diff --git a/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Anteckningar.md b/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Anteckningar.md index bea956e..5d49706 100644 --- a/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Anteckningar.md +++ b/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Anteckningar.md @@ -6,3 +6,130 @@ tags: - anteckningar date: 2025-12-08 --- +## Proteinogena och icke-proteinogena aminosyror. + +đ›Œ-aminosyra sitter pĂ„ alfasidan. +icke-proteinogena aminosyror Ă€r de som inte ingĂ„r i vĂ„ra proteiner + +GABA t.ex. ingĂ„r inte i proteiner, ingen đ›Œ-aminsyra, Ă€r en gamma-aminosyra, sitter pĂ„ gammakolet. + +# Aminosyrors anvĂ€ndningsomrĂ„den + +Aminorsyror Ă€r: +- byggstenar till proteiner +- homeostasis + - syra-bas regleringen +- grundskelett för andra biomolekyler +- transporterar ammoniak icke-toxiskt + - glutamin och alanin transporterar kvĂ€ve till levern +- neurotransmiterare + - glutamat och glycin + +KĂ€lla till aminosyror Ă€r ifrĂ„n proteiner som vi fĂ„tt in oss frĂ„n födan. +I magtarmkanalen finns mycket enzymer som bryter ner +Kan inte bara diffundera över cellmembran, mĂ„ste fĂ„ hjĂ€lp pĂ„ nĂ„got sĂ€tt. Finns ett stort antal aminosyratransportörer. Vissa transportörer för vissa aminosyror (polĂ€ra, hydrofoba osv) +- ligger en jonpump som pumpar ut Na+, sĂ„ Na+ blir lĂ€gre pĂ„ cellsidan Ă€n pĂ„ utsidan, nĂ€r Na+ vill vandra in frĂ„n högre till lĂ€gre koncentrationen, de drar med sig aminosyrorna in i cell, det Ă€r en indirekt aktiv transport av aminosyror +- gĂ„r frĂ„n en högre till en lĂ€gre koncentration +- VIKTIGT: aminosyror krĂ€ver en transportör för att passaera cellmembranet + +Aminosyror byggs upp och bryts ner hela tiden, de Ă„teranvĂ€ndas eller Ă„tervinnas. + +# Uppbyggnad +En aminosyra har tvĂ„ sidor +- kolskelett + - hĂ€mtas frĂ„n glukolysen, pentosfosfatvĂ€gen eller TCA + - efter fĂ„ metabola vĂ€gar kan man bilda samtliga 20 aa +- aminogruppen + - nĂ€stan uteslutande frĂ„n **glutamat**, antingen + - donerar eller + - hela strukturer modifieras till en aminosyra + +De flesta mikroorganismer kan skapa alla aa pĂ„ detta sĂ€tt. Vissa vĂ€gar Ă€r vĂ€ldigt komplexa och involverar mĂ„nga steg. +Essentiella aminosyror mĂ„ste komma via kedjan, speciellt de komplexa +Vi kan bilda 11 av de 20, icke-essentiella +Listan Ă€r inte helt regid, för vissa individer Ă€r vissa essentiella. +- t.ex. arginin för vuxna Ă€r icke-essentiell, men barn kan inte syntesisera den +- finns sjukdomstillstĂ„nd, PKU dĂ€r man inte kan producera tyrosin + +Icke-essentiella + +### 3-fosfosglycerat +serin +- glycin +- cystein + +### đ›Œ-ketoglutarat +glutamat +- glutamin +- prolin +- arginin + +Bildas ofta ifrĂ„n transamineringsreaktioner. Finns motsvarande đ›Œ-ketosyra. +Glutamaat och a-ketoglutarat. Skiljer sig bara frĂ„n alfapositionen +Reagerar med en annan aminosyra sĂ„ man fĂ„r över en đ›Œ-ketosyra. +aminotransferaser kan katalysera dessa reaktioner +kan sĂ€ga byter plats pĂ„ karbonylgruppen och aminogruppen +VIKTIGT: Ă€r reversibla, samma reaktion anvĂ€nds för att bygga upp och bryta ner + +glutamat kan i ett viss antal steg skapa fler aminosyror som t.ex. arginin och prolin. + +### oxalaccetat +aspartat +- aspargin + +### pyruvat +alanin + +## Aminotransferaser + +#### ALT/ALAT +pyruvat + glutamat → alanin + đ›Œ-ketoglutarat +#### AST/ASAT +oxalaccetat + glutamat → aspartat + đ›Œ-ketoglutarat + +Generell: X + glutamat → Y + đ›Œ-ketoglutarat + +#### đ›Œ-ketosyror +- pyruvat +- oxalacetat +- đ›Œ-ketoglutarat + +Hittar man de i blodbanan sĂ„ har cellerna skadats pĂ„ nĂ„got sĂ€tt. De ökar blodbanan i nĂ€stan alla typ av leverskada, hepatit/alkolism pga högt tryck i leverna, lĂ€cker ut i blodet + +Finns andra sĂ€tt att bilda glutamat frĂ„n đ›Œ-ketoglutarat, glutamat-dehydrogenas Ă€r ett leverspecifikt enzym. Tror inte att den anvĂ€nds normalt, eftersom vi har inte sĂ„ mkt ammoniak i vĂ„ra vĂ€vnader, den Ă€r toxiskt, försöker minimera. men kan i vissa fall vara en syntesvĂ€g + +Glutamin kan bildas frĂ„n glutamat och aminiak, kostar ATP +- laddar in amoniak + + +### Tyrosin +Bildas frĂ„n fenylanalyn, sitter en hydroxylgrupp som gör att det saknas. +- reagerar med syra, + +Fenylalanin + $O_2$ + NADPH + $H^+$ → Tyriosin + $NADP^+$ + $H_2O$ +Katalyseras av fenylalaninhydroxalas-enzymet + +PKU Ă€r en sjukdom nĂ€r man fĂ„tt defekter i form av en genmutation som kodar för det enzymet. +Tyrosin Ă€r viktigt för att bilda andra aa, men ocksĂ„ pigment och andra saker. + +### PKU +Intelektuela nedsĂ€ttningar +fördröjd utveckling +neurologiska problem + +tidig behandling med bra förutsĂ€ttningar, minska proteinintaget och ge olika typer av supplement + +aspartam kan omvandlas till fenylalanin. + +Testar barn i PKU-provet vid födsel sedan 1965, sĂ„ man kan börja tidig behandling. + +## Summering +- aa Ă€r ocksĂ„ energikĂ€lla och signalering +- essentiella vs icke-essentiella +- đ›Œ-aminogruppen kommer ifrĂ„n glutamat +- kolskelettet kommer ifrĂ„n 5 precursors +- aminotransferaser Ă€r essentiella för bĂ„de uppbyggnad och nerbrytning av aa +- PKU + + + diff --git a/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Instuderingsuppgifter.md b/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Instuderingsuppgifter.md index 4b45556..f48675a 100644 --- a/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Instuderingsuppgifter.md +++ b/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Instuderingsuppgifter.md @@ -6,7 +6,7 @@ tags: - instuderingsuppgifter date: 2025-12-08 --- -### 1. Beskriv den generella strukturen för en ïĄ-aminosyra. +### 1. Beskriv den generella strukturen för en đ›Œ-aminosyra. ### 2. Aminosyror kan vara proteinogena och icke-proteinogena. Vad menas med detta? Ge ett par exempel pĂ„ aminosyror som tillhör den senare kategorin. diff --git a/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/ProvfrĂ„gor.md b/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/ProvfrĂ„gor.md index 2f9ed96..9fce26b 100644 --- a/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/ProvfrĂ„gor.md +++ b/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/ProvfrĂ„gor.md @@ -8,7 +8,10 @@ date: 2025-12-08 --- ```dataviewjs -for (const path of dv.pagePaths("#provfrĂ„ga and #aminosyrametabolism")) { +const paths = dv.pagePaths("#provfrĂ„ga and #aminosyrametabolism") +dv.span("Antal frĂ„gor: " + paths.length + " \n \n") + +for (const path of paths) { dv.span(" \n[[" + path + "]]\n") const content = await dv.io.load(path) dv.span(content)