Remove Ord:

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/1.md

@@ -16,5 +16,4 @@ Förklara vad som menas med att en molekyl är resonansstabiliserad och vad det
 
 ![[Pasted image 20251129235730.png]]
 
-Ord: 29  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/10.md

@@ -12,5 +12,4 @@ Vilken är den biologiska betydelsen av den 5’-cap som återfinns på mRNA i e
 **Svar**  
 Så fort mRNA:et börjar komma ut från RNA polymeras II, så sätts det på en guaninmolekyl på 5'-ändan via en 5'-5' bindning. Detta gör att mRNA-sekvensen inte bryts ner och att transkriptionen kan fortgå. När transkriptionen är färdig och mRNA-sekvensen har fått sin poly(A)-svans på sin 3´-ända och ska translateras så krävs det att både 5´cap och poly(A) finns på mRNA:et för att det ska kännas igen av ribosomen och translateras. 5´-capen hämmar alltså nedbrytning av mRNA, och möjliggör intiering av translation (tillsammas med poly(A)-svansen).  
 
-Ord: 85  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/13.md

@@ -12,5 +12,4 @@ Describe the main features of the genetic code and explain their biological sign
 **Answer**  
 The genetic code is that 3 codons on the mRNA, translates into 3 anti-codons on tRNA which gives the correct amino acid. Many amino acids has 3 codons that encode for them, because in case something goes wrong the correct amino acid binds anyway. Even the first base of the anticodon got what is called the Wobble effect, which means that for example Inosin there can bind to either A, C or U on the third base of codon. This enables that some errors in the genetic code does not lead to mutations because it bind the correct amino acid.  
 
-Ord: 100  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/14.md

@@ -12,5 +12,4 @@ Hur kan man identifiera viktiga aminosyror i ett protein när man bara har sekve
 **Svar**  
 Sekvensanalys innebär att man kan identifiera viktiga aminosyror genom att jämföra sekvenser från flera olika organismer och hitta likheter mellan organismerna. Viktiga aminosyror, t.ex den katalytiska triaden i t.ex chymotrypsin tenderar att bevaras i organismer därför att det naturliga urvalet bevarar sekvenser som är gynnsamma för artens anpassning och överlevnad.  
 
-Ord: 50  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/17.md

@@ -17,5 +17,4 @@ Om entalpin är negativ så kan en liten temperaturökning få reaktionen att st
 Om entalpin är positiv så betyder det att det är en endergon reaktion, som inte kommer att ske spontant. Positiv entalpi och ökad temperatur och ökad oordning kommer att ge en positiv delta G, alltså har endergona reaktioner positivt delta G.  
 Sänkt temperatur leder till sänkt oordning, eftersom rörelsenergin minskar.  
 
-Ord: 113  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/18.md

@@ -12,5 +12,4 @@ Chymotrypsin är ett enzym som använder kovalent katalys, vilken lämnar en kov
 **Svar**  
 Brevid serinet finns histidin, som en del av den katalytiska triaden (med bredvid menas endast i den katalytiska triaden, eftersom i primärstrukturen ligger serin och histidin inte brevid varandra). När en vattenmolekyl kommer in i den katalytiska klyftan så kommer histidinet att ta upp ett väte från vattenmolekylen, vilket aktiverar syremolekylen i vattnet. Syremolekylen utför en nukleofil attack på bindningen mellan serin och polypeptiden, och syret från vattnet binder till polypeptiden istället för serin. Detta gör att peptiden och OH-gruppen från vattnet lämnar den katalytiska klyftan, och att histidin donerar sitt väte som den tog från vattnet till serinet så att serin återgår till att ha en OH-grupp i sin sidokedja så att enzymet regenereras till sin ursprungsform.  
 
-Ord: 118  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/2.md

@@ -19,5 +19,5 @@ B) Basisk, kan ta upp en H⁺ vid lågt pH. Fungerar i vissa enzymkomplex som en
 
 *Ritning:* Lysin vid pH 2, fullständigt protonerad (sid 12).
 ![[Pasted image 20251129235808.png]]
-Ord: 29  
+
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/21.md

@@ -15,5 +15,4 @@ B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras allosteriskt och redog
 A) När en molekyl binder till ett annat ställe på enzymet än på det aktiva sätet och ändrar enzymets form, vilket ändrar dess aktivitet.  
 B) Fosfofruktokinas I stimuleras vid allosterisk reglering av AMP och fruktos-2,6-bisfofat. Den hämmas vid allosterisk reglering av ATP och citrat.  
 
