All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 1m55s
251 lines
9.7 KiB
Markdown
251 lines
9.7 KiB
Markdown
---
|
||
tags:
|
||
- biokemi
|
||
- glykolysen
|
||
- anteckningar
|
||
förelÀsare: Ingela Parmryd
|
||
date: 2025-12-01
|
||
---
|
||
|
||
|
||
glykys = söt (grekiska)
|
||
lysis = sönderdelning
|
||
- - **-lys / -lyse / -lytic** â anger att nĂ„got bryts ned eller löses upp.
|
||
10 steg
|
||
3 faser
|
||
Start: Glykos
|
||
Slut: Pyruvat
|
||
Kommer inte frÄga om strukturformer för metaboliten
|
||
- kan vara bra
|
||
- SKA KUNNA namn pÄ metaboliter och enzymer och förestÄelse för reaktioner
|
||
|
||
## Energiinvesteringsfas
|
||
2 ATP förbrukas
|
||
2 ADP skapas
|
||
2 $H^+$ skapas
|
||
|
||
| Steg | Input | Output | Enzym | Reaktion | Reversibelt | Energi |
|
||
| ---- | ---------------- | --------------------- | ----------------------- | ------------------------------------------------------------------------------------------------- | ----------- | --------------------------- |
|
||
| 1 | Glykos | glykos-6-fosfat | hexokinas | fosforylering<br>gruppöverförning<br>glykosinbinding<br>konformationsÀndring<br>$H_2O$ stÀngs ute | Nej | KrÀver ATP<br>Ger ADP+$H^+$ |
|
||
| 2 | glykos-6-fosfat | fruktos-6-fosfat | fosfosglykosisomeras | Isomerering<br>aldosâketos<br>Möjliggör klyvning | Ja | |
|
||
| 3 | fruktos-6-fosfat | fruktos-1,6-bisfosfat | fosfofrukotkinas (PK-1) | fosforylering<br>gruppöverförning<br>hindrar Äterisomerisering | Nej | KrÀver ATP<br>Ger ADP+$H^+$ |
|
||
|
||
|
||
## Klyvningsfas
|
||
6 kol blir 2 st 3 col
|
||
|
||
| Steg | Input | Output | Enzym | Reaktion | Reversibelt | Energi |
|
||
| ---- | --------------------- | ----------------------------------------------------- | ------------------- | -------------------- | ----------- | ------ |
|
||
| 4 | fruktos-1,6-bisfosfat | dihydroxyacetonfosfat +<br>glyceraldehyd-3-fosfat<br> | aldolas | klyvning 6Câ2x3C<br> | Ja | |
|
||
| 5 | dihydroxyacetonfosfat | glyceraldehyd-3-fosfat | triosfosfatisomeras | isomerisering | Ja | |
|
||
|
||
|
||
## Energiutvinningsfas
|
||
|
||
6
|
||
- dehydrokinas plockar vÀten (oxidation)
|
||
- $NAD^+$ â $NADH$ oxideras
|
||
- GA3PDH utför tvÄ reaktioner en fördelaktig och en ofördelaktig
|
||
- tioester Àr intermediÀr - möjliggör koppling
|
||
- ![[Pasted image 20251201104247.png]]
|
||
7
|
||
- gruppöverföring, en molekyl till en annan
|
||
substratnivÄfosforylering ATP bildas i en reaktion gruppöverföring
|
||
8
|
||
- mutas - isomeriserar genom att flytta funktioell grupp
|
||
|
||
NedanstÄende steg sker 2 ggr
|
||
|
||
| Steg | Input | Output | Rev | Enzym | Reaktion | Energi |
|
||
| ---- | ---------------------- | --------------------- | --- | ----------------------------------- | ------------------------------------------------------- | ---------------------------- |
|
||
| 6 | glyceraldehyd-3-fosfat | 1,3-bisfosfatglycerat | Ja | glyceraldehyd-3-fosfat-dehydrokinas | oxidation (fördelaktig)<br>fosforylering (ofördelaktig) | Ger $NAD^+$ â $NADH$<br>$Pi$ |
|
||
| 7 | 1,3-bisfosfatglycerat | 3-fosfatglycerat | Ja | fosfoglyceratkinas | substratnivÄfosforylering | Ger ATP |
|
||
| 8 | 3-fosfatglycerat | 2-fosfoglycerat | Ja | fosfoglyceratmutas | isomerisering | |
|
||
| 9 | 2-fosfoglycerat | fosfoenolpyruvat | Ja | enolas | dehydratisering | Ger $H_2O$ |
|
||
| 10 | fosfoenolpyruvat | pyruvat | Nej | pyruvatkinas | substratnivÄfosforylering | Ger ATP |
|
||
Vad utvinns?
