From 590af3daf9757cd7cc1a882572a523f0d5c45898 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Johan Dahlin Date: Mon, 8 Dec 2025 09:10:43 +0100 Subject: [PATCH] vault backup: 2025-12-08 09:10:43 --- .../Aminosyrametabolism/Anteckningar.md | 127 ++++++++++++++++++ .../Instuderingsuppgifter.md | 2 +- .../Aminosyrametabolism/Provfrågor.md | 5 +- 3 files changed, 132 insertions(+), 2 deletions(-) diff --git a/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Anteckningar.md b/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Anteckningar.md index bea956e..5d49706 100644 --- a/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Anteckningar.md +++ b/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Anteckningar.md @@ -6,3 +6,130 @@ tags: - anteckningar date: 2025-12-08 --- +## Proteinogena och icke-proteinogena aminosyror. + +𝛼-aminosyra sitter på alfasidan. +icke-proteinogena aminosyror är de som inte ingår i våra proteiner + +GABA t.ex. ingår inte i proteiner, ingen 𝛼-aminsyra, är en gamma-aminosyra, sitter på gammakolet. + +# Aminosyrors användningsområden + +Aminorsyror är: +- byggstenar till proteiner +- homeostasis + - syra-bas regleringen +- grundskelett för andra biomolekyler +- transporterar ammoniak icke-toxiskt + - glutamin och alanin transporterar kväve till levern +- neurotransmiterare + - glutamat och glycin + +Källa till aminosyror är ifrån proteiner som vi fått in oss från födan. +I magtarmkanalen finns mycket enzymer som bryter ner +Kan inte bara diffundera över cellmembran, måste få hjälp på något sätt. Finns ett stort antal aminosyratransportörer. Vissa transportörer för vissa aminosyror (polära, hydrofoba osv) +- ligger en jonpump som pumpar ut Na+, så Na+ blir lägre på cellsidan än på utsidan, när Na+ vill vandra in från högre till lägre koncentrationen, de drar med sig aminosyrorna in i cell, det är en indirekt aktiv transport av aminosyror +- går från en högre till en lägre koncentration +- VIKTIGT: aminosyror kräver en transportör för att passaera cellmembranet + +Aminosyror byggs upp och bryts ner hela tiden, de återanvändas eller återvinnas. + +# Uppbyggnad +En aminosyra har två sidor +- kolskelett + - hämtas från glukolysen, pentosfosfatvägen eller TCA + - efter få metabola vägar kan man bilda samtliga 20 aa +- aminogruppen + - nästan uteslutande från **glutamat**, antingen + - donerar eller + - hela strukturer modifieras till en aminosyra + +De flesta mikroorganismer kan skapa alla aa på detta sätt. Vissa vägar är väldigt komplexa och involverar många steg. +Essentiella aminosyror måste komma via kedjan, speciellt de komplexa +Vi kan bilda 11 av de 20, icke-essentiella +Listan är inte helt regid, för vissa individer är vissa essentiella. +- t.ex. arginin för vuxna är icke-essentiell, men barn kan inte syntesisera den +- finns sjukdomstillstånd, PKU där man inte kan producera tyrosin + +Icke-essentiella + +### 3-fosfosglycerat +serin +- glycin +- cystein + +### 𝛼-ketoglutarat +glutamat +- glutamin +- prolin +- arginin + +Bildas ofta ifrån transamineringsreaktioner. Finns motsvarande 𝛼-ketosyra. +Glutamaat och a-ketoglutarat. Skiljer sig bara från alfapositionen +Reagerar med en annan aminosyra så man får över en 𝛼-ketosyra. +aminotransferaser kan katalysera dessa reaktioner +kan säga byter plats på karbonylgruppen och aminogruppen +VIKTIGT: är reversibla, samma reaktion används för att bygga upp och bryta ner + +glutamat kan i ett viss antal steg skapa fler aminosyror som t.ex. arginin och prolin. + +### oxalaccetat +aspartat +- aspargin + +### pyruvat +alanin + +## Aminotransferaser + +#### ALT/ALAT +pyruvat + glutamat → alanin + 𝛼-ketoglutarat +#### AST/ASAT +oxalaccetat + glutamat → aspartat + 𝛼-ketoglutarat + +Generell: X + glutamat → Y + 𝛼-ketoglutarat + +#### 𝛼-ketosyror +- pyruvat +- oxalacetat +- 𝛼-ketoglutarat + +Hittar man de i blodbanan så har cellerna skadats på något sätt. De ökar blodbanan i nästan alla typ av leverskada, hepatit/alkolism pga högt tryck i leverna, läcker ut i blodet + +Finns andra sätt att bilda glutamat från 𝛼-ketoglutarat, glutamat-dehydrogenas är ett leverspecifikt enzym. Tror inte att den används normalt, eftersom vi har inte så mkt ammoniak i våra vävnader, den är toxiskt, försöker minimera. men kan i vissa fall vara en syntesväg + +Glutamin kan bildas från glutamat och aminiak, kostar ATP +- laddar in amoniak + + +### Tyrosin +Bildas från fenylanalyn, sitter en hydroxylgrupp som gör att det saknas. +- reagerar med syra, + +Fenylalanin + $O_2$ + NADPH + $H^+$ → Tyriosin + $NADP^+$ + $H_2O$ +Katalyseras av fenylalaninhydroxalas-enzymet + +PKU är en sjukdom när man fått defekter i form av en genmutation som kodar för det enzymet. +Tyrosin är viktigt för att bilda andra aa, men också pigment och andra saker. + +### PKU +Intelektuela nedsättningar +fördröjd utveckling +neurologiska problem + +tidig behandling med bra förutsättningar, minska proteinintaget och ge olika typer av supplement + +aspartam kan omvandlas till fenylalanin. + +Testar barn i PKU-provet vid födsel sedan 1965, så man kan börja tidig behandling. + +## Summering +- aa är också energikälla och signalering +- essentiella vs icke-essentiella +- 𝛼-aminogruppen kommer ifrån glutamat +- kolskelettet kommer ifrån 5 precursors +- aminotransferaser är essentiella för både uppbyggnad och nerbrytning av aa +- PKU + + + diff --git a/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Instuderingsuppgifter.md b/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Instuderingsuppgifter.md index 4b45556..f48675a 100644 --- a/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Instuderingsuppgifter.md +++ b/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Instuderingsuppgifter.md @@ -6,7 +6,7 @@ tags: - instuderingsuppgifter date: 2025-12-08 --- -### 1. Beskriv den generella strukturen för en -aminosyra. +### 1. Beskriv den generella strukturen för en 𝛼-aminosyra. ### 2. Aminosyror kan vara proteinogena och icke-proteinogena. Vad menas med detta? Ge ett par exempel på aminosyror som tillhör den senare kategorin. diff --git a/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Provfrågor.md b/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Provfrågor.md index 2f9ed96..9fce26b 100644 --- a/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Provfrågor.md +++ b/content/Biokemi/Metabolism/Aminosyrametabolism/Provfrågor.md @@ -8,7 +8,10 @@ date: 2025-12-08 --- ```dataviewjs -for (const path of dv.pagePaths("#provfråga and #aminosyrametabolism")) { +const paths = dv.pagePaths("#provfråga and #aminosyrametabolism") +dv.span("Antal frågor: " + paths.length + " \n \n") + +for (const path of paths) { dv.span(" \n[[" + path + "]]\n") const content = await dv.io.load(path) dv.span(content)