1
0

vault backup: 2025-12-11 10:42:22
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 2m3s

This commit is contained in:
2025-12-11 10:42:22 +01:00
parent 15c081eb5a
commit 6ff764108d
8 changed files with 987 additions and 31 deletions

View File

@@ -6,30 +6,40 @@
{ {
"id": "33cf68c6719cb278", "id": "33cf68c6719cb278",
"type": "tabs", "type": "tabs",
"dimension": 32.30912476722533,
"children": [ "children": [
{ {
"id": "fb89c054e0a630b7", "id": "2daafd72ce76c277",
"type": "leaf", "type": "leaf",
"state": { "state": {
"type": "markdown", "type": "markdown",
"state": { "state": {
"file": "Biokemi/Gamla tentor/2025-02-01/26.md", "file": "Biokemi/Metabolism/Biokemi ur ett evolutionsperspektiv/Anteckningar.md",
"mode": "source", "mode": "source",
"source": false, "source": false,
"backlinks": false "backlinks": false
}, },
"icon": "lucide-file", "icon": "lucide-file",
"title": "26" "title": "Anteckningar"
} }
}, }
]
},
{
"id": "3bddd6ef2ec49f09",
"type": "tabs",
"dimension": 67.69087523277467,
"children": [
{ {
"id": "e09cfef17720a392", "id": "4500546397a4e760",
"type": "leaf", "type": "leaf",
"state": { "state": {
"type": "tasknotes-pomodoro-view", "type": "pdf",
"state": {}, "state": {
"icon": "clock", "file": "Biokemi/Metabolism/Biokemi ur ett evolutionsperspektiv/Slides.pdf.pdf"
"title": "Pomodoro" },
"icon": "lucide-file-text",
"title": "Slides.pdf"
} }
} }
] ]
@@ -79,7 +89,8 @@
} }
], ],
"direction": "horizontal", "direction": "horizontal",
"width": 200 "width": 285.50271224975586,
"collapsed": true
}, },
"right": { "right": {
"id": "0948c66181b40af9", "id": "0948c66181b40af9",
@@ -173,10 +184,10 @@
"state": { "state": {
"type": "file-properties", "type": "file-properties",
"state": { "state": {
"file": "Biokemi/Gamla tentor/2025-02-01/26.md" "file": "Biokemi/Metabolism/Biokemi ur ett evolutionsperspektiv/Anteckningar.md"
}, },
"icon": "lucide-info", "icon": "lucide-info",
"title": "File properties for 26" "title": "File properties for Anteckningar"
} }
} }
], ],
@@ -210,13 +221,25 @@
"tasknotes:Create new task": false "tasknotes:Create new task": false
} }
}, },
"active": "fb89c054e0a630b7", "active": "2daafd72ce76c277",
"lastOpenFiles": [ "lastOpenFiles": [
"Biokemi/Metabolism/Biokemi ur ett evolutionsperspektiv/Slides.pdf.pdf",
"Biokemi/Metabolism/Biokemi ur ett evolutionsperspektiv/Anteckningar.md",
"Biokemi/Metabolism/Biokemi ur ett evolutionsperspektiv/Untitled.md",
"Biokemi/Metabolismseminarie/1. Springa.md",
"Biokemi/Metabolism/Untitled.md",
"Biokemi/Metabolism/Biokemi ur ett evolutionsperspektiv",
"Biokemi/Metabolismseminarie/Direktiv.md",
"Biokemi/Metabolism/🍟 Kolesterolsyntes/🗒 Anteckningar Gabriel.md",
"Biokemi/Metabolism/🍕 β-oxidation/Slides.pdf.pdf",
"Biokemi/Metabolism/🍕 β-oxidation/Instuderingsuppgifter.md",
"Biokemi/Metabolism/🍕 β-oxidation/Lärandemål.md",
"Biokemi/Metabolism/Pentosfosfatvägen/Slides.pdf.pdf",
"Biokemi/Metabolism/🧬 Nukleotidnedbrytning/👨🏻‍🏫 Slides.md",
"Biokemi/Gamla tentor/2025-02-01/26.md",
"Untitled.canvas", "Untitled.canvas",
"Biokemi/Metabolism/🍬 Glykolysen/Slides.pdf.pdf", "Biokemi/Metabolism/🍬 Glykolysen/Slides.pdf.pdf",
"Biokemi/Metabolism/🍋 Citronsyracykeln/Citronsyracykeln.md", "Biokemi/Metabolism/🍋 Citronsyracykeln/Citronsyracykeln.md",
"Biokemi/Metabolismseminarie/1. Springa.md",
"Biokemi/Metabolismseminarie/Direktiv.md",
"Biokemi/Metabolism/Elektrontransportkedjan/📚 Instuderingsuppgifter.md", "Biokemi/Metabolism/Elektrontransportkedjan/📚 Instuderingsuppgifter.md",
"Biokemi/Metabolism/Elektrontransportkedjan/🎯 Lärandemål.md", "Biokemi/Metabolism/Elektrontransportkedjan/🎯 Lärandemål.md",
"Biokemi/Metabolism/Elektrontransportkedjan/🗒 Anteckningar.md", "Biokemi/Metabolism/Elektrontransportkedjan/🗒 Anteckningar.md",
@@ -234,22 +257,10 @@
"Biokemi/Gamla tentor/2024-08-01/28.md", "Biokemi/Gamla tentor/2024-08-01/28.md",
"Biokemi/Gamla tentor/2024-05-15/34.md", "Biokemi/Gamla tentor/2024-05-15/34.md",
"Biokemi/Gamla tentor/2024-01-27/29.md", "Biokemi/Gamla tentor/2024-01-27/29.md",
"Biokemi/Gamla tentor/2024-01-27/24.md",
"Biokemi/Gamla tentor/2023-05-15/26.md",
"Biokemi/Gamla tentor/2024-12-20/25.md",
"Biokemi/Gamla tentor/2022-12-19/29.md",
"Biokemi/Metabolism/🍕 β-oxidation/Instuderingsuppgifter.md",
"Biokemi/Metabolism/🍕 β-oxidation/Slides.pdf.pdf",
"Biokemi/Gamla tentor/2021-12-16/26.md",
"Biokemi/Gamla tentor/2023-05-15/25.md",
"Biokemi/Gamla tentor/2023-12-18/27.md",
"TYK", "TYK",
"Biokemi/Metabolism/Diagram/Glycolysis_overview.svg", "Biokemi/Metabolism/Diagram/Glycolysis_overview.svg",
"Biokemi/Metabolism/Diagram/Unconfirmed 719955.crdownload", "Biokemi/Metabolism/Diagram/Unconfirmed 719955.crdownload",
"Biokemi/Metabolism/Diagram/TCA_cycle.svg", "Biokemi/Metabolism/Diagram/TCA_cycle.svg",
"Biokemi/Metabolism/Diagram/Unconfirmed 281590.crdownload",
"Biokemi/Metabolism/Diagram",
"Biokemi/Gamla tentor/2022-12-19/2022-12-19-0097-TUX.pdf",
"attachments/Pasted image 20251129235332.png", "attachments/Pasted image 20251129235332.png",
"attachments/Pasted image 20251129235536.png", "attachments/Pasted image 20251129235536.png",
"Biokemi/Plasmidlabb/Bilder/IMG_1976.jpg", "Biokemi/Plasmidlabb/Bilder/IMG_1976.jpg",

View File

@@ -0,0 +1,29 @@
---
föreläsare: Martin Ott
date: 2025-12-11
tags:
- biokemi
- evolution
- anteckningar
---
Många frågeställningar går ofta tillbaka till evolution
# Evolution
1. Samla och kategorisera (ie Linné)
2. Natural selection (Darwin)
1. Drivkraften är inte vilja
2. Iaktagelse av skillnader
3. Mendel hur egenskaper nedärvs slumpmässigt
Två krav
1. viss variation
2. naturligt utval, de som är bäst lämpade är de som överlever/vidareutvecklas
Likheter
- arvsmassa är kodad i DNA
- tre kvävebaser-kodoner
- metabolism
- ATP
- co-faktorer

448
excel.csv Normal file
View File

@@ -0,0 +1,448 @@
"";"PU";"Etik Människovärde Behov Kostnad SRHR - Sexuell reproduktiv hälsa och rättigheter Kunskapscentrum riktar in sig mot personal (KCS) pod sex på arbetstid (kliniskt och forskningsperspektiv) Sexualmedicinskt Centrum (SMC) svårigheter i sex, ångest/tvång osv tvärprofissionellt Mottagning för sexulla övergrepp (MSÖ) mellan primärvård och specialister över 18 år MSÖ Pilen 13 år och uppåt lågtröskelmottagning Etiskt Hur kan du använda dig av det du lärde dig vid forumspelen? + Våga ifrågasätta, Har du varit med om liknande situtation? + Hur agerade du? + Har de du gjort annorlunda idag? +";"";"";"Etik Människovärde Behov Kostnad SRHR - Sexuell reproduktiv hälsa och rättigheter Kunskapscentrum riktar in sig mot personal (KCS) pod sex på arbetstid (kliniskt och forskningsperspektiv) Sexualmedicinskt Centrum (SMC) svårigheter i sex, ångest/tvång osv tvärprofissionellt Mottagning för sexulla övergrepp (MSÖ) mellan primärvård och specialister över 18 år MSÖ Pilen 13 år och uppåt lågtröskelmottagning Etiskt Hur kan du använda dig av det du lärde dig vid forumspelen? + Våga ifrågasätta, Har du varit med om liknande situtation? + Hur agerade du? + Har de du gjort annorlunda idag? +";""
"2025-12-05";"5";"Vad stämmer för en kemisk reaktion? Du kan välja flera alternativ. A I isolering går den till jämvikt. B Hastigheten bestäms av energiskillnaden i substrat och produkt(er). C Ett enzym ändrar deltaG för reaktionen. D Ett negativt deltaG innebär att reaktionen är fördelaktig.";"menti";"";"Vad stämmer för en kemisk reaktion? Du kan välja flera alternativ. A I isolering går den till jämvikt. B Hastigheten bestäms av energiskillnaden i substrat och produkt(er). C Ett enzym ändrar deltaG för reaktionen. D Ett negativt deltaG innebär att reaktionen är fördelaktig.";"A D"
"2025-12-05";"18";"Vad händer i pyruvatdehydrogenaskomplexet? Du kan välja flera alternativ. A En dekarboxylering. B Bildning av NAD+. C Bildning av acetyl-CoA. D En reduktion.";"menti";"";"Vad händer i pyruvatdehydrogenaskomplexet? Du kan välja flera alternativ. A En dekarboxylering. B Bildning av NAD+. C Bildning av acetyl-CoA. D En reduktion.";"A C D"
"2025-12-05";"1";"Mellan vilka två v nedanstående aminosyror kan bilda vätebindngar mellan sidokedjor? A metionin B leucin C tyrosin D glutamin";"menti";"";"Mellan vilka två v nedanstående aminosyror kan bilda vätebindngar mellan sidokedjor? A metionin B leucin C tyrosin D glutamin";"C D"
"2025-12-05";"19";"Pyruvatdehydrogenaskomplexet regleras av Du kan välja flera alternativ. A Cellens energikvot B Feedbackinhibering C Fosforylering D Feedforwardinhibering";"menti";"";"Pyruvatdehydrogenaskomplexet regleras av Du kan välja flera alternativ. A Cellens energikvot B Feedbackinhibering C Fosforylering D Feedforwardinhibering";"A, B, C and D"
"2025-12-05";"4";"Vilka finns det flest olika sorter av i cellen? A Aminosyror B Fosfolipider C Nukleotider D Monosackarider";"menti";"";"Vilka finns det flest olika sorter av i cellen? A Aminosyror B Fosfolipider C Nukleotider D Monosackarider";"B vi har några tusen, kan variera längd och huvudgrupp"
"2025-12-05";"16";"Till vad används CoA? Du kan välja flera alternativ. A Transport av alkylgrupper. B Transport av acylgrupper. C Citronsyracykeln. D Att koppla glykolysen med citronsyracykeln.";"menti";"";"Till vad används CoA? Du kan välja flera alternativ. A Transport av alkylgrupper. B Transport av acylgrupper. C Citronsyracykeln. D Att koppla glykolysen med citronsyracykeln.";"B, C, D"
"2025-12-05";"22";"I elektrontransportkedjan finns Du kan välja flera alternativ. A Kopparjoner B CoA C Cytokromer D CoQ";"menti";"";"I elektrontransportkedjan finns Du kan välja flera alternativ. A Kopparjoner B CoA C Cytokromer D CoQ";"A C D"
"2025-12-05";"12";"Vilken/vilka av nedanstående är en regulator för fosfofruktokinas 1? Du kan välja flera alternativ. A AMP B ADP C ATP D Fruktos 6-fosfat E Citrat";"menti";"";"Vilken/vilka av nedanstående är en regulator för fosfofruktokinas 1? Du kan välja flera alternativ. A AMP B ADP C ATP D Fruktos 6-fosfat E Citrat";"A, C, E"
"2025-12-05";"13";"Från vad kan vi göra glukos? Du kan välja flera alternativ. A Alanin B Lysin C Malat D Laktat E Palmitat";"menti";"";"Från vad kan vi göra glukos? Du kan välja flera alternativ. A Alanin B Lysin C Malat D Laktat E Palmitat";"A C D Kan inte göra glukos från fettsyror"
"2025-12-05";"17";"Vilken/vilka av nedanstående molekyler är en metabolit i citronsyracyklen? Du kan välja flera alternativ. A Oxalacetat B Akonitas C Succinat D Fumaras E Malat";"menti";"";"Vilken/vilka av nedanstående molekyler är en metabolit i citronsyracyklen? Du kan välja flera alternativ. A Oxalacetat B Akonitas C Succinat D Fumaras E Malat";"A, C, E"
"2025-12-05";"23";"Den slutgiltiga elektronacceptorn i ETK är A Komplex IV B ATP-syntas C O2 D CO2";"menti";"";"Den slutgiltiga elektronacceptorn i ETK är A Komplex IV B ATP-syntas C O2 D CO2";"C"
"2025-12-05";"10";"Vilken har flest steg? A Glykolysen B Glukoneogensen C Glykogenolysen D Citronsyracykeln E Betaoxidatnion";"menti";"";"Vilken har flest steg? A Glykolysen B Glukoneogensen C Glykogenolysen D Citronsyracykeln E Betaoxidatnion";"B"
"2025-12-05";"9";"Vilken/vilka av nedanstående molekyler härstammar från en B vitamin? Du kan välja flera alternativ. A Coenzym A B NAD+ C FAD D TPP";"menti";"";"Vilken/vilka av nedanstående molekyler härstammar från en B vitamin? Du kan välja flera alternativ. A Coenzym A B NAD+ C FAD D TPP";"A, B, C, D"
"2025-12-05";"14";"Vad förbrukas i glukoneogenesen? Du kan välja flera alternativ. A ATP B CTP C GTP D NAD+ E FADH2";"menti";"";"Vad förbrukas i glukoneogenesen? Du kan välja flera alternativ. A ATP B CTP C GTP D NAD+ E FADH2";"A, C"
"2025-12-05";"20";"Vad bildas i citronsyracykeln? Du kan välja flera alternativ. A FADH2 B NAD+ C CO2 D ATP";"menti";"";"Vad bildas i citronsyracykeln? Du kan välja flera alternativ. A FADH2 B NAD+ C CO2 D ATP";"A, C och D"
"2025-12-05";"15";"Vad/vilket stämmer om laktatdehydrogenas? Du kan välja flera alternativ. A Det är en dimer. B I hjärtat bildas alltid laktat. C När vi tränar ökar andelen M-subenheter i muskel typ 1. D Laktat bildas i muskel typ IIb.";"menti";"";"Vad/vilket stämmer om laktatdehydrogenas? Du kan välja flera alternativ. A Det är en dimer. B I hjärtat bildas alltid laktat. C När vi tränar ökar andelen M-subenheter i muskel typ 1. D Laktat bildas i muskel typ IIb.";"D"
"2025-12-05";"21";"I elektrontransportkedjen pumpas protoner i komplex Du kan välja flera alternativ. A I B II C III D IV";"menti";"";"I elektrontransportkedjen pumpas protoner i komplex Du kan välja flera alternativ. A I B II C III D IV";"A, C, D"
"2025-12-05";"11";"Vilken/vilka av nedanstående är metaboliter i glykolysen? Du kan välja flera alternativ. A Fruktos 2,6-bisfosfat B 3-fosfoglycerat C Glycerolfosfat D Pyruvat E Fruktos 6-fosfat";"menti";"";"Vilken/vilka av nedanstående är metaboliter i glykolysen? Du kan välja flera alternativ. A Fruktos 2,6-bisfosfat B 3-fosfoglycerat C Glycerolfosfat D Pyruvat E Fruktos 6-fosfat";"B, D, E"
"2025-12-05";"8";"När cellens energikvot är hög finns det mycket Du kan välja flera alternativ. A AMP B ATP C NADH D NAD+";"menti";"";"När cellens energikvot är hög finns det mycket Du kan välja flera alternativ. A AMP B ATP C NADH D NAD+";"B och C När energikvoten är hög finns det mycket ATP och NADH, medan AMP och NAD⁺ ligger lågt."
"2025-12-05";"3";"Vilken av nedanstående molekyler har svårast att diffundera genom ett menbran A N2 B Galaktos C Alanin D Metanol";"menti";"";"Vilken av nedanstående molekyler har svårast att diffundera genom ett menbran A N2 B Galaktos C Alanin D Metanol";"B Galaktos är en stor, starkt polär monosackarid och passerar därför svårast genom membranet."
"2025-12-05";"7";"Vilken av nedanstående molekyler har den högsta fosforyltransferpotentialen? A ATP B 3-fosfoglycerat C Fosfoenolpyruvat D Glyceraldehyd 3-fosfat";"menti";"";"Vilken av nedanstående molekyler har den högsta fosforyltransferpotentialen? A ATP B 3-fosfoglycerat C Fosfoenolpyruvat D Glyceraldehyd 3-fosfat";"C"
"2025-12-05";"6";"Vad karaktäriserar katabolismen? A Nedbrytning. B Sker när energikvoten är hög. C Produktion av NADH. D Oxidation av kol.";"menti";"";"Vad karaktäriserar katabolismen? A Nedbrytning. B Sker när energikvoten är hög. C Produktion av NADH. D Oxidation av kol.";"A, C och D"
"2025-12-05";"2";"vad karaktiäriserar sekundär struktur hos proteiner A vätebindingar mellan atomer i peptidbindingarna B interaktioner mellan r-grupperna C svårt att föresäga aminosyrsekvenser D konstrant avstånd mellan aminosyror";"menti";"";"vad karaktiäriserar sekundär struktur hos proteiner A vätebindingar mellan atomer i peptidbindingarna B interaktioner mellan r-grupperna C svårt att föresäga aminosyrsekvenser D konstrant avstånd mellan aminosyror";"A"
"2024-01-27";"28";"A) Var i cellen och i vilken metabol process sker cellandning? B) Beskriv cellandningen med en formel. (4p) (Max 50 ord.)";"elektrontransportkedjan";"";"A) Var i cellen och i vilken metabol process sker cellandning? B) Beskriv cellandningen med en formel. (4p) (Max 50 ord.)";"3 av 4: A. I elektrontransportkedjan i mitokondriens innre membran. B. Syre + elektroner --> H O Själva cellandningen sker i komplex 4 i elektrontransportkedjan."
"2024-01-27";"5";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av COVID-19 (4p). (Max 200 ord.) a) Beskriv en analysmetod för att undersöka detta. b) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod?";"utforska-proteiner";"";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av COVID-19 (4p). (Max 200 ord.) a) Beskriv en analysmetod för att undersöka detta. b) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod?";"Jag väljer att använda en ELISA, närmare bestämt en sandwich ELISA som identifierar om patienten har antigen. I en sandwich ELISA tillsätts patientens prov till en brunn där det finns en fast antikropp, i detta fall för COVID-19. Om patienten har antigen för COVID-19 kommer dessa att binda till antikroppen. Efter detta sköljer man provet för att göra sig av med andra antigen och antikroppar. Därefter tillsätts en antikropp bunden till ett enzym, mha detta kan man få fram en färgskiftning i provet om det är positivt. Efter att den enzymbundna antikroppen tillsatts sköljer man ytterliggare en gång och tillsist tillsätter man ett substrat som inducerar en färgskiftning i provet om den enzymbunda antikroppen lyckats binda, om färgskiftning sker är provet positivt och patienten har således antigen för COVID-19."
"2024-01-27";"18";"Varför ökar entropin i en spontan reaktion? Hur kan man förklara det molekylärt? (4p)";"termodynamik";"";"Varför ökar entropin i en spontan reaktion? Hur kan man förklara det molekylärt? (4p)";"I en spontant reaktion ökar alltid entropin enligt termodynamikens lagar. Molekyler har en förmåga att vilja sprida ut sig och således öka entropin. Detta sker genom Brownsk rörelse, alltså när molekyler ""krockar"" med varandra och ändrar riktning. Molekyler kommer röra sig mot det område där minst krockar uppstår. Som exempel kan vi ta salt i vatten. Saltet kommer spontant att lösa upp sig i vattnet, öka entropin. Genom Brownsk rörelse, krockar mellan molekylerna, fördelas saltet i vätskan."
"2024-01-27";"1";"Förklara vad van der Waals krafter är och ge ett exempel på hur de kan uppkomma i en biologisk molekyl. (4p) (Max 75 ord.)";"kemiska-bindingar";"";"Förklara vad van der Waals krafter är och ge ett exempel på hur de kan uppkomma i en biologisk molekyl. (4p) (Max 75 ord.)";"Van der Waals krafter är de svagaste av bindingstyper. Runt en molekyl finns elektroner i elektronskal och vid något tillfälle är den lite mer positiv respektive negativ på ena sidan. Detta påverkar molekyler runt ikring som blir s.k. transienta dipoler. När dessa uppstår medkommer krafter mellan molekylerna som kallas van der Waals krafter/bindningar. Ett exempel på molekyler med mycket van der Waals krafter är aromatiska aminosyror som kan packas tätt pga sin planstruktur. Totalpoäng: 4"
"2024-01-27";"19";"Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.04 mM är, och för D-fruktos = 1.7 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (4p)";"enzymer";"";"Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.04 mM är, och för D-fruktos = 1.7 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (4p)";"Km är den koncentration substrat som behövs för att halva Vmax ska vara uppnått. I detta fall är Km betydligt lägre för D-glukos än för D-fruktos. I och med att Km är lägre för D-glukos uppnår enzymet en högre hastighet med D-glukos eftersom koncentrationen för båda substraten var 1mM. Km för D-frukots var 1,7 mM vilket betyder att vi inte ens uppnåt halva Vmax vid koncentrationen 1 mM D-fruktos. Eftersom Vmax är detsamma för båda substraten kan man utgå från att det substrat med lägst Km värde är det som kommer förbrukas först. Detta stämmer också in med att glukos är det primära bränslet som vi fått lära oss på föreläsningar."
"2024-01-27";"29";"Vilka två av följande påståenden om beta-oxidationen är korrekta? (2p) A: Vid beta-oxidation av en 16-kolatomers fettsyra produceras 8 acetyl-CoA. B: Beta-oxidationen sker framför allt i cytoplasman. C: Vid beta-oxidationen bryts framför allt trans-fettsyror ner. D: Beta-oxidationen kräver en fungerande citronsyracykel för att ATP ska produceras.";"betaoxidation";"";"Vilka två av följande påståenden om beta-oxidationen är korrekta? (2p) A: Vid beta-oxidation av en 16-kolatomers fettsyra produceras 8 acetyl-CoA. B: Beta-oxidationen sker framför allt i cytoplasman. C: Vid beta-oxidationen bryts framför allt trans-fettsyror ner. D: Beta-oxidationen kräver en fungerande citronsyracykel för att ATP ska produceras.";"A och D"
"2024-01-27";"4";"Describe the allosteric regulation of hemoglobin with an example. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words)";"hemoglobin";"";"Describe the allosteric regulation of hemoglobin with an example. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words)";"2 av 4: Hemoglobin is an oxygentransport protein which transport oxygen from our lungs to our muscles and tissue. Hemoglobin consists of four subunits, two alfa and two beta, with one Fe per unit. When oxygen binds to the first Fe it moves 0,4 Å upwards, closer to the heme-group. This induce a conformatioin change in hemoglobin which increases the affinty for oxygen for the next subunit. This is why hemoglobins curve is hyperbol. This is called cooperativity."
"2024-01-27";"16";"Vilka två av dessa lipider hittas i det eukaryota cellmembranet? (2p) A: Sfingomyelin B: Kolesterol C: Fria fettsyror D: Triacylglycerol";"cellmembran";"";"Vilka två av dessa lipider hittas i det eukaryota cellmembranet? (2p) A: Sfingomyelin B: Kolesterol C: Fria fettsyror D: Triacylglycerol";"A och B"
"2024-01-27";"22";"I katabolismen hittar vi många enzymer som tillhör gruppen (välj två) A: Dehydrogenaser B: Isomeraser C: Polymeraser D: Karboxylaser";"";"";"I katabolismen hittar vi många enzymer som tillhör gruppen (välj två) A: Dehydrogenaser B: Isomeraser C: Polymeraser D: Karboxylaser";"A och B"
"2024-01-27";"32";"Varför måste ureacykeln användas vid nedbrytning av purin-nukleotider? (2p) (Max 50 ord)";"nukleotidnedbrytning";"";"Varför måste ureacykeln användas vid nedbrytning av purin-nukleotider? (2p) (Max 50 ord)";"1 av 2: Puriner har två ringstruktur. I puriner finns det kväve och väte som bildar ammoniak vilket i höga koncentrationer är farligt för kroppen. Ureacyklen används för att göra sig av med ammoniaken genom urat och sedan urinen. AI: Nedbrytning av purinnukleotider frigör aminogrupper, som omvandlas till ammoniak via transaminering och glutamatdehydrogenas. Ammoniak är starkt toxiskt, särskilt för CNS, och måste därför oskadliggöras. Ureacykeln omvandlar ammoniak till urea, som kan utsöndras säkert via njurarna."
"2024-01-27";"26";"Beskriv översiktligt den allostera regleringen av glykogenfosforylas i skelettmuskel och lever, dvs de viktigaste allostera modulatorerna som reglerar enzymet i respektive vävnad. Ange om modulatorerna stimulerar eller hämmar enzymets aktivitet. Rätt kombination av alloster modulator och påverkan på enzymaktivitet krävs för poäng. (4p) (Max 75 ord)";"glykogen";"";"Beskriv översiktligt den allostera regleringen av glykogenfosforylas i skelettmuskel och lever, dvs de viktigaste allostera modulatorerna som reglerar enzymet i respektive vävnad. Ange om modulatorerna stimulerar eller hämmar enzymets aktivitet. Rätt kombination av alloster modulator och påverkan på enzymaktivitet krävs för poäng. (4p) (Max 75 ord)";"2 av 4: Glykogen fosforylas är ett av enzymen som bryter ner glykogen. I muskler ska glykogenet brytas ner och användas som bränsle. Cellen känner av energikvoten. Detta betyder att om energikvoten är låg och vi har mycket ADP kommer enzymet att stimuleras. Om det finns mycket ATP hämmas enzymet. I levern ska glykogenet brytas ner och reglera blodsockret mellan måltider. Om glukosnivåerna är låga kommer enzymet stimuleras och vice versa. Glukagon kommer då stimulera medan insulin hämmar. AI: Skelettmuskel: Glykogenfosforylas aktiveras allostert av AMP, som signalerar låg energi. Det hämmas av ATP och glukos-6-fosfat, som signalerar god energitillgång. Lever: Glykogenfosforylas hämmas av glukos, vilket speglar höga blodglukosnivåer. Levern saknar AMP-aktivering i fysiologiskt relevant grad, eftersom dess uppgift är att frisätta glukos, inte att reglera sin egen energistatus."
"2024-01-27";"12";"Vilka två påståenden stämmer om splicing? (2p) A: Vid alternativ splicing kan även exon tas bort. B: Greningsstället är alltid ett G. C: Spliceosomen består av både proteiner och RNA. D: En lariatstruktur består alltid av två sammanlänkade exoner.";"rna-syntes";"";"Vilka två påståenden stämmer om splicing? (2p) A: Vid alternativ splicing kan även exon tas bort. B: Greningsstället är alltid ett G. C: Spliceosomen består av både proteiner och RNA. D: En lariatstruktur består alltid av två sammanlänkade exoner.";"A och C"
"2024-01-27";"36";"Which two statements about restriction enzymes such as BamHI are correct? (2p) A: They allow the visualization of the DNA at the end of gel electrophoresis. B: They perform the ligation of an insert into a vector. C: They generate “sticky ends” or “blunt ends”. D: They recognise and cleave DNA at specific sequences. (Svar markerat Totalpoäng: 2)";"plasmid";"";"Which two statements about restriction enzymes such as BamHI are correct? (2p) A: They allow the visualization of the DNA at the end of gel electrophoresis. B: They perform the ligation of an insert into a vector. C: They generate “sticky ends” or “blunt ends”. D: They recognise and cleave DNA at specific sequences. (Svar markerat Totalpoäng: 2)";"C och D"
"2024-01-27";"27";"A) Vilka energirika föreningar bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Vilken är kopplingen mellan cellens energikvot och citronsyracykeln? (4p) (Max 75 ord.)";"citronsyracykeln";"";"A) Vilka energirika föreningar bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Vilken är kopplingen mellan cellens energikvot och citronsyracykeln? (4p) (Max 75 ord.)";"2 av 4: A. Tre NADH och en FADH2 B. NADH och FADH2 behövs för att transportera elektoner till elektrontransportkedjan som kan bygga upp en elektrokemisk gradient för att bilda ATP genom ATP syntaset. En låg energikvot betyder därav att det inte finns tillräckligt med NADH och FADH2 från citronsyracyklen. AI: A) Ett varv i citronsyracykeln bildar 3 NADH, 1 FADH₂ och 1 GTP (≈ATP). B) Hög energikvot (mycket ATP, NADH) hämmar cykeln, främst via isocitratdehydrogenas och α-ketoglutaratdehydrogenas. Låg energikvot (mycket ADP, NAD⁺) stimulerar cykeln. Cykeln regleras alltså efter cellens energibehov."
"2024-01-27";"13";"Lac-operonet behövs för att uttrycka enzymer som kan bryta ner laktos (mjölksocker). Vilka två påståenden stämmer? (2p) A: När allolaktos finns närvarande kan lac-repressorn inte binda till operator-sekvensen. B: I närvaro av laktos är lac-operonet fullt påslaget, även om det finns rikligt med glukos i omgivningen. C: I närvaro av höga mängder glukos stimuleras bildning av cAMP. D: cAMP binder till CAP och stimulerar aktiviteten hos detta aktivator-protein.";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"";"Lac-operonet behövs för att uttrycka enzymer som kan bryta ner laktos (mjölksocker). Vilka två påståenden stämmer? (2p) A: När allolaktos finns närvarande kan lac-repressorn inte binda till operator-sekvensen. B: I närvaro av laktos är lac-operonet fullt påslaget, även om det finns rikligt med glukos i omgivningen. C: I närvaro av höga mängder glukos stimuleras bildning av cAMP. D: cAMP binder till CAP och stimulerar aktiviteten hos detta aktivator-protein.";"A och D"
"2024-01-27";"17";"Redogör för den principiella uppbyggnaden av spänningsaktiverade katjonkanaler och hur de öppnas. (4p) (Max 100 ord)";"transport-över-cellmembran";"";"Redogör för den principiella uppbyggnaden av spänningsaktiverade katjonkanaler och hur de öppnas. (4p) (Max 100 ord)";"2 av 4: En jonkanal består av sex olika segment. Segment 5 och 6 bildar själva centralporen medan segment 1-3 tillsammans med segment 4 bildar den spännings känsliga padeln. Segment 4 är det segment som känner av själva spänningsförändringen. När en en spänningsförändring i membranet sker registeras detta hos padlen vilket inducerar en konformationsändring och får den att ställa sig på ""högkant"". Detta öppnar katjonkanalen och joner kan flöda in eller ut ur cellen. AI: Spänningsaktiverade katjonkanaler består av fyra domäner (eller fyra separata subenheter) som vardera har sex transmembransegment (S1S6). Segmentet S4 innehåller positivt laddade aminosyror och fungerar som spänningssensor. När membranet depolariseras rör sig S4 utåt, vilket drar i kopplade segment (framför allt S5S6) och öppnar poren. En selektivitetsfilterregion bestämmer vilka katjoner som passerar. Kanalen kan även inaktiveras via en separat “inaktiveringsgrind” efter öppning."
"2024-01-27";"23";"Vilka två av nedanstående metaboliter ingår i glykolysen? A: Fruktos 2,6-bisfosfat B: Glukos 1-fosfat C: Glyceraldehyd 3-fosfat D: Fosfoenolpyruvat";"glykolysen";"";"Vilka två av nedanstående metaboliter ingår i glykolysen? A: Fruktos 2,6-bisfosfat B: Glukos 1-fosfat C: Glyceraldehyd 3-fosfat D: Fosfoenolpyruvat";"C och D"
"2024-01-27";"33";"Mutationer i genen som kodar för enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas kan leda till ett defekt enzym vilket i sin tur kan orsaka hemolytisk anemi i vissa situationer. Vilken är grundorsaken till detta? (2p) (Max 50 ord)";"pentosfosfatvägen";"";"Mutationer i genen som kodar för enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas kan leda till ett defekt enzym vilket i sin tur kan orsaka hemolytisk anemi i vissa situationer. Vilken är grundorsaken till detta? (2p) (Max 50 ord)";"1 av 2: Glukos 6-fosfatdehydrogenas är det första enzymet i pentosfosfatvägen, som körs för att bilda NADPH och ribos 5-fosfat. Vid deffekt i detta enzym bildas inte tillräckligt med NADPH som skyddar mot reaktiva syreföreningar. Detta är speceillt farligt för t.ex. eretrocyter som saknar mitokondrier och måste få allt sitt NADPH från pentosfofsfatvägen. AI: Glukos-6-fosfatdehydrogenas behövs för att bilda NADPH i pentosfosfatvägen. NADPH håller glutation reducerat, vilket skyddar erytrocyter mot oxidativ skada. Vid enzymdefekt saknar cellen detta skydd → oxidativ stress skadar membran och hemoglobin → erytrocyterna hemolyserar."
"2024-01-27";"24";"Förklara hur arsenikförgiftning påverkar metabolismen och varför liknande påverkan ses vid alkoholism. (4p) (Max 120 ord)";"integrering-av-metabolismen";"";"Förklara hur arsenikförgiftning påverkar metabolismen och varför liknande påverkan ses vid alkoholism. (4p) (Max 120 ord)";"3 av 4: Arsenit har affiniet för sulfhydrylgrupper. En viktig del i PDH komplexet är den arm som för intermediärerna mellan E1, E2 och E3. Denna arm bygger på just svavel. Armen inhiberas således av arsenit när bindningar mellan arsenit och armen bildas vilket medför att vi inte kan producera lika mycket eller ingen acetyl-CoA. Utan acetyl-CoA kan vi inte köra citronsyracyklen och således inte få fram NADH och FADH2 till elektrontransport kedjan. Alkholism leder till liknande effekter då de polära alkholerna kan binda till den intermediär-transportrande armen och inhibiera PDH komplexet. PDH=Pyruvat dehydrogenas"
"2024-01-27";"10";"![[Pasted image 20251129235332.png]] På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. A) Ange för positionerna a, b, c och d om de motsvarar en 5 eller 3-ände. Vid DNA replikation skapas de två strängarna på litet olika vis. B) Vad kallas strängen som markerats med e? C) Vad kallas strängen som markerats med f? (4p)";"dna-replikation";"";"![[Pasted image 20251129235332.png]] På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. A) Ange för positionerna a, b, c och d om de motsvarar en 5 eller 3-ände. Vid DNA replikation skapas de två strängarna på litet olika vis. B) Vad kallas strängen som markerats med e? C) Vad kallas strängen som markerats med f? (4p)";"a = 5´ b = 3´ c = 5´ d = 5´ B) Leadning strand C) Lagging strand"
"2024-01-27";"9";"Var binder histon H1? Vilken roll spelar detta protein? (4p)";"kromatin";"";"Var binder histon H1? Vilken roll spelar detta protein? (4p)";"Histon 1, H1, upptäcktes senare än de andra histonen, H2A, H2B, H3 och H4. H1 har i uppgift att stabilisera och binder till linker DNA som finns mellan ""histonpärlorna"""
"2024-01-27";"34";"Vilket av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten in vivo? (2p) A: Den intracellulära kolesterolhalten regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet lysosomal acid lipas (LAL). B: Den intracellulära kolesterolhalten regleras i princip enbart via endogen syntes - upptaget av kolesterol från det extracellulära rummet är normalt försumbart. C: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol på en fettsyra. D: Celler utanför levern kan göra sig av med ett överskott av kolesterol genom att överföra detta till HDL-partiklar, som för kolesterolet tillbaka till levern.";"kolesterol";"";"Vilket av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten in vivo? (2p) A: Den intracellulära kolesterolhalten regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet lysosomal acid lipas (LAL). B: Den intracellulära kolesterolhalten regleras i princip enbart via endogen syntes - upptaget av kolesterol från det extracellulära rummet är normalt försumbart. C: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol på en fettsyra. D: Celler utanför levern kan göra sig av med ett överskott av kolesterol genom att överföra detta till HDL-partiklar, som för kolesterolet tillbaka till levern.";"C och D"
"2024-01-27";"14";"Beskriv i detalj hur terminationssteget i proteinsyntesen fungerar med särskilt fokus på funktionen av stoppkodon och ribosomens struktur. Förklara även hur Release Factor 1 (RF1) bidrar till processen. (4p) (Max 150 ord)";"translation";"";"Beskriv i detalj hur terminationssteget i proteinsyntesen fungerar med särskilt fokus på funktionen av stoppkodon och ribosomens struktur. Förklara även hur Release Factor 1 (RF1) bidrar till processen. (4p) (Max 150 ord)";"3 av 4: Ribosomen består av två subenheter, hos människan heter dessa 40 och 60. Den lilla subenheten, 40, har i uppgift leta efter starkodonet men också känna av stoppkodonet. Den stora subenheten, 60, har i uppgift att katalysera inbindingen av rätt aminosyra till en växande aminosyra sekvens i P-site. I terminations steget kommer ribosomen, 40 enheten, att känna av en cleavage signal som får RF1 att avsluta translationen. Cleavage signal är alltså ett stoppkodon. Det som sker är att RF1 kommer klyva den nu färdig byggda aminosyra sekvens som växt fram i P-site så att den transporteras till sin ämmnade destination."
"2024-01-27";"20";"Vilka två påståenden om kompetitiva hämmare är korrekta? (2p) A: De binder reversibelt till det aktiva stället. B: De binder till flera olika ställen på ett enzym. C: De sänker reaktionens karakteristiska Km. D: De binder kovalent till enzymet.";"enzymer";"";"Vilka två påståenden om kompetitiva hämmare är korrekta? (2p) A: De binder reversibelt till det aktiva stället. B: De binder till flera olika ställen på ett enzym. C: De sänker reaktionens karakteristiska Km. D: De binder kovalent till enzymet.";"A och C"
"2024-01-27";"30";"Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur detta sker. (4p)";"heme";"";"Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur detta sker. (4p)";"AI: Hemesyntesen styrs av hur mycket järn som finns i cellen genom reglering av ALA-syntas (erytroid isoform). När järn är lågt binder IRP till en IRE-sekvens i 5-änden av ALAS-mRNA och blockerar translationen, vilket bromsar hemesyntesen. När järn är tillräckligt släpper IRP → ALA-syntas kan översättas → hemesyntesen ökar. På så sätt matchas hemeproduktionen med tillgängligt järn."
"2024-01-27";"15";"Hur kan man bestämma släktskap mellan olika arter med DNA-teknik och varför fungerar det? (4p)";"evolution";"";"Hur kan man bestämma släktskap mellan olika arter med DNA-teknik och varför fungerar det? (4p)";"Genom att sekvensera DNA kan man se hur mycket som stämmer överens mellan olika arter. Även om majoriteten av vårt DNA är sig likt hos många arter kan man ändå se skillnader på t.ex. mutationer. För att exemplifiera: DNA't hos en människa och en orangutang är mycket likt varandra, men pga DNA'ts ordning, proteinveckning och epigentik kan det uttryckas väldigt olika och således ge upphov till olika utseende, beetende och andra egenskaper. Således kan okika arter vara nära besläktande med varandra, alltså ha liknade DNA, men ändå vara olika arter."
"2024-01-27";"21";"Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs minskar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från fruktos 1,6-bisfosfat. C: ATP innehåller färre fosfoanhydridbindningar än fosfatgrupper. D: I en välmående cell finns mer ATP än ADP.";"introduktion-till-metabolismen";"";"Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs minskar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från fruktos 1,6-bisfosfat. C: ATP innehåller färre fosfoanhydridbindningar än fosfatgrupper. D: I en välmående cell finns mer ATP än ADP.";"C och D"
"2024-01-27";"31";"Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Vid fenylketonuri blir aminosyran fenylalanin essentiell. B: Ureacykeldefekter leder till hyperammonemi. C: Det kliniskt viktiga enzymet aspartataminotransferas kan bilda aspartat från pyruvat i en så kallad transamineringsreaktion. D: Aspartat är en glukogen aminosyra.";"aminosyrametabolism";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Vid fenylketonuri blir aminosyran fenylalanin essentiell. B: Ureacykeldefekter leder till hyperammonemi. C: Det kliniskt viktiga enzymet aspartataminotransferas kan bilda aspartat från pyruvat i en så kallad transamineringsreaktion. D: Aspartat är en glukogen aminosyra.";"B och D"
"2024-01-27";"25";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker främst i levern. B: Kol oxideras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 1,6-bisfosfat. D: Aminosyrorna cystein och metionin är glukogena.";"glukoneogenes";"";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker främst i levern. B: Kol oxideras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 1,6-bisfosfat. D: Aminosyrorna cystein och metionin är glukogena.";"A och D"
"2024-01-27";"11";"Telomeras är ett omvänt transkriptas. Vad använder detta enzym som templat (mall)? Nämn också två typer av celler i vilka detta enzym återfinns. (4p)";"dna-replikation";"";"Telomeras är ett omvänt transkriptas. Vad använder detta enzym som templat (mall)? Nämn också två typer av celler i vilka detta enzym återfinns. (4p)";"Telomeras har med sig en egen RNA sekvens som den använder som mall när det ska förlänga telomererna. Detta enzym återfinns i t.ex. stamceller och cancer celler."
"2024-01-27";"8";"Vilka två nedanstående påståenden är korrekta? (2p) A: Uracil är en kvävebas i DNA. B: Kolatomen i position 1' hos sockret är bunden till kvävebasen via en β-glykosid-bindning. C: Adenosin är en nukleosid. D: ATP innehåller två fosfatgrupper.";"nukleotider";"";"Vilka två nedanstående påståenden är korrekta? (2p) A: Uracil är en kvävebas i DNA. B: Kolatomen i position 1' hos sockret är bunden till kvävebasen via en β-glykosid-bindning. C: Adenosin är en nukleosid. D: ATP innehåller två fosfatgrupper.";"B och C"
"2024-01-27";"35";"I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värdet på 0.03 och ett 95% konfidensintervall på 6-17 mmHg. Diskutera vad dessa resultat ger oss för information och huruvida nollhypotesen kan förkastas. (4p) (Max 100 ord).";"introduktionslaboration";"";"I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värdet på 0.03 och ett 95% konfidensintervall på 6-17 mmHg. Diskutera vad dessa resultat ger oss för information och huruvida nollhypotesen kan förkastas. (4p) (Max 100 ord).";"2 av 4: Detta resultat visar att nollhypotesen kan förkastas då p-värdet är under 0,05 då det finns sk. statistisk signifikans. Hade p-värdet varit över 0,05 hade man inte kunnat förkasta nollhypotesen. Vidare visar konfidensintervallet att 95% av de som fick den blodtryckssänknade medicinen fick ett lägre blodtryck med 6-17 mmHg. AI: p-värdet 0,03 innebär att om nollhypotesen (ingen skillnad i medelblodtryck) vore sann, skulle en så här stor eller större skillnad uppstå bara i cirka 3 % av fallen. Nollhypotesen kan därför förkastas vid 5 %-nivån. Ett 95 % konfidensintervall på 617 mmHg innebär att vi med 95 % säkerhet skattar den sanna medelreduktionen i blodtryck till mellan 6 och 17 mmHg, och eftersom intervallet inte innehåller 0 talar det också för en statistiskt signifikant blodtryckssänkande effekt."
"2024-01-27";"3";"Lista fyra egenskaper hos en alfahelix. (4p) (Max 75 ord.)";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Lista fyra egenskaper hos en alfahelix. (4p) (Max 75 ord.)";"3 av 4: 1. Har en konstant diameter. 2. Har kvävebaserna innåt och fosfatgrupperna och sockret utåt. (Pga hydrofob/hydrofil) 3. Kan polymeriseras till beta flaks liknande strukturer och bilda amyloider => Sjukdom. 4. Kan bilda transmembran-alfahelixar om det finns mycket hydrofoba aminosyror. Går att undersöka genom hydropatiplot."
"2024-01-27";"7";"Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och proteoglykaner. (4p) (Max 150 ord)";"kolhydrater";"";"Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och proteoglykaner. (4p) (Max 150 ord)";"2 av 4: Glykoproteiner och proteoglykaner är båda former av glykokonjugat och består båda av proteiner och socker. Glykoproteiner är väldigt långa och repetativa, tillskillnad från proteoglykaner. Både glykoproteiner och proteoglykaner finns ut mot ECM och har något att göra med cellens kommunikation/interaktion med andra celler, bakterier och virus. De kan också utgöra skydd. Glykoproteiner kan vara O-länkade eller N-länkade. Det vill säga om de är länkade via syret (O) i serin eller teronins funktionella grupp eller via kvävet (N) i aspargins funktionella grupp."
"2024-01-27";"6";"Rita den principiella strukturen för en glykolipid. (4p)";"cellmembran";"";"Rita den principiella strukturen för en glykolipid. (4p)";""
"2024-01-27";"2";"Vilka två av nedanstående aminosyror är de mest troliga att förekomma mot ytan av ett cytoplasmatiskt protein? A: Fenylalanin B: Serin C: Alanin D: Cystein";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Vilka två av nedanstående aminosyror är de mest troliga att förekomma mot ytan av ett cytoplasmatiskt protein? A: Fenylalanin B: Serin C: Alanin D: Cystein";"B och D"
"2022-01-29";"28";"Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: En fungerande pentosfosfatväg behövs för att upprätthålla ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar i röda blodkroppar. B: Fruktos 6-fosfat och glyceraldehyd 3-fosfat kan bildas i pentosfosfatvägens oxidatativa fas. C: Det som styr om glukos 6-fosfat ska slussas in i pentosfosfatvägens oxidataiva fas är de intracellulära nivåerna av NADP+ och NADPH. D: Pentosfosfatvägen är förlagd i mitokondriens matrix.";"pentosfosfatvägen";"";"Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: En fungerande pentosfosfatväg behövs för att upprätthålla ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar i röda blodkroppar. B: Fruktos 6-fosfat och glyceraldehyd 3-fosfat kan bildas i pentosfosfatvägens oxidatativa fas. C: Det som styr om glukos 6-fosfat ska slussas in i pentosfosfatvägens oxidataiva fas är de intracellulära nivåerna av NADP+ och NADPH. D: Pentosfosfatvägen är förlagd i mitokondriens matrix.";"A och C"
"2022-01-29";"5";"Fråga 5 A. Hur många vätebindningar finns i AT resp. GC baspar? B. Hur påverkar baskompositionen DNA stabiliteten? (2p)";"nukleotider";"";"Fråga 5 A. Hur många vätebindningar finns i AT resp. GC baspar? B. Hur påverkar baskompositionen DNA stabiliteten? (2p)";"A. AT har 2 vätebidningar GC har 3 vätebidningar B. Detta gör att vätebidningarna mellan G och C är stabilare eftersom det finns fler bidningspunkter. AT-bidningarna som har färre bindningspunkter /par är därmed ostabilare, detta är något som kan utnyttjas vid bl.a. transkription, eftersom DNA blir mer lättsmält vid AT-rika sekvenser som TATA-boxen."
"2022-01-29";"18";"För ett enzym är Michaelis-Mentens konstant (KM) 15 mM. Vid en substratkoncentration på 5 mM, vad är förhållandet mellan reaktionshastigheten V och den maximala reaktionshastigheten Vmax? Motivera ditt svar. (Max 150 ord) (2p) ![[Pasted image 20251128081722.png]]";"enzymer";"";"För ett enzym är Michaelis-Mentens konstant (KM) 15 mM. Vid en substratkoncentration på 5 mM, vad är förhållandet mellan reaktionshastigheten V och den maximala reaktionshastigheten Vmax? Motivera ditt svar. (Max 150 ord) (2p) ![[Pasted image 20251128081722.png]]";"Reaktionshastigheten vid 5mM är alltså en fjärdedel av hastigheten vid Vmax"
"2022-01-29";"1";"A) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en vätebindning kan bildas. Ange vilka atomer som är donator respektive acceptor i vätebindningen. B) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en jonbindning kan bildas vid pH = 7.";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"A) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en vätebindning kan bildas. Ange vilka atomer som är donator respektive acceptor i vätebindningen. B) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en jonbindning kan bildas vid pH = 7.";"a) Serin syre är donator, Asparagin kväve är acceptor b) Lysin, Aspartat"
"2022-01-29";"19";"I en av delreaktionerna som katalyseras av chymotrypsin krävs närvaro av vatten, medan i en annan delreaktion krävs det att inget vatten är närvarande. Vilka är dessa delreaktioner och varför krävs närvaro respektive frånvaro av vatten i de respektive stegen? (Max 150 ord) (2p)";"enzymer";"";"I en av delreaktionerna som katalyseras av chymotrypsin krävs närvaro av vatten, medan i en annan delreaktion krävs det att inget vatten är närvarande. Vilka är dessa delreaktioner och varför krävs närvaro respektive frånvaro av vatten i de respektive stegen? (Max 150 ord) (2p)";"I delreaktion 1 krävs inget vatten, då his tar emot vätet från asp som gör en nukleofilattack på den inkommande peptidbidningen. I delreaktion 2 krävs vatten, för att den peptiden ska klyvas och släppa från chymotrypsin"
"2022-01-29";"29";"Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Nukleosidaser spjälkar av fosfatgrupper från nukleotider. B: Delar av purinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Kvävebaser som frisätts vid nedbrydning av nukleotider återanvänds ofta för nukleotidsyntes. D: Kväveatomerna i pyrimidinerna hamnar huvudsakligen i urat då dessa kvävebaser bryts ned.";"nukleotidnedbrytning";"";"Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Nukleosidaser spjälkar av fosfatgrupper från nukleotider. B: Delar av purinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Kvävebaser som frisätts vid nedbrydning av nukleotider återanvänds ofta för nukleotidsyntes. D: Kväveatomerna i pyrimidinerna hamnar huvudsakligen i urat då dessa kvävebaser bryts ned.";"Rätt svar 1. C"
"2022-01-29";"4";"Fråga 4 Vilken/vilka av dessa är en omega-3 fettsyra? (1p) ![[Pasted image 20251128081622.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: B B: C C: A D: D";"lipider";"";"Fråga 4 Vilken/vilka av dessa är en omega-3 fettsyra? (1p) ![[Pasted image 20251128081622.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: B B: C C: A D: D";"Rätt svar 1. A 2. B"
"2022-01-29";"16";"Bacterial DNA may end up in a bacteriophage due to (choose one or more)/Bakteriellt DNA kan hamna i en bakteriofag för att (välj ett eller flera alternativ): (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Errors during the assembly of new bacteriophages./Fel som sker när nya bakteriofager sätts samman. B: The small and circular nature of bacterial DNA./Bakteriellt DNA är cirkulärt och litet. C: Template switching during bacterophage DNA replication./Ändring av mall när bakteriofagens DNA replikeras. D: Imprecise excision of the prophage./Inexakt utklippning av profagen.";"rekombinant-dna-teknik";"";"Bacterial DNA may end up in a bacteriophage due to (choose one or more)/Bakteriellt DNA kan hamna i en bakteriofag för att (välj ett eller flera alternativ): (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Errors during the assembly of new bacteriophages./Fel som sker när nya bakteriofager sätts samman. B: The small and circular nature of bacterial DNA./Bakteriellt DNA är cirkulärt och litet. C: Template switching during bacterophage DNA replication./Ändring av mall när bakteriofagens DNA replikeras. D: Imprecise excision of the prophage./Inexakt utklippning av profagen.";"Rätt svar 1. D"
"2022-01-29";"22";"Redogör för hur enzymet fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktokinas 2 regleras och spelar en central roll i glukosmetabolismen. Max 150 ord. (2p)";"glukosmetabolism";"";"Redogör för hur enzymet fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktokinas 2 regleras och spelar en central roll i glukosmetabolismen. Max 150 ord. (2p)";"Enzymets aktivitet styrs av hormonreglering och fosforylering. När insulin binder in till cellens recptor stimuleras PP1. Funktionen för PP1 är att defosforylera enzymet. När fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2 är defosforylerat inhiberas fosfatasdelen medan kinasdelen aktiveras. När kinasdelen är aktiverad katalyseras reaktionen där fruktos 6-fosfat blir fruktos-2,6-bisfosfat. När glukagon binder in till cellens receptor sätter en kaskadreaktion igång där cAMP genereras, vilket aktiverar PKA. PKAs aktivitet leder till en inhibering av PP1 och en fosforylering av enzymet fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2. Fosforyleringen inhiberar kinas delen och aktiverar fosfataset. När fosfatasdelen är aktiv katalyseras reaktionen där fruktos-2,6-bisfosfat återbildas till fruktos 6-fosfat. Detta spelar en central roll i metabolismen då hög koncentration av fruktos-2,6-bisfosfat (vilket bildas när enzymet är defosforylerat) stimulerar glykolysenzymet fosfofruktikinas 1 (som katalyserar reaktionen fruktos 6-fosfat --> fruktos 1,6-bisfosfat) samtidigt som det inhiberar glykoneogenes enzymet fruktos 1,6-bisfosfatas (som katalyserar reaktionen fruktos 1,6-bisfosfat --> fruktos 6-fosfat). Alltså fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2 styr mängden fruktos-2,6-bisfosfat vilket reglerar om cellen ska köra glykolys eller glukoneogenes."
"2022-01-29";"32";"Beskriv uppbyggnaden av ett GPI-ankare. (2p)";"cellmembran";"";"Beskriv uppbyggnaden av ett GPI-ankare. (2p)";"En GPI-ankare består av 3 olika molekyler bundna till varandra, den innersta delen fäster till cellmembranet och den yttersta delen binder till tex. en kolhydrat."
"2022-01-29";"26";"Redogör för mekanismen hos ATP-syntas i mitokondriens innermembran. Max 150 ord. (2p)";"elektrontransportkedjan";"";"Redogör för mekanismen hos ATP-syntas i mitokondriens innermembran. Max 150 ord. (2p)";"ATP-syntas funktion är att utnyttja den elektrokemiska gradienten som skapats av de protonpumpande komplexen i ETK, för att omvandla vätejoners rörelseenergi till kemisk bidningsenergi mellan fosfatgrupperna i ATP. Detta sker genom att vätejoner som strävar efter att ta sig från mmu genom innermembranet till matrix för att jämna ut gradienten åker in och neutraliserar en halvkanal i F0s c-ring, som roterar ett steg för varje vätejon som binder in. (När vätejonen åkt ett helt varv släpps den ut i matrix.) Rörelseenergin som skapas av rotationen i c-ringen leds genom den roterande gammasjälken till F1-enheten som finns i matrix och inducerar konformationsändringar i dess subenheter. ADP + Pi binder in i B-subeneheterna under Loose state, binds samman under Tense state och släpps ut som ATP under Open state."
"2022-01-29";"12";"Vilket/vilka av följande alternativ beskriver en funktion för poly-A svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid B: Skyddar mot felaktig splicing C: Samverkar med 5'-cap för att stimulera translation D: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan";"rna-syntes";"";"Vilket/vilka av följande alternativ beskriver en funktion för poly-A svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid B: Skyddar mot felaktig splicing C: Samverkar med 5'-cap för att stimulera translation D: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan";"Rätt svar 1. A 2. C"
"2022-01-29";"27";"Vilka är de två viktigaste transportörerna av kväve från kroppens vävnader till levern, och via vilka två andra molekyler kommer de två kväveatomerna, som slutligen hamnar i urea, föras in i ureacykelns cykliska del? (2p)";"aminosyrametabolism";"";"Vilka är de två viktigaste transportörerna av kväve från kroppens vävnader till levern, och via vilka två andra molekyler kommer de två kväveatomerna, som slutligen hamnar i urea, föras in i ureacykelns cykliska del? (2p)";"De två viktigate transportörerna av kväve från kroppen vävnader är alanin och asparagin. Kväveatomerna hamnar i urea cykeln genom glutamat, vars kvävegrupp reagerar med koldioxid och bildar karbamoyl som sedan reagerar och bildar citrulin. Och asparaginsyra som i nästa steg lämnar av sin kvävegrupp till citrulin som då bildar argininsuccinat."
"2022-01-29";"13";"Which protein is often required to initiate transcription by a bacterial RNA polymerase? How does it mediate initiation?/Vilket protein behövs ofta för att initiera transkription av bakteriellt RNA-polymeras? Hur underlättar det initieringen? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska.";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"";"Which protein is often required to initiate transcription by a bacterial RNA polymerase? How does it mediate initiation?/Vilket protein behövs ofta för att initiera transkription av bakteriellt RNA-polymeras? Hur underlättar det initieringen? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska.";"Proteinet CAP behövs för att binda in cAMP för att aktivera RNA-polymeraset, så att det sedan kan hitta fram till promotorn och där starta transkriptionen."
"2022-01-29";"17";"Alexandra and Bill were the finalists of the Swedish Thermodynamics championship quiz. In a crucial tie-breaker, they were asked to say something about exergonic and endergonic reactions. Alexandra said: In an exergonic reaction, energy is released from the system to the surroundings. Bill said: In an endergonic reaction, ∆G is negative./Alexandra och Bill var finalister i Sveriges termodynamiska mästerskapsquiz. I en utslagsfråga blev de ombedda att säga något om exergona och endergona reaktioner. Alexandra sa: ”I en exergon reaktion avges energi från systemet till omgivningen”. Bill sa: ”I en endergon reaktion är ∆G negativt.” (1p) Välj ett alternativ: A: Both Alexandra and Bill are correct./Både Alexandra och Bill har rätt. B: Only Alexandra is correct./Enbart Alexandra har rätt. C: Only Bill is correct./Enbart Bill har rätt D: Both Alexandra and Bill are wrong./Både Alexandra och Bill har fel.";"termodynamik";"";"Alexandra and Bill were the finalists of the Swedish Thermodynamics championship quiz. In a crucial tie-breaker, they were asked to say something about exergonic and endergonic reactions. Alexandra said: In an exergonic reaction, energy is released from the system to the surroundings. Bill said: In an endergonic reaction, ∆G is negative./Alexandra och Bill var finalister i Sveriges termodynamiska mästerskapsquiz. I en utslagsfråga blev de ombedda att säga något om exergona och endergona reaktioner. Alexandra sa: ”I en exergon reaktion avges energi från systemet till omgivningen”. Bill sa: ”I en endergon reaktion är ∆G negativt.” (1p) Välj ett alternativ: A: Both Alexandra and Bill are correct./Både Alexandra och Bill har rätt. B: Only Alexandra is correct./Enbart Alexandra har rätt. C: Only Bill is correct./Enbart Bill har rätt D: Both Alexandra and Bill are wrong./Både Alexandra och Bill har fel.";"Rätt svar 1. B"
"2022-01-29";"23";"Vad gör proteinet glykogenin och vilken viktig roll spelar enzymet i relation till glykogenmetabolism? (2p)";"glykogen";"";"Vad gör proteinet glykogenin och vilken viktig roll spelar enzymet i relation till glykogenmetabolism? (2p)";"Glykogenin är ett protein som fungerar som en primer i glykogensyntesen. Det har en enzymaktivitet som fäster några glukos-enheter på sig själv för att utgöra en primer som glykogensyntataset kan syntetisera vidare på. Utan glykogenin skulle inte glykogensyntaset ha någon reducerad ände att starta sin glykogensyntes ifrån och vi skulle därmed inte kunna få någon glykogensyntes."
"2022-01-29";"33";"Rangordna molekylerna vatten, leucin, glukos och kväveoxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den molekyl som har lättast att passera. Ange två egenskaper hos varje molekyl av betydelse för deras placering i listan. (2p)";"transport-över-cellmembran";"";"Rangordna molekylerna vatten, leucin, glukos och kväveoxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den molekyl som har lättast att passera. Ange två egenskaper hos varje molekyl av betydelse för deras placering i listan. (2p)";"Vatten - liten, oladdad molekyl Glukos - hydrofob, relativt stor molekyl Leucin - oladdad, hydrofil ""kropp"" (alltså NH3+ och COO-, inte R-kedjan) Kväveoxid - laddad, hydrofil"
"2022-01-29";"24";"Redogör för vilket sätt arsenikförgiftning påverkar metabolismen och vad som kan göras för att häva förgiftningen. Max 150 ord. (2p)";"integrering-av-metabolismen";"";"Redogör för vilket sätt arsenikförgiftning påverkar metabolismen och vad som kan göras för att häva förgiftningen. Max 150 ord. (2p)";"Arsenikförgiftning hämmar natrium/kalium-pumpen vilket förstör gradienterna. Pumpen upprätthåller gradienter över membranet som annars skulle utjämnas av jonkanalerna. Cellen är beroende av gradienten för att upprätthålla vissa reaktioner i cellen och transporter över cellmembranet. Bl.a. så utnyttjas den uppbyggda kaliumgradienten för att aktivit (sekundär aktiv transport) transportera glukos in i cellen genom att kalium som transporteras med sin gradient drar med sig glukosmolekylen mot sin gradient in i cellen."
"2022-01-29";"10";"Explain how proofreading works at the molecular level during bacterial replication./Förklara hur korrekturläsning fungerar på molekylär nivå under bakteriell replikation. (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska.";"dna-replikation";"";"Explain how proofreading works at the molecular level during bacterial replication./Förklara hur korrekturläsning fungerar på molekylär nivå under bakteriell replikation. (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska.";"DNA-polymeras 3 har både en DNA-syntetiserande del och en exonukleas del, detta gör det möjligt för polymeraset att ""backtracka"" om den skulle upptäcka att något basparat fel. Detta gör den genom sin exonukleas-aktivitet där den klyver peptidbidningar (genom att backa) 3´ till 5´. När den klyvt bort den/de felparade baserna syntetiserar den nya baser 5´ till 3´ och fortsätter som vanligt. DNA-polymeras 1 vars funktion är att klippa bort RNA-primer och syntetisera nya baser i gapsen har samma exonukleasa funktion (3´ till 5´ radering) för att korrigera den korta del den nyligen syntetiserat om ett fel skulle upptäckas."
"2022-01-29";"9";"Discuss the evolutionary origin of RNase P. This question needs to be answered in English. (Max 100 words.) (2p)";"evolution";"";"Discuss the evolutionary origin of RNase P. This question needs to be answered in English. (Max 100 words.) (2p)";"The RNaseP is an enzyme consisting of both RNA and protein. By comparing the level of protein in different organisms we can see that in less complex organisms like bacteria the enzyme consists of most RNA and only one protein unit, comparing with ""arkener"" which is a more complex organism there is shorter/smaller RNA unit and more protein units. In even more complex organisms like humans the protein units are much greater than the RNA-unit. This provens the hypothesis that RNA also acted as enzymes long time ago, before ""the tasks were split"" to proteins to be more efficient."
"2022-01-29";"34";"I vilken ordning genomförs nedanstående steg när plasmider ska renas? (1p) Eluera plasmiderna från kolumnen Lysera cellerna Neutralisera lysatet Pelletera cellkulturen som växt under natten";"plasmid";"";"I vilken ordning genomförs nedanstående steg när plasmider ska renas? (1p) Eluera plasmiderna från kolumnen Lysera cellerna Neutralisera lysatet Pelletera cellkulturen som växt under natten";"1. Pelletera cellkulturen som växt under natten 2. Lysera cellerna 3. Neutralisera lysatet 4. Eluera plasmiderna från kolumnen"
"2022-01-29";"14";"Vad är intron och exon? (2p)";"rna-syntes";"";"Vad är intron och exon? (2p)";"Intron och exon är båda en del av den transkriberade omogna RNA-kedjan. För att skapa ett moget mRNA klipps introner (""onödiga"" RNA-sekvenser) bort genom splicing. Medan de sekvenser som krävs för transaltion utgör den mogna RNA-kedjan och används som mall i proteinsyntesen. Det finns flera exon på samma mRNA kedja, vissa exon kan också klippas bort för att samma gen kan koda för olika protein. Vilket protein som uttryck styrs av miljön i cellen och beror alltså på vilka exon som sparas."
"2022-01-29";"20";"Vilket/vilka av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan positiva laddningar. B: När en fosfatgrupp avges kan ADP resonansstabiliseras. C: När en fosfatgrupp frigörs ökar entropin. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i GTP.";"introduktion-till-metabolismen";"";"Vilket/vilka av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan positiva laddningar. B: När en fosfatgrupp avges kan ADP resonansstabiliseras. C: När en fosfatgrupp frigörs ökar entropin. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i GTP.";"Rätt svar 1. C 2. D"
"2022-01-29";"30";"Syntes av heme beror på cellens tillgång till järn. Beskriv vad som sker när järntillgången är låg. (2p)";"heme";"";"Syntes av heme beror på cellens tillgång till järn. Beskriv vad som sker när järntillgången är låg. (2p)";"På mRNA som används som mall för att syntetisera ALA-syntetaset som behövs vid hemsyntes finns den reglerande sekvensen IRE, Ire Respossible Element. När järntillgången är låg binder IRP, IRE-binding protein, till IRE vilket hämmar translationen av det nödvändiga enzymet ALA-syntas. Detta inhiberar hemsyntesen, vilket är syftet eftersom vi inte har något järn."
