medical-notes/content/Biokemi/Cellulära processer/Utforska proteiner/Instuderingsfrågor.md

---
tags:
  - biokemi
  - utforska-proteiner
  - instuderingsuppgifter
föreläsare: Ingela Parmryd
---
### Vad är definitionen av ”genom”?
```spoiler-block:
Allt genetiskt material (DNA) i en organism eller cell.
```

### 1. Vad menas med ”proteom”?
```spoiler-block:
Samtliga proteiner som uttrycks i en cell, vävnad eller organism vid ett givet tillfälle.
```

### 2. Vad menas med ett homogenisat?
```spoiler-block:
En cell- eller vävnadssuspension där celler har brutits sönder.
```

### 3. Egenskaper hos proteiner som kan användas för rening
```spoiler-block:
Storlek, laddning, hydrofobicitet och specifik bindningsförmåga.
```

### 4. I vilken ordning elueras proteiner vid gelfiltrering?
```spoiler-block:
Stora proteiner först, små sist.
```

### 5. Vilken laddning har proteiner som binder en katjonbytare?
```spoiler-block:
Positiv laddning.
```

### 6. Vilken laddning har proteiner som inte binder till katjonbytare?
```spoiler-block:
Negativ eller neutral laddning.
```

### 7. Vilken laddning har proteiner som binder en anjonbytare?
```spoiler-block:
Negativ laddning.
```

### 8. Vilken laddning har proteiner som inte binder till anjonbytare?
```spoiler-block:
Positiv eller neutral laddning.
```

### 9. Hur eluerar man protein från en katjonbytare?
```spoiler-block:
Genom ökad salthalt eller ändrat pH.
```

### 10. Vad menas med affinitetskromatografi?
```spoiler-block:
Rening baserad på specifik bindning mellan protein och ligand.
```

### 11. Hur elueras 6xHis-protein från Ni²⁺-kolonn?
```spoiler-block:
Med imidazol.
```

### 12. Vad kallas det automatiserade systemet för proteinrening?
```spoiler-block:
ÄKTA-system.
```

### 13. Vilken parameter följs oftast?
```spoiler-block:
Absorbans vid 280 nm.
```

### 14. Vilken gel används i SDS-PAGE?
```spoiler-block:
Polyakrylamidgel.
```

### 15. Vad är SDS?
```spoiler-block:
Ett anjoniskt detergent (natriumdodecylsulfat).
```

### 16. Vilken laddning har SDS?
```spoiler-block:
Negativ.
```

### 17. Vad hamnar högst upp respektive längst ner i SDS-PAGE?
```spoiler-block:
Stora proteiner överst, små längst ner.
```

### 18. Hur visualiseras SDS-PAGE?
```spoiler-block:
Coomassie-färgning eller silverfärgning.
```

### 19. Vad menas med proteinreferens?
```spoiler-block:
Molekylviktsmarkör (protein ladder).
```

### 20. Vad är isoelektrisk fokusering?
```spoiler-block:
Separation av proteiner efter deras isoelektriska punkt (pI).
```

### 21. Vad är tvådimensionell gelelektrofores?
```spoiler-block:
Kombination av isoelektrisk fokusering och SDS-PAGE.
```

### 22. Hur används SDS-PAGE för att följa proteinrening?
```spoiler-block:
Genom att analysera renhet och bandintensitet över reningssteg.
```

### 23. Vad är en antikropp?
```spoiler-block:
Ett protein som specifikt binder ett antigen.
```

### 24. Vad är ett antigen?
```spoiler-block:
En molekyl som känns igen av antikroppar.
```

### 25. Vad är en epitop?
```spoiler-block:
Den del av antigenet som antikroppen binder.
```

### 26. Vad kännetecknar en monoklonal antikropp?
```spoiler-block:
Binder en enda specifik epitop.
```

### 27. Vad kännetecknar polyklonala antikroppar?
```spoiler-block:
Binder flera epitoper på samma antigen.
```

### 28. Hur tillverkas monoklonala antikroppar?
```spoiler-block:
Via hybridomteknik (B-cell + myelomcell).
```

### 29. Beskriv ELISA
```spoiler-block:
En enzymbaserad metod för att detektera antigen eller antikroppar.
```

### 30. Beskriv indirekt ELISA
```spoiler-block:
Antigen på platta → primärantikropp → enzymkopplad sekundärantikropp.
```

### 31. Beskriv Sandwich ELISA
```spoiler-block:
Antigen fångas mellan två antikroppar.
```

### 32. Vilken ELISA-metod är mest specifik?
```spoiler-block:
Sandwich ELISA.
```

### 33. Kliniska applikationer för ELISA
```spoiler-block:
Indirekt: antikroppsdetektion (infektioner).  
Sandwich: antigen-/hormondetektion.
```

### 34. Vad är Western blot?
```spoiler-block:
Proteiner separeras med SDS-PAGE, överförs till membran och detekteras med antikroppar.
```

### 35. Skillnad mellan SDS-PAGE och Western blot?
```spoiler-block:
SDS-PAGE separerar proteiner; Western blot identifierar specifika proteiner.
```

### 36. Vad kan masspektrometri detektera?
```spoiler-block:
Proteiner, peptider, metaboliter och lipider.
```

### 37. Användningsområden för masspektrometri
```spoiler-block:
Proteomik, identifiering av proteiner, posttranslationella modifieringar.
```

### 38. Varför behövs kristaller för röntgenkristallografi?
```spoiler-block:
För att ge regelbundet diffraktionsmönster.
```

### 39. Varför är hög upplösning viktig?
```spoiler-block:
För att kunna se atomära detaljer i strukturen.
```

### 40. Vanligaste atomen i NMR?
```spoiler-block:
¹H (väte).
```

### 41. Fördel med kryo-EM jämfört med röntgenkristallografi?
```spoiler-block:
Kräver inga kristaller och kan studera stora komplex i nära nativt tillstånd.
```