Johan Dahlin
198c119a18
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 1m40s
47 lines
4.1 KiB
Markdown
47 lines
4.1 KiB
Markdown
```
|
||
Reducera när man tar bort ett syre
|
||
I en gen ingår även reglersekvenser, inte bara
|
||
Genuttryck är när xxx
|
||
Undantag är housekeeping genes som xxx
|
||
RNA syntesiseras alltid 5 → 3 riktning. Riktningen avgör vilken av strängarna som är mall eller kodande.
|
||
Promotorn bestämmer i vilken riktning RNA- polymeraset skall transkribera
|
||
En transkriptionsenhet är den sekvens i DNA som transkriberas till RNA. Startar vid promotorn och slutar vid terminatorn
|
||
Ett operon är ett långt mRNA som kodar för flera olika proteiner
|
||
I ett bakteriellt mRNA från ett operon finns många startplatser för translation
|
||
För att skilja startplats och aminosyra, finns en liten extra kodon som heter Sine-Dalgarno site
|
||
E. coli DNA polymeras har en beta subenhet som är det katalytiska subenheten
|
||
E. coli DNA polymeras har en sigma subenhet som hjälper till att hitta promotorn
|
||
När E. coli DNA polymeras innehåller sigma-faktorn binder den väldigt svagt till ospecifikt DNA, att den glider försiktigt längs med ytan
|
||
Bakteriellt RNA-polymeras glider längs DNA och letar efter en promotor.
|
||
I bakterier finns sju olika sigma-subenheter som reglerar olika typer av gener
|
||
I bakterier finns särskilda sigma faktorer för snabb tillväxt, för att skydda mot värme- shock, för att stimulera rörelse etc.
|
||
I bakterier finns bindningsställer för aktivatorer och repressorer nära promotorn
|
||
Regulatoriska sekvenser är platser i DNA där aktivatorer och repressorer binder.
|
||
En operator är en DNA-sekvens till vilken en repressor kan binda för att blockera initiering av transkription.
|
||
Tryptofan-operonet kodar för genprodukter (enzymer) som behövs för att bilda aminosyran tryptofan
|
||
Tryptofan-operonet kodar för fem olika gener, typ A till E som skapar var sin enzym som krävs för att skapa tryptofan
|
||
Finns det lite tryptofan i omgivningen så behöver Tryptofan-operonet uttryckas
|
||
Finns det mycket tryptofan i omgivningen så behöver inte dessa enzymer uttryckas.
|
||
Trypotfan kan binda till trp repressorn så den inte längre binder
|
||
Tillgången på tryptofan reglerar tryptofanrepressorns aktivitet!
|
||
När E coli har god tillgång på tryptofan i mediet, binder det till repressorn och orsakar en konformationsförändring så att repressorn kan binda till operatorn.
|
||
Lac-operonet - kodar för genprodukter som behövs för att bryta ner laktos
|
||
När det finns mycket glukos i cellerna är alternativa sockerkällor avstängda så att cellen huvudsakligen förbränner glukos
|
||
När det finns lite glukos i cellen kan arabinos, laktos eller andra sockermolekyler användas som energikällor.
|
||
Lac-operones slås bara på när det saknas glukos i cellen
|
||
Vid reglering av Lac-operonet samverkar en aktivator och en repressor
|
||
För att Lac-operonet ska transkribera, behövs repressorn tas bort och en aktiv aktivor som stimular RNA-polymeraset
|
||
I närvaro av laktos så bildas allolaktos. Binder till repressorn och får den att släppa operatorn
|
||
När det finns låga glukosnivåer så producerar cAMP som binder till cap-proteinern som kan binda till aktivatorplatsen brevid promotorn och hjälpa till att slå på transkriptionen
|
||
När det finns glukos så produceras inte cAMP som inte binder till cap och inget blir aktiveras och det blir ingen transkription
|
||
I närvaro av glukos används inte lac-operonet. Även om laktos finns i omgivningen!
|
||
I frånvaro av glukos slås lac-operonet på! Men bara om det finns laktos i omgivningen!
|
||
Antibiotika är ämnen som producerats av levande organismer i syfte att hålla andra organismer borta
|
||
Inom medicinen används antibiotika för att behandla infektioner, men också vid cancersjukdom
|
||
Rifampicin binder till beta-subenheten i det bakteriella RNA polymeraset och blockerar elongering (förmåga att transkribera). Används t.ex. vid behandling av tuberkulos
|
||
Elongering är förmångan att transkribera
|
||
Actinomycin lägger sig mellan basparen i DNA. Stör t.ex. Transkription och DNA replikation Används vid cancerbehandling t.ex. ovarialcancer
|
||
Bakteriofager infekterar bakterien och utnyttjar cellen för att skapa många nya kopior – bakterien dödas i en s.k. lytisk cykel
|
||
Bakteriofag T7 RNA-polymeras används i ren form för att producera mRNA-vacciner mot t.ex. COVID
|
||
|
||
``` |