"2022-01-29";"15";"What regions of a tRNA are recognized by amino-acyl-tRNA synthetases?/Vilka regioner hos tRNA känns igen av amino-acyl-rRNA syntetaser? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska.";"translation";"";"What regions of a tRNA are recognized by amino-acyl-tRNA synthetases?/Vilka regioner hos tRNA känns igen av amino-acyl-rRNA syntetaser? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska.";"OH-gruppen på 3´änden Den specifika nukleotidsekvensen näst längst ut på 3´änden"
"2022-01-29";"21";"Vilken av nedanstående metaboliter är mest reducerad? (1p) Välj ett alternativ: A: Pyruvat B: 3-fosfoglycerat C: Citrat D: Fruktos 6-fosfat";"introduktion-till-metabolismen";"";"Vilken av nedanstående metaboliter är mest reducerad? (1p) Välj ett alternativ: A: Pyruvat B: 3-fosfoglycerat C: Citrat D: Fruktos 6-fosfat";"Rätt svar 1. D"
"2022-01-29";"31";"Vilket av följande påståenden är helt korrekt avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom transkriptionsfaktorn SRE-1. Ökad SRE-1 signalering leder till ökat uttryck av proteinet CETP, som defosforylerar HMGR och gör det inaktivt. B: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom halten av kolesterol i blodet. Hög halt leder till att den intracellulära koncentrationen ökar genom passivt upptag. C: Endast några få celltyper i kroppen (exempelvis hepatocyter) har förmåga att syntetisera kolesterol. Övriga celltyper är helt beroende av tillförsel av kolesterol utifrån, via blodet. Kolesterol tas upp av dessa celler genom transportproteinet CETP. D: Transkriptionsfaktorn SREBP-2 är viktig för relgering av kolesterolsyntesens hastighet. SREBP-2 aktiveras genom att proteinet transporteras från det endoplasmatiska nätverket till Golgiapparaten, där transkriptionsfaktordelen klyvs av.";"kolesterol";"";"Vilket av följande påståenden är helt korrekt avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom transkriptionsfaktorn SRE-1. Ökad SRE-1 signalering leder till ökat uttryck av proteinet CETP, som defosforylerar HMGR och gör det inaktivt. B: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom halten av kolesterol i blodet. Hög halt leder till att den intracellulära koncentrationen ökar genom passivt upptag. C: Endast några få celltyper i kroppen (exempelvis hepatocyter) har förmåga att syntetisera kolesterol. Övriga celltyper är helt beroende av tillförsel av kolesterol utifrån, via blodet. Kolesterol tas upp av dessa celler genom transportproteinet CETP. D: Transkriptionsfaktorn SREBP-2 är viktig för relgering av kolesterolsyntesens hastighet. SREBP-2 aktiveras genom att proteinet transporteras från det endoplasmatiska nätverket till Golgiapparaten, där transkriptionsfaktordelen klyvs av.";"Rätt svar 1. D"
"2022-01-29";"25";"Vilken/vilka av nedanstående produceras vid beta-oxidation? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Pyruvat B: Acetyl-CoA C: Malonyl-CoA D: Acetoacetat E: Oxaloacetat";"betaoxidation";"";"Vilken/vilka av nedanstående produceras vid beta-oxidation? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Pyruvat B: Acetyl-CoA C: Malonyl-CoA D: Acetoacetat E: Oxaloacetat";"Rätt svar 1. B"
"2022-01-29";"11";"Vilken roll spelar Mediatorn vid transkriptionell aktivering? (2p)";"rna-syntes";"";"Vilken roll spelar Mediatorn vid transkriptionell aktivering? (2p)";"Mediatorn fungerar som en sambandscentral mellan enhancern (och dess aktivatorprotein) och promotorsekvensen, enhancern ligger ca 1000 baspar bort, men påverkar transkriptionen för sin specifika gen."
"2022-01-29";"8";"Du träffar en patient som du misstänker har drabbats av HIV. Du kommer att använda en Indirekt ELISA för att ta reda på detta. (Max 150 ord.) (2p) A) Beskriv de olika stegen för en Indirekt ELISA. B) Detekterar denna metod patientens antikropp eller antigen?";"utforska-proteiner";"";"Du träffar en patient som du misstänker har drabbats av HIV. Du kommer att använda en Indirekt ELISA för att ta reda på detta. (Max 150 ord.) (2p) A) Beskriv de olika stegen för en Indirekt ELISA. B) Detekterar denna metod patientens antikropp eller antigen?";"A. Ett specifikt antigen fästs i en brunn, patientens prov tillsätts, sköljning genomförs för att sortera bort de antikroppar som inte fäst till antigenet, ytterligare en antikropp tillsätts som binder till den första antikroppen, färg som binder till den andra antikroppen tillsätts, provet färgas om antikroppen är detekterad. B. Antikropp"
"2022-01-29";"35";"Du arbetar på en vårdcentral där du förvånas över att många patienter med njursvikt (=dålig njurfunktion) tidigare har haft gikt (”portvinstå”). Du bestämmer dig därför för att undersöka om patienter med gikt löper en högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. Vilken av nedanstående är den mest rimliga nollhypotesen? (1p) Välj ett alternativ: A: Patienter med gikt har högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. B: Patienter med gikt har samma risk att utveckla njursvikt som patienter utan gikt. C: Det finns en skillnad i risken att utveckla njursvikt mellan giktpatienter och patienter utan gikt. D: Patienter med gikt har lägre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt.";"introduktionslaboration";"";"Du arbetar på en vårdcentral där du förvånas över att många patienter med njursvikt (=dålig njurfunktion) tidigare har haft gikt (”portvinstå”). Du bestämmer dig därför för att undersöka om patienter med gikt löper en högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. Vilken av nedanstående är den mest rimliga nollhypotesen? (1p) Välj ett alternativ: A: Patienter med gikt har högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. B: Patienter med gikt har samma risk att utveckla njursvikt som patienter utan gikt. C: Det finns en skillnad i risken att utveckla njursvikt mellan giktpatienter och patienter utan gikt. D: Patienter med gikt har lägre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt.";"B"
"2022-01-29";"3";"Fråga 3 Diskutera molekylära likheter och skillnader mellan mekanismerna bakom galaktosemi och laktosintolerans. (2p)";"kolhydrater";"";"Fråga 3 Diskutera molekylära likheter och skillnader mellan mekanismerna bakom galaktosemi och laktosintolerans. (2p)";"Laktos är en molekyl som består av glukos och galaktos. Båda sjukdommarna beror på brist av enzymet som bryter ned den specifika molekylen. I laktosintolerans handlar det om enzymet laktas som spjälkar laktos till galaktos och glukos, medan det i galaktosemi handlar om enzymet som omvandlar galaktos till glukos. Vid obehandlad galaktosemi ansamlas galaktos, vilket leder till att galaktos går ut i blodet och omvandlas till den toxiska molekylen galaktitol, vilket är mycket farligt. Vid obehandlad laktos bryts inte laktosmolekylen ned i tunntarmen som kroppen annars hade gjort, utan den fortsätter genom magtarmkanalen tills den hamnar i tjocktramen där den fermenteras av bakterier, vilket leder till gasbildning och buksmärtor. Ometaboliserad laktos blir alltså inte toxiskt som galaktos(--> galaktitol). Den vanligaste behandlingen för båda intoleranserna handlar främst om att utesluta den sjukdomsframkallande molekylen. Båda molekylerna finns i komjölk, vilket alltså ska undvikas. Vid laktosintolerans finns laktosfria mjölkprodukter, det finns däremot inte galaktosfria mjölkprodukter."
"2022-01-29";"7";"En allvarlig komplikation till bl.a. Covid-19 är så kallad Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS), vilket ger en gravt sviktande lungfunktion orsakad av inflammation och vätskeansamling (ödem) i alveolerna. Ödemet leder till att mindre syre når blodet och att mindre koldioxid lämnar blodet. Beskriv i detalj hur den minskade mängden syre och den ökade mängden koldioxid påverkar hemoglobinets struktur och funktion. (2p)";"hemoglobin";"";"En allvarlig komplikation till bl.a. Covid-19 är så kallad Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS), vilket ger en gravt sviktande lungfunktion orsakad av inflammation och vätskeansamling (ödem) i alveolerna. Ödemet leder till att mindre syre når blodet och att mindre koldioxid lämnar blodet. Beskriv i detalj hur den minskade mängden syre och den ökade mängden koldioxid påverkar hemoglobinets struktur och funktion. (2p)";"Den ökande mängden koldioxid stabiliserar T-state, deoxy-formen, av hemoglobin vilket minskar hemoglobinets affinitet för syre och gör det svårare för syremolekylen att binda in. Detta sker bl.a. genom att koldioxid binder i till hemoglobins ena peptidände, vilket gör det möjligt för saltbryggor att återskapas vilket stabiliserar T-state (tense state). Ökad mängd koldioxid innebär även lägre PH i blodet, dvs. ökad mängd vätejoner - vilka kan binda in till hemoglobin och de möjliggör också återskapandet av saltbryggor för hemoglobinet. Vid lungorna ska normalt sett den höga syrehalten och det högre PHt leda till att koldioxidet och vätejoner släpper, för att destabilisera T-state. När syrehalten är låg är PH i blodet vid lungorna något lägre än normalt vilket gör det svårare för denna reaktion att ske. Syrehalten ska också bidra till att en syremolekyl initialt binder in till järnet i en subenhet. Eftersom hemoglobin är ett kooperativ av 4 subenheter med 4 hemgrupper leder inbidningen av syre i en enhet till en konformationsändring i de andra subenheterna vilket gör järnemolekylerna mer tillgängliga för syre att binda in till. Detta stimulerar R-state och oxy-formen av hemoglobin. Den låga syrehalten gör ""sannolikheten lägre"" för det första syret att binda in, och konformationsändringen sker då inte. Vanligtvis sker denna växling mellan T- och R-state på så vis att koldioxid konc. är högst i muskler och stimulerar T-state vilket gör att syret släpps av där det behövs. Å andra sidan är koncentrationen syre tillräckligt hög vid lungorna för att stimulera R-state och binda in syre. Dessa konformationsändringar är nödvändiga för ett så effektivt gasutbyte som möjligt och för att syre ska binda och släppa på rätt ställe. När dessa koncentrationer ändras och koldioxidhalten i bloden blir för hög i relation till syrehalten rubbas samspelet mellan dessa konformationsformer och T-state, deoxyformen blir dominerande."
"2022-01-29";"6";"Vilket/vilka av följande påståenden om RNA är korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ryggraden i RNA hålls samman av fosfodiester-bindningar. B: Uracil kan deamineras till cytosin. C: RNA använder kvävebasen uracil istället för tymin. D: Ribonukleotider har en OH-grupp i 1'-position.";"nukleotider";"";"Vilket/vilka av följande påståenden om RNA är korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ryggraden i RNA hålls samman av fosfodiester-bindningar. B: Uracil kan deamineras till cytosin. C: RNA använder kvävebasen uracil istället för tymin. D: Ribonukleotider har en OH-grupp i 1'-position.";"Rätt svar 1. A 2. C"
"2022-01-29";"2";"Fråga 2 Vilket/vilka av nedanstående kan hittas i ett protein? Välj ett eller flera alternativ: A: En alfahelix. B: En hårnålsböj. C: En dubbelhelix. D: En loop.";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Fråga 2 Vilket/vilka av nedanstående kan hittas i ett protein? Välj ett eller flera alternativ: A: En alfahelix. B: En hårnålsböj. C: En dubbelhelix. D: En loop.";"Rätt svar 1. A 2. B 3. D"
"2022-05-16";"28";"I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i följande två nukleotider då dessa bryts ner? (1p) A: AMP B: CMP";"nukleotidnedbrytning";"";"I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i följande två nukleotider då dessa bryts ner? (1p) A: AMP B: CMP";"A: Urat B: Urea"
"2022-05-16";"5";"Rita syredissociationskurvan för hemoglobin och myoglobin. Vilken strukturell skillnad mellan myoglobin och hemoglobin förklarar skillnaden i dissociationskurvorna? (2p) (Max 100 ord)";"hemoglobin";"";"Rita syredissociationskurvan för hemoglobin och myoglobin. Vilken strukturell skillnad mellan myoglobin och hemoglobin förklarar skillnaden i dissociationskurvorna? (2p) (Max 100 ord)";"Myoglobin består av en subenhet och har mycket affinitet för syre. Myoglobin har en mycket brant dissociationskurva. Man kan säga att myoglobin fungerar som en on-off knapp, då den antingen är oxiderad (oxyform) eller deoxiderad (deoxyform). Myoglobin är därför bra för lagring av syre men väldigt dåligt för syretransport. Tillskillnad från myoglobin består hemoglobin av fyra subenheter. Hemoglobin har inte lika brant dissociationskurva, vilket innebär att hemoglobin är lämplig för transport av syre. Hemoglobin blir oxyform i lungorna där syrehalten är stor. I musklerna släpper hemoglobinet sina syre atomer gradvist och till slut blir den deoxyform. ![[Pasted image 20251129234842.png]]"
"2022-05-16";"18";"Vilka två av nedanstående molekyler har sitt ursprung i en B vitamin? A: Coenzym A B: ATP C: Liponsyra D: NADH";"integrering-av-metabolismen";"";"Vilka två av nedanstående molekyler har sitt ursprung i en B vitamin? A: Coenzym A B: ATP C: Liponsyra D: NADH";"Rätt svar 1. A 2. D"
"2022-05-16";"1";"A) Vad är mukopolysackaridos? B) Beskriv den biokemiska bakgrunden för mukopolysackaridos. (2p)";"kolhydrater";"";"A) Vad är mukopolysackaridos? B) Beskriv den biokemiska bakgrunden för mukopolysackaridos. (2p)";"A. Mukopolysackaridos är en sjukdom som innebär att GAG (glukoaminoglukaner) inte kan brytas ner. Då ansamlas GAGs i blodet och kroppens vävnader vilket har negativa konsekvenser på kroppen. B. GAG finns i proteoglykaner och består av repeterande disackarid enheter. Disackariden består av en negativt laddad monosackarid och en annan monosackarid som innehåller en acetylamin grupp (till exempel acetylgalaktosamin). Nedbrytningen av GAG behöver speciella enzymer. När dessa enzymer fungerar inte som de ska bryts GAGs inte ner. Då ansamlas stora mängder av GAG i kroppen."
"2022-05-16";"19";"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzymer att vara verksamma i den processen? (1p) alfaketoglutaratdehydrogenas fosfofruktokinas hexokinas succinatdehydrogenas";"glykolysen";"";"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzymer att vara verksamma i den processen? (1p) alfaketoglutaratdehydrogenas fosfofruktokinas hexokinas succinatdehydrogenas";"1. hexokinas 2. fosfofruktokinas 3. alfaketoglutaratdehydrogenas 4. succinatdehydrogenas"
"2022-05-16";"29";"Ribos-5-fosfat kan bildas på två olika sätt i pentosfosfatvägen. I det ena fallet utnyttjas enbart den icke-oxidativa fasen av denna metabola väg. Vilka två glykolysintermediärer utnyttjas i detta fall för syntesen av ribos-5-fosfat? Ange molekylernas fullständiga namn, inte förkortningar. (1p)";"pentosfosfatvägen";"";"Ribos-5-fosfat kan bildas på två olika sätt i pentosfosfatvägen. I det ena fallet utnyttjas enbart den icke-oxidativa fasen av denna metabola väg. Vilka två glykolysintermediärer utnyttjas i detta fall för syntesen av ribos-5-fosfat? Ange molekylernas fullständiga namn, inte förkortningar. (1p)";"fruktos-6-fosfat och glyceraldehyd-3-fosfat"
"2022-05-16";"4";"Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp som deras R-grupper kan delta i när pH är 7. (1p) Möjliga bindningstyper: kovalent bindning jonbindning van der Waals interaktion vätebindning Aminosyror: Arginin Asparagin Fenylalanin Tyrosin";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp som deras R-grupper kan delta i när pH är 7. (1p) Möjliga bindningstyper: kovalent bindning jonbindning van der Waals interaktion vätebindning Aminosyror: Arginin Asparagin Fenylalanin Tyrosin";"Fenylalanin: van der Waals interaktion Asparagin: vätebindning Arginin: jonbindning Tyrosin: van der Waals interaktion"
"2022-05-16";"16";"Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.05 mM är, och för D-fruktos = 1.5 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (2p)";"enzymer";"";"Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.05 mM är, och för D-fruktos = 1.5 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (2p)";"Km är substratkoncentrationen när enzymhastigheten är hälften av den maximala enzymhastigheten (Vmax/2). Ett lägre Km-värde innebär att enzymet kommer att nå hälften av sin maximala hastigheten vid en mindre substratkoncentration. Om vi jämför Km-värdet för D-glukos och D-fruktos så ser vi att Km-värdet är lägre för D-glukos. Detta innebär att hexokinas kommer att förbruka D-glukos snabbare."
"2022-05-16";"22";"Ange vilka två av följande som är en ketonkropp. (1p) A: Acetyl-CoA B: Aceton C: Adenosin D: Acetoacetat";"betaoxidation";"";"Ange vilka två av följande som är en ketonkropp. (1p) A: Acetyl-CoA B: Aceton C: Adenosin D: Acetoacetat";"Rätt svar 1. B 2. D"
"2022-05-16";"32";"Beskriv hur lipid rafts är uppbyggda. (2p)";"cellmembran";"";"Beskriv hur lipid rafts är uppbyggda. (2p)";"Lipid rafts är uppbyggda av kolesterol, sphingomyelin och glukolipider."
"2022-05-16";"26";"Vilka två av följande aminosyror räknas som rent glukogena? A: Glutamat B: Leucin C: Lysin D: Alanin";"aminosyrametabolism";"";"Vilka två av följande aminosyror räknas som rent glukogena? A: Glutamat B: Leucin C: Lysin D: Alanin";"A och D"
"2022-05-16";"12";"Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: Flap endonuklease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. D: Topoisomeraser har en 5´ till 3´ exonukleas-aktivitet.";"dna-replikation";"";"Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: Flap endonuklease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. D: Topoisomeraser har en 5´ till 3´ exonukleas-aktivitet.";"Rätt svar 1. A 2. B"
"2022-05-16";"27";"Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? A: Ureacykelns delreaktioner sker uteslutande i cytosolen. B: Ureacykeldefekter ger upphov till förhöjda plasmanivåer av ammoniak som är mycket toxiskt för framförallt hjärnan. C: De två kväveatomer som finalt hamnar i urea har förts in i ureacykelns cykliska del via karbamoylfosfat och aspartat. D: Enzymet argininosuccinatlyas utgör den viktigaste regleringspunkten i ureacykeln.";"aminosyrametabolism";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? A: Ureacykelns delreaktioner sker uteslutande i cytosolen. B: Ureacykeldefekter ger upphov till förhöjda plasmanivåer av ammoniak som är mycket toxiskt för framförallt hjärnan. C: De två kväveatomer som finalt hamnar i urea har förts in i ureacykelns cykliska del via karbamoylfosfat och aspartat. D: Enzymet argininosuccinatlyas utgör den viktigaste regleringspunkten i ureacykeln.";"B och C"
"2022-05-16";"13";"Vilken roll spelar tryptofanrepressorn vid tryptofanoperonet? Hur styrs dess aktivitet av mängden tryptofan? (2p)";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"";"Vilken roll spelar tryptofanrepressorn vid tryptofanoperonet? Hur styrs dess aktivitet av mängden tryptofan? (2p)";"Tryptofanoperonet kodar för enzymer som är essentiella för bildningen av tryptofan. Tryptofanrepressorn binder till operatorn i tryptofanoperonet och hämmar transkriptionen. När en tryptofan molekyl binder sig till tryptofanrepressorn, kommer tryptofanrepressorn att kunna binda till operatorn och hämma transkriptionen av tryptofanoperonet. Vid brist på tryptofan, kommer trymptofanrepressorn inte att vara bunden till några tryptofan molekyler och därmed kommer tryptofanrepressorn att lösna från operatorn och tillåta transkriptionen av tryptofanoperonet. Mycket tryptofan => tryptofanrepressorn binder => Transkriptionen hämmas Lite tryptofan => tryptofanrepressorn lössnar => Transkriptionen stimuleras"
"2022-05-16";"17";"Vilka två av nedanstående påståenden om övergångstillståndet vid en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det ändrar enzymets optimala pH. B: Det tillåter reaktioner att fortgå vid en acceptabel temperatur. C: Det tillåter kemikalier att reagera som annars inte skulle göra det. D: Det tillåter reaktioner att fortskrida snabbare.";"enzymer";"";"Vilka två av nedanstående påståenden om övergångstillståndet vid en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det ändrar enzymets optimala pH. B: Det tillåter reaktioner att fortgå vid en acceptabel temperatur. C: Det tillåter kemikalier att reagera som annars inte skulle göra det. D: Det tillåter reaktioner att fortskrida snabbare.";"Rätt svar 1. A 2. C"
"2022-05-16";"23";"2,4-dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord)";"citronsyracykeln";"";"2,4-dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord)";"2,4-dinitrofenol är en frikopplare, vilket innebär att den förstör protongradienten över mitokondriens inremembran. 2,4-dinitrofenol är en hydrofob molekyl som kan lätt diffundera från mitokondriens intermembranutrymmet till matrix. 2,4-dinitrofenol kan binda till vätejoner och transportera de över mitokondriens inre membran, vilket förstör protongradienter och ger upphov till värme. Protongradienten behövs för att producera ATP. När protongradienter förstörs kommer cellen att bryta mer fettsyror ner för att upprätthålla gradienter. Detta gör att upptag av 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning, då kroppen bryter ner en stor mängd av fett. Vilka två av nedanstående enzymer katalyserar en dekarboxylering? Isocitratdehydrogenas Alfaketoglutaratdehydrogenas Malatdehydrogenas Succinatdehydrogenas"
"2022-05-16";"33";"Proteinet på bilden transporterar glukos och Na⁺ från tarmen in i epitelceller. A) Vilken typ av transportör är det? B) Vilken typ av transport sker för glukos? C) Vilken är drivkraften bakom transporten av glukos? (Max 75 ord) ![[Pasted image 20251128083857.png]]";"transport-över-cellmembran";"";"Proteinet på bilden transporterar glukos och Na⁺ från tarmen in i epitelceller. A) Vilken typ av transportör är det? B) Vilken typ av transport sker för glukos? C) Vilken är drivkraften bakom transporten av glukos? (Max 75 ord) ![[Pasted image 20251128083857.png]]";"A. Symport B. Sekundär-aktivtransport C. Vid sekundär-aktivtransport används en molekyl koncentrationsgradient för att transportera en annan molekyl mot sin koncentrationsgradient. Vid transport av glukos används Na jonernas koncentrationsgradient som drivkraften. Det är termodynamiskt fördelaktigt att transportera Na in i cellen då det sker med koncentrationsgradienten."
"2022-05-16";"24";"2,4 -dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4 -dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord)";"integrering-av-metabolismen";"";"2,4 -dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4 -dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord)";"1.5p av 2: 2,4-dinitrofenol är en frikopplare, vilket innebär att den förstör protongradienten över mitokondriens inremembran. 2,4-dinitrofenol är en hydrofob molekyl som kan lätt diffundera från mitokondriens intermembranutrymmet till matrix. 2,4-dinitrofenol kan binda till vätejoner och transportera de över mitokondriens inre membran, vilket förstör protongradienter och ger upphov till värme. Protongradienten behövs för att producera ATP. När protongradienter förstörs kommer cellen att bryta mer fettsyror ner för att upprätthålla gradienter. Detta gör att upptag av 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning, då kroppen bryter ner en stor mängd av fett. AI: 2,4-Dinitrofenol (DNP) frikopplar oxidativ fosforylering genom att transportera protoner över det inre mitokondriemembranet. När protongradienten kortsluts kan ATP-syntas inte använda energin i elektrontransportkedjan för att bilda ATP. Cellerna svarar genom att öka oxidationen av fett och kolhydrater för att försöka upprätthålla ATP-nivåerna, vilket kraftigt ökar metabolismen och värmeproduktionen. Denna ineffektiva energiomvandling gör att mer bränsle förbrukas per producerad ATP → snabb viktminskning. Den ökade syreförbrukningen och värmeproduktionen kan bli livshotande, eftersom DNP ger hypertermi, acidos och organsvikt vid relativt små doser."
"2022-05-16";"10";"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet.";"rna-syntes";"";"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet.";"Rätt svar 1. A 2. D"
"2022-05-16";"9";"Hur kan en punktmutation i ett intron leda till human sjukdom? (2p) (Max 25 ord).";"rna-syntes";"";"Hur kan en punktmutation i ett intron leda till human sjukdom? (2p) (Max 25 ord).";"Genom att skapa nya splice-sites i intronen som leder till att mRNAt klivs felaktigt, som gör att mRNAt kan koda för fel proteiner."
"2022-05-16";"34";"Förklara kortfattat vad som menas med A) Selektion av antibiotikaresistenta bakterier B) Blåvit screening (2p) Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska.";"plasmid";"";"Förklara kortfattat vad som menas med A) Selektion av antibiotikaresistenta bakterier B) Blåvit screening (2p) Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska.";"A. Selektion av antibiotikaresistenta bakterier innebär att odla bakterier i en miljö med antibiotika. Då kommer bara de bakterier med antibiotikaresistens att överleva, medan de bakterier utan antibiotika resistens kommer att dö ut. Ampicillin är ett exempel av antibiotika som används vid selektion av antibiotikaresistenta bakterier. Genom att använda plasmider som innehåller antibiotikaresistens-gener kommer endast de bakterier som bär på dessa plasmider att överleva i en antibiotikarik miljö. B. Blåvit screening är ett metod att skilja mellan bakterier med plasmider och bakterier utan plasmider. Bakterier med plasmider har en klyvd lac-operon och därför kommer inte de färgas vid addition av x-GAL, då säger man att de är vita kolonier. Bakterier utan plasmider har en fullt fungerande lac-operon och kommer att färgas blått vid addition av x-GAL, då säger man att de är blå kolonier."
"2022-05-16";"14";"Hur är det möjligt för en bakterie att initiera proteinsyntes av flera olika proteiner från enbart ett mRNA-transkript? (2p)";"translation";"";"Hur är det möjligt för en bakterie att initiera proteinsyntes av flera olika proteiner från enbart ett mRNA-transkript? (2p)";"Till skillnad från eukaryouter där mRNAt har endast en startkodon (AUG), har bakterier flera start kodoner inom samma mRNA molekyl. I bakterier har mRNAt ""shine dalgarno"" sekvenser i närhet till startkodonerna AUG. Dessa ""shine dalgarno"" sekvenser känns igen med hjälp av S16 subenheten som i sin tur finns i S30 subenheten av ribosomen (också kallad den lilla subenheten). Detta förklarar hur det är möjligt att initiera proteinsyntes av flera olika proteiner från enbart ett mRNA-transkript i bakterier."
"2022-05-16";"20";"I vilka två vävnader hittar vi framförallt glykogen hos människa, och vilken huvudsakliga funktion har glykogenet i respektive vävnad? (2p)";"glykogen";"";"I vilka två vävnader hittar vi framförallt glykogen hos människa, och vilken huvudsakliga funktion har glykogenet i respektive vävnad? (2p)";"Glykogen finns i muskelvävnad och i levern. Glykogen i levern används för att reglera glukoshalten i blodet. Glykogen bryts ner till glukos-1-fosfat och omvandlas senare till glukos-6-fosfat med hjälp av enzymet fosfoglukomutas. Glukos-6-fosfat kan defosforyliseras till glukos med hjälp av enzymet glukos-6-fosfatas som endast finns i levern. Senare kan glukos molekylerna frisättas från levern till blodet. Muskler saknar enzymet glukos-6-fosfatas vilket innebär att muskler kan inte skapa glukos och frisätta det i blodet. Glykogenet i muskler används därför som energireserv, genom att brytas ner till glukos-6-fosfat som kan fortsätta i glykolysen och till sist producera ATP."
"2022-05-16";"30";"Vilken typ av bilirubin (konjugerat eller okonjugerat) är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? Förklara varför. (2p)";"heme";"";"Vilken typ av bilirubin (konjugerat eller okonjugerat) är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? Förklara varför. (2p)";"I mjälten bryts hem ner till biliverdin och sedan omvandlas till okonjugerat bilirubin som frisätts i blodet. I levern konjugeras bilirubinet och utsöndras via galla. Konjugeringen sker för att göra den hydrofoba bilirubinet amfipatisk och vattenlöslig. Vid hemolytiska sjukdomar ökar nedbrytningen av röda blodkroppar i mjälten vilket ger upphov till förhöjt koncentration av okonjugerat bilirubin. Om levern inte kan ta hand om de stora koncentrationer av okonjugerat bilirubin i blodet ansamlas okonjugerat bilirubin i stora koncentrationer."
"2022-05-16";"15";"A biologist studying a new bacterial strain identified in Göteborg is interested in the following two new biochemical reactions: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) What does ∆G mean in Thermodynamics? Which of the two reactions is spontaneous and what is the explanation for this? / En biolog som studerar en ny bakteriestam som har identifierats i Göteborg är intresserad av följande biokemiska reaktioner: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) Vad avses med ∆G inom termodynamiken? Vilken av reaktionerna är spontan och vilken är anledningen till det? This question needs to be answered in English. (2p) (Max 100 words)";"termodynamik";"";"A biologist studying a new bacterial strain identified in Göteborg is interested in the following two new biochemical reactions: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) What does ∆G mean in Thermodynamics? Which of the two reactions is spontaneous and what is the explanation for this? / En biolog som studerar en ny bakteriestam som har identifierats i Göteborg är intresserad av följande biokemiska reaktioner: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) Vad avses med ∆G inom termodynamiken? Vilken av reaktionerna är spontan och vilken är anledningen till det? This question needs to be answered in English. (2p) (Max 100 words)";"G (Gibbs free energi) means the change of free energy in the system. Delta-G explains how the free energi in the system change after a specific reaction. Negative delta-G means the reaction is spontaneous, while positive delta-G indicates that the reaction is not spontaneous and is not thermodynamicly favorable. The spontaneous reaction is P + H₂O -> Q + Pi because it has negativ Delta-G."
"2022-05-16";"21";"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (2p) (Max 120 ord) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? C) En typ av reglering av komplexet är av feedforwardtyp. Redogör för vad feedforwardreglering innebär samt vad som ger feedforwardreglering av komplexet och hur.";"integrering-av-metabolismen";"";"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (2p) (Max 120 ord) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? C) En typ av reglering av komplexet är av feedforwardtyp. Redogör för vad feedforwardreglering innebär samt vad som ger feedforwardreglering av komplexet och hur.";"A. Pyruvatdehydrogenaskomplexet är länken mellan glykolysen och citronsyracykeln. Komplexet katalyserar den irreversibla nedbrytningen av pyruvat till koldioxid och acetyl-Coa. B. Komplexet styr en irreversibel reaktion där pyruvat bryts ner till Acetyl-Coa. Acetyl-Coa kan inte användas för återbilda pyruvat och därför måste den användas i andra metabola vägar. Därför är enormt viktigt att reglera komplexet för att inte slösa pyruvat onödigt. C. Feedforwardreglering innebär att substraten i en reaktion stimulerar enzymet som katalyserar denna reaktion. Pyruvat ger feedforwardreglering av pyruvatdehydrogenaskomplexet, då ökade koncentrationen av pyruvat leder till att komplexet stimuleras. Då bryts pyruvat till Acetyl-Coa för att minska koncentrationen av pyruvat."
"2022-05-16";"31";"Beskriv kortfattat två huvudsakliga mekanismer för hur cellens intracellulära kolesterolkoncentration regleras. (2p)";"kolesterol";"";"Beskriv kortfattat två huvudsakliga mekanismer för hur cellens intracellulära kolesterolkoncentration regleras. (2p)";"1. Transkriptionen av HMGR kan regleras. Vid låg halt av kolesterol kommer Insig-proteinet att lössna från scap-SREBP komplexet i ER, vilket gör att scap-SREBP transporteras till golgia apparaten med hjälp av COPII. SREBP bryts ner av enzymerna S1P och S2P, vilket gör att den N-terminala delen av SREBP frigörs till cellkärnan. I cellkärnan kan den N-terminala delen av SREBP binda till SRE-1, vilket bland annat ökar transkriptionen av enzymet HMGR. HMGR katalyserar första steget i kolesterolsyntesen där HMG omvandlas till mevalonat. 2. Translationen av HMGR-mRNAt kan regleras med hjälp av oxylanesterol-halten i cellen. En hög halt oxylanesterol (orsakad av hög halt av kolesterol) leder till att mindre polysomer binder till HMGR-mRNAt, vilket leder till mindre translation av HMGR. Å andra sidan kommer en låg oxylanesterol-halt (orsakad av låg halt av kolesterol) i cellen att leda till att fler polysomer binder sig till HMGR-mRNAt, då translateras fler HMGR som stimulerar kolesterolsyntes."
"2022-05-16";"25";"A. Vad innebär redoxpotential? B. Ge två exempel på redoxpar som förekommer i elektrontransportkedjan. (2p) (Max 75 ord)";"elektrontransportkedjan";"";"A. Vad innebär redoxpotential? B. Ge två exempel på redoxpar som förekommer i elektrontransportkedjan. (2p) (Max 75 ord)";"A. Redoxpotential innebär ett molekyls förmåga att ta upp elektroner. Hög redoxpotential innebär att molekylen har stor affinitet till elektroner (molekylen vill ta upp mer elektroner), medan låg redoxpotential innebär att molekylen har låg affinitet till elektroner (molekylen vill avge sina elektroner). B. Ubiquiton (Q) och Ubiquinol (QH₂). QH₂ har lägre redoxpotential än Q, då QH₂ vill avge sina två elektroner. FADH₂ och FAD är ett annat redoxpar i elektrontransportkedjan."
"2022-05-16";"11";"Vilka två av följande påståenden om histoner är korrekta? A: I kromatin ingår endast DNA, ej proteiner. B: I en nukleosom är ~146 bp av DNA lindat kring en kärna av åtta histonproteiner. C: Acetylering av histonsvansar kan neutralisera positiva laddningar. D: Med begreppet histonkod avses DNA-sekvensen hos histongener.";"kromatin";"";"Vilka två av följande påståenden om histoner är korrekta? A: I kromatin ingår endast DNA, ej proteiner. B: I en nukleosom är ~146 bp av DNA lindat kring en kärna av åtta histonproteiner. C: Acetylering av histonsvansar kan neutralisera positiva laddningar. D: Med begreppet histonkod avses DNA-sekvensen hos histongener.";"Rätt svar 1. B 2. C"
"2022-05-16";"8";"Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p)";"evolution";"";"Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p)";"Endosymbios är en teori som förklarar mitokondriens uppkomst i eukaryota celler. Teorin går ut på att en stor anaerob eukaryotcell har endocyterat en aerob bakterie. Den eukaryota cellen och bakterien lever i symbios, där den eukaryota cellen försörjer bakterien med metaboliter medan bakterien utför aerob metabolism åt den eukaryotacellen. Bakterien har senare utvecklats till mitokondrie. En bevis på att endosymbios teorin stämmer är att mitokondrier har egna DNA."
"2022-05-16";"35";"Du vill sätta upp en studie för att ta reda på hur lång tid det tar för blod att koagulera hos friska individer. Du vill få ett relativt litet standardfel (SE) för att känna att du har lyckats få en bra skattning av hur lång tid det brukar ta för blod att koagulera. SE kan härledas fram med hjälp av två parametrar. Vilka är parametrarna och hur ska de se ut om du vill få ett litet värde på SE? (2p) (Max 50 ord.)";"introduktionslaboration";"";"Du vill sätta upp en studie för att ta reda på hur lång tid det tar för blod att koagulera hos friska individer. Du vill få ett relativt litet standardfel (SE) för att känna att du har lyckats få en bra skattning av hur lång tid det brukar ta för blod att koagulera. SE kan härledas fram med hjälp av två parametrar. Vilka är parametrarna och hur ska de se ut om du vill få ett litet värde på SE? (2p) (Max 50 ord.)";"1- Ju större antal individer som försöket utförs på desto lägre SE. 2- Ju mer lika dessa individers egenskaper är (ålder, kön, hälsa, kost mm.) desto lägre SE."
"2022-05-16";"3";"När protoner transporteras över mitokondriens inre membran genom ATPsyntas spelar specifika aminosyror en viktig roll. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar protontransporten behöver ha och vad som möjliggör protontransporten. Ge även ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (2p) (Max 100 ord)";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"När protoner transporteras över mitokondriens inre membran genom ATPsyntas spelar specifika aminosyror en viktig roll. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar protontransporten behöver ha och vad som möjliggör protontransporten. Ge även ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (2p) (Max 100 ord)";"ATPsyntasets transmembranella del (F0) ansvarar för transporten av protoner över mitokondriens inre membran. F0 innehåller en roterande c-ring som består av 10 c-subenheter samt en a-subenhet som protoniserar och deprotoniserar c-subenheterna. När en c-subenhet protoniseras, nutraliseras ett negativt laddat aminosyra i c-subenheten, vilket leder till en konformationsändring som tillåter c-ringen att rotera. En protoniserad c-subenhet roterar en varv runt c-ringen innan den släpper sin proton, då blir aminosyran negativt laddad som i början. Exempel på ett negativt laddad aminosyra: Aspartat"
"2022-05-16";"7";"Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p)";"nukleotider";"";"Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p)";"Endosymbios är en teori som förklarar mitokondriens uppkomst i eukaryota celler. Teorin går ut på att en stor anaerob eukaryotcell har endocyterat en aerob bakterie. Den eukaryota cellen och bakterien lever i symbios, där den eukaryota cellen försörjer bakterien med metaboliter medan bakterien utför aerob metabolism åt den eukaryotacellen. Bakterien har senare utvecklats till mitokondrie. En bevis på att endosymbios teorin stämmer är att mitokondrier har egna DNA. A. Hur skiljer sig endonukleaser från exonukleaser? B. Skriv det fullständiga namnet för dADP? (2p) A. Endonukleaser klipper nukleinsyror från mitten, medan exonukleaser klipper nukleinsyror från ändarna (antingen från 3' till 5' riktning eller från 5' till 3'). Detta utförs genom att bryta fosfodiesterbindningen mellan nukleotiderna. B. Deoxyadinosindifosfat"
"2022-05-16";"6";"Du har fått i uppgift att preparera fram ett protein ur ett homogenisat och du kommer använda tre olika metoder för detta. Beskriv varje metod kortfattat samt ange vilken proteinegenskap som används för separationen (2p) (Max 200 ord) A. Gelfiltrering B. Jonbyteskromatografi C. Affinitetskromatografi";"utforska-proteiner";"";"Du har fått i uppgift att preparera fram ett protein ur ett homogenisat och du kommer använda tre olika metoder för detta. Beskriv varje metod kortfattat samt ange vilken proteinegenskap som används för separationen (2p) (Max 200 ord) A. Gelfiltrering B. Jonbyteskromatografi C. Affinitetskromatografi";"A. Vid gelfiltrering består den fasta fasen av kulor med håligheter. Vid gelfiltrering filtreras proteinerna storleksmässigt, där små proteiner binder till kulorna medan de stora proteiner fortsätter vidare genom kolumnen. Därför kommer protienerna med störst massa först ut, och proteinerna med låg massa hamnar sist i filtreringen. B. Jonbyteskromatografi filtrerar protiener beroende på laddning. De finns två typer av jonbyteskromatografi. Första typen är anjonsbytare, där proteinerna med positiv laddning kommer ut först. Andra typen är katjonsbytare där jonerna med negativ laddning kommer ut först. Den fasta fasen består av kulor med antingen negativ eller positiv laddning som kan fästa till de laddade proteinerna med hjälp av jonbindningar. C. Affinitetskromatografi är en filtreringsmetod som är baserad på att filtrera protiener med hjälp av en speciell egenskap hos proteinerna. Till exempel kan proteinernas glykolysering användas för att filtrera protienerna."
"2022-05-16";"2";"Nya regler från EU ska se till att minimera mängden transfetter i livsmedel. Vilka två påståenden stämmer om transfetter? (1p) A: Transfetter kan i regel packas tätare än cisfetter och bidrar därmed till minskad fluiditet i cellmembranet. B: Transfetter kan inte brytas ner av kroppens enzymer. C: Transfetter höjer koncentrationen av det ”goda” kolesterolet HDL i blodet. D: Transfetter består av mättade fettsyror.";"lipider";"";"Nya regler från EU ska se till att minimera mängden transfetter i livsmedel. Vilka två påståenden stämmer om transfetter? (1p) A: Transfetter kan i regel packas tätare än cisfetter och bidrar därmed till minskad fluiditet i cellmembranet. B: Transfetter kan inte brytas ner av kroppens enzymer. C: Transfetter höjer koncentrationen av det ”goda” kolesterolet HDL i blodet. D: Transfetter består av mättade fettsyror.";"Rätt svar 1. A 2. B"
"2025-02-01";"28";"Redogör för ett skäl till att man inte kan säga exakt hur många protoner som behöver förflyttas över mitokondriens inre membran för varje ATP som bildas av ATP-syntaset. Förklara också hur protonerna förflyttas i ATP-syntaset. (4p) Max 80 ord.";"elektrontransportkedjan";"";"Redogör för ett skäl till att man inte kan säga exakt hur många protoner som behöver förflyttas över mitokondriens inre membran för varje ATP som bildas av ATP-syntaset. Förklara också hur protonerna förflyttas i ATP-syntaset. (4p) Max 80 ord.";"3.5 av 4 poäng C-ringen är bunden till ATP-syntasets matrix del via en gamma stjälk. Inre delen består av 6 subenheter, 3 beta och 3 alfa. Det är beta subenheterna som sköter produktion av ATP då de har 3 konformationer, loose(tar emot ADP+pi), tense (bildar ATP) och open (ATP lämnar). När en proton binder till c-subenhet neutraliserar det en negativladdad aa --> c ringen roterar - -> gamma-stjälken + b-subenheter roterar-->ATP-produktion. -Svårt att säga exakt atntal H+ eftersom frikopplare utjämnar gradienten utan att tillverka ATP. Ord: 80 Totalpoäng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen AI-rättning 1. Det korrekta skälet: antalet c-subenheter varierar mellan arter C-ringen i ATP-syntas har olika antal c-subenheter (t.ex. 815). Varje subenhet kräver 1 H⁺ per 360° rotation. Därför varierar H⁺/ATP mellan organismer. Det är detta examinatorerna är ute efter. 2. Övriga faktorer som påverkar (godkända som komplettering): Protonläckage (inkl. UCP/frikopplare). Energiåtgång för fosfattransport och ADP/ATP-translokas."
"2025-02-01";"5";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av HIV. (4p) Max 200 ord. (Lista AB i ditt svar nedan!) A) Nämn en analysmetod som kan användas för att undersöka detta samt beskriv de olika stegen i metoden. B) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod?";"utforska-proteiner";"";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av HIV. (4p) Max 200 ord. (Lista AB i ditt svar nedan!) A) Nämn en analysmetod som kan användas för att undersöka detta samt beskriv de olika stegen i metoden. B) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod?";"a) För att undersöka huruvida en patient är smittad av HIV eller inte, kan metoden indirekt ELISA användas. I denna metod har vi först en brunn med HIV-antigener. Prov från patienten tillsätts för att senare kunna se om dess antikroppar binder till antigenerna, och därefter sköljer vi för att undvika att oönskade substanser ska påverka resultatet. Senare tillsätts enzymbundna antikroppar till provet, och sedan sköljer vi igen. Efteråt tillsätts ett substrat som binder till enzymet. Om patienten har antikroppar, kommer patientens antikroppar ha bundit till antigenena och därmed kommer provet att färgas. Om patientens antikroppar inte binder, kommer vi inte få något färgämne, vilket tyder på att patienten inte har antikropparna och har därmed inte HIV. b) antikroppar"
"2025-02-01";"18";"Redogör för begreppet entalpi. Vilka termer/aspekter ingår och hur kan man använda entalpiförändringar för att förutse benägenheten för en viss biokemisk reaktion att ske? (4p)";"termodynamik";"";"Redogör för begreppet entalpi. Vilka termer/aspekter ingår och hur kan man använda entalpiförändringar för att förutse benägenheten för en viss biokemisk reaktion att ske? (4p)";"Elev 1 - 2 av 4 poäng Entalpi är skillnaden mellan produkternas och reaktanternas energi i en reaktion. Om entalpivärdet är positivt, innebär det att reaktionen kommer kräva energitillförsel, då produkterna kommer ha högre energi än reaktanterna. Om entalpivärdet är negativt innebär det att reaktionen kan ske spontant då det frigörs energi och det är därmed fördelaktig. Elev 2 - 2 av 4 poäng Entalpi är värme energi, betecknas H. En reaktion mellan x och y, där y har högre entalpi än x är ofördelaktig eller har positiv deltaG för man går från att ha lite energi till att ha mer, vilket innebär att energiförändringen (E2-E1) är negativ --> alltså behöver energi tillföras för att reaktionen ska ske. Om reaktionen skulle vara spontant istället så behöver entalpin hos y vara lägre än X --> deltaG < 0. H = S - T x deltaG AI-rättning: Den riktiga definitionen: H = U + pV. ΔH = värmeutbyte vid konstant tryck. ΔH ensamt räcker inte för spontanitet → måste kopplas till ΔG = ΔH TΔS. Entropi och temperatur som avgörande delar av bedömningen. Biokemisk kontext: bindningsstyrka, värmeutbyte, och hur ΔH vägs mot ΔS för att avgöra om en reaktion går åt rätt håll."
"2025-02-01";"1";"Vilka två påståenden om vätebindningar är korrekta? (2p) A: De stabiliserar primärstrukturen hos proteiner. B: De bildas mellan dipoler. C: Ju rakare bindning, desto svagare. D: Acceptoratomerna har hög elektronegativet.";"kemiska-bindingar";"";"Vilka två påståenden om vätebindningar är korrekta? (2p) A: De stabiliserar primärstrukturen hos proteiner. B: De bildas mellan dipoler. C: Ju rakare bindning, desto svagare. D: Acceptoratomerna har hög elektronegativet.";"B och D"
"2025-02-01";"19";"Fördelen med att mäta den initiala hastigheten V i början av en reaktion är att (välj två av nedanstående): (2p) A: Förändringar i [S] är försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. B: Produktinhibering kan då inte påverka hastigheten. C: Förändringar i Km är försumbara, så Km kan behandlas som en konstant. D: Variationer av [S] har ingen effekt på V₀.";"enzymer";"";"Fördelen med att mäta den initiala hastigheten V i början av en reaktion är att (välj två av nedanstående): (2p) A: Förändringar i [S] är försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. B: Produktinhibering kan då inte påverka hastigheten. C: Förändringar i Km är försumbara, så Km kan behandlas som en konstant. D: Variationer av [S] har ingen effekt på V₀.";"A och B"
"2025-02-01";"29";"Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? (2p) A: Nedsatt funktion av enzymer som verkar i ureacykeln leder till förhöjda plasmanivåer av ammoniak. B: Ureacykeln sker i ibland i muskel när denna vävnad använder sig av aminosyror som energikälla. C: De två kväveatomer som slutligen hamnar i urea har förts in i ureacykeln via karbamoylfosfat och aspartat. D: Ureacykelns huvudsakliga funktion är att omvandla urea, som bildas vid nedbrytning av tex aminosyror, till ammoniak som kan utsöndras med urinen.";"aminosyrametabolism";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? (2p) A: Nedsatt funktion av enzymer som verkar i ureacykeln leder till förhöjda plasmanivåer av ammoniak. B: Ureacykeln sker i ibland i muskel när denna vävnad använder sig av aminosyror som energikälla. C: De två kväveatomer som slutligen hamnar i urea har förts in i ureacykeln via karbamoylfosfat och aspartat. D: Ureacykelns huvudsakliga funktion är att omvandla urea, som bildas vid nedbrytning av tex aminosyror, till ammoniak som kan utsöndras med urinen.";"B och C OBS: Fel i facit, föreläsaren bekräftat att B och C är rätt"
"2025-02-01";"4";"A) Name two allosteric regulators of oxygen binding to hemoglobin. B) Explain an outcome for each regulator. (Max 100 words.) Please answer this question in English. (4p)";"hemoglobin";"";"A) Name two allosteric regulators of oxygen binding to hemoglobin. B) Explain an outcome for each regulator. (Max 100 words.) Please answer this question in English. (4p)";"a) O₂ and CO₂ b) O₂: Hemoglobin has four subunits that bind to O₂ through cooperativity, meaning that if one subunit binds to an O₂, the other subunits' affinity for O₂ will increase, leading to all subunits binding to O₂. When O₂ binds, the state goes from T-state (deoxy; tense) to R-state (oxy; relaxed). CO₂: When CO₂ binds to hemoglobin, the hemoglobin's affinity to oxygen decreases, leading to a stabilization of the T-state instead."
"2025-02-01";"16";"![[Pasted image 20251129235913.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns proteinet? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord.";"transport-över-cellmembran";"";"![[Pasted image 20251129235913.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns proteinet? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord.";"A) ATPaser, specifikt ABCaset. Exempel på aktiv transport. B) Ligger på cellmembranet, transporterar substrat från cytoplasman till ECM. C) ATP hydrolys --> fosfoanhydridbindningar bryts --> energi frigörs, det sker konformationsändringar som växlar mellan att proteinet öppnar mot cytoplasman respektive ECM. Ord: 40 Totalpoäng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen"
"2025-02-01";"22";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glykolysen? (2p) A: När glukos fosforyleras av hexokinas kan produkten enbart användas i glykolysen. B: För varje glukosmolekyl bildas 4 ATP. C: Den sker i cellens cytoplasma. D: Den kräver syre.";"glykolysen";"";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glykolysen? (2p) A: När glukos fosforyleras av hexokinas kan produkten enbart användas i glykolysen. B: För varje glukosmolekyl bildas 4 ATP. C: Den sker i cellens cytoplasma. D: Den kräver syre.";"B och C"
"2025-02-01";"32";"Nämn två metabola vägar som är integrerade med pentosfosfatvägen eftersom de sker i samma del av cellen och har gemensamma intermediärer. (2p) Max 10 ord.";"pentosfosfatvägen";"";"Nämn två metabola vägar som är integrerade med pentosfosfatvägen eftersom de sker i samma del av cellen och har gemensamma intermediärer. (2p) Max 10 ord.";"Glykolysen och glukoneogenesen"
"2025-02-01";"26";"Beskriv hur acetyl-CoA karboxylas regleras. (4p)";"lipider";"";"Beskriv hur acetyl-CoA karboxylas regleras. (4p)";"Elev 1 - 1 av 4 Insulin stimulerar enzymet medan glukagon hämmar. Enzymet är aktivt i dess defosforylerade form, och insulin stimulerar defosforylering. Acetyl-CoA-karboxylas fosforyleras när glukagon är dominerande, och därmed hämmas enzymet av glukagon. Feedforwardreglering av pyruvat där höga mängder pyruvat hämmar och låga mängder stimulerar. Elev 2 - 1 av 4 Acetyl-CoA karboxylas stimuleras av insulin och hämmas av glukagon. Den regleras även av energikvoten där ATP stimulerar och ADP/AMP hämmar. AI-rättning Citrat aktiverar (allosteriskt + polymerisering) Palmitoyl-CoA hämmar (feedback + depolymerisering) AMPK fosforylerar och inaktiverar → energikontroll Polymeriseringstillståndet styr enzymets aktivitet (Insulin/glukagon ska nämnas, men räcker inte ens nära för 4p)"
"2025-02-01";"12";"Vilka två påståenden om RNA-splicing är korrekta? (2p) A: Spliceosomen består av både RNA och proteiner. B: Splicingprocessen sker i cellens cytoplasma. C: Splicing sker endast i prokaryoter. D: En lariatstruktur bildas.";"rna-syntes";"";"Vilka två påståenden om RNA-splicing är korrekta? (2p) A: Spliceosomen består av både RNA och proteiner. B: Splicingprocessen sker i cellens cytoplasma. C: Splicing sker endast i prokaryoter. D: En lariatstruktur bildas.";"A och D"
"2025-02-01";"27";"Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (2p) Börja med lägst redoxpotential: cytokrom c FADH₂ NADH O₂";"elektrontransportkedjan";"";"Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (2p) Börja med lägst redoxpotential: cytokrom c FADH₂ NADH O₂";"A: NADH B: FADH₂ C: cytokrom c D: O₂"
"2025-02-01";"13";"Lac-operonet reglerar nedbrytningen av laktos i bakterier. Vilken roll spelar allolaktos vid lac-operonet, och hur påverkar detta transkriptionen av generna som är inblandade i laktosmetabolismen? (4p)";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"";"Lac-operonet reglerar nedbrytningen av laktos i bakterier. Vilken roll spelar allolaktos vid lac-operonet, och hur påverkar detta transkriptionen av generna som är inblandade i laktosmetabolismen? (4p)";"Allolaktos är en korepressor som binder till repressorn på lac-operonet vid närvaro av laktos. När allolaktos binder, kommer repressorn att flyttas och därmed kommer gener som kodar för enzymer som bryter ner laktos att kunna transkriberas."
"2025-02-01";"17";"Perifera membranproteiner kan vara bundna till cellmembranet på flera olika sätt. Beskriv tre olika varianter. (4p)";"cellmembran";"";"Perifera membranproteiner kan vara bundna till cellmembranet på flera olika sätt. Beskriv tre olika varianter. (4p)";"1. Kan binda mha adhesions molekyler, ex integriner som binder via komponenter i ECM (ex kollagen). 2. GPI ankare. Kan frisättas när som helst vid behov, då den binder perifert till nervcellernas cellmembran. 3. Kan binda till delen av membranproteiner som finns utanför cellmembranet. Exempelvis har alfa helixar en del av sig utanför cellmembranet, kan binda till cellmembranet genom den."
"2025-02-01";"23";"Redogör för hur glukosmetabolismen regleras på hormonell nivå. (4p) Max 150 ord.";"glukosmetabolism";"";"Redogör för hur glukosmetabolismen regleras på hormonell nivå. (4p) Max 150 ord.";"Elev 1 - 3 av 4 poäng Glukagon aktiverar glukoneogenesen, det vill säga återbildning av glukos. Detta då glukagon aktiverar cAMP som fosforylerar PKA. PKA, i sin tur, fosforylerar Fosfofruktokinas 2 (PFK2) /fruktos-2,6-bisfosfatas (FBPase-2). Vid fosforylering kommer PFK2-delen att hämmas, samtidigt som FBPase-2-delen aktiveras. När FBPase-2 är aktivt, kommer fruktos-2,6-bisfosfat att brytas ner. Då fruktos-2,6-bisfosfat är en allosterisk regluator som aktiverar fosfofruktokinas 1 i glykolysen, kommer glykolysen att hämmas då f-2,6-bp kommer att brytas ned. Om insulin är dominerande, kommer det däremot signalera defosforylering som medför att PFK2 blir aktivt och bilda fruktos-2,6-bisfosfat som kan stimulera glykolysen. (Sen tror jag också att även glukokinas i levern regleras hormonellt där insulin aktiverar och glukagon hämmar) Elev 2 - 3 av 4 poäng Insulin: Frisätts när glukos nivåer i blodet höjs. Insulin stimulerar enzymer i glykolysen, mycket glukos --> den behöver metaboliseras och användas till ATP produktion. Insulin hämmar enzymer i glukoneogenesen såsom fruktos-1,6-bisfosfatas. Den gör detta genom att aktivera PKA som i sin tur aktiverar fosfofruktokinas-2, enzym som fosforylerar fruktos-6-fosfat för att omvandlas till fruktos-2,6-bisfosfat. Fruktos-2,6-bisfosfat stimulerar glykolysen och hämmar glukoneogenesen, som jag nämnt innan så inhiberar den fruktos- 1,6-fosfatas. Fosfofruktokinas-1 stimuleras av insulin för att omvandla fruktos-6-fosfat till fruktos-1,6-bisfosfat. Glukagon: Frisätts när glukos nivåer i blodet är låga. Den har motsatt effekt till insulin, den stimulerar glukoneogenesen och hämmar glykolysen. Glukagon verkar mest på levern och stimulerar enzymer i som pyruvatkarboxykinasdehydrogenas som är en del av glukoneogenesen. Adrenalin verkar likt glukagon men mer på skelettmuskulatur. All hormonell reglering sker genom att hormonet binder till 7TM receptorer på cellmembranet --> ATP--> cAMP --> aktivt/inaktivt PKA beroende på om enzymet behöver fosforyleras eller defosforyleras. AI-rättning: Att insulin/glukagon reglerar både glykolys, glukoneogenes och glykogenmetabolism. Att insulin verkar via defosforylering och glukagon via fosforylering kopplat till flera enzym, inte bara PFK-2. Att adrenalin har en tydlig roll i muskel."
"2025-02-01";"33";"Beskriv två huvudsakliga och principiellt olika sätt, på vilka cellen reglerar mängden fritt intracellulärt kolesterol. (4p)";"kolesterol";"";"Beskriv två huvudsakliga och principiellt olika sätt, på vilka cellen reglerar mängden fritt intracellulärt kolesterol. (4p)";"1. Man kan reglera transkriptionen av HMG-CoA reduktas för det är en irreversibel steg i kolesterol syntesen. Om mängden kolesterol ökar så kommer kolesterol binda till scap protein. Denna förhindrar SERBP transkriptionsfaktorn i ER från att transporteras till golgi där den kan binda till en sekvens SRE-1 och transkribera genen för HMG-CoA reduktas. Då kommer mängden HMG-CoA reduktas minska --> mindre kolesterol syntetiseras. Om det är låg kolesterol däremot så kommer insig proteiner vid ER binda till scap så att den inte blockerar SERBP transkriptionsfaktorn från att gå och binda till SRE-1 och starta transkription. 2. Då kolesterol lagras i kolesterolestrat så kommer cellen att bryta loss fettsyran när den har behov för kolesterol. Kolesterolestrarna transporteras först mha lipoproteiner till cellen för att där inne bryta sig loss och bilda fri kolesterol. 3. (extra) Man kan reglerar kolesterol syntes translationellt genom att låta proteiner binda till mRNA under translation för att inhibera den vid höga kolesterolhalter. Kolesterol kan även binda in sig mellan DNA och mRNA för att störa replikation/translation --> inget kolesterol."
"2025-02-01";"24";"Hur skiljer sig glykogenets huvudsakliga funktion i levern från dess funktion i skelettmuskulaturen? Vilket enzym är avgörande för denna skillnad och i vilken av vävnaderna uttrycks det? (4p) Max 50 ord.";"glykogen";"";"Hur skiljer sig glykogenets huvudsakliga funktion i levern från dess funktion i skelettmuskulaturen? Vilket enzym är avgörande för denna skillnad och i vilken av vävnaderna uttrycks det? (4p) Max 50 ord.";"Glykogen i levern används för att upprätthålla stabilt blodsocker. Glykogen i muskler används till ATP eftersom den saknar glukos-6-fosfatas. Glukos bryts som glukos-1-fosfat från glykogen och omvandlas sedan till glukos-6-fosfat(fosfoglukomutas). I levern finns enzymet glukos-6-fosfatas som omvandlar glukos-6-fosfat till glukos men i skelettmuskler metaboliseras glukos-6-fosfat vidare i glykolysen för ATP-produktion."
"2025-02-01";"10";"Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: Histon H1 binder linker-DNA och stabiliserar nukleosomen. B: Kromatin består endast av DNA. C: Acetylering av histoner leder till en mer kondenserad kromatinstruktur. D: Kromatin finns endast i eukaryota celler.";"kromatin";"";"Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: Histon H1 binder linker-DNA och stabiliserar nukleosomen. B: Kromatin består endast av DNA. C: Acetylering av histoner leder till en mer kondenserad kromatinstruktur. D: Kromatin finns endast i eukaryota celler.";"A och D"
"2025-02-01";"9";"Vilka två påståenden om eukaryot DNA-replikation är korrekta? (2p) A: ORC binder till replikationsorigin under hela cellcykeln. B: DNA-syntes initieras i M-fas. C: CMG-komplexet bildas genom bindning av MCM, GINS och Cdc45. D: MCM-helikaset är aktivt under hela cellcykeln.";"dna-replikation";"";"Vilka två påståenden om eukaryot DNA-replikation är korrekta? (2p) A: ORC binder till replikationsorigin under hela cellcykeln. B: DNA-syntes initieras i M-fas. C: CMG-komplexet bildas genom bindning av MCM, GINS och Cdc45. D: MCM-helikaset är aktivt under hela cellcykeln.";"A och C"
"2025-02-01";"34";"Du arbetar som läkare och följer upp hemoglobin (Hb) hos 200 patienter behandlade för järnbrist. Hb följer en normalfördelning med medelvärde 130 g/L och standardavvikelse 10 g/L. Vilka två av följande påståenden är korrekta? (2p) A: Cirka 68% av patienterna har ett Hb mellan 120 och 140 g/L. B: Standardavvikelsen beskriver hur spridda Hb-värdena är kring medelvärdet. C: Cirka 99% av patienterna har ett Hb under 120 g/L. D: Cirka 95% av patienterna har ett Hb mellan 100 och 200 g/L.";"introduktionslaboration";"";"Du arbetar som läkare och följer upp hemoglobin (Hb) hos 200 patienter behandlade för järnbrist. Hb följer en normalfördelning med medelvärde 130 g/L och standardavvikelse 10 g/L. Vilka två av följande påståenden är korrekta? (2p) A: Cirka 68% av patienterna har ett Hb mellan 120 och 140 g/L. B: Standardavvikelsen beskriver hur spridda Hb-värdena är kring medelvärdet. C: Cirka 99% av patienterna har ett Hb under 120 g/L. D: Cirka 95% av patienterna har ett Hb mellan 100 och 200 g/L.";"A och B"
"2025-02-01";"14";"Aminoacyl-tRNA synthetases have an activation site and an editing site. Account for their function in translation. (4p) Please answer this question in English.";"translation";"";"Aminoacyl-tRNA synthetases have an activation site and an editing site. Account for their function in translation. (4p) Please answer this question in English.";"The activation site is where the binding of an aminoacid to the 3´amino acid pocket in tRNA happens. The enzym catalyzes the reaction between these two to create an ""esterbindning"" between the CCA in tRNA's amino acid seat/pocket to the C in the aminoacid. More specfically, it is adenine that directly binds to the tRNA. The aminoacyl-tRNA is then moved to the editing site where it gets checked that the right aminoacid has bound to the tRNA to see if its anticodons are compatible with the mRNAs codons. Ord: 88 Totalpoäng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen"
"2025-02-01";"20";"Enzymer har ofta en katalytisk klyfta där den katalyserade reaktionen sker. Redogör för två olika kemiska fördelar med detta. (4p)";"enzymer";"";"Enzymer har ofta en katalytisk klyfta där den katalyserade reaktionen sker. Redogör för två olika kemiska fördelar med detta. (4p)";"1. Unik kemisk miljö där den specifika reaktionen som enzymet katalyserar kan ske utan störningar från omgivningen då katalytiska klyftan isoleras från omgivande miljö. Då kan ex hydrofoba molekyler reagera utan att behöver aggregeras eller påverkas av hydrofob effekt. 2. Vatten kan trängas ut så attt den inte stör eller står i väg när substratet kommer och binder till enzymet. 3. (Extra: katalytiska klyftan är specifikt för en substrat)"
"2025-02-01";"30";"Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Glutamat och serin utgör de två viktigaste transportformerna av kväve från extrahepatiska vävnader till levern. B: Vid nedbrytning av flera olika aminosyror hamnar deras aminogrupper i glutamat, som i sin tur är molekylen som kan avge aminogruppen som ammoniak i levercellernas mitokondrier. C: Rent ketogena aminosyror kan omvandlas till oxaloacetat. D: Vid leverskada ses oftast förhöjda plasmanivåer av två aminotransferaser, alaninaminotransferas och aspartataminotransferas.";"aminosyrametabolism";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Glutamat och serin utgör de två viktigaste transportformerna av kväve från extrahepatiska vävnader till levern. B: Vid nedbrytning av flera olika aminosyror hamnar deras aminogrupper i glutamat, som i sin tur är molekylen som kan avge aminogruppen som ammoniak i levercellernas mitokondrier. C: Rent ketogena aminosyror kan omvandlas till oxaloacetat. D: Vid leverskada ses oftast förhöjda plasmanivåer av två aminotransferaser, alaninaminotransferas och aspartataminotransferas.";"B och D"
"2025-02-01";"15";"Redogör för de två viktigaste principerna som förklarar hur nya egenskaper kan utvecklas i ett evolutionärt sammanhang samt hur de två principerna är beroende av varandra. (4p)";"evolution";"";"Redogör för de två viktigaste principerna som förklarar hur nya egenskaper kan utvecklas i ett evolutionärt sammanhang samt hur de två principerna är beroende av varandra. (4p)";"De två viktigaste principerna är variation och naturligt urval. I en population förekommer en genetisk variation mellan individerna. Den genetiska variationen beror på mutationer bland annat. Alla individer har inte samma egenskaper och är därför olika anpassade efter miljön som dessa lever i. De individer som är bäst anpassade till miljön kommer ha en större chans att utnyttja resurserna och kunna överleva samt föröka sig och föra vidare sina gynnsamma gener. Detta i sin tur är kallat naturligt urval där miljön ""selekterar"" de bäst anpassade. Exempel på det är hur giraffens långa hals kan ha uppstått. I en giraffpopulation förekom en genetisk variation med giraffer som hade både korta och långa halser. I en miljö med korta träd kunde båda nyttjas, men i samband med att träden blev allt högre, kunde de som hade långt hals nå upp och utnyttja det. Dessa blev de bäst anpassade och därmed överförde vidare de gynnsamma generna, medan de som hade kort hals kunde inte utnyttja resurserna på samma sätt i just den specifika miljön."