-Ord: 44  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/26.md

@@ -13,5 +13,4 @@ Redogör för två sätt som metabolismen ändras vid träning och hur ändringa
 Laktat i muskeltyp IIb tas upp av hjärtat och av muskeltyp I, vilket gör att mängden laktat minskar i muskeltyp IIb så att anaerob metabolism kan fortgå längre. Hjärtats konkurrens om glukos minskar även då.  
 Laktat tas även upp av levern, och omvandlas till pyruvat, och sedan till glukos som går ut till blodet och tas upp av muskeltyp IIb och används i glykolysen. Detta kallas för Coricykeln. Båda dessa metabola vägar leder till förbättrad prestation, eftersom kroppen orkar hålla på under längre tid.  
 
-Ord: 84  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/27.md

@@ -19,5 +19,4 @@ En annan QH₂ kommer in till komplex III
 1 elektron tas upp av cytokrom C1 och ges till cytokrom C  
 1 elektron tas upp av Q⁻ blir till QH₂ (2 H⁺ tas upp från matrix)  
 
-Ord: 95  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/28.md

@@ -13,5 +13,4 @@ Vid reduktion av syre bildas små mängder reaktiva syreföreningar. Ange två e
 1. Glutation perioxidas  
 2. Superoxid dismutas  
 
-Ord: 6  
 Totalpoäng: 2

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/29.md

@@ -12,5 +12,4 @@ Beskriv hur triacylglycerol i fettceller bryts ner till fria fettsyror. (4p)
 **Svar**  
 Adrenalin eller glukagon inducerar intracellulära reaktioner via 7TM, vilket omvandlar ATP till cAMP. cAMP aktiverar proteinkinas A, som i sin tur aktiverar perilipin. Perilipin omarrangerar TAG så att ATGL kan klyva den första fettsyran (TAG blir DAG). Proteinkinas A aktiverar HS lipas som spjälkar den andra fettsyran (DAG till MAG). MAG lipas spjälkar den tredje fettsyran, så att det bara blir kvar glycerol.  
 
-Ord: 63  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/3.md

@@ -14,5 +14,4 @@ B) Give an example where cooperativity is beneficial and explain how it is benef
 A) Coopertivity means that once one hemegroup in hemoglobin binds to one oxygen molecule, it makes it easier to other oxygen molecules to bind in to the other hemegroups in the same hemoglobin molecule. Even when one oxygen molecule gets released from heme, it fascilitates for other oxygen molecules to get released.  
 B) In hemoglobin there are 4 hememolecules, and each one of them can bind to one oxygen. In the lungs, the partial pressure of oxygen is high, which encourage hemoglobin to bind to oxygen. Coopevtivity here is benificial because it makes the oxygen transport in the body effective.  
 
-Ord: 100  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/30.md

@@ -13,5 +13,4 @@ Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur hemesyntesen regle
 I första steget av hemesyntesen används enzymet ALA-syntas, och det är translationen av detta enzym som regleras.  
 Det finns ett järn-bindande protein som binder till mRNA:et som kodar för ALA-syntas vid frånvaro av järn. När det finns järn så binder järnet till järn-bindande proteinet, och får det att lossna från mRNA:et. Då kan mRNA:et translateras och ALA-syntas bildas. Järn sätts in i heme som sista steg vid syntesen, så det hade varit onödigt om alla syntes-steg skedde trots att det inte finns något järn.  
 
-Ord: 84  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/31.md

@@ -14,5 +14,4 @@ Oxaloacetat (alfaketosyra) transamineras vid deaminering av glutamat (aminosyra)
 Enzym: aspartataminotransferas (AST)  
 Alfa-ketosyran från citronsyracykeln  
 
-Ord: 25  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/32.md

@@ -12,5 +12,4 @@ Nämn en vanlig sjukdom som är relaterad till nedbrytning av nukleotider, samt
 **Svar**  
 Gikt, och puriner har en koppling till sjukdomen.  
 
-Ord: 8  
 Totalpoäng: 2

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/33.md

@@ -12,5 +12,4 @@ Var i cellen sker pentosfosfatvägen, och vilken biomolekyl, som kan användas v
 **Svar**  
 Pentosfosfatvägen sker i cytosolen, och bildar NADPH.  
 
-Ord: 7  
 Totalpoäng: 2

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/35.md

@@ -16,5 +16,4 @@ A) Nollhypotes: Det finns ingen skilland mellan blodtryckssänkningen om standra
 Alternativ hypotes: Det finns en skilland mellan blodtryckssänkningen om standradbehandling eller den nya tabletten används  
 B) Testet visar statistisk signifikans, eftersom p-värdet är lägre än 0,05 och konfidensintervallet inte innehåller siffran noll. Nollhypotesen kan därför förkastas.  
 
