Johan Dahlin
e1f922c195
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 1m47s
172 lines
4.5 KiB
Markdown
172 lines
4.5 KiB
Markdown
---
|
|
tags:
|
|
- biokemi
|
|
- anteckningar
|
|
- initiering-och-terminering-eukaryot-dna-replikation
|
|
förelÀsare: Claes Gustavsson
|
|
---
|
|
|
|
Brukar stÀlla frÄgor pÄ de som finns i förelÀsningar, titta pÄ gamla frÄgor, inte stÀlla omöjliga frÄgor.
|
|
|
|
Bakgrund: Vi ska bli lÀkare, behöver veta vad som hÀnder i humana celler
|
|
|
|
|
|
|
|
![[Pasted image 20251121111405.png]]
|
|
Generella bubblan gÀller i vÄra celler
|
|
CMG helikas:
|
|
- Claes Mikael Gustavsson heter förelÀsaren!
|
|
- MCM för att sÀtta ihop
|
|
- Gins
|
|
- Cdc45
|
|
|
|
Heter delta och epsilon heter polymerasen de Àr lite olika
|
|
sliding camps heter PCNA
|
|
|
|
-----
|
|
|
|
leading strand:
|
|
- DNA pol epsilon
|
|
- sliding clamp PCNA
|
|
lagging strand:
|
|
- DNA pol delta
|
|
- sliding clamp PCNA
|
|
|
|
---
|
|
|
|
Löser problemet att RNA primer inte ska sitta löst
|
|
|
|
Primaset skiljer sig lite gran
|
|
DNA-polymeras
|
|
- RNA-primarna Àr c:a 5 olika
|
|
- finns en risk att trilla av, de vill man inte i vÄra celler
|
|
- vi vill vara sÀkra pÄ att den verkligen anvÀnds
|
|
- alfa.primas
|
|
![[Pasted image 20251121111829.png]]
|
|
- DNA-polymeras alfa-primas
|
|
- bÄde primas och polymeras i samma
|
|
- enzym som sitter ihop (namn?)
|
|
|
|
om man har en mallstrÀng kommer enzymet att verka först
|
|
|
|
de kan byta plats utan att slÀppa
|
|
|
|
behöver bara en liten extra snutt, kommer sitta mkt mer stabilt pÄ DNA, utan att det finns risk att primern trillar bort.
|
|
|
|
![[Pasted image 20251121111945.png]]
|
|
|
|
|
|
Vad Àr de olika polymerasen?
|
|
- alpha-primas
|
|
- delta
|
|
- epsilon
|
|
|
|
----
|
|
![[Pasted image 20251121112158.png]]
|
|
|
|
Ser likadana ut i bakterier, det Àr en ring som sitter och hÄller fast DNA pol
|
|
Man kan uttrycka antikroppar mot PCNA, kan kroppen utveckla av misstag.
|
|
|
|
----
|
|
SLE/Lupus PCNA ANA
|
|
|
|
----
|
|
![[Pasted image 20251121112518.png]]
|
|
|
|
Kan inte dela innan DNA-syntesen Àr fÀrdig och heller inte sÀtta igÄng, specifikt.
|
|
En gÄng per cellcykel. DÄ fÄr vi felaktigt antal kopier.
|
|
|
|
----
|
|
|
|
Vi har upp till 30 000 origins i vÄra cell
|
|
Alla gÄr inte igÄng alltid
|
|
MÄnga mÄste gÄ igÄng för att kunna replikera tillrÀckligt fort
|
|
50-300kbp
|
|
Ska börja ungefÀr samtidigt.
|
|
Alla behövs
|
|
|
|
----
|
|
|
|
Hur hittar man en origin?
|
|
|
|
Det finns ett komplex som binder hela tiden, Origin recognition complex - komplexet som hittar origin. Som bestÄr av 6 proteiner. Sitter fast hel cellcykeln. En slags markör.
|
|
![[Pasted image 20251121113014.png]]
|
|
|
|
----
|
|
|
|
Hur pÄbörjas DNA replikation?
|
|
|
|
---
|
|
![[Pasted image 20251121113046.png]]
|
|
tvÄ rekryteringsfaktorer hjÀlper ORC att locka till sig DNA helikaset MCM.
|
|
|
|
laddningsfaktorer:
|
|
- Cdc6 och cdt1 till ORC
|
|
|
|
|
|
1. ORC complex sitter i hel cellcykeln
|
|
2. CDC6 och CDT1
|
|
3. Helikaset
|
|
4. Sen laddar CDC6/CDT1/ORC upp MCM i G1-fasen
|
|
|
|
---
|
|
|
|
![[Pasted image 20251121113406.png]]
|
|
|
|
Nu Àr det laddat, men inte aktivt.
|
|
|
|
KrÀver höga nivÄr av cyklinberoende kinas (CDK) för att kunna bilda CMG-helikaset
|
|
|
|
Viktigt att det bara gÄr att aktiva helikaset nÀr det finns mycket CDK
|
|
- som en pistol som Àr laddad, för att kunna fÄ ivÀg kulan
|
|
- CMG helikas smÀlts och replikationen kan man börja
|
|
- Se till att man inte fÄr en dubbel aktivering (HUR?)
|
|
|
|
Noggrant: skilj **laddning** frÄn **aktivering**
|
|
|
|
----
|
|
|
|
Problem vid DNA-replikation
|
|
Hur kan Àndarna pÄ linjÀrt DNA replikeras? Vi mÄste ju ha en RNA-primer?
|
|
Detta Àr ett klassiskt problem.
|
|
|
|
---
|
|
|
|
![[Pasted image 20251121114215.png]]
|
|
- Behöver ha en RNA-primer i början, men nÀr vi kommer ut i slutet
|
|
- den sista vi behöver lagging strand för behöver vi en primer
|
|
- de fixar inte primerasen
|
|
- vi kommer förlora lite i 5'-Ànden, över tiden blir det kortare och kortare till slut försvinner det
|
|
- hur sÀkerstÀlls det att det gör att replikera hela vÀgen ut i Àndan?
|
|
|
|
---
|
|
|
|
I Àndarna pÄ kromsomerna kallas telomerer
|
|
|
|
- De blir kortare och kortare till cellen dör
|
|
- Vilket betyder att en cell kan bara delas ett visst antal gÄnger, sen dör cellerna
|
|
- Men det gÀller inte alla celler
|
|
- gÀller somatiska celler
|
|
- gÀller inte stamceller
|
|
- gÀller inte cancerceller
|
|
- vad Àr det som gör att telomererna kan finnas kvar i stam och cancerceller, men det blir kortare och kortare i alla andra celler?
|
|
![[Pasted image 20251121114507.png]]
|
|
|
|
---
|
|
|
|
I centrala dogman DNAâRNAâprotein
|
|
Men det finns möjlighet att gĂ„ RNAâDNA vilket Ă€r omvĂ€nt transkriptas
|
|
|
|
---
|
|
|
|
![[Pasted image 20251121114559.png]]
|
|
|
|
Telomeras förlÀnger kromsomÀndarna.
|
|
- Sker genom att lÀgga till en kort,
|
|
- behöver en mall för att starta
|
|
- har med sig en egen bit RNA som fungerar som mall
|
|
- alla Àndar ser likadana ut i slutÀndan (C A A U C C C A A U C)
|
|
- lÀgger till skrÀp DNA sÄ det Àr okej att förlora lite i Àndarna
|
|
|
|
|