1
0
Files
medical-notes/content/Biokemi/Regleringar.md
Johan Dahlin 2e65d5492a
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 1m31s
Add regleringar
2025-12-14 08:19:03 +01:00

73 lines
24 KiB
Markdown
Raw Permalink Blame History

This file contains ambiguous Unicode characters
This file contains Unicode characters that might be confused with other characters. If you think that this is intentional, you can safely ignore this warning. Use the Escape button to reveal them.
| Föreläsning | Typ av reglering | Enzym / Protein | Substrat / Hormon / Faktor | Organ | Organell | Anabol / Katabol / När / Varför |
| :---------------------------------- | :------------------------------- | :------------------------------------ | :-------------------------------------------------------- | :----------------------------------------- | :----------------------- | :---------------------------------------------------------------------------------- |
| **Intro Metabolism / Citratcykeln** | Allosterisk (Feedback) | Pyruvatdehydrogenas (PDH) | Acetyl-CoA () | Alla mitokondriella | Mitokondrie (Matrix) | Katabol. Produkten ansamlas → bromsar inflöde från pyruvat (t.ex. vid β-oxidation). |
| **Intro Metabolism / Citratcykeln** | Allosterisk (Feedback) | Pyruvatdehydrogenas (PDH) | NADH () | Alla mitokondriella | Mitokondrie (Matrix) | Katabol. Hög reduktionsgrad/ETC “mättad” → bromsar PDH. |
| **Intro Metabolism / Citratcykeln** | Allosterisk (Energikvot) | Pyruvatdehydrogenas (PDH) | ATP () | Alla mitokondriella | Mitokondrie (Matrix) | Katabol. Hög energi → mindre behov av acetyl-CoA in i CTK. |
| **Intro Metabolism / Citratcykeln** | Allosterisk (Energikvot) | Pyruvatdehydrogenas (PDH) | ADP (+) | Alla mitokondriella | Mitokondrie (Matrix) | Katabol. Energifattigt → ökar flödet från pyruvat in i CTK. |
| **Intro Metabolism / Citratcykeln** | Kovalent (Fosforylering) | Pyruvatdehydrogenas (PDH) | PDH-Kinas (PDK) | Alla mitokondriella | Mitokondrie (Matrix) | PDK fosforylerar PDH → **PDH inaktivt** (bromsar glukosoxidation). |
| **Intro Metabolism / Citratcykeln** | Kovalent (Defosforylering) | Pyruvatdehydrogenas (PDH) | PDH-Fosfatas (PDP) | Alla mitokondriella | Mitokondrie (Matrix) | PDP defosforylerar PDH → **PDH aktivt** (ökar pyruvat→acetyl-CoA). |
| **Intro Metabolism / Citratcykeln** | Allosterisk (påverkar PDK) | PDH-Kinas (PDK) | ATP (+) | Alla mitokondriella | Mitokondrie (Matrix) | Hög energi → PDK aktivt → PDH stängs (sparar glukos). |
| **Intro Metabolism / Citratcykeln** | Allosterisk (påverkar PDK) | PDH-Kinas (PDK) | Acetyl-CoA & NADH (+) | Alla mitokondriella | Mitokondrie (Matrix) | Produkter aktiverar PDK → förstärker PDH-avstängning (feedback-loop). |
| **Intro Metabolism / Citratcykeln** | Allosterisk (påverkar PDK) | PDH-Kinas (PDK) | Pyruvat () | Alla mitokondriella | Mitokondrie (Matrix) | Högt pyruvat hämmar PDK → håller PDH aktivt (feedforward). |
| **Intro Metabolism / Citratcykeln** | Allosterisk (påverkar PDP) | PDH-Fosfatas (PDP) | Ca²⁺ (+) | Muskler m.fl. | Mitokondrie (Matrix) | Muskelarbete → Ca²⁺ → PDP på → PDH på → mer ATP. |
| **Intro Metabolism / Citratcykeln** | Hormonell (påverkar PDP) | PDH-Fosfatas (PDP) | Insulin (+) | Lever / Fettväv | Mitokondrie (Matrix) | Fed state: PDH på → acetyl-CoA till CTK/lipogenes. |