"2025-02-01";"21";"Vilka två av nedanstående molekyler innehåller delar från en B-vitamin? (2p) A: Cyt c B: ATP C: CoA D: NADH";"integrering-av-metabolismen";"";"Vilka två av nedanstående molekyler innehåller delar från en B-vitamin? (2p) A: Cyt c B: ATP C: CoA D: NADH";"C och D"
"2025-02-01";"31";"Namnge en nukleosid och ange i vilken molekyl merparten av nukleosidens kväveatomer hamnar när den bryts ned. Molekylen utsöndras slutligen med urinen. (2p) Max 10 ord.";"nukleotidnedbrytning";"";"Namnge en nukleosid och ange i vilken molekyl merparten av nukleosidens kväveatomer hamnar när den bryts ned. Molekylen utsöndras slutligen med urinen. (2p) Max 10 ord.";"Adenosin. Hamnar i Urat"
"2025-02-01";"25";"I citronsyracykeln deltar fyra dehydrogenaser. A) Vad gör ett dehydrogenas? B) Vilka två av de fyra dehydrogenaserna utför också en annan gemensam reaktion? C) Vilken är den andra gemensamma reaktionen? (4p) Max 30 ord.";"citronsyracykeln";"";"I citronsyracykeln deltar fyra dehydrogenaser. A) Vad gör ett dehydrogenas? B) Vilka två av de fyra dehydrogenaserna utför också en annan gemensam reaktion? C) Vilken är den andra gemensamma reaktionen? (4p) Max 30 ord.";"a) Tar bort väte b) Isocitratdehydrogenas och alfa-ketoglutaratdehydrogenas c) Dekarboxylering; frigör CO₂"
"2025-02-01";"11";"Telomeras är ett enzym som spelar en viktig roll i bevarandet av kromosomernas integritet under DNA-replikation. Vad gör telomeras, och varför är det viktigt för celler som delar sig ofta, som stamceller och könsceller? (4p)";"dna-replikation";"";"Telomeras är ett enzym som spelar en viktig roll i bevarandet av kromosomernas integritet under DNA-replikation. Vad gör telomeras, och varför är det viktigt för celler som delar sig ofta, som stamceller och könsceller? (4p)";"Vid replikation av DNA har vi en ledande sträng som syntetiseras kontinuerligt, och en lagging sträng som syntetiseras i olika fragment kallade Okazakifragment. Då replikationen sker i 5'- till 3'-riktning, måste Okazakifragmenten ha olika RNA-primers som de startar vid. Just här uppstår ett problem, då vi inte kan lägga till primers på ändarna, så lagging strand kommer inte kunna syntetisera där. I normala fall leder detta till att DNA förkortas efter varje replikation. Men i celler som stamceller och cancerceller kommer telomeraset att ha med sig en egen RNA-mall och utför omvänd transkriptas, det vill säga att göra RNA till DNA. Så telomeraset kommer att förlänga ändarna med en repeterande sekvens. Det som händer då är att vid nästa replikation kommer DNA att förkortas vid de sekvenserna som lades till av telomeraset, men ingen viktig information kommer att tas bort. Detta utnyttjas av stamceller och cancerceller för att cellerna ska kunna dela sig utan att dö eller tappa viktiga gener."
"2025-02-01";"8";"Nukleotider är de byggstenar som bygger upp både DNA och RNA. Vilken kemisk grupp finns i 2'-position hos ribonukleotider, och hur skiljer sig denna från deoxyribonukleotider? (4p)";"nukleotider";"";"Nukleotider är de byggstenar som bygger upp både DNA och RNA. Vilken kemisk grupp finns i 2'-position hos ribonukleotider, och hur skiljer sig denna från deoxyribonukleotider? (4p)";"Hos ribonukleotider finns en OH-grupp i 2´positioinen medan det i DNA finns H. Detta beror på att enzymet ribonukleotidreduktas ersätter OH gruppen i RNA med H för att omvandla ribos till deoxyribos. RNA: Ribos har OH på kol nr 2. DNA: Deoxyribos har H på kol nr 2."
"2025-02-01";"35";"Explain how gel electrophoresis can be used to analyze different conformations of plasmid DNA. Discuss how the migration patterns of these conformations differ and how comparing them with the ladder (marker) helps interpreting the gel results and understand the structure of the plasmid DNA. (4p) Max 150 words. Answer in English.";"plasmid";"";"Explain how gel electrophoresis can be used to analyze different conformations of plasmid DNA. Discuss how the migration patterns of these conformations differ and how comparing them with the ladder (marker) helps interpreting the gel results and understand the structure of the plasmid DNA. (4p) Max 150 words. Answer in English.";"The electrophoresis has two differently charged ends, one positive and one negative. The plasmids get injected into the gel electrophoresis in a well from the negatively charged end. When we then give it a current, the plasmids will travel to the positive end (because DNA is negative). The bigger the plasmid is, the further it will travel, because it has more negative charges than a small one. Supercoiled and circular DNA will meet different amount of friction, since they have different forms, which will result in one traveling further than the other even though they have the same size. The marker will help identify how many base pairs the plasmid have. But if we analyze two of the same plasmids and they travel different distances, then it means that they have different conformations where one is supercoiled and the other is circular. The circular meets more friction."
"2025-02-01";"3";"Ange två likheter och två skillnader mellan en alfahelix och en hårnålsböj (reverse turn). (4p) Max 50 ord.";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Ange två likheter och två skillnader mellan en alfahelix och en hårnålsböj (reverse turn). (4p) Max 50 ord.";"Alfahelixar har vätebindningar mellan var fjärde aminosyra, medan hårnålsböj har mellan var tredje. Båda är en typ av primärstruktur. Alfahelixar är ofta högervridna."
"2025-02-01";"7";"Glukos lagras hos människan i form av glykogen. Hos växter lagras glukos som stärkelse. Beskriv skillnader och likheter mellan glykogen och stärkelse. (4p)";"glykogen";"";"Glukos lagras hos människan i form av glykogen. Hos växter lagras glukos som stärkelse. Beskriv skillnader och likheter mellan glykogen och stärkelse. (4p)";"Elev 1 - 3 av 4 poäng: Båda är långa kedjor av kolhydrater. Skillnaden är dock att glykogen består av förgrenade kedjor där vi har 1,4-glykosidbindningar mellan linjära delar, och 1,6-glykosidbindningar mellan förgreningar. Stärkelse är en enda linjär kedja som inte förgrenas. Elev 2 - 3 av 4 poäng Stärkelse i växter bildas av fotosyntes, utav koldioxid och vatten där solenergin utnyttjas för att skapa bindningar mellan dessa molekyler, då får vi bl.a glukos. Det glukos som tillverkas i växter av fotosyntes är samma glukos vi äter och bryter dess bindningar för energi. Att glukos lagras som glykogen hos oss är för att glukos är för osmotiskt aktiv för att lagras som den är. Men stärkelse lagras inte för växternas skull, utan det är ett sätt att omvandla koldioxid som vi andas ut till syrgas, annars skulle syrgas i atmosfären ha tagit slut. AI-rättning: Kort sammanfattning av vad som typiskt ger full poäng: Likhet: båda består av α-D-glukos. Likhet: båda använder α-1,4- och α-1,6-bindningar. Skillnad: stärkelse = amylose (linjär) + amylopektin (lätt förgrenad). Skillnad: glykogen = mycket mer förgrenat."
"2025-02-01";"6";"Du gör forskar-ST inom infektionsmedicin och studerar hur Helicobacter pylori binder till glykolipider. Du ritar upp en glykolipid i cellmembranet och markerar hur den del som sitter på utsidan är den bakterierna binder till. Principiell struktur räcker. (4p)";"cellmembran";"";"Du gör forskar-ST inom infektionsmedicin och studerar hur Helicobacter pylori binder till glykolipider. Du ritar upp en glykolipid i cellmembranet och markerar hur den del som sitter på utsidan är den bakterierna binder till. Principiell struktur räcker. (4p)";". Ritning: På ritningen (sida 11) visas ett cellmembran med glykolipider: hydrofila huvuden utåt, hydofoba fettsyrasvansar i membranet och en kolhydrat kopplad via glycerol (kommentar: ”kan också vara sfingosin”). Lärarens kommentar: Det absolut vanligaste är att glykolipider har sfingosin som bas och inte glycerol, och när man säger glykolipid utan att specificera mer så menar man nästan alltid de med sfingosin som bas. Ord (textsvar): 1"
"2025-02-01";"2";"Vilka två av nedanstående påstående stämmer för proteinveckning? (2p) A: Den är reversibel. B: Det är en ofördelaktig process. C: Den börjar på lokal nivå. D: En aminosyrasekvens veckas alltid till samma struktur.";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Vilka två av nedanstående påstående stämmer för proteinveckning? (2p) A: Den är reversibel. B: Det är en ofördelaktig process. C: Den börjar på lokal nivå. D: En aminosyrasekvens veckas alltid till samma struktur.";"A och C"
"2024-08-01";"28";"Vad får det för konsekvens när NADH som bildats i glykolysen transporteras till mitokondriens matrix med glycerol 3-fosfatshunten istället för med malat-aspartatshunten? (2p) (Max 30 ord)";"elektrontransportkedjan";"";"Vad får det för konsekvens när NADH som bildats i glykolysen transporteras till mitokondriens matrix med glycerol 3-fosfatshunten istället för med malat-aspartatshunten? (2p) (Max 30 ord)";"0 poäng: Konsekvensen blir att vi kommer behöva förbruka en atp för att glycerol 3 fosfat ska kunna bildas. Det kräver mer energi AI-svar: När elektroner från cytosoliskt NADH går via glycerol-3-fosfatshunten i stället för malataspartatshunten blir konsekvensen: → Färre ATP per NADH. Glycerol-3-fosfatshunten överför elektroner till FAD i mitokondriens inre membran → FADH₂ → komplex II → ger ~1,5 ATP. Malataspartatshunten överför elektroner direkt till mitokondriellt NAD⁺ → NADH → komplex I → ger ~2,5 ATP. Konsekvens: lägre ATP-utbyte från glykolysen när glycerol-3-fosfatshunten används."
"2024-08-01";"5";"Du är läkare och handleder en läkarstudent som är stressad över sin biokemitenta. Läkarstudenten kommer inte ihåg membranlipiderna så bra och undrar om du kan hjälpa till att förklara, vilket du gör genom att: A) Rita den principiella strukturen för den vanligaste membranlipiden. B) Markera i bilden som du har ritat den del som är polär, samt den del som är hydrofob. (4p) ![[Pasted image 20251129235536.png]]";"cellmembran";"";"Du är läkare och handleder en läkarstudent som är stressad över sin biokemitenta. Läkarstudenten kommer inte ihåg membranlipiderna så bra och undrar om du kan hjälpa till att förklara, vilket du gör genom att: A) Rita den principiella strukturen för den vanligaste membranlipiden. B) Markera i bilden som du har ritat den del som är polär, samt den del som är hydrofob. (4p) ![[Pasted image 20251129235536.png]]";"Svar på ritpapper: fosfolipid med alkohol + fosfat (polär del) kopplad till glycerol och två fettsyrasvansar (hydrofob del)."
"2024-08-01";"18";"Kemiska reaktioner i vätskor och gaser sker snabbare när temperaturen höjs. Hur kan det förklaras? (4p) (Max 150 ord.)";"termodynamik";"";"Kemiska reaktioner i vätskor och gaser sker snabbare när temperaturen höjs. Hur kan det förklaras? (4p) (Max 150 ord.)";"Det går snabbare därför att en ökning i värmeenergi kommer omvandlas till en ökning i rörelseenergin (termodynamikens första lag, energi kan inte skapas eller förstöras men det kan omvandlas). När vi höjer rörelseenergi kommer detta innebära att varje partikel befinner sig på en högre energinivå än vad den var innan. Detta ökar både chansen för att två partiklar med rätt konformation krockar med varandra, men också att de krockar med varandra med tillräckligt mycket energi för att kunna nå övergångstillståndet och således reagera."
"2024-08-01";"1";"I glykolysens första steg binder glukos till en klyfta i enzymet som utför reaktionen från vilken vatten stängs ute. Förklara vilka egenskaper de aminosyror behöver ha som binder till glukos och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 60 ord.)";"glukosmetabolism";"";"I glykolysens första steg binder glukos till en klyfta i enzymet som utför reaktionen från vilken vatten stängs ute. Förklara vilka egenskaper de aminosyror behöver ha som binder till glukos och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 60 ord.)";"Glukos är en vattenlöslig molekyl - den är polär. De som binder till glukos behöver då också vara polära och vattenlösliga. två aminosyror som har dessa egenskaper är serin och treonin. Det som utmärker dessa är att de är alkoholer - så de binder gärna till glukos via sina OH-grupper."
"2024-08-01";"19";"Enzymet A som omvandlar S till P har ett Km på 10 µM och ett Vmax på 100 nmol/s. Enzymet B som omvandlar S till Q har ett Km på 1 mM och ett Vmax på 200 nmol/s. Lika mängder av A och B blandas med 100 µM S i ett och samma kärl. Vad kommer man att ha mest av när reaktionerna är klara - P eller Q? Motivera ditt svar. (4p) (Max 150 ord.)";"enzymer";"";"Enzymet A som omvandlar S till P har ett Km på 10 µM och ett Vmax på 100 nmol/s. Enzymet B som omvandlar S till Q har ett Km på 1 mM och ett Vmax på 200 nmol/s. Lika mängder av A och B blandas med 100 µM S i ett och samma kärl. Vad kommer man att ha mest av när reaktionerna är klara - P eller Q? Motivera ditt svar. (4p) (Max 150 ord.)";"1 av 4: Km = ([E]+[S])/[ES] och Vmax = K + Etot k2=turnover number Med hjälp av formlerna ovan har jag kunnat dra slutsatsen att Enzym A har både en mindre kapacitet för att forma enzym-substrat komplex och har även en lägre turnover number än vad Enzym B har. Denna slutsats drar jag då enzym A har ett större Km värde än vad Enzym B har, vilket innebär att [ES] är mindre hos Enzym A än Enzym B enligt michealis mentes kinetiken. Enzym A har alltså lägre affinitet för sitt substrat än Enzym B Vmax är också lägre hos enzymA än vad den är hos enxym B, detta beror på turnover number som är det värde som talar om hur bra ett enzym bildar produkt. Enzym A måste ha ett lägre turnover-number än enzym B då dess Vmax är lägre. Enzym B har alltså både större [ES] och bildar produkt bättre(K )->Q kommer bildas."
"2024-08-01";"29";"Vilka två av nedanstående komponenter deltar i elektrontransportkedjan? (2p) A: Cu2+ B: Coenzym A C: Mn2+ D: Fe-S-kluster";"elektrontransportkedjan";"";"Vilka två av nedanstående komponenter deltar i elektrontransportkedjan? (2p) A: Cu2+ B: Coenzym A C: Mn2+ D: Fe-S-kluster";"A och D"
"2024-08-01";"4";"Du jobbar på labb över sommaren och du har fått i uppgift att utföra en ELISA för att undersöka om en patient har HIV. Beskriv vilken typ av ELISA som skall utföras, vilka steg som utförs och ange vilken substans hos patienten som undersöks med metoden. (4p). (Max 200 ord.)";"utforska-proteiner";"";"Du jobbar på labb över sommaren och du har fått i uppgift att utföra en ELISA för att undersöka om en patient har HIV. Beskriv vilken typ av ELISA som skall utföras, vilka steg som utförs och ange vilken substans hos patienten som undersöks med metoden. (4p). (Max 200 ord.)";"För att undersöka om en patient har HIV så vill man kolla ifall den har antikroppar för det. Då använder man sig av indirekt ELIZA samt ett prov innehållande patientens plasma-komponenter - då det är där antikropparna finns. Vid indirekt ELIZA kommer det i en behållare finnas antigener bundna till botten, dessa ska ha en epitop som HIV-antikroppen känner igen. Man kommer tillsätta ett prov innehållande patientens plasma-komponenter till behållaren. HIV-antikropparna kommer binda till antigenerna och sedan kommer provet att sköljas. efter sköjlning kommer man tillsätta en substans innehållande enzymlänkade antikroppar som kommer binda till HIV-antikropparna. Efter dessa har fått tid att binda sköljer man provet en gång till. sedan så tillsätter man en annan substans som innehåller ett substrat som enzymerna binder. Detta substrat kommer orsaka ett färgskifte om det finns HIV-antikroppar i provet, om det inte finns hiv-antikroppar blir det inget färgskifte och man vet att patienten inte har HIV. det är viktigt att man sköljer ordentligt mellan stegen, annars kan det uppstå en falsk positiv, detta då antikropparna ju skulle finnas kvar i provet, som då de enzymbundna antikropparna kan binda till, som då kommer ge färgskifte vid tillsatts av substrat."
"2024-08-01";"16";"Vilka två av nedanstående proteiner utför aktiv transport? A: Aquaporiner B: ABC-transportörer C: Adeninnukleotidtranslokas D: GLUT4 (2p)";"transport-över-cellmembran";"";"Vilka två av nedanstående proteiner utför aktiv transport? A: Aquaporiner B: ABC-transportörer C: Adeninnukleotidtranslokas D: GLUT4 (2p)";"B och C"
"2024-08-01";"22";"A) Förklara vad som menas med feedbackreglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras med feedbackreglering och ange vad det är som ger feedbackregleringen. (4p) (50 ord)";"glykolysen";"";"A) Förklara vad som menas med feedbackreglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras med feedbackreglering och ange vad det är som ger feedbackregleringen. (4p) (50 ord)";"A) Feedback reglering är att en produkt som bildas kommer reglera aktiviteten hos ett enzym som katalyserar en reaktion som sker innan den reglerande produkten har bildats. B) Hexokinas katalyserar reaktionen Glukos + ATP -> glukos-6-fosfat + ADP, den feedbackinhiberas av sin egen produkt, glukos-6-fosfat."
"2024-08-01";"32";"Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? (2p) A: En funktionell pentosfosfatväg är viktig för att celler skall kunna upprätthålla ett fullgott skydd mot skadliga reaktiva syreföreningar (ROS). B: Glykolysintermediärerna glukos-6-fosfat och glyceraldehyd-3-fosfat är slutprodukterna som bildas i pentosfosfatvägens icke-oxidativa fas. C: En väldigt viktig uppgift för pentosfosfatvägen är att bilda NADPH och ribos-5-fosfat. D: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla och det är cellens behov som styr riktningen av reaktionerna.";"pentosfosfatvägen";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? (2p) A: En funktionell pentosfosfatväg är viktig för att celler skall kunna upprätthålla ett fullgott skydd mot skadliga reaktiva syreföreningar (ROS). B: Glykolysintermediärerna glukos-6-fosfat och glyceraldehyd-3-fosfat är slutprodukterna som bildas i pentosfosfatvägens icke-oxidativa fas. C: En väldigt viktig uppgift för pentosfosfatvägen är att bilda NADPH och ribos-5-fosfat. D: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla och det är cellens behov som styr riktningen av reaktionerna.";"A och C"
"2024-08-01";"26";"Kan citronsyracykeln gå åt vilket håll som helst? Motivera svaret. (4p) (Max 75 ord)";"citronsyracykeln";"";"Kan citronsyracykeln gå åt vilket håll som helst? Motivera svaret. (4p) (Max 75 ord)";"Jag förstår inte helt frågan som ställs, CSC kan inte gå bakåt i cykeln då vi har två reglerande steg då koldioxid avges. Isocitratdehdyrogenas och alfaketoglutaratdehydrogenas är reglerade dels av sina produkter men även av energikvoten, dessa kan inte gå bakåt hur som helst. Då det är en cykel kan vi dock återbilda en produkt genom att låta cykeln fortgå efter oxalacetat har bildats tills vi får den produkten som vi ville återbilda."
"2024-08-01";"12";"Vid prokaryot transkription spelar sigma-faktorn en avgörande roll. Vilka två påståenden om sigma-faktorn stämmer? (2p) A: Sigma-faktorn gör så att bakteriellt RNA-polymeras binder starkare till alla typer av DNA. B: En bakterie innehåller ofta flera typer av sigma-faktorer. C: Sigma-faktorn styr bakteriellt RNA-polymeras till promotorn. D: Sigma-faktorn gör RNA-polymeraset mer processivt.";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"";"Vid prokaryot transkription spelar sigma-faktorn en avgörande roll. Vilka två påståenden om sigma-faktorn stämmer? (2p) A: Sigma-faktorn gör så att bakteriellt RNA-polymeras binder starkare till alla typer av DNA. B: En bakterie innehåller ofta flera typer av sigma-faktorer. C: Sigma-faktorn styr bakteriellt RNA-polymeras till promotorn. D: Sigma-faktorn gör RNA-polymeraset mer processivt.";"B och C"
"2024-08-01";"27";"Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter / vägar: fosfofruktokinas 1 fosfoglyceratkinas fumaras laktatdehydrogenas citronsyracykeln Coricykeln glykolysen glukoneogenes";"glukoneogenes";"";"Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter / vägar: fosfofruktokinas 1 fosfoglyceratkinas fumaras laktatdehydrogenas citronsyracykeln Coricykeln glykolysen glukoneogenes";"fosfofruktokinas 1: glykoneogenesen fosfoglyceratkinas: glykolysen fumaras: citronsyracykeln laktatdehydrogenas: Coricykeln"
"2024-08-01";"13";"Hur sker matchningen mellan den kodande sekvensen på mRNA och antikodonsekvensen på tRNA? Beskriv var i ribosomer som denna matchning sker under translationen. (4p) (Max 150 ord.)";"translation";"";"Hur sker matchningen mellan den kodande sekvensen på mRNA och antikodonsekvensen på tRNA? Beskriv var i ribosomer som denna matchning sker under translationen. (4p) (Max 150 ord.)";"3 av 4: Ribosomen består av en liten subenhet - 30S och en stor subenhetet 50S. den stora subenheten kommer sköta matchningen av kodon till antikodon och den lilla kommer hålla i mRNA strängen. Matchningen mellan den kodande sekvensen på mRNA och antikodonssekvensen på tRNA sker på Aminoadenyl siten (A-site) i ribosomen. En aminosyra-laddad tRNA kommer att vandra in i A-siten på en riboosom. Där kommer antikodonerna matchas med kodonerna och vätebindingar kommer bildas mellan dem. Om dessa har matchat rätt kommer elongation factors göra att tRNA släpper ifrån och fortsätter till peptidyl-site och sedan ut via exit-site i ribosomen."
"2024-08-01";"17";"Rangordna molekylerna etanol, fruktos, leucin och koldioxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den som har lättast att passera. (2p) Lättast → Svårast: Etanol Fruktos Koldioxid Leucin";"transport-över-cellmembran";"";"Rangordna molekylerna etanol, fruktos, leucin och koldioxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den som har lättast att passera. (2p) Lättast → Svårast: Etanol Fruktos Koldioxid Leucin";"1. Koldioxid 2. Etanol 3. Fruktos 4. Leucin"
"2024-08-01";"23";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Aminosyrorna isoleucin och leucin är glukogena. B: Kol reduceras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat. D: Glukoneogenes sker framför allt när insulinnivån är hög.";"glukoneogenes";"";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Aminosyrorna isoleucin och leucin är glukogena. B: Kol reduceras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat. D: Glukoneogenes sker framför allt när insulinnivån är hög.";"B och C"
"2024-08-01";"33";"Beskriv kortfattat vad det enterohepatiska kretsloppet är och förklara dess koppling till kolesterolsyntes. (4p)";"kolesterol";"";"Beskriv kortfattat vad det enterohepatiska kretsloppet är och förklara dess koppling till kolesterolsyntes. (4p)";"2 av 4: Nedbruten kolesterol kommer att utsöndras med gallsyror, därför är det viktigt att vi har gallsyror så att vi inte får en ackumulering av kolesterol. Enterohepatiska kretsloppet är att vi har en 95-procentig reabsorption av gallsyror i hepatocyterna - vilket gör att vi ständigt har galla. AI: Det enterohepatiska kretsloppet innebär att gallsyror som bildats från kolesterol i levern utsöndras till tarmen och därefter till största delen återabsorberas i ileum och förs tillbaka till levern via portavenen. Detta sparar kolesterol, eftersom färre nya gallsyror behöver syntetiseras. Om återcirkulationen minskar måste levern istället öka sin kolesterolsyntes och uppreglera LDL-receptorer för att få mer kolesterol till ny gallsyrabildning."
"2024-08-01";"24";"A) Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar och varför sker detta? B) Vilka är de tre ketonkropparna som bildas? (4p)";"betaoxidation";"";"A) Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar och varför sker detta? B) Vilka är de tre ketonkropparna som bildas? (4p)";"1 av 4: a) bildningen av ketonkroppar sker vid svält. Vid svält kommer glukosreserverna att ha brutits ned och vi kommer gå över till att bryta ner våra fettreserver. Då kommer det bildas ketonkroppar och detta är ffa för att förse hjärnan med energi, då den inte längre kan få det från glukos. b) acyl-CoA, acetoacyl-CoA och aceton."
"2024-08-01";"10";"Vilka två påståenden stämmer om RNA processning? (2p) A: En lariatstruktur bildas som restprodukt vid splicing av mRNA B: mRNA har en polyA-svans som bildas i cytoplasman. C: 5-cap hämmar translation. D: Introner bevaras i moget mRNA.";"rna-syntes";"";"Vilka två påståenden stämmer om RNA processning? (2p) A: En lariatstruktur bildas som restprodukt vid splicing av mRNA B: mRNA har en polyA-svans som bildas i cytoplasman. C: 5-cap hämmar translation. D: Introner bevaras i moget mRNA.";"A och B"
"2024-08-01";"9";"A) Vad är skillnaden mellan exo- och endonukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för CMP. (4p)";"dna-replikation";"";"A) Vad är skillnaden mellan exo- och endonukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för CMP. (4p)";"a) exonukleaser kommer att bryta fosfodiesterbindingar på änden av en DNA- kedja medan endonukelaser kommer bryta en fosfodiesterbindning någonstans i mitten av DNA-kedjan. b) cytidinmonofosfat."
"2024-08-01";"34";"Vilka två faropiktogram visas i bild nedan? ![[Pasted image 20251129235602.png]] A: Oxiderande B: Brandfarlig C: Skadlig D: Giftig (2p)";"introduktionslaboration";"";"Vilka två faropiktogram visas i bild nedan? ![[Pasted image 20251129235602.png]] A: Oxiderande B: Brandfarlig C: Skadlig D: Giftig (2p)";"A & C"
"2024-08-01";"14";"Beskriv kortfattat hur den första eukaryota cellen bildades. (4p) (Max 150 ord.)";"evolution";"";"Beskriv kortfattat hur den första eukaryota cellen bildades. (4p) (Max 150 ord.)";"Den första eukaryota cellen bildades tack vare endosymbios. Med endosymbios menas att två bakterier har gått ihop och har haft ett utbyte mellan varandra som gynnar båda. Detta sker genom att en mindre bakterie vandrar in i en större bakterie med en egenskap som gynnar överlevnaden hos både sig själv och den större bakterien. Tillslut kommer den större bakterien att ta över vissa processer som den lilla gör genom att den lilla bakteriens DNA överförs till den större bakterien - på så sätt får vi en cell med flera organeller. Exempel: mitokondrien mitokondrien - som var en aerob bakterie, vandrade en gång in i en anaerob, större cell. den gav energi i form av ATP och den större anaeroba cellen gav den näring. tillslut överfördes DNA från den aeroba bakterien till den anaeroba cellen - på så sätt kunde cellen börja styra vissa processer och vi fick en cellandande cell."
"2024-08-01";"20";"Vilka två av nedanstående påståenden om enzymer är korrekta? (2p) A: Enzymer förändrar den fria energin i en reaktion. B: Enzymernas tredimensionella form är nyckeln till deras funktion. C: Enzymer påskyndar reaktioner genom att sänka aktiveringsenergin. D: Enzymer är alltid proteiner.";"enzymer";"";"Vilka två av nedanstående påståenden om enzymer är korrekta? (2p) A: Enzymer förändrar den fria energin i en reaktion. B: Enzymernas tredimensionella form är nyckeln till deras funktion. C: Enzymer påskyndar reaktioner genom att sänka aktiveringsenergin. D: Enzymer är alltid proteiner.";"B och C"
"2024-08-01";"30";"Alanin kan bildas i en så kallad transamineringsreaktion med hjälp av ett kliniskt viktigt enzym. Ange det fullständiga namnet på enzymet, samt beskriv reaktionen som enzymet katalyserar med en reaktionsformel. (4p) (Max 20 ord.)";"aminosyrametabolism";"";"Alanin kan bildas i en så kallad transamineringsreaktion med hjälp av ett kliniskt viktigt enzym. Ange det fullständiga namnet på enzymet, samt beskriv reaktionen som enzymet katalyserar med en reaktionsformel. (4p) (Max 20 ord.)";"3 av 4: Alanin-aminotransferas pyruvat + glutamat -> alanin + alfa-ketoglutarat"
"2024-08-01";"15";"Ange två typer av celladhesionsmolekyler och beskriv kortfattat deras funktion. (4p)";"cellmembran";"";"Ange två typer av celladhesionsmolekyler och beskriv kortfattat deras funktion. (4p)";"integriner - förankrar cellen med ECM. Detta gör de genom att binda till cytoskelettet som aktinfilament och sedan binda till ECM komponenter såsom fibrinogen samt kollagen. cadheriner - finns i desmosomer och adherensjunctions, de förankrar cellerna i varandra. Detta gör de genom att binda till andra cedheriner med homophilic bindings samt till cytoskelletet, på så sätt binder de ihop cellerna."
"2024-08-01";"21";"Ange vad som används som cellens energivaluta och förklara vad som gör molekylen lämplig för ändamålet. (4p) (Max 100 ord).";"introduktion-till-metabolismen";"";"Ange vad som används som cellens energivaluta och förklara vad som gör molekylen lämplig för ändamålet. (4p) (Max 100 ord).";"Det som används som cellens energivaluta är ATP. Det som gör ATP lämplig är att den innehåller tre stycken fosfatgrupper som binder till varandra med fosfoanhybridbindniningar. Fosfoanhybridbindingen är instabil och kräver energi för att hållas ihop då det är en repulsion mellan fosfatgrupperna. Då en fosfat spjälkas av så kommer det att frisättas energi genom att repulsionen minskar, dessutom uppstår resonans mellan de två övriga fosfatgrupperna som gör dem stabilare - mer energi avges. Energin som avges kan då gå till andra energikrävadne processer ex. bilda gradienter och makromolekyler."
"2024-08-01";"31";"Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? (2p) A: Gikt är en sjukdom orsakad av förhöjda plasmakoncentrationer av urea. B: Sockerstrukturerna i både purin- och pyrimidin-nukleotider spjälkas loss från kvävebaserna via fosforolys. C: UMP och CMP är purin-nukleotider. D: Då purin-nukleotider bryts ned kommer merparten av purinbasernas kväveatomer slutligen hamna i urat, men en mindre andel av basernas kväveatomer hamnar slutligen i urea.";"nukleotidnedbrytning";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? (2p) A: Gikt är en sjukdom orsakad av förhöjda plasmakoncentrationer av urea. B: Sockerstrukturerna i både purin- och pyrimidin-nukleotider spjälkas loss från kvävebaserna via fosforolys. C: UMP och CMP är purin-nukleotider. D: Då purin-nukleotider bryts ned kommer merparten av purinbasernas kväveatomer slutligen hamna i urat, men en mindre andel av basernas kväveatomer hamnar slutligen i urea.";"B och D"
"2024-08-01";"25";"För att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel, det vill säga börja bilda en glykogenpartikel ""från början"", så behövs en så kallad glykogen-primer, dvs en kort sträcka linjärt glykogen. Hur bildas denna primer, och varför måste strukturen bildas för att glykogenpartikeln sedan skall kunna byggas upp? (4p) (Max 50 ord.)";"glykogen";"";"För att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel, det vill säga börja bilda en glykogenpartikel ""från början"", så behövs en så kallad glykogen-primer, dvs en kort sträcka linjärt glykogen. Hur bildas denna primer, och varför måste strukturen bildas för att glykogenpartikeln sedan skall kunna byggas upp? (4p) (Max 50 ord.)";"Glykogenin kommer att autokatalysera bildningen av en glykogenprimer genom att sätta på den aktiva formen av glukos (UDP-glukos) på sin tyrosins OH-grupp. Sedan forsätter den att binda ca. 10-20 glukosenheter innan glykogensyntas tar över. Glykogensyntas kan bara bilda alfa-1,4-bindningar om det finns en kedja att koppa dem till."
"2024-08-01";"11";"Var sitter histon H1 och vilken roll spelar denna faktor? (4p)";"kromatin";"";"Var sitter histon H1 och vilken roll spelar denna faktor? (4p)";"H1 sitter på den yttre regionen av en nukleosom. Dess uppgift är att stabilisera nukleosomen genom att binda till/över DNA:t som är virat kring histonbunten och se till att DNAt förankras med histonerna. Utan H1 hade dnat främst hållts kvar av H3 och H4s positivt laddade N-terminaler som binder till den negativt laddade DNA strängen. Detta hade inneburit att så fort dessa histoner hade genomgått acetylering eller metylering så hade nukleosomen varit väldigt instabil."
"2024-08-01";"8";"Vilka två påståenden om DNA-replikation stämmer? (2p) A: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. B: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. C: Topoisomeraser kan ta bort supercoils. D: DNA replikation sker alltid i 3´ till 5´-riktning.";"dna-replikation";"";"Vilka två påståenden om DNA-replikation stämmer? (2p) A: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. B: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. C: Topoisomeraser kan ta bort supercoils. D: DNA replikation sker alltid i 3´ till 5´-riktning.";"(svar angivet i flervalsformulär)"
"2024-08-01";"35";"A gene of interest was amplified and verified using the blue/white screening method. The plasmids from two bacterial colonies, one blue colony and one white colony, were purified. Then restriction enzyme digestion was performed, and the samples were run on a gel as follows: white uncut, white cut, blue uncut, blue cut (see figure below). After imaging the gel, we can conclude that while there is plasmid DNA in all samples, the white sample was probably mixed with the blue sample. Explain what finding in the gel indicates the white sample was probably mixed with the blue sample by referring to the size/number of bands. Account for the other source of error for this outcome besides pipette tip contamination from sample to sample. (4p) (Max 200 words) OBS! This question needs to be answered in English. ![[Pasted image 20251129235633.png]]";"plasmid";"";"A gene of interest was amplified and verified using the blue/white screening method. The plasmids from two bacterial colonies, one blue colony and one white colony, were purified. Then restriction enzyme digestion was performed, and the samples were run on a gel as follows: white uncut, white cut, blue uncut, blue cut (see figure below). After imaging the gel, we can conclude that while there is plasmid DNA in all samples, the white sample was probably mixed with the blue sample. Explain what finding in the gel indicates the white sample was probably mixed with the blue sample by referring to the size/number of bands. Account for the other source of error for this outcome besides pipette tip contamination from sample to sample. (4p) (Max 200 words) OBS! This question needs to be answered in English. ![[Pasted image 20251129235633.png]]";"the findings in the gel that indicate that the samples were mixed are the lines in the white uncut sample. It has two visible bands, with one lining up quite nicely with the blue uncut bands in size. If the plasmid is uncut, than there shouldn't be two distinct bands because the sample only consists of an uncut product. The white uncut should also have a larger amount of base pairs than the blue uncut because we have transformed a gene of interest into it, but they seem to have the same amount. a source of error for this outcome could be that the colony picked for the white cut may have been close to a blue colony - causing a small amount of the blue colony to be accidentaly picked."
"2024-08-01";"3";"How does fetal hemoglobin (HbF) differ from adult hemoglobin (HbA) and what effect does this have? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words).";"hemoglobin";"";"How does fetal hemoglobin (HbF) differ from adult hemoglobin (HbA) and what effect does this have? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words).";"3 av 4: Adult hemoglobin consists of two beta subunits and two alfa subunits, while fetal hemoglobin consists of two alfa subunits and two gamma subunits. HbA has a lower affinity for oxygen than HbF. Beta subunits allow for the allosteric regulator 2,3-BPG to bind. when 2,3-bpg binds it enhances T-state because it becomes a type of blockage for the conformational change to R-state, meaning that the affinity for oxygen is lowered. 2,3-BPG cannot bind to the gamma subunits - meaning that the affinity for oxygen increases."
"2024-08-01";"7";"A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Hur ser denna faktor ut? (4p)";"dna-replikation";"";"A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Hur ser denna faktor ut? (4p)";"a) PCNA, eller en sliding clamp, ökar DNA-polymerasets processivitet, den kan öka hastigheten med upp till 50x. Den fungerar på det sättet att den håller i DNA strängen så att dna-polymeraset lätt kan glida fram b) Den ser ungefär ut som en ring som omringar leading/lagging strand."
"2024-08-01";"6";"Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och glykolipider. (4p)";"cellmembran";"";"Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och glykolipider. (4p)";"3 av 4: glykoproteiner är glykosylerade proteiner, dessa består alltså av ett protein med ""barr"" av kolhydrater. de kan vara o-länkade, via serin och treonins OH-grupp, eller så kan de vara n-länkade via aspargin. Glykoproteiner bygger upp extra- cellulär-matrix och finns i ledvätska, brosk, ögat mm. likt glykoproteiner är glykolipider glykosylerade, men de består av sfingosin + en fettsyra + en sackarid/flera sackarider. Denna finns i outer leaflet i cellmembran och bl.a. bygger upp glykokalyx som är på cellen och inte i ECM. Dessa har som en ""svans"" med sackarider medan glykoproteiners kolhydrater är mer som ovannämnt, ""barr"" som kan finnas över hela proteinet."
"2024-08-01";"2";"Stamceller behöver skyddas från det åldrande som drabbar andra celler. En sak som skyddar dem är ökat uttryck av chaperoniner. Förklara hur det kan skydda mot något som är skadligt för celler. (4p) (Max 60 ord.)";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Stamceller behöver skyddas från det åldrande som drabbar andra celler. En sak som skyddar dem är ökat uttryck av chaperoniner. Förklara hur det kan skydda mot något som är skadligt för celler. (4p) (Max 60 ord.)";"chaperoniner - som hsp60 har två stycken ringstrukturer och en hålighet. I håligheten erbjuds en isolerad plats för proteiner att vecka sig genom att proteinet går in i håligheten och ett lock rekryteras - den veckas ""som vanligt"" oavsett hur miljön utanför. utan detta skulle prioner kunna bildas - vilka kan infektera andra proteiner att veckas fel, vilket skadar cellen."
"";"28";"";"";"";"";""
"";"5";"";"";"";"";""
"";"18";"";"";"";"";""
"";"1";"";"";"";"";""
"";"19";"";"";"";"";""
"";"29";"";"";"";"";""
"";"4";"";"";"";"";""
"";"16";"";"";"";"";""
"";"22";"";"";"";"";""
"";"32";"";"";"";"";""
"";"26";"";"";"";"";""
"";"12";"";"";"";"";""
"";"27";"";"";"";"";""
"";"13";"";"";"";"";""
"";"17";"";"";"";"";""
"";"23";"";"";"";"";""
"";"33";"";"";"";"";""
"";"24";"";"";"";"";""
"";"10";"";"";"";"";""
"";"9";"";"";"";"";""
"";"34";"";"";"";"";""
"";"14";"";"";"";"";""
"";"20";"";"";"";"";""
"";"30";"";"";"";"";""
"";"15";"";"";"";"";""
"";"21";"";"";"";"";""
"";"31";"";"";"";"";""
"";"25";"";"";"";"";""
"";"11";"";"";"";"";""
"";"8";"";"";"";"";""
"";"35";"";"";"";"";""
"";"3";"";"";"";"";""
"";"7";"";"";"";"";""
"";"6";"";"";"";"";""
"";"2";"";"";"";"";""
"2021-12-16";"28";"ALAT är ett kliniskt mycket viktigt enzym. Beskriv reaktionen enzymet katalyserar samt vad en ökad plasmakoncentration av enzymet vanligen indikerar.";"aminosyrametabolism";"";"ALAT är ett kliniskt mycket viktigt enzym. Beskriv reaktionen enzymet katalyserar samt vad en ökad plasmakoncentration av enzymet vanligen indikerar.";"ALAT alaninaminotransferas. Enzymet utför en transaminering glutamat slås ihop med pyruvat aminogruppen från glutamat överförs till pyruvat pyruvat blir då alanin och glutamat alfaketoglutarat. ALAT kan även genomföra omvänd reaktion. ALAT är vanligtvis ett intracellulärt enzym, om man uppmäter en hög koncentration av detta antyder det på att det läckt ut ur cellerna. Detta indikerar därav på vävnadsskada. ALAT finns i hög utsträckning i levern. Därför kan man se höga koncentrationer av ALAT i plasma vid många typer av leversjukdomar t.ex. hepatit."
"2021-12-16";"5";"A) Vilken typ av bindning bryter nukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för dCMP.";"nukleotider";"";"A) Vilken typ av bindning bryter nukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för dCMP.";"A) Nukleaser bryter bindningar mellan nukleotider därav fosfodiesterbindningar. B) dehydroxyriboscytosinmonofosfat (fel) rätt: - deoxycytidinmonofosfat"
"2021-12-16";"18";"Vid syntes av DNA eller RNA måste var och en av de nukleotider som ska adderas till den växande strängen ha tre fosfatgrupper på sig. Man får ingen reaktion om det bara sitter en eller två fosfatgrupper på nukleotiderna. Förklara varför de tre fosfatgrupperna behövs. (Max 150 ord.)";"nukleotider";"";"Vid syntes av DNA eller RNA måste var och en av de nukleotider som ska adderas till den växande strängen ha tre fosfatgrupper på sig. Man får ingen reaktion om det bara sitter en eller två fosfatgrupper på nukleotiderna. Förklara varför de tre fosfatgrupperna behövs. (Max 150 ord.)";"Nukleotider kopplas ihop med fosfodiesterbindningar. Bildningen av denna bindning är termodynamiskt ofördelaktig eftersom att entropin minskar reaktionen kräver tillförd energi. Fosfatgrupperna på nukleotiden är kopplade med mycket energirika fosfoanhydridbindningar. När dessa hydrolyseras frigörs mycket energi. När nukleotiden ska binda in kommer då två av fosfatgrupperna att släppa först frigörs det energi när de bryter från det ena fosfatet (som fortfarande sitter på nukleotiden) och sedan ännu mer energi när bindningen bryts mellan de två frigjorda fosfatgrupperna sinsemellan. Med hjälp av denna energi kan man då driva den energikrävande processen av att skapa en fosfodiesterbindning mellan den nya nukleotiden och den som redan finns på DNA/RNA-strängen. För att få tillräckligt med energi för att driva fosfodiesterbindningen behöver man alltså bryta två fosfoanhydridbindningar m.h.a. hydrolys. Därför krävs det totalt tre stycken fosfat (två släpps av och en hamnar i DNA/RNA-skelettet)."
"2021-12-16";"1";"Blodgrupperna ABO är kolhydratstrukturer som bland annat finns på våra röda blodkroppar. A) Hur skiljer sig A, B och O strukturerna från varandra? B) När man ska ge röda blodkroppar till patienter kan man ge röda blodkroppar från O-donatorer till patienter med blodgrupp A, B och AB, men man kan inte ge patienter med blodgrupp O röda blodkroppar från donatorer med blodgrupp A, B eller AB. Varför?";"kolhydrater";"";"Blodgrupperna ABO är kolhydratstrukturer som bland annat finns på våra röda blodkroppar. A) Hur skiljer sig A, B och O strukturerna från varandra? B) När man ska ge röda blodkroppar till patienter kan man ge röda blodkroppar från O-donatorer till patienter med blodgrupp A, B och AB, men man kan inte ge patienter med blodgrupp O röda blodkroppar från donatorer med blodgrupp A, B eller AB. Varför?";"A) De har olika uppsättning av sockerenheter. A har fucos + galaktos + acetylgalaktosamin B har fucos + galaktos + galaktos 0 har fucos + galaktos Alltså skiljer sig dessa sekvenser från varandra, därför binder olika antikroppar in till olika sorter. B) Beroende på vilken blodgrupp man har kommer man ha olika antigen och antikroppar A har A-antigen och antikroppar mot B B har B-antigen och antikroppar mot A AB har A+B-antigen och inga antikroppar mot vare sig A eller B 0 har ""inget antigen"" och därav antikroppar mot både A och B Anledningen varför en person med blodgrupp 0 då inte kan få röda blodkroppar från vare sig A, B eller AB är att den har antikroppar mot både A och B. Dessa skulle då fästa sig på de transfererade blodkropparnas antigen och aktivera immunförsvaret → autoimmun reaktion. Däremot går det bra att personer som har blodgrupp A, B eller AB får 0-röda blodkroppar eftersom dessa inte innehåller några antigen som deras immunförsvar (antikroppar) skulle känna igen."
"2021-12-16";"19";"![[Pasted image 20251128080420.png]] Diagrammet ovan visar koncentrationen av ämnet A som funktion av tiden i en reaktion där A omvandlas till ämnet B i närvaro av en låg koncentration av ett enzym som katalyserar reaktionen. Enzymet tillsattes omedelbart efter tiden t₀. Vi upprepar nu försöket på samma sätt, men med den skillnaden att vi nu tillsätter 10 gånger högre koncentration av enzymet omedelbart efter tiden t₀. Ange för var och en av tidpunkterna t₀, t₁ och t₂ om [A] kommer att vara högre, lägre eller oförändrad jämfört med i diagrammet ovan. Ange också en motivation till ditt svar vid varje tidpunkt. (Max 150 ord.)";"enzymer";"";"![[Pasted image 20251128080420.png]] Diagrammet ovan visar koncentrationen av ämnet A som funktion av tiden i en reaktion där A omvandlas till ämnet B i närvaro av en låg koncentration av ett enzym som katalyserar reaktionen. Enzymet tillsattes omedelbart efter tiden t₀. Vi upprepar nu försöket på samma sätt, men med den skillnaden att vi nu tillsätter 10 gånger högre koncentration av enzymet omedelbart efter tiden t₀. Ange för var och en av tidpunkterna t₀, t₁ och t₂ om [A] kommer att vara högre, lägre eller oförändrad jämfört med i diagrammet ovan. Ange också en motivation till ditt svar vid varje tidpunkt. (Max 150 ord.)";"t₀ kommer att vara oförändrad. Detta pga att utgångskoncentrationen av A inte kommer att minska bara för att man adderar mer enzym. t₁ kommer vara lägre. Detta pga att enzymet katalyserar reaktionen den kommer ske mycket snabbare A kommer att bildas till B snabbare när man tillsätter mer enzym därför sänks koncentrationen av A snabbare. t₂ kommer även den att vara oförändrad eftersom man i kurvan ser att reaktionen vid den tidpunkten uppnått jämvikt (koncentrationen förändras inte). Enzymer påverkar inte jämviktskonstanten alltså vid vilket förhållande mellan koncentrationerna av A och B som reaktionshastigheten av A→B och B→A är lika. Därför kommer koncentrationen av A vid jämvikt (t₂) inte att påverkas av ökad koncentration av enzym."
"2021-12-16";"29";"Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ribulos 5-fosfat kan bildas i både den oxidativa och icke-oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. B: I röda blodkroppar är pentosfosfatvägen essentiell för att upprätthålla ett funktionellt glutation-system och därmed ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar. C: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla. D: Pentosfosfatvägens samtliga reaktioner sker i cytoplasman. Rätt svar";"pentosfosfatvägen";"";"Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ribulos 5-fosfat kan bildas i både den oxidativa och icke-oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. B: I röda blodkroppar är pentosfosfatvägen essentiell för att upprätthålla ett funktionellt glutation-system och därmed ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar. C: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla. D: Pentosfosfatvägens samtliga reaktioner sker i cytoplasman. Rätt svar";"A, B och D"
"2021-12-16";"4";"När elektroner från NADH genom transport i NADH-Q oxidoreduktas når Q sker en konformationsförändring i komplexet som tillåter protontransport över mitokondriens inre membran. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar konformationsändringen behöver ha, varför den behöver ha den egenskapen samt ge ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (Max 75 ord.)";"elektrontransportkedjan";"";"När elektroner från NADH genom transport i NADH-Q oxidoreduktas når Q sker en konformationsförändring i komplexet som tillåter protontransport över mitokondriens inre membran. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar konformationsändringen behöver ha, varför den behöver ha den egenskapen samt ge ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (Max 75 ord.)";"När Q tar upp två elektroner kommer den innan upptaget av protoner att vara negativt laddad, Q²⁻. Eftersom den är negativt laddad kommer den då att interagera med aminosyror som har en laddning (kommer ske repulsion eller attraktion), därför krävs det att aminosyran som förmedlar konformationsändringen är positivt eller negativt laddad. Ett exempel på en sådan aminosyra är arginin (Arg) som är positivt laddad vid pH runt 7."
"2021-12-16";"16";"Which basic building blocks is the ribosome made of? / Vad är ribosomen huvudsakligen uppbyggd av?";"translation";"";"Which basic building blocks is the ribosome made of? / Vad är ribosomen huvudsakligen uppbyggd av?";"It is made of rRNA and proteins. rRNA is in the center of both the large subunit and the small subunit. The proteins are more in the periphery. As described the ribosome has a large and a small subunit. In prokaryotes the small subunit is 30S and the large is 50S they together form the 70S ribosome. In eukaryotes the ribosome is a bigger, the small subunit is 40S and the bigger is 60S they form the 80S ribosome. The small subunits is where the t-RNA´s anticodon pairs with the codon on the RNA strand, in the large subunit the peptide-bond is formed."
"2021-12-16";"22";"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (Max 120 ord.) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Ange summaformeln för de reaktioner som katalyseras av komplexet. C) En typ av reglering av komplexet är av feedforward-typ. Vad innebär feedforwardreglering, vad ger feedforwardreglering av komplexet och hur? Rita gärna.";"integrering-av-metabolismen";"";"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (Max 120 ord.) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Ange summaformeln för de reaktioner som katalyseras av komplexet. C) En typ av reglering av komplexet är av feedforward-typ. Vad innebär feedforwardreglering, vad ger feedforwardreglering av komplexet och hur? Rita gärna.";"a) Eftersom att den omvandlar pyruvat till acetyl-CoA ett irreversibelt steg glukoneogenes kan ej ske (eftersom pyruvat omvandlats). b) Pyruvat + CoA + NAD⁺ → Acetyl-CoA + CO₂ + NADH + H⁺ c) PDC kommer att feedforward-stimuleras av pyruvat. Feedforwardreglering innebär att en metabolit i något steg innan det aktuella steget kommer att reglera den aktuella reaktionen. Stor mängd pyruvat det finns tillräckligt pyruvat inhiberar PD-kinas (enzym som fosforylerar och därmed inhiberar PDC) PDC är ej fosforylerat och därmed aktivt. Pyruvatet signalerar alltså att det finns tillräckligt pyruvat bättre att omvandlas till acetyl-CoA för andra användningsområden."
"2021-12-16";"32";"cVilken typ av molekyler passerar lättast genom ett cellmembran? Välj ett alternativ: A: Små polära B: Laddade C: Stora polära D: Stora hydrofoba E: Små hydrofoba Rätt svar";"cellmembran";"";"cVilken typ av molekyler passerar lättast genom ett cellmembran? Välj ett alternativ: A: Små polära B: Laddade C: Stora polära D: Stora hydrofoba E: Små hydrofoba Rätt svar";"E"
"2021-12-16";"26";"Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar. Varför sker detta? Beskriv den molekylära mekanismen.";"betaoxidation";"";"Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar. Varför sker detta? Beskriv den molekylära mekanismen.";"Bildning av ketonkroppar sker vid svält/fasta men kan även ske vid diabetes typ 1. Vid båda dessa tillstånd kommer det finnas en låg nivå av insulin i blodet. Vid svält för att glukoshalten är mycket låg vid diabetes typ 1 för att pankreas ej kan producera insulin. Levern kommer att tolka de låga nivåerna av insulin som att kroppen svälter den kommer genomföra mycket glukoneogenes för att bilda glukos för att släppa ut till kroppens vävnader. Vid glukoneogenes används oxaloacetat när levern kör glukoneogenes i högvarv kommer den därför nästan helt ta slut. Den behövs även för att slås ihop med acetyl-CoA för att kunna påbörja citronsyracykeln. Vid avsaknad av oxaloacetat kommer därav acetyl-CoA att ansamlas den kommer då att brytas ner till ketonkroppar. Dessa är vattenlösliga (till skillnad från lipider) och kan därav ta sig igenom blod-hjärnbarriären. Hjärnan kan då omvandla ketonkropparna till acetyl-CoA och använda det som energi. Hjärnan tar dock endast upp dessa vid svält (då finns ju ingen glukos i blodet) men inte vid diabetes (då är glukoshalten hög). Bildningen av ketonkroppar är alltså ett sätt att se till att hjärnan får energi vid svält. Vid svält kan andra celler bilda energi m.h.a lipider men det kan inte hjärnan eftersom dessa inte kan passera blod-hjärnbarriären. Vid svält (lågt glukos) måste därför hjärnan få energi på annat sätt än glukos. Detta sker genom bildningen av ketonkroppar."
"2021-12-16";"12";"Vid initiering av RNA-polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilket/vilka påstående(n) om denna process stämmer? Välj ett eller flera alternativ: A: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIE binder till TATA-boxen. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. Rätt svar";"rna-syntes";"";"Vid initiering av RNA-polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilket/vilka påstående(n) om denna process stämmer? Välj ett eller flera alternativ: A: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIE binder till TATA-boxen. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. Rätt svar";"D"
"2021-12-16";"27";"Vilket/vilka av följande påståenden är helt korrekta avseende kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? Välj ett eller flera alternativ: A: Merparten av kroppens kolesterol härrör från födointag, ny-syntes av kroppens celler bidrar normalt i liten utsträckning. B: Kolesterol utsöndras normalt sett via levern (gallan) i form av gallsyror och, i mindre utsträckning, fritt kolesterol. C: Kroppens enda sätt att göra sig av med kolesterol är genom utsöndring via njurarna (efter konjugering till aminosyran glycin i levern). D: Kolesterolets funktioner inkluderar bl.a. att vara utgångsmaterial i syntesen av steriodhormoner.";"kolesterol";"";"Vilket/vilka av följande påståenden är helt korrekta avseende kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? Välj ett eller flera alternativ: A: Merparten av kroppens kolesterol härrör från födointag, ny-syntes av kroppens celler bidrar normalt i liten utsträckning. B: Kolesterol utsöndras normalt sett via levern (gallan) i form av gallsyror och, i mindre utsträckning, fritt kolesterol. C: Kroppens enda sätt att göra sig av med kolesterol är genom utsöndring via njurarna (efter konjugering till aminosyran glycin i levern). D: Kolesterolets funktioner inkluderar bl.a. att vara utgångsmaterial i syntesen av steriodhormoner.";"B och D"
"2021-12-16";"13";"Describe mechanistically how an antibiotic may interfere with transcription of a bacterial genome. / Beskriv en mekanism för hur antibiotika kan störa transkription av ett bakteriellt genom.";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"";"Describe mechanistically how an antibiotic may interfere with transcription of a bacterial genome. / Beskriv en mekanism för hur antibiotika kan störa transkription av ett bakteriellt genom.";"Antibiotics can work as repressors. They can bind in to the operator region of an operon and thereby inhibiting the transcription of the genes that the operon contains."
"2021-12-16";"17";"The coupling of ATP synthesis to a glycolytic reaction is described below. PEP + H₂O → pyruvate + Pi (ΔG = 78 kJ/mol) ADP + Pi → ATP + H₂O (ΔG = +55 kJ/mol) PEP + ADP → pyruvate + ATP (ΔG = 23 kJ/mol) Which of the following statements is correct for the reaction ADP + Pi → ATP + H₂O? Välj ett alternativ: A: The reaction is exergonic and thermodynamically unfavorable. B: The reaction is endergonic and thermodynamically favorable. C: The reaction is endergonic and thermodynamically unfavorable. D: The reaction is exergonic and thermodynamically favorable. Rätt svar";"termodynamik";"";"The coupling of ATP synthesis to a glycolytic reaction is described below. PEP + H₂O → pyruvate + Pi (ΔG = 78 kJ/mol) ADP + Pi → ATP + H₂O (ΔG = +55 kJ/mol) PEP + ADP → pyruvate + ATP (ΔG = 23 kJ/mol) Which of the following statements is correct for the reaction ADP + Pi → ATP + H₂O? Välj ett alternativ: A: The reaction is exergonic and thermodynamically unfavorable. B: The reaction is endergonic and thermodynamically favorable. C: The reaction is endergonic and thermodynamically unfavorable. D: The reaction is exergonic and thermodynamically favorable. Rätt svar";"D"
"2021-12-16";"23";"Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. Cytokrom C FADH₂ Fe i heme a₃ i komplex IV O₂";"elektrontransportkedjan";"";"Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. Cytokrom C FADH₂ Fe i heme a₃ i komplex IV O₂";"1. FADH₂ 2. Cytokrom C 3. Fe i heme a₃ i komplex IV 4. O₂"
"2021-12-16";"33";"Vilken/vilka av nedanstående transportörer är en antiport? Välj ett eller flera alternativ: A: Adeninnukleotidtranslokas B: CFTR (Cystisk fibros transmembrane conductance regulator) C: Na⁺/K⁺-pumpen D: GLUT4 (glukostransportör 4) Rätt svar";"transport-över-cellmembran";"";"Vilken/vilka av nedanstående transportörer är en antiport? Välj ett eller flera alternativ: A: Adeninnukleotidtranslokas B: CFTR (Cystisk fibros transmembrane conductance regulator) C: Na⁺/K⁺-pumpen D: GLUT4 (glukostransportör 4) Rätt svar";"A och C"
"2021-12-16";"24";"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande intermediärer: alfaketoglutarat, 3-fosfoglycerat, glyceraldehyd 3-fosfat, oxalacetat? 3-fosfoglycerat alfaketoglutarat glyceraldehyd 3-fosfat oxalacetat (Drag-och-släpp-fråga)";"glukosmetabolism";"";"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande intermediärer: alfaketoglutarat, 3-fosfoglycerat, glyceraldehyd 3-fosfat, oxalacetat? 3-fosfoglycerat alfaketoglutarat glyceraldehyd 3-fosfat oxalacetat (Drag-och-släpp-fråga)";"1. glyceraldehyd 3-fosfat 2. 3-fosfoglycerat 3. alfaketoglutarat 4. oxalacetat"
"2021-12-16";"10";"Fråga 10 Vilket/vilka av följande alternativ om DNA-replikation är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA-replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Opoisomeraser kan förändra ”linking number” hos DNA. D: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”.";"dna-replikation";"";"Fråga 10 Vilket/vilka av följande alternativ om DNA-replikation är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA-replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Opoisomeraser kan förändra ”linking number” hos DNA. D: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”.";"A & B"
"2021-12-16";"9";"Vid eukaryot DNA-replikation så spelar CMG-helikaset en viktig roll. Detta helikas består av tre delar: MCM, Gins och Cdc45. (Max 50 ord.) a. I vilken fas av cellcykeln binder MCM till replikations-origin? b. I vilken fas av cellcykeln binder Gins och Cdc45 till MCM? c. Varför är det viktigt att separera laddningen av MCM-helikaset från dess aktivering med hjälp av Gins och Cdc45?";"dna-replikation";"";"Vid eukaryot DNA-replikation så spelar CMG-helikaset en viktig roll. Detta helikas består av tre delar: MCM, Gins och Cdc45. (Max 50 ord.) a. I vilken fas av cellcykeln binder MCM till replikations-origin? b. I vilken fas av cellcykeln binder Gins och Cdc45 till MCM? c. Varför är det viktigt att separera laddningen av MCM-helikaset från dess aktivering med hjälp av Gins och Cdc45?";"a) I G1-fasen binder MCM m.h.a. ORC och laddningsfaktorerna Cdc6 och Cdt1. b) Ökad nivå av CDK (kinaser) bidrar till att binda Gins och Cdc45 i S-fasen. c) För att försäkra att replikationen bara sker en gång per cellcykel. Därför är nivåerna av CDK låga i G1 och stiger i S."
"2021-12-16";"34";"Plasmid DNA purified from colonies grown on blue/white screening plates was verified by electrophoresis. Samples in Lanes C and D are digested by enzyme for verification whilst Lanes A and B are non-digested samples. Select the correct description/descriptions based on the gel picture below. ![[Pasted image 20251128080404.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: The band in Lane A that migrates the furthest is in supercoiled form and we can predict its size by a comparison with the size markers. B: The sample in Lane C has the largest size of DNA because it displays the brightest intensity under UV light. C: By comparing Lanes C and D, we can infer that the sample in Lane D is a plasmid with an insert DNA whilst Lane C is an empty vector. D: By comparing Lanes A and B, we can infer that the sample in Lane B is a plasmid with an insert DNA whilst Lane A is an empty vector.";"plasmid";"";"Plasmid DNA purified from colonies grown on blue/white screening plates was verified by electrophoresis. Samples in Lanes C and D are digested by enzyme for verification whilst Lanes A and B are non-digested samples. Select the correct description/descriptions based on the gel picture below. ![[Pasted image 20251128080404.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: The band in Lane A that migrates the furthest is in supercoiled form and we can predict its size by a comparison with the size markers. B: The sample in Lane C has the largest size of DNA because it displays the brightest intensity under UV light. C: By comparing Lanes C and D, we can infer that the sample in Lane D is a plasmid with an insert DNA whilst Lane C is an empty vector. D: By comparing Lanes A and B, we can infer that the sample in Lane B is a plasmid with an insert DNA whilst Lane A is an empty vector.";"Rätt svar 1. C 2. D (Flersvarsfråga; i originalbilden är första påståendet felmarkerat, de två sista rättmarkerade.)"
"2021-12-16";"14";"Which of the following is/are true about bacterial transformation? / Vilket/vilka av nedanstående stämmer för bakteriell transformation? Välj ett eller flera alternativ: A: Competence is not required for all bacterial species. / Kompetens är inte nödvändigt för alla bakteriearter. B: The DNA is typically fragmented at the bacteriums surface. / DNA fragmenteras vanligtvis vid bakteriens yta. C: Transformation may be general or specialized. / Transformation kan vara generell eller specialiserad. D: The DNA may or may not need to integrate into the host genome. / DNA måste inte alltid integreras i värdens genom.";"rekombinant-dna-teknik";"";"Which of the following is/are true about bacterial transformation? / Vilket/vilka av nedanstående stämmer för bakteriell transformation? Välj ett eller flera alternativ: A: Competence is not required for all bacterial species. / Kompetens är inte nödvändigt för alla bakteriearter. B: The DNA is typically fragmented at the bacteriums surface. / DNA fragmenteras vanligtvis vid bakteriens yta. C: Transformation may be general or specialized. / Transformation kan vara generell eller specialiserad. D: The DNA may or may not need to integrate into the host genome. / DNA måste inte alltid integreras i värdens genom.";"B och D"
"2021-12-16";"20";"Ge ett exempel på och förklara mekanismen bakom en förändring i metabolismen som sker vid högintensivt muskelarbete för att vi ska bli bättre på att utföra anaerob glykolys framöver. (Max 120 ord.)";"glykolysen";"";"Ge ett exempel på och förklara mekanismen bakom en förändring i metabolismen som sker vid högintensivt muskelarbete för att vi ska bli bättre på att utföra anaerob glykolys framöver. (Max 120 ord.)";"Högintensivt muskelarbete kommer leda till syrebrist, när detta sker kommer transkriptionsfaktorn HIF-1 att aktiveras. Den kommer att stimulera ökad produktion av glukostransportörer, enzymer i glykolysen och även aktivera VEGF. VEGF ökar vaskulariseringen av vävnaden mer blodkärl. Detta gör att musklerna kommer i kontakt med fler blodkärl och därmed mer glukos. Den ökade mängden glukostransportörer gör att cellerna kan ta upp glukos i större mängder när det behövs. Ökad mängd enzymer i glykolysen gör att musklerna kan ta hand om glukoset och omvandla det till energi i större utsträckning när det behövs. Vid anaeroba förhållanden kan musklerna bara använda sig av glykolys genom HIF-1 blir de bättre på att ta upp glukos och bättre på att utnyttja den."
"2021-12-16";"30";"Vilket/vilket av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Xantinoxidas är ett viktigt enzym involverat i nedbrydning av purin-nukleotider. B: Delar av pyrimidinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Bindningen mellan nukleosiders sockerstruktur och kvävebas klyvs genom hydrolys när nukleosider bryts ned. D: Urinsyra (urat) innehåller merparten av de kväveatomer som ingår i purinbaser. Rätt svar";"nukleotidnedbrytning";"";"Vilket/vilket av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Xantinoxidas är ett viktigt enzym involverat i nedbrydning av purin-nukleotider. B: Delar av pyrimidinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Bindningen mellan nukleosiders sockerstruktur och kvävebas klyvs genom hydrolys när nukleosider bryts ned. D: Urinsyra (urat) innehåller merparten av de kväveatomer som ingår i purinbaser. Rätt svar";"A, B och D"
"2021-12-16";"15";"In order for the lagging strand to become one single continuous strand, the Okazaki fragments (OF) must undergo a maturation process. / För att den släpande strängen ska bli en kontinuerlig sträng behöver Okazakifragment genomgå en mognadsprocess. A) Which two enzymes are involved in bacterial OF maturation? B) Briefly describe their specific functions in the process.";"dna-replikation";"";"In order for the lagging strand to become one single continuous strand, the Okazaki fragments (OF) must undergo a maturation process. / För att den släpande strängen ska bli en kontinuerlig sträng behöver Okazakifragment genomgå en mognadsprocess. A) Which two enzymes are involved in bacterial OF maturation? B) Briefly describe their specific functions in the process.";"a) Polymeras 1 och DNA-ligas. b) Polymeras 1 har en 5-3-exonukleas-aktivitet, den kommer att bryta upp RNA-primerna på Okazakifragmenten i 5-3-riktning. Den kommer också byta ut RNAt mot korresponderande DNA. För att detta ska ske korrekt har den även en 3-5-exonukleas-aktivitet som kan bryta fosfodiesterbindningar om fel nukleotid sätts på. Ligaset kommer att reparera ""nicks"", alltså små mellanrum som kommer finnas mellan det nysyntetiserade DNAt som tagit primerns plats och det ""äldre"" DNAt. Detta gör ligaset genom att skapa en fosfodiesterbindning mellan nukleotiderna, detta sker med hjälp av ATP."
