1
0
Files
medical-notes/content/Biokemi/Metabolism/🍬 Glykolysen/Anteckningar.md
Johan Dahlin 14d6af92f7
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 3m3s
vault backup: 2025-12-27 14:19:57
2025-12-27 14:19:57 +01:00

236 lines
8.6 KiB
Markdown

---
tags:
- biokemi
- glykolysen
- anteckningar
förelÀsare: Ingela Parmryd
date: 2025-12-01
---
glykys = söt (grekiska)
lysis = sönderdelning
- - **-lys / -lyse / -lytic** → anger att nĂ„got bryts ned eller löses upp.
10 steg
3 faser
Start: Glykos
Slut: Pyruvat
Kommer inte frÄga om strukturformer för metaboliten
- kan vara bra
- SKA KUNNA namn pÄ metaboliter och enzymer och förestÄelse för reaktioner
## Energiinvesteringsfas
2 ATP förbrukas
2 ADP skapas
2 $H^+$ skapas
| Steg | Input | Output | Enzym | Reaktion | Reversibelt | Energi |
| ---- | ---------------- | --------------------- | ----------------------- | ------------------------------------------------------------------------------------------------- | ----------- | --------------------------- |
| 1 | Glykos | glykos-6-fosfat | hexokinas | fosforylering<br>gruppöverförning<br>glykosinbinding<br>konformationsÀndring<br>$H_2O$ stÀngs ute | Nej | KrÀver ATP<br>Ger ADP+$H^+$ |
| 2 | glykos-6-fosfat | fruktos-6-fosfat | fosfosglykosisomeras | Isomerering<br>aldos→ketos<br>Möjliggör klyvning | Ja | |
| 3 | fruktos-6-fosfat | fruktos-1,6-bisfosfat | fosfofrukotkinas (PK-1) | fosforylering<br>gruppöverförning<br>hindrar Äterisomerisering | Nej | KrÀver ATP<br>Ger ADP+$H^+$ |
## Klyvningsfas
6 kol blir 2 st 3 col
| Steg | Input | Output | Enzym | Reaktion | Reversibelt | Energi |
| ---- | --------------------- | ----------------------------------------------------- | ------------------- | -------------------- | ----------- | ------ |
| 4 | fruktos-1,6-bisfosfat | dihydroxyacetonfosfat +<br>glyceraldehyd-3-fosfat<br> | aldolas | klyvning 6C→2x3C<br> | Ja | |
| 5 | dihydroxyacetonfosfat | glyceraldehyd-3-fosfat | triosfosfatisomeras | isomerisering | Ja | |
## Energiutvinningsfas
6
- dehydrokinas plockar vÀten (oxidation)
- $NAD^+$ → $NADH$ oxideras
- GA3PDH utför tvÄ reaktioner en fördelaktig och en ofördelaktig
- tioester Àr intermediÀr - möjliggör koppling
- ![[Pasted image 20251201104247.png]]
7
- gruppöverföring, en molekyl till en annan
substratnivÄfosforylering ATP bildas i en reaktion gruppöverföring
8
- mutas - isomeriserar genom att flytta funktioell grupp
NedanstÄende steg sker 2 ggr
| Steg | Input | Output | Rev | Enzym | Reaktion | Energi |
| ---- | ---------------------- | --------------------- | --- | ----------------------------------- | ------------------------------------------------------- | ---------------------------- |
| 6 | glyceraldehyd-3-fosfat | 1,3-bisfosfatglycerat | Ja | glyceraldehyd-3-fosfat-dehydrokinas | oxidation (fördelaktig)<br>fosforylering (ofördelaktig) | Ger $NAD^+$ → $NADH$<br>$Pi$ |
| 7 | 1,3-bisfosfatglycerat | 3-fosfatglycerat | Ja | fosfoglyceratkinas | substratnivÄfosforylering | Ger ATP |
| 8 | 3-fosfatglycerat | 2-fosfoglycerat | Ja | fosfoglyceratmutas | isomerisering | |
| 9 | 2-fosfoglycerat | fosfoenolpyruvat | Ja | enolas | dehydratisering | Ger $H_2O$ |
| 10 | fosfoenolpyruvat | pyruvat | Nej | pyruvatkinas | substratnivÄfosforylering | Ger ATP |
Vad utvinns?
- 4 ATP
- 2 NADH + $H^+$
- 2 $H_2O$
Varför sitter de olika enzymerna i glykolysen i ett komplex?
- gör det snabbare om de sitter nÀra varandra
----
### Fosforyltransferpotential
Fruktos i framförallt i levern
- fruktos 1-fosfat
- klyvs till deoxyacetonfosfat + glyceraldehyd
- deoxyacetonfosfat kan gÄ in i glykolysen
- glyceraldehyd behöver fosforylseras till glyceralaldehyd 3-fosfat
Olika sockerarter utvinner olika mycket energi. VÀrre att Àta fruktos eller glykos, fettinlagrning. Det finns inte mer energi fruktos Àn i glykos.
Hur tar sig galaktos in i glykolysen?