-Ord: 51  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/4.md

@@ -15,5 +15,4 @@ B) Beskriv vad en his-tag är och hur den kan användas för rening och detektio
 A) Gelfiltrening består av en fast fas med porösa kulor i en kolonn, och en mobil fas med en buffert och proteinet som ska renas. Små molekyler kommer att fastna i håligheterna i kulorna, medan stora proteiner kommer att komma ut först. Reningsmetoden är alltså baserad på proteiners storlek.  
 B) His-tagg är en sekvens av 6 histidin-aminosyror efter varandra. His-tagg binder starkt till nickel-joner och man kan därför använda den egenskapen vid rening av proteinet. Man använder då affinitetskromatografi, och renar proteinet baserat på selektivitet alltså en specifik egenskap. Proteinet kan sedan elueras med Imidazol, som konkurrerar ut His-taggen.  
 
-Ord: 99  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/5.md

@@ -14,5 +14,4 @@ Fettsyror i cellmembran är amfipatiska, och har alltså en polär del (huvud) o
 Fluiditeten i cellmembran ökar när temperaturen ökar, eftersom fettsyrorna börjar att röra på sig av värmeenergin. För att cellmembranet inte ska bli alltför genomsläppligt så fungerar kolesterol som en buffert som minskar på rörelsen hos fettsyrorna.  
 Och tvärtom gäller det att när temperaturen sjunker så minskar fettsyrornas rörelseenergi, och de börjar att binda hårdare till varandra. För att cellmembranet inte ska klumpa ihop sig, och bli helt ogenomsläppligt så fungerar kolesterolet även här som en buffert som sitter mellan fettsyrorna och sänker möjligheten för ihopklumpning av fettsyrorna.  
 
-Ord: 136  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/6.md

@@ -13,5 +13,4 @@ Förklara kortfattat likheter och skillnader mellan glukos, glukopyranos och N-a
 Linjär glukos blir cirkulär genom att aldehydgruppen på kol 1 binder till kol 5. Glukopyranos bildas genom att en aldehydgrupp på en molekyl binder till en hydroxylgrupp på en annan molekyl. Likheten är alltså att båda är cirkulära, men att antalet molekyler är olika.  
 N-acetylglukosamin är en glukosmolekyl, som är bunden till en acetylamingrupp. Acetylamingruppen är bunden till glukoset via sitt kväve. Likheten är alltså att glukos och N-acetylglukosamin båda innehåller glukos, men att N-acetylglukosamin även innehåller en acetylamingrupp.  
 
-Ord: 79  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/8.md

@@ -13,5 +13,4 @@ DNA-replikation är en noggrant reglerad process. I vilken fas av cellcykeln bin
 MCM-helikaset binder till replikationsorigin under G1-fasen när den lockas dit av ORC, och laddas av Cdc6 och Cdt1. Detta är möjligt under G1-fasen eftersom CDK-nivåerna är låga.  
 Under S-fasen höjs CDK-nivåerna vilket lockar dit Gins och Cdc45, som binder till det laddade MCM-helikaset och skapar ett komplett CMG-helikas som kan börja öppna upp dubbelsträngen. Replikationen sker under S-fasen, och det möjliggörs alltså av de höga nivåerna av CDK, vilket säkerställer att replikationen endast sker en gång under cellcykeln. Helikaset är ett motorprotein som glider längs med DNA-ryggraden av fosfatgrupper och bryter vätebindningarna mellan kvävebaserna genom hydrolys av ATP.  
 
-Ord: 98  
 Totalpoäng: 4

content/Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/9.md

@@ -12,5 +12,4 @@ Histonmodifieringar spelar en viktig roll i kromatinets funktion. Vilken effekt
 **Svar**  
 I nukleosomen finns bland annat dubbla uppsättningar av H3 och H4, och dessa 4 histoner har svansar av positivt laddade aminosyror (t.ex lysin och arginin) vid sin N-terminal. Dessa aminosyror binder till fosfatgrupperna på DNA:et ryggrad, eftersom fosfatgrupperna är negativt laddade. När svansarna blir acetylerade så neutraliseras de positiva laddningarna, och svansarna binder inte lika hårt till fosfatgrupperna. Detta möjliggör för enzymer att komma åt DNA:et, eftersom den inte är så hårt bunden till histonerna och möjliggör reglering av genuttryck (antingen mer eller mindre transkription beroende på gen och vilket enzym det handlar om).  
 
-Ord: 94  
 Totalpoäng: 4