Johan Dahlin
8481ab8ca4
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 1m52s
236 lines
8.6 KiB
Markdown
236 lines
8.6 KiB
Markdown
---
|
|
tags:
|
|
- biokemi
|
|
- glykolysen
|
|
- anteckningar
|
|
föreläsare: Ingela Parmryd
|
|
date: 2025-12-01
|
|
---
|
|
glykys = söt (grekiska)
|
|
lysis = sönderdelning
|
|
- - **-lys / -lyse / -lytic** → anger att något bryts ned eller löses upp.
|
|
10 steg
|
|
3 faser
|
|
Start: Glykos
|
|
Slut: Pyruvat
|
|
Kommer inte fråga om strukturformer för metaboliten
|
|
- kan vara bra
|
|
- SKA KUNNA namn på metaboliter och enzymer och föreståelse för reaktioner
|
|
|
|
## Energiinvesteringsfas
|
|
2 ATP förbrukas
|
|
2 ADP skapas
|
|
2 $H^+$ skapas
|
|
|
|
| Steg | Input | Output | Enzym | Reaktion | Reversibelt | Energi |
|
|
| ---- | ---------------- | --------------------- | ----------------------- | ------------------------------------------------------------------------------------------------- | ----------- | --------------------------- |
|
|
| 1 | Glykos | glykos-6-fosfat | hexokinas | fosforylering<br>gruppöverförning<br>glykosinbinding<br>konformationsändring<br>$H_2O$ stängs ute | Nej | Kräver ATP<br>Ger ADP+$H^+$ |
|
|
| 2 | glykos-6-fosfat | fruktos-6-fosfat | fosfosglykosisomeras | Isomerering<br>aldos→ketos<br>Möjliggör klyvning | Ja | |
|
|
| 3 | fruktos-6-fosfat | fruktos-1,6-bisfosfat | fosfofrukotkinas (PK-1) | fosforylering<br>gruppöverförning<br>hindrar återisomerisering | Nej | Kräver ATP<br>Ger ADP+$H^+$ |
|
|
|
|
|
|
## Klyvningsfas
|
|
6 kol blir 2 st 3 col
|
|
|
|
| Steg | Input | Output | Enzym | Reaktion | Reversibelt | Energi |
|
|
| ---- | --------------------- | ----------------------------------------------------- | ------------------- | -------------------- | ----------- | ------ |
|
|
| 4 | fruktos-1,6-bisfosfat | dihydroxyacetonfosfat +<br>glyceraldehyd-3-fosfat<br> | aldolas | klyvning 6C→2x3C<br> | Ja | |
|
|
| 5 | dihydroxyacetonfosfat | glyceraldehyd-3-fosfat | triosfosfatisomeras | isomerisering | Ja | |
|
|
|
|
|
|
## Energiutvinningsfas
|
|
|
|
6
|
|
- dehydrokinas plockar väten (oxidation)
|
|
- $NAD^+$ → $NADH$ oxideras
|
|
- GA3PDH utför två reaktioner en fördelaktig och en ofördelaktig
|
|
- tioester är intermediär - möjliggör koppling
|
|
- ![[Pasted image 20251201104247.png|200]]
|
|
7
|
|
- gruppöverföring, en molekyl till en annan
|
|
substratnivåfosforylering ATP bildas i en reaktion gruppöverföring
|
|
8
|
|
- mutas - isomeriserar genom att flytta funktioell grupp
|
|
|
|
Nedanstående steg sker 2 ggr
|
|
|
|
| Steg | Input | Output | Rev | Enzym | Reaktion | Energi |
|
|
| ---- | ---------------------- | --------------------- | --- | ----------------------------------- | ------------------------------------------------------- | ---------------------------- |
|
|
| 6 | glyceraldehyd-3-fosfat | 1,3-bisfosfatglycerat | Ja | glyceraldehyd-3-fosfat-dehydrokinas | oxidation (fördelaktig)<br>fosforylering (ofördelaktig) | Ger $NAD^+$ → $NADH$<br>$Pi$ |
|
|
| 7 | 1,3-bisfosfatglycerat | 3-fosfatglycerat | Ja | fosfoglyceratkinas | substratnivåfosforylering | Ger ATP |
|
|
| 8 | 3-fosfatglycerat | 2-fosfoglycerat | Ja | fosfoglyceratmutas | isomerisering | |
|
|
| 9 | 2-fosfoglycerat | fosfoenolpyruvat | Ja | enolas | dehydratisering | Ger $H_2O$ |
|
|
| 10 | fosfoenolpyruvat | pyruvat | Nej | pyruvatkinas | substratnivåfosforylering | Ger ATP |
|
|
Vad utvinns?