"2021-12-16";"21";"Förklara varför utbytet av ATP från en glukos som genomgår aerob katabolism inte alltid blir detsamma. (Max 120 ord.)";"integrering-av-metabolismen";"";"Förklara varför utbytet av ATP från en glukos som genomgår aerob katabolism inte alltid blir detsamma. (Max 120 ord.)";"Hur mycket ATP man får beror på vilken transportör som används för intaget av de 2 NADH till mitokondrien som tillverkats vid glykolys. Om glycerol-3-fosfatshunten används, där kommer NADH genom ett mellansteg donera sina elektroner till FAD som befinner sig i komplex 2 i elektrontransportkedjan. Därav kommer 2 st NADH inte att donera några elektroner till komplex 1 vilket skulle ha resulterat i utpumpandet av 2×4 väten som i sin tur skulle resulterat två mer ATP genererade. Om istället malat-aspartatshunten användas kommer inte två ATP att förloras. Där kommer NADH reducera oxaloacetat till malat → transporteras in i mitokondrien → omvända reaktionen sker → NAD⁺ i mitokondrien blir NADH → donerar elektroner till komplex 1 → inga protoner ""tappas"", två ""extra"" ATP."
"2021-12-16";"31";"Beskriv översiktligt hur heme bryts ner och utsöndras.";"heme";"";"Beskriv översiktligt hur heme bryts ner och utsöndras.";"Heme kommer först att bilda biliverdin sedan bildas bilirubin sedan bildas bilrubin. Bilirubin är en hydrofob molekul kan inte transporteras fritt i blodet därför kommer den i levern att konjugeras med två stycken syror, glukaronsyror bilrubin bildas som är amfipatisk och en mer vattenlöslig molekyl. Den kommer därmed att utsöndras genom gallan i levern → transporteras till tunntarmen → utsöndras slutligen i avföringen."
"2021-12-16";"25";"Vilken är den huvudsakliga funktionen av glykogen i levern respektive skelettmuskulaturen? Ange även den huvudsakliga orsaken till denna skillnad samt vilken slutprodukt som bildas vid fullständig glykogenolys i respektive vävnad.";"glykogen";"";"Vilken är den huvudsakliga funktionen av glykogen i levern respektive skelettmuskulaturen? Ange även den huvudsakliga orsaken till denna skillnad samt vilken slutprodukt som bildas vid fullständig glykogenolys i respektive vävnad.";"Glykogen i levern fungerar som en glukosreserv för blodet man vill kunna sänka blodglukosen om den är för hög glykogen bildas och kunna höja den om den är för låg glykogen bryts ner glukos släpps ut i blodet. I muskler fungerar glykogen som en glukosreserv för muskeln själv. Om det behövs ATP pga muskelarbete kommer glykogen att brytas ned och gå in i glykolysen. Anledningen till att bara levern kan skicka ut glukos till blodet är för att den har enzymet glukos-6-fosfatas i ER. Vid nedbrytning av glykogen kommer glukos-1-fosfat bildas → sedan isomeriseras detta m.h.a. fosfoglukosmutas (sker i både muskler och lever) till glukos-6-fosfat. Detta är den slutgiltiga produkt som bildas i glykogenolys i muskler → den kan gå in i glykolys eller andra metabola vägar. Glukos-6-fosfat kan dock inte transporteras ut ur cellerna. För att göra detta måste den omvandlas till glukos. Det är vad glukos-6-fosfatas-enzymet gör, den tar bort fosfatgruppen med hjälp av hydrolys. Då kan glukos släppas ut i blodet och transporteras till andra vävnader. Glukos är alltså slutprodukten i lever. Sammanfattat är alltså anledningen till varför glykogen har olika funktioner i muskler och lever för att lever innehåller enzymet glukos-6-fosfatas medan muskler inte innehåller detta enzym. Detta enzym möjliggör att glukos kan släppas ut i blodet och inte endast användas i den egna cellen."
"2021-12-16";"11";"Beskriv nukleosomens uppbyggnad (Nucleosome core particle). Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade.";"kromatin";"";"Beskriv nukleosomens uppbyggnad (Nucleosome core particle). Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade.";"Nukleosomen består av histon-proteiner och DNA-helix. I mitten av nukleosomen finns två kopior av histonproteinerna H2A, H2B, H3 och H4. Detta bildar alltså en oktamer. Sedan lindas DNA runt histonerna ungefär 1,75 varv, ca 100200 baspar långt. Sedan sätter sig en till histon, H1, utanpå DNA-strängen och oktameren för att stabilisera och motverka att strukturen lindas upp. Mellan två histoner kommer det finnas en fri bit av DNA som kallas linker-DNA."
"2021-12-16";"8";"Du har fått i uppgift att analysera proteiner i en lösning med hjälp av SDS-PAGE. (Max 150 ord) A) Förklara principen för metoden. B) Vad fyller SDS för funktion? C) Vilken egenskap hos proteinet används för separation?";"utforska-proteiner";"";"Du har fått i uppgift att analysera proteiner i en lösning med hjälp av SDS-PAGE. (Max 150 ord) A) Förklara principen för metoden. B) Vad fyller SDS för funktion? C) Vilken egenskap hos proteinet används för separation?";"A) Principen med SDS-PAGE är att man vill analysera proteiner avseende massa. Man använder först en molekyl som heter SDS, en negativt laddad molekyl som binder till proteiner. Ju större massa proteinet har desto större mängd SDS-molekyler binder resulterar i en större negativ laddning (jämfört med mindre proteiner). Sedan låter man dessa proteiner vandra genom en polyakrylamid-gel från en negativ elektrod till en positiv elektrod. Ju större negativ laddning desto större motstånd i gelen. Detta leder till att små proteiner vandrar längst och stora kortast. Då får man alltså en separation i gelen avseende storlek. B) SDS som beskrivet är en negativ molekyl som binder till protein funktionen är att skapa en laddningsskillnad mellan proteiner som korresponderar till storleken. C) Det är proteinernas massa som används för separation."
"2021-12-16";"35";"Du sätter upp en studie för att avgöra om människor som migrerar löper en ökad risk att utveckla schizofreni jämfört med icke-migranter. Din nollhypotes är således följande: ”Risken att utveckla schizofreni är densamma bland migranter och icke-migranter”. Du genomför studien, sammanställer resultaten och utför ett statistiskt test för att avgöra om den eventuella skillnaden är statistiskt signifikant. När kan du förkasta nollhypotesen med viss säkerhet? Välj ett alternativ: A: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. B: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. C: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0. D: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0.";"introduktionslaboration";"";"Du sätter upp en studie för att avgöra om människor som migrerar löper en ökad risk att utveckla schizofreni jämfört med icke-migranter. Din nollhypotes är således följande: ”Risken att utveckla schizofreni är densamma bland migranter och icke-migranter”. Du genomför studien, sammanställer resultaten och utför ett statistiskt test för att avgöra om den eventuella skillnaden är statistiskt signifikant. När kan du förkasta nollhypotesen med viss säkerhet? Välj ett alternativ: A: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. B: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. C: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0. D: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0.";"C"
"2021-12-16";"3";"Rita en dipeptid bestående av de två (olika) aminosyror från vars sidokedjor det inte går att bilda glukos. Dipeptiden befinner sig i en lösning med pH-värde 2. Ange vilka aminosyrorna är.";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Rita en dipeptid bestående av de två (olika) aminosyror från vars sidokedjor det inte går att bilda glukos. Dipeptiden befinner sig i en lösning med pH-värde 2. Ange vilka aminosyrorna är.";"![[Pasted image 20251128074813.png]] Ska stå Lysin, inte Lycin."
"2021-12-16";"7";"Briefly describe the RNA world hypothesis with an example. / Beskriv kortfattat RNA-världs-hypotesen genom ett exempel. (Max 100 words.)";"evolution";"";"Briefly describe the RNA world hypothesis with an example. / Beskriv kortfattat RNA-världs-hypotesen genom ett exempel. (Max 100 words.)";"The RNA world hypothesis describes how living things has gone from using only RNA as storage of genetic material and catalyzing chemical processes (ribozymes) to being close to solely depending on proteins to catalyze many important chemical processes. One example is the enzyme RNAse P which function is cleave the 5´ end of tRNA-molecules. In bacteria the enzyme consits of almost only RNA and very little proteins (which are not even essentiall to the function). In archea there is less RNA and more protein, and in eukaryotes proteins make up the largest part of the enzyme. This is aligned with the hypothesis."
"2021-12-16";"6";"Vilken/vilka av nedanstående faktorer leder till att hemoglobinets syrebindande förmåga minskar? Välj ett eller flera alternativ: A: Hög koncentration 2,3-BPG. B: Högt pH. C: Hög koncentration O₂. D: Hög koncentration CO₂.";"hemoglobin";"";"Vilken/vilka av nedanstående faktorer leder till att hemoglobinets syrebindande förmåga minskar? Välj ett eller flera alternativ: A: Hög koncentration 2,3-BPG. B: Högt pH. C: Hög koncentration O₂. D: Hög koncentration CO₂.";"A och D"
"2021-12-16";"2";"Ange en skillnad mellan mättade och omättade fettsyror avseende struktur och en skillnad avseende inverkan på fluiditeten hos cellens membran.";"lipider";"";"Ange en skillnad mellan mättade och omättade fettsyror avseende struktur och en skillnad avseende inverkan på fluiditeten hos cellens membran.";"Mättade fettsyror har inga dubbelbindningar därav är deras fettsyrekedjor raka strukturer. Omättade fettsyror har däremot en eller flera dubbelbindningar detta leder till en böjning i strukturen där dubbelbindningen sitter fettsyrorna blir inte helt raka strukturer utan böjda på olika sätt beroende på vart dubbelbindningarna sitter och om de har trans eller cis-konfiguration. Eftersom att de mättade fettsyrorna har raka fettsyrasvansar kan dessa packas mycket tätt fluiditeten i membranet minskar. Däremot kan de omättade fettsvansarna inte packas lika tätt på grund av att de inte är raka strukturer fluiditeten i membranet ökar."
"2023-12-18";"28";"Vilka två påståenden om heme är korrekta? (2p) A: Succinyl-CoA och glycin används vid hemesyntesen. B: Trypsin innehåller heme. C: Hememolekylen innehåller en magnesiumjon. D: Cytokrom C innehåller heme.";"heme";"";"Vilka två påståenden om heme är korrekta? (2p) A: Succinyl-CoA och glycin används vid hemesyntesen. B: Trypsin innehåller heme. C: Hememolekylen innehåller en magnesiumjon. D: Cytokrom C innehåller heme.";"A och D"
"2023-12-18";"5";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein baserat på laddning. (4p) (Max 200 ord) A) Beskriv vilken metod du skulle använda dig av och hur denna fungerar. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en förklaring till hur denna fungerar.";"utforska-proteiner";"";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein baserat på laddning. (4p) (Max 200 ord) A) Beskriv vilken metod du skulle använda dig av och hur denna fungerar. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en förklaring till hur denna fungerar.";"a) Jonbyteskromotografi. Efter att ha lösgjört proteinerna i homogenisat går reningsmetoden ut på att man för proteinlösningen genom en kolonn som innehåller kulor som antingen är positivt eller negativt laddade beroende på proteinets laddning som man vill ha ut. En katjonsbytare är negativt laddade kulor i kolonnen som kommer att attrahera positivt laddade proteiner från fasen man för igenom medan en anjonbytare däremot är positivt laddade kulor som kommer att attrahera negativt laddade proteiner. Det är proteinets totala laddning som selekteras. Sedan kan en buffert eller salt användas för att eluera proteinerna från de laddade kulorna i kolonnen för vidare analys. b) För att analysera storleken hade jag valt SDS page som är en elektrofores-metod där man först blandar i ämnet SDS (sodum dodecyl sulfate) som är negativt laddade molekyler som kommer att binda till aminosyrorna och slå ut proteinets tidigare laddning. Proteinetet kommer att binda SDS baserat på hur stort det är, ju större protein desto mer negativt laddat då fler aminosyror laddas av SDS och proteinerna får vandra i ett elektriskt fält där de minsta vandrar längst mot positiv pol då de hindras minst av de steriska hindrena i polyakrylamid-gelen. Separation map STORLEK"
"2023-12-18";"18";"Redogör för begreppet entalpi samt för hur den kan användas för att förutse tendensen för att en viss biokemisk reaktion att ske. (4p)";"termodynamik";"";"Redogör för begreppet entalpi samt för hur den kan användas för att förutse tendensen för att en viss biokemisk reaktion att ske. (4p)";"Entalpi (H) betyder energiinnehållet i en reaktion. Entalpi beror på bindningar som finns i de ämnen som är delaktiga i reaktionen och vilken art bindningarna har. I en exoterm reaktion kommer energiinnehållet minska eftersom energi släpps ut. Om ΔH är negativ för en reaktion är den exoterm och kan därmed ses som fördelaktig. När energi, t.ex. i form av värme, släpps ut till omgivningen kan det öka entropin i molekyler som finns runtom, vilket är fördelaktigt enligt termodynamikens andra lag. (Om temperaturen och trycket är konstant kan H tillsammans med systemets parametrar användas för att beräkna den fria energin. ΔG = ΔH TΔS. Om ΔG är negativ är reaktionen spontan och benägen att ske.)"
"2023-12-18";"1";"I celler är vatten lösningsmedel. Förklara ur bindningssynpunkt varför detta är fördelaktigt. (4p) (Max 100 ord.)";"kemiska-bindingar";"";"I celler är vatten lösningsmedel. Förklara ur bindningssynpunkt varför detta är fördelaktigt. (4p) (Max 100 ord.)";"Vatten är en polär molekyl och har en dipol eftersom syret är mer elektronegativt än de två vätena. Polariteten gör att vattenmolekyler kan interagera med både positivt laddade molekyler och negativa laddade molekyler som finns i celler. Vid interaktioner med positivt laddade joner kommer den mer elektronegativa syret interagera med jonerna. I interaktioner med negativt laddade joner kommer istället väterna interagera. Vatten kan således bilda hydratiseringsskal runt joner som är essentiella för cellfunktion. Vatten har hög dielektricitetskonstant som gör att alltför starka jonbindningar inte bildas till ämnen, så att joner kan fortfarande utnyttjas i cellulära processer vid behov."
"2023-12-18";"19";"Två fördelar med att mäta den initiala hastigheten för en reaktion, V₀, är att i början av en reaktion … (2p) A: kan produktinhibering inte påverka hastigheten. B: är förändringar i [S] försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. C: har variationer av [S] inte någon effekt på V₀. D: är förändringar i Kₘ försumbara, så Kₘ kan behandlas som en konstant.";"enzymer";"";"Två fördelar med att mäta den initiala hastigheten för en reaktion, V₀, är att i början av en reaktion … (2p) A: kan produktinhibering inte påverka hastigheten. B: är förändringar i [S] försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. C: har variationer av [S] inte någon effekt på V₀. D: är förändringar i Kₘ försumbara, så Kₘ kan behandlas som en konstant.";"A och B"
"2023-12-18";"29";"Redogör för hur ATP-syntaset fungerar. (4p) (Max 150 ord.)";"elektrontransportkedjan";"";"Redogör för hur ATP-syntaset fungerar. (4p) (Max 150 ord.)";"ATP-syntaset utnyttjar protongradienten som bildades i elektrontransportkedjan. Dess F₀-del finns i mitokondriens inre membran och har en a-subenhet som innehåller två hydrofila halvkanaler: mot mellanmembranutrymmet (MMU) respektive matrix. a-subenheten interagerar med en c-subenhet (som finns i en ring) som har en negativt laddad aspartat- eller glutamatrest. En proton kan komma in i halvkanalen mot MMU och interagera med aminosyraresten i c-subenheten. Neutralisering gör att c-subenheten roterar en enhet medsols. Därmed kan en proton komma in mot halvkanalen mot matrix och frisättas i matrix. F₀ är kopplad till F₁-delen i matrix via en γ-stjälk. F₁ har 3 alfa- och 3 betasubenheter i en ring. Betasubenheterna bildar ATP och antar tre konformationer: Loose (där ADP + Pi binder), Tight (där ATP bildas) och Open (där ATP frisläpps och en ny ADP + Pi kan binda in). Den roterande γ-stjälken kan leda till konformationsändringarna i betasubenheterna. 3 ATP bildas per varv."
"2023-12-18";"4";"What does cooperative binding mean? Explain this in the context of hemoglobin. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max 100 words)";"hemoglobin";"";"What does cooperative binding mean? Explain this in the context of hemoglobin. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max 100 words)";"Cooperative binding means that the binding of an oxygen to hemoglobin makes it more likely for the molecule to bind more oxygen. This is because when an oxygen binds to hemoglobin the structure becomes less tense as one αβ-dimer rotates 15 degrees, which increases its affinity for oxygen at other binding sites. Release of an oxygen promotes also further release. Due to the cooperativity hemoglobin has a sigmoidal binding curve at different partial pressures of oxygen. Cooperativity enables hemoglobin to be a good oxygen transporter."
"2023-12-18";"16";"Vad är en hydropatiplot och vad ger den information om? (4p)";"cellmembran";"";"Vad är en hydropatiplot och vad ger den information om? (4p)";"En hydropatiplot kan ge information om det är sannolikt att en viss sekvens är en transmembran alfahelix och hur många alfahelixar det kan motsvara. En hydropatiplot kan skapas genom att undersöka en aminosyrasekvens från N- till C-terminal i intervaller om 20 (aminosyra 120, 221, 322 osv.). Detta beror på att det krävs 20 aminosyror för att gå genom cellmembranet. Man tittar på den energimässiga kostnaden för att flytta respektive aminosyra från en hydrofob till hydrofil miljö. Värdena plottas i en graf där energinivån är på y-axeln och intervallerna är på x-axeln. Man sätter gränsvärdet på 84 kJ/mol (kommer från transmembrana alfahelixar med känd struktur). Om en graf går över gränsvärdet en gång är det sannolikt en transmembran alfahelix. Om den går ovanför gränsvärdet flera gånger tyder det på flera transmembrana alfahelixar."
"2023-12-18";"22";"I glykolysen finns två reaktioner där ATP förbrukas och två reaktioner där ATP bildas. A) Vilka enzymer katalyserar dessa reaktioner? B) Förklara hur glykolysen trots detta ger ett nettoutbyte av två ATP. (4p) (Max 50 ord)";"glykolysen";"";"I glykolysen finns två reaktioner där ATP förbrukas och två reaktioner där ATP bildas. A) Vilka enzymer katalyserar dessa reaktioner? B) Förklara hur glykolysen trots detta ger ett nettoutbyte av två ATP. (4p) (Max 50 ord)";"A) Hexokinas (glukokinas) katalyserar första förbrukningen av ATP och fosfofruktokinas 1 katalyserar andra. Fosfoglyceratkinas katalyserar bildning av första ATP och pyruvatkinas katalyserar bildning av. B) Vid spjälning av fruktos 1,6 - bisfosfatas bildas två 3-kolsenheter, dihydroxyacetonfosfat och glyceraldehyd 3 fosfat. Dihydroxyacetonfosfat kommer bilda glyceraldehyd3fosfat och därmed går 2 glyceraldehyd3fosfat igenom"
"2023-12-18";"32";"Nämn det fullständiga namnet på en purin-nukleotid och ange i vilken molekyl kolskelettet respektive huvuddelen av molekylens kväveatomer slutligen hamnar då nukleotiden bryts ned. (2p) (Max 50 ord)";"nukleotidnedbrytning";"";"Nämn det fullständiga namnet på en purin-nukleotid och ange i vilken molekyl kolskelettet respektive huvuddelen av molekylens kväveatomer slutligen hamnar då nukleotiden bryts ned. (2p) (Max 50 ord)";"Adenosinmonofosfat (AMP). Kolskelettet samt huvuddelen av kvävet hamnar i urat."
"2023-12-18";"26";"I aerob katabolism kommer glukos att omvandlas i ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande metaboliter? (2p) 2-fosfoglycerat Alfaketoglutarat Glyceraldehyd 3-fosfat Malat";"integrering-av-metabolismen";"";"I aerob katabolism kommer glukos att omvandlas i ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande metaboliter? (2p) 2-fosfoglycerat Alfaketoglutarat Glyceraldehyd 3-fosfat Malat";"1. glyceraldehyd 3-fosfat 2. 2-fosfoglycerat 3. Alfaketoglutarat 4. Malat"
"2023-12-18";"12";"Hur kan en mutation i ett icke-kodande intron ge upphov till sjukdom, t.ex. talassemi? (4p)";"rna-syntes";"";"Hur kan en mutation i ett icke-kodande intron ge upphov till sjukdom, t.ex. talassemi? (4p)";"En mutation, t.ex. en punktmutation, kan leda till att en ny splice site bildas i mitten av en intron. När ett primärt mRNA senare ska genomgå splicing kan det nya splice-sitet leda till att en del av intronet blir kvar. Intronet kan t.ex. leda till att andra kodon finns kvar eller att stoppkodon blir kvar som leder till att felaktig genprodukt bildas när mRNA senare translateras. Detta kan i sin tur leda till proteiner som har defekter och inte kan utföra normal funktion."
"2023-12-18";"36";"You amplified a gene of interest using the blue/white screening method. You extracted plasmids from two bacterial colonies (one blue colony and one white colony), then performed restriction enzyme digestion and ran the samples on a gel as follows: blue uncut, blue cut, white uncut, white cut (see gel below). When imaging the gel, however, you notice there is a faint band in the blue cut sample (see arrow), which should not be there. Explain why the faint band should not be present in that sample and what are the possible sources of error for this outcome? Refer to the size/number of bands in comparison to the bands in the other lanes for your explanation. This questions needs to be answered in English. (4p) ![[Pasted image 20251129235214.png]]";"plasmid";"";"You amplified a gene of interest using the blue/white screening method. You extracted plasmids from two bacterial colonies (one blue colony and one white colony), then performed restriction enzyme digestion and ran the samples on a gel as follows: blue uncut, blue cut, white uncut, white cut (see gel below). When imaging the gel, however, you notice there is a faint band in the blue cut sample (see arrow), which should not be there. Explain why the faint band should not be present in that sample and what are the possible sources of error for this outcome? Refer to the size/number of bands in comparison to the bands in the other lanes for your explanation. This questions needs to be answered in English. (4p) ![[Pasted image 20251129235214.png]]";"The blue samples are samples with no DNA-insert. They have an intact lacZ-gene and are able to produce β-galactosidase which breaks down X-gal to a blue pigment. Since the blue colony samples have no DNA insert, the blue sample should show one band on the gel electrophoresis. The reason that the blue cut shows two bands can be because a mixed colony was chosen, meaning one that also had white colonies. This could likely be the case because the second band has a 1500 bp size which the second band of the ""white cut"" also has. Another possible reason for this odd result is contamination. The ""blue cut"" sample could possibly have been contaminated with white cut samples when pipetting or by improper labelling of tubes. This could be the case as the samples in both lanes show similar sizes (even the larger band is approximately the same size in both, 3000 bp)."
"2023-12-18";"27";"Vilka två effekter har insulin på fettmetabolismen? (2p) A: Inhiberar acetyl-CoA-karboxylas. B: Inhiberar syntes av fettsyror. C: Aktiverar acetyl-CoA-karboxylas. D: Aktiverar syntes av fettsyror.";"betaoxidation";"";"Vilka två effekter har insulin på fettmetabolismen? (2p) A: Inhiberar acetyl-CoA-karboxylas. B: Inhiberar syntes av fettsyror. C: Aktiverar acetyl-CoA-karboxylas. D: Aktiverar syntes av fettsyror.";"C och D"
"2023-12-18";"13";"Vilka två påståenden stämmer om trp-operonet? (2p) A: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att bryta ner aminosyran tryptofan. B: När det inte finns tryptofan i omgivningen, binder tryptofan-repressorn till operatorsekvensen i trp-operonet. C: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att syntetisera aminosyran tryptofan. D: Trp-repressorn kan blockera bindning av RNA-polymeras till promotorn.";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"";"Vilka två påståenden stämmer om trp-operonet? (2p) A: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att bryta ner aminosyran tryptofan. B: När det inte finns tryptofan i omgivningen, binder tryptofan-repressorn till operatorsekvensen i trp-operonet. C: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att syntetisera aminosyran tryptofan. D: Trp-repressorn kan blockera bindning av RNA-polymeras till promotorn.";"C och D"
"2023-12-18";"17";"Vilka två påståenden om glukostransportörer är korrekta? (2p) A: De utför aktiv transport. B: De faciliterar diffusion. C: De är bärarproteiner. D: De kan enbart transportera glukos i en riktning.";"transport-över-cellmembran";"";"Vilka två påståenden om glukostransportörer är korrekta? (2p) A: De utför aktiv transport. B: De faciliterar diffusion. C: De är bärarproteiner. D: De kan enbart transportera glukos i en riktning.";"B och C"
"2023-12-18";"23";"Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för flera enzymer. A) Vilka är enzymerna och hur påverkas deras aktivitet av fruktos 2,6-bisfosfat inbindning? B) Vad reglerar hur mycket fruktos 2,6-bisfosfat som bildas? (4p) (Max 75 ord.)";"";"";"Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för flera enzymer. A) Vilka är enzymerna och hur påverkas deras aktivitet av fruktos 2,6-bisfosfat inbindning? B) Vad reglerar hur mycket fruktos 2,6-bisfosfat som bildas? (4p) (Max 75 ord.)";"A) Fosfofruktokinas i glykolys aktiveras. Fruktos-1,6-bisfosfatas i glukoneogenes inhiberas. B) Fruktos 2,6-bisfosfat (F-2,6-BP) bildas av fosfofruktokinas 2 som ingår i ett bifunktionellt enzym med fruktos-2,6-bisfosfatas. Om insulin finns stimulerar det fosfoproteinfosfatas som defosforylerar och aktiverar fosfofruktokinas 2 vilket leder till ökad F-2,6-BP-produktion. Däremot, om glukagon finns, ger det upphov till cAMP-bildning som aktiverar proteinkinas A som fosforylerar fosfofruktokinas 2, som därmed inhiberar produktionen av fruktos-2,6-bisfosfat."
"2023-12-18";"33";"En fullt funktionell pentosfosfatväg är viktig för röda blodkroppars skydd mot väteperoxid. Varför? (2p) (Max 50 ord)";"pentosfosfatvägen";"";"En fullt funktionell pentosfosfatväg är viktig för röda blodkroppars skydd mot väteperoxid. Varför? (2p) (Max 50 ord)";"När glutationperoxidas tar hand om väteperoxid oxideras glutation. För att skyddet ska fortsätta finnas mot väteperoxid måste den reducerade formen av glutation återbildas med reduktionsmedlet NADPH. I röda blodkroppar saknas mitokondrier och NADPH kan endast bildas genom pentosfosfatvägen. Därför är en funktionell pentosfosfatväg viktig."
"2023-12-18";"24";"Vilka två av följande påståenden om glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Glykogen är kovalent bundet till enzymet glykogenin. B: Höga intracellulära nivåer av glukos-6-fosfat stimulerar glykogenolys i skelettmuskel. C: Skelettmuskel kan använda sig av glykogen som energikälla vid anaerobt arbete. D: Glykogenolys sker i huvudsak via så kallad hydrolys.";"glykogen";"";"Vilka två av följande påståenden om glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Glykogen är kovalent bundet till enzymet glykogenin. B: Höga intracellulära nivåer av glukos-6-fosfat stimulerar glykogenolys i skelettmuskel. C: Skelettmuskel kan använda sig av glykogen som energikälla vid anaerobt arbete. D: Glykogenolys sker i huvudsak via så kallad hydrolys.";"A och C"
"2023-12-18";"10";"På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. Fyra olika replikationsfaktorer är markerade på denna bild. Vad heter de olika faktorerna vid pil a, b, c och d? (4p) ![[Pasted image 20251129235154.png]]";"dna-replikation";"";"På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. Fyra olika replikationsfaktorer är markerade på denna bild. Vad heter de olika faktorerna vid pil a, b, c och d? (4p) ![[Pasted image 20251129235154.png]]";"a) CMG-helikas b) PCNA c) Replication protein A d) DNA-polymeras δ"
"2023-12-18";"9";"Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: En nukleosom innehåller 8 proteiner. B: Acetylering kan neutralisera positiva laddningar i histonsvansar. C: Med epigenetisk reglering menas reglering av genuttryck som endast beror av den nedärvda DNA-sekvensen. D: I en nukleosom lindas DNA 2,75 varv runt ett proteinkomplex.";"kromatin";"";"Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: En nukleosom innehåller 8 proteiner. B: Acetylering kan neutralisera positiva laddningar i histonsvansar. C: Med epigenetisk reglering menas reglering av genuttryck som endast beror av den nedärvda DNA-sekvensen. D: I en nukleosom lindas DNA 2,75 varv runt ett proteinkomplex.";"A och B"
"2023-12-18";"34";"3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA reduktas (HMG-CoA-reduktas) har en nyckelroll i reglering av cellernas kolesterolsyntes. Beskriv hur detta enzym regleras på transkriptionell nivå; den viktigaste reglermekanismen. (4p)";"kolesterol";"";"3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA reduktas (HMG-CoA-reduktas) har en nyckelroll i reglering av cellernas kolesterolsyntes. Beskriv hur detta enzym regleras på transkriptionell nivå; den viktigaste reglermekanismen. (4p)";"Transkriptionen regleras av Sterol Regulator Element Binding Protein (SREBP) som har en transkriptionsfaktordel mot cytosolen. Vid låg kolesterol flyttas SREBP från det endoplasmatiska retiklet till golgiapparaten. Här klyvs transkriptionsfaktordelen av SREBP av Golgi localized site 1 proteaset. Därefter klyver site 2-proteaset vid N-terminalen. Den N-terminala delen som har transkriptionsfaktorn binder till Sterol Regulator Element 1 som finns i promotorn av bland annat HMGR, som leder till en ökad transkription av HMGR. Själva transporten av SREBP till golgiapparaten, som också påverkar transkriptionen, regleras av Insig 1, Insig 2 och Scap. Vid låg kolesterolnivå kommer Insig inte binda till SREBPScap-komplexet. Insig bryts därmed ned i proteasomen och SREBPScap-komplexet kan interagera med COPII, som är involverade i vesiklar som transporteras till golgi. Men om kolesterol finns och det binder till SREBPScap-komplexet kommer en konformationsändring ske som gör att Insig kan binda in. Detta förhindrar interaktion med COPII. SREBP går inte med i vesiklar till golgi, vilket betyder att transkription av HMGR inte ökar när mycket kolesterol finns."
"2023-12-18";"14";"Wobble-effekten är en viktig aspekt av genetisk kodavläsning under translationen. Förklara vad wobble-effekten är och hur den bidrar till flexibiliteten i parningen mellan kodoner på mRNA och antikodonerna på tRNA. Diskutera även hur denna effekt kan bidra till tolerans mot vissa genetiska mutationer. (4p) (Max 150 ord)";"translation";"";"Wobble-effekten är en viktig aspekt av genetisk kodavläsning under translationen. Förklara vad wobble-effekten är och hur den bidrar till flexibiliteten i parningen mellan kodoner på mRNA och antikodonerna på tRNA. Diskutera även hur denna effekt kan bidra till tolerans mot vissa genetiska mutationer. (4p) (Max 150 ord)";"Wobble-effekten betyder att den första basen i ett antikodon kan binda till flera olika baser på den tredje basen av ett kodon. En kvävebas på tRNA-antikodon som har en sådan förmåga att binda till flera olika baser på den tredje basen i kodonet är inosin, som kan binda till uracil, cytosin och adenin. Att den första basen i antikodonet kan binda till flera baser leder till att ett tRNA kan binda till flera kodon på mRNA vilket ökar molekylens flexibilitet (en aminosyra kan kopplas till flera olika kodon). Wobble-effekten kan bidra till tolerans mot vissa genetiska mutationer, eftersom även om en mutation finns som gör att en annorlunda kvävebas finns, kan tRNA trots detta binda till det och binda korrekt aminosyra."
"2023-12-18";"20";"Vad är syftet med den katalytiska klyftan som finns i ett enzym? Redogör för två fördelar den katalytiska klyftan ger för katalys. (4p)";"enzymer";"";"Vad är syftet med den katalytiska klyftan som finns i ett enzym? Redogör för två fördelar den katalytiska klyftan ger för katalys. (4p)";"Den katalytiska klyftan är den del av enzymet som substratet binder in och som reaktionen kan katalyseras i. och övergångstillståndet kan stabilseras så att reaktionen kan ske snabbare. Den katalytiska klyftan är en väldigt liten del av enzymet och består av aminosyrarester i proteinet som ger en specificitet för enbart vissa molekyler att binda in, detta ökar specificiteten och hindrar andra potentiella reaktanter från att komma nära och interagera. Den utesluter bland annat vatten som hade hämmat många reaktioner genom sin polaritet. Dessutom kommer den katalytiska klyftan att införa svaga bindingar som stabiliserar övergångstillståndet och bildningen av produkt, ett fenomen som i vanliga fall hade krävt betydligt högre aktiveringsenergi för att kunna ske. Dvs som hade krävt högre energi i omlopp som hade satt molekylerna i rörelse så att de kom nära varandra tillräckligt ofta för att det ostabila övergångstillståndet hade kunnat ske. Den katalytiska klyftan av enzymet sänker därför aktiveringsenergin till reaktionen."
"2023-12-18";"30";"Beskriv med en reaktionsformel hur celler hanterar att syrgas ibland enbart tar upp en elektron. (2p) (Max 25 ord)";"elektrontransportkedjan";"";"Beskriv med en reaktionsformel hur celler hanterar att syrgas ibland enbart tar upp en elektron. (2p) (Max 25 ord)";"Superoxid + 2 H⁺ → H₂O₂ mha dismutas. (superoxid = O₂·⁻) (Väteperoxiden tas hand om av glutationperoxidas (2 H₂O₂ → O₂ + 2 H₂O, där 2 glutation oxideras))"
"2023-12-18";"15";"Lista fyra aspekter som är identiska för alla livsformer på jorden. (4p)";"evolution";"";"Lista fyra aspekter som är identiska för alla livsformer på jorden. (4p)";"1. Alla livsformer lagrar sin arvsmassa/genetiska information i nukleinsyror i form av RNA eller DNA. 2. Den grundläggande metabolismen i alla livsformer är liknande. 3. Livsformer använder ATP som energivaluta i sina celler. 4. Alla livsformer använder cofaktorer i sina enzymer."
"2023-12-18";"21";"Vilka två av nedanstående molekyler är beroende av en B-vitamin för sin syntes? (2p) A: Coenzym A B: Coenzym Q C: NADH D: ATP";"introduktion-till-metabolismen";"";"Vilka två av nedanstående molekyler är beroende av en B-vitamin för sin syntes? (2p) A: Coenzym A B: Coenzym Q C: NADH D: ATP";"A och C"
"2023-12-18";"31";"Ange det fullständiga namnet på ett kliniskt viktigt enzym som tillhör gruppen aminotransferaser, samt ange reaktionen enzymet katalyserar. (4p) (Max 50 ord)";"aminosyrametabolism";"";"Ange det fullständiga namnet på ett kliniskt viktigt enzym som tillhör gruppen aminotransferaser, samt ange reaktionen enzymet katalyserar. (4p) (Max 50 ord)";"Alanin aminotransferas (höga nivåer av detta tyder på leversjukdom). Den katalyserar följande reaktion: Alanin + α-ketoglutarat ⇌ Pyruvat + Glutamat."
"2023-12-18";"25";"Vilka två av nedanstående molekyler reglerar något enzym i citronsyracykeln? (2p) A: NADH B: Pyruvat C: Acetyl-CoA D: ADP";"citronsyracykeln";"";"Vilka två av nedanstående molekyler reglerar något enzym i citronsyracykeln? (2p) A: NADH B: Pyruvat C: Acetyl-CoA D: ADP";"A och D"
"2023-12-18";"11";"a) Vilken roll spelar DNA-polymeras epsilon? b) Hur kan PCNA påverka aktiviteten hos DNA-polymeras epsilon? (4p)";"dna-replikation";"";"a) Vilken roll spelar DNA-polymeras epsilon? b) Hur kan PCNA påverka aktiviteten hos DNA-polymeras epsilon? (4p)";"a) DNA-polymeras epsilon är involverad i DNA-replikation på leading strand. Det katalyserar påkopplingen av kvävebaser från 5' till 3'-riktning. Det har en 3' till 5' exonukleasaktivitet och kan ta bort om en felaktig bas har kopplats på (proofreading). b) PCNA (sliding clamp) ökar processiviteten hos DNA-polymeras genom att hålla det fastbundet till DNA-mallen. På så sätt ramlar DNA-polymeraset inte av och kan arbeta med ökad processivitet."
"2023-12-18";"8";"Glykaner kan vara O-länkade och N-länkade. Förklara kortfattat vad detta innebär på molekylär nivå. (4p) (Max 150 ord)";"kolhydrater";"";"Glykaner kan vara O-länkade och N-länkade. Förklara kortfattat vad detta innebär på molekylär nivå. (4p) (Max 150 ord)";"O-länkade glykaner betyder att kolhydraten är länkad via syre i sidokedjan av serin eller threonin. N-länkade betyder att kolhydraterna är länkade via kvävet i sidokedjan av asparagin."
"2023-12-18";"35";"I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värde på 0,03 och ett 95% konfidensintervall på 617 mmHg. Nollhypotesen är att det inte finns någon skillnad i medelvärde i blodtryck mellan de två grupperna. Vilka två påståenden är korrekta baserat på dessa resultat? (2p) Välj ett eller flera alternativ: A: Ett p-värde på 0,03 innebär att det 95%-iga konfidensintervallet inte inkluderar nollan. B: Nollhypotesen kan förkastas. C: Det är 95% säkert att behandlingsgruppen har mellan 6 och 17 mmHg lägre blodtryck jämfört med placebogruppen. D: Det finns ingen statistisk signifikant skillnad i blodtryck mellan grupperna.";"introduktionslaboration";"";"I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värde på 0,03 och ett 95% konfidensintervall på 617 mmHg. Nollhypotesen är att det inte finns någon skillnad i medelvärde i blodtryck mellan de två grupperna. Vilka två påståenden är korrekta baserat på dessa resultat? (2p) Välj ett eller flera alternativ: A: Ett p-värde på 0,03 innebär att det 95%-iga konfidensintervallet inte inkluderar nollan. B: Nollhypotesen kan förkastas. C: Det är 95% säkert att behandlingsgruppen har mellan 6 och 17 mmHg lägre blodtryck jämfört med placebogruppen. D: Det finns ingen statistisk signifikant skillnad i blodtryck mellan grupperna.";"A och B"
"2023-12-18";"3";"Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för två enzymer. Förklara vilka egenskaper de aminosyror som binder till fruktos 2,6-bisfosfat behöver ha och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 75 ord.)";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för två enzymer. Förklara vilka egenskaper de aminosyror som binder till fruktos 2,6-bisfosfat behöver ha och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 75 ord.)";"Fruktos 2,6-bisfosfat har två fosfatgrupper som kan ha negativt laddade syren. För att binda in ämnet och skapa en elektrostatisk attraktion (jonbindning), kan det därmed vara fördelaktigt att ha aminosyror som har en positiv laddning. Lysin och arginin är två positivt laddade aminosyror som kan vara lämpliga."
"2023-12-18";"7";"Den vanligaste formen som DNA antar kallas B-DNA. Vilka två påståenden stämmer om denna? (2p) A: Den är vänstervriden. B: Det är mellan 1010,4 baspar per varv av helixen. C: Avståndet mellan baspar är cirka 3,4 Å. D: De två strängarna parallella.";"nukleotider";"";"Den vanligaste formen som DNA antar kallas B-DNA. Vilka två påståenden stämmer om denna? (2p) A: Den är vänstervriden. B: Det är mellan 1010,4 baspar per varv av helixen. C: Avståndet mellan baspar är cirka 3,4 Å. D: De två strängarna parallella.";"B och C"
"2023-12-18";"6";"a) Rita strukturen för kolesterol. b) Visa hur kolesterol orienteras i ett membran. OBS! Den här frågan ska besvaras på separat papper som kommer att skannas in och bifogas tentamen. (4p)";"lipider";"";"a) Rita strukturen för kolesterol. b) Visa hur kolesterol orienteras i ett membran. OBS! Den här frågan ska besvaras på separat papper som kommer att skannas in och bifogas tentamen. (4p)";"se 2023-12-18-0114-EES"
"2023-12-18";"2";"Rangordna nedanstående aminosyror efter stigande polaritet (2p) Cystein Lysin Metionin Treonin";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Rangordna nedanstående aminosyror efter stigande polaritet (2p) Cystein Lysin Metionin Treonin";"1. Metionin 2. Cystein 3. Treonin 4. Lysin"
"2024-05-15";"28";"Vilka två av följande faktorer stimulerar glykogenes (syntes av glykogen) i en skelettmuskelcell? (2p) A: Förhöjda koncentrationer av ATP i muskelcellen. B: Förhöjda koncentrationer av AMP i muskelcellen. C: Förhöjda koncentrationer av glukos-6-fosfat i muskelcellen. D: Intracellulär signalering inducerad av hormonet insulin.";"glykogen";"";"Vilka två av följande faktorer stimulerar glykogenes (syntes av glykogen) i en skelettmuskelcell? (2p) A: Förhöjda koncentrationer av ATP i muskelcellen. B: Förhöjda koncentrationer av AMP i muskelcellen. C: Förhöjda koncentrationer av glukos-6-fosfat i muskelcellen. D: Intracellulär signalering inducerad av hormonet insulin.";"C och D"
"2024-05-15";"5";"Du jobbar på ett labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein med hjälp av affinitetskromatografi. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med hjälp av affinitetskromatografi. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en kortfattad förklaring till hur denna fungerar. (4p) (Max 200 ord.)";"utforska-proteiner";"";"Du jobbar på ett labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein med hjälp av affinitetskromatografi. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med hjälp av affinitetskromatografi. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en kortfattad förklaring till hur denna fungerar. (4p) (Max 200 ord.)";"3 av 4 poäng: A) Affinitetskromatografi är rening baserad på egenskaper hos proteinet. Ett exempel är att man kan sätta på 6 stycken histidin på proteinet på DNA nivå, sk 6xHis. Histidin har en hög affinitet för nickeljoner som man kan lägga i kolonnen. När man häller ner proteinblandningen kommer histidin att binda till nickeljonerna vilket gör att proteinet stannar i kolonnen. För att sedan få proteinet att släppa kan man använda sig av imidazol som har ännu högre affinitet för nickeljonerna för att eleduera ut proteinet. B) Man kan använda sig av SDS-Page. Då utsätter man proteinet för SDS molekyler som kommer att binda in till det. SDS molekylerna är negativt laddade och ju större protein, ju fler SDS molekyler kommer binda in, ju mer negativt laddat blir det. Sedan använder man sig av gelelektrofores (Page) för att få proteinet att röra på sig i ett elektromagnetiskt fält. Större protein kommer röra sig långsammare medan snabbare rör sig fortare. DVS Störst, sist."
"2024-05-15";"18";"En ändring i entropi kan vara den huvudsakliga drivkraften för en reaktion. Nämn två sätt att ändra entropin i biokemiska reaktioner. Förklara med exempel. (4p) (Max 150 ord.)";"termodynamik";"";"En ändring i entropi kan vara den huvudsakliga drivkraften för en reaktion. Nämn två sätt att ändra entropin i biokemiska reaktioner. Förklara med exempel. (4p) (Max 150 ord.)";"3 av 4: Entropi är ett mått på oordning. Enligt deltaG= deltaH - T deltaS. Vilket betyder att förändring i S/entropi kan man få utifrån (deltaH - deltaG)/T. Alltså kan man ändra entropin genom att ändra temperaturen. Då temperatur är mått på värmeenergi. Högre temperatur betyder mer oordning. Man kan ändra entropin genom att katalysera en reaktion med ett enzym. Enzymet minskar aktiveringsenergin som behövs för att reaktionen ska se."
"2024-05-15";"1";"Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. (2p) Svagast → Starkast: A: van der Waals B: väte C: dubbel D: peptid";"kemiska-bindingar";"";"Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. (2p) Svagast → Starkast: A: van der Waals B: väte C: dubbel D: peptid";"(svar angivet i drag-och-släpp-formulär) Totalpoäng: 2"
"2024-05-15";"19";"Ett enzym uppvisar Michaelis-Mentens kinetik. A) Redogör för hur man i ett V mot [S] diagram kan avläsa de två konstanterna Km och Vmax. B) Förklara vad som händer med Km respektive Vmax om man tillsätter en icke-kompetitiv hämmare? (4p) (Max 150 ord.)";"enzymer";"";"Ett enzym uppvisar Michaelis-Mentens kinetik. A) Redogör för hur man i ett V mot [S] diagram kan avläsa de två konstanterna Km och Vmax. B) Förklara vad som händer med Km respektive Vmax om man tillsätter en icke-kompetitiv hämmare? (4p) (Max 150 ord.)";"A) Vmax kan avläsas som det y-värde på grafen som fås då substratoncentrationen går mot oändligheten dvs det y-värde som fås när grafen planar ut allt eftersom substratkoncentrationen ökar. Km kan avläsas som det x-värde som grafen antar då grafens y-värde är halva Vmax dvs hälften av grafens maxvärde. B) Det som sker är att Vmax kommer minska eftersom en icke-kompetitiv hämmare binder allostert till enzymet oavsett om substrat bundit eller ej och genför en konformationsändring i enzymet som gör att enzymet får sämre katalytisk förmåga dvs Vmax sänks. Däremot kommer Km att vara oförändrat då inhibitorn är oberoende av substratkoncentrationen eftersom den binder till enzymet oavsett om substrat finns och oavsett hur mycket/lite substrat som finns."
"2024-05-15";"29";"Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolismen är korrekta? (2p) A: Skelettmuskel kan bara bryta ned glykogenet till glukos-6-fosfat eftersom muskelcellerna saknar enzymet glukos-6-fosfatas. B: Glykogenin är ett enzym som krävs för att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel. C: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet glukagon induceras glykogenolys i cellen. D: Glykogen upplagrat i skelettmuskel kan användas för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider.";"glykogen";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolismen är korrekta? (2p) A: Skelettmuskel kan bara bryta ned glykogenet till glukos-6-fosfat eftersom muskelcellerna saknar enzymet glukos-6-fosfatas. B: Glykogenin är ett enzym som krävs för att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel. C: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet glukagon induceras glykogenolys i cellen. D: Glykogen upplagrat i skelettmuskel kan användas för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider.";"A och B"
"2024-05-15";"4";"How does the partial pressure of oxygen influence binding and release of oxygen to/from hemoglobin? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words).";"hemoglobin";"";"How does the partial pressure of oxygen influence binding and release of oxygen to/from hemoglobin? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words).";"If the partial pressure is high it means that there is a high concentration of oxygen in the area which will increase the chance of oxygen binding to the hemoglobin. Once one oxygen has binded to the hemoglobin, the affinity for oxygen increases in its subunits. This occurs in the lungs, where the concentration of oxygen is very high. On the other hand, in the tissues where oxygen is needed, the partial pressure of oxygen is low which will lead to oxygen being released from the hemoglobin. Leading to the hemoglobin going inte T-state which facilitates oxygen release."
"2024-05-15";"16";"Det finns tre olika typer av integrala cellmembranproteiner. Vilka? Beskriv kortfattat hur de är uppbyggda. (4p)";"cellmembran";"";"Det finns tre olika typer av integrala cellmembranproteiner. Vilka? Beskriv kortfattat hur de är uppbyggda. (4p)";"Alfa-helixar, dessa är vanliga alfahelixar som bildar en tunnel då hydrofob R-grupp är riktad utåt. Beta barrels, flera stycken antiparallella Beta flak som bildar en stor tunnel, likt en tunna. Därifrån namnet. Partiellt integrerade, dessa är alfahelixar som sitter bland de hydrofoba svansarna i membranet och sticker ut från membranet. Kan finnas på båda sidorna av membranet."
"2024-05-15";"22";"Vilka två av nedanstående molekyler är mest reducerade? (2p) A: pyruvat B: glyceraldehyd 3-fosfat C: fruktos 6-fosfat D: citrat";"glykolysen";"";"Vilka två av nedanstående molekyler är mest reducerade? (2p) A: pyruvat B: glyceraldehyd 3-fosfat C: fruktos 6-fosfat D: citrat";"B & C"
"2024-05-15";"32";"Vilken molekyl utgör substratet som går in i pentosfosfatvägens oxidativa fas och vilka tre olika slutprodukter bildas i denna fas? (2p) Max 20 ord.";"pentosfosfatvägen";"";"Vilken molekyl utgör substratet som går in i pentosfosfatvägens oxidativa fas och vilka tre olika slutprodukter bildas i denna fas? (2p) Max 20 ord.";"1.5 av 2: Glukos-6-fosfat går in i pentosfosfatvägen. I den oxidativa fasen bildas NADPH, Ribulose-5-fosfat och Ribos-5-fosfat."
"2024-05-15";"26";"Vilka två av nedanstående enzymer katalyserar en reaktion där det sker en dekarboxylering? (2p) A: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas B: Alfaketoglutaratdehydrogenas C: Pyruvatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas";"citronsyracykeln";"";"Vilka två av nedanstående enzymer katalyserar en reaktion där det sker en dekarboxylering? (2p) A: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas B: Alfaketoglutaratdehydrogenas C: Pyruvatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas";"B och C"
"2024-05-15";"12";"Lac-operonet kodar för genprodukter som behövs för att bryta ner laktos. Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Allolaktos bildas av laktos och binder till CAP. B: cAMP bildas i frånvaro av glukos och binder till CAP. C: cAMP bildas i närvaro av glukos och binder till CAP. D: Allolaktos bildas av laktos och binder till lac-repressorn.";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"";"Lac-operonet kodar för genprodukter som behövs för att bryta ner laktos. Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Allolaktos bildas av laktos och binder till CAP. B: cAMP bildas i frånvaro av glukos och binder till CAP. C: cAMP bildas i närvaro av glukos och binder till CAP. D: Allolaktos bildas av laktos och binder till lac-repressorn.";"B och D"
"2024-05-15";"36";"I vilken ordning genomförs stegen nedan när en gen ska amplifieras med rekombinant DNA-teknologi? (2p) amplifiering gelelektrofores plasmidrening transformation";"rekombinant-dna-teknik";"";"I vilken ordning genomförs stegen nedan när en gen ska amplifieras med rekombinant DNA-teknologi? (2p) amplifiering gelelektrofores plasmidrening transformation";"1. transformation 2. amplifiering 3. plasmidrening 4. gelelektrofores"
"2024-05-15";"27";"I elektrontransportkedjan förflyttas elektroner mellan olika komponenter. Redogör för två förutsättningar för att förflyttningen ska fungera. (4p) (Max 80 ord.)";"elektrontransportkedjan";"";"I elektrontransportkedjan förflyttas elektroner mellan olika komponenter. Redogör för två förutsättningar för att förflyttningen ska fungera. (4p) (Max 80 ord.)";"Redoxpotentialen måste vara högre hos den som tar emot elektronen. Tex när FMNH2 lämnar över elektronerna till Q. Det fungerar då Q har en högre redoxpotential än FMNH2. Det är viktigt att påpeka att de olika komponenterna måste vara tillräckligt nära varandra också för att plocka upp elektronerna. Det måste också finnas en molekyl som tillslut plockar upp elektronerna, denna är O2. Syre kommet plocka upp elektronerna och reagera med protoner för att bilda vatten."
"2024-05-15";"13";"Beskriv nukleosomens (Nucleosome core particle) uppbyggnad. Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade. (4p)";"kromatin";"";"Beskriv nukleosomens (Nucleosome core particle) uppbyggnad. Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade. (4p)";"Nukleosomen består av en kärna (en oktamer) på 8 histoner (2st H2A, 2st H2B, 2st H3, 2st H4). Den har också 146 baspar DNA som är lindat 1,75 varv runt oktameren. Dessutom ligger histonen H1 (som inte är lika konserverad som övriga ovannämda histoner) utanpå kärnan och binder till linker DNA (DNAt mellan nukelosomerna) och stabiliserar nukleosomen. H3 och H4 har även N-terminala svansar som ligger runt DNAt som är lindat runt oktameren och reglerar DNAts packning till nukleosomkärnan."
"2024-05-15";"17";"Proteinet på bilden utför transport. ![[Pasted image 20251129235458.png]] A) Ange vilken grupp av transportörer proteinet tillhör och vad som karaktäriserar denna grupp av transportörer? B) I vilket av cellens membran finns transportören? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord.";"transport-över-cellmembran";"";"Proteinet på bilden utför transport. ![[Pasted image 20251129235458.png]] A) Ange vilken grupp av transportörer proteinet tillhör och vad som karaktäriserar denna grupp av transportörer? B) I vilket av cellens membran finns transportören? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord.";"A) Antiport som är en aktiv transportör av 2 olika föreningar som transporteras åt olika håll (en in och en ut) B) I mitokondriets inre membran C) Den elektrokemiska gradienten av vätejoner mellan MMU och matrix."
"2024-05-15";"23";"En morgon när du var sen blev du tvungen att springa för att hinna med spårvagnen. Efter ett tag smärtade lårmusklerna och kort därefter blev de stumma. Förklara vad som har hänt metaboliskt på molekylär nivå och varför det har inträffat. (4p) (Max 100 ord.)";"glukosmetabolism";"";"En morgon när du var sen blev du tvungen att springa för att hinna med spårvagnen. Efter ett tag smärtade lårmusklerna och kort därefter blev de stumma. Förklara vad som har hänt metaboliskt på molekylär nivå och varför det har inträffat. (4p) (Max 100 ord.)";"Det har skett då man har sprungit, en snabb explosiv aktivitet, så har lite syre blivit upptagit. Detta har lett till att glykolysen som skett i musklerna har skett i anaeroba förhållanden. Detta har lett till att pyruvat som är slutprodukten i glykolysen, har reagerat med NADH (som behöver släppa av elektronerna till syret i elektrontransportkedjan vid aeroba förhållanden) som bildats tidigare i processen, katalyserat av laktatdehydrogenas för att bilda laktat, så NAD+ kan återbildas. Laktat i sin tur har sänkt pH:t i musklerna vilket har lett till smärtan. Laktatet kommer sedan transporteras till levern för att omvandlas till glukos."
"2024-05-15";"33";"Beskriv schematiskt hur nedbrytningen och utsöndringen av heme går till, samt ange i vilka organ/vävnader de olika stegen sker. (4p)";"heme";"";"Beskriv schematiskt hur nedbrytningen och utsöndringen av heme går till, samt ange i vilka organ/vävnader de olika stegen sker. (4p)";"Erytrocyter bryts ned i mjälten. Från erytrocyterna kommer hemoglobin att frisläppas. Hemoglobinet bryts ned till fria aminosyror och heme. Heme kommer att brytas ned till biliverdin som kommer att omvandlas till bilirubin. Bilirubin är okonjugerat dvs fettlöslig och ej vattenlöslig, därför kommer det transporteras till levern med hjälp av albumin. I levern kommer bilirubin att konjugera genom att bindas med gluturonsyra vilket kommer att göra den amfipatisk och vattenlöslig. Det konjugerade bilirubinet kommer sedan utsöndras från levern med gallan till tarmarna. Där det sedan kan utsöndras genom avföring."
"2024-05-15";"24";"Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter: fosfoenolpyruvat laktat oxalacetat succinat Vägar: citronsyracykeln Coricykeln glukoneogenes glykolysen";"glukoneogenes";"";"Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter: fosfoenolpyruvat laktat oxalacetat succinat Vägar: citronsyracykeln Coricykeln glukoneogenes glykolysen";"fosfoenolpyruvat: glykolysen laktat: Coricykeln oxalacetat: glukoneogenes succinat: citronsyracykeln"
"2024-05-15";"10";"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonCrick helix. Vilka två påståenden är korrekta? (2p) A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning från 5´ till 3´. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är högervriden.";"nukleotider";"";"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonCrick helix. Vilka två påståenden är korrekta? (2p) A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning från 5´ till 3´. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är högervriden.";"C och D"
"2024-05-15";"9";"Initiering av eukaryot DNA-replikation är en noggrant reglerad process. A) I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin. B) I vilken fas av cellcykeln binder Cdc45 och GINS till MCM-helikaset? C) Vad heter det proteinkomplex som är bundet till replikationsorigin under hela cellcykeln? D) Vad gör CMG-helikaset när DNA-replikationen skall initieras? (4p) (Max 15 ord.)";"dna-replikation";"";"Initiering av eukaryot DNA-replikation är en noggrant reglerad process. A) I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin. B) I vilken fas av cellcykeln binder Cdc45 och GINS till MCM-helikaset? C) Vad heter det proteinkomplex som är bundet till replikationsorigin under hela cellcykeln? D) Vad gör CMG-helikaset när DNA-replikationen skall initieras? (4p) (Max 15 ord.)";"A) G-fasen. B) S1-fasen. C) ORC, origin recognition complex. D) Smälter DNA-strängarna, dvs separerar dem."
"2024-05-15";"34";"Vilka två av följande påståenden stämmer för kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? (2p) A: Kolesterol kan vid svält brytas ned till acetyl-CoA, som kan gå in i citronsyra-cykeln. B: En korrekt kolesterolkoncentration i cellens membran är viktig, då kolesterolkoncentrationen avgör membranets stelhet. C: Kolesterol och 7-dehydrokolesterol utgör utgångsmaterialet för syntes av steroidhormoner respektive D-vitamin. D: Kolesterol kan hos de flesta däggdjur (inklusive människa) endast syntetiseras i leverns celler (hepatocyter).";"kolesterol";"";"Vilka två av följande påståenden stämmer för kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? (2p) A: Kolesterol kan vid svält brytas ned till acetyl-CoA, som kan gå in i citronsyra-cykeln. B: En korrekt kolesterolkoncentration i cellens membran är viktig, då kolesterolkoncentrationen avgör membranets stelhet. C: Kolesterol och 7-dehydrokolesterol utgör utgångsmaterialet för syntes av steroidhormoner respektive D-vitamin. D: Kolesterol kan hos de flesta däggdjur (inklusive människa) endast syntetiseras i leverns celler (hepatocyter).";"B och C"
"2024-05-15";"14";"Vilken roll har fMet (N-formylmetionin) i initiering av translation? Beskriv kortfattat translationens initieringsprocess där fMet används. (4p) (Max 150 ord.)";"translation";"";"Vilken roll har fMet (N-formylmetionin) i initiering av translation? Beskriv kortfattat translationens initieringsprocess där fMet används. (4p) (Max 150 ord.)";"fMet finns enbart i prokaryoter. I eukaryota celler används istället Met. I prokaryot translation så initieras den genom att IF1 hittar en Shine-Delgarno sekvens, där binder sedan den lila ribosomala enheten in och letar tills ett AUG (startkodon) hittas. Denna startkodon kodar för aminosyran fMet som kommer bindas in då den sitter bundet till en tRNA-molekyl. tRNA:t binds in med hjälp av IF2 och sedan kommer den stora ribosomala enheten att binda in med hjälp av GTP. Alltså är fMet den första aminosyran som binder in, till startkodonet, i prokaryot translation."
"2024-05-15";"20";"Om ∆G°´ för reaktionen A → B är -40 kJ/mol under standardförhållanden så… (2p) Välj de två korrekta alternativen: A: kommer den att fortsätta i snabb takt. B: är den långt ifrån jämvikt. C: kommer den att gå från vänster till höger spontant. D: kommer den aldrig att nå jämvikt.";"termodynamik";"";"Om ∆G°´ för reaktionen A → B är -40 kJ/mol under standardförhållanden så… (2p) Välj de två korrekta alternativen: A: kommer den att fortsätta i snabb takt. B: är den långt ifrån jämvikt. C: kommer den att gå från vänster till höger spontant. D: kommer den aldrig att nå jämvikt.";"B och C"
"2024-05-15";"30";"Allopurinol är en så kallad hypoxantinanalog som inhiberar nedbrytning av purin-nukleotider till urat. Vilket enzym hämmar denna läkemedelssubstans och vid vilken sjukdom används allopurinol som läkemedel? (2p) (Max 20 ord.)";"nukleotidnedbrytning";"";"Allopurinol är en så kallad hypoxantinanalog som inhiberar nedbrytning av purin-nukleotider till urat. Vilket enzym hämmar denna läkemedelssubstans och vid vilken sjukdom används allopurinol som läkemedel? (2p) (Max 20 ord.)";"Allopurinol hämmar enzymet xantinoxidas. Detta används vid sjukdomen gikt som beror på ökad uratnivå i kroppen."
"2024-05-15";"15";"Vilka är det två viktigaste principerna bakom evolutionen? Beskriv med ett valfritt exempel hur dessa två principer är viktiga för att möjliggöra uppkomsten av nya arter/fenotyper/funktioner. (4p) (Max 150 ord.)";"evolution";"";"Vilka är det två viktigaste principerna bakom evolutionen? Beskriv med ett valfritt exempel hur dessa två principer är viktiga för att möjliggöra uppkomsten av nya arter/fenotyper/funktioner. (4p) (Max 150 ord.)";"Variation: Att det ska finnas ett brett urval av olika gener i en population. Detta stora urvalet leder till att olika individer inom samma art är olika bra anpassade. Tex om en individ från en art som i vanliga fall bara klarar varmare områden, får en gen som leder till att den klarar av kyla bättre, då kommer denna individ kunna migrera till kallare områden, eller överleva ifall kallare tider kommer. Detta gör att två individer från samma art kan utvecklas iväg från varandra, en i det varmare och en i det kallare. Naturligt urval/Survival of the fittest: Den säger att den som är best anpassad överlever. Samma exempel. Ifall en längre isperiod skulle börja så kommer de som har bäst kan anpassa sig, tex som att de kan växa extra mycket päls för att hålla inne värmen, kommer överleva medan de som ej kan anpassa sig kommer dö."
"2024-05-15";"21";"Förklara vad ett kinas gör. (2p) (Max 20 ord.)";"enzymer";"";"Förklara vad ett kinas gör. (2p) (Max 20 ord.)";"Ett kinas katalyserar en reaktion där en fosfatgrupp sätts på ett substrat. Tex hexokinas som sätter på fosfat på glukos."
"2024-05-15";"31";"Till vilka aminosyror kan nedanstående två alfa-ketosyror omvandlas i ett steg via transamineringsreaktioner? Ange även det fullständiga namnet på enzymet som katalyserar bildningen av respektive aminosyra. A) pyruvat B) oxalacetat (4p) (Max 20 ord.)";"aminosyrametabolism";"";"Till vilka aminosyror kan nedanstående två alfa-ketosyror omvandlas i ett steg via transamineringsreaktioner? Ange även det fullständiga namnet på enzymet som katalyserar bildningen av respektive aminosyra. A) pyruvat B) oxalacetat (4p) (Max 20 ord.)";"A) Pyruvat kan omvandlas till alanin mha enzymet alaninaminotransferas. B) Oxalacetat kan omvandlas till aspartat mha enzymet aspartataminotransferas."
"2024-05-15";"25";"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. En typ av reglering av komplexet sker via fosforylering. A) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? B) Vad händer med komplexets aktivitet när det fosforyleras? C) Redogör för hur energikvoten påverkar fosforyleringen av komplexet. (4p) (Max 100 ord)";"integrering-av-metabolismen";"";"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. En typ av reglering av komplexet sker via fosforylering. A) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? B) Vad händer med komplexets aktivitet när det fosforyleras? C) Redogör för hur energikvoten påverkar fosforyleringen av komplexet. (4p) (Max 100 ord)";"A) PDH-komplexet katalyserar omvandlingen av pyruvat till Acetyl-CoA, detta är mellansteget mellan glykolys och citronsyracykeln. Det är viktigt det regleras så rätt mängd energi utvinns. Så att vi inte genererar ATP när vi ej behöver, tillexempel glukoneogenesen behövs sättas igång så vi kan omvandla pyruvat till glukos eller så att det istället lagras i kroppen. B) Komplexet kommer inhiberas vid fosforylering. C) Ifall energikvoten är hög, dvs mycket ATP finns kommer det att kunna hämma komplexet då fosforyleringen av komplexet kräver ATP. Då en fosfatgrupp kommer sättas på komplexet. Ifall hög mängd ADP finns kommer det ej att fosforylera komplexet."