| **Glykolysen** | Allosterisk (Feedback) | Hexokinas | Glukos-6-fosfat () | De flesta vävnader (ej leverns glukokinas) | Cytosol | Katabol. Förhindrar “inlåsning” av glukos när nedströms är fullt. |
| **Glykolysen** | Substrat/isoenzym | Glukokinas | Glukos (kräver hög [glukos]) | Lever (± β-cell) | Cytosol | Katabol/anabol koppling. “Tar hand om” glukos efter måltid. |
| **Glykolysen** | Allosterisk (Energikvot) | PFK-1 | ATP () | Alla (främst muskel/lever) | Cytosol | Katabol. Hög energi → bromsar hastighetsbestämmande steg. |
| **Glykolysen** | Allosterisk (Energikvot) | PFK-1 | AMP (+) | Alla (främst muskel) | Cytosol | Katabol. Låg energi → stark aktivering av glykolys. |
| **Glykolysen** | Allosterisk (koppling CTK) | PFK-1 | Citrat () | Lever m.fl. | Cytosol | Katabol. CTK “full” → minska inflöde från glykolys. |
| **Glykolysen** | Allosterisk (pH) | PFK-1 | H⁺ / lågt pH () | Muskel | Cytosol | Katabol. Skydd mot kraftig acidos vid anaerobt arbete. |
| **Glykolysen** | Allosterisk (potent) | PFK-1 | Fruktos-2,6-bisfosfat (+) | Lever | Cytosol | Katabol. Överstyr ATP-hämning vid högt blodsocker. |
| **Glykolysen** | Allosterisk (Feedforward) | Pyruvatkinas | Fruktos-1,6-bisfosfat (+) | Lever/muskel | Cytosol | Katabol. Synkar sista steget med högt flöde genom PFK-1. |
| **Glykolysen** | Allosterisk | Pyruvatkinas | ATP () / Alanin (, lever) | Lever/muskel | Cytosol | Katabol. Hög energi/byggstenar → bromsar pyruvatproduktion. |
| **Glykolysen** | Hormonell (Kovalent) | Pyruvatkinas (L-form) | Glukagon → PKA → fosforylering () | Lever | Cytosol | Fasta: stänger glykolys i lever → sparar substrat för glukoneogenes. |
| **Glukoneogenes** | Allosterisk | Pyruvatkarboxylas | Acetyl-CoA (+) | Lever/Njure | Mitokondrie | Anabol. Fettförbränning ger acetyl-CoA → “energi finns” för GNG. |
| **Glukoneogenes** | Allosterisk (Energikvot) | Pyruvatkarboxylas | ADP () | Lever/Njure | Mitokondrie | Anabol. Energibrist → stoppar ATP-krävande glukosnybildning. |
| **Glukoneogenes** | Allosterisk | Fruktos-1,6-bisfosfatas (FBPase-1) | Fruktos-2,6-bisfosfat () | Lever | Cytosol | Anabol. Fed state hämmar GNG via F2,6BP. |
| **Glukoneogenes** | Allosterisk | Fruktos-1,6-bisfosfatas (FBPase-1) | AMP () | Lever | Cytosol | Anabol. Låg energi → stänger GNG. |
| **Glukoneogenes** | Allosterisk | Fruktos-1,6-bisfosfatas (FBPase-1) | Citrat (+) | Lever | Cytosol | Anabol. Energiöverskott → gynnar glukosnybildning. |
| **Glukoneogenes / Glykolys** | Hormonell (bifunktionellt enzym) | PFK-2 / FBPase-2 | Insulin → defosforylering → PFK-2 aktiv (↑F2,6BP) | Lever | Cytosol | Fed state: ↑ glykolys, ↓ glukoneogenes. |
| **Glukoneogenes / Glykolys** | Hormonell (bifunktionellt enzym) | PFK-2 / FBPase-2 | Glukagon → PKA → fosforylering → FBPase-2 aktiv (↓F2,6BP) | Lever | Cytosol | Fasta: ↓ glykolys, ↑ glukoneogenes. |
| **Citronsyracykeln** | Allosterisk | Citratsyntas | ATP, NADH, Citrat, Succinyl-CoA () | Alla | Mitokondrie (Matrix) | Katabol. Hög energi/produktansamling → bromsar inflöde. |
| **Citronsyracykeln** | Allosterisk | Citratsyntas | ADP (+) | Alla | Mitokondrie (Matrix) | Katabol. Energifattigt → ökar CTK-flöde. |
| **Citronsyracykeln** | Allosterisk (rate-limiting) | Isocitratdehydrogenas | ATP, NADH () | Alla | Mitokondrie (Matrix) | Katabol. Energirikt → bromsar hastighetsbestämmande steg. |
