Johan Dahlin
1f2e90858c
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 1m49s
123 lines
4.5 KiB
Markdown
123 lines
4.5 KiB
Markdown
---
|
|
tags:
|
|
- biokemi
|
|
- citronsyracykeln
|
|
- anteckningar
|
|
föreläsare: Ingela Parmryd
|
|
date: 2025-12-02
|
|
---
|
|
# Mitokondrier
|
|
|
|
- Yttre membran
|
|
- Mellanmembransytrumme (pH ~= 7.2)
|
|
- Inre membranet
|
|
- ETK, oxidativ fosforylering
|
|
- Matrix
|
|
- TCA, β-oxidation (katabolism av fettsyror)
|
|
- pH ~= 8.6 (upp till och med)
|
|
- pga pH har vi en gradient som skapas av ETK och används av oxidativ fosforylering
|
|
- cristae
|
|
- veckat membran kan vara så långt kan det vara lika långt som 1/3 av **cellens** membran
|
|
|
|
![[Pasted image 20251202082256.png]]
|
|
# Coenzym-A
|
|
|
|
Bärarare av acylgrupper. Har en restgrupp.
|
|
Kommer från pantotenat (vitamin $B_5$)
|
|
Reaktiv sulfhydrylgrupp, HS-
|
|
|
|
![[Pasted image 20251202082551.png|200]]
|
|
I bilden ovan har den kopplat av en -tioesterbindning till acylgrupp.
|
|
När man använder Acetyl coenzym A transporteras två kol
|
|
Kinetiskt stabil, termodynamisk instabil
|
|
Tioester resonansstabiliseras så det är fördelaktigt att skicka iväg acylgruppen
|
|
- hade kunnat ske med en esterbindning, om det finns syre
|
|
ester=syre+?
|
|
|
|
# Pyruvat omvandlas till acetyl-CoA
|
|
Länkar glykolysen och TCA
|
|
|
|
Pyruvat transporteras till matrix.
|
|
Där stöter de på pyruvatdehydrognas (PDH)
|
|
|
|
|
|
glykolys är reversibel, man kan gå tillbaka från pyruvat till glykolysen. Men när man gått över till Acetyl-CoA går inte det, finns två öden:
|
|
- vidare oxidation i TCA
|
|
- fettsyresyntes
|
|
|
|
Spelar det någon roll vad vi äter?
|
|
- Vi kan **inte** bilda socker av fettsyror
|
|
- Vi kan bilda fettsyror av socker
|
|
|
|
Metastudier säger att spelar inte så stor roll vad vi äter, bara hur mycket. Kalorier in & ut.
|
|
Mättnadshormon utsöndras om vi äter fett/protein, de utsyndras inte när vi äter kalorier.
|
|
|
|
|
|
| Enzym | In | Ut | Rev? | Reaktion | Energi |
|
|
| ------------------ | ------------- | ------------------- | ---- | --------------- | ------------------------ |
|
|
| pyruvatdehydrognas | CoA + Pyruvat | Acetyl-CoA + $CO_2$ | Nej | dekarboxylering | $NAD^+$ → $NADH$ + $H^+$ |
|
|
| | | | | | |
|
|
|
|
# Pyruvatdehydrogenaskomplexet
|
|
|
|
Hittar vi i mitokondriens matrix
|
|
- det är hit pyruvat har tagit sig
|
|
Stort som en ribosom
|
|
- består av 3 enzymer många av kopior av vardera enzym
|
|
|
|
Kopplar man ihop reaktioner blir det effektivt
|
|
- Dekarboxyleringen är väldigt mycket energi Delta G, de andra behöver tillföra energi
|
|
Finns 3 st protetiska grupper
|
|
- reminder: icke-aminosyror som deltar i grupper
|
|
- FAD känner vi igen sen tidigare, bärare av elektroner
|
|
- Lipoamid - liponsyra till Lysin
|
|
- flexibel "arm"
|
|
- bildar en arm som flyttar runt produkterna mellan enzymerna i komplexet
|
|
- Tiaminpyrofosfat, kommer ifrån Vitamin $B_1$
|
|
|
|
Reaktioerna
|
|
|
|
| Steg | In | Reaktion | Plats |
|
|
| ---- | -------------------------------------- | --------- | ----- |
|
|
| 1 | Dekarboxylering vid | | $E_1$ |
|
|
| 2 | Lipoamid flyttas från $E_1$ till $E_2$ | | |
|
|
| 3 | Acetylgrupp överförs till lipoamid | oxidation | |
|
|
| 4 | Bildning av acetyl-CoA i | | $E_2$ |
|
|
| 5 | Återgenering av lipoamid | oxidation | $E_3$ |
|
|
| 6 | NADH bildas, återbildning av FAD | | $E_3$ |
|
|
|
|
![[Pasted image 20251202084148.png|300]]
|
|
|
|
----
|
|
|
|
# Acetyl-CoA kan bildas från fetter, kolhydrater och proteiner
|
|
|
|
Inte vanligt att man använder sig av proteiner, fetter och kolhydrater är vanligare, främst glukos
|
|
|
|
![[Pasted image 20251202084530.png|200]]
|
|
|
|
# Arsenikförgiftning
|
|
|
|
Arsenikjon $AsO_3^-$
|
|
Affinitet för sulfhydridgrupper
|
|
Det blockerar armen som ska flytta runt substrat i Pyruvatdehydrogenaskomplexet PDH
|
|
- klicksilver likaså
|
|
→ blockering av lipoamid
|
|
Motgift: sulfhydridreagent, t.ex. 2,3-dimerkaptoetanol
|
|
|
|
sulfhydridreagent används för att bryta svavelbryggor i proteiner vid elektrofores
|
|
togs ffram mot Lewisit
|
|
|
|
Äter man inte höljet på riset får man en sjukdom som eheter Beriberi-brist på vitamin $B_1$
|
|
Det är vanligt förekommande i alkolism, när man inte tar in mycket annat än alkohol och ger samma symptom.
|
|
|
|
Neurologiska symptom, liknelser mathatter i Alice i Underlandet och kvicksilverlösning
|
|
|
|
|
|
Berberi, arsenik och kicksilverförgiftning ger framför allt neruodegenerativa problem. Vad kan vara anledning till det?
|
|
|
|
- CNS kan bara använda sig av glukos BHB
|
|
- Funkar inte Pyruvatdehydrogenaskomplexet kommer man inte förbi glykolysen
|
|
- ATP produceras främst i ETK, 90%.
|
|
|