vault backup: 2025-11-21 13:14:22

content/Biokemi/Cellulära processer/DNA replikation/Stoff.md

@@ -0,0 +1,39 @@
+```
+Replikationsbubbla bildas vid {{c1::origin of replication}} där DNA öppnas och syntes sker i två riktningar.
+Replikationsgaffel är punkten där {{c1::helikas separerar DNA}} och polymeras arbetar.
+Origin of replication är {{c1::en specifik DNA-sekvens där replikation startar}}.
+Leading strand syntetiseras {{c1::kontinuerligt}} i 5’→3’-riktning.
+Lagging strand syntetiseras {{c1::diskontinuerligt}} som Okazaki-fragment.
+Okazaki-fragment är {{c1::100–200 nt långa bitar i eukaryoter}}.
+3’→5’-exonukleas hos DNA-polymeras ger {{c1::proofreading}}.
+Proofreading tar bort {{c1::felaktig nukleotid}} innan kedjan fortsätter.
+Processivitet är {{c1::polymerasets förmåga att fortsätta syntes utan att lossna}}.
+Sliding clamp (PCNA) ökar processivitet genom {{c1::att hålla polymeraset fast på DNA}}.
+Primas är {{c1::ett enzym som gör RNA-primers}}.
+RNA-primers behövs för {{c1::att DNA-polymeras inte kan starta de novo}}.
+Okazaki fragment maturation sker via {{c1::FEN1 som klyver flap + DNA-ligas som försluter nicken}}.
+FEN1 är {{c1::ett endonukleas som tar bort RNA-primer-flaps}}.
+Exonukleas tar bort nukleotider {{c1::från ändarna}}.
+Endonukleas klyver DNA {{c1::mitt i strängen}}.
+Helikas separerar DNA genom {{c1::ATP-driven upplindning av dubbelhelixen}}.
+RPA (Replication Protein A) binder {{c1::enkelsträngat DNA och stabiliserar det}}.
+Positiva supercoils bildas {{c1::framför helikas när DNA tvingas öppnas}}.
+Topoisomeras I tar bort supercoils genom {{c1::enkelsträngsbrott utan ATP}}.
+Topoisomeras II tar bort supercoils genom {{c1::dubbelsträngsbrott med ATP}}.
+CMG-komplexet består av {{c1::Cdc45, MCM och GINS}}.
+ORC är proteinkomplexet som {{c1::binder origin hela cellcykeln}}.
+MCM laddas på DNA i {{c1::G1-fasen}}.
+Cdc45 och GINS binder till MCM i {{c1::S-fasen}}.
+CMG-helikaset aktiveras i S-fasen och {{c1::öppnar DNA vid replikationsstart}}.
+PCNA:s roll är {{c1::sliding clamp som ökar polymerasets processivitet}}.
+PCNA har formen av {{c1::en trimerisk ring}} runt DNA.
+DNA-polymeras ε syntetiserar {{c1::leading strand}}.
+DNA-polymeras δ syntetiserar {{c1::lagging strand}}.
+Primers på lagging strand tas bort av {{c1::FEN1 och RNase H}}.
+DNA-ligas försluter {{c1::nicks mellan Okazaki-fragment}}.
+Topoisomeraser förhindrar {{c1::stopp i replikationen pga topologisk stress}}.
+Supercoils uppstår eftersom {{c1::dubbelhelixen inte kan rotera fritt}}.
+Bakteriofager får bakteriellt DNA genom {{c1::fel vid packning}} eller {{c2::imprecise excision av profag}}.
+Eukaryot DNA-replikation sker alltid i {{c1::5’→3’-riktning}}.
+Okazaki-fragment bildas endast på {{c1::lagging strand}}.
+```