vault backup: 2025-11-28 09:51:15

content/Biokemi/Gamla tentor/2023-12-18/16.md

@@ -0,0 +1,18 @@
+---
+tags:
+  - biokemi
+  - provfråga
+  - cellmembran
+---
+**Vad är en hydropatiplot och vad ger den information om? (4p)**  
+
+**Svar**
+
+En hydropatiplot kan ge information om det är sannolikt att en viss sekvens är en transmembran alfahelix och hur många alfahelixar det kan motsvara.  
+En hydropatiplot kan skapas genom att undersöka en aminosyrasekvens från N- till C-terminal i intervaller om 20 (aminosyra 1–20, 2–21, 3–22 osv.).  
+Detta beror på att det krävs 20 aminosyror för att gå genom cellmembranet.  
+Man tittar på den energimässiga kostnaden för att flytta respektive aminosyra från en hydrofob till hydrofil miljö.  
+Värdena plottas i en graf där energinivån är på y-axeln och intervallerna är på x-axeln.  
+Man sätter gränsvärdet på 84 kJ/mol (kommer från transmembrana alfahelixar med känd struktur).  
+Om en graf går över gränsvärdet en gång är det sannolikt en transmembran alfahelix.  
+Om den går ovanför gränsvärdet flera gånger tyder det på flera transmembrana alfahelixar.