1
0
Files
medical-notes/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Anteckningar.md
Johan Dahlin 25e1578778
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 4m30s
vault backup: 2025-12-01 13:14:27
2025-12-01 13:14:27 +01:00

8.6 KiB

tags, föreläsare, date
tags föreläsare date
biokemi
glykolysen
anteckningar
Ingela Parmryd 2025-12-01

glykys = söt (grekiska) lysis = sönderdelning

    • -lys / -lyse / -lytic → anger att något bryts ned eller löses upp. 10 steg 3 faser Start: Glykos Slut: Pyruvat Kommer inte fråga om strukturformer för metaboliten
  • kan vara bra
  • SKA KUNNA namn på metaboliter och enzymer och föreståelse för reaktioner

Energiinvesteringsfas

2 ATP förbrukas 2 ADP skapas 2 H^+ skapas

Steg Input Output Enzym Reaktion Reversibelt Energi
1 Glykos glykos-6-fosfat hexokinas fosforylering
gruppöverförning
glykosinbinding
konformationsändring
H_2O stängs ute
Nej Kräver ATP
Ger ADP+H^+
2 glykos-6-fosfat fruktos-6-fosfat fosfosglykosisomeras Isomerering
aldos→ketos
Möjliggör klyvning
Ja
3 fruktos-6-fosfat fruktos-1,6-bisfosfat fosfofrukotkinas (PK-1) fosforylering
gruppöverförning
hindrar återisomerisering
Nej Kräver ATP
Ger ADP+H^+

Klyvningsfas

6 kol blir 2 st 3 col

Steg Input Output Enzym Reaktion Reversibelt Energi
4 fruktos-1,6-bisfosfat dihydroxyacetonfosfat +
glyceraldehyd-3-fosfat
aldolas klyvning 6C→2x3C
Ja
5 dihydroxyacetonfosfat glyceraldehyd-3-fosfat triosfosfatisomeras isomerisering Ja

Energiutvinningsfas

6

  • dehydrokinas plockar väten (oxidation)
  • NAD^+NADH oxideras
  • GA3PDH utför två reaktioner en fördelaktig och en ofördelaktig
  • tioester är intermediär - möjliggör koppling
  • !Pasted image 20251201104247.png 7
  • gruppöverföring, en molekyl till en annan substratnivåfosforylering ATP bildas i en reaktion gruppöverföring 8
  • mutas - isomeriserar genom att flytta funktioell grupp

Nedanstående steg sker 2 ggr

Steg Input Output Rev Enzym Reaktion Energi
6 glyceraldehyd-3-fosfat 1,3-bisfosfatglycerat Ja glyceraldehyd-3-fosfat-dehydrokinas oxidation (fördelaktig)
fosforylering (ofördelaktig)
Ger NAD^+ → $NADH$
Pi
7 1,3-bisfosfatglycerat 3-fosfatglycerat Ja fosfoglyceratkinas substratnivåfosforylering Ger ATP
8 3-fosfatglycerat 2-fosfoglycerat Ja fosfoglyceratmutas isomerisering
9 2-fosfoglycerat fosfoenolpyruvat Ja enolas dehydratisering Ger H_2O
10 fosfoenolpyruvat pyruvat Nej pyruvatkinas substratnivåfosforylering Ger ATP
Vad utvinns?
  • 4 ATP
  • 2 NADH + H^+
  • 2 H_2O

Varför sitter de olika enzymerna i glykolysen i ett komplex?

  • gör det snabbare om de sitter nära varandra

Fosforyltransferpotential

Fruktos i framförallt i levern

  • fruktos 1-fosfat
  • klyvs till deoxyacetonfosfat + glyceraldehyd
    • deoxyacetonfosfat kan gå in i glykolysen
    • glyceraldehyd behöver fosforylseras till glyceralaldehyd 3-fosfat

Olika sockerarter utvinner olika mycket energi. Värre att äta fruktos eller glykos, fettinlagrning. Det finns inte mer energi fruktos än i glykos.

Hur tar sig galaktos in i glykolysen?

  • det tar sig in i 4 steg
  • blir så småningom glykos-6-fosfat (som hittas långt upp i glykolysen)

Laktosintolerans

Enzym: laktas

laktos + H_2O <→ glukos + galaktos

Vi har kvar 5% som vuxna av enzymet. Baketerier som älskar det och producerar metanol och vätgas. Vatten går även ut i floran.