| **Citronsyracykeln** | Allosterisk | Isocitratdehydrogenas | ADP, Ca²⁺ (+) | Alla (Ca²⁺ särskilt muskel) | Mitokondrie (Matrix) | Katabol. Muskelarbete/ADP → mer NADH till ETC. |
| **Citronsyracykeln** | Produktinhibition | α-ketoglutaratdehydrogenas | Succinyl-CoA, NADH () | Alla | Mitokondrie (Matrix) | Katabol. Produkter bromsar komplexet. |
| **Citronsyracykeln** | Allosterisk | α-ketoglutaratdehydrogenas | Ca²⁺ (+) | Alla | Mitokondrie (Matrix) | Katabol. Ca²⁺ vid arbete → ökar flöde. |
| **Glykogen** | Allosterisk (isoenzym) | Glykogenfosforylas (muskel) | AMP (+) | Muskel | Cytosol | Katabol. Akut energibrist → glykogenolys utan hormonkrav. |
| **Glykogen** | Allosterisk (isoenzym) | Glykogenfosforylas (lever) | Glukos () | Lever | Cytosol | Katabol. Högt glukos → stänger glykogenolys i lever. |
| **Glykogen** | Hormonell (kaskad) | Glykogenfosforylas | Glukagon/Adrenalin → cAMP → PKA → kinas | Lever/Muskel | Cytosol | Katabol. Fosforylas a (fosforylerad) = aktiv → mobiliserar glukos. |
| **Glykogen** | Hormonell | Glykogenfosforylas | Insulin → PP1 (defosforylering) | Lever/Muskel | Cytosol | Fed state: fosforylas b = mindre aktivt → stoppar nedbrytning. |
| **Glykogen** | Hormonell | Glykogensyntas | Insulin → PP1 + GSK3-hämning | Lever/Muskel | Cytosol | Anabol. Defosforylerat syntas (a) = aktivt → lagrar glukos. |
| **Glykogen** | Hormonell | Glykogensyntas | Glukagon/Adrenalin → PKA/GSK3 (fosforylering) | Lever/Muskel | Cytosol | Fasta/stress: syntas fosforyleras → inaktivt (hindrar lagring). |
| **Glykogen** | Allosterisk | Glykogensyntas (b-form) | Glukos-6-fosfat (+) | Lever/Muskel | Cytosol | Anabol. Hög G6P kan driva lagring trots fosforylering. |
| **Glykogen** | Organ-specifik | Glukos-6-fosfatas | Finns i lever (inte muskel) | Lever | ER | Varför: lever kan höja blodglukos; muskel använder lokalt. |
| **Fettsyrasyntes** | Allosterisk | Acetyl-CoA-karboxylas (ACC) | Citrat (+) | Lever/Fettväv | Cytosol | Anabol. Citrat signalerar överskott → ACC aktiveras (polymerisering). |
| **Fettsyrasyntes** | Allosterisk (feedback) | Acetyl-CoA-karboxylas (ACC) | Palmitoyl-CoA () | Lever/Fettväv | Cytosol | Anabol. Slutprodukt bromsar → undviker överproduktion. |
| **Fettsyrasyntes** | Hormonell (kovalent) | ACC | Insulin (+ via fosfatas) | Lever/Fettväv | Cytosol | Anabol. Defosforylering → ACC aktivt → malonyl-CoA ↑. |
| **Fettsyrasyntes** | Energisensor (kovalent) | ACC | AMPK ( via fosforylering); AMP (+ på AMPK) | Lever/Fettväv | Cytosol | Anabol av. Låg energi → stoppar lipogenes, sparar ATP. |
| **Fettsyrasyntes** | Hormonell (via AMPK) | ACC | Glukagon/Adrenalin () | Lever/Fettväv | Cytosol | Fasta/stress: minskar lipogenes, gynnar mobilisering/oxidation. |
| **Betaoxidation / Lipolys** | Hormonell (kovalent) | Hormonkänsligt lipas (HSL) | Adrenalin/Glukagon → PKA (+) | Fettväv | Cytosol | Katabol. Fosforylering → lipolys ↑ (frisätter FFA). |
| **Betaoxidation / Lipolys** | Hormonell (tillgänglighet) | Perilipin | PKA (+) | Fettväv | Lipiddroppe | Katabol. Gör TAG mer åtkomligt för lipaser. |
| **Betaoxidation / Lipolys** | Hormonell | HSL (indirekt) | Insulin (; ↓cAMP, ↑fosfatas) | Fettväv | Cytosol | Fed state: bromsar lipolys → lagring. |
| **Betaoxidation** | Allosterisk (transport) | Karnitin-acyltransferas 1 (CPT1/CAT1) | Malonyl-CoA () | Lever/muskel | Yttre mitokondriemembran | Katabol. Hindrar import när lipogenes pågår (undviker futile cycle). |
