vault backup: 2025-12-08 09:10:43

content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Anteckningar.md

@@ -6,3 +6,130 @@ tags:
   - anteckningar
 date: 2025-12-08
 ---
+## Proteinogena och icke-proteinogena aminosyror.  
+
+𝛼-aminosyra sitter på alfasidan.
+icke-proteinogena aminosyror är de som inte ingår i våra proteiner
+
+GABA t.ex. ingår inte i proteiner, ingen 𝛼-aminsyra, är en gamma-aminosyra, sitter på gammakolet.
+
+# Aminosyrors användningsområden
+
+Aminorsyror är:
+- byggstenar till proteiner
+- homeostasis
+	- syra-bas regleringen
+- grundskelett för andra biomolekyler
+- transporterar ammoniak icke-toxiskt 
+	- glutamin och alanin transporterar kväve till levern
+- neurotransmiterare
+	- glutamat och glycin
+
+Källa till aminosyror är ifrån proteiner som vi fått in oss från födan.
+I magtarmkanalen finns mycket enzymer som bryter ner
+Kan inte bara diffundera över cellmembran, måste få hjälp på något sätt. Finns ett stort antal aminosyratransportörer. Vissa transportörer för vissa aminosyror (polära, hydrofoba osv)
+- ligger en jonpump som pumpar ut Na+, så Na+ blir lägre på cellsidan än på utsidan, när Na+ vill vandra in från högre till lägre koncentrationen, de drar med sig aminosyrorna in i cell, det är en indirekt aktiv transport av aminosyror
+- går från en högre till en lägre koncentration
+- VIKTIGT: aminosyror kräver en transportör för att passaera cellmembranet
+
+Aminosyror byggs upp och bryts ner hela tiden, de återanvändas eller återvinnas.
+
+# Uppbyggnad
+En aminosyra har två sidor
+- kolskelett
+	- hämtas från glukolysen, pentosfosfatvägen eller TCA
+	- efter få metabola vägar kan man bilda samtliga 20 aa
+- aminogruppen
+	- nästan uteslutande från **glutamat**, antingen
+		- donerar eller
+		- hela strukturer modifieras till en aminosyra
+
+De flesta mikroorganismer kan skapa alla aa på detta sätt. Vissa vägar är väldigt komplexa och involverar många steg.
+Essentiella aminosyror måste komma via kedjan, speciellt de komplexa
+Vi kan bilda 11 av de 20, icke-essentiella
+Listan är inte helt regid, för vissa individer är vissa essentiella.
+- t.ex. arginin för vuxna är icke-essentiell, men barn kan inte syntesisera den
+- finns sjukdomstillstånd, PKU där man inte kan producera tyrosin
+
+Icke-essentiella
+
+### 3-fosfosglycerat
+serin
+- glycin
+- cystein
+
+### 𝛼-ketoglutarat
+glutamat
+- glutamin
+- prolin
+- arginin
+
+Bildas ofta ifrån transamineringsreaktioner. Finns motsvarande 𝛼-ketosyra. 
+Glutamaat och a-ketoglutarat. Skiljer sig bara från alfapositionen
+Reagerar med en annan aminosyra så man får över en 𝛼-ketosyra.
+aminotransferaser kan katalysera dessa reaktioner
+kan säga byter plats på karbonylgruppen och aminogruppen
+VIKTIGT: är reversibla, samma reaktion används för att bygga upp och bryta ner
+
+glutamat kan i ett viss antal steg skapa fler aminosyror som t.ex. arginin och prolin.
+
+### oxalaccetat
+aspartat
+- aspargin
+
+### pyruvat
+alanin
+
+## Aminotransferaser
+
+#### ALT/ALAT
+pyruvat + glutamat → alanin + 𝛼-ketoglutarat
+#### AST/ASAT
+oxalaccetat + glutamat → aspartat + 𝛼-ketoglutarat
+
+Generell: X + glutamat → Y + 𝛼-ketoglutarat
+
+#### 𝛼-ketosyror
+- pyruvat
+- oxalacetat
+- 𝛼-ketoglutarat
+
+Hittar man de i blodbanan så har cellerna skadats på något sätt. De ökar blodbanan i nästan alla typ av leverskada, hepatit/alkolism pga högt tryck i leverna, läcker ut i blodet
+
+Finns andra sätt att bilda glutamat från 𝛼-ketoglutarat, glutamat-dehydrogenas är ett leverspecifikt enzym. Tror inte att den används normalt, eftersom vi har inte så mkt ammoniak i våra vävnader, den är toxiskt, försöker minimera. men kan i vissa fall vara en syntesväg
+
+Glutamin kan bildas från glutamat och aminiak, kostar ATP
+- laddar in amoniak
+
+
+### Tyrosin
+Bildas från fenylanalyn, sitter en hydroxylgrupp som gör att det saknas.
+- reagerar med syra, 
+
+Fenylalanin + $O_2$ + NADPH + $H^+$ → Tyriosin + $NADP^+$ + $H_2O$
+Katalyseras av fenylalaninhydroxalas-enzymet
+
+PKU är en sjukdom när man fått defekter i form av en genmutation som kodar för det enzymet.
+Tyrosin är viktigt för att bilda andra aa, men också pigment och andra saker. 
+
+### PKU
+Intelektuela nedsättningar
+fördröjd utveckling
+neurologiska problem
+
+tidig behandling med bra förutsättningar, minska proteinintaget och ge olika typer av supplement
+
+aspartam kan omvandlas till fenylalanin.
+
+Testar barn i PKU-provet vid födsel sedan 1965, så man kan börja tidig behandling.
+
+## Summering
+- aa är också energikälla och signalering
+- essentiella vs icke-essentiella
+- 𝛼-aminogruppen kommer ifrån glutamat
+- kolskelettet kommer ifrån 5 precursors
+- aminotransferaser är essentiella för både uppbyggnad och nerbrytning av aa
+- PKU
+
+
+

content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Instuderingsuppgifter.md

@@ -6,7 +6,7 @@ tags:
   - instuderingsuppgifter
 date: 2025-12-08
 ---
-### 1. Beskriv den generella strukturen för en -aminosyra.
+### 1. Beskriv den generella strukturen för en 𝛼-aminosyra.
 
 ### 2. Aminosyror kan vara proteinogena och icke-proteinogena. Vad menas med detta? Ge ett par exempel på aminosyror som tillhör den senare kategorin.
 

content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Provfrågor.md

@@ -8,7 +8,10 @@ date: 2025-12-08
 ---
 
 ```dataviewjs
-for (const path of dv.pagePaths("#provfråga and #aminosyrametabolism")) {
+const paths = dv.pagePaths("#provfråga and #aminosyrametabolism")
+dv.span("Antal frågor: " + paths.length + " \n \n")
+
+for (const path of paths) {
 	dv.span(" \n[[" + path + "]]\n")
 	const content = await dv.io.load(path)
 	dv.span(content)