"2024-05-15";"11";"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription samverkar flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två påståenden om denna process stämmer? (2p) A: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikasaktivitet. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TBP ingår som en subenhet i det större TFIIF-komplexet. D: TBP binder till TATA-boxen.";"rna-syntes";"";"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription samverkar flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två påståenden om denna process stämmer? (2p) A: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikasaktivitet. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TBP ingår som en subenhet i det större TFIIF-komplexet. D: TBP binder till TATA-boxen.";"A och D"
"2024-05-15";"8";"Nukleotider bygger upp RNA och DNA. A) Vilken kemisk grupp finns i 2-positionen hos ribonukleotider? B) I vilken position på sockret sitter kvävebasen? C) I vilken position på sockret sitter fosfatgruppen? D) Vad är dGDP förkortning för? (4p)";"nukleotider";"";"Nukleotider bygger upp RNA och DNA. A) Vilken kemisk grupp finns i 2-positionen hos ribonukleotider? B) I vilken position på sockret sitter kvävebasen? C) I vilken position på sockret sitter fosfatgruppen? D) Vad är dGDP förkortning för? (4p)";"A) Hydroxylgrupp (OH-grupp) B) På 1'-kolet C) På 5'-kolet D) Deoxyguanosin 5'-difosfat"
"2024-05-15";"35";"Du befinner dig i labsalen när det plötsligt börjar brinna i en bägare med etanol. Efter att ha uppmärksammat de övriga i labbet på branden och konstaterat att den är begränsad bestämmer du dig för att släcka den. På labbet hittar du brandsläckare för bränder av klass AC. A) Vad avses med bränder klass A, B och C? B) Förklara vilken klass av brand som har uppstått. (4p) Max 80 ord.";"introduktionslaboration";"";"Du befinner dig i labsalen när det plötsligt börjar brinna i en bägare med etanol. Efter att ha uppmärksammat de övriga i labbet på branden och konstaterat att den är begränsad bestämmer du dig för att släcka den. På labbet hittar du brandsläckare för bränder av klass AC. A) Vad avses med bränder klass A, B och C? B) Förklara vilken klass av brand som har uppstått. (4p) Max 80 ord.";"3 av 4: A= brand i textilier/trä B=brand i vätskor/alkoholer C=brand i gaser Det är en typ B brand som uppstått då etanol är en alkohol."
"2024-05-15";"3";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för proteiners sekundärstruktur? (2p) A: En dubbelhelix är en av de två vanligaste formerna. B: Identiska aminosyrasekvenser kan ha olika sekundärstruktur i olika proteiner. C: Den stabiliseras av vätebindningar mellan aminosyrornas R-grupper. D: Olika sekundärstrukturdelar hos ett protein kan bindas samman med loopar.";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för proteiners sekundärstruktur? (2p) A: En dubbelhelix är en av de två vanligaste formerna. B: Identiska aminosyrasekvenser kan ha olika sekundärstruktur i olika proteiner. C: Den stabiliseras av vätebindningar mellan aminosyrornas R-grupper. D: Olika sekundärstrukturdelar hos ett protein kan bindas samman med loopar.";"(svar angivet i flervalsformulär) Totalpoäng: 2"
"2024-05-15";"7";"Laktosintolerans och galaktosemi: ge ett exempel på vad som är gemensamt för dessa tillstånd och ett exempel på vad som skiljer dem åt. (4p) (Max 200 ord.)";"kolhydrater";"";"Laktosintolerans och galaktosemi: ge ett exempel på vad som är gemensamt för dessa tillstånd och ett exempel på vad som skiljer dem åt. (4p) (Max 200 ord.)";"Gemensamt: Båda två sjukdomar beror på brist på funktion eller brist på respektive enzym som bryter ned laktos respektive galaktos. Skillnad: Laktosintolerans är brist på enzymet laktas som bryter ned laktos till galaktos och glukos, det leder till att kroppen ej bryter ned laktos i GI-kanalen, detta leder till att laktos kommer hamna i tarmarna där det kan jäsa vilket leder till magsmärtor, diarré och gasbildning. Galaktosemi beror på bristande funktion eller brist på enzymerna (en av dem är GALT) som omvandlar galaktos till glukos. Galaktos kan ta upp av tarmcellerna tillskillnad från laktos. Detta leder till ökad nivå av galaktos i plasman, galaktos blir till galaktilol som är ett toxiskt ämne. Detta kan leda till neurologisk skador och i värsta fall död. Alltså är skillnaden vart de kommer ansamlas och påverkan på kroppen."
"2024-05-15";"6";"Du är läkare på en vårdcentral och en patient har frågor om de prover som du just ordinerat i en ”lipidstatus”. Du tar hjälp av en ritning du lärde dig göra när du läste biokemi under din grundutbildning för att börja svara på frågan. A) Rita den principiella strukturen för den molekyl som framför allt används för att lagra energi i kroppen. B) Vilken sorts lipoprotein skickar levern ut i blodet för att transportera energilagringsmolekylen till resten av kroppens celler? 1 ord räcker som svar. (4p)";"lipider";"";"Du är läkare på en vårdcentral och en patient har frågor om de prover som du just ordinerat i en ”lipidstatus”. Du tar hjälp av en ritning du lärde dig göra när du läste biokemi under din grundutbildning för att börja svara på frågan. A) Rita den principiella strukturen för den molekyl som framför allt används för att lagra energi i kroppen. B) Vilken sorts lipoprotein skickar levern ut i blodet för att transportera energilagringsmolekylen till resten av kroppens celler? 1 ord räcker som svar. (4p)";"A) Triacylglycerol (TAG). B) VLDL. ![[Pasted image 20251129235437.png]] (Ritning på TAG-struktur finns på sida 11 i original-PDF.)"
"2024-05-15";"2";"På bilden visas en tripeptid. ![[Pasted image 20251129235411.png]] A) Ange vilken aminosyra som finns på C-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. B) Ange vilken aminosyra som finns på N-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. (4p) (Max 25 ord.)";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"På bilden visas en tripeptid. ![[Pasted image 20251129235411.png]] A) Ange vilken aminosyra som finns på C-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. B) Ange vilken aminosyra som finns på N-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. (4p) (Max 25 ord.)";"A) Asparginsyra, en syra. Kan binda mha elektrostatiska interaktioner då den är negativt laddad. B) Glycin, en alifatisk aminosyra. Opolär."
"2022-12-19";"28";"I elektrontransportkedjan pumpas protoner när elektroner förflyttas mellan olika komponenter. A) Var i elektrontransportkedjan pumpas protoner? B) Vilken är drivkraften bakom protonpumpningen? Max 50 ord.";"elektrontransportkedjan";"";"I elektrontransportkedjan pumpas protoner när elektroner förflyttas mellan olika komponenter. A) Var i elektrontransportkedjan pumpas protoner? B) Vilken är drivkraften bakom protonpumpningen? Max 50 ord.";"A) I komplex I, III och IV B) I elektrontransportkedjans komplex flyttas elektroner från komponenter med lägre redoxpotential till komponenter med högre. Detta är en energimässigt gynnsam process och energin kan då utnyttjas för att pumpa protoner från matrix till mellanmembransutrymmet mot gradienten. Energin omvandlas då till elektrokemisk energi."
"2022-12-19";"5";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att köra affinitetskromatografi med en 6xHis-tag. A) Beskriv kortfattat principen för affinitetskromatografi. B) Hur kan man eluera proteinet? C) Ange en metod som kan användas för analys av det eluerade proteinet. Max 200 ord.";"utforska-proteiner";"";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att köra affinitetskromatografi med en 6xHis-tag. A) Beskriv kortfattat principen för affinitetskromatografi. B) Hur kan man eluera proteinet? C) Ange en metod som kan användas för analys av det eluerade proteinet. Max 200 ord.";"A) Affinitetskromatografi är en kromatografimetod som bygger på att separera proteiner baserat på en viss egeskap. Exempelvis kan glykosylerade proteiner separeras ut genom att kulorna i kolonnen har molekyler som binder till sockerenheterna. Man kan även, som i detta fall, modifiera DNA-sekvensen för proteinet man är ute efter genom att lägga till en tag av histidin vilken binder väl till nickeljoner på kulorna. B) För att få proteinet att lossna från kulorna krävs att man eluerar. Det kan ske med hjälp av en stark buffert eller saltlösning, ofta en kombination av båda. C) Gelelektrofores, SDS-PAGE, kan användas för att analysera proteinets storlek samt hur väl proteinreningen lyckats."
"2022-12-19";"18";"Diffusion är en viktig process för att fördela molekyler i gaser och vätskor. Vad beror den på och vilken termodynamisk drivkraft finns bakom den?";"termodynamik";"";"Diffusion är en viktig process för att fördela molekyler i gaser och vätskor. Vad beror den på och vilken termodynamisk drivkraft finns bakom den?";"1.5p Diffusion beror på att det finns många fler sätt för ett ämne i en vätska eller gas att vara oordnat än ordnat, alltså är sannolikheten för ett oordnat tillstånd större och molekylerna kommer då till följd av sin konstanta rörelse att hamna i ett oordnat tillstånd. Den termodynamiska drivkraften bakom diffusion är således termodynamikens andra lag, att ett system tenderar att gå mot mer oordnade tillstånd, alltså att entropin ökar. 2.0p Brownsk rörelse (stavning?) innebär att en liten molekyl har större sannolikhet att inte stöta på något (annan molekyl) på ena sidan än andra. Det leder till att molekyler rör sig mot där det är mindre molekyl-tätt, och således sprids ämnet jämt. Ämnet vill fördela sig, eftersom att ha det ordnat = låg entropi => ofördelaktigt (om molekylen är löslig i sin omgiving, om olja i vatten är det mer fördelaktigt att oljan är samlad i en stor klump)"
"2022-12-19";"1";"Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. Jon Peptid van der Waals Väte";"kemiska-bindingar";"";"Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. Jon Peptid van der Waals Väte";"1. van der Waals 2. Väte 3. Jon 4. Peptid"
"2022-12-19";"19";"Vilka påståenden om övergångstillståndet för en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det har högre energi än för en icke-katalyserad reaktion. B: Det har lägre energi än reaktionens substrat. C: Det är mycket kortvarigt. D: Det har lägre energi än för en icke-katalyserad reaktion.";"enzymer";"";"Vilka påståenden om övergångstillståndet för en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det har högre energi än för en icke-katalyserad reaktion. B: Det har lägre energi än reaktionens substrat. C: Det är mycket kortvarigt. D: Det har lägre energi än för en icke-katalyserad reaktion.";"Rätt svar 1. C 2. D"
"2022-12-19";"29";"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzym i den processen? alfaketoglutaratdehydrogenas glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas malatdehydrogenas pyruvatdehydrogenas";"integrering-av-metabolismen";"";"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzym i den processen? alfaketoglutaratdehydrogenas glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas malatdehydrogenas pyruvatdehydrogenas";"1. glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas 2. pyruvatdehydrogenas 3. alfaketoglutaratdehydrogenas 4. malatdehydrogenas"
"2022-12-19";"4";"Hemoglobin och myoglobin innehåller den prostetiska gruppen heme. Denna innehåller ett järn (Fe²⁺) som ansvarar för inbindningen av syremolekyler. Beskriv varför bindning till syre påverkar hemoglobinets struktur och hur det i sin tur påverkar hemoglobinets syreaffinitet. Max 70 ord.";"hemoglobin";"";"Hemoglobin och myoglobin innehåller den prostetiska gruppen heme. Denna innehåller ett järn (Fe²⁺) som ansvarar för inbindningen av syremolekyler. Beskriv varför bindning till syre påverkar hemoglobinets struktur och hur det i sin tur påverkar hemoglobinets syreaffinitet. Max 70 ord.";"Järnatomens storlek gör att den inte får plats i mitten av hemegruppen. När syre binder in blir järnets atommoln mindre och kan således flyttas upp 0,4 Å in i hemeplanet. Då kommer även det proximala histidinet kopplat till järnet att flyttas upp samt den alfahelix den är kopplad till. Det påverkar strukturen på hemoglobinet där subenheterna totalt kommer vridas upp 15 grader till R-state med ökad affinitet för syre."
"2022-12-19";"16";"Vilka påståenden om det eukaryota cellmembranet är korrekta? A: Fosfatidylserin finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. B: Kolesterol finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. C: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cellens utsida. D: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cytoplasman.";"cellmembran";"";"Vilka påståenden om det eukaryota cellmembranet är korrekta? A: Fosfatidylserin finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. B: Kolesterol finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. C: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cellens utsida. D: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cytoplasman.";"Rätt svar 1. A 2. C"
"2022-12-19";"22";"Ett enzym uppvisar MichaelisMenten-kinetik. Behöver du känna till den totala enzymkoncentrationen för att bestämma konstanterna (i) Kₘ, (ii) Vmax eller (iii) kcat? Motivera ditt svar. ![[Pasted image 20251128085625.png]]";"enzymer";"";"Ett enzym uppvisar MichaelisMenten-kinetik. Behöver du känna till den totala enzymkoncentrationen för att bestämma konstanterna (i) Kₘ, (ii) Vmax eller (iii) kcat? Motivera ditt svar. ![[Pasted image 20251128085625.png]]";"Vmax motsvarar den maximala reaktionshastighet som är möjlig för en enzymkatalyserad reaktion och uppnås då alla enzym är bundna i enzym-substratkomplex. Vmax beror alltså av enzymkoncentratonen. Kₘ motsvarar den substratkoncentration då V = Vmax/2, alltså när hälften av enzymen har bundit substratet och är upptagna med katalys. Kₘ och Vmax kan bestämmas experimentellt för en reaktion genom att mäta den initiella reaktionshastigheten för varierande substratkoncentrationer men med samma enzymkoncentration. Värdena förs in i ett diagram där reaktionshastigheten blir en funktion av substratkoncentrationen (se nedan). När substratkoncentrationen går mot oändligheten kommer då V gå mot Vmax och man kan då matematiskt bestämma Vmax utan att känna till den exakta enzymkoncentrationen. Kₘ kan sedan bestämmas utifrån vid vilken substratkoncentration som V = Vmax/2. kcat är ett mått på hur många molekyler produkt som bildas per sekund och enzym, turnover number, och räknas således fram ur den maximala reaktionshastigheten dividerat med den totala enzymkoncentrationen. För att bestämma kcat krävs alltså att känna till den maximala enzymkoncentrationen."
"2022-12-19";"32";"Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? A: Den huvudsakliga regleringspunkten i pentosfosfatvägen är enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas. B: Ribulos-5-fosfat kan omvandlas till glukos-6-fosfat i den reversibla oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. C: NADPH är ett mycket viktigt oxidationsmedel i celler. D: Nedsatt funktion i pentosfosfatvägen kan orsaka hemolytisk anemi. Rätt svar";"pentosfosfatvägen";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? A: Den huvudsakliga regleringspunkten i pentosfosfatvägen är enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas. B: Ribulos-5-fosfat kan omvandlas till glukos-6-fosfat i den reversibla oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. C: NADPH är ett mycket viktigt oxidationsmedel i celler. D: Nedsatt funktion i pentosfosfatvägen kan orsaka hemolytisk anemi. Rätt svar";"A och D"
"2022-12-19";"26";"A) Vilka två enzymer hjälps åt att återuppbygga en delvis nedbruten glykogenpartikel genom att addera nya glukosenheter till strukturen? B) Vilken typ av bindning skapar respektive enzym?";"glykogen";"";"A) Vilka två enzymer hjälps åt att återuppbygga en delvis nedbruten glykogenpartikel genom att addera nya glukosenheter till strukturen? B) Vilken typ av bindning skapar respektive enzym?";"A) En delvis nedbruten glykogenpartikel har redan en primer i form av glykogenin, alltså behöver bara kedjorna elongeras och förgreningar bildas. Glykogensyntas kommer att förlänga kedjorna genom att addera glukosenheter medan branching enzyme kommer skapa förgreningar genom att flytta 7 glukosenheter. B) Glykogensyntas alfa 14 glykosidbindning Branching enzyme alfa 16 glykosidbindning"
"2022-12-19";"12";"Vilka två av följande alternativ beskriver funktioner för poly-A-svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? A: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Stimulerar translation. D: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid.";"rna-syntes";"";"Vilka två av följande alternativ beskriver funktioner för poly-A-svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? A: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Stimulerar translation. D: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid.";"Rätt svar 1. C 2. D"
"2022-12-19";"27";"A) Vilka molekyler av betydelse för energiomvandling bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Varför är citronsyracykeln inte aktiv i frånvaro av syre? Max 50 ord.";"citronsyracykeln";"";"A) Vilka molekyler av betydelse för energiomvandling bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Varför är citronsyracykeln inte aktiv i frånvaro av syre? Max 50 ord.";"A) 3 NADH och 1 FADH₂ B) För att citronsyracykeln ska ske krävs att det finns mitokondriellt NAD⁺ och FAD. Utan syre avstannar elektrontransportkedjan då syre behövs i komplex IV och därmed kan inte NADH och FADH₂ oxideras vilket är det enda sättet att återbilda NAD⁺ och FAD i mitokondriens matrix."
"2022-12-19";"13";"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet.";"rna-syntes";"";"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet.";"Rätt svar 1. A 2. D"
"2022-12-19";"17";"Proteinet på bilden förflyttas till plasmamembranet hos skelettmuskler som ett svar på insulinsignalering. A) Vilken är transportören? B) Vilken typ av transport sker? C) Vad händer med glukos när den kommit in i cellen och varför? Max 50 ord. ![[Pasted image 20251128085555.png]]";"transport-över-cellmembran";"";"Proteinet på bilden förflyttas till plasmamembranet hos skelettmuskler som ett svar på insulinsignalering. A) Vilken är transportören? B) Vilken typ av transport sker? C) Vad händer med glukos när den kommit in i cellen och varför? Max 50 ord. ![[Pasted image 20251128085555.png]]";"A) GLUT-4 B) Faciliterad diffusion C) Den kommer genom enzymet Hexokinas och förbrukning av 1 ATP bilda glukos 6-fosfat. Fosforyleringen gör att bärarproteinet inte längre känner igen glukosmolekylen och därmed kan den inte transporteras ut igen utan kommer, beroende på energikvoten, brytas ned i glykolysen eller användas för uppbyggnad av glykogen."
"2022-12-19";"23";"Vad har molekylerna NADH, ATP, CoA och FADH₂ gemensamt? A: De är kinetiskt stabila. B: De är kinetiskt instabila. C: De är termodynamiskt stabila. D: De är termodynamiskt instabila.";"integrering-av-metabolismen";"";"Vad har molekylerna NADH, ATP, CoA och FADH₂ gemensamt? A: De är kinetiskt stabila. B: De är kinetiskt instabila. C: De är termodynamiskt stabila. D: De är termodynamiskt instabila.";"A och D"
"2022-12-19";"33";"Vilka av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? A: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol till en fettsyra. B: Den regleras främst via tillgången på fritt extracellulärt kolesterol. C: Den regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet HMG-CoA-reduktas. D: Att bilda kolesterolestrar är i de flesta celler irreversibelt för att återbildas till kolesterol behöver kolesterolestern först transporteras till levern via HDL. Rätt svar";"kolesterol";"";"Vilka av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? A: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol till en fettsyra. B: Den regleras främst via tillgången på fritt extracellulärt kolesterol. C: Den regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet HMG-CoA-reduktas. D: Att bilda kolesterolestrar är i de flesta celler irreversibelt för att återbildas till kolesterol behöver kolesterolestern först transporteras till levern via HDL. Rätt svar";"A och C"
"2022-12-19";"24";"Det pyruvat som bildas vid anaerob glykolys behöver metaboliseras vidare. A) Vad bildas av pyruvatet? B) Vilken är orsaken till det? C) Vilket enzym katalyserar reaktionen? Max 50 ord.";"glukosmetabolism";"";"Det pyruvat som bildas vid anaerob glykolys behöver metaboliseras vidare. A) Vad bildas av pyruvatet? B) Vilken är orsaken till det? C) Vilket enzym katalyserar reaktionen? Max 50 ord.";"A) Laktat B) Cellen behöver återbilda NAD⁺ i cytoplasman för att inte glykolysen ska avstanna då det krävs i steg 6. Vid anaerob glykolys sker detta genom fermentering där pyruvat reduceras till laktat och NADH oxideras till NAD⁺. C) Laktatdehydrogenas"
"2022-12-19";"10";"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonCrick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Helixen är högervriden. D: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'.";"nukleotider";"";"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonCrick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Helixen är högervriden. D: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'.";"Rätt svar 1. A 2. C"
"2022-12-19";"9";"A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Vilken form har denna faktor?";"dna-replikation";"";"A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Vilken form har denna faktor?";"A) PCNA, eller sliding clamp som den också kallas, har funktionen att den sitter runt en av DNA-strängarna under replikation och håller fast DNA-polymeras på strängen. Det gör att processiviteten ökar upp till 50 gånger jämfört med utan PCNA då DNA-polymeras kan syntetisera långa sträckor DNA utan att ramla av. B) Ringformad"
"2022-12-19";"34";"Beskriv vad som karaktäriserar plasmider med konformationen supercoiled respektive relaxerad cirkulär, hur de bildas och hur de kan skiljas åt med gelelektrofores. Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska i tabellform eller i fritext. Max 75 ord.";"plasmid";"";"Beskriv vad som karaktäriserar plasmider med konformationen supercoiled respektive relaxerad cirkulär, hur de bildas och hur de kan skiljas åt med gelelektrofores. Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska i tabellform eller i fritext. Max 75 ord.";"I supercoiled kommer DNAt i plasmiden vara överdrivet tvinnat, så kallat supercoiled med högre linkingnumber än normalt. Därmed kommer det bildas en linjär struktur. I relaxerad cirkulär är plasmiden istället ringformat. De två olika konformationerna kommer möta olika stort motstånd av gelen under gelelektrofores till följd av att de har olika form och de kan således separeras baserat på att de kommer färdas olika långt. ![[Pasted image 20251128085752.png]]"
"2022-12-19";"14";"Beskriv sekundärstrukturen hos molekylen som transporterar aminosyror till ribosomen och förklara vilken funktionen är för varje del av strukturen. Rita gärna. ![[Pasted image 20251128085533.png]]";"translation";"";"Beskriv sekundärstrukturen hos molekylen som transporterar aminosyror till ribosomen och förklara vilken funktionen är för varje del av strukturen. Rita gärna. ![[Pasted image 20251128085533.png]]";"Strukturen som transporterar aminosyror till ribosomen kallas tRNA och byggs upp av RNA. I 2D, sekundärstruktur, är tRNA klöverformad och stabiliseras av vätebindningar mellan komplementära baspar i RNA kedjan. Den nedersta loopen, Antikodon loopen, innehåller ett antikodon på tre baser som är komplementärt till kodonet på mRNA och därmed aggerar som mellanhand mellan kodon och aminosyra vilket möjliggör för den genetiska koden. De andra två looparna spelar roll för interaktioner med exempelvis aminoacyl-tRNA syntetaser som kopplar ihop rätt aminosyra med rätt tRNA. De bidrar alltså till identifiering av det specifika tRNA:t. 5'-änden av tRNA kedjan är fosforylerad och i 3'-änden sitter en CCA-sekvens, så kallad acceptor stem. Till den fria OH-gruppen på 3'-änden av adenosin i acceptor stem kopplas aminosyran av aminoacyl-tRNA syntetaser."
"2022-12-19";"20";"Redogör för hur heme bryts ner och utsöndras. (2p)";"heme";"";"Redogör för hur heme bryts ner och utsöndras. (2p)";"Heme bryts ner i mjälten när röda blodkroppar bryts ner. Först bildas biliverdin som sedan omvandlas till bilirubin. Då bilirubin är en hydrofob molekyl kommer den att transporteras bunden till blodproteinet albumin via blodet till levern. I levern kommer bilirubinet konjugeras och då bli amfipatiskt för att sedan utsöndras via gallan."
"2022-12-19";"30";"Nämn två aminosyror som genom transaminering kan omvandlas till citronsyracykelintermediärer vilket gör dem till glukogena aminosyror. Ange även vilken citronsyracykelintermediär respektive aminosyra bildar.";"aminosyrametabolism";"";"Nämn två aminosyror som genom transaminering kan omvandlas till citronsyracykelintermediärer vilket gör dem till glukogena aminosyror. Ange även vilken citronsyracykelintermediär respektive aminosyra bildar.";"Glutamat kan omvandlas till alfaketoglutarat Aspartat kan omvandlas till oxalacetat"
"2022-12-19";"15";"Cancerceller utvecklas från normala celler. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till.";"evolution";"";"Cancerceller utvecklas från normala celler. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till.";"2.0p Evolution beror på variation och naturligt urval. Det sker mutationer ""ofta"", vilket ökar variationen inom en population. Många gånger är mutationen som uppstår sämre och försvinner. Ibland är en mutation bra och den blir selekterad (survival of the fittest) och lever kvar inom en population (evolution) Vid cancer så sker likaså mutationer, det kan vara mutationer som stör delningsprocessen i en cell (så att den ohämmat delar sig) eller mutationer som hämmar vårt immunsystem (vi kan ej bekämpa tumörer, p53). Cancerceller utvecklas alltså från våra egna celler (fast de är muterade och orsakar sjukdom). Cancerceller genomgår också mutationer. ""Vanligt"" är mutationer som stimulerar ohämmad delning och gör dem mer maligna. Cancerceller har en variation som gör dem ""starka"" och tar därför över i kroppen. 1.5p Evolutionen utgår från att det finns en genetisk variation och ett naturligt urval där de egenskaper som gynnar överlevnad i den aktuella miljön kommer föras vidare till nästa generation i större utsträckning. Genetisk variation uppnås bland annat genom slumpmässiga spontana mutationer i DNA. Mutationer kan då uppkomma i en cell som stänger av en tumörsupressorgen vilket då är ""gynnsamt"" för den individuella cellen som kan fortsätta dela sig. Andra mutationer kan då uppstå i en gen som kodar för reparation av DNA vilket möjliggör för ytterligare mutationer som aktiverar oncogener och stänger av andra tumörsupressorgener. Genom ett flertal steg där mutationer möjliggör för cellen att dela sig oftare och för fler mutationer att uppstå kan således en cancertumör utvecklas ur en normal cell."
"2022-12-19";"21";"Vilka av följande är ketonkroppar? A: Acetoacetat B: Hydroxy-metyl-glutarat C: Aceton D: Beta-hydroxy-acetat Rätt svar";"betaoxidation";"";"Vilka av följande är ketonkroppar? A: Acetoacetat B: Hydroxy-metyl-glutarat C: Aceton D: Beta-hydroxy-acetat Rätt svar";"A och C"
"2022-12-19";"31";"Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? A: Gikt är en sjukdom som kan orsakas av defekter i enzymerna som bryter ner pyrimidin-nukleotider. B: Urat är en molekyl med två ringstrukturer. C: Nukleotidaser omvandlar nukleotider till nukleosider. D: Vid nedbrytning av nukleotiden AMP kommer molekylens samtliga kväveatomer slutligen hamna i urea som utsöndras med urinen.";"nukleotidnedbrytning";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? A: Gikt är en sjukdom som kan orsakas av defekter i enzymerna som bryter ner pyrimidin-nukleotider. B: Urat är en molekyl med två ringstrukturer. C: Nukleotidaser omvandlar nukleotider till nukleosider. D: Vid nedbrytning av nukleotiden AMP kommer molekylens samtliga kväveatomer slutligen hamna i urea som utsöndras med urinen.";"Rätt svar 1. B 2. C"
"2022-12-19";"25";"Vilka faktorer är viktiga för regleringen av fosfofruktokinas 2/fruktos 2,6-bisfosfatas? A: Hormoner B: Cellens energikvot C: pH D: Fosforylering";"glukosmetabolism";"";"Vilka faktorer är viktiga för regleringen av fosfofruktokinas 2/fruktos 2,6-bisfosfatas? A: Hormoner B: Cellens energikvot C: pH D: Fosforylering";"Rätt svar 1. A 2. D"
"2022-12-19";"11";"A) Var återfinns alfa-amanitin i naturen? B) Vilket enzym inhiberar denna substans?";"rna-syntes";"";"A) Var återfinns alfa-amanitin i naturen? B) Vilket enzym inhiberar denna substans?";"A) I den lömska flugsvampen B) Substansen inhiberar RNA-polymeras II"
"2022-12-19";"8";"A) Vilken kemisk grupp finns i 2-positionen hos ribonukleotider? B) Vad är AMP förkortning för?";"nukleotider";"";"A) Vilken kemisk grupp finns i 2-positionen hos ribonukleotider? B) Vad är AMP förkortning för?";"A) Hydroxylgrupp (OH) B) Adenosinmonofosfat"
"2022-12-19";"35";"Du arbetar på en vårdcentral som specialistläkare. En försäljare från ett läkemedelsföretag är inbjuden för att presentera en ny medicin som påstås sänka kolesterolnivåerna i blodet med 30%. Vilka två 95%:iga konfidensintervall (CI95%) stöder detta påstående i minst utsträckning? A: 29,5% 30,5% B: 27% 33% C: 1% 60% D: 10% 70%";"introduktionslaboration";"";"Du arbetar på en vårdcentral som specialistläkare. En försäljare från ett läkemedelsföretag är inbjuden för att presentera en ny medicin som påstås sänka kolesterolnivåerna i blodet med 30%. Vilka två 95%:iga konfidensintervall (CI95%) stöder detta påstående i minst utsträckning? A: 29,5% 30,5% B: 27% 33% C: 1% 60% D: 10% 70%";"C och D"
"2022-12-19";"3";"Nyligen har det konstaterats att sjukdomen ALS (amyotrofisk lateral skleros) karaktäriseras av bildning av amyloider. Hur bildas de? Max 75 ord.";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Nyligen har det konstaterats att sjukdomen ALS (amyotrofisk lateral skleros) karaktäriseras av bildning av amyloider. Hur bildas de? Max 75 ord.";"Amyloider bildas då ett protein med alfahelixrik struktur övergår i en betaflaksrik struktur. Betaflaken kan sedan aggregeras och bilda långa fibrer, så kallade amyloider."
"2022-12-19";"7";"Kolhydrater finns förutom i fri form även bundna till lipider och proteiner. Vilka är de två vanligaste typerna av bindningar mellan kolhydrater och proteiner? (2p)";"kolhydrater";"";"Kolhydrater finns förutom i fri form även bundna till lipider och proteiner. Vilka är de två vanligaste typerna av bindningar mellan kolhydrater och proteiner? (2p)";"O-link: kolhydraten binder till OH-gruppen i sidokedjan på serin eller treonin i proteinet. N-link: kolhydraten binder till aminogruppen i en asparaginrests sidokedja i proteinet."
"2022-12-19";"6";"Namnge och rita: A) Den principiella strukturen för lipiden som lagrar energi i adipocyter. B) Strukturen för den vanligaste membranlipiden.";"lipider";"";"Namnge och rita: A) Den principiella strukturen för lipiden som lagrar energi i adipocyter. B) Strukturen för den vanligaste membranlipiden.";"Se 2022-12-19-0097-TUX för 2/2"
"2022-12-19";"2";"I metabolismen är det vanligt att enzymer regleras av cellens energikvot. A) Nämn två aminosyror som kan interagera med olika delar hos de molekyler som då fungerar som allosteriska regulatorer. B) Förklara vad som gör dessa aminosyror lämpliga för uppdraget. Max 75 ord.";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"I metabolismen är det vanligt att enzymer regleras av cellens energikvot. A) Nämn två aminosyror som kan interagera med olika delar hos de molekyler som då fungerar som allosteriska regulatorer. B) Förklara vad som gör dessa aminosyror lämpliga för uppdraget. Max 75 ord.";"A) Negativt laddad lysin Som kan bilda vätebindningar Asparagin B) Vid allosterisk reglering av cellens energikvot kommer ATP respektive ADP/AMP binda in till enzymet. Fosfatgrupperna är negativt laddade vilket gör att de kan interaggera med positivt laddade sidokedjor som lysin genom jonbindningar. Kvävebasen adenin som är en del av molekylerna kommer innehålla kvävegrupper som kan bilda vätebindningar med en aminosyra som har karbonyl, hydroxyl- eller aminogrupper, som asparagin med både amino- och karbonylgrupp."
"2023-05-15";"28";"Vad menas med respirationskontroll? (1p) Max 25 ord.";"elektrontransportkedjan";"";"Vad menas med respirationskontroll? (1p) Max 25 ord.";"Reglering av cellandningen, dvs bildningen av ATP genom oxidativ fosforylering. Drivs av elektrontransportkedjan och den elektrokemiska gradient som uppstår, och regleras av cellens energikvot."
"2023-05-15";"5";"Du har fått i uppgift att göra en proteinrening med hjälp av gelfiltrering samt att analysera resultatet av denna. (2p) Max 200 ord. A) Beskriv metoden för gelfiltrering. B) Vilken egenskap hos proteinet bygger metoden på?";"utforska-proteiner";"";"Du har fått i uppgift att göra en proteinrening med hjälp av gelfiltrering samt att analysera resultatet av denna. (2p) Max 200 ord. A) Beskriv metoden för gelfiltrering. B) Vilken egenskap hos proteinet bygger metoden på?";"A) Gelfiltrering är en separationsmetod med avseende på storlek. Man preparerar en kolonn med ""beads"", dvs porösa gelékulor. Detta utgör den fasta fasen. Sedan tillsätts en lösning med det protein man vill separera ut, detta kallas för den mobila fasen. När den mobila fasen hälls till kolonnen kommer den att rinna igenom och elueras under kolonnen. Stora proteiner kommer att ta vägen förbi kulorna och därmed komma ut först. De små proteinerna kommer istället att gå igenom de porösa kulorna. Detta tar längre tid och de kommer därför komma ut sist. Resultatet blir en separation med avseende på storlek där störst går först. B) Separation med avseende på storlek, där störst går först."
"2023-05-15";"18";"A) Redogör kort för vikten av jämviktskonstanten för biokemiska reaktioner. B) Hur är jämviktskonstanten definierad? (2p)";"termodynamik";"";"A) Redogör kort för vikten av jämviktskonstanten för biokemiska reaktioner. B) Hur är jämviktskonstanten definierad? (2p)";"A) Jämviktskonstanten K anger förhållandet mellan substrat/reaktant och produkt. Om K = 1 betyder det att systemet är i jämvikt, mängden reaktant är lika stor som mängden produkt. Om K > 1 finns mer produkt än reaktant. Om K < 1 finns mer reaktant än produkt. Detta kan visa åt vilket håll en reaktion är förskjuten, och visar förhållandet mellan olika ämnen i ett system. I cellen är ofta flera reaktioner kopplade eller sker som en kedjereaktion. Det innebär att det som är produkt i en reaktion går vidare och utgör reaktant i en annan reaktion. Detta dynamiska samspel gör att jämviktskonstanten hela tiden kommer att förändras och gå åt olika håll. Det är bra, vi vill inte ha jämvikt (K = 1) i cellerna eftersom det då inte finns några gradienter eller någon reaktionsbenägenhet, vilket skulle innebära att alla livsviktiga processer avstannar och vi skulle dö. B) K = [produkt]/[reaktant]"
"2023-05-15";"1";"Rita aminosyran serin, R = CH₂OH, i S-konfiguration vid: A) pH 2 B) pH 7 C) pH 12 (2p)";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Rita aminosyran serin, R = CH₂OH, i S-konfiguration vid: A) pH 2 B) pH 7 C) pH 12 (2p)";"1.5 av 2 Svar (text + ritning på separat papper) A) Vid lågt pH finns mycket fria H⁺, aminogruppen kommer att vilja motverka pH-sänkningen och ta upp en H⁺ och får således en positiv laddning. B) Vid neutralt pH kommer aminosyran vara en zwitterjon, dvs ha både en positiv och en negativ laddning men ingen nettoladdning. C) Vid högt pH kommer karboxylgruppen vilja motverka detta genom att avge H⁺, därav kommer denna att få en negativ laddning. ![[Pasted image 20251129235001.png]]"
"2023-05-15";"19";"Ett enzym uppvisar MichaelisMenten-kinetik. A) Hur kan man i ett V mot [S]-diagram avläsa de två konstanterna Kₘ och Vmax? B) Förklara vad som händer med Kₘ respektive Vmax om man tillsätter en kompetitiv hämmare. (2p)";"enzymer";"";"Ett enzym uppvisar MichaelisMenten-kinetik. A) Hur kan man i ett V mot [S]-diagram avläsa de två konstanterna Kₘ och Vmax? B) Förklara vad som händer med Kₘ respektive Vmax om man tillsätter en kompetitiv hämmare. (2p)";"A) Om ett enzym uppvisar MichaelisMenten-kinetik kommer vi i ett sådant diagram se en hyperbol kurva där reaktionshastigheten ökar och går mot den maximala reaktionshastigheten med ökningen av substratets koncentration. Varje reaktion har ett Vmax, det vill säga den maximala hastighet en reaktion kan nå då samtliga enzym är bundna till substratet. När kurvan planar ut är V nära Vmax och kommer mycket långsamt fortsätta gå mot Vmax med en ökande substratkoncentration. Kₘ är den substratkoncentration för vilken reaktionshastigheten uppnår 1/2 Vmax. Kₘ är alltså den punkt på kurvan där V når halva Vmax. B) En kompetitiv inhibitor kommer att binda till enzymets aktiva säte och hindra det tänkta substratet från att binda in. Det uppstår alltså konkurrens om att binda in till de enzym som finns. Detta innebär att enzymets affinitet för substratet minskar och det betyder att vi vid närvaro av inhibitorn kommer att få ett lägre Kₘ-värde än utan. Om substratet hinner binda enzymet innan inhibitorn gör det finns det inget som hindrar att den tänkta produkten bildas. Vmax kommer alltså inte att förändras, det kommer bara krävas en högre substratkoncentration för att lyckas konkurrera ut inhibitorn."
"2023-05-15";"29";"Från vilka alfa-ketosyror kan aminosyrorna nedan bildas med hjälp av två kliniskt viktiga enzymer tillhörande gruppen aminotransferaser? Ange också från vilken metabol väg respektive alfa-ketosyra hämtas. (2p) A) Alanin B) Aspartat";"aminosyrametabolism";"";"Från vilka alfa-ketosyror kan aminosyrorna nedan bildas med hjälp av två kliniskt viktiga enzymer tillhörande gruppen aminotransferaser? Ange också från vilken metabol väg respektive alfa-ketosyra hämtas. (2p) A) Alanin B) Aspartat";"A) Pyruvat → Alanin. Sker med hjälp av ALAT (alaninaminotransferas). Alfaketosyran är pyruvat och hämtas från glykolysen. B) Oxaloacetat → Aspartat. Sker med hjälp av ASAT (aspartataminotransferas). Alfaketosyran är oxaloacetat och hämtas från citronsyracykeln."
"2023-05-15";"4";"Nämn de allosteriska regulatorerna för hemoglobin och ange om de höjer eller sänker hemoglobinets syreaffinitet. (2p) Max 25 ord.";"hemoglobin";"";"Nämn de allosteriska regulatorerna för hemoglobin och ange om de höjer eller sänker hemoglobinets syreaffinitet. (2p) Max 25 ord.";"1.5 av 2: CO₂: bildar kolsyra & karbamatjoner, sänker pH. H⁺: interagerar med sidokedjor, uppstår jonbindningar. 2,3-BPG: binder subenheterna, förhindrar konformationsändring. Samtliga stabiliserar T-state, sänker affiniteten för syre."
"2023-05-15";"16";"![[Pasted image 20251129235023.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns det? C) Vilken är drivkraften för transporten? (2p) Max 30 ord.";"transport-över-cellmembran";"";"![[Pasted image 20251129235023.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns det? C) Vilken är drivkraften för transporten? (2p) Max 30 ord.";"A) En antiport. B) I mitokondriens inre membran. C) Energikvoten. Dvs fördelningen mellan ATP och ADP innanför respektive utanför mitokondriens inre membran."
"2023-05-15";"22";"Du är lite sen till bussen och behöver springa den sista biten för att inte missa den. När du slår dig ned är du varm och andas häftigt. Det gör också lite ont i lårmusklerna. A) Vilka metabola vägar aktiverades när du började springa och varför? B) Förklara med hjälp av termodynamik varför du har blivit varm. (Max 120 ord) (3p)";"glykolysen";"";"Du är lite sen till bussen och behöver springa den sista biten för att inte missa den. När du slår dig ned är du varm och andas häftigt. Det gör också lite ont i lårmusklerna. A) Vilka metabola vägar aktiverades när du började springa och varför? B) Förklara med hjälp av termodynamik varför du har blivit varm. (Max 120 ord) (3p)";"2 av 3: A) När jag började springa förbrukades energi. Glykolysen omvandlade blodglukos till pyruvat för att skapa mer ATP via citronsyracykeln, ETK och oxidativ fosforylering. Glykogen lagrat i musklerna bröts ner för att frigöra energi där. B) När ett arbete utförs kommer alltid lite av energin att gå till spillo och bli till kinetisk energi/värme. Tack vare att alla processer i kroppen är uppdelade i många men mindre steg kan vi ta tillvara på en större del av den tillgängliga energin, vi får alltså en större verkningsgrad än t.ex. en förbränningsmotor. Vår verkningsgrad är ca 50%, det innebär att hälften av den energi jag förbrukade när jag sprang frigjordes i form av värme och det var därför jag blev varm."
"2023-05-15";"32";"I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i nedanstående två nukleosider när dessa bryts ner? Ange en molekyl för respektive nukleosid. (1p) A) Inosin B) Cytidin";"nukleotidnedbrytning";"";"I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i nedanstående två nukleosider när dessa bryts ner? Ange en molekyl för respektive nukleosid. (1p) A) Inosin B) Cytidin";"A) Urat. B) Urea."
"2023-05-15";"26";"Din kompis har bestämt sig för att utesluta fett ur sin diet med målet att minska sina fettförråd. Du som har studerat metabolism ser en svaghet i strategin. Redogör för den svagheten på molekylär nivå. (Max 75 ord) (2p)";"lipider";"";"Din kompis har bestämt sig för att utesluta fett ur sin diet med målet att minska sina fettförråd. Du som har studerat metabolism ser en svaghet i strategin. Redogör för den svagheten på molekylär nivå. (Max 75 ord) (2p)";"AI: Utan fett i kosten minskar tillgången på essentiella fettsyror och framför allt på oxaloacetat, som krävs för att acetyl-CoA ska kunna gå in i citronsyracykeln. Brist på kolhydrater och fett gör att oxaloacetat används för glukoneogenes, vilket hindrar fullständig fettoxidation. Fettförbränningen bromsas alltså snarare än ökar, och ketonkroppar kan bildas."
"2023-05-15";"12";"Vilka två påståenden om kromatin stämmer bäst? (1p) A: Acetylering gör histonsvansar mer positivt laddade. B: Topoisomeraser kan reglera aktiviteten i en kromatinfiber-loop. C: Histon H1 destabiliserar nukleosomen. D: Nukleosomen har en kärna av 8 histonproteiner.";"kromatin";"";"Vilka två påståenden om kromatin stämmer bäst? (1p) A: Acetylering gör histonsvansar mer positivt laddade. B: Topoisomeraser kan reglera aktiviteten i en kromatinfiber-loop. C: Histon H1 destabiliserar nukleosomen. D: Nukleosomen har en kärna av 8 histonproteiner.";"B och C"
"2023-05-15";"27";"Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (1p) Komponenter: Coenzym Q CuB Cytokrom C NADH";"elektrontransportkedjan";"";"Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (1p) Komponenter: Coenzym Q CuB Cytokrom C NADH";"1. NADH 2. Coenzym Q 3. Cytokrom C 4. CuB"
"2023-05-15";"13";"Vilken roll spelar sigma-faktorn vid prokaryot transkription? (2p)";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"";"Vilken roll spelar sigma-faktorn vid prokaryot transkription? (2p)";"Sigmafaktorn är en av de 6 subenheter som ingår i det prokaryota polymeraset. Sigmafaktorns uppgift är att hjälpa polymeraset att snabbare hitta fram till rätt promotor. Polymeraset med sigmafaktorn åker längs med DNA till dess att rätt promotor hittas. Sigmafaktorns effekt är att polymeraset binder lösare till ospecifikt DNA, vilket gör att det kan glida längs DNA utan att fastna på fel ställe. Utan sigmafaktorn hade polymeraset bundit mycket starkare till ospecifikt DNA, vilket hade försvårat processen då det hade haft problem med att glida längs DNA utan att fastna på fel ställe. När sigmafaktorn väl hittat och bundit till rätt promotor kan transkriptionen börja. Då kommer sigmafaktorn att falla av, eftersom vi nu vill att polymeraset ska sitta fast vid DNA för att kunna utföra transkriptionen korrekt."
"2023-05-15";"17";"Var hittas ett GPI-ankare och vad har det för funktion? (2p)";"cellmembran";"";"Var hittas ett GPI-ankare och vad har det för funktion? (2p)";"Ett GPI-ankare är ett perifert membranprotein. Det sitter förankrat till cellmembranet via fosfatgrupper och sockerstrukturer. GPI-ankaret kan mobiliseras väldigt snabbt genom att klippas loss med hjälp av lipaser. Vid en synaps i t.ex. en muskel kommer transmittorsubstansen acetylkolin på en impuls frisättas och leda till muskelkontraktion. För att kontraktionen ska upphöra måste acetylkolin plockas bort från muskelcellens receptorer, och det sker via acetylkolinesteras. Acetylkolinesteras sitter bundet till axonterminalen via ett GPI-ankare, vilket gör att det då snabbt kan frigöras och avsluta muskelkontraktionen."
"2023-05-15";"23";"Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (1p) A: Glykogenet i skelettmuskel bryts ner hela vägen till glukos som sedan används för att generera energi i form av ATP till muskelcellen själv. B: Höga intracellulära nivåer av AMP kan stimulera glykogenolys i skelettmuskel. C: Intracellulär signalering inducerad av hormonet glukagon stimulerar glykogenolys och hämmar glykogenes i skelettmuskel. D: Utan ett funktionellt debranching enzyme kan bara en mindre del av leverns glykogenförråd utnyttjas för att höja blodets glukoskoncentration i en fastesituation.";"glykogen";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (1p) A: Glykogenet i skelettmuskel bryts ner hela vägen till glukos som sedan används för att generera energi i form av ATP till muskelcellen själv. B: Höga intracellulära nivåer av AMP kan stimulera glykogenolys i skelettmuskel. C: Intracellulär signalering inducerad av hormonet glukagon stimulerar glykogenolys och hämmar glykogenes i skelettmuskel. D: Utan ett funktionellt debranching enzyme kan bara en mindre del av leverns glykogenförråd utnyttjas för att höja blodets glukoskoncentration i en fastesituation.";"C och D"
"2023-05-15";"33";"Vilken typ av bilirubin är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? (1p)";"heme";"";"Vilken typ av bilirubin är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? (1p)";"Det okonjugerade bilirubinet. Bilirubin är en hydrofob molekyl. I normala fall kommer bilirubin i levern att konjugeras med två glukuronsyra som gör att molekylen blir vattenlöslig och kan utsöndras med gallsyran. Om denna konjugering inte sker kan bilirubin inte utsöndras, och därför är det denna variant vi kommer att se förhöjda halter av vid sjukdom."
"2023-05-15";"24";"Vilka två av nedanstående enzymer återfinns i citronsyracykeln? (1p) A: Succinatdehydrogenas B: Pyruvatdehydrogenas C: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas";"citronsyracykeln";"";"Vilka två av nedanstående enzymer återfinns i citronsyracykeln? (1p) A: Succinatdehydrogenas B: Pyruvatdehydrogenas C: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas";"A och D"
"2023-05-15";"10";"Vilka två alternativ är korrekta vad gäller 5' cap hos eukaryot mRNA? (1p) A: Stimulerar syntes av polyA-svansen. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Skyddar mRNA från nedbrytning. D: Består av nukleotid bunden via en 55 bindning.";"rna-syntes";"";"Vilka två alternativ är korrekta vad gäller 5' cap hos eukaryot mRNA? (1p) A: Stimulerar syntes av polyA-svansen. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Skyddar mRNA från nedbrytning. D: Består av nukleotid bunden via en 55 bindning.";"C och D"
"2023-05-15";"9";"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonCrick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'. B: Ett varv av DNA motsvarar ca 10,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är vänstervriden.";"nukleotider";"";"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonCrick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'. B: Ett varv av DNA motsvarar ca 10,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är vänstervriden.";"B och C"
"2023-05-15";"34";"Du ska labba! Beskriv fyra saker som du behöver göra innan du börjar experimentera. (2p) Max 50 ord.";"introduktionslaboration";"";"Du ska labba! Beskriv fyra saker som du behöver göra innan du börjar experimentera. (2p) Max 50 ord.";"Förbereda mig genom att läsa igenom labb-handledningen så att jag vet vad jag ska göra. Lämna ytterkläder och väska och ta på mig labbrock. Tvätta av bänken med minst 75% etanol. Vid behov, ta på mig handskar."
"2023-05-15";"14";"Beskriv strukturen och funktionen av aminoacyl-tRNA syntetas översiktligt samt förklara vad som sker i aminoacyl-tRNA syntetas om fel aminosyra binder till tRNA. (2p) Max 150 ord.";"translation";"";"Beskriv strukturen och funktionen av aminoacyl-tRNA syntetas översiktligt samt förklara vad som sker i aminoacyl-tRNA syntetas om fel aminosyra binder till tRNA. (2p) Max 150 ord.";"Aminoacyl-tRNA syntetas är ett enzym som katalyserar inbindning av en aminosyra till sin motsvarande tRNA-molekyl för att kunna nyttjas i translationen och kopplas ihop med andra aminosyror. Aminoacyl-tRNA syntetas har två olika delar som är avgörande för funktionen. Det finns ett active site, dit aminosyran binder för att sedan kunna länkas till en OH-grupp på tRNA-molekylens CCA-svans. Sedan finns också ett editing site. Enzymet kommer att känna av om kopplingen mellan aminosyran och tRNA blev rätt eller inte. Om det blev fel kommer editing siten direkt att spjälka loss aminosyran från tRNA för att via active site kunna sätta dit en ny. Det finns en god flexibilitet hos enzymet som gör att dessa två olika delar enkelt kan samarbeta för att snabbt åtgärda ett eventuellt fel."
"2023-05-15";"20";"Vilka två av nedanstående behöver du känna till för att beräkna omsättningstalet för ett enzym? (1p) A: Enzymstrukturen. B: Enzymkoncentrationen. C: Initialhastigheten för den katalyserade reaktionen vid [S] >> Kₘ. D: Kₘ för substratet.";"enzymer";"";"Vilka två av nedanstående behöver du känna till för att beräkna omsättningstalet för ett enzym? (1p) A: Enzymstrukturen. B: Enzymkoncentrationen. C: Initialhastigheten för den katalyserade reaktionen vid [S] >> Kₘ. D: Kₘ för substratet.";"B och C"
"2023-05-15";"30";"Varför är tillgång av NADPH essentiellt för ett fungerande glutationsystem? (1p) Max 50 ord.";"pentosfosfatvägen";"";"Varför är tillgång av NADPH essentiellt för ett fungerande glutationsystem? (1p) Max 50 ord.";"Glutation är en antioxidant som reducerar reaktiva syreföreningar, ex väteperoxid till vatten. För att reaktionen ska kunna ske igen måste glutation reduceras tillbaka till sin ursprungsform. Det är NADPH som fungerar som reduktionsmedel och oxideras till NADP⁺. Utan NADPH förblir glutation oxiderat och kan inte reducera fler farliga syreradikaler."
"2023-05-15";"15";"Coronavirus ändrades mycket under pandemin, från en ganska dödlig variant som var lagom smittsam till en variant som är relativt ofarlig men mycket smittsam. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till. (2p)";"evolution";"";"Coronavirus ändrades mycket under pandemin, från en ganska dödlig variant som var lagom smittsam till en variant som är relativt ofarlig men mycket smittsam. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till. (2p)";"1 av 2: Med tiden har celler, organismer och hela populationer förändrats efter rådande omständigheter. Miljön påverkar och leder till att egenskaper som är gynnsamma för en organisms överlevnad i den aktuella miljön kommer att bevaras medan egenskaper som inte är gynnsamma kommer att selekteras bort hos kommande generationer. Coronaviruset genomgick en sådan förändring. Till en början var viruset mindre smittsamt men hade en högre dödlighet hos de smittade. Människor kom fram med sätt att skydda sig mot viruset och metoder för att bli frisk om man blivit smittad. Viruset mötte motstånd som hotade dess fortsatta utveckling och överlevnad. Omgivningen fick alltså viruset att utveckla nya egenskaper som var mer gynnsamma för att kunna fortsätta utvecklas och leva vidare. Det var i detta fall att bli mindre dödligt men desto mer smittsamt. Omgivningens selektionstryck kommer alltså leda till en förändring hos organismen där de mest fördelaktiga egenskaperna för dess överlevnad kommer att bevaras och utvecklas vidare."
"2023-05-15";"21";"Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) A: ATP stimulerar katabolism. B: ATP innehåller en energirik fosfoanhydridbindning för varje fosfatgrupp. C: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan negativa laddningar. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i CTP.";"introduktion-till-metabolismen";"";"Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) A: ATP stimulerar katabolism. B: ATP innehåller en energirik fosfoanhydridbindning för varje fosfatgrupp. C: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan negativa laddningar. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i CTP.";"C och D"
"2023-05-15";"31";"Beskriv översiktligt kolesterolets omsättning i kroppen: var det kommer ifrån, två viktiga funktioner och hur det kan utsöndras. (2p)";"kolesterol";"";"Beskriv översiktligt kolesterolets omsättning i kroppen: var det kommer ifrån, två viktiga funktioner och hur det kan utsöndras. (2p)";"Kolesterol kan antingen bildas i kroppen eller intas via födan. För en person som väger ca 70 kg och har en västerländsk diet får man i sig ca 500700 mikrogram kolesterol via födan varje dygn och ca 50% av detta tas upp i kroppen. Syntes av kolesterol kommer att ske ändå, men i vilken utsträckning varierar beroende på kostsammansättningen. Kolesterol är en viktig komponent i våra cellmembran där det påverkar membranets fluiditet och skyddar membranet från att fluiditeten ska bli för hög eller låg vid temperaturförändringar i kroppen. Kolesterol utgör också grundstrukturen i syntesen av katekolaminer i binjuren, exempelvis testosteron, testosteron och progesteron. När kolesterol bryts ner kommer det att utsöndras gallan."
"2023-05-15";"25";"Vilka två av nedanstående påståenden om ketonkroppar är korrekta? (1p) A: De syntetiseras i njuren. B: De kan betraktas som vattenlösliga transportformer av oxaloacetat i blodbanan. C: Höga halter av ketonkroppar ger metabol acidos. D: De används som energikälla i hjärtmuskel och njurcortex.";"betaoxidation";"";"Vilka två av nedanstående påståenden om ketonkroppar är korrekta? (1p) A: De syntetiseras i njuren. B: De kan betraktas som vattenlösliga transportformer av oxaloacetat i blodbanan. C: Höga halter av ketonkroppar ger metabol acidos. D: De används som energikälla i hjärtmuskel och njurcortex.";"C och D"
"2023-05-15";"11";"Enzymet flap endonuclease 1 (FEN1) är viktigt vid eukaryot DNA-replikation. Vad gör detta enzym? (2p)";"dna-replikation";"";"Enzymet flap endonuclease 1 (FEN1) är viktigt vid eukaryot DNA-replikation. Vad gör detta enzym? (2p)";"FEN1 är verksamt vid lagging strand under Okazaki fragment maturation. Eftersom lagging strand syntetiseras i flera sekvenser finns det flera primers med RNA inne i den nysyntetiserade strängen. I färdigt DNA vill vi inte ha något RNA kvar, detta måste på något sätt plockas bort. När polymeraset syntetiserar ett fragment kommer det slutligen krocka in i RNA-primern som utgjorde starten för det föregående fragmentet. När polymeraset och primern krockar kommer primern puttas bort och hänga som en liten svans från DNA-strängen. Då är det FEN1 som med sin endonukleasaktivitet klipper bort primern så att enbart DNA återstår i den nya strängen."
"2023-05-15";"8";"De olika kolatomerna i ribos och deoxyribos numreras som 1', 2', 3', 4' och 5'. (2p) A) Vad skiljer ribos från deoxyribos? B) Till vilken position är basen kopplad?";"nukleotider";"";"De olika kolatomerna i ribos och deoxyribos numreras som 1', 2', 3', 4' och 5'. (2p) A) Vad skiljer ribos från deoxyribos? B) Till vilken position är basen kopplad?";"A) Ribos har en OH-grupp kopplad till både 2´ och 3´ position. Deoxyribos har också en OH-grupp vid 3´ position, men enbart ett väte i 2´ position. B) Kvävebasen är kopplad till pentosens 1´ position."
"2023-05-15";"35";"Vilka två av nedanstående används som substrat för beta-galaktosidas vid blåvit screening? (1p) A: IPTG B: X-gal C: Beta-laktamas D: 5-Bromo-4-Chloro-3-Indolyl beta-D-Galctopyranoside";"plasmid";"";"Vilka två av nedanstående används som substrat för beta-galaktosidas vid blåvit screening? (1p) A: IPTG B: X-gal C: Beta-laktamas D: 5-Bromo-4-Chloro-3-Indolyl beta-D-Galctopyranoside";"B och D"
"2023-05-15";"3";"Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp vardera som deras R-grupper kan delta i när pH = 7. (1p) Aminosyror: Cystein Glutamat Treonin Tryptofan Bindningstyper: Jonbindning Kovalent bindning van der Waals interaktion Vätebindning";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp vardera som deras R-grupper kan delta i när pH = 7. (1p) Aminosyror: Cystein Glutamat Treonin Tryptofan Bindningstyper: Jonbindning Kovalent bindning van der Waals interaktion Vätebindning";"Cystein: Kovalent bindning Glutamat: Jonbindning Treonin: Vätebindning Tryptofan: van der Waals interaktion"
"2023-05-15";"7";"Membranlipider är amfipatiska. Vad betyder amfipati och varför är det en nödvändig egenskap för membranlipider? (2p) Max 75 ord.";"cellmembran";"";"Membranlipider är amfipatiska. Vad betyder amfipati och varför är det en nödvändig egenskap för membranlipider? (2p) Max 75 ord.";"En molekyl som är amfipatisk har både en hydrofob och en hydrofil del. Både fosfolipiderna och kolesterol är amfipatiska molekyler. Egenskapen gör att membranlipiderna kan orientera sig så att det bildas ett dubbellager med samtliga molekylers hydrofoba delar riktade in mot varandra och membranets mitt medan dess hydrofila delar riktas mot cytoplasman respektive extracellulärmatrix. Amfipati är alltså en nödvändig egenskap för att kunna bilda ett cellmembran som kan interagera med omgivningen och utgöra en barriärfunktion."
"2023-05-15";"6";"A) Vad kallas den kovalenta bindningen som binder ihop två monosackarider (till exempel i en di- eller trisackarid)? B) Ange två skäl till varför tre hexoser kan resultera i många fler olika trisackarider än antalet olika tripeptider tre aminosyror kan resultera i. (2p) Max 100 ord.";"kolhydrater";"";"A) Vad kallas den kovalenta bindningen som binder ihop två monosackarider (till exempel i en di- eller trisackarid)? B) Ange två skäl till varför tre hexoser kan resultera i många fler olika trisackarider än antalet olika tripeptider tre aminosyror kan resultera i. (2p) Max 100 ord.";"1 av 2: A) Glykosidbindning. B) Det finns 20 proteinogena aminosyror. Dessa kan förekomma i L- och D-form efter hur de bryter ljus. I kroppen finns bara aminosyror av L-form, det innebär att det i kroppen endast finns 20 olika aminosyror att välja mellan i skapandet av en tripeptid. Antalet möjliga kombinationer är begränsat. Det finns många olika monosackarider. Dessa kan likt aminosyrorna också förekomma i olika former, så kallade stereoisomerer. Skillnaden är att det finns väldigt många fler monosackarider och fler isomerer av dessa som kan förekomma i kroppen. Det gör att det finns en större möjlig variation vid bildandet av en trisackarid."
"2023-05-15";"2";"I pyruvatdehydrogenaskomplexet överförs en av reaktionsintermediärerna från en subenhet till en annan och till det används sidogruppen av en aminosyra kopplad med en kovalent bindning till en prostetisk grupp. (2p) Max 30 ord. A) Vilken aminosyra är lämplig för uppdraget och varför? B) Förklara kortfattat syftet med överföringen.";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"I pyruvatdehydrogenaskomplexet överförs en av reaktionsintermediärerna från en subenhet till en annan och till det används sidogruppen av en aminosyra kopplad med en kovalent bindning till en prostetisk grupp. (2p) Max 30 ord. A) Vilken aminosyra är lämplig för uppdraget och varför? B) Förklara kortfattat syftet med överföringen.";"A) Serin. Är en alkohol, har OH-grupp som kan bilda vätebindning till kväveatomer hos lipoamidarmen. B) Acetylgrupp överförs av lipoamidarmen från E1 till E2 där den blir acetyl-CoA."
"2024-12-20";"28";"Vid reduktion av syre bildas små mängder reaktiva syreföreningar. Ange två enzymer som oskadliggör dessa. (2p) Max 10 ord.";"elektrontransportkedjan";"";"Vid reduktion av syre bildas små mängder reaktiva syreföreningar. Ange två enzymer som oskadliggör dessa. (2p) Max 10 ord.";"1. Glutation perioxidas 2. Superoxid dismutas"
"2024-12-20";"5";"Redogör för hur bakterier/anpassning av cellmembranets fluiditet kan ske via fettsyrornas egenskaper. (4p)";"cellmembran";"";"Redogör för hur bakterier/anpassning av cellmembranets fluiditet kan ske via fettsyrornas egenskaper. (4p)";"Fettsyror i cellmembran är amfipatiska, och har alltså en polär del (huvud) och en opolär del (svans). Den opolära delen består av acylgrupper, som binder till varandra via VdW-krafter, vilket inte är så starka bindningar och börjar därför lossna vid värmetillförsel (även om det inte är så hög temperatur). Fluiditeten i cellmembran ökar när temperaturen ökar, eftersom fettsyrorna börjar att röra på sig av värmeenergin. För att cellmembranet inte ska bli alltför genomsläppligt så fungerar kolesterol som en buffert som minskar på rörelsen hos fettsyrorna. Och tvärtom gäller det att när temperaturen sjunker så minskar fettsyrornas rörelseenergi, och de börjar att binda hårdare till varandra. För att cellmembranet inte ska klumpa ihop sig, och bli helt ogenomsläppligt så fungerar kolesterolet även här som en buffert som sitter mellan fettsyrorna och sänker möjligheten för ihopklumpning av fettsyrorna."
"2024-12-20";"18";"Chymotrypsin är ett enzym som använder kovalent katalys, vilken lämnar en kovalent bunden polypeptid till ett serin i enzymet efter att peptidbindningen har spjälkats. Redogör för den kemiska mekanism med vilken enzymet regenereras. (4p)";"enzymer";"";"Chymotrypsin är ett enzym som använder kovalent katalys, vilken lämnar en kovalent bunden polypeptid till ett serin i enzymet efter att peptidbindningen har spjälkats. Redogör för den kemiska mekanism med vilken enzymet regenereras. (4p)";"Brevid serinet finns histidin, som en del av den katalytiska triaden (med bredvid menas endast i den katalytiska triaden, eftersom i primärstrukturen ligger serin och histidin inte brevid varandra). När en vattenmolekyl kommer in i den katalytiska klyftan så kommer histidinet att ta upp ett väte från vattenmolekylen, vilket aktiverar syremolekylen i vattnet. Syremolekylen utför en nukleofil attack på bindningen mellan serin och polypeptiden, och syret från vattnet binder till polypeptiden istället för serin. Detta gör att peptiden och OH-gruppen från vattnet lämnar den katalytiska klyftan, och att histidin donerar sitt väte som den tog från vattnet till serinet så att serin återgår till att ha en OH-grupp i sin sidokedja så att enzymet regenereras till sin ursprungsform."
"2024-12-20";"1";"Förklara vad som menas med att en molekyl är resonansstabiliserad och vad det innebär för molekylen. Illustrera med ett valfritt exempel. (4p) Max 30 ord. Illustrationen görs på ett separat papper.";"kemiska-bindingar";"";"Förklara vad som menas med att en molekyl är resonansstabiliserad och vad det innebär för molekylen. Illustrera med ett valfritt exempel. (4p) Max 30 ord. Illustrationen görs på ett separat papper.";"""Mellanläge"" mellan enkelbindning och dubbelbindning, så styrkan på en resonansstabiliserad bindning är mellan enkelbindning och dubbelbindning. Atomer delar på elektronerna, så molekylen kan stabiliseras och finnas i flera konfigurationer. Ritning: ATP med streckade bindningar mellan PO som visar resonans (sid 8). ![[Pasted image 20251129235730.png]]"
"2024-12-20";"19";"Ett enzym uppvisar Michaelis-Menten kinetik, vilket gör det möjligt att bestämma dess Km-värde. Km kan man använda för att förstå: (2p) A: Hur snabbt det går för bundet substrat att bli omsatt till frisatt produkt. B: Hur sannolikt det är att substrat binder till enzymet. C: Hur bra ett enzym kan skilja mellan olika möjliga substrat. D: Hur sannolikt det är att substrat lossnar från enzymet när det har bundit.";"enzymer";"";"Ett enzym uppvisar Michaelis-Menten kinetik, vilket gör det möjligt att bestämma dess Km-värde. Km kan man använda för att förstå: (2p) A: Hur snabbt det går för bundet substrat att bli omsatt till frisatt produkt. B: Hur sannolikt det är att substrat binder till enzymet. C: Hur bra ett enzym kan skilja mellan olika möjliga substrat. D: Hur sannolikt det är att substrat lossnar från enzymet när det har bundit.";"C och D"
"2024-12-20";"29";"Beskriv hur triacylglycerol i fettceller bryts ner till fria fettsyror. (4p)";"lipider";"";"Beskriv hur triacylglycerol i fettceller bryts ner till fria fettsyror. (4p)";"Adrenalin eller glukagon inducerar intracellulära reaktioner via 7TM, vilket omvandlar ATP till cAMP. cAMP aktiverar proteinkinas A, som i sin tur aktiverar perilipin. Perilipin omarrangerar TAG så att ATGL kan klyva den första fettsyran (TAG blir DAG). Proteinkinas A aktiverar HS lipas som spjälkar den andra fettsyran (DAG till MAG). MAG lipas spjälkar den tredje fettsyran, så att det bara blir kvar glycerol."
