medical-notes/content/Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/Instuderingsfrågor.md

---
tags:
  - biokemi
  - anteckningar
  - rna-syntes
föreläsare: Claes Gustavsson
---
#### 1. Hur ser en transkriptionsbubbla ut?
```spoiler-block:
Ett lokalt uppsmält DNA-område (~12–17 bp) där strängarna separeras så RNA-polymeras kan läsa templatsträngen.
```

#### 2. Vilka tre typer av RNA-polymeraser finns i kärnan och vilka gener transkriberar de?
```spoiler-block:
RNA-pol I: rRNA (28S, 18S, 5.8S).  
RNA-pol II: mRNA och vissa snRNA.  
RNA-pol III: tRNA, 5S rRNA och små RNA.
```

#### 3. Vad är alfa-amanitin?
```spoiler-block:
Ett toxin från flugsvamp som hämmar RNA-polymeras II (och svagt III).
```

#### 4. Vilka sekvenselement hittar man vid en eukaryot promotor?
```spoiler-block:
TATA-box, Inr (initiator), BRE och ibland CAAT- och GC-boxar.
```

#### 5. Hur bildas preinitieringskomplexet?
```spoiler-block:
Generella transkriptionsfaktorer och RNA-pol II binds stegvis till promotorn.
```

#### 6. Vilka aktiviteter hos TFIIH startar transkriptionen?
```spoiler-block:
Helikasaktivitet som öppnar DNA och kinasaktivitet som fosforylerar CTD.
```

#### 7. Vilken roll spelar CTD vid transkription och mRNA-processning?
```spoiler-block:
CTD fosforyleras och rekryterar faktorer för capping, splicing och polyadenylering.
```

#### 8. Hur processas den primära RNA-molekylen till moget mRNA?
```spoiler-block:
5’-capping, borttagning av introner (splicing) och poly(A)-svans.
```

#### 9. Vad är en 5’-cap och vilken funktion har den?
```spoiler-block:
En 7-metylguanosin-kap som skyddar mRNA, krävs för export och translation.
```

#### 10. Vad är en poly(A)-svans och vilken funktion har den?
```spoiler-block:
En kedja av adenosiner som sätts på posttranskriptionellt; ökar stabilitet och translation.
```

#### 11. Vad är intron och exon?
```spoiler-block:
Introner är icke-kodande sekvenser som tas bort; exoner är sekvenser som ingår i moget mRNA.
```

#### 12. Beskriv de grundläggande stegen vid splicing!
```spoiler-block:
Spliceosomen klipper vid 5’-splice site, bildar lariat, klipper 3’-splice site och ligerar exoner.
```

#### 13. Vad är alternativ splicing och dess betydelse?
```spoiler-block:
Olika kombinationer av exoner ger flera proteiner från samma gen och ökar proteomets komplexitet.
```