Johan Dahlin
d0890bee08
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 2m52s
112 lines
2.9 KiB
Markdown
112 lines
2.9 KiB
Markdown
|
||
# Kromosomer och kromatin
|
||
|
||
## Grundprincip
|
||
- Nukleärt DNA är organiserat i kromosomer.
|
||
- I kärnan är DNA bundet till proteiner → **kromatin**.
|
||
|
||
---
|
||
|
||
# Upptäckten av nukleosomen
|
||
|
||
## Experimentet som avslöjade nukleosomen
|
||
1. Isolera kärnor
|
||
2. Klyv med ospecifikt endonukleas (DNase I)
|
||
3. Analysera fragmenten med gelelektrofores
|
||
|
||
**Resultat:**
|
||
- Små ”pärlor” innehöll DNA (150–200 bp) + proteiner → **histoner**.
|
||
|
||
---
|
||
|
||
# Histoner
|
||
|
||
## Evolutionär konservering
|
||
- De små pärlorna visade sig innehålla en grupp **högt konserverade proteiner**.
|
||
- Exempel: histon H4 skiljer sig med endast **två aminosyror** mellan gröna ärtor och kor.
|
||
- Evolutionär distans: **≈1,3 miljarder år**.
|
||
|
||
---
|
||
|
||
# Nukleosomen
|
||
|
||
## Nucleosome core particle
|
||
En nukleosom består av:
|
||
- **2 × H2A**
|
||
- **2 × H2B**
|
||
- **2 × H3**
|
||
- **2 × H4**
|
||
|
||
Totalt: **8 proteiner (histonoktamer)**
|
||
DNA: **146 bp** virat **1,75 varv** runt oktameren.
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## Histon H1
|
||
- Ett femte histon som binder till **linker-DNA**.
|
||
- Mindre konserverat.
|
||
- Har en **stabiliserande effekt** på nukleosomen.
|
||
|
||
---
|
||
|
||
# Kromatinets funktionella betydelse
|
||
- När DNA täcks av histoner → **repressiv effekt**.
|
||
- DNA måste öppnas för processer som:
|
||
- DNA-replikation
|
||
- Transkription
|
||
|
||
---
|
||
|
||
# Histonsvansar
|
||
|
||
## Struktur
|
||
- N-terminala delar (främst H3 och H4) sticker ut från nukleosomen.
|
||
- Dessa svansar påverkar hur hårt histoner binder DNA.
|
||
|
||
## Modifieringar
|
||
- Modifieringar alters styrka i bindningen:
|
||
- **Acetylering**
|
||
- Neutraliserar positiva laddningar på lysin/arginin
|
||
- → svagare bindning till negativ DNA-ryggrad
|
||
- **Metylering**
|
||
- Flera andra modifieringar förekommer
|
||
|
||
### Funktion
|
||
- Modifieringar kan **aktivera eller repressa** genuttryck.
|
||
- Detta är **epigenetisk reglering** → styrning utan förändring i DNA-sekvensen.
|
||
|
||
---
|
||
|
||
# Histonkoden
|
||
- Den specifika **kombinationen** av modifieringar är avgörande.
|
||
- Kallas populärt **”histonkoden”**.
|
||
|
||
---
|
||
|
||
# Histoner vid DNA-replikation
|
||
- Nukleosomer tas bort av replikationsmaskineriet och byggs om direkt bakom replikationsgaffeln.
|
||
- Gamla histoner fördelas **jämnt** mellan de två dottersträngarna.
|
||
- Detta ger **semikonservativ nedärvning** av epigenetiska markeringar.
|
||
- Specialiserade proteinmaskiner reglerar modifieringar (mer i termin 3).
|
||
|
||
---
|
||
|
||
# Kromatinets organisation i högre nivåer
|
||
|
||
## Organisation
|
||
- **A:** 30 nm-fiber i interfas-kromosom
|
||
- **B:** Nukleosomer längs DNA
|
||
|
||
## Loopar och protein-ställningar
|
||
- DNA organiseras även i **loopar**, som fästs vid proteinstrukturer.
|
||
- Loopars aktivitet kan regleras via:
|
||
1. **Histonmodifieringar**
|
||
2. **Topoisomeraser**
|
||
|
||
Dessa styr **åtkomlighet och packning** av det genetiska materialet.
|
||
|
||
---
|
||
|
||
# Sammanfattning
|
||
- Flera nivåer av DNA-packning krävs för att få plats i cellkärnan.
|
||
- Reglering sker både via histonmodifieringar och strukturell organisering av kromatin. |