|
||
- 4 ATP
|
||
- 2 NADH + $H^+$
|
||
- 2 $H_2O$
|
||
|
||
Varför sitter de olika enzymerna i glykolysen i ett komplex?
|
||
- gör det snabbare om de sitter nÀra varandra
|
||
|
||
----
|
||
### Fosforyltransferpotential
|
||
|
||
Fruktos i framförallt i levern
|
||
- fruktos 1-fosfat
|
||
- klyvs till deoxyacetonfosfat + glyceraldehyd
|
||
- deoxyacetonfosfat kan gÄ in i glykolysen
|
||
- glyceraldehyd behöver fosforylseras till glyceralaldehyd 3-fosfat
|
||
|
||
Olika sockerarter utvinner olika mycket energi. VÀrre att Àta fruktos eller glykos, fettinlagrning. Det finns inte mer energi fruktos Àn i glykos.
|
||
|
||
Hur tar sig galaktos in i glykolysen?
|
||
- det tar sig in i 4 steg
|
||
- blir sÄ smÄningom glykos-6-fosfat (som hittas lÄngt upp i glykolysen)
|
||
|
||
|
||
----
|
||
|
||
### Laktosintolerans
|
||
Enzym: laktas
|
||
|
||
laktos + $H_2O$ <â glukos + galaktos
|
||
|
||
Vi har kvar 5% som vuxna av enzymet.
|
||
Baketerier som Àlskar det och producerar metanol och vÀtgas. Vatten gÄr Àven ut i floran.
|
||
|
||
Fyra olika platser i vÀrlden har laktostolerans
|
||
- varit fördelaktigt att reproducera om man kan anvÀanda alternativ kost nÀr det varit brist pÄ föda
|
||
Avsild utveckling tll tolerans pÄ fyra platser
|
||
- reproduktionsfördel
|
||
|
||
### Galaktitol
|
||
|
||
Om galaktos ej omvandlas till galaktos till glykosintermediÀr
|
||
â ackumulering av galaktitol, lagras i linsen
|
||
â vatten tas upp â grumling
|
||
|
||
|
||
### Ă
terbildning av NAD+ hastighetsbegrÀnsande
|
||
|
||
Om aerobt
|
||
- ETK
|
||
Om anaerobt
|
||
- fermentering
|
||
- ATP bildas med bÄde organisk dontator och acceptor för elektroner
|
||
- redoxneutralt
|
||
- Fermetering bakom alkohol, surkÄl, crÚme frache
|
||
|
||
![[Pasted image 20251201112326.png|300]]
|
||
|
||
|
||
## Glykolys vid $O_2$
|
||
|
||
glykos + 2 ADP + 2Pi + 2 $NAD^+$ â 2 pyruvat + 2$H_2O$ + 2NADH + 2$H^+$ + 2ATP
|
||
|
||
### Glykolys utan $O_2$
|
||
|
||
glykos + 2 ADP+ 2Pi â 2 pyruvat + 2$H_2O$ + 2$H^+$ + 2ATP
|
||
|
||
$\Delta G = -22kcal/mol$ (för hela glykolysen)
|
||
|
||
-----
|
||
|
||
### Reglering av enzymaktivitet
|
||
|
||
inhibitorer eller stimulatorer
|
||
konformationsÀndring:
|
||
- allosteriskt (millisekunder)
|
||
- kovalent modifiering (sekunder)
|
||
enzymmÀngd
|
||
- transkriberaâtranslation (timmar)
|
||
- hormonell reglering
|
||
separation av enzym & substrat
|
||
- de har inte tillgÄng till varandra, celler som inte tar upp glykos om det inte finns
|
||
|
||
### Fosfofruktokinas
|
||
|
||
Huvudsaklig regleringspunkt (3:e steget i glykolysen)
|
||
- 1:a steget kan Àven bilda glykogen, 3:e Àr första unika steget för glykolysen
|
||
I skelettmuskeln regleras det av energikvoten (bÄda allosteriska regulatorer)
|
||
- (-) ATP: mycket ATP att göra enzymet mindre effektivt (kan spara till svÄrare förhÄllande)
|
||
- (+) ADP: stimuleras av AMP
|
||
- (-) om pH sjunker lÀgre Àn 6.3, sÄ funkar inte enzymet lÀngre
|
||
I lever som ovan,
|
||
- det finns mycket energi, mycket citrat, vi behöver inte bryta ner med
|
||
- (-) citrat
|
||
- (+) fruktos 2,6-bisfosfat
|
||
- fruktos-6-fosfat
|
||
- feedforward
|
||
|
||
### Hexokinas
|
||
första steget i glykolysen
|
||
muskel
|
||
- (-) glukos-6-fosfat - feedback
|
||
- byggs upp mycket nÀr fosfogruktokinas inhiberas
|
||
lever
|
||
- AnvÀnder glukokinas
|
||
- 50x lÀgre affinitet
|
||
|
||
|
||
### Pyruvatkinas
|
||
10:e steget i glykolysen
|
||
|
||
Muskel
|
||
- förekommer i m-form, muskel-form
|
||
- energikvot
|
||
- (-) ATP (allosterisk)
|
||
- (+) fruktos-1,6-bisfosfat (feedforward)
|
||
Lever
|
||
- finns i L-form
|
||
- regleras som i muskel samt
|
||
- (-) alanin (feedback)
|
||
- aminosyra men ett steg frÄn pyruvat!
