vault backup: 2025-11-21 13:14:22

content/Biokemi/Cellulära processer/Initiering och terminering av DNA replikation/Anteckningar.md

@@ -0,0 +1,163 @@
+Brukar ställa frågor på de som finns i föreläsningar, titta på gamla frågor, inte ställa omöjliga frågor.
+
+Bakgrund: Vi ska bli läkare, behöver veta vad som händer i humana celler
+
+
+
+![[Pasted image 20251121111405.png]]
+Generella bubblan gäller i våra celler
+CMG helikas:
+- Claes Mikael Gustavsson heter föreläsaren!
+- MCM för att sätta ihop
+- Gins
+- Cdc45
+
+Heter delta och epsilon heter polymerasen de är lite olika
+sliding camps heter PCNA
+
+-----
+
+leading strand:
+- DNA pol epsilon
+- sliding clamp PCNA
+lagging strand:
+- DNA pol delta
+- sliding clamp PCNA
+
+---
+
+Löser problemet att RNA primer inte ska sitta löst
+
+Primaset skiljer sig lite gran
+DNA-polymeras
+- RNA-primarna är c:a 5 olika
+	- finns en risk att trilla av, de vill man inte i våra celler
+	- vi vill vara säkra på att den verkligen används
+- alfa.primas
+![[Pasted image 20251121111829.png]]
+- DNA-polymeras alfa-primas
+- både primas och polymeras i samma
+- enzym som sitter ihop (namn?)
+
+om man har en mallsträng kommer enzymet att verka först
+
+de kan byta plats utan att släppa
+
+behöver bara en liten extra snutt, kommer sitta mkt mer stabilt på DNA, utan att det finns risk att primern trillar bort.
+
+![[Pasted image 20251121111945.png]]
+
+
+Vad är de olika polymerasen?
+- alpha-primas
+- delta
+- epsilon
+
+----
+![[Pasted image 20251121112158.png]]
+
+Ser likadana ut i bakterier, det är en ring som sitter och håller fast DNA pol
+Man kan uttrycka antikroppar mot PCNA, kan kroppen utveckla av misstag.
+
+----
+SLE/Lupus PCNA ANA
+
+----
+![[Pasted image 20251121112518.png]]
+
+Kan inte dela innan DNA-syntesen är färdig och heller inte sätta igång, specifikt.
+En gång per cellcykel. Då får vi felaktigt antal kopier.
+
+----
+
+Vi har upp till 30 000 origins i våra cell
+Alla går inte igång alltid
+Många måste gå igång för att kunna replikera tillräckligt fort
+50-300kbp
+Ska börja ungefär samtidigt.
+Alla behövs
+
+----
+
+Hur hittar man en origin?
+
+Det finns ett komplex som binder hela tiden, Origin recognition complex - komplexet som hittar origin. Som består av 6 proteiner. Sitter fast hel cellcykeln. En slags markör.
+![[Pasted image 20251121113014.png]]
+
+----
+
+Hur påbörjas DNA replikation?
+
+---
+![[Pasted image 20251121113046.png]]
+två rekryteringsfaktorer hjälper ORC att locka till sig DNA helikaset MCM.
+
+laddningsfaktorer:
+- Cdc6 och cdt1 till ORC
+
+
+1. ORC complex sitter i hel cellcykeln
+2. CDC6 och CDT1
+3. Helikaset
+4. Sen laddar CDC6/CDT1/ORC upp MCM i G1-fasen
+
+---
+
+![[Pasted image 20251121113406.png]]
+
+Nu är det laddat, men inte aktivt.
+
+Kräver höga nivår av cyklinberoende kinas (CDK) för att  kunna bilda CMG-helikaset
+
+Viktigt att det bara går att aktiva helikaset när det finns mycket CDK
+- som en pistol som är laddad, för att kunna få iväg kulan
+- CMG helikas smälts och replikationen kan man börja
+- Se till att man inte får en dubbel aktivering  (HUR?)
+
+Noggrant: skilj **laddning** från **aktivering**
+
+----
+
+Problem vid DNA-replikation
+Hur kan ändarna på linjärt DNA replikeras? Vi måste ju ha en RNA-primer?
+Detta är ett klassiskt problem.
+
+---
+
+![[Pasted image 20251121114215.png]]
+- Behöver ha en RNA-primer i början, men när vi kommer ut i slutet
+- den sista vi behöver lagging strand för behöver vi en primer
+- de fixar inte primerasen
+- vi kommer förlora lite i 5'-änden, över tiden blir det kortare och kortare till slut försvinner det
+- hur säkerställs det att det gör att replikera hela vägen ut i ändan?
+
+---
+
+I ändarna på kromsomerna kallas telomerer
+
+- De blir kortare och kortare till cellen dör
+- Vilket betyder att en cell kan bara delas ett visst antal gånger, sen dör cellerna
+- Men det gäller inte alla celler
+	- gäller somatiska celler
+	- gäller inte stamceller
+	- gäller inte cancerceller
+- vad är det som gör att telomererna kan finnas kvar i stam och cancerceller, men det blir kortare och kortare i alla andra celler?
+![[Pasted image 20251121114507.png]]
+
+---
+
+I centrala dogman DNA→RNA→protein
+Men det finns möjlighet att gå RNA→DNA vilket är omvänt transkriptas
+
+---
+
+![[Pasted image 20251121114559.png]]
+
+Telomeras förlänger kromsomändarna. 
+- Sker genom att lägga till en kort,
+- behöver en mall för att starta
+- har med sig en egen bit RNA som fungerar som mall
+- alla ändar ser likadana ut i slutändan (C A A U C C C A A U C)
+- lägger till skräp DNA så det är okej att förlora lite i ändarna
+
+