"2024-12-20";"4";"Du ska rena ett protein med gelfiltrering. Proteinet innehåller också en his-tagg. (4p) Max 200 ord. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med gelfiltrering. B) Beskriv vad en his-tag är och hur den kan användas för rening och detektion.";"utforska-proteiner";"";"Du ska rena ett protein med gelfiltrering. Proteinet innehåller också en his-tagg. (4p) Max 200 ord. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med gelfiltrering. B) Beskriv vad en his-tag är och hur den kan användas för rening och detektion.";"A) Gelfiltrening består av en fast fas med porösa kulor i en kolonn, och en mobil fas med en buffert och proteinet som ska renas. Små molekyler kommer att fastna i håligheterna i kulorna, medan stora proteiner kommer att komma ut först. Reningsmetoden är alltså baserad på proteiners storlek. B) His-tagg är en sekvens av 6 histidin-aminosyror efter varandra. His-tagg binder starkt till nickel-joner och man kan därför använda den egenskapen vid rening av proteinet. Man använder då affinitetskromatografi, och renar proteinet baserat på selektivitet alltså en specifik egenskap. Proteinet kan sedan elueras med Imidazol, som konkurrerar ut His-taggen."
"2024-12-20";"16";"Para ihop respektive molekyl med en typ av transport den kan genomgå. Varje alternativ får enbart användas en gång. (2p) A: Glukos B: O₂ C: K⁺ D: Vatten Transporttyper: A: Sekundär aktiv transport B: Primär aktiv transport C: Passiv transport D: Fri diffusion";"transport-över-cellmembran";"";"Para ihop respektive molekyl med en typ av transport den kan genomgå. Varje alternativ får enbart användas en gång. (2p) A: Glukos B: O₂ C: K⁺ D: Vatten Transporttyper: A: Sekundär aktiv transport B: Primär aktiv transport C: Passiv transport D: Fri diffusion";"Glukos → Sekundär aktiv transport O₂ → Fri diffusion K⁺ → Primär aktiv transport Vatten → Passiv transport (kanal/aquaporin)"
"2024-12-20";"22";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker när hormonet insulin utsöndras. B: Aminosyrorna alanin och lysin är glukogena. C: Glukoneogenes sker under nattens fasta. D: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat.";"glukoneogenes";"";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker när hormonet insulin utsöndras. B: Aminosyrorna alanin och lysin är glukogena. C: Glukoneogenes sker under nattens fasta. D: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat.";"C och D"
"2024-12-20";"32";"Nämn en vanlig sjukdom som är relaterad till nedbrytning av nukleotider, samt ange vilken av de två huvudtyperna av nukleotider som har en koppling till denna sjukdom. (2p) Max 10 ord.";"nukleotidnedbrytning";"";"Nämn en vanlig sjukdom som är relaterad till nedbrytning av nukleotider, samt ange vilken av de två huvudtyperna av nukleotider som har en koppling till denna sjukdom. (2p) Max 10 ord.";"Gikt, och puriner har en koppling till sjukdomen."
"2024-12-20";"26";"Redogör för två sätt som metabolismen ändras vid träning och hur ändringarna leder till förbättrad prestation. (4p) Max 120 ord.";"integrering-av-metabolismen";"";"Redogör för två sätt som metabolismen ändras vid träning och hur ändringarna leder till förbättrad prestation. (4p) Max 120 ord.";"Laktat i muskeltyp IIb tas upp av hjärtat och av muskeltyp I, vilket gör att mängden laktat minskar i muskeltyp IIb så att anaerob metabolism kan fortgå längre. Hjärtats konkurrens om glukos minskar även då. Laktat tas även upp av levern, och omvandlas till pyruvat, och sedan till glukos som går ut till blodet och tas upp av muskeltyp IIb och används i glykolysen. Detta kallas för Coricykeln. Båda dessa metabola vägar leder till förbättrad prestation, eftersom kroppen orkar hålla på under längre tid."
"2024-12-20";"12";"Vilka två påståenden om B-DNA (WatsonCrick helix) är korrekta? (2p) A: Avståndet mellan baspar i helixen är 5,0 Å. B: Helixen är vänstervriden. C: De två strängarna i helixen löper i motsatta riktningar. D: Ett varv av DNA består av ungefär 10 baspar.";"nukleotider";"";"Vilka två påståenden om B-DNA (WatsonCrick helix) är korrekta? (2p) A: Avståndet mellan baspar i helixen är 5,0 Å. B: Helixen är vänstervriden. C: De två strängarna i helixen löper i motsatta riktningar. D: Ett varv av DNA består av ungefär 10 baspar.";"C och D"
"2024-12-20";"36";"Vilka två påståenden om plasmidkloning är korrekta? (2p) A: När en miniprep görs centrifugeras lösningen direkt efter alkalisk lysering för att separera plasmider från bakterierester. B: IPTG används för att bryta ned X-gal vilket gör att kolonier som tagit upp plasmiden blir blå. C: LacZ-genen används för blåvit screening där vita kolonier indikerar rekombinant DNA och blå kolonier indikerar icke-rekombinant DNA. D: BamHI är ett restriktionsenzym som klyver DNA vid en specifik sekvens.";"plasmid";"";"Vilka två påståenden om plasmidkloning är korrekta? (2p) A: När en miniprep görs centrifugeras lösningen direkt efter alkalisk lysering för att separera plasmider från bakterierester. B: IPTG används för att bryta ned X-gal vilket gör att kolonier som tagit upp plasmiden blir blå. C: LacZ-genen används för blåvit screening där vita kolonier indikerar rekombinant DNA och blå kolonier indikerar icke-rekombinant DNA. D: BamHI är ett restriktionsenzym som klyver DNA vid en specifik sekvens.";"C och D"
"2024-12-20";"27";"I elektrontransportkedjan förekommer steg där elektrondonatorn och elektronacceptorn inte är bärare av lika många elektroner. Redogör för vad som händer vid ett sådant steg. (4p) Max 100 ord.";"elektrontransportkedjan";"";"I elektrontransportkedjan förekommer steg där elektrondonatorn och elektronacceptorn inte är bärare av lika många elektroner. Redogör för vad som händer vid ett sådant steg. (4p) Max 100 ord.";"Detta händer i komplex III i elektrontransportkedjan när coenzym Q ska donera 2 elektroner till cytokrom C som endast kan ta upp en elektron. Q-cykeln: QH₂ kommer till Q Cytokrom C oxidoreduktas (komplex III): 1 elektron tas upp av cytokrom C och ges till cytokrom C (elektronen transporteras till komplex IV) 1 elektron tas upp av Q som blir Q⁻ En annan QH₂ kommer in till komplex III 1 elektron tas upp av cytokrom C1 och ges till cytokrom C 1 elektron tas upp av Q⁻ blir till QH₂ (2 H⁺ tas upp från matrix)"
"2024-12-20";"13";"Describe the main features of the genetic code and explain their biological significance. (4p) Answer in English.";"translation";"";"Describe the main features of the genetic code and explain their biological significance. (4p) Answer in English.";"The genetic code is in humans stored in DNA (23 chromosome pairs). It stems from our mother and father. The DNA contains 4 different base-pairs. Adenin, Tymin, Cytosin och Guanin. The genetic code is not read one base-pair at a time, but rather in groups of three (i.e codons). For example AUG, ATT. The genetic code is also degenarative, leading to different codons being able to code for the same aminoacid. This leads to a protective function against mutations, since a mutation in a codon can lead to the same amino acid still being coded for example. The gentic code codes for all the proteins in an organism. The DNA can be transcribed into mRNA which can be translated into proteins"
"2024-12-20";"17";"Gibbs fria energi möjliggör att man kan förutsäga om en kemisk reaktion kan ske spontant. Ange vilka termer som ingår i formeln som beskriver förändringar i Gibbs fria energi. Förklara även hur ökad respektive minskad temperatur påverkar förändringen av Gibbs fria energi. (4p)";"termodynamik";"";"Gibbs fria energi möjliggör att man kan förutsäga om en kemisk reaktion kan ske spontant. Ange vilka termer som ingår i formeln som beskriver förändringar i Gibbs fria energi. Förklara även hur ökad respektive minskad temperatur påverkar förändringen av Gibbs fria energi. (4p)";"Gibbs fria energi = deltaG Entalpi = deltaH Temperatur = T Entropi = deltaS En ökad temperatur kommer ha inverkan på entropin, vilket kommer leda till att deltaG kommer bli mer negativ/gå mot ett lägre värde. Den kemiska reaktionen i fråga kommer då förkjutas mot ett läge där den kan ske spontant (kan ske spontant om delta G är <0) En minskad temperatur kommer också ha en inverkan på entropin, fast i detta fall kommer deltaG istälett gå mot ett högre värde. Den kemiska reaktionen i fråga kommer då kräva mer energi för att äga rum. Temperaturen påverkar entropin eftersom detta är ett diret mått på molekylers/atomernas rörelseenergi."
"2024-12-20";"23";"Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet adrenalin induceras glykogenes i cellen. B: Glykogen upplagrat i skelettmuskel används främst för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider. C: Glukos-6-fosfat är slutprodukten vid glykogenolys i skelettmuskler. D: Glykogenin är ett enzym som är kovalent bundet till glykogen.";"glykogen";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet adrenalin induceras glykogenes i cellen. B: Glykogen upplagrat i skelettmuskel används främst för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider. C: Glukos-6-fosfat är slutprodukten vid glykogenolys i skelettmuskler. D: Glykogenin är ett enzym som är kovalent bundet till glykogen.";"C och D"
"2024-12-20";"33";"Var i cellen sker pentosfosfatvägen, och vilken biomolekyl, som kan användas vid reduktiv biosyntes, kan bildas i denna väg? (2p) Max 10 ord.";"pentosfosfatvägen";"";"Var i cellen sker pentosfosfatvägen, och vilken biomolekyl, som kan användas vid reduktiv biosyntes, kan bildas i denna väg? (2p) Max 10 ord.";"Pentosfosfatvägen sker i cytosolen, och bildar NADPH."
"2024-12-20";"24";"Vilka av följande faktorer stimulerar glykogenolys i en skelettmuskelcell? (2p) A: Intracellulär signalering inducerad av hormonet adrenalin. B: Aktivering av proteinfosfatas 1 i cellen. C: En låg energistatus i cellen, vilket reflekteras av en förhöjd intracellulär koncentration av AMP. D: En förhöjd koncentration av ATP i cellen.";"glykogen";"";"Vilka av följande faktorer stimulerar glykogenolys i en skelettmuskelcell? (2p) A: Intracellulär signalering inducerad av hormonet adrenalin. B: Aktivering av proteinfosfatas 1 i cellen. C: En låg energistatus i cellen, vilket reflekteras av en förhöjd intracellulär koncentration av AMP. D: En förhöjd koncentration av ATP i cellen.";"A och C"
"2024-12-20";"10";"Vilken är den biologiska betydelsen av den 5-cap som återfinns på mRNA i eukaryota celler? (4p)";"rna-syntes";"";"Vilken är den biologiska betydelsen av den 5-cap som återfinns på mRNA i eukaryota celler? (4p)";"Så fort mRNA:et börjar komma ut från RNA polymeras II, så sätts det på en guaninmolekyl på 5'-ändan via en 5'-5' bindning. Detta gör att mRNA-sekvensen inte bryts ner och att transkriptionen kan fortgå. När transkriptionen är färdig och mRNA-sekvensen har fått sin poly(A)-svans på sin 3´-ända och ska translateras så krävs det att både 5´cap och poly(A) finns på mRNA:et för att det ska kännas igen av ribosomen och translateras. 5´-capen hämmar alltså nedbrytning av mRNA, och möjliggör intiering av translation (tillsammas med poly(A)-svansen)."
"2024-12-20";"9";"Histonmodifieringar spelar en viktig roll i kromatinets funktion. Vilken effekt har acetylering av histoner på kromatinstrukturen, och varför är detta viktigt för genuttryck? (4p)";"kromatin";"";"Histonmodifieringar spelar en viktig roll i kromatinets funktion. Vilken effekt har acetylering av histoner på kromatinstrukturen, och varför är detta viktigt för genuttryck? (4p)";"I nukleosomen finns bland annat dubbla uppsättningar av H3 och H4, och dessa 4 histoner har svansar av positivt laddade aminosyror (t.ex lysin och arginin) vid sin N-terminal. Dessa aminosyror binder till fosfatgrupperna på DNA:et ryggrad, eftersom fosfatgrupperna är negativt laddade. När svansarna blir acetylerade så neutraliseras de positiva laddningarna, och svansarna binder inte lika hårt till fosfatgrupperna. Detta möjliggör för enzymer att komma åt DNA:et, eftersom den inte är så hårt bunden till histonerna och möjliggör reglering av genuttryck (antingen mer eller mindre transkription beroende på gen och vilket enzym det handlar om)."
"2024-12-20";"34";"På vilka två sätt regleras kolesterolsyntesens hastighet? (2p) A: Via mängden aktivt 24-dehydrokolesterolreduktas, som styr aktiviteten i Kandutsch-Russel vägen för kolesterolsyntes. B: Via mängden aktivt HMG-CoA reduktas, som katalyserar bildningen av mevalonat. C: Via mängden aktivt squalenmonooxygenas, som katalyserar första steget i cykliseringen av squalen till lanosterol. D: Via mängden aktivt SLC25A1, ett transportprotein som transporterar citrat ut ur mitokondrien.";"kolesterol";"";"På vilka två sätt regleras kolesterolsyntesens hastighet? (2p) A: Via mängden aktivt 24-dehydrokolesterolreduktas, som styr aktiviteten i Kandutsch-Russel vägen för kolesterolsyntes. B: Via mängden aktivt HMG-CoA reduktas, som katalyserar bildningen av mevalonat. C: Via mängden aktivt squalenmonooxygenas, som katalyserar första steget i cykliseringen av squalen till lanosterol. D: Via mängden aktivt SLC25A1, ett transportprotein som transporterar citrat ut ur mitokondrien.";"B och C"
"2024-12-20";"14";"Hur kan man identifiera viktiga aminosyror i ett protein när man bara har sekvensinformation från många olika organismer att tillgå? (4p)";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"Hur kan man identifiera viktiga aminosyror i ett protein när man bara har sekvensinformation från många olika organismer att tillgå? (4p)";"Sekvensanalys innebär att man kan identifiera viktiga aminosyror genom att jämföra sekvenser från flera olika organismer och hitta likheter mellan organismerna. Viktiga aminosyror, t.ex den katalytiska triaden i t.ex chymotrypsin tenderar att bevaras i organismer därför att det naturliga urvalet bevarar sekvenser som är gynnsamma för artens anpassning och överlevnad."
"2024-12-20";"20";"Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs från ATP ökar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från glukos 6-fosfat. C: Det frigörs lika mycket energi när ATP och GTP hydrolyseras. D: ATP har högre fosforyltransferpotential än fosfoenolpyruvat.";"introduktion-till-metabolismen";"";"Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs från ATP ökar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från glukos 6-fosfat. C: Det frigörs lika mycket energi när ATP och GTP hydrolyseras. D: ATP har högre fosforyltransferpotential än fosfoenolpyruvat.";"A och C"
"2024-12-20";"30";"Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur hemesyntesen regleras. (4p)";"heme";"";"Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur hemesyntesen regleras. (4p)";"I första steget av hemesyntesen används enzymet ALA-syntas, och det är translationen av detta enzym som regleras. Det finns ett järn-bindande protein som binder till mRNA:et som kodar för ALA-syntas vid frånvaro av järn. När det finns järn så binder järnet till järn-bindande proteinet, och får det att lossna från mRNA:et. Då kan mRNA:et translateras och ALA-syntas bildas. Järn sätts in i heme som sista steg vid syntesen, så det hade varit onödigt om alla syntes-steg skedde trots att det inte finns något järn."
"2024-12-20";"15";"Vilka två påståenden om jonkanaler är korrekta? (2p) A: Transport sker alltid med en gradient. B: Na⁺-kanalen är mer selektiv än K⁺-kanalen. C: ATP driver transporten. D: De kan aktiveras genom ligandbindning.";"transport-över-cellmembran";"";"Vilka två påståenden om jonkanaler är korrekta? (2p) A: Transport sker alltid med en gradient. B: Na⁺-kanalen är mer selektiv än K⁺-kanalen. C: ATP driver transporten. D: De kan aktiveras genom ligandbindning.";"A och D"
"2024-12-20";"21";"A) Förklara vad som menas med allosterisk reglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras allosteriskt och redogör för hur enzymets aktivitet ändras av regleringen. (4p) Max 50 ord.";"glykolysen";"";"A) Förklara vad som menas med allosterisk reglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras allosteriskt och redogör för hur enzymets aktivitet ändras av regleringen. (4p) Max 50 ord.";"A) När en molekyl binder till ett annat ställe på enzymet än på det aktiva sätet och ändrar enzymets form, vilket ändrar dess aktivitet. B) Fosfofruktokinas I stimuleras vid allosterisk reglering av AMP och fruktos-2,6-bisfofat. Den hämmas vid allosterisk reglering av ATP och citrat."
"2024-12-20";"31";"Nämn en så kallad alfa-ketosyra, som via transaminering kan omvandlas till en aminosyra. Ange även vilken aminosyra som bildas från alfa-ketosyran, vad enzymet som katalyserar reaktionen heter, samt från vilken metabol väg alfa-ketosyran kan hämtas. (4p) Max 25 ord.";"aminosyrametabolism";"";"Nämn en så kallad alfa-ketosyra, som via transaminering kan omvandlas till en aminosyra. Ange även vilken aminosyra som bildas från alfa-ketosyran, vad enzymet som katalyserar reaktionen heter, samt från vilken metabol väg alfa-ketosyran kan hämtas. (4p) Max 25 ord.";"Oxaloacetat (alfaketosyra) transamineras vid deaminering av glutamat (aminosyra), och bilda aspartat (aminosyra som bildas) och alfa-ketoglutarat (alfa-ketosyran som bildas) Enzym: aspartataminotransferas (AST) Alfa-ketosyran från citronsyracykeln"
"2024-12-20";"25";"I vilken ordning kommer glukos att stöta på nedanstående enzymer under sin väg i katabolismen? (2p) A: succinyl-CoA syntetas B: glyceraldehyd 3-dehydrogenas C: malatdehydrogenas D: fosfoglyceratkinas";"integrering-av-metabolismen";"";"I vilken ordning kommer glukos att stöta på nedanstående enzymer under sin väg i katabolismen? (2p) A: succinyl-CoA syntetas B: glyceraldehyd 3-dehydrogenas C: malatdehydrogenas D: fosfoglyceratkinas";"1. glyceraldehyd 3-dehydrogenas 2. fosfoglyceratkinas 3. succinyl-CoA syntetas 4. malatdehydrogenas"
"2024-12-20";"11";"Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Lac-repressorn kan binda till operatorn också när det finns mycket glukos. B: Lac-operonet uttrycks alltid, oavsett närvaro av laktos. C: I närvaro av laktos binder allolaktos till repressorn och förhindrar dess bindning till DNA. D: CAP-proteinet förhindrar transkription av lac-operonet när glukos är frånvarande.";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"";"Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Lac-repressorn kan binda till operatorn också när det finns mycket glukos. B: Lac-operonet uttrycks alltid, oavsett närvaro av laktos. C: I närvaro av laktos binder allolaktos till repressorn och förhindrar dess bindning till DNA. D: CAP-proteinet förhindrar transkription av lac-operonet när glukos är frånvarande.";"A och C"
"2024-12-20";"8";"DNA-replikation är en noggrant reglerad process. I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin, och vilken funktion har detta komplex under replikationen? (4p)";"dna-replikation";"";"DNA-replikation är en noggrant reglerad process. I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin, och vilken funktion har detta komplex under replikationen? (4p)";"MCM-helikaset binder till replikationsorigin under G1-fasen när den lockas dit av ORC, och laddas av Cdc6 och Cdt1. Detta är möjligt under G1-fasen eftersom CDK-nivåerna är låga. Under S-fasen höjs CDK-nivåerna vilket lockar dit Gins och Cdc45, som binder till det laddade MCM-helikaset och skapar ett komplett CMG-helikas som kan börja öppna upp dubbelsträngen. Replikationen sker under S-fasen, och det möjliggörs alltså av de höga nivåerna av CDK, vilket säkerställer att replikationen endast sker en gång under cellcykeln. Helikaset är ett motorprotein som glider längs med DNA-ryggraden av fosfatgrupper och bryter vätebindningarna mellan kvävebaserna genom hydrolys av ATP."
"2024-12-20";"35";"Du jämför ny kolesterolsänkande tablett mot standardbehandling. Efter tre månader görs t-test: p = 0,02, 95% KI för skillnaden 0,51,7 mmol/L. A) Formulera nollhypotes och alternativhypotes. B) Vilka slutsatser kan dras baserat på p-värdet och konfidensintervallet? (4p)";"introduktionslaboration";"";"Du jämför ny kolesterolsänkande tablett mot standardbehandling. Efter tre månader görs t-test: p = 0,02, 95% KI för skillnaden 0,51,7 mmol/L. A) Formulera nollhypotes och alternativhypotes. B) Vilka slutsatser kan dras baserat på p-värdet och konfidensintervallet? (4p)";"A) Nollhypotes: Det finns ingen skilland mellan blodtryckssänkningen om standradbehandling eller den nya tabletten används Alternativ hypotes: Det finns en skilland mellan blodtryckssänkningen om standradbehandling eller den nya tabletten används B) Testet visar statistisk signifikans, eftersom p-värdet är lägre än 0,05 och konfidensintervallet inte innehåller siffran noll. Nollhypotesen kan därför förkastas."
"2024-12-20";"3";"A) Define cooperativity in the context of hemoglobin and myoglobin. B) Give an example where cooperativity is beneficial and explain how it is beneficial. (4p) Max 100 words. Answer in English.";"hemoglobin";"";"A) Define cooperativity in the context of hemoglobin and myoglobin. B) Give an example where cooperativity is beneficial and explain how it is beneficial. (4p) Max 100 words. Answer in English.";"A) Coopertivity means that once one hemegroup in hemoglobin binds to one oxygen molecule, it makes it easier to other oxygen molecules to bind in to the other hemegroups in the same hemoglobin molecule. Even when one oxygen molecule gets released from heme, it fascilitates for other oxygen molecules to get released. B) In hemoglobin there are 4 hememolecules, and each one of them can bind to one oxygen. In the lungs, the partial pressure of oxygen is high, which encourage hemoglobin to bind to oxygen. Coopevtivity here is benificial because it makes the oxygen transport in the body effective."
"2024-12-20";"7";"Vilka två påståenden om nukleotider är korrekta? (2p) A: En nukleotid består av en kvävebas, ett socker och tre fosfatgrupper. B: Den innersta fosfatgruppen, närmast sockret, kallas gamma. C: Ribonukleotider har en OH-grupp på 3'-kolatomen. D: Deoxyribonukleotider innehåller en OH-grupp på 2'-kolatomen.";"nukleotider";"";"Vilka två påståenden om nukleotider är korrekta? (2p) A: En nukleotid består av en kvävebas, ett socker och tre fosfatgrupper. B: Den innersta fosfatgruppen, närmast sockret, kallas gamma. C: Ribonukleotider har en OH-grupp på 3'-kolatomen. D: Deoxyribonukleotider innehåller en OH-grupp på 2'-kolatomen.";"A och C"
"2024-12-20";"6";"Förklara kortfattat likheter och skillnader mellan glukos, glukopyranos och N-acetylglukosamin på strukturell/molekylär nivå. (4p)";"kolhydrater";"";"Förklara kortfattat likheter och skillnader mellan glukos, glukopyranos och N-acetylglukosamin på strukturell/molekylär nivå. (4p)";"3 av 4 poäng: Linjär glukos blir cirkulär genom att aldehydgruppen på kol 1 binder till kol 5. Glukopyranos bildas genom att en aldehydgrupp på en molekyl binder till en hydroxylgrupp på en annan molekyl. Likheten är alltså att båda är cirkulära, men att antalet molekyler är olika. N-acetylglukosamin är en glukosmolekyl, som är bunden till en acetylamingrupp. Acetylamingruppen är bunden till glukoset via sitt kväve. Likheten är alltså att glukos och N-acetylglukosamin båda innehåller glukos, men att N-acetylglukosamin även innehåller en acetylamingrupp."
"2024-12-20";"2";"En aminosyra har en sidogrupp bestående av en aminogrupp och en kedja med fyra CH₂-grupper. A) Vilken är aminosyran? B) Ange två egenskaper aminosyran har. C) Rita upp aminosyran vid pH = 2. (4p) Max 30 ord. Uppgift C på separat papper.";"från-aminosyror-till-proteiner";"";"En aminosyra har en sidogrupp bestående av en aminogrupp och en kedja med fyra CH₂-grupper. A) Vilken är aminosyran? B) Ange två egenskaper aminosyran har. C) Rita upp aminosyran vid pH = 2. (4p) Max 30 ord. Uppgift C på separat papper.";"A) Lysin B) Basisk, kan ta upp en H⁺ vid lågt pH. Fungerar i vissa enzymkomplex som en arm som flyttar prostetisk grupp mellan enzymer, t.ex lipoamiden i pyruvatdehydrogenaskomplexet. Ritning: Lysin vid pH 2, fullständigt protonerad (sid 12). ![[Pasted image 20251129235808.png]]"
1 PU Etik Människovärde Behov Kostnad SRHR - Sexuell reproduktiv hälsa och rättigheter Kunskapscentrum riktar in sig mot personal (KCS) pod sex på arbetstid (kliniskt och forskningsperspektiv) Sexualmedicinskt Centrum (SMC) svårigheter i sex, ångest/tvång osv tvärprofissionellt Mottagning för sexulla övergrepp (MSÖ) mellan primärvård och specialister över 18 år MSÖ Pilen 13 år och uppåt lågtröskelmottagning Etiskt Hur kan du använda dig av det du lärde dig vid forumspelen? + Våga ifrågasätta, Har du varit med om liknande situtation? + Hur agerade du? + Har de du gjort annorlunda idag? + Etik Människovärde Behov Kostnad SRHR - Sexuell reproduktiv hälsa och rättigheter Kunskapscentrum riktar in sig mot personal (KCS) pod sex på arbetstid (kliniskt och forskningsperspektiv) Sexualmedicinskt Centrum (SMC) svårigheter i sex, ångest/tvång osv tvärprofissionellt Mottagning för sexulla övergrepp (MSÖ) mellan primärvård och specialister över 18 år MSÖ Pilen 13 år och uppåt lågtröskelmottagning Etiskt Hur kan du använda dig av det du lärde dig vid forumspelen? + Våga ifrågasätta, Har du varit med om liknande situtation? + Hur agerade du? + Har de du gjort annorlunda idag? +
2 2025-12-05 5 Vad stämmer för en kemisk reaktion? Du kan välja flera alternativ. A I isolering går den till jämvikt. B Hastigheten bestäms av energiskillnaden i substrat och produkt(er). C Ett enzym ändrar deltaG för reaktionen. D Ett negativt deltaG innebär att reaktionen är fördelaktig. menti Vad stämmer för en kemisk reaktion? Du kan välja flera alternativ. A I isolering går den till jämvikt. B Hastigheten bestäms av energiskillnaden i substrat och produkt(er). C Ett enzym ändrar deltaG för reaktionen. D Ett negativt deltaG innebär att reaktionen är fördelaktig. A D
3 2025-12-05 18 Vad händer i pyruvatdehydrogenaskomplexet? Du kan välja flera alternativ. A En dekarboxylering. B Bildning av NAD+. C Bildning av acetyl-CoA. D En reduktion. menti Vad händer i pyruvatdehydrogenaskomplexet? Du kan välja flera alternativ. A En dekarboxylering. B Bildning av NAD+. C Bildning av acetyl-CoA. D En reduktion. A C D
4 2025-12-05 1 Mellan vilka två v nedanstående aminosyror kan bilda vätebindngar mellan sidokedjor? A metionin B leucin C tyrosin D glutamin menti Mellan vilka två v nedanstående aminosyror kan bilda vätebindngar mellan sidokedjor? A metionin B leucin C tyrosin D glutamin C D
5 2025-12-05 19 Pyruvatdehydrogenaskomplexet regleras av Du kan välja flera alternativ. A Cellens energikvot B Feedbackinhibering C Fosforylering D Feedforwardinhibering menti Pyruvatdehydrogenaskomplexet regleras av Du kan välja flera alternativ. A Cellens energikvot B Feedbackinhibering C Fosforylering D Feedforwardinhibering A, B, C and D
6 2025-12-05 4 Vilka finns det flest olika sorter av i cellen? A Aminosyror B Fosfolipider C Nukleotider D Monosackarider menti Vilka finns det flest olika sorter av i cellen? A Aminosyror B Fosfolipider C Nukleotider D Monosackarider B vi har några tusen, kan variera längd och huvudgrupp
7 2025-12-05 16 Till vad används CoA? Du kan välja flera alternativ. A Transport av alkylgrupper. B Transport av acylgrupper. C Citronsyracykeln. D Att koppla glykolysen med citronsyracykeln. menti Till vad används CoA? Du kan välja flera alternativ. A Transport av alkylgrupper. B Transport av acylgrupper. C Citronsyracykeln. D Att koppla glykolysen med citronsyracykeln. B, C, D
8 2025-12-05 22 I elektrontransportkedjan finns Du kan välja flera alternativ. A Kopparjoner B CoA C Cytokromer D CoQ menti I elektrontransportkedjan finns Du kan välja flera alternativ. A Kopparjoner B CoA C Cytokromer D CoQ A C D
9 2025-12-05 12 Vilken/vilka av nedanstående är en regulator för fosfofruktokinas 1? Du kan välja flera alternativ. A AMP B ADP C ATP D Fruktos 6-fosfat E Citrat menti Vilken/vilka av nedanstående är en regulator för fosfofruktokinas 1? Du kan välja flera alternativ. A AMP B ADP C ATP D Fruktos 6-fosfat E Citrat A, C, E
10 2025-12-05 13 Från vad kan vi göra glukos? Du kan välja flera alternativ. A Alanin B Lysin C Malat D Laktat E Palmitat menti Från vad kan vi göra glukos? Du kan välja flera alternativ. A Alanin B Lysin C Malat D Laktat E Palmitat A C D Kan inte göra glukos från fettsyror
11 2025-12-05 17 Vilken/vilka av nedanstående molekyler är en metabolit i citronsyracyklen? Du kan välja flera alternativ. A Oxalacetat B Akonitas C Succinat D Fumaras E Malat menti Vilken/vilka av nedanstående molekyler är en metabolit i citronsyracyklen? Du kan välja flera alternativ. A Oxalacetat B Akonitas C Succinat D Fumaras E Malat A, C, E
12 2025-12-05 23 Den slutgiltiga elektronacceptorn i ETK är A Komplex IV B ATP-syntas C O2 D CO2 menti Den slutgiltiga elektronacceptorn i ETK är A Komplex IV B ATP-syntas C O2 D CO2 C
13 2025-12-05 10 Vilken har flest steg? A Glykolysen B Glukoneogensen C Glykogenolysen D Citronsyracykeln E Betaoxidatnion menti Vilken har flest steg? A Glykolysen B Glukoneogensen C Glykogenolysen D Citronsyracykeln E Betaoxidatnion B
14 2025-12-05 9 Vilken/vilka av nedanstående molekyler härstammar från en B vitamin? Du kan välja flera alternativ. A Coenzym A B NAD+ C FAD D TPP menti Vilken/vilka av nedanstående molekyler härstammar från en B vitamin? Du kan välja flera alternativ. A Coenzym A B NAD+ C FAD D TPP A, B, C, D
15 2025-12-05 14 Vad förbrukas i glukoneogenesen? Du kan välja flera alternativ. A ATP B CTP C GTP D NAD+ E FADH2 menti Vad förbrukas i glukoneogenesen? Du kan välja flera alternativ. A ATP B CTP C GTP D NAD+ E FADH2 A, C
16 2025-12-05 20 Vad bildas i citronsyracykeln? Du kan välja flera alternativ. A FADH2 B NAD+ C CO2 D ATP menti Vad bildas i citronsyracykeln? Du kan välja flera alternativ. A FADH2 B NAD+ C CO2 D ATP A, C och D
17 2025-12-05 15 Vad/vilket stämmer om laktatdehydrogenas? Du kan välja flera alternativ. A Det är en dimer. B I hjärtat bildas alltid laktat. C När vi tränar ökar andelen M-subenheter i muskel typ 1. D Laktat bildas i muskel typ IIb. menti Vad/vilket stämmer om laktatdehydrogenas? Du kan välja flera alternativ. A Det är en dimer. B I hjärtat bildas alltid laktat. C När vi tränar ökar andelen M-subenheter i muskel typ 1. D Laktat bildas i muskel typ IIb. D
18 2025-12-05 21 I elektrontransportkedjen pumpas protoner i komplex Du kan välja flera alternativ. A I B II C III D IV menti I elektrontransportkedjen pumpas protoner i komplex Du kan välja flera alternativ. A I B II C III D IV A, C, D
19 2025-12-05 11 Vilken/vilka av nedanstående är metaboliter i glykolysen? Du kan välja flera alternativ. A Fruktos 2,6-bisfosfat B 3-fosfoglycerat C Glycerolfosfat D Pyruvat E Fruktos 6-fosfat menti Vilken/vilka av nedanstående är metaboliter i glykolysen? Du kan välja flera alternativ. A Fruktos 2,6-bisfosfat B 3-fosfoglycerat C Glycerolfosfat D Pyruvat E Fruktos 6-fosfat B, D, E
20 2025-12-05 8 När cellens energikvot är hög finns det mycket Du kan välja flera alternativ. A AMP B ATP C NADH D NAD+ menti När cellens energikvot är hög finns det mycket Du kan välja flera alternativ. A AMP B ATP C NADH D NAD+ B och C När energikvoten är hög finns det mycket ATP och NADH, medan AMP och NAD⁺ ligger lågt.
21 2025-12-05 3 Vilken av nedanstående molekyler har svårast att diffundera genom ett menbran A N2 B Galaktos C Alanin D Metanol menti Vilken av nedanstående molekyler har svårast att diffundera genom ett menbran A N2 B Galaktos C Alanin D Metanol B Galaktos är en stor, starkt polär monosackarid och passerar därför svårast genom membranet.
22 2025-12-05 7 Vilken av nedanstående molekyler har den högsta fosforyltransferpotentialen? A ATP B 3-fosfoglycerat C Fosfoenolpyruvat D Glyceraldehyd 3-fosfat menti Vilken av nedanstående molekyler har den högsta fosforyltransferpotentialen? A ATP B 3-fosfoglycerat C Fosfoenolpyruvat D Glyceraldehyd 3-fosfat C
23 2025-12-05 6 Vad karaktäriserar katabolismen? A Nedbrytning. B Sker när energikvoten är hög. C Produktion av NADH. D Oxidation av kol. menti Vad karaktäriserar katabolismen? A Nedbrytning. B Sker när energikvoten är hög. C Produktion av NADH. D Oxidation av kol. A, C och D
24 2025-12-05 2 vad karaktiäriserar sekundär struktur hos proteiner A vätebindingar mellan atomer i peptidbindingarna B interaktioner mellan r-grupperna C svårt att föresäga aminosyrsekvenser D konstrant avstånd mellan aminosyror menti vad karaktiäriserar sekundär struktur hos proteiner A vätebindingar mellan atomer i peptidbindingarna B interaktioner mellan r-grupperna C svårt att föresäga aminosyrsekvenser D konstrant avstånd mellan aminosyror A
25 2024-01-27 28 A) Var i cellen och i vilken metabol process sker cellandning? B) Beskriv cellandningen med en formel. (4p) (Max 50 ord.) elektrontransportkedjan A) Var i cellen och i vilken metabol process sker cellandning? B) Beskriv cellandningen med en formel. (4p) (Max 50 ord.) 3 av 4: A. I elektrontransportkedjan i mitokondriens innre membran. B. Syre + elektroner --> H O Själva cellandningen sker i komplex 4 i elektrontransportkedjan.
26 2024-01-27 5 Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av COVID-19 (4p). (Max 200 ord.) a) Beskriv en analysmetod för att undersöka detta. b) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod? utforska-proteiner Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av COVID-19 (4p). (Max 200 ord.) a) Beskriv en analysmetod för att undersöka detta. b) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod? Jag väljer att använda en ELISA, närmare bestämt en sandwich ELISA som identifierar om patienten har antigen. I en sandwich ELISA tillsätts patientens prov till en brunn där det finns en fast antikropp, i detta fall för COVID-19. Om patienten har antigen för COVID-19 kommer dessa att binda till antikroppen. Efter detta sköljer man provet för att göra sig av med andra antigen och antikroppar. Därefter tillsätts en antikropp bunden till ett enzym, mha detta kan man få fram en färgskiftning i provet om det är positivt. Efter att den enzymbundna antikroppen tillsatts sköljer man ytterliggare en gång och tillsist tillsätter man ett substrat som inducerar en färgskiftning i provet om den enzymbunda antikroppen lyckats binda, om färgskiftning sker är provet positivt och patienten har således antigen för COVID-19.
27 2024-01-27 18 Varför ökar entropin i en spontan reaktion? Hur kan man förklara det molekylärt? (4p) termodynamik Varför ökar entropin i en spontan reaktion? Hur kan man förklara det molekylärt? (4p) I en spontant reaktion ökar alltid entropin enligt termodynamikens lagar. Molekyler har en förmåga att vilja sprida ut sig och således öka entropin. Detta sker genom Brownsk rörelse, alltså när molekyler "krockar" med varandra och ändrar riktning. Molekyler kommer röra sig mot det område där minst krockar uppstår. Som exempel kan vi ta salt i vatten. Saltet kommer spontant att lösa upp sig i vattnet, öka entropin. Genom Brownsk rörelse, krockar mellan molekylerna, fördelas saltet i vätskan.
28 2024-01-27 1 Förklara vad van der Waals krafter är och ge ett exempel på hur de kan uppkomma i en biologisk molekyl. (4p) (Max 75 ord.) kemiska-bindingar Förklara vad van der Waals krafter är och ge ett exempel på hur de kan uppkomma i en biologisk molekyl. (4p) (Max 75 ord.) Van der Waals krafter är de svagaste av bindingstyper. Runt en molekyl finns elektroner i elektronskal och vid något tillfälle är den lite mer positiv respektive negativ på ena sidan. Detta påverkar molekyler runt ikring som blir s.k. transienta dipoler. När dessa uppstår medkommer krafter mellan molekylerna som kallas van der Waals krafter/bindningar. Ett exempel på molekyler med mycket van der Waals krafter är aromatiska aminosyror som kan packas tätt pga sin planstruktur. Totalpoäng: 4
29 2024-01-27 19 Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.04 mM är, och för D-fruktos = 1.7 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (4p) enzymer Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.04 mM är, och för D-fruktos = 1.7 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (4p) Km är den koncentration substrat som behövs för att halva Vmax ska vara uppnått. I detta fall är Km betydligt lägre för D-glukos än för D-fruktos. I och med att Km är lägre för D-glukos uppnår enzymet en högre hastighet med D-glukos eftersom koncentrationen för båda substraten var 1mM. Km för D-frukots var 1,7 mM vilket betyder att vi inte ens uppnåt halva Vmax vid koncentrationen 1 mM D-fruktos. Eftersom Vmax är detsamma för båda substraten kan man utgå från att det substrat med lägst Km värde är det som kommer förbrukas först. Detta stämmer också in med att glukos är det primära bränslet som vi fått lära oss på föreläsningar.
30 2024-01-27 29 Vilka två av följande påståenden om beta-oxidationen är korrekta? (2p) A: Vid beta-oxidation av en 16-kolatomers fettsyra produceras 8 acetyl-CoA. B: Beta-oxidationen sker framför allt i cytoplasman. C: Vid beta-oxidationen bryts framför allt trans-fettsyror ner. D: Beta-oxidationen kräver en fungerande citronsyracykel för att ATP ska produceras. betaoxidation Vilka två av följande påståenden om beta-oxidationen är korrekta? (2p) A: Vid beta-oxidation av en 16-kolatomers fettsyra produceras 8 acetyl-CoA. B: Beta-oxidationen sker framför allt i cytoplasman. C: Vid beta-oxidationen bryts framför allt trans-fettsyror ner. D: Beta-oxidationen kräver en fungerande citronsyracykel för att ATP ska produceras. A och D
31 2024-01-27 4 Describe the allosteric regulation of hemoglobin with an example. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words) hemoglobin Describe the allosteric regulation of hemoglobin with an example. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words) 2 av 4: Hemoglobin is an oxygentransport protein which transport oxygen from our lungs to our muscles and tissue. Hemoglobin consists of four subunits, two alfa and two beta, with one Fe per unit. When oxygen binds to the first Fe it moves 0,4 Å upwards, closer to the heme-group. This induce a conformatioin change in hemoglobin which increases the affinty for oxygen for the next subunit. This is why hemoglobins curve is hyperbol. This is called cooperativity.
32 2024-01-27 16 Vilka två av dessa lipider hittas i det eukaryota cellmembranet? (2p) A: Sfingomyelin B: Kolesterol C: Fria fettsyror D: Triacylglycerol cellmembran Vilka två av dessa lipider hittas i det eukaryota cellmembranet? (2p) A: Sfingomyelin B: Kolesterol C: Fria fettsyror D: Triacylglycerol A och B
33 2024-01-27 22 I katabolismen hittar vi många enzymer som tillhör gruppen (välj två) A: Dehydrogenaser B: Isomeraser C: Polymeraser D: Karboxylaser I katabolismen hittar vi många enzymer som tillhör gruppen (välj två) A: Dehydrogenaser B: Isomeraser C: Polymeraser D: Karboxylaser A och B
34 2024-01-27 32 Varför måste ureacykeln användas vid nedbrytning av purin-nukleotider? (2p) (Max 50 ord) nukleotidnedbrytning Varför måste ureacykeln användas vid nedbrytning av purin-nukleotider? (2p) (Max 50 ord) 1 av 2: Puriner har två ringstruktur. I puriner finns det kväve och väte som bildar ammoniak vilket i höga koncentrationer är farligt för kroppen. Ureacyklen används för att göra sig av med ammoniaken genom urat och sedan urinen. AI: Nedbrytning av purinnukleotider frigör aminogrupper, som omvandlas till ammoniak via transaminering och glutamatdehydrogenas. Ammoniak är starkt toxiskt, särskilt för CNS, och måste därför oskadliggöras. Ureacykeln omvandlar ammoniak till urea, som kan utsöndras säkert via njurarna.
35 2024-01-27 26 Beskriv översiktligt den allostera regleringen av glykogenfosforylas i skelettmuskel och lever, dvs de viktigaste allostera modulatorerna som reglerar enzymet i respektive vävnad. Ange om modulatorerna stimulerar eller hämmar enzymets aktivitet. Rätt kombination av alloster modulator och påverkan på enzymaktivitet krävs för poäng. (4p) (Max 75 ord) glykogen Beskriv översiktligt den allostera regleringen av glykogenfosforylas i skelettmuskel och lever, dvs de viktigaste allostera modulatorerna som reglerar enzymet i respektive vävnad. Ange om modulatorerna stimulerar eller hämmar enzymets aktivitet. Rätt kombination av alloster modulator och påverkan på enzymaktivitet krävs för poäng. (4p) (Max 75 ord) 2 av 4: Glykogen fosforylas är ett av enzymen som bryter ner glykogen. I muskler ska glykogenet brytas ner och användas som bränsle. Cellen känner av energikvoten. Detta betyder att om energikvoten är låg och vi har mycket ADP kommer enzymet att stimuleras. Om det finns mycket ATP hämmas enzymet. I levern ska glykogenet brytas ner och reglera blodsockret mellan måltider. Om glukosnivåerna är låga kommer enzymet stimuleras och vice versa. Glukagon kommer då stimulera medan insulin hämmar. AI: Skelettmuskel: Glykogenfosforylas aktiveras allostert av AMP, som signalerar låg energi. Det hämmas av ATP och glukos-6-fosfat, som signalerar god energitillgång. Lever: Glykogenfosforylas hämmas av glukos, vilket speglar höga blodglukosnivåer. Levern saknar AMP-aktivering i fysiologiskt relevant grad, eftersom dess uppgift är att frisätta glukos, inte att reglera sin egen energistatus.
36 2024-01-27 12 Vilka två påståenden stämmer om splicing? (2p) A: Vid alternativ splicing kan även exon tas bort. B: Greningsstället är alltid ett G. C: Spliceosomen består av både proteiner och RNA. D: En lariatstruktur består alltid av två sammanlänkade exoner. rna-syntes Vilka två påståenden stämmer om splicing? (2p) A: Vid alternativ splicing kan även exon tas bort. B: Greningsstället är alltid ett G. C: Spliceosomen består av både proteiner och RNA. D: En lariatstruktur består alltid av två sammanlänkade exoner. A och C
37 2024-01-27 36 Which two statements about restriction enzymes such as BamHI are correct? (2p) A: They allow the visualization of the DNA at the end of gel electrophoresis. B: They perform the ligation of an insert into a vector. C: They generate “sticky ends” or “blunt ends”. D: They recognise and cleave DNA at specific sequences. (Svar markerat – Totalpoäng: 2) plasmid Which two statements about restriction enzymes such as BamHI are correct? (2p) A: They allow the visualization of the DNA at the end of gel electrophoresis. B: They perform the ligation of an insert into a vector. C: They generate “sticky ends” or “blunt ends”. D: They recognise and cleave DNA at specific sequences. (Svar markerat – Totalpoäng: 2) C och D
38 2024-01-27 27 A) Vilka energirika föreningar bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Vilken är kopplingen mellan cellens energikvot och citronsyracykeln? (4p) (Max 75 ord.) citronsyracykeln A) Vilka energirika föreningar bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Vilken är kopplingen mellan cellens energikvot och citronsyracykeln? (4p) (Max 75 ord.) 2 av 4: A. Tre NADH och en FADH2 B. NADH och FADH2 behövs för att transportera elektoner till elektrontransportkedjan som kan bygga upp en elektrokemisk gradient för att bilda ATP genom ATP syntaset. En låg energikvot betyder därav att det inte finns tillräckligt med NADH och FADH2 från citronsyracyklen. AI: A) Ett varv i citronsyracykeln bildar 3 NADH, 1 FADH₂ och 1 GTP (≈ATP). B) Hög energikvot (mycket ATP, NADH) hämmar cykeln, främst via isocitratdehydrogenas och α-ketoglutaratdehydrogenas. Låg energikvot (mycket ADP, NAD⁺) stimulerar cykeln. Cykeln regleras alltså efter cellens energibehov.
39 2024-01-27 13 Lac-operonet behövs för att uttrycka enzymer som kan bryta ner laktos (mjölksocker). Vilka två påståenden stämmer? (2p) A: När allolaktos finns närvarande kan lac-repressorn inte binda till operator-sekvensen. B: I närvaro av laktos är lac-operonet fullt påslaget, även om det finns rikligt med glukos i omgivningen. C: I närvaro av höga mängder glukos stimuleras bildning av cAMP. D: cAMP binder till CAP och stimulerar aktiviteten hos detta aktivator-protein. kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Lac-operonet behövs för att uttrycka enzymer som kan bryta ner laktos (mjölksocker). Vilka två påståenden stämmer? (2p) A: När allolaktos finns närvarande kan lac-repressorn inte binda till operator-sekvensen. B: I närvaro av laktos är lac-operonet fullt påslaget, även om det finns rikligt med glukos i omgivningen. C: I närvaro av höga mängder glukos stimuleras bildning av cAMP. D: cAMP binder till CAP och stimulerar aktiviteten hos detta aktivator-protein. A och D
40 2024-01-27 17 Redogör för den principiella uppbyggnaden av spänningsaktiverade katjonkanaler och hur de öppnas. (4p) (Max 100 ord) transport-över-cellmembran Redogör för den principiella uppbyggnaden av spänningsaktiverade katjonkanaler och hur de öppnas. (4p) (Max 100 ord) 2 av 4: En jonkanal består av sex olika segment. Segment 5 och 6 bildar själva centralporen medan segment 1-3 tillsammans med segment 4 bildar den spännings känsliga padeln. Segment 4 är det segment som känner av själva spänningsförändringen. När en en spänningsförändring i membranet sker registeras detta hos padlen vilket inducerar en konformationsändring och får den att ställa sig på "högkant". Detta öppnar katjonkanalen och joner kan flöda in eller ut ur cellen. AI: Spänningsaktiverade katjonkanaler består av fyra domäner (eller fyra separata subenheter) som vardera har sex transmembransegment (S1–S6). Segmentet S4 innehåller positivt laddade aminosyror och fungerar som spänningssensor. När membranet depolariseras rör sig S4 utåt, vilket drar i kopplade segment (framför allt S5–S6) och öppnar poren. En selektivitetsfilterregion bestämmer vilka katjoner som passerar. Kanalen kan även inaktiveras via en separat “inaktiveringsgrind” efter öppning.
41 2024-01-27 23 Vilka två av nedanstående metaboliter ingår i glykolysen? A: Fruktos 2,6-bisfosfat B: Glukos 1-fosfat C: Glyceraldehyd 3-fosfat D: Fosfoenolpyruvat glykolysen Vilka två av nedanstående metaboliter ingår i glykolysen? A: Fruktos 2,6-bisfosfat B: Glukos 1-fosfat C: Glyceraldehyd 3-fosfat D: Fosfoenolpyruvat C och D
42 2024-01-27 33 Mutationer i genen som kodar för enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas kan leda till ett defekt enzym vilket i sin tur kan orsaka hemolytisk anemi i vissa situationer. Vilken är grundorsaken till detta? (2p) (Max 50 ord) pentosfosfatvägen Mutationer i genen som kodar för enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas kan leda till ett defekt enzym vilket i sin tur kan orsaka hemolytisk anemi i vissa situationer. Vilken är grundorsaken till detta? (2p) (Max 50 ord) 1 av 2: Glukos 6-fosfatdehydrogenas är det första enzymet i pentosfosfatvägen, som körs för att bilda NADPH och ribos 5-fosfat. Vid deffekt i detta enzym bildas inte tillräckligt med NADPH som skyddar mot reaktiva syreföreningar. Detta är speceillt farligt för t.ex. eretrocyter som saknar mitokondrier och måste få allt sitt NADPH från pentosfofsfatvägen. AI: Glukos-6-fosfatdehydrogenas behövs för att bilda NADPH i pentosfosfatvägen. NADPH håller glutation reducerat, vilket skyddar erytrocyter mot oxidativ skada. Vid enzymdefekt saknar cellen detta skydd → oxidativ stress skadar membran och hemoglobin → erytrocyterna hemolyserar.
43 2024-01-27 24 Förklara hur arsenikförgiftning påverkar metabolismen och varför liknande påverkan ses vid alkoholism. (4p) (Max 120 ord) integrering-av-metabolismen Förklara hur arsenikförgiftning påverkar metabolismen och varför liknande påverkan ses vid alkoholism. (4p) (Max 120 ord) 3 av 4: Arsenit har affiniet för sulfhydrylgrupper. En viktig del i PDH komplexet är den arm som för intermediärerna mellan E1, E2 och E3. Denna arm bygger på just svavel. Armen inhiberas således av arsenit när bindningar mellan arsenit och armen bildas vilket medför att vi inte kan producera lika mycket eller ingen acetyl-CoA. Utan acetyl-CoA kan vi inte köra citronsyracyklen och således inte få fram NADH och FADH2 till elektrontransport kedjan. Alkholism leder till liknande effekter då de polära alkholerna kan binda till den intermediär-transportrande armen och inhibiera PDH komplexet. PDH=Pyruvat dehydrogenas
44 2024-01-27 10 ![[Pasted image 20251129235332.png]] På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. A) Ange för positionerna a, b, c och d om de motsvarar en 5’ eller 3’-ände. Vid DNA replikation skapas de två strängarna på litet olika vis. B) Vad kallas strängen som markerats med e? C) Vad kallas strängen som markerats med f? (4p) dna-replikation ![[Pasted image 20251129235332.png]] På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. A) Ange för positionerna a, b, c och d om de motsvarar en 5’ eller 3’-ände. Vid DNA replikation skapas de två strängarna på litet olika vis. B) Vad kallas strängen som markerats med e? C) Vad kallas strängen som markerats med f? (4p) a = 5´ b = 3´ c = 5´ d = 5´ B) Leadning strand C) Lagging strand
45 2024-01-27 9 Var binder histon H1? Vilken roll spelar detta protein? (4p) kromatin Var binder histon H1? Vilken roll spelar detta protein? (4p) Histon 1, H1, upptäcktes senare än de andra histonen, H2A, H2B, H3 och H4. H1 har i uppgift att stabilisera och binder till linker DNA som finns mellan "histonpärlorna"
46 2024-01-27 34 Vilket av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten in vivo? (2p) A: Den intracellulära kolesterolhalten regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet lysosomal acid lipas (LAL). B: Den intracellulära kolesterolhalten regleras i princip enbart via endogen syntes - upptaget av kolesterol från det extracellulära rummet är normalt försumbart. C: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol på en fettsyra. D: Celler utanför levern kan göra sig av med ett överskott av kolesterol genom att överföra detta till HDL-partiklar, som för kolesterolet tillbaka till levern. kolesterol Vilket av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten in vivo? (2p) A: Den intracellulära kolesterolhalten regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet lysosomal acid lipas (LAL). B: Den intracellulära kolesterolhalten regleras i princip enbart via endogen syntes - upptaget av kolesterol från det extracellulära rummet är normalt försumbart. C: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol på en fettsyra. D: Celler utanför levern kan göra sig av med ett överskott av kolesterol genom att överföra detta till HDL-partiklar, som för kolesterolet tillbaka till levern. C och D
47 2024-01-27 14 Beskriv i detalj hur terminationssteget i proteinsyntesen fungerar med särskilt fokus på funktionen av stoppkodon och ribosomens struktur. Förklara även hur Release Factor 1 (RF1) bidrar till processen. (4p) (Max 150 ord) translation Beskriv i detalj hur terminationssteget i proteinsyntesen fungerar med särskilt fokus på funktionen av stoppkodon och ribosomens struktur. Förklara även hur Release Factor 1 (RF1) bidrar till processen. (4p) (Max 150 ord) 3 av 4: Ribosomen består av två subenheter, hos människan heter dessa 40 och 60. Den lilla subenheten, 40, har i uppgift leta efter starkodonet men också känna av stoppkodonet. Den stora subenheten, 60, har i uppgift att katalysera inbindingen av rätt aminosyra till en växande aminosyra sekvens i P-site. I terminations steget kommer ribosomen, 40 enheten, att känna av en cleavage signal som får RF1 att avsluta translationen. Cleavage signal är alltså ett stoppkodon. Det som sker är att RF1 kommer klyva den nu färdig byggda aminosyra sekvens som växt fram i P-site så att den transporteras till sin ämmnade destination.
48 2024-01-27 20 Vilka två påståenden om kompetitiva hämmare är korrekta? (2p) A: De binder reversibelt till det aktiva stället. B: De binder till flera olika ställen på ett enzym. C: De sänker reaktionens karakteristiska Km. D: De binder kovalent till enzymet. enzymer Vilka två påståenden om kompetitiva hämmare är korrekta? (2p) A: De binder reversibelt till det aktiva stället. B: De binder till flera olika ställen på ett enzym. C: De sänker reaktionens karakteristiska Km. D: De binder kovalent till enzymet. A och C
49 2024-01-27 30 Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur detta sker. (4p) heme Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur detta sker. (4p) AI: Hemesyntesen styrs av hur mycket järn som finns i cellen genom reglering av ALA-syntas (erytroid isoform). När järn är lågt binder IRP till en IRE-sekvens i 5’-änden av ALAS-mRNA och blockerar translationen, vilket bromsar hemesyntesen. När järn är tillräckligt släpper IRP → ALA-syntas kan översättas → hemesyntesen ökar. På så sätt matchas hemeproduktionen med tillgängligt järn.
50 2024-01-27 15 Hur kan man bestämma släktskap mellan olika arter med DNA-teknik och varför fungerar det? (4p) evolution Hur kan man bestämma släktskap mellan olika arter med DNA-teknik och varför fungerar det? (4p) Genom att sekvensera DNA kan man se hur mycket som stämmer överens mellan olika arter. Även om majoriteten av vårt DNA är sig likt hos många arter kan man ändå se skillnader på t.ex. mutationer. För att exemplifiera: DNA't hos en människa och en orangutang är mycket likt varandra, men pga DNA'ts ordning, proteinveckning och epigentik kan det uttryckas väldigt olika och således ge upphov till olika utseende, beetende och andra egenskaper. Således kan okika arter vara nära besläktande med varandra, alltså ha liknade DNA, men ändå vara olika arter.
51 2024-01-27 21 Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs minskar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från fruktos 1,6-bisfosfat. C: ATP innehåller färre fosfoanhydridbindningar än fosfatgrupper. D: I en välmående cell finns mer ATP än ADP. introduktion-till-metabolismen Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs minskar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från fruktos 1,6-bisfosfat. C: ATP innehåller färre fosfoanhydridbindningar än fosfatgrupper. D: I en välmående cell finns mer ATP än ADP. C och D
52 2024-01-27 31 Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Vid fenylketonuri blir aminosyran fenylalanin essentiell. B: Ureacykeldefekter leder till hyperammonemi. C: Det kliniskt viktiga enzymet aspartataminotransferas kan bilda aspartat från pyruvat i en så kallad transamineringsreaktion. D: Aspartat är en glukogen aminosyra. aminosyrametabolism Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Vid fenylketonuri blir aminosyran fenylalanin essentiell. B: Ureacykeldefekter leder till hyperammonemi. C: Det kliniskt viktiga enzymet aspartataminotransferas kan bilda aspartat från pyruvat i en så kallad transamineringsreaktion. D: Aspartat är en glukogen aminosyra. B och D
53 2024-01-27 25 Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker främst i levern. B: Kol oxideras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 1,6-bisfosfat. D: Aminosyrorna cystein och metionin är glukogena. glukoneogenes Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker främst i levern. B: Kol oxideras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 1,6-bisfosfat. D: Aminosyrorna cystein och metionin är glukogena. A och D
54 2024-01-27 11 Telomeras är ett omvänt transkriptas. Vad använder detta enzym som templat (mall)? Nämn också två typer av celler i vilka detta enzym återfinns. (4p) dna-replikation Telomeras är ett omvänt transkriptas. Vad använder detta enzym som templat (mall)? Nämn också två typer av celler i vilka detta enzym återfinns. (4p) Telomeras har med sig en egen RNA sekvens som den använder som mall när det ska förlänga telomererna. Detta enzym återfinns i t.ex. stamceller och cancer celler.
55 2024-01-27 8 Vilka två nedanstående påståenden är korrekta? (2p) A: Uracil är en kvävebas i DNA. B: Kolatomen i position 1' hos sockret är bunden till kvävebasen via en β-glykosid-bindning. C: Adenosin är en nukleosid. D: ATP innehåller två fosfatgrupper. nukleotider Vilka två nedanstående påståenden är korrekta? (2p) A: Uracil är en kvävebas i DNA. B: Kolatomen i position 1' hos sockret är bunden till kvävebasen via en β-glykosid-bindning. C: Adenosin är en nukleosid. D: ATP innehåller två fosfatgrupper. B och C
56 2024-01-27 35 I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värdet på 0.03 och ett 95% konfidensintervall på 6-17 mmHg. Diskutera vad dessa resultat ger oss för information och huruvida nollhypotesen kan förkastas. (4p) (Max 100 ord). introduktionslaboration I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värdet på 0.03 och ett 95% konfidensintervall på 6-17 mmHg. Diskutera vad dessa resultat ger oss för information och huruvida nollhypotesen kan förkastas. (4p) (Max 100 ord). 2 av 4: Detta resultat visar att nollhypotesen kan förkastas då p-värdet är under 0,05 då det finns sk. statistisk signifikans. Hade p-värdet varit över 0,05 hade man inte kunnat förkasta nollhypotesen. Vidare visar konfidensintervallet att 95% av de som fick den blodtryckssänknade medicinen fick ett lägre blodtryck med 6-17 mmHg. AI: p-värdet 0,03 innebär att om nollhypotesen (ingen skillnad i medelblodtryck) vore sann, skulle en så här stor eller större skillnad uppstå bara i cirka 3 % av fallen. Nollhypotesen kan därför förkastas vid 5 %-nivån. Ett 95 % konfidensintervall på 6–17 mmHg innebär att vi med 95 % säkerhet skattar den sanna medelreduktionen i blodtryck till mellan 6 och 17 mmHg, och eftersom intervallet inte innehåller 0 talar det också för en statistiskt signifikant blodtryckssänkande effekt.
57 2024-01-27 3 Lista fyra egenskaper hos en alfahelix. (4p) (Max 75 ord.) från-aminosyror-till-proteiner Lista fyra egenskaper hos en alfahelix. (4p) (Max 75 ord.) 3 av 4: 1. Har en konstant diameter. 2. Har kvävebaserna innåt och fosfatgrupperna och sockret utåt. (Pga hydrofob/hydrofil) 3. Kan polymeriseras till beta flaks liknande strukturer och bilda amyloider => Sjukdom. 4. Kan bilda transmembran-alfahelixar om det finns mycket hydrofoba aminosyror. Går att undersöka genom hydropatiplot.
58 2024-01-27 7 Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och proteoglykaner. (4p) (Max 150 ord) kolhydrater Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och proteoglykaner. (4p) (Max 150 ord) 2 av 4: Glykoproteiner och proteoglykaner är båda former av glykokonjugat och består båda av proteiner och socker. Glykoproteiner är väldigt långa och repetativa, tillskillnad från proteoglykaner. Både glykoproteiner och proteoglykaner finns ut mot ECM och har något att göra med cellens kommunikation/interaktion med andra celler, bakterier och virus. De kan också utgöra skydd. Glykoproteiner kan vara O-länkade eller N-länkade. Det vill säga om de är länkade via syret (O) i serin eller teronins funktionella grupp eller via kvävet (N) i aspargins funktionella grupp.
59 2024-01-27 6 Rita den principiella strukturen för en glykolipid. (4p) cellmembran Rita den principiella strukturen för en glykolipid. (4p)
60 2024-01-27 2 Vilka två av nedanstående aminosyror är de mest troliga att förekomma mot ytan av ett cytoplasmatiskt protein? A: Fenylalanin B: Serin C: Alanin D: Cystein från-aminosyror-till-proteiner Vilka två av nedanstående aminosyror är de mest troliga att förekomma mot ytan av ett cytoplasmatiskt protein? A: Fenylalanin B: Serin C: Alanin D: Cystein B och D
61 2022-01-29 28 Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: En fungerande pentosfosfatväg behövs för att upprätthålla ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar i röda blodkroppar. B: Fruktos 6-fosfat och glyceraldehyd 3-fosfat kan bildas i pentosfosfatvägens oxidatativa fas. C: Det som styr om glukos 6-fosfat ska slussas in i pentosfosfatvägens oxidataiva fas är de intracellulära nivåerna av NADP+ och NADPH. D: Pentosfosfatvägen är förlagd i mitokondriens matrix. pentosfosfatvägen Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: En fungerande pentosfosfatväg behövs för att upprätthålla ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar i röda blodkroppar. B: Fruktos 6-fosfat och glyceraldehyd 3-fosfat kan bildas i pentosfosfatvägens oxidatativa fas. C: Det som styr om glukos 6-fosfat ska slussas in i pentosfosfatvägens oxidataiva fas är de intracellulära nivåerna av NADP+ och NADPH. D: Pentosfosfatvägen är förlagd i mitokondriens matrix. A och C
62 2022-01-29 5 Fråga 5 A. Hur många vätebindningar finns i AT resp. GC baspar? B. Hur påverkar baskompositionen DNA stabiliteten? (2p) nukleotider Fråga 5 A. Hur många vätebindningar finns i AT resp. GC baspar? B. Hur påverkar baskompositionen DNA stabiliteten? (2p) A. AT har 2 vätebidningar GC har 3 vätebidningar B. Detta gör att vätebidningarna mellan G och C är stabilare eftersom det finns fler bidningspunkter. AT-bidningarna som har färre bindningspunkter /par är därmed ostabilare, detta är något som kan utnyttjas vid bl.a. transkription, eftersom DNA blir mer lättsmält vid AT-rika sekvenser som TATA-boxen.
