Johan Dahlin
bb52f6d884
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 1m19s
80 lines
3.1 KiB
Markdown
80 lines
3.1 KiB
Markdown
---
|
|
tags:
|
|
- biokemi
|
|
- enzymer
|
|
- anteckningar
|
|
föreläsare: Martin Ott
|
|
---
|
|
|
|
Vad bestämmer reaktionshastigheten
|
|
- temperatur
|
|
- tryck
|
|
- reaktionens natur
|
|
- koncentration av reaktanterna
|
|
- lösningsmedel etc ej viktig för denna föreläsning
|
|
|
|
En ökning av temperaturen minskar kinesiska energin som behövs för att utföra reaktionen
|
|
(reaktantmolekylerna)
|
|
- det höjer sannolikheten att molekylerna krockar med varandra eftersom det krävs mindre energi för att det ska ske
|
|
|
|
Aktiveringsenergin är skillnaden mellan övergångstillståndet och reaktanterna (T - R)
|
|
![[Pasted image 20251112085054.png|400]]
|
|
Nettoreaktioenn P - R är alltid det samma, oavsett aktiveringsenergi.
|
|
Aktiveringsenergin kan sänkas med en katalysator som en enzym.
|
|
|
|
Ej reaktion utan katalysator kostar mer, kräver mer energi
|
|
Katalysatorn gör att det går fortare
|
|
![[Pasted image 20251112085710.png|350]]
|
|
|
|
Katalysatorn binder in reaktanterna i rätt konfiguration, förlänger/stabiliserar övergångstillståndet
|
|
|
|
## Enzymer
|
|
Vanligaste katalysatorerna i kroppen är enzymer gjorda av proteiner, men det finns ett par stycken som är RNA.
|
|
|
|
Aktiva ytan av enzymen måste passa formen på produkten. Enzymet tvingar någonting som liknar övergångstillståndet som förenklar övergångstillståndet
|
|
|
|
Enzymet kan antingen
|
|
- stabilisera TS (övergångstillstånd)
|
|
- erbjuda alternativ reaktionsväg TS
|
|
|
|
aktiv site / klyfta / trång inbuktning
|
|
- specificitet för substrat
|
|
- miljö som förenklar reaktionen
|
|
- utesluter vatten
|
|
|
|
enzymer är unika för att de kan välja substrat med hög specificitet
|
|
ett slags nyckelhål
|
|
![[Pasted image 20251112093538.png|300]]
|
|
|
|
Finns också enzymer som byter form för att substratet ska passa
|
|
![[Pasted image 20251112093609.png|300]]
|
|
|
|
I en klyfta/aktivt centrum finns det speciella kemiska miljöer som t.ex. deprotonerad serin som är mycket hydrofob vilket gör att vatten kan uteslutas så vi bara får de substrat vi vill
|
|
|
|
![[Pasted image 20251112094043.png|500]]
|
|
reaktioner i ett enzym sker på en liten del, men proteinerna är ofta stora, det är för att stabilisera en sådan klyfta och säkerställa och en viss form kan skapa, tillräckligt med massa runt omkring för att klyftan ska vara stabil.
|
|
- Aktiva centret kan vara uppbyggt av aminosyrasekvenser väldigt lång ifrån varandra på grund av veckning
|
|
- allesteriska receptorer har sina egna siter
|
|
- finns speciella substratkanaler
|
|
|
|
Allosteri - enzymet påverkas av något som händer någon annanstans
|
|
- inhibitorer, nu har vi tillverkat tillräckligt med produkt
|
|
- aktivering, man ändrar strukturen på enzymet med hjälp av t.ex. fosforylering
|
|
- kooperativit - enzymet ökar om det finns mer produkter
|
|
|
|
co-faktor: nödvändigt bihang som inte är protein
|
|
apoenzym: proteindelen av enzymet
|
|
holoenzym: apoenzym + co-faktor
|
|
cozenum: co-faktor som är organisk molekyl
|
|
prostetisk grupp: co-enzym hårt bundet till apoenzym
|
|
|
|
vitaminer metaboliseras till co-enzymer
|
|
|
|
![[Pasted image 20251112095158.png]]
|
|
|
|
![[Pasted image 20251112095205.png]]
|
|
Coenzymer kan flytta intermediärer mellan subenheter/polypeptidkedjor i enzymproteinkomplexet → ett enzym kan ha flera aktiva centrum
|
|
|
|
|
|
|