vault backup: 2025-11-25 10:18:48

content/Biokemi/Cellulära processer/Translation/Stoff.md

@@ -0,0 +1,32 @@
+```
+mRNA kodas i 5'-till-3'-riktning ett kodon i taget
+Proteinet är syntetiserat från amino- till karboxyl-riktning
+tRNA är en adaptormolekyl mellan kodonet och aminosyran
+antikodonet parar med kodonet och är komplementar, innehåller samma information bakvänt
+För att kunna syntetisera protein måste kodonet läsas av korrekt av antikodonen
+tRNA är en kedja som innehåller mellan 73 och 93 nukleotider
+tRNA innehåller 7 till 15 ovanliga baser, metylerade eller demetylerade derivat
+Sekundärstruktuern av tRNA ser ut som ett klöverlöv
+Fem grupper av bases i tRNA är inte basparade men deltar i vätebindingar
+tRNAs sätter fast aminosyror i 3 CCA-terminalaregionen som också heter acceptor stem
+tRNAs 3' ände har först en adenosine med en hydroxylgrupp som sitter fast med aminosyran
+tRNAs 3D-struktur ser ut som ett L
+tRNAs antikodonloop sitter i mitten av sekvensen
+Genetiska koden är relationen mellan basparen i DNA och sekvensen av aminosyror i proteiner
+Genetiska koden karakteriseras av: 3 nukleotider (kodon), går i en riktning, överlappar inte, ingen punktuation
+Den genetiska koden är degenererad: flera kodon kodar för samma aminosyra, vilket minskar effekten av vanliga mutationer
+Det finns 3 kodon sekvenser som terminerar translationen (UAA, UAG, UGA)
+61 kodon kodar för 20 aminosyror
+Vissa tRNA-molekyler kan känna igen fler än ett kodon, det heter Wobble-effekten 
+Den tredje nukleotiden i ett kodon kan ’svaja’ lite, den har större sterisk frihet och behöver inte alltid baspara strikt
+Svajhypotesen förutser vilket antikodon som kan binda till ett visst kodon
+Inosin bildas genom deaminering av adenosin och kan bilda vätebindningar med adenin, cytosin och uracil
+Aminoacyl-tRNA-syntetaser kopplar specifika aminosyror till tRNA
+När man kopplar en aminosyra till tRNA heter det aminoacylisering
+Aminosyror kopplar till 2' eller 3'-hydroxylgruppen på det terminala adenosin i tRNA
+Varje aminosyra har ett specifikt enzym (aminoacyl-tRNA-syntetas), som katalyserar kopplingen av just den aminosyran till rätt tRNA-molekyl.
+Aminoacyl-tRNA-syntetas har en redigeringsplats som korrekturläser och tar bort felaktigt bundna aminosyror
+Aminoacyl-tRNA-syntetas har en aktiveringsplats som aktiverar rätt aminosyra genom att binda den till ATP innan den förs över till tRNA.
+Aktiveringsplatsen försöker välja rätt aminosyra, och redigeringsplatsen fångar upp och tar bort de små fel som ändå passerar vilket ger mycket hög noggrannhet.
+
+```