63 2022-01-29 18 För ett enzym är Michaelis-Mentens konstant (KM) 15 mM. Vid en substratkoncentration på 5 mM, vad är förhållandet mellan reaktionshastigheten V och den maximala reaktionshastigheten Vmax? Motivera ditt svar. (Max 150 ord) (2p) ![[Pasted image 20251128081722.png]] enzymer För ett enzym är Michaelis-Mentens konstant (KM) 15 mM. Vid en substratkoncentration på 5 mM, vad är förhållandet mellan reaktionshastigheten V och den maximala reaktionshastigheten Vmax? Motivera ditt svar. (Max 150 ord) (2p) ![[Pasted image 20251128081722.png]] Reaktionshastigheten vid 5mM är alltså en fjärdedel av hastigheten vid Vmax
64 2022-01-29 1 A) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en vätebindning kan bildas. Ange vilka atomer som är donator respektive acceptor i vätebindningen. B) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en jonbindning kan bildas vid pH = 7. från-aminosyror-till-proteiner A) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en vätebindning kan bildas. Ange vilka atomer som är donator respektive acceptor i vätebindningen. B) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en jonbindning kan bildas vid pH = 7. a) Serin syre är donator, Asparagin kväve är acceptor b) Lysin, Aspartat
65 2022-01-29 19 I en av delreaktionerna som katalyseras av chymotrypsin krävs närvaro av vatten, medan i en annan delreaktion krävs det att inget vatten är närvarande. Vilka är dessa delreaktioner och varför krävs närvaro respektive frånvaro av vatten i de respektive stegen? (Max 150 ord) (2p) enzymer I en av delreaktionerna som katalyseras av chymotrypsin krävs närvaro av vatten, medan i en annan delreaktion krävs det att inget vatten är närvarande. Vilka är dessa delreaktioner och varför krävs närvaro respektive frånvaro av vatten i de respektive stegen? (Max 150 ord) (2p) I delreaktion 1 krävs inget vatten, då his tar emot vätet från asp som gör en nukleofilattack på den inkommande peptidbidningen. I delreaktion 2 krävs vatten, för att den peptiden ska klyvas och släppa från chymotrypsin
66 2022-01-29 29 Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Nukleosidaser spjälkar av fosfatgrupper från nukleotider. B: Delar av purinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Kvävebaser som frisätts vid nedbrydning av nukleotider återanvänds ofta för nukleotidsyntes. D: Kväveatomerna i pyrimidinerna hamnar huvudsakligen i urat då dessa kvävebaser bryts ned. nukleotidnedbrytning Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Nukleosidaser spjälkar av fosfatgrupper från nukleotider. B: Delar av purinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Kvävebaser som frisätts vid nedbrydning av nukleotider återanvänds ofta för nukleotidsyntes. D: Kväveatomerna i pyrimidinerna hamnar huvudsakligen i urat då dessa kvävebaser bryts ned. Rätt svar 1. C
67 2022-01-29 4 Fråga 4 Vilken/vilka av dessa är en omega-3 fettsyra? (1p) ![[Pasted image 20251128081622.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: B B: C C: A D: D lipider Fråga 4 Vilken/vilka av dessa är en omega-3 fettsyra? (1p) ![[Pasted image 20251128081622.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: B B: C C: A D: D Rätt svar 1. A 2. B
68 2022-01-29 16 Bacterial DNA may end up in a bacteriophage due to (choose one or more)/Bakteriellt DNA kan hamna i en bakteriofag för att (välj ett eller flera alternativ): (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Errors during the assembly of new bacteriophages./Fel som sker när nya bakteriofager sätts samman. B: The small and circular nature of bacterial DNA./Bakteriellt DNA är cirkulärt och litet. C: Template switching during bacterophage DNA replication./Ändring av mall när bakteriofagens DNA replikeras. D: Imprecise excision of the prophage./Inexakt utklippning av profagen. rekombinant-dna-teknik Bacterial DNA may end up in a bacteriophage due to (choose one or more)/Bakteriellt DNA kan hamna i en bakteriofag för att (välj ett eller flera alternativ): (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Errors during the assembly of new bacteriophages./Fel som sker när nya bakteriofager sätts samman. B: The small and circular nature of bacterial DNA./Bakteriellt DNA är cirkulärt och litet. C: Template switching during bacterophage DNA replication./Ändring av mall när bakteriofagens DNA replikeras. D: Imprecise excision of the prophage./Inexakt utklippning av profagen. Rätt svar 1. D
69 2022-01-29 22 Redogör för hur enzymet fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktokinas 2 regleras och spelar en central roll i glukosmetabolismen. Max 150 ord. (2p) glukosmetabolism Redogör för hur enzymet fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktokinas 2 regleras och spelar en central roll i glukosmetabolismen. Max 150 ord. (2p) Enzymets aktivitet styrs av hormonreglering och fosforylering. När insulin binder in till cellens recptor stimuleras PP1. Funktionen för PP1 är att defosforylera enzymet. När fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2 är defosforylerat inhiberas fosfatasdelen medan kinasdelen aktiveras. När kinasdelen är aktiverad katalyseras reaktionen där fruktos 6-fosfat blir fruktos-2,6-bisfosfat. När glukagon binder in till cellens receptor sätter en kaskadreaktion igång där cAMP genereras, vilket aktiverar PKA. PKAs aktivitet leder till en inhibering av PP1 och en fosforylering av enzymet fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2. Fosforyleringen inhiberar kinas delen och aktiverar fosfataset. När fosfatasdelen är aktiv katalyseras reaktionen där fruktos-2,6-bisfosfat återbildas till fruktos 6-fosfat. Detta spelar en central roll i metabolismen då hög koncentration av fruktos-2,6-bisfosfat (vilket bildas när enzymet är defosforylerat) stimulerar glykolysenzymet fosfofruktikinas 1 (som katalyserar reaktionen fruktos 6-fosfat --> fruktos 1,6-bisfosfat) samtidigt som det inhiberar glykoneogenes enzymet fruktos 1,6-bisfosfatas (som katalyserar reaktionen fruktos 1,6-bisfosfat --> fruktos 6-fosfat). Alltså fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2 styr mängden fruktos-2,6-bisfosfat vilket reglerar om cellen ska köra glykolys eller glukoneogenes.
70 2022-01-29 32 Beskriv uppbyggnaden av ett GPI-ankare. (2p) cellmembran Beskriv uppbyggnaden av ett GPI-ankare. (2p) En GPI-ankare består av 3 olika molekyler bundna till varandra, den innersta delen fäster till cellmembranet och den yttersta delen binder till tex. en kolhydrat.
71 2022-01-29 26 Redogör för mekanismen hos ATP-syntas i mitokondriens innermembran. Max 150 ord. (2p) elektrontransportkedjan Redogör för mekanismen hos ATP-syntas i mitokondriens innermembran. Max 150 ord. (2p) ATP-syntas funktion är att utnyttja den elektrokemiska gradienten som skapats av de protonpumpande komplexen i ETK, för att omvandla vätejoners rörelseenergi till kemisk bidningsenergi mellan fosfatgrupperna i ATP. Detta sker genom att vätejoner som strävar efter att ta sig från mmu genom innermembranet till matrix för att jämna ut gradienten åker in och neutraliserar en halvkanal i F0s c-ring, som roterar ett steg för varje vätejon som binder in. (När vätejonen åkt ett helt varv släpps den ut i matrix.) Rörelseenergin som skapas av rotationen i c-ringen leds genom den roterande gammasjälken till F1-enheten som finns i matrix och inducerar konformationsändringar i dess subenheter. ADP + Pi binder in i B-subeneheterna under Loose state, binds samman under Tense state och släpps ut som ATP under Open state.
72 2022-01-29 12 Vilket/vilka av följande alternativ beskriver en funktion för poly-A svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid B: Skyddar mot felaktig splicing C: Samverkar med 5'-cap för att stimulera translation D: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan rna-syntes Vilket/vilka av följande alternativ beskriver en funktion för poly-A svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid B: Skyddar mot felaktig splicing C: Samverkar med 5'-cap för att stimulera translation D: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan Rätt svar 1. A 2. C
73 2022-01-29 27 Vilka är de två viktigaste transportörerna av kväve från kroppens vävnader till levern, och via vilka två andra molekyler kommer de två kväveatomerna, som slutligen hamnar i urea, föras in i ureacykelns cykliska del? (2p) aminosyrametabolism Vilka är de två viktigaste transportörerna av kväve från kroppens vävnader till levern, och via vilka två andra molekyler kommer de två kväveatomerna, som slutligen hamnar i urea, föras in i ureacykelns cykliska del? (2p) De två viktigate transportörerna av kväve från kroppen vävnader är alanin och asparagin. Kväveatomerna hamnar i urea cykeln genom glutamat, vars kvävegrupp reagerar med koldioxid och bildar karbamoyl som sedan reagerar och bildar citrulin. Och asparaginsyra som i nästa steg lämnar av sin kvävegrupp till citrulin som då bildar argininsuccinat.
74 2022-01-29 13 Which protein is often required to initiate transcription by a bacterial RNA polymerase? How does it mediate initiation?/Vilket protein behövs ofta för att initiera transkription av bakteriellt RNA-polymeras? Hur underlättar det initieringen? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska. kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Which protein is often required to initiate transcription by a bacterial RNA polymerase? How does it mediate initiation?/Vilket protein behövs ofta för att initiera transkription av bakteriellt RNA-polymeras? Hur underlättar det initieringen? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska. Proteinet CAP behövs för att binda in cAMP för att aktivera RNA-polymeraset, så att det sedan kan hitta fram till promotorn och där starta transkriptionen.
75 2022-01-29 17 Alexandra and Bill were the finalists of the Swedish Thermodynamics championship quiz. In a crucial tie-breaker, they were asked to say something about exergonic and endergonic reactions. Alexandra said: ‘In an exergonic reaction, energy is released from the system to the surroundings’. Bill said: ‘In an endergonic reaction, ∆G is negative’./Alexandra och Bill var finalister i Sveriges termodynamiska mästerskapsquiz. I en utslagsfråga blev de ombedda att säga något om exergona och endergona reaktioner. Alexandra sa: ”I en exergon reaktion avges energi från systemet till omgivningen”. Bill sa: ”I en endergon reaktion är ∆G negativt.” (1p) Välj ett alternativ: A: Both Alexandra and Bill are correct./Både Alexandra och Bill har rätt. B: Only Alexandra is correct./Enbart Alexandra har rätt. C: Only Bill is correct./Enbart Bill har rätt D: Both Alexandra and Bill are wrong./Både Alexandra och Bill har fel. termodynamik Alexandra and Bill were the finalists of the Swedish Thermodynamics championship quiz. In a crucial tie-breaker, they were asked to say something about exergonic and endergonic reactions. Alexandra said: ‘In an exergonic reaction, energy is released from the system to the surroundings’. Bill said: ‘In an endergonic reaction, ∆G is negative’./Alexandra och Bill var finalister i Sveriges termodynamiska mästerskapsquiz. I en utslagsfråga blev de ombedda att säga något om exergona och endergona reaktioner. Alexandra sa: ”I en exergon reaktion avges energi från systemet till omgivningen”. Bill sa: ”I en endergon reaktion är ∆G negativt.” (1p) Välj ett alternativ: A: Both Alexandra and Bill are correct./Både Alexandra och Bill har rätt. B: Only Alexandra is correct./Enbart Alexandra har rätt. C: Only Bill is correct./Enbart Bill har rätt D: Both Alexandra and Bill are wrong./Både Alexandra och Bill har fel. Rätt svar 1. B
76 2022-01-29 23 Vad gör proteinet glykogenin och vilken viktig roll spelar enzymet i relation till glykogenmetabolism? (2p) glykogen Vad gör proteinet glykogenin och vilken viktig roll spelar enzymet i relation till glykogenmetabolism? (2p) Glykogenin är ett protein som fungerar som en primer i glykogensyntesen. Det har en enzymaktivitet som fäster några glukos-enheter på sig själv för att utgöra en primer som glykogensyntataset kan syntetisera vidare på. Utan glykogenin skulle inte glykogensyntaset ha någon reducerad ände att starta sin glykogensyntes ifrån och vi skulle därmed inte kunna få någon glykogensyntes.
77 2022-01-29 33 Rangordna molekylerna vatten, leucin, glukos och kväveoxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den molekyl som har lättast att passera. Ange två egenskaper hos varje molekyl av betydelse för deras placering i listan. (2p) transport-över-cellmembran Rangordna molekylerna vatten, leucin, glukos och kväveoxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den molekyl som har lättast att passera. Ange två egenskaper hos varje molekyl av betydelse för deras placering i listan. (2p) Vatten - liten, oladdad molekyl Glukos - hydrofob, relativt stor molekyl Leucin - oladdad, hydrofil "kropp" (alltså NH3+ och COO-, inte R-kedjan) Kväveoxid - laddad, hydrofil
78 2022-01-29 24 Redogör för vilket sätt arsenikförgiftning påverkar metabolismen och vad som kan göras för att häva förgiftningen. Max 150 ord. (2p) integrering-av-metabolismen Redogör för vilket sätt arsenikförgiftning påverkar metabolismen och vad som kan göras för att häva förgiftningen. Max 150 ord. (2p) Arsenikförgiftning hämmar natrium/kalium-pumpen vilket förstör gradienterna. Pumpen upprätthåller gradienter över membranet som annars skulle utjämnas av jonkanalerna. Cellen är beroende av gradienten för att upprätthålla vissa reaktioner i cellen och transporter över cellmembranet. Bl.a. så utnyttjas den uppbyggda kaliumgradienten för att aktivit (sekundär aktiv transport) transportera glukos in i cellen genom att kalium som transporteras med sin gradient drar med sig glukosmolekylen mot sin gradient in i cellen.
79 2022-01-29 10 Explain how proofreading works at the molecular level during bacterial replication./Förklara hur korrekturläsning fungerar på molekylär nivå under bakteriell replikation. (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska. dna-replikation Explain how proofreading works at the molecular level during bacterial replication./Förklara hur korrekturläsning fungerar på molekylär nivå under bakteriell replikation. (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska. DNA-polymeras 3 har både en DNA-syntetiserande del och en exonukleas del, detta gör det möjligt för polymeraset att "backtracka" om den skulle upptäcka att något basparat fel. Detta gör den genom sin exonukleas-aktivitet där den klyver peptidbidningar (genom att backa) 3´ till 5´. När den klyvt bort den/de felparade baserna syntetiserar den nya baser 5´ till 3´ och fortsätter som vanligt. DNA-polymeras 1 vars funktion är att klippa bort RNA-primer och syntetisera nya baser i gapsen har samma exonukleasa funktion (3´ till 5´ radering) för att korrigera den korta del den nyligen syntetiserat om ett fel skulle upptäckas.
80 2022-01-29 9 Discuss the evolutionary origin of RNase P. This question needs to be answered in English. (Max 100 words.) (2p) evolution Discuss the evolutionary origin of RNase P. This question needs to be answered in English. (Max 100 words.) (2p) The RNaseP is an enzyme consisting of both RNA and protein. By comparing the level of protein in different organisms we can see that in less complex organisms like bacteria the enzyme consists of most RNA and only one protein unit, comparing with "arkener" which is a more complex organism there is shorter/smaller RNA unit and more protein units. In even more complex organisms like humans the protein units are much greater than the RNA-unit. This provens the hypothesis that RNA also acted as enzymes long time ago, before "the tasks were split" to proteins to be more efficient.
81 2022-01-29 34 I vilken ordning genomförs nedanstående steg när plasmider ska renas? (1p) Eluera plasmiderna från kolumnen Lysera cellerna Neutralisera lysatet Pelletera cellkulturen som växt under natten plasmid I vilken ordning genomförs nedanstående steg när plasmider ska renas? (1p) Eluera plasmiderna från kolumnen Lysera cellerna Neutralisera lysatet Pelletera cellkulturen som växt under natten 1. Pelletera cellkulturen som växt under natten 2. Lysera cellerna 3. Neutralisera lysatet 4. Eluera plasmiderna från kolumnen
82 2022-01-29 14 Vad är intron och exon? (2p) rna-syntes Vad är intron och exon? (2p) Intron och exon är båda en del av den transkriberade omogna RNA-kedjan. För att skapa ett moget mRNA klipps introner ("onödiga" RNA-sekvenser) bort genom splicing. Medan de sekvenser som krävs för transaltion utgör den mogna RNA-kedjan och används som mall i proteinsyntesen. Det finns flera exon på samma mRNA kedja, vissa exon kan också klippas bort för att samma gen kan koda för olika protein. Vilket protein som uttryck styrs av miljön i cellen och beror alltså på vilka exon som sparas.
83 2022-01-29 20 Vilket/vilka av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan positiva laddningar. B: När en fosfatgrupp avges kan ADP resonansstabiliseras. C: När en fosfatgrupp frigörs ökar entropin. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i GTP. introduktion-till-metabolismen Vilket/vilka av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan positiva laddningar. B: När en fosfatgrupp avges kan ADP resonansstabiliseras. C: När en fosfatgrupp frigörs ökar entropin. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i GTP. Rätt svar 1. C 2. D
84 2022-01-29 30 Syntes av heme beror på cellens tillgång till järn. Beskriv vad som sker när järntillgången är låg. (2p) heme Syntes av heme beror på cellens tillgång till järn. Beskriv vad som sker när järntillgången är låg. (2p) På mRNA som används som mall för att syntetisera ALA-syntetaset som behövs vid hemsyntes finns den reglerande sekvensen IRE, Ire Respossible Element. När järntillgången är låg binder IRP, IRE-binding protein, till IRE vilket hämmar translationen av det nödvändiga enzymet ALA-syntas. Detta inhiberar hemsyntesen, vilket är syftet eftersom vi inte har något järn.
85 2022-01-29 15 What regions of a tRNA are recognized by amino-acyl-tRNA synthetases?/Vilka regioner hos tRNA känns igen av amino-acyl-rRNA syntetaser? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska. translation What regions of a tRNA are recognized by amino-acyl-tRNA synthetases?/Vilka regioner hos tRNA känns igen av amino-acyl-rRNA syntetaser? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska. OH-gruppen på 3´änden Den specifika nukleotidsekvensen näst längst ut på 3´änden
86 2022-01-29 21 Vilken av nedanstående metaboliter är mest reducerad? (1p) Välj ett alternativ: A: Pyruvat B: 3-fosfoglycerat C: Citrat D: Fruktos 6-fosfat introduktion-till-metabolismen Vilken av nedanstående metaboliter är mest reducerad? (1p) Välj ett alternativ: A: Pyruvat B: 3-fosfoglycerat C: Citrat D: Fruktos 6-fosfat Rätt svar 1. D
87 2022-01-29 31 Vilket av följande påståenden är helt korrekt avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom transkriptionsfaktorn SRE-1. Ökad SRE-1 signalering leder till ökat uttryck av proteinet CETP, som defosforylerar HMGR och gör det inaktivt. B: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom halten av kolesterol i blodet. Hög halt leder till att den intracellulära koncentrationen ökar genom passivt upptag. C: Endast några få celltyper i kroppen (exempelvis hepatocyter) har förmåga att syntetisera kolesterol. Övriga celltyper är helt beroende av tillförsel av kolesterol utifrån, via blodet. Kolesterol tas upp av dessa celler genom transportproteinet CETP. D: Transkriptionsfaktorn SREBP-2 är viktig för relgering av kolesterolsyntesens hastighet. SREBP-2 aktiveras genom att proteinet transporteras från det endoplasmatiska nätverket till Golgiapparaten, där transkriptionsfaktordelen klyvs av. kolesterol Vilket av följande påståenden är helt korrekt avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom transkriptionsfaktorn SRE-1. Ökad SRE-1 signalering leder till ökat uttryck av proteinet CETP, som defosforylerar HMGR och gör det inaktivt. B: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom halten av kolesterol i blodet. Hög halt leder till att den intracellulära koncentrationen ökar genom passivt upptag. C: Endast några få celltyper i kroppen (exempelvis hepatocyter) har förmåga att syntetisera kolesterol. Övriga celltyper är helt beroende av tillförsel av kolesterol utifrån, via blodet. Kolesterol tas upp av dessa celler genom transportproteinet CETP. D: Transkriptionsfaktorn SREBP-2 är viktig för relgering av kolesterolsyntesens hastighet. SREBP-2 aktiveras genom att proteinet transporteras från det endoplasmatiska nätverket till Golgiapparaten, där transkriptionsfaktordelen klyvs av. Rätt svar 1. D
88 2022-01-29 25 Vilken/vilka av nedanstående produceras vid beta-oxidation? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Pyruvat B: Acetyl-CoA C: Malonyl-CoA D: Acetoacetat E: Oxaloacetat betaoxidation Vilken/vilka av nedanstående produceras vid beta-oxidation? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Pyruvat B: Acetyl-CoA C: Malonyl-CoA D: Acetoacetat E: Oxaloacetat Rätt svar 1. B
89 2022-01-29 11 Vilken roll spelar Mediatorn vid transkriptionell aktivering? (2p) rna-syntes Vilken roll spelar Mediatorn vid transkriptionell aktivering? (2p) Mediatorn fungerar som en sambandscentral mellan enhancern (och dess aktivatorprotein) och promotorsekvensen, enhancern ligger ca 1000 baspar bort, men påverkar transkriptionen för sin specifika gen.
90 2022-01-29 8 Du träffar en patient som du misstänker har drabbats av HIV. Du kommer att använda en Indirekt ELISA för att ta reda på detta. (Max 150 ord.) (2p) A) Beskriv de olika stegen för en Indirekt ELISA. B) Detekterar denna metod patientens antikropp eller antigen? utforska-proteiner Du träffar en patient som du misstänker har drabbats av HIV. Du kommer att använda en Indirekt ELISA för att ta reda på detta. (Max 150 ord.) (2p) A) Beskriv de olika stegen för en Indirekt ELISA. B) Detekterar denna metod patientens antikropp eller antigen? A. Ett specifikt antigen fästs i en brunn, patientens prov tillsätts, sköljning genomförs för att sortera bort de antikroppar som inte fäst till antigenet, ytterligare en antikropp tillsätts som binder till den första antikroppen, färg som binder till den andra antikroppen tillsätts, provet färgas om antikroppen är detekterad. B. Antikropp
91 2022-01-29 35 Du arbetar på en vårdcentral där du förvånas över att många patienter med njursvikt (=dålig njurfunktion) tidigare har haft gikt (”portvinstå”). Du bestämmer dig därför för att undersöka om patienter med gikt löper en högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. Vilken av nedanstående är den mest rimliga nollhypotesen? (1p) Välj ett alternativ: A: Patienter med gikt har högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. B: Patienter med gikt har samma risk att utveckla njursvikt som patienter utan gikt. C: Det finns en skillnad i risken att utveckla njursvikt mellan giktpatienter och patienter utan gikt. D: Patienter med gikt har lägre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. introduktionslaboration Du arbetar på en vårdcentral där du förvånas över att många patienter med njursvikt (=dålig njurfunktion) tidigare har haft gikt (”portvinstå”). Du bestämmer dig därför för att undersöka om patienter med gikt löper en högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. Vilken av nedanstående är den mest rimliga nollhypotesen? (1p) Välj ett alternativ: A: Patienter med gikt har högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. B: Patienter med gikt har samma risk att utveckla njursvikt som patienter utan gikt. C: Det finns en skillnad i risken att utveckla njursvikt mellan giktpatienter och patienter utan gikt. D: Patienter med gikt har lägre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. B
92 2022-01-29 3 Fråga 3 Diskutera molekylära likheter och skillnader mellan mekanismerna bakom galaktosemi och laktosintolerans. (2p) kolhydrater Fråga 3 Diskutera molekylära likheter och skillnader mellan mekanismerna bakom galaktosemi och laktosintolerans. (2p) Laktos är en molekyl som består av glukos och galaktos. Båda sjukdommarna beror på brist av enzymet som bryter ned den specifika molekylen. I laktosintolerans handlar det om enzymet laktas som spjälkar laktos till galaktos och glukos, medan det i galaktosemi handlar om enzymet som omvandlar galaktos till glukos. Vid obehandlad galaktosemi ansamlas galaktos, vilket leder till att galaktos går ut i blodet och omvandlas till den toxiska molekylen galaktitol, vilket är mycket farligt. Vid obehandlad laktos bryts inte laktosmolekylen ned i tunntarmen som kroppen annars hade gjort, utan den fortsätter genom magtarmkanalen tills den hamnar i tjocktramen där den fermenteras av bakterier, vilket leder till gasbildning och buksmärtor. Ometaboliserad laktos blir alltså inte toxiskt som galaktos(--> galaktitol). Den vanligaste behandlingen för båda intoleranserna handlar främst om att utesluta den sjukdomsframkallande molekylen. Båda molekylerna finns i komjölk, vilket alltså ska undvikas. Vid laktosintolerans finns laktosfria mjölkprodukter, det finns däremot inte galaktosfria mjölkprodukter.
93 2022-01-29 7 En allvarlig komplikation till bl.a. Covid-19 är så kallad Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS), vilket ger en gravt sviktande lungfunktion orsakad av inflammation och vätskeansamling (ödem) i alveolerna. Ödemet leder till att mindre syre når blodet och att mindre koldioxid lämnar blodet. Beskriv i detalj hur den minskade mängden syre och den ökade mängden koldioxid påverkar hemoglobinets struktur och funktion. (2p) hemoglobin En allvarlig komplikation till bl.a. Covid-19 är så kallad Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS), vilket ger en gravt sviktande lungfunktion orsakad av inflammation och vätskeansamling (ödem) i alveolerna. Ödemet leder till att mindre syre når blodet och att mindre koldioxid lämnar blodet. Beskriv i detalj hur den minskade mängden syre och den ökade mängden koldioxid påverkar hemoglobinets struktur och funktion. (2p) Den ökande mängden koldioxid stabiliserar T-state, deoxy-formen, av hemoglobin vilket minskar hemoglobinets affinitet för syre och gör det svårare för syremolekylen att binda in. Detta sker bl.a. genom att koldioxid binder i till hemoglobins ena peptidände, vilket gör det möjligt för saltbryggor att återskapas vilket stabiliserar T-state (tense state). Ökad mängd koldioxid innebär även lägre PH i blodet, dvs. ökad mängd vätejoner - vilka kan binda in till hemoglobin och de möjliggör också återskapandet av saltbryggor för hemoglobinet. Vid lungorna ska normalt sett den höga syrehalten och det högre PHt leda till att koldioxidet och vätejoner släpper, för att destabilisera T-state. När syrehalten är låg är PH i blodet vid lungorna något lägre än normalt vilket gör det svårare för denna reaktion att ske. Syrehalten ska också bidra till att en syremolekyl initialt binder in till järnet i en subenhet. Eftersom hemoglobin är ett kooperativ av 4 subenheter med 4 hemgrupper leder inbidningen av syre i en enhet till en konformationsändring i de andra subenheterna vilket gör järnemolekylerna mer tillgängliga för syre att binda in till. Detta stimulerar R-state och oxy-formen av hemoglobin. Den låga syrehalten gör "sannolikheten lägre" för det första syret att binda in, och konformationsändringen sker då inte. Vanligtvis sker denna växling mellan T- och R-state på så vis att koldioxid konc. är högst i muskler och stimulerar T-state vilket gör att syret släpps av där det behövs. Å andra sidan är koncentrationen syre tillräckligt hög vid lungorna för att stimulera R-state och binda in syre. Dessa konformationsändringar är nödvändiga för ett så effektivt gasutbyte som möjligt och för att syre ska binda och släppa på rätt ställe. När dessa koncentrationer ändras och koldioxidhalten i bloden blir för hög i relation till syrehalten rubbas samspelet mellan dessa konformationsformer och T-state, deoxyformen blir dominerande.
94 2022-01-29 6 Vilket/vilka av följande påståenden om RNA är korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ryggraden i RNA hålls samman av fosfodiester-bindningar. B: Uracil kan deamineras till cytosin. C: RNA använder kvävebasen uracil istället för tymin. D: Ribonukleotider har en OH-grupp i 1'-position. nukleotider Vilket/vilka av följande påståenden om RNA är korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ryggraden i RNA hålls samman av fosfodiester-bindningar. B: Uracil kan deamineras till cytosin. C: RNA använder kvävebasen uracil istället för tymin. D: Ribonukleotider har en OH-grupp i 1'-position. Rätt svar 1. A 2. C
95 2022-01-29 2 Fråga 2 Vilket/vilka av nedanstående kan hittas i ett protein? Välj ett eller flera alternativ: A: En alfahelix. B: En hårnålsböj. C: En dubbelhelix. D: En loop. från-aminosyror-till-proteiner Fråga 2 Vilket/vilka av nedanstående kan hittas i ett protein? Välj ett eller flera alternativ: A: En alfahelix. B: En hårnålsböj. C: En dubbelhelix. D: En loop. Rätt svar 1. A 2. B 3. D
96 2022-05-16 28 I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i följande två nukleotider då dessa bryts ner? (1p) A: AMP B: CMP nukleotidnedbrytning I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i följande två nukleotider då dessa bryts ner? (1p) A: AMP B: CMP A: Urat B: Urea
97 2022-05-16 5 Rita syredissociationskurvan för hemoglobin och myoglobin. Vilken strukturell skillnad mellan myoglobin och hemoglobin förklarar skillnaden i dissociationskurvorna? (2p) (Max 100 ord) hemoglobin Rita syredissociationskurvan för hemoglobin och myoglobin. Vilken strukturell skillnad mellan myoglobin och hemoglobin förklarar skillnaden i dissociationskurvorna? (2p) (Max 100 ord) Myoglobin består av en subenhet och har mycket affinitet för syre. Myoglobin har en mycket brant dissociationskurva. Man kan säga att myoglobin fungerar som en on-off knapp, då den antingen är oxiderad (oxyform) eller deoxiderad (deoxyform). Myoglobin är därför bra för lagring av syre men väldigt dåligt för syretransport. Tillskillnad från myoglobin består hemoglobin av fyra subenheter. Hemoglobin har inte lika brant dissociationskurva, vilket innebär att hemoglobin är lämplig för transport av syre. Hemoglobin blir oxyform i lungorna där syrehalten är stor. I musklerna släpper hemoglobinet sina syre atomer gradvist och till slut blir den deoxyform. ![[Pasted image 20251129234842.png]]
98 2022-05-16 18 Vilka två av nedanstående molekyler har sitt ursprung i en B vitamin? A: Coenzym A B: ATP C: Liponsyra D: NADH integrering-av-metabolismen Vilka två av nedanstående molekyler har sitt ursprung i en B vitamin? A: Coenzym A B: ATP C: Liponsyra D: NADH Rätt svar 1. A 2. D
99 2022-05-16 1 A) Vad är mukopolysackaridos? B) Beskriv den biokemiska bakgrunden för mukopolysackaridos. (2p) kolhydrater A) Vad är mukopolysackaridos? B) Beskriv den biokemiska bakgrunden för mukopolysackaridos. (2p) A. Mukopolysackaridos är en sjukdom som innebär att GAG (glukoaminoglukaner) inte kan brytas ner. Då ansamlas GAGs i blodet och kroppens vävnader vilket har negativa konsekvenser på kroppen. B. GAG finns i proteoglykaner och består av repeterande disackarid enheter. Disackariden består av en negativt laddad monosackarid och en annan monosackarid som innehåller en acetylamin grupp (till exempel acetylgalaktosamin). Nedbrytningen av GAG behöver speciella enzymer. När dessa enzymer fungerar inte som de ska bryts GAGs inte ner. Då ansamlas stora mängder av GAG i kroppen.
100 2022-05-16 19 I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzymer att vara verksamma i den processen? (1p) alfaketoglutaratdehydrogenas fosfofruktokinas hexokinas succinatdehydrogenas glykolysen I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzymer att vara verksamma i den processen? (1p) alfaketoglutaratdehydrogenas fosfofruktokinas hexokinas succinatdehydrogenas 1. hexokinas 2. fosfofruktokinas 3. alfaketoglutaratdehydrogenas 4. succinatdehydrogenas
101 2022-05-16 29 Ribos-5-fosfat kan bildas på två olika sätt i pentosfosfatvägen. I det ena fallet utnyttjas enbart den icke-oxidativa fasen av denna metabola väg. Vilka två glykolysintermediärer utnyttjas i detta fall för syntesen av ribos-5-fosfat? Ange molekylernas fullständiga namn, inte förkortningar. (1p) pentosfosfatvägen Ribos-5-fosfat kan bildas på två olika sätt i pentosfosfatvägen. I det ena fallet utnyttjas enbart den icke-oxidativa fasen av denna metabola väg. Vilka två glykolysintermediärer utnyttjas i detta fall för syntesen av ribos-5-fosfat? Ange molekylernas fullständiga namn, inte förkortningar. (1p) fruktos-6-fosfat och glyceraldehyd-3-fosfat
102 2022-05-16 4 Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp som deras R-grupper kan delta i när pH är 7. (1p) Möjliga bindningstyper: kovalent bindning jonbindning van der Waals interaktion vätebindning Aminosyror: Arginin Asparagin Fenylalanin Tyrosin från-aminosyror-till-proteiner Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp som deras R-grupper kan delta i när pH är 7. (1p) Möjliga bindningstyper: kovalent bindning jonbindning van der Waals interaktion vätebindning Aminosyror: Arginin Asparagin Fenylalanin Tyrosin Fenylalanin: van der Waals interaktion Asparagin: vätebindning Arginin: jonbindning Tyrosin: van der Waals interaktion
103 2022-05-16 16 Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.05 mM är, och för D-fruktos = 1.5 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (2p) enzymer Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.05 mM är, och för D-fruktos = 1.5 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (2p) Km är substratkoncentrationen när enzymhastigheten är hälften av den maximala enzymhastigheten (Vmax/2). Ett lägre Km-värde innebär att enzymet kommer att nå hälften av sin maximala hastigheten vid en mindre substratkoncentration. Om vi jämför Km-värdet för D-glukos och D-fruktos så ser vi att Km-värdet är lägre för D-glukos. Detta innebär att hexokinas kommer att förbruka D-glukos snabbare.
104 2022-05-16 22 Ange vilka två av följande som är en ketonkropp. (1p) A: Acetyl-CoA B: Aceton C: Adenosin D: Acetoacetat betaoxidation Ange vilka två av följande som är en ketonkropp. (1p) A: Acetyl-CoA B: Aceton C: Adenosin D: Acetoacetat Rätt svar 1. B 2. D
105 2022-05-16 32 Beskriv hur lipid rafts är uppbyggda. (2p) cellmembran Beskriv hur lipid rafts är uppbyggda. (2p) Lipid rafts är uppbyggda av kolesterol, sphingomyelin och glukolipider.
106 2022-05-16 26 Vilka två av följande aminosyror räknas som rent glukogena? A: Glutamat B: Leucin C: Lysin D: Alanin aminosyrametabolism Vilka två av följande aminosyror räknas som rent glukogena? A: Glutamat B: Leucin C: Lysin D: Alanin A och D
107 2022-05-16 12 Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: Flap endonuklease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. D: Topoisomeraser har en 5´ till 3´ exonukleas-aktivitet. dna-replikation Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: Flap endonuklease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. D: Topoisomeraser har en 5´ till 3´ exonukleas-aktivitet. Rätt svar 1. A 2. B
108 2022-05-16 27 Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? A: Ureacykelns delreaktioner sker uteslutande i cytosolen. B: Ureacykeldefekter ger upphov till förhöjda plasmanivåer av ammoniak som är mycket toxiskt för framförallt hjärnan. C: De två kväveatomer som finalt hamnar i urea har förts in i ureacykelns cykliska del via karbamoylfosfat och aspartat. D: Enzymet argininosuccinatlyas utgör den viktigaste regleringspunkten i ureacykeln. aminosyrametabolism Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? A: Ureacykelns delreaktioner sker uteslutande i cytosolen. B: Ureacykeldefekter ger upphov till förhöjda plasmanivåer av ammoniak som är mycket toxiskt för framförallt hjärnan. C: De två kväveatomer som finalt hamnar i urea har förts in i ureacykelns cykliska del via karbamoylfosfat och aspartat. D: Enzymet argininosuccinatlyas utgör den viktigaste regleringspunkten i ureacykeln. B och C
109 2022-05-16 13 Vilken roll spelar tryptofanrepressorn vid tryptofanoperonet? Hur styrs dess aktivitet av mängden tryptofan? (2p) kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Vilken roll spelar tryptofanrepressorn vid tryptofanoperonet? Hur styrs dess aktivitet av mängden tryptofan? (2p) Tryptofanoperonet kodar för enzymer som är essentiella för bildningen av tryptofan. Tryptofanrepressorn binder till operatorn i tryptofanoperonet och hämmar transkriptionen. När en tryptofan molekyl binder sig till tryptofanrepressorn, kommer tryptofanrepressorn att kunna binda till operatorn och hämma transkriptionen av tryptofanoperonet. Vid brist på tryptofan, kommer trymptofanrepressorn inte att vara bunden till några tryptofan molekyler och därmed kommer tryptofanrepressorn att lösna från operatorn och tillåta transkriptionen av tryptofanoperonet. Mycket tryptofan => tryptofanrepressorn binder => Transkriptionen hämmas Lite tryptofan => tryptofanrepressorn lössnar => Transkriptionen stimuleras
110 2022-05-16 17 Vilka två av nedanstående påståenden om övergångstillståndet vid en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det ändrar enzymets optimala pH. B: Det tillåter reaktioner att fortgå vid en acceptabel temperatur. C: Det tillåter kemikalier att reagera som annars inte skulle göra det. D: Det tillåter reaktioner att fortskrida snabbare. enzymer Vilka två av nedanstående påståenden om övergångstillståndet vid en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det ändrar enzymets optimala pH. B: Det tillåter reaktioner att fortgå vid en acceptabel temperatur. C: Det tillåter kemikalier att reagera som annars inte skulle göra det. D: Det tillåter reaktioner att fortskrida snabbare. Rätt svar 1. A 2. C
111 2022-05-16 23 2,4-dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord) citronsyracykeln 2,4-dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord) 2,4-dinitrofenol är en frikopplare, vilket innebär att den förstör protongradienten över mitokondriens inremembran. 2,4-dinitrofenol är en hydrofob molekyl som kan lätt diffundera från mitokondriens intermembranutrymmet till matrix. 2,4-dinitrofenol kan binda till vätejoner och transportera de över mitokondriens inre membran, vilket förstör protongradienter och ger upphov till värme. Protongradienten behövs för att producera ATP. När protongradienter förstörs kommer cellen att bryta mer fettsyror ner för att upprätthålla gradienter. Detta gör att upptag av 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning, då kroppen bryter ner en stor mängd av fett. Vilka två av nedanstående enzymer katalyserar en dekarboxylering? Isocitratdehydrogenas Alfaketoglutaratdehydrogenas Malatdehydrogenas Succinatdehydrogenas
112 2022-05-16 33 Proteinet på bilden transporterar glukos och Na⁺ från tarmen in i epitelceller. A) Vilken typ av transportör är det? B) Vilken typ av transport sker för glukos? C) Vilken är drivkraften bakom transporten av glukos? (Max 75 ord) ![[Pasted image 20251128083857.png]] transport-över-cellmembran Proteinet på bilden transporterar glukos och Na⁺ från tarmen in i epitelceller. A) Vilken typ av transportör är det? B) Vilken typ av transport sker för glukos? C) Vilken är drivkraften bakom transporten av glukos? (Max 75 ord) ![[Pasted image 20251128083857.png]] A. Symport B. Sekundär-aktivtransport C. Vid sekundär-aktivtransport används en molekyl koncentrationsgradient för att transportera en annan molekyl mot sin koncentrationsgradient. Vid transport av glukos används Na jonernas koncentrationsgradient som drivkraften. Det är termodynamiskt fördelaktigt att transportera Na in i cellen då det sker med koncentrationsgradienten.
113 2022-05-16 24 2,4 -dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4 -dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord) integrering-av-metabolismen 2,4 -dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4 -dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord) 1.5p av 2: 2,4-dinitrofenol är en frikopplare, vilket innebär att den förstör protongradienten över mitokondriens inremembran. 2,4-dinitrofenol är en hydrofob molekyl som kan lätt diffundera från mitokondriens intermembranutrymmet till matrix. 2,4-dinitrofenol kan binda till vätejoner och transportera de över mitokondriens inre membran, vilket förstör protongradienter och ger upphov till värme. Protongradienten behövs för att producera ATP. När protongradienter förstörs kommer cellen att bryta mer fettsyror ner för att upprätthålla gradienter. Detta gör att upptag av 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning, då kroppen bryter ner en stor mängd av fett. AI: 2,4-Dinitrofenol (DNP) frikopplar oxidativ fosforylering genom att transportera protoner över det inre mitokondriemembranet. När protongradienten kortsluts kan ATP-syntas inte använda energin i elektrontransportkedjan för att bilda ATP. Cellerna svarar genom att öka oxidationen av fett och kolhydrater för att försöka upprätthålla ATP-nivåerna, vilket kraftigt ökar metabolismen och värmeproduktionen. Denna ineffektiva energiomvandling gör att mer bränsle förbrukas per producerad ATP → snabb viktminskning. Den ökade syreförbrukningen och värmeproduktionen kan bli livshotande, eftersom DNP ger hypertermi, acidos och organsvikt vid relativt små doser.
114 2022-05-16 10 Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. rna-syntes Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. Rätt svar 1. A 2. D
115 2022-05-16 9 Hur kan en punktmutation i ett intron leda till human sjukdom? (2p) (Max 25 ord). rna-syntes Hur kan en punktmutation i ett intron leda till human sjukdom? (2p) (Max 25 ord). Genom att skapa nya splice-sites i intronen som leder till att mRNAt klivs felaktigt, som gör att mRNAt kan koda för fel proteiner.
116 2022-05-16 34 Förklara kortfattat vad som menas med A) Selektion av antibiotikaresistenta bakterier B) Blåvit screening (2p) Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska. plasmid Förklara kortfattat vad som menas med A) Selektion av antibiotikaresistenta bakterier B) Blåvit screening (2p) Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska. A. Selektion av antibiotikaresistenta bakterier innebär att odla bakterier i en miljö med antibiotika. Då kommer bara de bakterier med antibiotikaresistens att överleva, medan de bakterier utan antibiotika resistens kommer att dö ut. Ampicillin är ett exempel av antibiotika som används vid selektion av antibiotikaresistenta bakterier. Genom att använda plasmider som innehåller antibiotikaresistens-gener kommer endast de bakterier som bär på dessa plasmider att överleva i en antibiotikarik miljö. B. Blåvit screening är ett metod att skilja mellan bakterier med plasmider och bakterier utan plasmider. Bakterier med plasmider har en klyvd lac-operon och därför kommer inte de färgas vid addition av x-GAL, då säger man att de är vita kolonier. Bakterier utan plasmider har en fullt fungerande lac-operon och kommer att färgas blått vid addition av x-GAL, då säger man att de är blå kolonier.
117 2022-05-16 14 Hur är det möjligt för en bakterie att initiera proteinsyntes av flera olika proteiner från enbart ett mRNA-transkript? (2p) translation Hur är det möjligt för en bakterie att initiera proteinsyntes av flera olika proteiner från enbart ett mRNA-transkript? (2p) Till skillnad från eukaryouter där mRNAt har endast en startkodon (AUG), har bakterier flera start kodoner inom samma mRNA molekyl. I bakterier har mRNAt "shine dalgarno" sekvenser i närhet till startkodonerna AUG. Dessa "shine dalgarno" sekvenser känns igen med hjälp av S16 subenheten som i sin tur finns i S30 subenheten av ribosomen (också kallad den lilla subenheten). Detta förklarar hur det är möjligt att initiera proteinsyntes av flera olika proteiner från enbart ett mRNA-transkript i bakterier.
118 2022-05-16 20 I vilka två vävnader hittar vi framförallt glykogen hos människa, och vilken huvudsakliga funktion har glykogenet i respektive vävnad? (2p) glykogen I vilka två vävnader hittar vi framförallt glykogen hos människa, och vilken huvudsakliga funktion har glykogenet i respektive vävnad? (2p) Glykogen finns i muskelvävnad och i levern. Glykogen i levern används för att reglera glukoshalten i blodet. Glykogen bryts ner till glukos-1-fosfat och omvandlas senare till glukos-6-fosfat med hjälp av enzymet fosfoglukomutas. Glukos-6-fosfat kan defosforyliseras till glukos med hjälp av enzymet glukos-6-fosfatas som endast finns i levern. Senare kan glukos molekylerna frisättas från levern till blodet. Muskler saknar enzymet glukos-6-fosfatas vilket innebär att muskler kan inte skapa glukos och frisätta det i blodet. Glykogenet i muskler används därför som energireserv, genom att brytas ner till glukos-6-fosfat som kan fortsätta i glykolysen och till sist producera ATP.
119 2022-05-16 30 Vilken typ av bilirubin (konjugerat eller okonjugerat) är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? Förklara varför. (2p) heme Vilken typ av bilirubin (konjugerat eller okonjugerat) är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? Förklara varför. (2p) I mjälten bryts hem ner till biliverdin och sedan omvandlas till okonjugerat bilirubin som frisätts i blodet. I levern konjugeras bilirubinet och utsöndras via galla. Konjugeringen sker för att göra den hydrofoba bilirubinet amfipatisk och vattenlöslig. Vid hemolytiska sjukdomar ökar nedbrytningen av röda blodkroppar i mjälten vilket ger upphov till förhöjt koncentration av okonjugerat bilirubin. Om levern inte kan ta hand om de stora koncentrationer av okonjugerat bilirubin i blodet ansamlas okonjugerat bilirubin i stora koncentrationer.
120 2022-05-16 15 A biologist studying a new bacterial strain identified in Göteborg is interested in the following two new biochemical reactions: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) What does ∆G mean in Thermodynamics? Which of the two reactions is spontaneous and what is the explanation for this? / En biolog som studerar en ny bakteriestam som har identifierats i Göteborg är intresserad av följande biokemiska reaktioner: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) Vad avses med ∆G inom termodynamiken? Vilken av reaktionerna är spontan och vilken är anledningen till det? This question needs to be answered in English. (2p) (Max 100 words) termodynamik A biologist studying a new bacterial strain identified in Göteborg is interested in the following two new biochemical reactions: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) What does ∆G mean in Thermodynamics? Which of the two reactions is spontaneous and what is the explanation for this? / En biolog som studerar en ny bakteriestam som har identifierats i Göteborg är intresserad av följande biokemiska reaktioner: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) Vad avses med ∆G inom termodynamiken? Vilken av reaktionerna är spontan och vilken är anledningen till det? This question needs to be answered in English. (2p) (Max 100 words) G (Gibbs free energi) means the change of free energy in the system. Delta-G explains how the free energi in the system change after a specific reaction. Negative delta-G means the reaction is spontaneous, while positive delta-G indicates that the reaction is not spontaneous and is not thermodynamicly favorable. The spontaneous reaction is P + H₂O -> Q + Pi because it has negativ Delta-G.
121 2022-05-16 21 Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (2p) (Max 120 ord) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? C) En typ av reglering av komplexet är av feedforwardtyp. Redogör för vad feedforwardreglering innebär samt vad som ger feedforwardreglering av komplexet och hur. integrering-av-metabolismen Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (2p) (Max 120 ord) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? C) En typ av reglering av komplexet är av feedforwardtyp. Redogör för vad feedforwardreglering innebär samt vad som ger feedforwardreglering av komplexet och hur. A. Pyruvatdehydrogenaskomplexet är länken mellan glykolysen och citronsyracykeln. Komplexet katalyserar den irreversibla nedbrytningen av pyruvat till koldioxid och acetyl-Coa. B. Komplexet styr en irreversibel reaktion där pyruvat bryts ner till Acetyl-Coa. Acetyl-Coa kan inte användas för återbilda pyruvat och därför måste den användas i andra metabola vägar. Därför är enormt viktigt att reglera komplexet för att inte slösa pyruvat onödigt. C. Feedforwardreglering innebär att substraten i en reaktion stimulerar enzymet som katalyserar denna reaktion. Pyruvat ger feedforwardreglering av pyruvatdehydrogenaskomplexet, då ökade koncentrationen av pyruvat leder till att komplexet stimuleras. Då bryts pyruvat till Acetyl-Coa för att minska koncentrationen av pyruvat.
122 2022-05-16 31 Beskriv kortfattat två huvudsakliga mekanismer för hur cellens intracellulära kolesterolkoncentration regleras. (2p) kolesterol Beskriv kortfattat två huvudsakliga mekanismer för hur cellens intracellulära kolesterolkoncentration regleras. (2p) 1. Transkriptionen av HMGR kan regleras. Vid låg halt av kolesterol kommer Insig-proteinet att lössna från scap-SREBP komplexet i ER, vilket gör att scap-SREBP transporteras till golgia apparaten med hjälp av COPII. SREBP bryts ner av enzymerna S1P och S2P, vilket gör att den N-terminala delen av SREBP frigörs till cellkärnan. I cellkärnan kan den N-terminala delen av SREBP binda till SRE-1, vilket bland annat ökar transkriptionen av enzymet HMGR. HMGR katalyserar första steget i kolesterolsyntesen där HMG omvandlas till mevalonat. 2. Translationen av HMGR-mRNAt kan regleras med hjälp av oxylanesterol-halten i cellen. En hög halt oxylanesterol (orsakad av hög halt av kolesterol) leder till att mindre polysomer binder till HMGR-mRNAt, vilket leder till mindre translation av HMGR. Å andra sidan kommer en låg oxylanesterol-halt (orsakad av låg halt av kolesterol) i cellen att leda till att fler polysomer binder sig till HMGR-mRNAt, då translateras fler HMGR som stimulerar kolesterolsyntes.
123 2022-05-16 25 A. Vad innebär redoxpotential? B. Ge två exempel på redoxpar som förekommer i elektrontransportkedjan. (2p) (Max 75 ord) elektrontransportkedjan A. Vad innebär redoxpotential? B. Ge två exempel på redoxpar som förekommer i elektrontransportkedjan. (2p) (Max 75 ord) A. Redoxpotential innebär ett molekyls förmåga att ta upp elektroner. Hög redoxpotential innebär att molekylen har stor affinitet till elektroner (molekylen vill ta upp mer elektroner), medan låg redoxpotential innebär att molekylen har låg affinitet till elektroner (molekylen vill avge sina elektroner). B. Ubiquiton (Q) och Ubiquinol (QH₂). QH₂ har lägre redoxpotential än Q, då QH₂ vill avge sina två elektroner. FADH₂ och FAD är ett annat redoxpar i elektrontransportkedjan.
124 2022-05-16 11 Vilka två av följande påståenden om histoner är korrekta? A: I kromatin ingår endast DNA, ej proteiner. B: I en nukleosom är ~146 bp av DNA lindat kring en kärna av åtta histonproteiner. C: Acetylering av histonsvansar kan neutralisera positiva laddningar. D: Med begreppet histonkod avses DNA-sekvensen hos histongener. kromatin Vilka två av följande påståenden om histoner är korrekta? A: I kromatin ingår endast DNA, ej proteiner. B: I en nukleosom är ~146 bp av DNA lindat kring en kärna av åtta histonproteiner. C: Acetylering av histonsvansar kan neutralisera positiva laddningar. D: Med begreppet histonkod avses DNA-sekvensen hos histongener. Rätt svar 1. B 2. C
125 2022-05-16 8 Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p) evolution Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p) Endosymbios är en teori som förklarar mitokondriens uppkomst i eukaryota celler. Teorin går ut på att en stor anaerob eukaryotcell har endocyterat en aerob bakterie. Den eukaryota cellen och bakterien lever i symbios, där den eukaryota cellen försörjer bakterien med metaboliter medan bakterien utför aerob metabolism åt den eukaryotacellen. Bakterien har senare utvecklats till mitokondrie. En bevis på att endosymbios teorin stämmer är att mitokondrier har egna DNA.
126 2022-05-16 35 Du vill sätta upp en studie för att ta reda på hur lång tid det tar för blod att koagulera hos friska individer. Du vill få ett relativt litet standardfel (SE) för att känna att du har lyckats få en bra skattning av hur lång tid det brukar ta för blod att koagulera. SE kan härledas fram med hjälp av två parametrar. Vilka är parametrarna och hur ska de se ut om du vill få ett litet värde på SE? (2p) (Max 50 ord.) introduktionslaboration Du vill sätta upp en studie för att ta reda på hur lång tid det tar för blod att koagulera hos friska individer. Du vill få ett relativt litet standardfel (SE) för att känna att du har lyckats få en bra skattning av hur lång tid det brukar ta för blod att koagulera. SE kan härledas fram med hjälp av två parametrar. Vilka är parametrarna och hur ska de se ut om du vill få ett litet värde på SE? (2p) (Max 50 ord.) 1- Ju större antal individer som försöket utförs på desto lägre SE. 2- Ju mer lika dessa individers egenskaper är (ålder, kön, hälsa, kost mm.) desto lägre SE.
127 2022-05-16 3 När protoner transporteras över mitokondriens inre membran genom ATPsyntas spelar specifika aminosyror en viktig roll. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar protontransporten behöver ha och vad som möjliggör protontransporten. Ge även ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (2p) (Max 100 ord) från-aminosyror-till-proteiner När protoner transporteras över mitokondriens inre membran genom ATPsyntas spelar specifika aminosyror en viktig roll. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar protontransporten behöver ha och vad som möjliggör protontransporten. Ge även ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (2p) (Max 100 ord) ATPsyntasets transmembranella del (F0) ansvarar för transporten av protoner över mitokondriens inre membran. F0 innehåller en roterande c-ring som består av 10 c-subenheter samt en a-subenhet som protoniserar och deprotoniserar c-subenheterna. När en c-subenhet protoniseras, nutraliseras ett negativt laddat aminosyra i c-subenheten, vilket leder till en konformationsändring som tillåter c-ringen att rotera. En protoniserad c-subenhet roterar en varv runt c-ringen innan den släpper sin proton, då blir aminosyran negativt laddad som i början. Exempel på ett negativt laddad aminosyra: Aspartat
128 2022-05-16 7 Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p) nukleotider Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p) Endosymbios är en teori som förklarar mitokondriens uppkomst i eukaryota celler. Teorin går ut på att en stor anaerob eukaryotcell har endocyterat en aerob bakterie. Den eukaryota cellen och bakterien lever i symbios, där den eukaryota cellen försörjer bakterien med metaboliter medan bakterien utför aerob metabolism åt den eukaryotacellen. Bakterien har senare utvecklats till mitokondrie. En bevis på att endosymbios teorin stämmer är att mitokondrier har egna DNA. A. Hur skiljer sig endonukleaser från exonukleaser? B. Skriv det fullständiga namnet för dADP? (2p) A. Endonukleaser klipper nukleinsyror från mitten, medan exonukleaser klipper nukleinsyror från ändarna (antingen från 3' till 5' riktning eller från 5' till 3'). Detta utförs genom att bryta fosfodiesterbindningen mellan nukleotiderna. B. Deoxyadinosindifosfat
129 2022-05-16 6 Du har fått i uppgift att preparera fram ett protein ur ett homogenisat och du kommer använda tre olika metoder för detta. Beskriv varje metod kortfattat samt ange vilken proteinegenskap som används för separationen (2p) (Max 200 ord) A. Gelfiltrering B. Jonbyteskromatografi C. Affinitetskromatografi utforska-proteiner Du har fått i uppgift att preparera fram ett protein ur ett homogenisat och du kommer använda tre olika metoder för detta. Beskriv varje metod kortfattat samt ange vilken proteinegenskap som används för separationen (2p) (Max 200 ord) A. Gelfiltrering B. Jonbyteskromatografi C. Affinitetskromatografi A. Vid gelfiltrering består den fasta fasen av kulor med håligheter. Vid gelfiltrering filtreras proteinerna storleksmässigt, där små proteiner binder till kulorna medan de stora proteiner fortsätter vidare genom kolumnen. Därför kommer protienerna med störst massa först ut, och proteinerna med låg massa hamnar sist i filtreringen. B. Jonbyteskromatografi filtrerar protiener beroende på laddning. De finns två typer av jonbyteskromatografi. Första typen är anjonsbytare, där proteinerna med positiv laddning kommer ut först. Andra typen är katjonsbytare där jonerna med negativ laddning kommer ut först. Den fasta fasen består av kulor med antingen negativ eller positiv laddning som kan fästa till de laddade proteinerna med hjälp av jonbindningar. C. Affinitetskromatografi är en filtreringsmetod som är baserad på att filtrera protiener med hjälp av en speciell egenskap hos proteinerna. Till exempel kan proteinernas glykolysering användas för att filtrera protienerna.
130 2022-05-16 2 Nya regler från EU ska se till att minimera mängden transfetter i livsmedel. Vilka två påståenden stämmer om transfetter? (1p) A: Transfetter kan i regel packas tätare än cisfetter och bidrar därmed till minskad fluiditet i cellmembranet. B: Transfetter kan inte brytas ner av kroppens enzymer. C: Transfetter höjer koncentrationen av det ”goda” kolesterolet HDL i blodet. D: Transfetter består av mättade fettsyror. lipider Nya regler från EU ska se till att minimera mängden transfetter i livsmedel. Vilka två påståenden stämmer om transfetter? (1p) A: Transfetter kan i regel packas tätare än cisfetter och bidrar därmed till minskad fluiditet i cellmembranet. B: Transfetter kan inte brytas ner av kroppens enzymer. C: Transfetter höjer koncentrationen av det ”goda” kolesterolet HDL i blodet. D: Transfetter består av mättade fettsyror. Rätt svar 1. A 2. B
131 2025-02-01 28 Redogör för ett skäl till att man inte kan säga exakt hur många protoner som behöver förflyttas över mitokondriens inre membran för varje ATP som bildas av ATP-syntaset. Förklara också hur protonerna förflyttas i ATP-syntaset. (4p) Max 80 ord. elektrontransportkedjan Redogör för ett skäl till att man inte kan säga exakt hur många protoner som behöver förflyttas över mitokondriens inre membran för varje ATP som bildas av ATP-syntaset. Förklara också hur protonerna förflyttas i ATP-syntaset. (4p) Max 80 ord. 3.5 av 4 poäng C-ringen är bunden till ATP-syntasets matrix del via en gamma stjälk. Inre delen består av 6 subenheter, 3 beta och 3 alfa. Det är beta subenheterna som sköter produktion av ATP då de har 3 konformationer, loose(tar emot ADP+pi), tense (bildar ATP) och open (ATP lämnar). När en proton binder till c-subenhet neutraliserar det en negativladdad aa --> c ringen roterar - -> gamma-stjälken + b-subenheter roterar-->ATP-produktion. -Svårt att säga exakt atntal H+ eftersom frikopplare utjämnar gradienten utan att tillverka ATP. Ord: 80 Totalpoäng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen AI-rättning 1. Det korrekta skälet: antalet c-subenheter varierar mellan arter C-ringen i ATP-syntas har olika antal c-subenheter (t.ex. 8–15). Varje subenhet kräver 1 H⁺ per 360° rotation. Därför varierar H⁺/ATP mellan organismer. Det är detta examinatorerna är ute efter. 2. Övriga faktorer som påverkar (godkända som komplettering): Protonläckage (inkl. UCP/frikopplare). Energiåtgång för fosfattransport och ADP/ATP-translokas.
132 2025-02-01 5 Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av HIV. (4p) Max 200 ord. (Lista A–B i ditt svar nedan!) A) Nämn en analysmetod som kan användas för att undersöka detta samt beskriv de olika stegen i metoden. B) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod? utforska-proteiner Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av HIV. (4p) Max 200 ord. (Lista A–B i ditt svar nedan!) A) Nämn en analysmetod som kan användas för att undersöka detta samt beskriv de olika stegen i metoden. B) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod? a) För att undersöka huruvida en patient är smittad av HIV eller inte, kan metoden indirekt ELISA användas. I denna metod har vi först en brunn med HIV-antigener. Prov från patienten tillsätts för att senare kunna se om dess antikroppar binder till antigenerna, och därefter sköljer vi för att undvika att oönskade substanser ska påverka resultatet. Senare tillsätts enzymbundna antikroppar till provet, och sedan sköljer vi igen. Efteråt tillsätts ett substrat som binder till enzymet. Om patienten har antikroppar, kommer patientens antikroppar ha bundit till antigenena och därmed kommer provet att färgas. Om patientens antikroppar inte binder, kommer vi inte få något färgämne, vilket tyder på att patienten inte har antikropparna och har därmed inte HIV. b) antikroppar
133 2025-02-01 18 Redogör för begreppet entalpi. Vilka termer/aspekter ingår och hur kan man använda entalpiförändringar för att förutse benägenheten för en viss biokemisk reaktion att ske? (4p) termodynamik Redogör för begreppet entalpi. Vilka termer/aspekter ingår och hur kan man använda entalpiförändringar för att förutse benägenheten för en viss biokemisk reaktion att ske? (4p) Elev 1 - 2 av 4 poäng Entalpi är skillnaden mellan produkternas och reaktanternas energi i en reaktion. Om entalpivärdet är positivt, innebär det att reaktionen kommer kräva energitillförsel, då produkterna kommer ha högre energi än reaktanterna. Om entalpivärdet är negativt innebär det att reaktionen kan ske spontant då det frigörs energi och det är därmed fördelaktig. Elev 2 - 2 av 4 poäng Entalpi är värme energi, betecknas H. En reaktion mellan x och y, där y har högre entalpi än x är ofördelaktig eller har positiv deltaG för man går från att ha lite energi till att ha mer, vilket innebär att energiförändringen (E2-E1) är negativ --> alltså behöver energi tillföras för att reaktionen ska ske. Om reaktionen skulle vara spontant istället så behöver entalpin hos y vara lägre än X --> deltaG < 0. H = S - T x deltaG AI-rättning: Den riktiga definitionen: H = U + pV. ΔH = värmeutbyte vid konstant tryck. ΔH ensamt räcker inte för spontanitet → måste kopplas till ΔG = ΔH − TΔS. Entropi och temperatur som avgörande delar av bedömningen. Biokemisk kontext: bindningsstyrka, värmeutbyte, och hur ΔH vägs mot ΔS för att avgöra om en reaktion går åt rätt håll.
134 2025-02-01 1 Vilka två påståenden om vätebindningar är korrekta? (2p) A: De stabiliserar primärstrukturen hos proteiner. B: De bildas mellan dipoler. C: Ju rakare bindning, desto svagare. D: Acceptoratomerna har hög elektronegativet. kemiska-bindingar Vilka två påståenden om vätebindningar är korrekta? (2p) A: De stabiliserar primärstrukturen hos proteiner. B: De bildas mellan dipoler. C: Ju rakare bindning, desto svagare. D: Acceptoratomerna har hög elektronegativet. B och D
135 2025-02-01 19 Fördelen med att mäta den initiala hastigheten V i början av en reaktion är att (välj två av nedanstående): (2p) A: Förändringar i [S] är försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. B: Produktinhibering kan då inte påverka hastigheten. C: Förändringar i Km är försumbara, så Km kan behandlas som en konstant. D: Variationer av [S] har ingen effekt på V₀. enzymer Fördelen med att mäta den initiala hastigheten V i början av en reaktion är att (välj två av nedanstående): (2p) A: Förändringar i [S] är försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. B: Produktinhibering kan då inte påverka hastigheten. C: Förändringar i Km är försumbara, så Km kan behandlas som en konstant. D: Variationer av [S] har ingen effekt på V₀. A och B
136 2025-02-01 29 Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? (2p) A: Nedsatt funktion av enzymer som verkar i ureacykeln leder till förhöjda plasmanivåer av ammoniak. B: Ureacykeln sker i ibland i muskel när denna vävnad använder sig av aminosyror som energikälla. C: De två kväveatomer som slutligen hamnar i urea har förts in i ureacykeln via karbamoylfosfat och aspartat. D: Ureacykelns huvudsakliga funktion är att omvandla urea, som bildas vid nedbrytning av tex aminosyror, till ammoniak som kan utsöndras med urinen. aminosyrametabolism Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? (2p) A: Nedsatt funktion av enzymer som verkar i ureacykeln leder till förhöjda plasmanivåer av ammoniak. B: Ureacykeln sker i ibland i muskel när denna vävnad använder sig av aminosyror som energikälla. C: De två kväveatomer som slutligen hamnar i urea har förts in i ureacykeln via karbamoylfosfat och aspartat. D: Ureacykelns huvudsakliga funktion är att omvandla urea, som bildas vid nedbrytning av tex aminosyror, till ammoniak som kan utsöndras med urinen. B och C OBS: Fel i facit, föreläsaren bekräftat att B och C är rätt
137 2025-02-01 4 A) Name two allosteric regulators of oxygen binding to hemoglobin. B) Explain an outcome for each regulator. (Max 100 words.) Please answer this question in English. (4p) hemoglobin A) Name two allosteric regulators of oxygen binding to hemoglobin. B) Explain an outcome for each regulator. (Max 100 words.) Please answer this question in English. (4p) a) O₂ and CO₂ b) O₂: Hemoglobin has four subunits that bind to O₂ through cooperativity, meaning that if one subunit binds to an O₂, the other subunits' affinity for O₂ will increase, leading to all subunits binding to O₂. When O₂ binds, the state goes from T-state (deoxy; tense) to R-state (oxy; relaxed). CO₂: When CO₂ binds to hemoglobin, the hemoglobin's affinity to oxygen decreases, leading to a stabilization of the T-state instead.
