Johan Dahlin
81790199af
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 2m4s
172 lines
4.5 KiB
Markdown
172 lines
4.5 KiB
Markdown
---
|
|
tags:
|
|
- biokemi
|
|
- anteckningar
|
|
- initiering-och-terminering-eukaryot-dna-replikation
|
|
föreläsare: Claes Gustavsson
|
|
---
|
|
|
|
Brukar ställa frågor på de som finns i föreläsningar, titta på gamla frågor, inte ställa omöjliga frågor.
|
|
|
|
Bakgrund: Vi ska bli läkare, behöver veta vad som händer i humana celler
|
|
|
|
|
|
|
|
![[Pasted image 20251121111405.png]]
|
|
Generella bubblan gäller i våra celler
|
|
CMG helikas:
|
|
- Claes Mikael Gustavsson heter föreläsaren!
|
|
- MCM för att sätta ihop
|
|
- Gins
|
|
- Cdc45
|
|
|
|
Heter delta och epsilon heter polymerasen de är lite olika
|
|
sliding camps heter PCNA
|
|
|
|
-----
|
|
|
|
leading strand:
|
|
- DNA pol epsilon
|
|
- sliding clamp PCNA
|
|
lagging strand:
|
|
- DNA pol delta
|
|
- sliding clamp PCNA
|
|
|
|
---
|
|
|
|
Löser problemet att RNA primer inte ska sitta löst
|
|
|
|
Primaset skiljer sig lite gran
|
|
DNA-polymeras
|
|
- RNA-primarna är c:a 5 olika
|
|
- finns en risk att trilla av, de vill man inte i våra celler
|
|
- vi vill vara säkra på att den verkligen används
|
|
- alfa.primas
|
|
![[Pasted image 20251121111829.png]]
|
|
- DNA-polymeras alfa-primas
|
|
- både primas och polymeras i samma
|
|
- enzym som sitter ihop (namn?)
|
|
|
|
om man har en mallsträng kommer enzymet att verka först
|
|
|
|
de kan byta plats utan att släppa
|
|
|
|
behöver bara en liten extra snutt, kommer sitta mkt mer stabilt på DNA, utan att det finns risk att primern trillar bort.
|
|
|
|
![[Pasted image 20251121111945.png]]
|
|
|
|
|
|
Vad är de olika polymerasen?
|
|
- alpha-primas
|
|
- delta
|
|
- epsilon
|
|
|
|
----
|
|
![[Pasted image 20251121112158.png]]
|
|
|
|
Ser likadana ut i bakterier, det är en ring som sitter och håller fast DNA pol
|
|
Man kan uttrycka antikroppar mot PCNA, kan kroppen utveckla av misstag.
|
|
|
|
----
|
|
SLE/Lupus PCNA ANA
|
|
|
|
----
|
|
![[Pasted image 20251121112518.png]]
|
|
|
|
Kan inte dela innan DNA-syntesen är färdig och heller inte sätta igång, specifikt.
|
|
En gång per cellcykel. Då får vi felaktigt antal kopier.
|
|
|
|
----
|
|
|
|
Vi har upp till 30 000 origins i våra cell
|
|
Alla går inte igång alltid
|
|
Många måste gå igång för att kunna replikera tillräckligt fort
|
|
50-300kbp
|
|
Ska börja ungefär samtidigt.
|
|
Alla behövs
|
|
|
|
----
|
|
|
|
Hur hittar man en origin?
|
|
|
|
Det finns ett komplex som binder hela tiden, Origin recognition complex - komplexet som hittar origin. Som består av 6 proteiner. Sitter fast hel cellcykeln. En slags markör.
|
|
![[Pasted image 20251121113014.png]]
|
|
|
|
----
|
|
|
|
Hur påbörjas DNA replikation?
|
|
|
|
---
|
|
![[Pasted image 20251121113046.png]]
|
|
två rekryteringsfaktorer hjälper ORC att locka till sig DNA helikaset MCM.
|
|
|
|
laddningsfaktorer:
|
|
- Cdc6 och cdt1 till ORC
|
|
|
|
|
|
1. ORC complex sitter i hel cellcykeln
|
|
2. CDC6 och CDT1
|
|
3. Helikaset
|
|
4. Sen laddar CDC6/CDT1/ORC upp MCM i G1-fasen
|
|
|
|
---
|
|
|
|
![[Pasted image 20251121113406.png]]
|
|
|
|
Nu är det laddat, men inte aktivt.
|
|
|
|
Kräver höga nivår av cyklinberoende kinas (CDK) för att kunna bilda CMG-helikaset
|
|
|
|
Viktigt att det bara går att aktiva helikaset när det finns mycket CDK
|
|
- som en pistol som är laddad, för att kunna få iväg kulan
|
|
- CMG helikas smälts och replikationen kan man börja
|
|
- Se till att man inte får en dubbel aktivering (HUR?)
|
|
|
|
Noggrant: skilj **laddning** från **aktivering**
|
|
|
|
----
|
|
|
|
Problem vid DNA-replikation
|
|
Hur kan ändarna på linjärt DNA replikeras? Vi måste ju ha en RNA-primer?
|
|
Detta är ett klassiskt problem.
|
|
|
|
---
|
|
|
|
![[Pasted image 20251121114215.png]]
|
|
- Behöver ha en RNA-primer i början, men när vi kommer ut i slutet
|
|
- den sista vi behöver lagging strand för behöver vi en primer
|
|
- de fixar inte primerasen
|
|
- vi kommer förlora lite i 5'-änden, över tiden blir det kortare och kortare till slut försvinner det
|
|
- hur säkerställs det att det gör att replikera hela vägen ut i ändan?
|
|
|
|
---
|
|
|
|
I ändarna på kromsomerna kallas telomerer
|
|
|
|
- De blir kortare och kortare till cellen dör
|
|
- Vilket betyder att en cell kan bara delas ett visst antal gånger, sen dör cellerna
|
|
- Men det gäller inte alla celler
|
|
- gäller somatiska celler
|
|
- gäller inte stamceller
|
|
- gäller inte cancerceller
|
|
- vad är det som gör att telomererna kan finnas kvar i stam och cancerceller, men det blir kortare och kortare i alla andra celler?
|
|
![[Pasted image 20251121114507.png]]
|
|
|
|
---
|
|
|
|
I centrala dogman DNA→RNA→protein
|
|
Men det finns möjlighet att gå RNA→DNA vilket är omvänt transkriptas
|
|
|
|
---
|
|
|
|
![[Pasted image 20251121114559.png]]
|
|
|
|
Telomeras förlänger kromsomändarna.
|
|
- Sker genom att lägga till en kort,
|
|
- behöver en mall för att starta
|
|
- har med sig en egen bit RNA som fungerar som mall
|
|
- alla ändar ser likadana ut i slutändan (C A A U C C C A A U C)
|
|
- lägger till skräp DNA så det är okej att förlora lite i ändarna
|
|
|
|
|