Johan Dahlin
aed264c326
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 1m16s
2.4 KiB
2.4 KiB
mRNA kodas i 5'-till-3'-riktning ett kodon i taget
Proteinet är syntetiserat från amino- till karboxyl-riktning
tRNA är en adaptormolekyl mellan kodonet och aminosyran
antikodonet parar med kodonet och är komplementar, innehåller samma information bakvänt
För att kunna syntetisera protein måste kodonet läsas av korrekt av antikodonen
tRNA är en kedja som innehåller mellan 73 och 93 nukleotider
tRNA innehåller 7 till 15 ovanliga baser, metylerade eller demetylerade derivat
Sekundärstruktuern av tRNA ser ut som ett klöverlöv
Fem grupper av bases i tRNA är inte basparade men deltar i vätebindingar
tRNAs sätter fast aminosyror i 3 CCA-terminalaregionen som också heter acceptor stem
tRNAs 3' ände har först en adenosine med en hydroxylgrupp som sitter fast med aminosyran
tRNAs 3D-struktur ser ut som ett L
tRNAs antikodonloop sitter i mitten av sekvensen
Genetiska koden är relationen mellan basparen i DNA och sekvensen av aminosyror i proteiner
Genetiska koden karakteriseras av: 3 nukleotider (kodon), går i en riktning, överlappar inte, ingen punktuation
Den genetiska koden är degenererad: flera kodon kodar för samma aminosyra, vilket minskar effekten av vanliga mutationer
Det finns 3 kodon sekvenser som terminerar translationen (UAA, UAG, UGA)
61 kodon kodar för 20 aminosyror
Vissa tRNA-molekyler kan känna igen fler än ett kodon, det heter Wobble-effekten
Den tredje nukleotiden i ett kodon kan ’svaja’ lite, den har större sterisk frihet och behöver inte alltid baspara strikt
Svajhypotesen förutser vilket antikodon som kan binda till ett visst kodon
Inosin bildas genom deaminering av adenosin och kan bilda vätebindningar med adenin, cytosin och uracil
Aminoacyl-tRNA-syntetaser kopplar specifika aminosyror till tRNA
När man kopplar en aminosyra till tRNA heter det aminoacylisering
Aminosyror kopplar till 2' eller 3'-hydroxylgruppen på det terminala adenosin i tRNA
Varje aminosyra har ett specifikt enzym (aminoacyl-tRNA-syntetas), som katalyserar kopplingen av just den aminosyran till rätt tRNA-molekyl.
Aminoacyl-tRNA-syntetas har en redigeringsplats som korrekturläser och tar bort felaktigt bundna aminosyror
Aminoacyl-tRNA-syntetas har en aktiveringsplats som aktiverar rätt aminosyra genom att binda den till ATP innan den förs över till tRNA.
Aktiveringsplatsen försöker välja rätt aminosyra, och redigeringsplatsen fångar upp och tar bort de små fel som ändå passerar vilket ger mycket hög noggrannhet.