| **Kolesterolsyntes** | Transkriptionell | HMG-CoA-reduktas (HMGR) | Lågt kolesterol (+ via SREBP) | Lever | ER→Golgi→Kärna | Anabol. Lågt kolesterol → SREBP aktiveras → ↑ enzymesyntes/LDL-upptag. |
| **Kolesterolsyntes** | Transkriptionell (feedback) | SREBP/SCAP/Insig | Högt kolesterol () | Lever | ER | Anabol bromsas. SREBP hålls kvar i ER → mindre genuttryck. |
| **Kolesterolsyntes** | Proteolys | HMGR | Steroler/intermediärer (; ubiquitin/proteasom) | Lever | ER-membran | Anabol bromsas snabbt genom nedbrytning av HMGR. |
| **Kolesterolsyntes** | Energisensor (kovalent) | HMGR | AMPK fosforylering () | Lever | ER | Låg energi → stoppar kolesterolsyntes (ATP/NADPH-spar). |
| **Kolesterolsyntes** | Hormonell (kovalent) | HMGR | Insulin (+ via defosforylering) | Lever | ER | Fed state: syntes på. |
| **Kolesterolsyntes** | Hormonell (via AMPK) | HMGR | Glukagon () | Lever | ER | Fasta: syntes av. |
| **Ureacykeln** | Allosterisk (obligatorisk) | Karbamoylfosfatsyntetas 1 (CPS1) | N-acetylglutamat (+) | Lever | Mitokondrie (Matrix) | Katabol/anabol koppling. Avgiftar kväve; utan NAG fungerar CPS1 i praktiken inte. |
| **Ureacykeln** | Substrat-aktivering | N-acetylglutamatsyntas (NAGS) | Arginin (+) | Lever | Mitokondrie | När protein/AA-nedbrytning hög → arginin ↑ → NAG ↑ → ureacykel upp. |
| **Pentosfosfatvägen** | Allosterisk (feedback) | G6PD | NADPH () | Lever, erytrocyter | Cytosol | Anabol. Om NADPH redan är högt → bromsar PPP. |
| **Pentosfosfatvägen** | Allosterisk (substratstyrd) | G6PD | NADP⁺ (+) | Lever, erytrocyter | Cytosol | Anabol. NADP⁺ driver PPP när NADPH behövs (t.ex. ROS-skydd i RBC). |
| **Elektrontransportkedjan/OXPHOS** | “Respiratory control” | ATP-syntas / ETC (kopplat) | ADP (+) | Alla aeroba vävnader | Inre mitokondriemembran | Katabol. ADP-tillgång styr OXPHOS-hastighet (”acceptor control”). |
| **Elektrontransportkedjan/OXPHOS** | Substrat/acceptor | Cyt c-oxidas (Komplex IV) | O₂ (+ som slutacceptor) | Alla aeroba | Inre mitokondriemembran | Katabol. Utan O₂ stannar ETC → NADH↑ → TCA/PDH bromsas. |
| **Ketonkroppar** | Substratflöde (indirekt) | Ketogenes (väg) | OAA “dras” till GNG; acetyl-CoA ansamlas | Lever | Mitokondrie (Matrix) | Katabol. Fasta/insulinbrist: acetyl-CoA → ketoner för perifera vävnader. |
| **Hemoglobin** | Allosterisk (kooperativitet) | Hemoglobin | O₂ (+) | Erytrocyter | Cytosol | Varför: sigmoidal kurva → effektivt upptag i lungor, avlämning i vävnad. |
| **Hemoglobin** | Allosterisk (Bohr-effekt) | Hemoglobin | H⁺/CO₂ ( på O₂-affinitet) | Erytrocyter | Cytosol | Varför: surt/CO₂-rikt i vävnad → stabiliserar T-state → O₂ släpps. |
| **Hemoglobin** | Allosterisk | Hemoglobin | 2,3-BPG ( på O₂-affinitet) | Erytrocyter | Cytosol | Varför: underlättar O₂-avlämning; ökar vid höjd/anemi. |
| **DNA-replikation** | Cellcykelreglering | ORC/Cdc6/Cdt1 (licensing) | Lågt CDK (G1) | Alla delande celler | Kromatin (kärna) | Anabol. Tillåter laddning av MCM (förhindrar re-replikation). |
| **DNA-replikation** | Cellcykelreglering | CMG-helikas / DNA-pol | Högt CDK (S) | Alla delande celler | Kromatin (kärna) | Anabol. Startar replikation och blockerar ny licensing. |
| **Hemesyntes** | Translationell | ALA-syntas | Järnstatus (Fe) | Erytroid vävnad | Cytosol/mito-axel | Anabol. Vid järnbrist hämmas effektivt hemsyntes (undviker porfyrin-ack). |