1
0
Files
Johan Dahlin e1f922c195
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 1m47s
vault backup: 2025-12-08 19:58:36
2025-12-08 19:58:36 +01:00

4.5 KiB

tags, förelÀsare
tags förelÀsare
biokemi
anteckningar
initiering-och-terminering-eukaryot-dna-replikation
Claes Gustavsson

Brukar stÀlla frÄgor pÄ de som finns i förelÀsningar, titta pÄ gamla frÄgor, inte stÀlla omöjliga frÄgor.

Bakgrund: Vi ska bli lÀkare, behöver veta vad som hÀnder i humana celler

!Pasted image 20251121111405.png Generella bubblan gÀller i vÄra celler CMG helikas:

  • Claes Mikael Gustavsson heter förelĂ€saren!
  • MCM för att sĂ€tta ihop
  • Gins
  • Cdc45

Heter delta och epsilon heter polymerasen de Àr lite olika sliding camps heter PCNA


leading strand:

  • DNA pol epsilon
  • sliding clamp PCNA lagging strand:
  • DNA pol delta
  • sliding clamp PCNA

Löser problemet att RNA primer inte ska sitta löst

Primaset skiljer sig lite gran DNA-polymeras

  • RNA-primarna Ă€r c:a 5 olika
    • finns en risk att trilla av, de vill man inte i vĂ„ra celler
    • vi vill vara sĂ€kra pĂ„ att den verkligen anvĂ€nds
  • alfa.primas !Pasted image 20251121111829.png
  • DNA-polymeras alfa-primas
  • bĂ„de primas och polymeras i samma
  • enzym som sitter ihop (namn?)

om man har en mallstrÀng kommer enzymet att verka först

de kan byta plats utan att slÀppa

behöver bara en liten extra snutt, kommer sitta mkt mer stabilt pÄ DNA, utan att det finns risk att primern trillar bort.

!Pasted image 20251121111945.png

Vad Àr de olika polymerasen?

  • alpha-primas
  • delta
  • epsilon

!Pasted image 20251121112158.png

Ser likadana ut i bakterier, det Àr en ring som sitter och hÄller fast DNA pol Man kan uttrycka antikroppar mot PCNA, kan kroppen utveckla av misstag.


SLE/Lupus PCNA ANA


!Pasted image 20251121112518.png

Kan inte dela innan DNA-syntesen Àr fÀrdig och heller inte sÀtta igÄng, specifikt. En gÄng per cellcykel. DÄ fÄr vi felaktigt antal kopier.


Vi har upp till 30 000 origins i vÄra cell Alla gÄr inte igÄng alltid MÄnga mÄste gÄ igÄng för att kunna replikera tillrÀckligt fort 50-300kbp Ska börja ungefÀr samtidigt. Alla behövs


Hur hittar man en origin?

Det finns ett komplex som binder hela tiden, Origin recognition complex - komplexet som hittar origin. Som bestÄr av 6 proteiner. Sitter fast hel cellcykeln. En slags markör. !Pasted image 20251121113014.png


Hur pÄbörjas DNA replikation?


!Pasted image 20251121113046.png tvÄ rekryteringsfaktorer hjÀlper ORC att locka till sig DNA helikaset MCM.

laddningsfaktorer:

  • Cdc6 och cdt1 till ORC
  1. ORC complex sitter i hel cellcykeln
  2. CDC6 och CDT1
  3. Helikaset
  4. Sen laddar CDC6/CDT1/ORC upp MCM i G1-fasen

!Pasted image 20251121113406.png

Nu Àr det laddat, men inte aktivt.

KrÀver höga nivÄr av cyklinberoende kinas (CDK) för att kunna bilda CMG-helikaset

Viktigt att det bara gÄr att aktiva helikaset nÀr det finns mycket CDK

  • som en pistol som Ă€r laddad, för att kunna fĂ„ ivĂ€g kulan
  • CMG helikas smĂ€lts och replikationen kan man börja
  • Se till att man inte fĂ„r en dubbel aktivering (HUR?)

Noggrant: skilj laddning frÄn aktivering


Problem vid DNA-replikation Hur kan Àndarna pÄ linjÀrt DNA replikeras? Vi mÄste ju ha en RNA-primer? Detta Àr ett klassiskt problem.


!Pasted image 20251121114215.png

  • Behöver ha en RNA-primer i början, men nĂ€r vi kommer ut i slutet
  • den sista vi behöver lagging strand för behöver vi en primer
  • de fixar inte primerasen
  • vi kommer förlora lite i 5'-Ă€nden, över tiden blir det kortare och kortare till slut försvinner det
  • hur sĂ€kerstĂ€lls det att det gör att replikera hela vĂ€gen ut i Ă€ndan?

I Àndarna pÄ kromsomerna kallas telomerer

  • De blir kortare och kortare till cellen dör
  • Vilket betyder att en cell kan bara delas ett visst antal gĂ„nger, sen dör cellerna
  • Men det gĂ€ller inte alla celler
    • gĂ€ller somatiska celler
    • gĂ€ller inte stamceller
    • gĂ€ller inte cancerceller
  • vad Ă€r det som gör att telomererna kan finnas kvar i stam och cancerceller, men det blir kortare och kortare i alla andra celler? !Pasted image 20251121114507.png

I centrala dogman DNA→RNA→protein Men det finns möjlighet att gĂ„ RNA→DNA vilket Ă€r omvĂ€nt transkriptas


!Pasted image 20251121114559.png

Telomeras förlÀnger kromsomÀndarna.

  • Sker genom att lĂ€gga till en kort,
  • behöver en mall för att starta
  • har med sig en egen bit RNA som fungerar som mall
  • alla Ă€ndar ser likadana ut i slutĂ€ndan (C A A U C C C A A U C)
  • lĂ€gger till skrĂ€p DNA sĂ„ det Ă€r okej att förlora lite i Ă€ndarna