vault backup: 2025-11-24 14:23:07

content/Biokemi/Cellulära processer/Kontroll av genuttryck i prokaryoter/Stoff.md

@@ -0,0 +1,47 @@
+```
+Reduktion innebär att ett ämne tar upp elektroner, vilket ofta – men inte alltid – leder till förlust av syre eller ökning av väte i molekylen.
+I en gen ingår även reglersekvenser, inte bara den proteinkodande delen.
+Genuttryck är när en gen används för att producera ett RNA eller ett protein.
+Housekeeping genes är alltid påslagna för de krävs för att en cell ska fungera.
+RNA syntesiseras alltid 5 → 3 riktning. Riktningen avgör vilken av strängarna som är mall eller kodande.
+Promotorn bestämmer i vilken riktning RNA- polymeraset skall transkribera
+En transkriptionsenhet är den sekvens i DNA som transkriberas till RNA. Startar vid promotorn och slutar vid terminatorn
+Ett operon är ett långt mRNA som kodar för flera olika proteiner
+I ett bakteriellt mRNA från ett operon finns många startplatser för translation
+Vid AUG som skall användas för initiering finns speciella sekvenser i mRNA – s.k. Shine-Dalgarno sekvenser, som hjälper ribosomen att hitta rätt. 
+E. coli RNA-polymeras (inte DNA-polymeras) har en beta-subenhet som är en del av det katalytiska centret.
+E. coli RNA-polymeras har en sigma-faktor som hjälper till att hitta promotorn.
+När E. coli DNA polymeras innehåller sigma-faktorn binder den väldigt svagt till ospecifikt DNA, att den glider försiktigt längs med ytan
+Bakteriellt RNA-polymeras glider längs DNA och letar efter en promotor.
+I bakterier finns sju olika sigma-subenheter som reglerar olika typer av gener
+I bakterier finns särskilda sigma faktorer för snabb tillväxt, för att skydda mot värme- shock, för att stimulera rörelse etc.
+I bakterier finns bindningsställer för aktivatorer och repressorer nära promotorn
+Regulatoriska sekvenser är platser i DNA där aktivatorer och repressorer binder.
+En operator är en DNA-sekvens till vilken en repressor kan binda för att blockera initiering av transkription.
+Tryptofan-operonet kodar för genprodukter (enzymer) som behövs för att bilda aminosyran tryptofan
+Tryptofan-operonet kodar för fem olika gener, typ A till E som skapar var sin enzym som krävs för att skapa tryptofan
+Finns det lite tryptofan i omgivningen så behöver Tryptofan-operonet uttryckas
+Finns det mycket tryptofan i omgivningen så behöver inte dessa enzymer uttryckas. 
+Trypotfan kan binda till trp repressorn så den inte längre binder
+Tillgången på tryptofan reglerar tryptofanrepressorns aktivitet!
+När E coli har god tillgång på tryptofan i mediet, binder det till repressorn och orsakar en konformationsförändring så att repressorn kan binda till operatorn. 
+Lac-operonet - kodar för genprodukter som behövs för att bryta ner laktos
+När det finns mycket glukos i cellerna är alternativa sockerkällor avstängda så att cellen huvudsakligen förbränner glukos
+När det finns lite glukos i cellen kan arabinos, laktos eller andra sockermolekyler användas som energikällor. 
+Lac-operones slås bara på när det saknas glukos i cellen
+Vid reglering av Lac-operonet samverkar en aktivator och en repressor 
+För att Lac-operonet ska transkribera, behövs repressorn tas bort och en aktiv aktivor som stimular RNA-polymeraset
+I närvaro av laktos så bildas allolaktos. Binder till repressorn och får den att släppa operatorn
+När det finns låga glukosnivåer så producerar cAMP som binder till cap-proteinern som kan binda till aktivatorplatsen brevid promotorn och hjälpa till att slå på transkriptionen
+När det finns glukos så produceras inte cAMP som inte binder till cap och inget blir aktiveras och det blir ingen transkription
+I närvaro av glukos används inte lac-operonet. Även om laktos finns i omgivningen! 
+I frånvaro av glukos slås lac-operonet på! Men bara om det finns laktos i omgivningen! 
+Antibiotika är ämnen som producerats av levande organismer i syfte att hålla andra organismer borta
+Inom medicinen används antibiotika för att behandla infektioner, men också vid cancersjukdom
+Rifampicin binder till beta-subenheten i det bakteriella RNA-polymeraset och blockerar elongering.
+Elongering är förmångan att transkribera
+Actinomycin lägger sig mellan basparen i DNA. Stör t.ex. Transkription och DNA replikation Används vid cancerbehandling t.ex. ovarialcancer 
+Bakteriofager infekterar bakterien och utnyttjar cellen för att skapa många nya kopior – bakterien dödas i en s.k. lytisk cykel
+Bakteriofag T7 RNA-polymeras används i ren form för att producera mRNA-vacciner mot t.ex. COVID
+
+```