80 lines
5.1 KiB
Markdown
80 lines
5.1 KiB
Markdown
```
|
||
Replikationsbubbla bildas vid {{c1::origin of replication}} där DNA öppnas och syntes sker i två riktningar.
|
||
Replikationsgaffel är punkten där {{c1::helikas separerar DNA}} och polymeras arbetar.
|
||
Origin of replication är {{c1::en specifik DNA-sekvens där replikation startar}}.
|
||
Leading strand syntetiseras {{c1::kontinuerligt}} i 5’→3’-riktning.
|
||
Lagging strand syntetiseras {{c1::diskontinuerligt}} som Okazaki-fragment.
|
||
Okazaki-fragment är {{c1::100-200 nt långa bitar i eukaryoter}}.
|
||
3’→5’-exonukleas hos DNA-polymeras ger {{c1::proofreading}}.
|
||
Proofreading tar bort {{c1::felaktig nukleotid}} innan kedjan fortsätter.
|
||
Processivitet är {{c1::polymerasets förmåga att fortsätta syntes utan att lossna}}.
|
||
Sliding clamp (PCNA) ökar processivitet genom {{c1::att hålla polymeraset fast på DNA}}.
|
||
Primas är {{c1::ett enzym som gör RNA-primers}}.
|
||
RNA-primers behövs för {{c1::att DNA-polymeras inte kan starta de novo}}.
|
||
Okazaki fragment maturation sker via {{c1::FEN1 som klyver flap + DNA-ligas som försluter nicken}}.
|
||
FEN1 är {{c1::ett endonukleas som tar bort RNA-primer-flaps}}.
|
||
Exonukleas tar bort nukleotider {{c1::från ändarna}}.
|
||
Endonukleas klyver DNA {{c1::mitt i strängen}}.
|
||
Helikas separerar DNA genom {{c1::ATP-driven upplindning av dubbelhelixen}}.
|
||
RPA (Replication Protein A) binder {{c1::enkelsträngat DNA och stabiliserar det}}.
|
||
Positiva supercoils bildas {{c1::framför helikas när DNA tvingas öppnas}}.
|
||
Topoisomeras I tar bort supercoils genom {{c1::enkelsträngsbrott utan ATP}}.
|
||
Topoisomeras II tar bort supercoils genom {{c1::dubbelsträngsbrott med ATP}}.
|
||
CMG-komplexet består av {{c1::Cdc45, MCM och GINS}}.
|
||
ORC är proteinkomplexet som {{c1::binder origin hela cellcykeln}}.
|
||
MCM laddas på DNA i {{c1::G1-fasen}}.
|
||
Cdc45 och GINS binder till MCM i {{c1::S-fasen}}.
|
||
CMG-helikaset aktiveras i S-fasen och {{c1::öppnar DNA vid replikationsstart}}.
|
||
PCNA:s roll är {{c1::sliding clamp som ökar polymerasets processivitet}}.
|
||
PCNA har formen av {{c1::en trimerisk ring}} runt DNA.
|
||
DNA-polymeras ε syntetiserar {{c1::leading strand}}.
|
||
DNA-polymeras δ syntetiserar {{c1::lagging strand}}.
|
||
Primers på lagging strand tas bort av {{c1::FEN1 och RNase H}}.
|
||
DNA-ligas försluter {{c1::nicks mellan Okazaki-fragment}}.
|
||
Topoisomeraser förhindrar {{c1::stopp i replikationen pga topologisk stress}}.
|
||
Supercoils uppstår eftersom {{c1::dubbelhelixen inte kan rotera fritt}}.
|
||
Bakteriofager får bakteriellt DNA genom {{c1::fel vid packning}} eller {{c2::imprecise excision av profag}}.
|
||
Eukaryot DNA-replikation sker alltid i {{c1::5’→3’-riktning}}.
|
||
Okazaki-fragment bildas endast på {{c1::lagging strand}}.
|
||
```
|
||
|
||
Round two
|
||
|
||
```
|
||
Replikationsbubbla bildas när {{c1::helikas öppnar DNA vid origin of replication}}.
|
||
Replikationsgaffel är {{c1::punkten där DNA separeras och syntes sker i två riktningar}}.
|
||
Origin of replication är {{c1::en specifik DNA-sekvens där replikation initieras}}.
|
||
Eukaryoter har {{c1::många origins}}, bakterier {{c2::ett origin}}.
|
||
Leading strand syntetiseras {{c1::kontinuerligt}} i 5’→3’.
|
||
Lagging strand syntetiseras {{c1::diskontinuerligt som Okazaki-fragment}}.
|
||
Okazaki-fragment i eukaryoter är {{c1::100-200 nt}} långa.
|
||
DNA-polymeras kan bara syntetisera {{c1::5’→3’}}.
|
||
3’→5’-exonukleas ger {{c1::proofreading och korrigering av fel}}.
|
||
Processivitet är {{c1::polymerasets förmåga att fortsätta syntes utan att lossna}}.
|
||
PCNA ökar processiviteten genom {{c1::att fungera som sliding clamp}}.
|
||
PCNA har formen av {{c1::en ringformad trimer runt DNA}}.
|
||
Primas syntetiserar {{c1::RNA-primers}} som startpunkter för DNA-syntes.
|
||
DNA-polymeras α/primase gör {{c1::hybridprimer (RNA+DNA) för lagging och leading strand}}.
|
||
RNA-primers tas bort av {{c1::RNase H}} och {{c2::FEN1}}.
|
||
FEN1 klyver {{c1::RNA-DNA-flaps vid Okazaki-mognad}}.
|
||
Okazaki fragment maturation avslutas av {{c1::DNA-ligas som försluter nicks med ATP}}.
|
||
Exonukleas klyver {{c1::från ände}}; endonukleas klyver {{c2::inuti DNA-strängen}}.
|
||
Helikas öppnar DNA genom {{c1::ATP-driven upplindning}}.
|
||
Eukaryot enkelsträngsbindande protein heter {{c1::RPA (Replication Protein A)}}.
|
||
RPA skyddar {{c1::ssDNA}} från degradering och sekundärstruktur.
|
||
Positiva supercoils bildas {{c1::framför helikas då DNA inte kan rotera fritt}}.
|
||
Topoisomeras I gör {{c1::enkelsträngsbrott utan ATP}}.
|
||
Topoisomeras II gör {{c1::dubbelsträngsbrott med ATP}} och tar bort supercoils.
|
||
Bakteriellt topoisomeras II kallas {{c1::DNA-gyras}}.
|
||
Gyras hämmas av {{c1::fluorokinoloner (t.ex. ciprofloxacin)}}.
|
||
ORC (Origin Recognition Complex) är bundet {{c1::till origins hela cellcykeln}}.
|
||
MCM laddas på DNA under {{c1::G1-fasen}}.
|
||
Cdc45 och GINS binder MCM i {{c1::S-fasen}}.
|
||
CMG-komplexet består av {{c1::Cdc45}}, {{c2::MCM}}, {{c3::GINS}}.
|
||
CMG-helikasets funktion är {{c1::att smälta DNA och öppna gaffeln vid replikationsstart}}.
|
||
DNA-polymeras ε syntetiserar {{c1::leading strand}}.
|
||
DNA-polymeras δ syntetiserar {{c1::lagging strand}}.
|
||
Replisomen är {{c1::hela proteinmaskineriet vid replikationsgaffeln}}.
|
||
DNA-replikation är {{c1::semi-konservativ}}.
|
||
Bakteriofager kan få bakteriellt DNA genom {{c1::packningsfel}} eller {{c2::imprecise excision av profag}}.
|
||
``` |