31 lines
2.6 KiB
Markdown
31 lines
2.6 KiB
Markdown
Det sitter 3 fosfatgrupper i 5'-änden
|
||
En fosfodiesterbrygga är bindningen som kopplar ihop nukleotider i DNA och RNA. Den bildas när 3’-OH på en sockergrupp binder till 5’-fosfatet på nästa nukleotid.
|
||
För varje nukleotid som sätts på kedjan krävs en ATP, en fosfatgrupp går in i fosfodiesterbryggan, 2 fosfatgrupper spjälkas bort som energi
|
||
RNA kopieras av mallsträngen, den får information som är identisk till den kodande strängen.
|
||
RNA-polymeras öppnar upp DNA-strängen så RNA kan replikeras
|
||
RNA-polymeras öppnning är ~17 baspar lång, för att ge lagom plats för mallsträng, aktivt säte och växande RNA, utan att kosta mer energi än nödvändigt.
|
||
NTP-kanalen är en smal, laddad tunnel som leder fria nukleotider rätt in till det aktiva sätet och ökar träffsäkerheten via elektrostatiska interaktioner.
|
||
Ribosomen är uppbyggd av ribosomalt RNA (rRNA)
|
||
RNA-polymeras II ger upphov till ribosomalt RNA (rRNA)
|
||
RNA-polymeras II är viktigast eftersom det gör **mRNA**, alltså utgångspunkten för alla proteiner. Det driver därmed huvuddelen av genuttrycket.
|
||
TATA-boxen består av en sekvens av AT-nukleotider med lägre smältpunkt (2 isf 3 vätebindingar)
|
||
Promotor är den region av DNA som RNA polymeraset binder vid för att börja transkriptionen
|
||
RNA-polymeras behöver hjälp att hitta startpunkten, och detta sker via promotorn, särskilt TATA-boxen och de basala transkriptionsfaktorerna
|
||
De basala transkriptionsfaktorerna är: TFIID, TFIIA, TFIIB, TFIIE, TFIIF och TFIIH.
|
||
TATA-boxen i promotorn ligger typiskt –25 till –30 baspar uppströms om transkriptionsstart
|
||
De viktigaste transkriptionsfaktorerna är TFIID och TFIIH
|
||
TFIID är transkriptionsfaktorn som startar transkriptionen
|
||
TFIIH är transkriptionsfaktorn som startar elongeringen
|
||
Elongering är fasen där RNA-polymeras rör sig längs DNA och förlänger RNA-kedjan genom att bygga in fler nukleotider.
|
||
Första steget vid initiering av transkription tas när det TATA-bindande proteinet (TBP) binder in till promotorns TATA-box.
|
||
TBP binder till minor groove och inducerar en kraftig böj i DNA – 90°
|
||
TBP ingår i ett större komplex, som kallas TFIID
|
||
Preinitieringskomplexet börjar med TFIID binder till TATA box via TBP.
|
||
TFIIA binder in till TFIID
|
||
TFIIB, F, E, H binder in till TTFIID
|
||
TFIIH öppnar DNA med sin helikasaktivitet och fosforylerar CTD med sin kinasaktivitet, vilket startar elongeringen.
|
||
CTD är den C-terminala domänen på RNA-pol II där fosfosvansen sitter och regleras genom fosforylering.
|
||
CTD har många fosforyleringsställen där fosfatgrupper binder för att reglera polymerasets växling mellan initiering, elongering och RNA-processing
|
||
|
||
|