medical-notes/content/Biokemi/Cellulära processer/DNA replikation/Instuderingsfrågor.md

#### Förklara följande begrepp: replikationsbubbla och replikationsgaffel.
#### Var är ett origin of replication?
#### Hur skiljer sig DNA-syntes åt på leading och lagging strand?
#### Vilken funktion har 3’ till 5’-exonukleas-aktiviteten som återfinns hos många DNA-polymeraser?
#### Vad är processivitet? Hur kan en sliding clamp stimulera processivitet?
#### Vad är ett primas? När behövs ett sådant enzym?
#### Hur går “Okazaki fragment maturation” till i våra celler?
#### Vilka aktiviteter är förknippade med exonukleas och endonukleas?### Förklara begreppen replikationsbubbla och replikationsgaffel
```spoiler-block:
Replikationsbubbla är området där DNA öppnats kring ett origin; replikationsgaffel är varje Y-formad ände där DNA syntetiseras.
```

### Var är ett origin of replication?
```spoiler-block:
En specifik DNA-sekvens där replikation initieras och DNA öppnas.
```

### Hur skiljer sig DNA-syntes på leading och lagging strand?
```spoiler-block:
Leading strand syntetiseras kontinuerligt; lagging strand syntetiseras diskontinuerligt som Okazaki-fragment.
```

### Vilken funktion har 3’→5’-exonukleasaktiviteten hos DNA-polymeraser?
```spoiler-block:
Proofreading; avlägsnar felinkorporerade nukleotider och ökar noggrannheten.
```

### Vad är processivitet och hur stimulerar sliding clamp detta?
```spoiler-block:
Processivitet är hur många nukleotider som adderas per bindning; sliding clamp håller polymeraset kvar på DNA.
```

### Vad är ett primas och när behövs det?
```spoiler-block:
Ett RNA-polymeras som syntetiserar primers; behövs för att starta DNA-syntes.
```

### Hur går Okazaki fragment maturation till?
```spoiler-block:
RNA-primer tas bort, gap fylls med DNA och fragmenten ligeras ihop.
```

### Vilka aktiviteter har exonukleas respektive endonukleas?
```spoiler-block:
Exonukleas tar bort nukleotider från ändar; endonukleas klyver inom en nukleotidkedja.
```

### Hur fungerar helikas?
```spoiler-block:
Använder ATP för att separera DNA-strängarna genom att bryta vätebindningar.
```

### Vilken roll spelar enkelsträngsbindande proteiner och vad heter de i våra celler?
```spoiler-block:
Stabiliserar ssDNA och förhindrar återparning; i eukaryoter heter de RPA.
```

### Varför bildas positiva supercoils och hur tas de bort?
```spoiler-block:
De bildas framför replikationsgaffeln vid uppvridning; topoisomeraser avlägsnar dem genom att klyva och återligera DNA.
```
#### Hur fungerar helikas?
#### Vilken roll spelar enkelsträngsbindande proteiner? Vad heter detta protein i våra celler?
#### Varför bildas positiva supercoils? Vilka enzymer kan ta bort supercoils och hur?