Johan Dahlin
5794434baf
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 1m25s
166 lines
4.1 KiB
Markdown
166 lines
4.1 KiB
Markdown
---
|
|
föreläsare: Ingela Parmryd
|
|
tags:
|
|
- biokemi
|
|
- introduktion-till-metabolismen
|
|
- anteckningar
|
|
date: 2025-11-28
|
|
---
|
|
Viktigt att veta Delta H för att veta vilket håll en reaktion går
|
|
punkt = metabolit
|
|
- något som ingår i en metabol väg
|
|
|
|
Glykolysen är den enda som finns i alla celler.
|
|
|
|
----
|
|
|
|
Vi gör eller förstör ingen energi, bara omvandlar
|
|
Olika typer av energi
|
|
- kemisk bindningsenergi
|
|
- kinetisk energi - rörelser, vibrationer EJ i kroppen
|
|
- potentiell energi - separation av laddningar
|
|
- elektromagnetisk energi - strålning-fotosyntes
|
|
|
|
---
|
|
|
|
Metabolism
|
|
|
|
| Katabolism | Anabolism |
|
|
| -------------- | -------------- |
|
|
| nedbrytning | uppbyggnad |
|
|
| låg energikvot | hög energikvot |
|
|
| | |
|
|
| | |
|
|
|
|
|
|
----
|
|
Entropi som bara kan öka
|
|
|
|
#### Celler upprätthåller ordning
|
|
- Makromolekyler eller mindre
|
|
- Gradienter
|
|
- Organisation
|
|
- Organeller
|
|
- Celler
|
|
- Organ
|
|
- Organism
|
|
- Kostnad: oordningen måste öka mer på annan plats
|
|
- genom omvandling av energi
|
|
|
|
----
|
|
Upp och ner 10 ggr
|
|
Vad händer?
|
|
- Andas mer
|
|
- Blir varmare
|
|
- Piggare
|
|
- Högre hjärtfrekvens
|
|
- Värk i benen
|
|
|
|
Behöver mer blod till benen, pumpa mer blod, kräver mer syre
|
|
|
|
Verkningsgrad
|
|
- förbränningsmotor: 10-20%
|
|
- katabolism: 50%
|
|
- bättre beroende på uppdelning i flera steg
|
|
|
|
Det vi inte klarar av att göra avges som värme
|
|
|
|
### Fotosyntes
|
|
Indirekt eller direkt förutsättning för liv
|
|
![[Pasted image 20251128144158.png]]
|
|
# $6H_2O (vatten) + 6CO_2 (koldioxid) → 6O_2 (syre) + C_6H_{12}O_6 (socker)$
|
|
|
|
|
|
----
|
|
|
|
Katabolismen sker i 3 stadier
|
|
1. munhåla/mattarmkanal - extracelulärt
|
|
1. amyl**as** (stärkelse)
|
|
2. peptid**aser** (protein)
|
|
3. oligosackarid**aser** (kolhydrater)
|
|
4. lip**aser** (lipider)
|
|
2. Cytoplasman
|
|
1. Glykolysen - alla celler
|
|
1. anaerob kräver inte $O_2$
|
|
2. ~10% av kroppens ATP
|
|
3. Mitokondrier (finns inte i röda blodkroppar)
|
|
1. Citronsyracykeln
|
|
2. β-oxidation (fettsyra)
|
|
3. Elektrontransportkedjan
|
|
1. aerob, kräver $O_2$
|
|
4. Oxidativ fosforylering
|
|
1. aerob, kräver $O_2$
|
|
5. ~90% av kroppens ATP
|
|
|
|
----
|
|
![[Pasted image 20251128145049.png|300]]
|
|
Inneboende egenskap hos A & B, ändras inte
|
|
- ∆G°= skillnad i standard fri energi, 1M & pH=7
|
|
- T = temperaturen som kan påverkas
|
|
- koncentrationerna A, B, C, D
|
|
|
|
I isolering går en reaktion mot jämvikt, MEN det kan ta tid
|
|
- grafit och diamant har hög aktiveringsenergi, kan ta miljontals år
|
|
|
|
I en metabol väv uppnås ej jämvikt
|
|
- konkurrens om substrat
|
|
- produkt avlägsnas
|
|
- substrat tillförs
|
|
jämvikt = oordning => död
|
|
----
|
|
En reaktion med pistivt delta g kan drivas av en reaktion med större negativt delta
|
|
-
|
|
-
|
|
|
|
| A <→ B | $\Delta G$ 4kcal/mol |
|
|
| ---------- | --------------------- |
|
|
| C <→ D | $\Delta G$ -7kcal/mol |
|
|
| A+C <> B+D | $\Delta G$ -3kcal/mol |
|
|
En fosfatgrupp är ungefär 7kcal/mol. (i provrör, i celler kan det vara ännu mer fördelaktigt)
|
|
|
|
---
|
|
|
|
ATP
|
|
adenosintrifosfat, en av nukleotiderna som används för att bygga RNA & DNA
|
|
- cellens energivaluta
|
|
- Katabolismens mål är att bygga ATP-molekyler som vi kan använda för att tex bygga upp protein
|
|
- *två stycken fosfoanhydridbindning*
|
|
- 11-13kcal per mol vid klyvning, pga av jonstyrkan i cellen
|
|
- man kan frigöra energi genom att klyva bindingarna, men det är inte bindingar i sig som innehåller energin
|
|
- Fördelaktigt att spjälka
|
|
- minskar repulsion
|
|
- Alla 3 har negativ laddning, en inneboende repulsion
|
|
- ökad oordning
|
|
- gör två molekyler av en, när man klyver
|
|
- mer fördelaktigt interaktion med vatten
|
|
- bättre arrangemang med vatten när man klyver än man har trifosfaten
|
|
- resonansstabilisering
|
|
- En fosfatjon kan förekomma i fyra olika former, som står i balans med varandra
|
|
- ![[Pasted image 20251128152451.png|200]]
|
|
- ![[Pasted image 20251128152516.png]]
|
|
|
|
|
|
Cellens energikvot
|
|
- ATP + 1/2 ADP
|
|
- samma som
|
|
- AMP + ADP + ATP
|
|
|
|
Koppling med ATP förskuter jämvikt med $10^8$ per ATP
|
|
|
|
0.9-0.95 i välmående celler.
|
|
|
|
100-250 gram beroende på vikt i kroppen är ATP vid ett enskilt tillfälle
|
|
|
|
En lugn dag behöver. vi ungefär våran kroppsvikt i ATP
|
|
|
|
---
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|