|
|
- 4 ATP
|
|
- 2 NADH + $H^+$
|
|
- 2 $H_2O$
|
|
|
|
Varför sitter de olika enzymerna i glykolysen i ett komplex?
|
|
- gör det snabbare om de sitter nära varandra
|
|
|
|
----
|
|
### Fosforyltransferpotential
|
|
|
|
Fruktos i framförallt i levern
|
|
- fruktos 1-fosfat
|
|
- klyvs till deoxyacetonfosfat + glyceraldehyd
|
|
- deoxyacetonfosfat kan gå in i glykolysen
|
|
- glyceraldehyd behöver fosforylseras till glyceralaldehyd 3-fosfat
|
|
|
|
Olika sockerarter utvinner olika mycket energi. Värre att äta fruktos eller glykos, fettinlagrning. Det finns inte mer energi fruktos än i glykos.
|
|
|
|
Hur tar sig galaktos in i glykolysen?
|
|
- det tar sig in i 4 steg
|
|
- blir så småningom glykos-6-fosfat (som hittas långt upp i glykolysen)
|
|
|
|
|
|
----
|
|
|
|
### Laktosintolerans
|
|
Enzym: laktas
|
|
|
|
laktos + $H_2O$ <→ glukos + galaktos
|
|
|
|
Vi har kvar 5% som vuxna av enzymet.
|
|
Baketerier som älskar det och producerar metanol och vätgas. Vatten går även ut i floran.
|
|
|
|
Fyra olika platser i världen har laktostolerans
|
|
- varit fördelaktigt att reproducera om man kan anväanda alternativ kost när det varit brist på föda
|
|
Avsild utveckling tll tolerans på fyra platser
|
|
- reproduktionsfördel
|
|
|
|
### Galaktitol
|
|
|
|
Om galaktos ej omvandlas till galaktos till glykosintermediär
|
|
→ ackumulering av galaktitol, lagras i linsen
|
|
→ vatten tas upp → grumling
|
|
|
|
|
|
### Återbildning av NAD+ hastighetsbegränsande
|
|
|
|
Om aerobt
|
|
- ETK
|
|
Om anaerobt
|
|
- fermentering
|
|
- ATP bildas med både organisk dontator och acceptor för elektroner
|
|
- redoxneutralt
|
|
- Fermetering bakom alkohol, surkål, crème frache
|
|
|
|
![[Pasted image 20251201112326.png|300]]
|
|
|
|
|
|
## Glykolys vid $O_2$
|
|
|
|
glykos + 2 ADP + 2Pi + 2 $NAD^+$ → 2 pyruvat + 2$H_2O$ + 2NADH + 2$H^+$ + 2ATP
|
|
|
|
### Glykolys utan $O_2$
|
|
|
|
glykos + 2 ADP+ 2Pi → 2 pyruvat + 2$H_2O$ + 2$H^+$ + 2ATP
|
|
|
|
$\Delta G = -22kcal/mol$ (för hela glykolysen)
|
|
|
|
-----
|
|
|
|
### Reglering av enzymaktivitet
|
|
|
|
inhibitorer eller stimulatorer
|
|
konformationsändring:
|
|
- allosteriskt (millisekunder
|
|
- kovalent modifiering (sekunder)
|
|
enzymmängd
|
|
- transkribera→translation (timmar)
|
|
- hormonell reglering
|
|
separation av enzym & substrat
|
|
- de har inte tillgång till varandra, celler som inte tar upp glykos om det inte finns
|
|
|
|
### Fosfofruktokinas
|
|
|
|
Huvudsaklig regleringspunkt (3:e steget i glykolysen)
|
|
- 1:a steget kan även bilda glykogen, 3:e är första unika steget för glykolysen
|
|