- det tar sig in i 4 steg
- blir sÄ smÄningom glykos-6-fosfat (som hittas lÄngt upp i glykolysen)
----
### Laktosintolerans
Enzym: laktas
laktos + $H_2O$ <→ glukos + galaktos
Vi har kvar 5% som vuxna av enzymet.
Baketerier som Àlskar det och producerar metanol och vÀtgas. Vatten gÄr Àven ut i floran.
Fyra olika platser i vÀrlden har laktostolerans
- varit fördelaktigt att reproducera om man kan anvÀanda alternativ kost nÀr det varit brist pÄ föda
Avsild utveckling tll tolerans pÄ fyra platser
- reproduktionsfördel
### Galaktitol
Om galaktos ej omvandlas till galaktos till glykosintermediÀr
→ ackumulering av galaktitol, lagras i linsen
→ vatten tas upp → grumling
### Återbildning av NAD+ hastighetsbegrĂ€nsande
Om aerobt
- ETK
Om anaerobt
- fermentering
- ATP bildas med bÄde organisk dontator och acceptor för elektroner
- redoxneutralt
- Fermetering bakom alkohol, surkÄl, crÚme frache
![[Pasted image 20251201112326.png|300]]
## Glykolys vid $O_2$
glykos + 2 ADP + 2Pi + 2 $NAD^+$ → 2 pyruvat + 2$H_2O$ + 2NADH + 2$H^+$ + 2ATP
### Glykolys utan $O_2$
glykos + 2 ADP+ 2Pi → 2 pyruvat + 2$H_2O$ + 2$H^+$ + 2ATP
$\Delta G = -22kcal/mol$ (för hela glykolysen)
-----
### Reglering av enzymaktivitet
inhibitorer eller stimulatorer
konformationsÀndring:
- allosteriskt (millisekunder)
- kovalent modifiering (sekunder)
enzymmÀngd
- transkribera→translation (timmar)
- hormonell reglering
separation av enzym & substrat
- de har inte tillgÄng till varandra, celler som inte tar upp glykos om det inte finns
### Fosfofruktokinas
Huvudsaklig regleringspunkt (3:e steget i glykolysen)
- 1:a steget kan Àven bilda glykogen, 3:e Àr första unika steget för glykolysen
I skelettmuskeln regleras det av energikvoten (bÄda allosteriska regulatorer)
- (-) ATP: mycket ATP att göra enzymet mindre effektivt (kan spara till svÄrare förhÄllande)
- (+) ADP: stimuleras av AMP
- (-) om pH sjunker lÀgre Àn 6.3, sÄ funkar inte enzymet lÀngre
I lever som ovan,
- det finns mycket energi, mycket citrat, vi behöver inte bryta ner med
- (-) citrat
- (+) fruktos 2,6-bisfosfat
- fruktos-6-fosfat
- feedforward
### Hexokinas
första steget i glykolysen
muskel
- (-) glukos-6-fosfat - feedback
- byggs upp mycket nÀr fosfogruktokinas inhiberas
lever
- AnvÀnder glukokinas
- 50x lÀgre affinitet
### Pyruvatkinas
10:e steget i glykolysen
Muskel
- förekommer i m-form, muskel-form
- energikvot
- (-) ATP (allosterisk)
- (+) fruktos-1,6-bisfosfat (feedforward)
Lever
- finns i L-form
- regleras som i muskel samt
- (-) alanin (feedback)
- aminosyra men ett steg frÄn pyruvat!
- (-) fosforylering
- styrs frÄn glykagon via PKA
- finns det inte glykagon finns det inte mycket blodsocker, dÄ vill man inte köra glykolysen utan köra Ät andra hÄllet
![[Pasted image 20251201114708.png|200]]
GLUT4 i skelettmuskel och adipocyter om det finns insulin
- till plasmamembranet om det finns insulin $[glukos]_{blod}$ Àr högt
GLUT2
- levern & b-celler
### Glykos & Cancerceller
Föredrar glyklys - Warberg-effekten
UpptÀcktes för 100 Är sen
Man kan se det i PET-scans, som gör att man kan lokalisera tumörer.
Kan anvÀnda det för att följa effekter av behandling.
AnvÀnder glykos Àven nÀr syre finns
FrÄgor
NÀr och var förekommer glykolys under anaeroba förhÄllanden hos en mÀnniska?
- alltid i erytrocyter
- nÀthinnan
- yttersta lagret av huden
Varför anvÀnder cancerceller företrÀdesvis anaerob glykolys?
Laktat
- förbÀttrar invasion
- hÀmmar immunförsvaret
- surt Àr bra för cancercellen
- behövs byggstenar
- glykolys intermediÀrer
- behÀvs Àven till pentosfosfatvÀgen som Àr viktig för anabolism
---
### Summering
> [!NOTE] Summary
7st reversibla, 3 irreversibla (1, 3, 10)
Oxination
NAD+ Àr hastighetsbegrÀnsande
Anaerob och aeroba
laktas fermenteras
feedback, reglerar nÄgot som hÀnt tidigare, aktivering eller inaktiver
feedforward tidigt steg, reglerar nÄgot senare (ofta allosteriska)
fruktos-2,6-bisfosfat viktig regulator
Warberg, cancerceller frodas i sur miljö och b
>