|
||
- (-) fosforylering
|
||
- styrs frÄn glykagon via PKA
|
||
- finns det inte glykagon finns det inte mycket blodsocker, dÄ vill man inte köra glykolysen utan köra Ät andra hÄllet
|
||
|
||
![[Pasted image 20251201114708.png|200]]
|
||
GLUT4 i skelettmuskel och adipocyter om det finns insulin
|
||
- till plasmamembranet om det finns insulin $[glukos]_{blod}$ Àr högt
|
||
GLUT2
|
||
- levern & b-celler
|
||
|
||
### Glykos & Cancerceller
|
||
|
||
Föredrar glyklys - Warberg-effekten
|
||
UpptÀcktes för 100 Är sen
|
||
|
||
Man kan se det i PET-scans, som gör att man kan lokalisera tumörer.
|
||
Kan anvÀnda det för att följa effekter av behandling.
|
||
|
||
AnvÀnder glykos Àven nÀr syre finns
|
||
|
||
FrÄgor
|
||
|
||
NÀr och var förekommer glykolys under anaeroba förhÄllanden hos en mÀnniska?
|
||
- alltid i erytrocyter
|
||
- nÀthinnan
|
||
- yttersta lagret av huden
|
||
|
||
Varför anvÀnder cancerceller företrÀdesvis anaerob glykolys?
|
||
Laktat
|
||
- förbÀttrar invasion
|
||
- hÀmmar immunförsvaret
|
||
- surt Àr bra för cancercellen
|
||
- behövs byggstenar
|
||
- glykolys intermediÀrer
|
||
- behÀvs Àven till pentosfosfatvÀgen som Àr viktig för anabolism
|
||
|
||
---
|
||
### Summering
|
||
|
||
|
||
> [!NOTE] Summary
|
||
7st reversibla, 3 irreversibla (1, 3, 10)
|
||
Oxination
|
||
NAD+ Àr hastighetsbegrÀnsande
|
||
Anaerob och aeroba
|
||
laktas fermenteras
|
||
feedback, reglerar nÄgot som hÀnt tidigare, aktivering eller inaktiver
|
||
feedforward tidigt steg, reglerar nÄgot senare (ofta allosteriska)
|
||
fruktos-2,6-bisfosfat viktig regulator
|
||
Warberg, cancerceller frodas i sur miljö och b
|
||
>
|
||
|
||
|
||
| Steg | In | Formel | | Energi |
|
||
| ---- | --------------- | -------------------------------------------- | ----- | ------- |
|
||
| 1 | Glc + ATP | $C_6H_{12}O_6$ + ATP = $C_6H_{13}O_9P$ + ADP | | HK |
|
||
| 2 | G6P | $C_6H_{13}O_9P$ | fosfo | â |
|
||
| 3 | F6P + ATP | $C_6H_{13}O_9P$ | iso | -1 ATP |
|
||
| 4 | F1,6BP | $C_3H_7O_6P$ +<br>$C_3H_7O_6P$ | | â |
|
||
| 5 | DHAP | C3H7O6P | | â |
|
||
| 6 | GAP + NADâș + Pi | C3H7O6P | | +1 NADH |
|
||
| 7 | 1,3BPG + ADP | C3H8O10P2 | | +1 ATP |
|
||
| 8 | 3PG | C3H7O7P | | â |
|
||
| 9 | 2PG | C3H7O7P | | â |
|
||
| 10 | PEP + ADP | C3H5O6P | | +1 ATP | |