I skelettmuskeln regleras det av energikvoten (båda allosteriska regulatorer)
|
|
- (-) ATP: mycket ATP att göra enzymet mindre effektivt (kan spara till svårare förhållande)
|
|
- (+) ADP: stimuleras av AMP
|
|
- (-) om pH sjunker lägre än 6.3, så funkar inte enzymet längre
|
|
I lever som ovan,
|
|
- det finns mycket energi, mycket citrat, vi behöver inte bryta ner med
|
|
- (-) citrat
|
|
- (+) fruktos 2,6-bisfosfat
|
|
- fruktos-6-fosfat
|
|
- feedforward
|
|
|
|
### Hexokinas
|
|
första steget i glykolysen
|
|
muskel
|
|
- (-) glukos-6-fosfat - feedback
|
|
- byggs upp mycket när fosfogruktokinas inhiberas
|
|
lever
|
|
- Använder glukokinas
|
|
- 50x lägre affinitet
|
|
|
|
|
|
### Pyruvatkinas
|
|
10:e steget i glykolysen
|
|
|
|
Muskel
|
|
- förekommer i m-form, muskel-form
|
|
- energikvot
|
|
- (-) ATP (allosterisk)
|
|
- (+) fruktos-1,6-bisfosfat (feedforward)
|
|
Lever
|
|
- finns i L-form
|
|
- regleras som i muskel samt
|
|
- (-) alanin (feedback)
|
|
- aminosyra men ett steg från pyruvat!
|
|
- (-) fosforylering
|
|
- styrs från glykagon via PKA
|
|
- finns det inte glykagon finns det inte mycket blodsocker, då vill man inte köra glykolysen utan köra åt andra hållet
|
|
|
|
![[Pasted image 20251201114708.png|200]]
|
|
GLUT4 i skelettmuskel och adipocyter om det finns insulin
|
|
- till plasmamembranet om det finns insulin $[glukos]_{blod}$ är högt
|
|
GLUT2
|
|
- levern & b-celler
|
|
|
|
### Glykos & Cancerceller
|
|
|
|
Föredrar glyklys - Warberg-effekten
|
|
Upptäcktes för 100 år sen
|
|
|
|
Man kan se det i PET-scans, som gör att man kan lokalisera tumörer.
|
|
Kan använda det för att följa effekter av behandling.
|
|
|
|
Använder glykos även när syre finns
|
|
|
|
Frågor
|
|
|
|
När och var förekommer glykolys under anaeroba förhållanden hos en människa?
|
|
- alltid i erytrocyter
|
|
- näthinnan
|
|
- yttersta lagret av huden
|
|
|
|
Varför använder cancerceller företrädesvis anaerob glykolys?
|
|
Laktat
|
|
- förbättrar invasion
|
|
- hämmar immunförsvaret
|
|
- surt är bra för cancercellen
|
|
- behövs byggstenar
|
|
- glykolys intermediärer
|
|
- behävs även till pentosfosfatvägen som är viktig för anabolism
|
|
|
|
---
|
|
### Summering
|
|
|
|
7st reversibla, 3 irreversibla (1, 3, 10)
|
|
Oxination
|
|
NAD+ är hastighetsbegränsande
|
|
Anaerob och aeroba
|
|
laktas fermenteras
|
|
feedback, reglerar något som hänt tidigare, aktivering eller inaktiver
|
|
feedforward tidigt steg, reglerar något senare (ofta allosteriska)
|
|
fruktos-2,6-bisfosfat viktig regulator
|
|
Warberg, cancerceller frodas i sur miljö och b
|
|
|
|
|
|
|