Fyra olika platser i världen har laktostolerans

  • varit fördelaktigt att reproducera om man kan anväanda alternativ kost när det varit brist på föda Avsild utveckling tll tolerans på fyra platser
  • reproduktionsfördel

Galaktitol

Om galaktos ej omvandlas till galaktos till glykosintermediär → ackumulering av galaktitol, lagras i linsen → vatten tas upp → grumling

Återbildning av NAD+ hastighetsbegränsande

Om aerobt

  • ETK Om anaerobt
  • fermentering
  • ATP bildas med både organisk dontator och acceptor för elektroner
    • redoxneutralt
  • Fermetering bakom alkohol, surkål, crème frache

!Pasted image 20251201112326.png

Glykolys vid O_2

glykos + 2 ADP + 2Pi + 2 NAD^+ → 2 pyruvat + 2$H_2O$ + 2NADH + 2$H^+$ + 2ATP

Glykolys utan O_2

glykos + 2 ADP+ 2Pi → 2 pyruvat + 2$H_2O$ + 2$H^+$ + 2ATP

\Delta G = -22kcal/mol (för hela glykolysen)


Reglering av enzymaktivitet

inhibitorer eller stimulatorer konformationsändring:

  • allosteriskt (millisekunder
  • kovalent modifiering (sekunder) enzymmängd
  • transkribera→translation (timmar)
    • hormonell reglering separation av enzym & substrat
  • de har inte tillgång till varandra, celler som inte tar upp glykos om det inte finns

Fosfofruktokinas

Huvudsaklig regleringspunkt (3:e steget i glykolysen)

  • 1:a steget kan även bilda glykogen, 3:e är första unika steget för glykolysen I skelettmuskeln regleras det av energikvoten (båda allosteriska regulatorer)
  • (-) ATP: mycket ATP att göra enzymet mindre effektivt (kan spara till svårare förhållande)
  • (+) ADP: stimuleras av AMP
  • (-) om pH sjunker lägre än 6.3, så funkar inte enzymet längre I lever som ovan,
  • det finns mycket energi, mycket citrat, vi behöver inte bryta ner med
  • (-) citrat
  • (+) fruktos 2,6-bisfosfat
    • fruktos-6-fosfat
    • feedforward

Hexokinas

första steget i glykolysen muskel

  • (-) glukos-6-fosfat - feedback
    • byggs upp mycket när fosfogruktokinas inhiberas lever
  • Använder glukokinas
  • 50x lägre affinitet

Pyruvatkinas

10:e steget i glykolysen

Muskel

  • förekommer i m-form, muskel-form
  • energikvot
  • (-) ATP (allosterisk)
  • (+) fruktos-1,6-bisfosfat (feedforward) Lever
  • finns i L-form
  • regleras som i muskel samt
  • (-) alanin (feedback)
    • aminosyra men ett steg från pyruvat!
  • (-) fosforylering
    • styrs från glykagon via PKA
      • finns det inte glykagon finns det inte mycket blodsocker, då vill man inte köra glykolysen utan köra åt andra hållet

!Pasted image 20251201114708.png GLUT4 i skelettmuskel och adipocyter om det finns insulin

  • till plasmamembranet om det finns insulin [glukos]_{blod} är högt GLUT2
  • levern & b-celler

Glykos & Cancerceller

Föredrar glyklys - Warberg-effekten Upptäcktes för 100 år sen

Man kan se det i PET-scans, som gör att man kan lokalisera tumörer. Kan använda det för att följa effekter av behandling.

Använder glykos även när syre finns

Frågor

När och var förekommer glykolys under anaeroba förhållanden hos en människa?

  • alltid i erytrocyter
  • näthinnan
  • yttersta lagret av huden

Varför använder cancerceller företrädesvis anaerob glykolys? Laktat

  • förbättrar invasion
  • hämmar immunförsvaret
  • surt är bra för cancercellen
  • behövs byggstenar
    • glykolys intermediärer
    • behävs även till pentosfosfatvägen som är viktig för anabolism

Summering

7st reversibla, 3 irreversibla (1, 3, 10) Oxination NAD+ är hastighetsbegränsande Anaerob och aeroba laktas fermenteras feedback, reglerar något som hänt tidigare, aktivering eller inaktiver feedforward tidigt steg, reglerar något senare (ofta allosteriska) fruktos-2,6-bisfosfat viktig regulator Warberg, cancerceller frodas i sur miljö och b