138 2025-02-01 16 ![[Pasted image 20251129235913.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns proteinet? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord. transport-över-cellmembran ![[Pasted image 20251129235913.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns proteinet? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord. A) ATPaser, specifikt ABCaset. Exempel på aktiv transport. B) Ligger på cellmembranet, transporterar substrat från cytoplasman till ECM. C) ATP hydrolys --> fosfoanhydridbindningar bryts --> energi frigörs, det sker konformationsändringar som växlar mellan att proteinet öppnar mot cytoplasman respektive ECM. Ord: 40 Totalpoäng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen
139 2025-02-01 22 Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glykolysen? (2p) A: När glukos fosforyleras av hexokinas kan produkten enbart användas i glykolysen. B: För varje glukosmolekyl bildas 4 ATP. C: Den sker i cellens cytoplasma. D: Den kräver syre. glykolysen Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glykolysen? (2p) A: När glukos fosforyleras av hexokinas kan produkten enbart användas i glykolysen. B: För varje glukosmolekyl bildas 4 ATP. C: Den sker i cellens cytoplasma. D: Den kräver syre. B och C
140 2025-02-01 32 Nämn två metabola vägar som är integrerade med pentosfosfatvägen eftersom de sker i samma del av cellen och har gemensamma intermediärer. (2p) Max 10 ord. pentosfosfatvägen Nämn två metabola vägar som är integrerade med pentosfosfatvägen eftersom de sker i samma del av cellen och har gemensamma intermediärer. (2p) Max 10 ord. Glykolysen och glukoneogenesen
141 2025-02-01 26 Beskriv hur acetyl-CoA karboxylas regleras. (4p) lipider Beskriv hur acetyl-CoA karboxylas regleras. (4p) Elev 1 - 1 av 4 Insulin stimulerar enzymet medan glukagon hämmar. Enzymet är aktivt i dess defosforylerade form, och insulin stimulerar defosforylering. Acetyl-CoA-karboxylas fosforyleras när glukagon är dominerande, och därmed hämmas enzymet av glukagon. Feedforwardreglering av pyruvat där höga mängder pyruvat hämmar och låga mängder stimulerar. Elev 2 - 1 av 4 Acetyl-CoA karboxylas stimuleras av insulin och hämmas av glukagon. Den regleras även av energikvoten där ATP stimulerar och ADP/AMP hämmar. AI-rättning Citrat aktiverar (allosteriskt + polymerisering) Palmitoyl-CoA hämmar (feedback + depolymerisering) AMPK fosforylerar och inaktiverar → energikontroll Polymeriseringstillståndet styr enzymets aktivitet (Insulin/glukagon ska nämnas, men räcker inte ens nära för 4p)
142 2025-02-01 12 Vilka två påståenden om RNA-splicing är korrekta? (2p) A: Spliceosomen består av både RNA och proteiner. B: Splicingprocessen sker i cellens cytoplasma. C: Splicing sker endast i prokaryoter. D: En lariatstruktur bildas. rna-syntes Vilka två påståenden om RNA-splicing är korrekta? (2p) A: Spliceosomen består av både RNA och proteiner. B: Splicingprocessen sker i cellens cytoplasma. C: Splicing sker endast i prokaryoter. D: En lariatstruktur bildas. A och D
143 2025-02-01 27 Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (2p) Börja med lägst redoxpotential: cytokrom c FADH₂ NADH O₂ elektrontransportkedjan Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (2p) Börja med lägst redoxpotential: cytokrom c FADH₂ NADH O₂ A: NADH B: FADH₂ C: cytokrom c D: O₂
144 2025-02-01 13 Lac-operonet reglerar nedbrytningen av laktos i bakterier. Vilken roll spelar allolaktos vid lac-operonet, och hur påverkar detta transkriptionen av generna som är inblandade i laktosmetabolismen? (4p) kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Lac-operonet reglerar nedbrytningen av laktos i bakterier. Vilken roll spelar allolaktos vid lac-operonet, och hur påverkar detta transkriptionen av generna som är inblandade i laktosmetabolismen? (4p) Allolaktos är en korepressor som binder till repressorn på lac-operonet vid närvaro av laktos. När allolaktos binder, kommer repressorn att flyttas och därmed kommer gener som kodar för enzymer som bryter ner laktos att kunna transkriberas.
145 2025-02-01 17 Perifera membranproteiner kan vara bundna till cellmembranet på flera olika sätt. Beskriv tre olika varianter. (4p) cellmembran Perifera membranproteiner kan vara bundna till cellmembranet på flera olika sätt. Beskriv tre olika varianter. (4p) 1. Kan binda mha adhesions molekyler, ex integriner som binder via komponenter i ECM (ex kollagen). 2. GPI ankare. Kan frisättas när som helst vid behov, då den binder perifert till nervcellernas cellmembran. 3. Kan binda till delen av membranproteiner som finns utanför cellmembranet. Exempelvis har alfa helixar en del av sig utanför cellmembranet, kan binda till cellmembranet genom den.
146 2025-02-01 23 Redogör för hur glukosmetabolismen regleras på hormonell nivå. (4p) Max 150 ord. glukosmetabolism Redogör för hur glukosmetabolismen regleras på hormonell nivå. (4p) Max 150 ord. Elev 1 - 3 av 4 poäng Glukagon aktiverar glukoneogenesen, det vill säga återbildning av glukos. Detta då glukagon aktiverar cAMP som fosforylerar PKA. PKA, i sin tur, fosforylerar Fosfofruktokinas 2 (PFK2) /fruktos-2,6-bisfosfatas (FBPase-2). Vid fosforylering kommer PFK2-delen att hämmas, samtidigt som FBPase-2-delen aktiveras. När FBPase-2 är aktivt, kommer fruktos-2,6-bisfosfat att brytas ner. Då fruktos-2,6-bisfosfat är en allosterisk regluator som aktiverar fosfofruktokinas 1 i glykolysen, kommer glykolysen att hämmas då f-2,6-bp kommer att brytas ned. Om insulin är dominerande, kommer det däremot signalera defosforylering som medför att PFK2 blir aktivt och bilda fruktos-2,6-bisfosfat som kan stimulera glykolysen. (Sen tror jag också att även glukokinas i levern regleras hormonellt där insulin aktiverar och glukagon hämmar) Elev 2 - 3 av 4 poäng Insulin: Frisätts när glukos nivåer i blodet höjs. Insulin stimulerar enzymer i glykolysen, mycket glukos --> den behöver metaboliseras och användas till ATP produktion. Insulin hämmar enzymer i glukoneogenesen såsom fruktos-1,6-bisfosfatas. Den gör detta genom att aktivera PKA som i sin tur aktiverar fosfofruktokinas-2, enzym som fosforylerar fruktos-6-fosfat för att omvandlas till fruktos-2,6-bisfosfat. Fruktos-2,6-bisfosfat stimulerar glykolysen och hämmar glukoneogenesen, som jag nämnt innan så inhiberar den fruktos- 1,6-fosfatas. Fosfofruktokinas-1 stimuleras av insulin för att omvandla fruktos-6-fosfat till fruktos-1,6-bisfosfat. Glukagon: Frisätts när glukos nivåer i blodet är låga. Den har motsatt effekt till insulin, den stimulerar glukoneogenesen och hämmar glykolysen. Glukagon verkar mest på levern och stimulerar enzymer i som pyruvatkarboxykinasdehydrogenas som är en del av glukoneogenesen. Adrenalin verkar likt glukagon men mer på skelettmuskulatur. All hormonell reglering sker genom att hormonet binder till 7TM receptorer på cellmembranet --> ATP--> cAMP --> aktivt/inaktivt PKA beroende på om enzymet behöver fosforyleras eller defosforyleras. AI-rättning: Att insulin/glukagon reglerar både glykolys, glukoneogenes och glykogenmetabolism. Att insulin verkar via defosforylering och glukagon via fosforylering – kopplat till flera enzym, inte bara PFK-2. Att adrenalin har en tydlig roll i muskel.
147 2025-02-01 33 Beskriv två huvudsakliga och principiellt olika sätt, på vilka cellen reglerar mängden fritt intracellulärt kolesterol. (4p) kolesterol Beskriv två huvudsakliga och principiellt olika sätt, på vilka cellen reglerar mängden fritt intracellulärt kolesterol. (4p) 1. Man kan reglera transkriptionen av HMG-CoA reduktas för det är en irreversibel steg i kolesterol syntesen. Om mängden kolesterol ökar så kommer kolesterol binda till scap protein. Denna förhindrar SERBP transkriptionsfaktorn i ER från att transporteras till golgi där den kan binda till en sekvens SRE-1 och transkribera genen för HMG-CoA reduktas. Då kommer mängden HMG-CoA reduktas minska --> mindre kolesterol syntetiseras. Om det är låg kolesterol däremot så kommer insig proteiner vid ER binda till scap så att den inte blockerar SERBP transkriptionsfaktorn från att gå och binda till SRE-1 och starta transkription. 2. Då kolesterol lagras i kolesterolestrat så kommer cellen att bryta loss fettsyran när den har behov för kolesterol. Kolesterolestrarna transporteras först mha lipoproteiner till cellen för att där inne bryta sig loss och bilda fri kolesterol. 3. (extra) Man kan reglerar kolesterol syntes translationellt genom att låta proteiner binda till mRNA under translation för att inhibera den vid höga kolesterolhalter. Kolesterol kan även binda in sig mellan DNA och mRNA för att störa replikation/translation --> inget kolesterol.
148 2025-02-01 24 Hur skiljer sig glykogenets huvudsakliga funktion i levern från dess funktion i skelettmuskulaturen? Vilket enzym är avgörande för denna skillnad och i vilken av vävnaderna uttrycks det? (4p) Max 50 ord. glykogen Hur skiljer sig glykogenets huvudsakliga funktion i levern från dess funktion i skelettmuskulaturen? Vilket enzym är avgörande för denna skillnad och i vilken av vävnaderna uttrycks det? (4p) Max 50 ord. Glykogen i levern används för att upprätthålla stabilt blodsocker. Glykogen i muskler används till ATP eftersom den saknar glukos-6-fosfatas. Glukos bryts som glukos-1-fosfat från glykogen och omvandlas sedan till glukos-6-fosfat(fosfoglukomutas). I levern finns enzymet glukos-6-fosfatas som omvandlar glukos-6-fosfat till glukos men i skelettmuskler metaboliseras glukos-6-fosfat vidare i glykolysen för ATP-produktion.
149 2025-02-01 10 Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: Histon H1 binder linker-DNA och stabiliserar nukleosomen. B: Kromatin består endast av DNA. C: Acetylering av histoner leder till en mer kondenserad kromatinstruktur. D: Kromatin finns endast i eukaryota celler. kromatin Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: Histon H1 binder linker-DNA och stabiliserar nukleosomen. B: Kromatin består endast av DNA. C: Acetylering av histoner leder till en mer kondenserad kromatinstruktur. D: Kromatin finns endast i eukaryota celler. A och D
150 2025-02-01 9 Vilka två påståenden om eukaryot DNA-replikation är korrekta? (2p) A: ORC binder till replikationsorigin under hela cellcykeln. B: DNA-syntes initieras i M-fas. C: CMG-komplexet bildas genom bindning av MCM, GINS och Cdc45. D: MCM-helikaset är aktivt under hela cellcykeln. dna-replikation Vilka två påståenden om eukaryot DNA-replikation är korrekta? (2p) A: ORC binder till replikationsorigin under hela cellcykeln. B: DNA-syntes initieras i M-fas. C: CMG-komplexet bildas genom bindning av MCM, GINS och Cdc45. D: MCM-helikaset är aktivt under hela cellcykeln. A och C
151 2025-02-01 34 Du arbetar som läkare och följer upp hemoglobin (Hb) hos 200 patienter behandlade för järnbrist. Hb följer en normalfördelning med medelvärde 130 g/L och standardavvikelse 10 g/L. Vilka två av följande påståenden är korrekta? (2p) A: Cirka 68% av patienterna har ett Hb mellan 120 och 140 g/L. B: Standardavvikelsen beskriver hur spridda Hb-värdena är kring medelvärdet. C: Cirka 99% av patienterna har ett Hb under 120 g/L. D: Cirka 95% av patienterna har ett Hb mellan 100 och 200 g/L. introduktionslaboration Du arbetar som läkare och följer upp hemoglobin (Hb) hos 200 patienter behandlade för järnbrist. Hb följer en normalfördelning med medelvärde 130 g/L och standardavvikelse 10 g/L. Vilka två av följande påståenden är korrekta? (2p) A: Cirka 68% av patienterna har ett Hb mellan 120 och 140 g/L. B: Standardavvikelsen beskriver hur spridda Hb-värdena är kring medelvärdet. C: Cirka 99% av patienterna har ett Hb under 120 g/L. D: Cirka 95% av patienterna har ett Hb mellan 100 och 200 g/L. A och B
152 2025-02-01 14 Aminoacyl-tRNA synthetases have an activation site and an editing site. Account for their function in translation. (4p) Please answer this question in English. translation Aminoacyl-tRNA synthetases have an activation site and an editing site. Account for their function in translation. (4p) Please answer this question in English. The activation site is where the binding of an aminoacid to the 3´amino acid pocket in tRNA happens. The enzym catalyzes the reaction between these two to create an "esterbindning" between the CCA in tRNA's amino acid seat/pocket to the C in the aminoacid. More specfically, it is adenine that directly binds to the tRNA. The aminoacyl-tRNA is then moved to the editing site where it gets checked that the right aminoacid has bound to the tRNA to see if its anticodons are compatible with the mRNAs codons. Ord: 88 Totalpoäng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen
153 2025-02-01 20 Enzymer har ofta en katalytisk klyfta där den katalyserade reaktionen sker. Redogör för två olika kemiska fördelar med detta. (4p) enzymer Enzymer har ofta en katalytisk klyfta där den katalyserade reaktionen sker. Redogör för två olika kemiska fördelar med detta. (4p) 1. Unik kemisk miljö där den specifika reaktionen som enzymet katalyserar kan ske utan störningar från omgivningen då katalytiska klyftan isoleras från omgivande miljö. Då kan ex hydrofoba molekyler reagera utan att behöver aggregeras eller påverkas av hydrofob effekt. 2. Vatten kan trängas ut så attt den inte stör eller står i väg när substratet kommer och binder till enzymet. 3. (Extra: katalytiska klyftan är specifikt för en substrat)
154 2025-02-01 30 Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Glutamat och serin utgör de två viktigaste transportformerna av kväve från extrahepatiska vävnader till levern. B: Vid nedbrytning av flera olika aminosyror hamnar deras aminogrupper i glutamat, som i sin tur är molekylen som kan avge aminogruppen som ammoniak i levercellernas mitokondrier. C: Rent ketogena aminosyror kan omvandlas till oxaloacetat. D: Vid leverskada ses oftast förhöjda plasmanivåer av två aminotransferaser, alaninaminotransferas och aspartataminotransferas. aminosyrametabolism Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Glutamat och serin utgör de två viktigaste transportformerna av kväve från extrahepatiska vävnader till levern. B: Vid nedbrytning av flera olika aminosyror hamnar deras aminogrupper i glutamat, som i sin tur är molekylen som kan avge aminogruppen som ammoniak i levercellernas mitokondrier. C: Rent ketogena aminosyror kan omvandlas till oxaloacetat. D: Vid leverskada ses oftast förhöjda plasmanivåer av två aminotransferaser, alaninaminotransferas och aspartataminotransferas. B och D
155 2025-02-01 15 Redogör för de två viktigaste principerna som förklarar hur nya egenskaper kan utvecklas i ett evolutionärt sammanhang samt hur de två principerna är beroende av varandra. (4p) evolution Redogör för de två viktigaste principerna som förklarar hur nya egenskaper kan utvecklas i ett evolutionärt sammanhang samt hur de två principerna är beroende av varandra. (4p) De två viktigaste principerna är variation och naturligt urval. I en population förekommer en genetisk variation mellan individerna. Den genetiska variationen beror på mutationer bland annat. Alla individer har inte samma egenskaper och är därför olika anpassade efter miljön som dessa lever i. De individer som är bäst anpassade till miljön kommer ha en större chans att utnyttja resurserna och kunna överleva samt föröka sig och föra vidare sina gynnsamma gener. Detta i sin tur är kallat naturligt urval där miljön "selekterar" de bäst anpassade. Exempel på det är hur giraffens långa hals kan ha uppstått. I en giraffpopulation förekom en genetisk variation med giraffer som hade både korta och långa halser. I en miljö med korta träd kunde båda nyttjas, men i samband med att träden blev allt högre, kunde de som hade långt hals nå upp och utnyttja det. Dessa blev de bäst anpassade och därmed överförde vidare de gynnsamma generna, medan de som hade kort hals kunde inte utnyttja resurserna på samma sätt i just den specifika miljön.
156 2025-02-01 21 Vilka två av nedanstående molekyler innehåller delar från en B-vitamin? (2p) A: Cyt c B: ATP C: CoA D: NADH integrering-av-metabolismen Vilka två av nedanstående molekyler innehåller delar från en B-vitamin? (2p) A: Cyt c B: ATP C: CoA D: NADH C och D
157 2025-02-01 31 Namnge en nukleosid och ange i vilken molekyl merparten av nukleosidens kväveatomer hamnar när den bryts ned. Molekylen utsöndras slutligen med urinen. (2p) Max 10 ord. nukleotidnedbrytning Namnge en nukleosid och ange i vilken molekyl merparten av nukleosidens kväveatomer hamnar när den bryts ned. Molekylen utsöndras slutligen med urinen. (2p) Max 10 ord. Adenosin. Hamnar i Urat
158 2025-02-01 25 I citronsyracykeln deltar fyra dehydrogenaser. A) Vad gör ett dehydrogenas? B) Vilka två av de fyra dehydrogenaserna utför också en annan gemensam reaktion? C) Vilken är den andra gemensamma reaktionen? (4p) Max 30 ord. citronsyracykeln I citronsyracykeln deltar fyra dehydrogenaser. A) Vad gör ett dehydrogenas? B) Vilka två av de fyra dehydrogenaserna utför också en annan gemensam reaktion? C) Vilken är den andra gemensamma reaktionen? (4p) Max 30 ord. a) Tar bort väte b) Isocitratdehydrogenas och alfa-ketoglutaratdehydrogenas c) Dekarboxylering; frigör CO₂
159 2025-02-01 11 Telomeras är ett enzym som spelar en viktig roll i bevarandet av kromosomernas integritet under DNA-replikation. Vad gör telomeras, och varför är det viktigt för celler som delar sig ofta, som stamceller och könsceller? (4p) dna-replikation Telomeras är ett enzym som spelar en viktig roll i bevarandet av kromosomernas integritet under DNA-replikation. Vad gör telomeras, och varför är det viktigt för celler som delar sig ofta, som stamceller och könsceller? (4p) Vid replikation av DNA har vi en ledande sträng som syntetiseras kontinuerligt, och en lagging sträng som syntetiseras i olika fragment kallade Okazakifragment. Då replikationen sker i 5'- till 3'-riktning, måste Okazakifragmenten ha olika RNA-primers som de startar vid. Just här uppstår ett problem, då vi inte kan lägga till primers på ändarna, så lagging strand kommer inte kunna syntetisera där. I normala fall leder detta till att DNA förkortas efter varje replikation. Men i celler som stamceller och cancerceller kommer telomeraset att ha med sig en egen RNA-mall och utför omvänd transkriptas, det vill säga att göra RNA till DNA. Så telomeraset kommer att förlänga ändarna med en repeterande sekvens. Det som händer då är att vid nästa replikation kommer DNA att förkortas vid de sekvenserna som lades till av telomeraset, men ingen viktig information kommer att tas bort. Detta utnyttjas av stamceller och cancerceller för att cellerna ska kunna dela sig utan att dö eller tappa viktiga gener.
160 2025-02-01 8 Nukleotider är de byggstenar som bygger upp både DNA och RNA. Vilken kemisk grupp finns i 2'-position hos ribonukleotider, och hur skiljer sig denna från deoxyribonukleotider? (4p) nukleotider Nukleotider är de byggstenar som bygger upp både DNA och RNA. Vilken kemisk grupp finns i 2'-position hos ribonukleotider, och hur skiljer sig denna från deoxyribonukleotider? (4p) Hos ribonukleotider finns en OH-grupp i 2´positioinen medan det i DNA finns H. Detta beror på att enzymet ribonukleotidreduktas ersätter OH gruppen i RNA med H för att omvandla ribos till deoxyribos. RNA: Ribos har OH på kol nr 2. DNA: Deoxyribos har H på kol nr 2.
161 2025-02-01 35 Explain how gel electrophoresis can be used to analyze different conformations of plasmid DNA. Discuss how the migration patterns of these conformations differ and how comparing them with the ladder (marker) helps interpreting the gel results and understand the structure of the plasmid DNA. (4p) Max 150 words. Answer in English. plasmid Explain how gel electrophoresis can be used to analyze different conformations of plasmid DNA. Discuss how the migration patterns of these conformations differ and how comparing them with the ladder (marker) helps interpreting the gel results and understand the structure of the plasmid DNA. (4p) Max 150 words. Answer in English. The electrophoresis has two differently charged ends, one positive and one negative. The plasmids get injected into the gel electrophoresis in a well from the negatively charged end. When we then give it a current, the plasmids will travel to the positive end (because DNA is negative). The bigger the plasmid is, the further it will travel, because it has more negative charges than a small one. Supercoiled and circular DNA will meet different amount of friction, since they have different forms, which will result in one traveling further than the other even though they have the same size. The marker will help identify how many base pairs the plasmid have. But if we analyze two of the same plasmids and they travel different distances, then it means that they have different conformations where one is supercoiled and the other is circular. The circular meets more friction.
162 2025-02-01 3 Ange två likheter och två skillnader mellan en alfahelix och en hårnålsböj (reverse turn). (4p) Max 50 ord. från-aminosyror-till-proteiner Ange två likheter och två skillnader mellan en alfahelix och en hårnålsböj (reverse turn). (4p) Max 50 ord. Alfahelixar har vätebindningar mellan var fjärde aminosyra, medan hårnålsböj har mellan var tredje. Båda är en typ av primärstruktur. Alfahelixar är ofta högervridna.
163 2025-02-01 7 Glukos lagras hos människan i form av glykogen. Hos växter lagras glukos som stärkelse. Beskriv skillnader och likheter mellan glykogen och stärkelse. (4p) glykogen Glukos lagras hos människan i form av glykogen. Hos växter lagras glukos som stärkelse. Beskriv skillnader och likheter mellan glykogen och stärkelse. (4p) Elev 1 - 3 av 4 poäng: Båda är långa kedjor av kolhydrater. Skillnaden är dock att glykogen består av förgrenade kedjor där vi har 1,4-glykosidbindningar mellan linjära delar, och 1,6-glykosidbindningar mellan förgreningar. Stärkelse är en enda linjär kedja som inte förgrenas. Elev 2 - 3 av 4 poäng Stärkelse i växter bildas av fotosyntes, utav koldioxid och vatten där solenergin utnyttjas för att skapa bindningar mellan dessa molekyler, då får vi bl.a glukos. Det glukos som tillverkas i växter av fotosyntes är samma glukos vi äter och bryter dess bindningar för energi. Att glukos lagras som glykogen hos oss är för att glukos är för osmotiskt aktiv för att lagras som den är. Men stärkelse lagras inte för växternas skull, utan det är ett sätt att omvandla koldioxid som vi andas ut till syrgas, annars skulle syrgas i atmosfären ha tagit slut. AI-rättning: Kort sammanfattning av vad som typiskt ger full poäng: Likhet: båda består av α-D-glukos. Likhet: båda använder α-1,4- och α-1,6-bindningar. Skillnad: stärkelse = amylose (linjär) + amylopektin (lätt förgrenad). Skillnad: glykogen = mycket mer förgrenat.
164 2025-02-01 6 Du gör forskar-ST inom infektionsmedicin och studerar hur Helicobacter pylori binder till glykolipider. Du ritar upp en glykolipid i cellmembranet och markerar hur den del som sitter på utsidan är den bakterierna binder till. Principiell struktur räcker. (4p) cellmembran Du gör forskar-ST inom infektionsmedicin och studerar hur Helicobacter pylori binder till glykolipider. Du ritar upp en glykolipid i cellmembranet och markerar hur den del som sitter på utsidan är den bakterierna binder till. Principiell struktur räcker. (4p) . Ritning: På ritningen (sida 11) visas ett cellmembran med glykolipider: hydrofila huvuden utåt, hydofoba fettsyrasvansar i membranet och en kolhydrat kopplad via glycerol (kommentar: ”kan också vara sfingosin”). Lärarens kommentar: Det absolut vanligaste är att glykolipider har sfingosin som bas och inte glycerol, och när man säger glykolipid utan att specificera mer så menar man nästan alltid de med sfingosin som bas. Ord (textsvar): 1
165 2025-02-01 2 Vilka två av nedanstående påstående stämmer för proteinveckning? (2p) A: Den är reversibel. B: Det är en ofördelaktig process. C: Den börjar på lokal nivå. D: En aminosyrasekvens veckas alltid till samma struktur. från-aminosyror-till-proteiner Vilka två av nedanstående påstående stämmer för proteinveckning? (2p) A: Den är reversibel. B: Det är en ofördelaktig process. C: Den börjar på lokal nivå. D: En aminosyrasekvens veckas alltid till samma struktur. A och C
166 2024-08-01 28 Vad får det för konsekvens när NADH som bildats i glykolysen transporteras till mitokondriens matrix med glycerol 3-fosfatshunten istället för med malat-aspartatshunten? (2p) (Max 30 ord) elektrontransportkedjan Vad får det för konsekvens när NADH som bildats i glykolysen transporteras till mitokondriens matrix med glycerol 3-fosfatshunten istället för med malat-aspartatshunten? (2p) (Max 30 ord) 0 poäng: Konsekvensen blir att vi kommer behöva förbruka en atp för att glycerol 3 fosfat ska kunna bildas. Det kräver mer energi AI-svar: När elektroner från cytosoliskt NADH går via glycerol-3-fosfatshunten i stället för malat–aspartatshunten blir konsekvensen: → Färre ATP per NADH. Glycerol-3-fosfatshunten överför elektroner till FAD i mitokondriens inre membran → FADH₂ → komplex II → ger ~1,5 ATP. Malat–aspartatshunten överför elektroner direkt till mitokondriellt NAD⁺ → NADH → komplex I → ger ~2,5 ATP. Konsekvens: lägre ATP-utbyte från glykolysen när glycerol-3-fosfatshunten används.
167 2024-08-01 5 Du är läkare och handleder en läkarstudent som är stressad över sin biokemitenta. Läkarstudenten kommer inte ihåg membranlipiderna så bra och undrar om du kan hjälpa till att förklara, vilket du gör genom att: A) Rita den principiella strukturen för den vanligaste membranlipiden. B) Markera i bilden som du har ritat den del som är polär, samt den del som är hydrofob. (4p) ![[Pasted image 20251129235536.png]] cellmembran Du är läkare och handleder en läkarstudent som är stressad över sin biokemitenta. Läkarstudenten kommer inte ihåg membranlipiderna så bra och undrar om du kan hjälpa till att förklara, vilket du gör genom att: A) Rita den principiella strukturen för den vanligaste membranlipiden. B) Markera i bilden som du har ritat den del som är polär, samt den del som är hydrofob. (4p) ![[Pasted image 20251129235536.png]] Svar på ritpapper: fosfolipid med alkohol + fosfat (polär del) kopplad till glycerol och två fettsyrasvansar (hydrofob del).
168 2024-08-01 18 Kemiska reaktioner i vätskor och gaser sker snabbare när temperaturen höjs. Hur kan det förklaras? (4p) (Max 150 ord.) termodynamik Kemiska reaktioner i vätskor och gaser sker snabbare när temperaturen höjs. Hur kan det förklaras? (4p) (Max 150 ord.) Det går snabbare därför att en ökning i värmeenergi kommer omvandlas till en ökning i rörelseenergin (termodynamikens första lag, energi kan inte skapas eller förstöras men det kan omvandlas). När vi höjer rörelseenergi kommer detta innebära att varje partikel befinner sig på en högre energinivå än vad den var innan. Detta ökar både chansen för att två partiklar med rätt konformation krockar med varandra, men också att de krockar med varandra med tillräckligt mycket energi för att kunna nå övergångstillståndet och således reagera.
169 2024-08-01 1 I glykolysens första steg binder glukos till en klyfta i enzymet som utför reaktionen från vilken vatten stängs ute. Förklara vilka egenskaper de aminosyror behöver ha som binder till glukos och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 60 ord.) glukosmetabolism I glykolysens första steg binder glukos till en klyfta i enzymet som utför reaktionen från vilken vatten stängs ute. Förklara vilka egenskaper de aminosyror behöver ha som binder till glukos och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 60 ord.) Glukos är en vattenlöslig molekyl - den är polär. De som binder till glukos behöver då också vara polära och vattenlösliga. två aminosyror som har dessa egenskaper är serin och treonin. Det som utmärker dessa är att de är alkoholer - så de binder gärna till glukos via sina OH-grupper.
170 2024-08-01 19 Enzymet A som omvandlar S till P har ett Km på 10 µM och ett Vmax på 100 nmol/s. Enzymet B som omvandlar S till Q har ett Km på 1 mM och ett Vmax på 200 nmol/s. Lika mängder av A och B blandas med 100 µM S i ett och samma kärl. Vad kommer man att ha mest av när reaktionerna är klara - P eller Q? Motivera ditt svar. (4p) (Max 150 ord.) enzymer Enzymet A som omvandlar S till P har ett Km på 10 µM och ett Vmax på 100 nmol/s. Enzymet B som omvandlar S till Q har ett Km på 1 mM och ett Vmax på 200 nmol/s. Lika mängder av A och B blandas med 100 µM S i ett och samma kärl. Vad kommer man att ha mest av när reaktionerna är klara - P eller Q? Motivera ditt svar. (4p) (Max 150 ord.) 1 av 4: Km = ([E]+[S])/[ES] och Vmax = K + Etot k2=turnover number Med hjälp av formlerna ovan har jag kunnat dra slutsatsen att Enzym A har både en mindre kapacitet för att forma enzym-substrat komplex och har även en lägre turnover number än vad Enzym B har. Denna slutsats drar jag då enzym A har ett större Km värde än vad Enzym B har, vilket innebär att [ES] är mindre hos Enzym A än Enzym B enligt michealis mentes kinetiken. Enzym A har alltså lägre affinitet för sitt substrat än Enzym B Vmax är också lägre hos enzymA än vad den är hos enxym B, detta beror på turnover number som är det värde som talar om hur bra ett enzym bildar produkt. Enzym A måste ha ett lägre turnover-number än enzym B då dess Vmax är lägre. Enzym B har alltså både större [ES] och bildar produkt bättre(K )->Q kommer bildas.
171 2024-08-01 29 Vilka två av nedanstående komponenter deltar i elektrontransportkedjan? (2p) A: Cu2+ B: Coenzym A C: Mn2+ D: Fe-S-kluster elektrontransportkedjan Vilka två av nedanstående komponenter deltar i elektrontransportkedjan? (2p) A: Cu2+ B: Coenzym A C: Mn2+ D: Fe-S-kluster A och D
172 2024-08-01 4 Du jobbar på labb över sommaren och du har fått i uppgift att utföra en ELISA för att undersöka om en patient har HIV. Beskriv vilken typ av ELISA som skall utföras, vilka steg som utförs och ange vilken substans hos patienten som undersöks med metoden. (4p). (Max 200 ord.) utforska-proteiner Du jobbar på labb över sommaren och du har fått i uppgift att utföra en ELISA för att undersöka om en patient har HIV. Beskriv vilken typ av ELISA som skall utföras, vilka steg som utförs och ange vilken substans hos patienten som undersöks med metoden. (4p). (Max 200 ord.) För att undersöka om en patient har HIV så vill man kolla ifall den har antikroppar för det. Då använder man sig av indirekt ELIZA samt ett prov innehållande patientens plasma-komponenter - då det är där antikropparna finns. Vid indirekt ELIZA kommer det i en behållare finnas antigener bundna till botten, dessa ska ha en epitop som HIV-antikroppen känner igen. Man kommer tillsätta ett prov innehållande patientens plasma-komponenter till behållaren. HIV-antikropparna kommer binda till antigenerna och sedan kommer provet att sköljas. efter sköjlning kommer man tillsätta en substans innehållande enzymlänkade antikroppar som kommer binda till HIV-antikropparna. Efter dessa har fått tid att binda sköljer man provet en gång till. sedan så tillsätter man en annan substans som innehåller ett substrat som enzymerna binder. Detta substrat kommer orsaka ett färgskifte om det finns HIV-antikroppar i provet, om det inte finns hiv-antikroppar blir det inget färgskifte och man vet att patienten inte har HIV. det är viktigt att man sköljer ordentligt mellan stegen, annars kan det uppstå en falsk positiv, detta då antikropparna ju skulle finnas kvar i provet, som då de enzymbundna antikropparna kan binda till, som då kommer ge färgskifte vid tillsatts av substrat.
173 2024-08-01 16 Vilka två av nedanstående proteiner utför aktiv transport? A: Aquaporiner B: ABC-transportörer C: Adeninnukleotidtranslokas D: GLUT4 (2p) transport-över-cellmembran Vilka två av nedanstående proteiner utför aktiv transport? A: Aquaporiner B: ABC-transportörer C: Adeninnukleotidtranslokas D: GLUT4 (2p) B och C
174 2024-08-01 22 A) Förklara vad som menas med feedbackreglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras med feedbackreglering och ange vad det är som ger feedbackregleringen. (4p) (50 ord) glykolysen A) Förklara vad som menas med feedbackreglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras med feedbackreglering och ange vad det är som ger feedbackregleringen. (4p) (50 ord) A) Feedback reglering är att en produkt som bildas kommer reglera aktiviteten hos ett enzym som katalyserar en reaktion som sker innan den reglerande produkten har bildats. B) Hexokinas katalyserar reaktionen Glukos + ATP -> glukos-6-fosfat + ADP, den feedbackinhiberas av sin egen produkt, glukos-6-fosfat.
175 2024-08-01 32 Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? (2p) A: En funktionell pentosfosfatväg är viktig för att celler skall kunna upprätthålla ett fullgott skydd mot skadliga reaktiva syreföreningar (ROS). B: Glykolysintermediärerna glukos-6-fosfat och glyceraldehyd-3-fosfat är slutprodukterna som bildas i pentosfosfatvägens icke-oxidativa fas. C: En väldigt viktig uppgift för pentosfosfatvägen är att bilda NADPH och ribos-5-fosfat. D: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla och det är cellens behov som styr riktningen av reaktionerna. pentosfosfatvägen Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? (2p) A: En funktionell pentosfosfatväg är viktig för att celler skall kunna upprätthålla ett fullgott skydd mot skadliga reaktiva syreföreningar (ROS). B: Glykolysintermediärerna glukos-6-fosfat och glyceraldehyd-3-fosfat är slutprodukterna som bildas i pentosfosfatvägens icke-oxidativa fas. C: En väldigt viktig uppgift för pentosfosfatvägen är att bilda NADPH och ribos-5-fosfat. D: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla och det är cellens behov som styr riktningen av reaktionerna. A och C
176 2024-08-01 26 Kan citronsyracykeln gå åt vilket håll som helst? Motivera svaret. (4p) (Max 75 ord) citronsyracykeln Kan citronsyracykeln gå åt vilket håll som helst? Motivera svaret. (4p) (Max 75 ord) Jag förstår inte helt frågan som ställs, CSC kan inte gå bakåt i cykeln då vi har två reglerande steg då koldioxid avges. Isocitratdehdyrogenas och alfaketoglutaratdehydrogenas är reglerade dels av sina produkter men även av energikvoten, dessa kan inte gå bakåt hur som helst. Då det är en cykel kan vi dock återbilda en produkt genom att låta cykeln fortgå efter oxalacetat har bildats tills vi får den produkten som vi ville återbilda.
177 2024-08-01 12 Vid prokaryot transkription spelar sigma-faktorn en avgörande roll. Vilka två påståenden om sigma-faktorn stämmer? (2p) A: Sigma-faktorn gör så att bakteriellt RNA-polymeras binder starkare till alla typer av DNA. B: En bakterie innehåller ofta flera typer av sigma-faktorer. C: Sigma-faktorn styr bakteriellt RNA-polymeras till promotorn. D: Sigma-faktorn gör RNA-polymeraset mer processivt. kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Vid prokaryot transkription spelar sigma-faktorn en avgörande roll. Vilka två påståenden om sigma-faktorn stämmer? (2p) A: Sigma-faktorn gör så att bakteriellt RNA-polymeras binder starkare till alla typer av DNA. B: En bakterie innehåller ofta flera typer av sigma-faktorer. C: Sigma-faktorn styr bakteriellt RNA-polymeras till promotorn. D: Sigma-faktorn gör RNA-polymeraset mer processivt. B och C
178 2024-08-01 27 Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter / vägar: fosfofruktokinas 1 fosfoglyceratkinas fumaras laktatdehydrogenas citronsyracykeln Coricykeln glykolysen glukoneogenes glukoneogenes Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter / vägar: fosfofruktokinas 1 fosfoglyceratkinas fumaras laktatdehydrogenas citronsyracykeln Coricykeln glykolysen glukoneogenes fosfofruktokinas 1: glykoneogenesen fosfoglyceratkinas: glykolysen fumaras: citronsyracykeln laktatdehydrogenas: Coricykeln
179 2024-08-01 13 Hur sker matchningen mellan den kodande sekvensen på mRNA och antikodonsekvensen på tRNA? Beskriv var i ribosomer som denna matchning sker under translationen. (4p) (Max 150 ord.) translation Hur sker matchningen mellan den kodande sekvensen på mRNA och antikodonsekvensen på tRNA? Beskriv var i ribosomer som denna matchning sker under translationen. (4p) (Max 150 ord.) 3 av 4: Ribosomen består av en liten subenhet - 30S och en stor subenhetet 50S. den stora subenheten kommer sköta matchningen av kodon till antikodon och den lilla kommer hålla i mRNA strängen. Matchningen mellan den kodande sekvensen på mRNA och antikodonssekvensen på tRNA sker på Aminoadenyl siten (A-site) i ribosomen. En aminosyra-laddad tRNA kommer att vandra in i A-siten på en riboosom. Där kommer antikodonerna matchas med kodonerna och vätebindingar kommer bildas mellan dem. Om dessa har matchat rätt kommer elongation factors göra att tRNA släpper ifrån och fortsätter till peptidyl-site och sedan ut via exit-site i ribosomen.
180 2024-08-01 17 Rangordna molekylerna etanol, fruktos, leucin och koldioxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den som har lättast att passera. (2p) Lättast → Svårast: Etanol Fruktos Koldioxid Leucin transport-över-cellmembran Rangordna molekylerna etanol, fruktos, leucin och koldioxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den som har lättast att passera. (2p) Lättast → Svårast: Etanol Fruktos Koldioxid Leucin 1. Koldioxid 2. Etanol 3. Fruktos 4. Leucin
181 2024-08-01 23 Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Aminosyrorna isoleucin och leucin är glukogena. B: Kol reduceras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat. D: Glukoneogenes sker framför allt när insulinnivån är hög. glukoneogenes Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Aminosyrorna isoleucin och leucin är glukogena. B: Kol reduceras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat. D: Glukoneogenes sker framför allt när insulinnivån är hög. B och C
182 2024-08-01 33 Beskriv kortfattat vad det enterohepatiska kretsloppet är och förklara dess koppling till kolesterolsyntes. (4p) kolesterol Beskriv kortfattat vad det enterohepatiska kretsloppet är och förklara dess koppling till kolesterolsyntes. (4p) 2 av 4: Nedbruten kolesterol kommer att utsöndras med gallsyror, därför är det viktigt att vi har gallsyror så att vi inte får en ackumulering av kolesterol. Enterohepatiska kretsloppet är att vi har en 95-procentig reabsorption av gallsyror i hepatocyterna - vilket gör att vi ständigt har galla. AI: Det enterohepatiska kretsloppet innebär att gallsyror som bildats från kolesterol i levern utsöndras till tarmen och därefter till största delen återabsorberas i ileum och förs tillbaka till levern via portavenen. Detta sparar kolesterol, eftersom färre nya gallsyror behöver syntetiseras. Om återcirkulationen minskar måste levern istället öka sin kolesterolsyntes och uppreglera LDL-receptorer för att få mer kolesterol till ny gallsyrabildning.
183 2024-08-01 24 A) Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar och varför sker detta? B) Vilka är de tre ketonkropparna som bildas? (4p) betaoxidation A) Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar och varför sker detta? B) Vilka är de tre ketonkropparna som bildas? (4p) 1 av 4: a) bildningen av ketonkroppar sker vid svält. Vid svält kommer glukosreserverna att ha brutits ned och vi kommer gå över till att bryta ner våra fettreserver. Då kommer det bildas ketonkroppar och detta är ffa för att förse hjärnan med energi, då den inte längre kan få det från glukos. b) acyl-CoA, acetoacyl-CoA och aceton.
184 2024-08-01 10 Vilka två påståenden stämmer om RNA processning? (2p) A: En lariatstruktur bildas som restprodukt vid splicing av mRNA B: mRNA har en polyA-svans som bildas i cytoplasman. C: 5’-cap hämmar translation. D: Introner bevaras i moget mRNA. rna-syntes Vilka två påståenden stämmer om RNA processning? (2p) A: En lariatstruktur bildas som restprodukt vid splicing av mRNA B: mRNA har en polyA-svans som bildas i cytoplasman. C: 5’-cap hämmar translation. D: Introner bevaras i moget mRNA. A och B
185 2024-08-01 9 A) Vad är skillnaden mellan exo- och endonukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för CMP. (4p) dna-replikation A) Vad är skillnaden mellan exo- och endonukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för CMP. (4p) a) exonukleaser kommer att bryta fosfodiesterbindingar på änden av en DNA- kedja medan endonukelaser kommer bryta en fosfodiesterbindning någonstans i mitten av DNA-kedjan. b) cytidinmonofosfat.
186 2024-08-01 34 Vilka två faropiktogram visas i bild nedan? ![[Pasted image 20251129235602.png]] A: Oxiderande B: Brandfarlig C: Skadlig D: Giftig (2p) introduktionslaboration Vilka två faropiktogram visas i bild nedan? ![[Pasted image 20251129235602.png]] A: Oxiderande B: Brandfarlig C: Skadlig D: Giftig (2p) A & C
187 2024-08-01 14 Beskriv kortfattat hur den första eukaryota cellen bildades. (4p) (Max 150 ord.) evolution Beskriv kortfattat hur den första eukaryota cellen bildades. (4p) (Max 150 ord.) Den första eukaryota cellen bildades tack vare endosymbios. Med endosymbios menas att två bakterier har gått ihop och har haft ett utbyte mellan varandra som gynnar båda. Detta sker genom att en mindre bakterie vandrar in i en större bakterie med en egenskap som gynnar överlevnaden hos både sig själv och den större bakterien. Tillslut kommer den större bakterien att ta över vissa processer som den lilla gör genom att den lilla bakteriens DNA överförs till den större bakterien - på så sätt får vi en cell med flera organeller. Exempel: mitokondrien mitokondrien - som var en aerob bakterie, vandrade en gång in i en anaerob, större cell. den gav energi i form av ATP och den större anaeroba cellen gav den näring. tillslut överfördes DNA från den aeroba bakterien till den anaeroba cellen - på så sätt kunde cellen börja styra vissa processer och vi fick en cellandande cell.
188 2024-08-01 20 Vilka två av nedanstående påståenden om enzymer är korrekta? (2p) A: Enzymer förändrar den fria energin i en reaktion. B: Enzymernas tredimensionella form är nyckeln till deras funktion. C: Enzymer påskyndar reaktioner genom att sänka aktiveringsenergin. D: Enzymer är alltid proteiner. enzymer Vilka två av nedanstående påståenden om enzymer är korrekta? (2p) A: Enzymer förändrar den fria energin i en reaktion. B: Enzymernas tredimensionella form är nyckeln till deras funktion. C: Enzymer påskyndar reaktioner genom att sänka aktiveringsenergin. D: Enzymer är alltid proteiner. B och C
189 2024-08-01 30 Alanin kan bildas i en så kallad transamineringsreaktion med hjälp av ett kliniskt viktigt enzym. Ange det fullständiga namnet på enzymet, samt beskriv reaktionen som enzymet katalyserar med en reaktionsformel. (4p) (Max 20 ord.) aminosyrametabolism Alanin kan bildas i en så kallad transamineringsreaktion med hjälp av ett kliniskt viktigt enzym. Ange det fullständiga namnet på enzymet, samt beskriv reaktionen som enzymet katalyserar med en reaktionsformel. (4p) (Max 20 ord.) 3 av 4: Alanin-aminotransferas pyruvat + glutamat -> alanin + alfa-ketoglutarat
190 2024-08-01 15 Ange två typer av celladhesionsmolekyler och beskriv kortfattat deras funktion. (4p) cellmembran Ange två typer av celladhesionsmolekyler och beskriv kortfattat deras funktion. (4p) integriner - förankrar cellen med ECM. Detta gör de genom att binda till cytoskelettet som aktinfilament och sedan binda till ECM komponenter såsom fibrinogen samt kollagen. cadheriner - finns i desmosomer och adherensjunctions, de förankrar cellerna i varandra. Detta gör de genom att binda till andra cedheriner med homophilic bindings samt till cytoskelletet, på så sätt binder de ihop cellerna.
191 2024-08-01 21 Ange vad som används som cellens energivaluta och förklara vad som gör molekylen lämplig för ändamålet. (4p) (Max 100 ord). introduktion-till-metabolismen Ange vad som används som cellens energivaluta och förklara vad som gör molekylen lämplig för ändamålet. (4p) (Max 100 ord). Det som används som cellens energivaluta är ATP. Det som gör ATP lämplig är att den innehåller tre stycken fosfatgrupper som binder till varandra med fosfoanhybridbindniningar. Fosfoanhybridbindingen är instabil och kräver energi för att hållas ihop då det är en repulsion mellan fosfatgrupperna. Då en fosfat spjälkas av så kommer det att frisättas energi genom att repulsionen minskar, dessutom uppstår resonans mellan de två övriga fosfatgrupperna som gör dem stabilare - mer energi avges. Energin som avges kan då gå till andra energikrävadne processer ex. bilda gradienter och makromolekyler.
192 2024-08-01 31 Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? (2p) A: Gikt är en sjukdom orsakad av förhöjda plasmakoncentrationer av urea. B: Sockerstrukturerna i både purin- och pyrimidin-nukleotider spjälkas loss från kvävebaserna via fosforolys. C: UMP och CMP är purin-nukleotider. D: Då purin-nukleotider bryts ned kommer merparten av purinbasernas kväveatomer slutligen hamna i urat, men en mindre andel av basernas kväveatomer hamnar slutligen i urea. nukleotidnedbrytning Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? (2p) A: Gikt är en sjukdom orsakad av förhöjda plasmakoncentrationer av urea. B: Sockerstrukturerna i både purin- och pyrimidin-nukleotider spjälkas loss från kvävebaserna via fosforolys. C: UMP och CMP är purin-nukleotider. D: Då purin-nukleotider bryts ned kommer merparten av purinbasernas kväveatomer slutligen hamna i urat, men en mindre andel av basernas kväveatomer hamnar slutligen i urea. B och D
193 2024-08-01 25 För att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel, det vill säga börja bilda en glykogenpartikel "från början", så behövs en så kallad glykogen-primer, dvs en kort sträcka linjärt glykogen. Hur bildas denna primer, och varför måste strukturen bildas för att glykogenpartikeln sedan skall kunna byggas upp? (4p) (Max 50 ord.) glykogen För att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel, det vill säga börja bilda en glykogenpartikel "från början", så behövs en så kallad glykogen-primer, dvs en kort sträcka linjärt glykogen. Hur bildas denna primer, och varför måste strukturen bildas för att glykogenpartikeln sedan skall kunna byggas upp? (4p) (Max 50 ord.) Glykogenin kommer att autokatalysera bildningen av en glykogenprimer genom att sätta på den aktiva formen av glukos (UDP-glukos) på sin tyrosins OH-grupp. Sedan forsätter den att binda ca. 10-20 glukosenheter innan glykogensyntas tar över. Glykogensyntas kan bara bilda alfa-1,4-bindningar om det finns en kedja att koppa dem till.
194 2024-08-01 11 Var sitter histon H1 och vilken roll spelar denna faktor? (4p) kromatin Var sitter histon H1 och vilken roll spelar denna faktor? (4p) H1 sitter på den yttre regionen av en nukleosom. Dess uppgift är att stabilisera nukleosomen genom att binda till/över DNA:t som är virat kring histonbunten och se till att DNAt förankras med histonerna. Utan H1 hade dnat främst hållts kvar av H3 och H4s positivt laddade N-terminaler som binder till den negativt laddade DNA strängen. Detta hade inneburit att så fort dessa histoner hade genomgått acetylering eller metylering så hade nukleosomen varit väldigt instabil.
195 2024-08-01 8 Vilka två påståenden om DNA-replikation stämmer? (2p) A: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. B: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. C: Topoisomeraser kan ta bort supercoils. D: DNA replikation sker alltid i 3´ till 5´-riktning. dna-replikation Vilka två påståenden om DNA-replikation stämmer? (2p) A: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. B: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. C: Topoisomeraser kan ta bort supercoils. D: DNA replikation sker alltid i 3´ till 5´-riktning. (svar angivet i flervalsformulär)
196 2024-08-01 35 A gene of interest was amplified and verified using the blue/white screening method. The plasmids from two bacterial colonies, one blue colony and one white colony, were purified. Then restriction enzyme digestion was performed, and the samples were run on a gel as follows: white uncut, white cut, blue uncut, blue cut (see figure below). After imaging the gel, we can conclude that while there is plasmid DNA in all samples, the white sample was probably mixed with the blue sample. Explain what finding in the gel indicates the white sample was probably mixed with the blue sample by referring to the size/number of bands. Account for the other source of error for this outcome besides pipette tip contamination from sample to sample. (4p) (Max 200 words) OBS! This question needs to be answered in English. ![[Pasted image 20251129235633.png]] plasmid A gene of interest was amplified and verified using the blue/white screening method. The plasmids from two bacterial colonies, one blue colony and one white colony, were purified. Then restriction enzyme digestion was performed, and the samples were run on a gel as follows: white uncut, white cut, blue uncut, blue cut (see figure below). After imaging the gel, we can conclude that while there is plasmid DNA in all samples, the white sample was probably mixed with the blue sample. Explain what finding in the gel indicates the white sample was probably mixed with the blue sample by referring to the size/number of bands. Account for the other source of error for this outcome besides pipette tip contamination from sample to sample. (4p) (Max 200 words) OBS! This question needs to be answered in English. ![[Pasted image 20251129235633.png]] the findings in the gel that indicate that the samples were mixed are the lines in the white uncut sample. It has two visible bands, with one lining up quite nicely with the blue uncut bands in size. If the plasmid is uncut, than there shouldn't be two distinct bands because the sample only consists of an uncut product. The white uncut should also have a larger amount of base pairs than the blue uncut because we have transformed a gene of interest into it, but they seem to have the same amount. a source of error for this outcome could be that the colony picked for the white cut may have been close to a blue colony - causing a small amount of the blue colony to be accidentaly picked.
197 2024-08-01 3 How does fetal hemoglobin (HbF) differ from adult hemoglobin (HbA) and what effect does this have? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words). hemoglobin How does fetal hemoglobin (HbF) differ from adult hemoglobin (HbA) and what effect does this have? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words). 3 av 4: Adult hemoglobin consists of two beta subunits and two alfa subunits, while fetal hemoglobin consists of two alfa subunits and two gamma subunits. HbA has a lower affinity for oxygen than HbF. Beta subunits allow for the allosteric regulator 2,3-BPG to bind. when 2,3-bpg binds it enhances T-state because it becomes a type of blockage for the conformational change to R-state, meaning that the affinity for oxygen is lowered. 2,3-BPG cannot bind to the gamma subunits - meaning that the affinity for oxygen increases.
198 2024-08-01 7 A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Hur ser denna faktor ut? (4p) dna-replikation A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Hur ser denna faktor ut? (4p) a) PCNA, eller en sliding clamp, ökar DNA-polymerasets processivitet, den kan öka hastigheten med upp till 50x. Den fungerar på det sättet att den håller i DNA strängen så att dna-polymeraset lätt kan glida fram b) Den ser ungefär ut som en ring som omringar leading/lagging strand.
199 2024-08-01 6 Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och glykolipider. (4p) cellmembran Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och glykolipider. (4p) 3 av 4: glykoproteiner är glykosylerade proteiner, dessa består alltså av ett protein med "barr" av kolhydrater. de kan vara o-länkade, via serin och treonins OH-grupp, eller så kan de vara n-länkade via aspargin. Glykoproteiner bygger upp extra- cellulär-matrix och finns i ledvätska, brosk, ögat mm. likt glykoproteiner är glykolipider glykosylerade, men de består av sfingosin + en fettsyra + en sackarid/flera sackarider. Denna finns i outer leaflet i cellmembran och bl.a. bygger upp glykokalyx som är på cellen och inte i ECM. Dessa har som en "svans" med sackarider medan glykoproteiners kolhydrater är mer som ovannämnt, "barr" som kan finnas över hela proteinet.
200 2024-08-01 2 Stamceller behöver skyddas från det åldrande som drabbar andra celler. En sak som skyddar dem är ökat uttryck av chaperoniner. Förklara hur det kan skydda mot något som är skadligt för celler. (4p) (Max 60 ord.) från-aminosyror-till-proteiner Stamceller behöver skyddas från det åldrande som drabbar andra celler. En sak som skyddar dem är ökat uttryck av chaperoniner. Förklara hur det kan skydda mot något som är skadligt för celler. (4p) (Max 60 ord.) chaperoniner - som hsp60 har två stycken ringstrukturer och en hålighet. I håligheten erbjuds en isolerad plats för proteiner att vecka sig genom att proteinet går in i håligheten och ett lock rekryteras - den veckas "som vanligt" oavsett hur miljön utanför. utan detta skulle prioner kunna bildas - vilka kan infektera andra proteiner att veckas fel, vilket skadar cellen.
201 28
202 5
203 18
204 1
205 19
206 29
207 4
208 16
209 22
210 32
211 26
212 12
213 27
214 13
215 17
216 23
217 33
218 24
219 10
220 9
221 34
222 14
223 20
224 30
225 15
226 21
227 31
228 25
229 11
230 8
231 35
232 3
233 7
234 6
235 2
236 2021-12-16 28 ALAT är ett kliniskt mycket viktigt enzym. Beskriv reaktionen enzymet katalyserar samt vad en ökad plasmakoncentration av enzymet vanligen indikerar. aminosyrametabolism ALAT är ett kliniskt mycket viktigt enzym. Beskriv reaktionen enzymet katalyserar samt vad en ökad plasmakoncentration av enzymet vanligen indikerar. ALAT – alaninaminotransferas. Enzymet utför en transaminering – glutamat slås ihop med pyruvat – aminogruppen från glutamat överförs till pyruvat – pyruvat blir då alanin och glutamat alfaketoglutarat. ALAT kan även genomföra omvänd reaktion. ALAT är vanligtvis ett intracellulärt enzym, om man uppmäter en hög koncentration av detta antyder det på att det läckt ut ur cellerna. Detta indikerar därav på vävnadsskada. ALAT finns i hög utsträckning i levern. Därför kan man se höga koncentrationer av ALAT i plasma vid många typer av leversjukdomar t.ex. hepatit.
237 2021-12-16 5 A) Vilken typ av bindning bryter nukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för dCMP. nukleotider A) Vilken typ av bindning bryter nukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för dCMP. A) Nukleaser bryter bindningar mellan nukleotider – därav fosfodiesterbindningar. B) dehydroxyriboscytosinmonofosfat (fel) rätt: - deoxycytidinmonofosfat
238 2021-12-16 18 Vid syntes av DNA eller RNA måste var och en av de nukleotider som ska adderas till den växande strängen ha tre fosfatgrupper på sig. Man får ingen reaktion om det bara sitter en eller två fosfatgrupper på nukleotiderna. Förklara varför de tre fosfatgrupperna behövs. (Max 150 ord.) nukleotider Vid syntes av DNA eller RNA måste var och en av de nukleotider som ska adderas till den växande strängen ha tre fosfatgrupper på sig. Man får ingen reaktion om det bara sitter en eller två fosfatgrupper på nukleotiderna. Förklara varför de tre fosfatgrupperna behövs. (Max 150 ord.) Nukleotider kopplas ihop med fosfodiesterbindningar. Bildningen av denna bindning är termodynamiskt ofördelaktig eftersom att entropin minskar – reaktionen kräver tillförd energi. Fosfatgrupperna på nukleotiden är kopplade med mycket energirika fosfoanhydridbindningar. När dessa hydrolyseras frigörs mycket energi. När nukleotiden ska binda in kommer då två av fosfatgrupperna att släppa – först frigörs det energi när de bryter från det ena fosfatet (som fortfarande sitter på nukleotiden) – och sedan ännu mer energi när bindningen bryts mellan de två frigjorda fosfatgrupperna sinsemellan. Med hjälp av denna energi kan man då driva den energikrävande processen av att skapa en fosfodiesterbindning mellan den nya nukleotiden och den som redan finns på DNA/RNA-strängen. För att få tillräckligt med energi för att driva fosfodiesterbindningen behöver man alltså bryta två fosfoanhydridbindningar m.h.a. hydrolys. Därför krävs det totalt tre stycken fosfat (två släpps av och en hamnar i DNA/RNA-skelettet).
239 2021-12-16 1 Blodgrupperna ABO är kolhydratstrukturer som bland annat finns på våra röda blodkroppar. A) Hur skiljer sig A, B och O strukturerna från varandra? B) När man ska ge röda blodkroppar till patienter kan man ge röda blodkroppar från O-donatorer till patienter med blodgrupp A, B och AB, men man kan inte ge patienter med blodgrupp O röda blodkroppar från donatorer med blodgrupp A, B eller AB. Varför? kolhydrater Blodgrupperna ABO är kolhydratstrukturer som bland annat finns på våra röda blodkroppar. A) Hur skiljer sig A, B och O strukturerna från varandra? B) När man ska ge röda blodkroppar till patienter kan man ge röda blodkroppar från O-donatorer till patienter med blodgrupp A, B och AB, men man kan inte ge patienter med blodgrupp O röda blodkroppar från donatorer med blodgrupp A, B eller AB. Varför? A) De har olika uppsättning av sockerenheter. A har fucos + galaktos + acetylgalaktosamin B har fucos + galaktos + galaktos 0 har fucos + galaktos Alltså skiljer sig dessa sekvenser från varandra, därför binder olika antikroppar in till olika sorter. B) Beroende på vilken blodgrupp man har kommer man ha olika antigen och antikroppar A har A-antigen och antikroppar mot B B har B-antigen och antikroppar mot A AB har A+B-antigen och inga antikroppar mot vare sig A eller B 0 har "inget antigen" och därav antikroppar mot både A och B Anledningen varför en person med blodgrupp 0 då inte kan få röda blodkroppar från vare sig A, B eller AB är att den har antikroppar mot både A och B. Dessa skulle då fästa sig på de transfererade blodkropparnas antigen och aktivera immunförsvaret → autoimmun reaktion. Däremot går det bra att personer som har blodgrupp A, B eller AB får 0-röda blodkroppar eftersom dessa inte innehåller några antigen som deras immunförsvar (antikroppar) skulle känna igen.
240 2021-12-16 19 ![[Pasted image 20251128080420.png]] Diagrammet ovan visar koncentrationen av ämnet A som funktion av tiden i en reaktion där A omvandlas till ämnet B i närvaro av en låg koncentration av ett enzym som katalyserar reaktionen. Enzymet tillsattes omedelbart efter tiden t₀. Vi upprepar nu försöket på samma sätt, men med den skillnaden att vi nu tillsätter 10 gånger högre koncentration av enzymet omedelbart efter tiden t₀. Ange för var och en av tidpunkterna t₀, t₁ och t₂ om [A] kommer att vara högre, lägre eller oförändrad jämfört med i diagrammet ovan. Ange också en motivation till ditt svar vid varje tidpunkt. (Max 150 ord.) enzymer ![[Pasted image 20251128080420.png]] Diagrammet ovan visar koncentrationen av ämnet A som funktion av tiden i en reaktion där A omvandlas till ämnet B i närvaro av en låg koncentration av ett enzym som katalyserar reaktionen. Enzymet tillsattes omedelbart efter tiden t₀. Vi upprepar nu försöket på samma sätt, men med den skillnaden att vi nu tillsätter 10 gånger högre koncentration av enzymet omedelbart efter tiden t₀. Ange för var och en av tidpunkterna t₀, t₁ och t₂ om [A] kommer att vara högre, lägre eller oförändrad jämfört med i diagrammet ovan. Ange också en motivation till ditt svar vid varje tidpunkt. (Max 150 ord.) t₀ kommer att vara oförändrad. Detta pga att utgångskoncentrationen av A inte kommer att minska bara för att man adderar mer enzym. t₁ kommer vara lägre. Detta pga att enzymet katalyserar reaktionen – den kommer ske mycket snabbare – A kommer att bildas till B snabbare när man tillsätter mer enzym – därför sänks koncentrationen av A snabbare. t₂ kommer även den att vara oförändrad eftersom man i kurvan ser att reaktionen vid den tidpunkten uppnått jämvikt (koncentrationen förändras inte). Enzymer påverkar inte jämviktskonstanten – alltså vid vilket förhållande mellan koncentrationerna av A och B som reaktionshastigheten av A→B och B→A är lika. Därför kommer koncentrationen av A vid jämvikt (t₂) inte att påverkas av ökad koncentration av enzym.
241 2021-12-16 29 Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ribulos 5-fosfat kan bildas i både den oxidativa och icke-oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. B: I röda blodkroppar är pentosfosfatvägen essentiell för att upprätthålla ett funktionellt glutation-system och därmed ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar. C: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla. D: Pentosfosfatvägens samtliga reaktioner sker i cytoplasman. Rätt svar pentosfosfatvägen Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ribulos 5-fosfat kan bildas i både den oxidativa och icke-oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. B: I röda blodkroppar är pentosfosfatvägen essentiell för att upprätthålla ett funktionellt glutation-system och därmed ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar. C: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla. D: Pentosfosfatvägens samtliga reaktioner sker i cytoplasman. Rätt svar A, B och D
242 2021-12-16 4 När elektroner från NADH genom transport i NADH-Q oxidoreduktas når Q sker en konformationsförändring i komplexet som tillåter protontransport över mitokondriens inre membran. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar konformationsändringen behöver ha, varför den behöver ha den egenskapen samt ge ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (Max 75 ord.) elektrontransportkedjan När elektroner från NADH genom transport i NADH-Q oxidoreduktas når Q sker en konformationsförändring i komplexet som tillåter protontransport över mitokondriens inre membran. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar konformationsändringen behöver ha, varför den behöver ha den egenskapen samt ge ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (Max 75 ord.) När Q tar upp två elektroner kommer den innan upptaget av protoner att vara negativt laddad, Q²⁻. Eftersom den är negativt laddad kommer den då att interagera med aminosyror som har en laddning (kommer ske repulsion eller attraktion), därför krävs det att aminosyran som förmedlar konformationsändringen är positivt eller negativt laddad. Ett exempel på en sådan aminosyra är arginin (Arg) – som är positivt laddad vid pH runt 7.
243 2021-12-16 16 Which basic building blocks is the ribosome made of? / Vad är ribosomen huvudsakligen uppbyggd av? translation Which basic building blocks is the ribosome made of? / Vad är ribosomen huvudsakligen uppbyggd av? It is made of rRNA and proteins. rRNA is in the center of both the large subunit and the small subunit. The proteins are more in the periphery. As described the ribosome has a large and a small subunit. In prokaryotes the small subunit is 30S and the large is 50S – they together form the 70S ribosome. In eukaryotes the ribosome is a bigger, the small subunit is 40S and the bigger is 60S – they form the 80S ribosome. The small subunits is where the t-RNA´s anticodon pairs with the codon on the RNA strand, in the large subunit the peptide-bond is formed.
244 2021-12-16 22 Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (Max 120 ord.) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Ange summaformeln för de reaktioner som katalyseras av komplexet. C) En typ av reglering av komplexet är av feedforward-typ. Vad innebär feedforwardreglering, vad ger feedforwardreglering av komplexet och hur? Rita gärna. integrering-av-metabolismen Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (Max 120 ord.) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Ange summaformeln för de reaktioner som katalyseras av komplexet. C) En typ av reglering av komplexet är av feedforward-typ. Vad innebär feedforwardreglering, vad ger feedforwardreglering av komplexet och hur? Rita gärna. a) Eftersom att den omvandlar pyruvat till acetyl-CoA – ett irreversibelt steg – glukoneogenes kan ej ske (eftersom pyruvat omvandlats). b) Pyruvat + CoA + NAD⁺ → Acetyl-CoA + CO₂ + NADH + H⁺ c) PDC kommer att feedforward-stimuleras av pyruvat. Feedforwardreglering innebär att en metabolit i något steg innan det aktuella steget kommer att reglera den aktuella reaktionen. Stor mängd pyruvat – det finns tillräckligt – pyruvat inhiberar PD-kinas (enzym som fosforylerar och därmed inhiberar PDC) – PDC är ej fosforylerat och därmed aktivt. Pyruvatet signalerar alltså att det finns tillräckligt pyruvat – bättre att omvandlas till acetyl-CoA för andra användningsområden.
245 2021-12-16 32 cVilken typ av molekyler passerar lättast genom ett cellmembran? Välj ett alternativ: A: Små polära B: Laddade C: Stora polära D: Stora hydrofoba E: Små hydrofoba Rätt svar cellmembran cVilken typ av molekyler passerar lättast genom ett cellmembran? Välj ett alternativ: A: Små polära B: Laddade C: Stora polära D: Stora hydrofoba E: Små hydrofoba Rätt svar E
246 2021-12-16 26 Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar. Varför sker detta? Beskriv den molekylära mekanismen. betaoxidation Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar. Varför sker detta? Beskriv den molekylära mekanismen. Bildning av ketonkroppar sker vid svält/fasta men kan även ske vid diabetes typ 1. Vid båda dessa tillstånd kommer det finnas en låg nivå av insulin i blodet. Vid svält för att glukoshalten är mycket låg – vid diabetes typ 1 för att pankreas ej kan producera insulin. Levern kommer att tolka de låga nivåerna av insulin som att kroppen svälter – den kommer genomföra mycket glukoneogenes för att bilda glukos för att släppa ut till kroppens vävnader. Vid glukoneogenes används oxaloacetat – när levern kör glukoneogenes i högvarv kommer den därför nästan helt ta slut. Den behövs även för att slås ihop med acetyl-CoA för att kunna påbörja citronsyracykeln. Vid avsaknad av oxaloacetat kommer därav acetyl-CoA att ansamlas – den kommer då att brytas ner till ketonkroppar. Dessa är vattenlösliga (till skillnad från lipider) och kan därav ta sig igenom blod-hjärnbarriären. Hjärnan kan då omvandla ketonkropparna till acetyl-CoA och använda det som energi. Hjärnan tar dock endast upp dessa vid svält (då finns ju ingen glukos i blodet) men inte vid diabetes (då är glukoshalten hög). Bildningen av ketonkroppar är alltså ett sätt att se till att hjärnan får energi vid svält. Vid svält kan andra celler bilda energi m.h.a lipider men det kan inte hjärnan eftersom dessa inte kan passera blod-hjärnbarriären. Vid svält (lågt glukos) måste därför hjärnan få energi på annat sätt än glukos. Detta sker genom bildningen av ketonkroppar.
247 2021-12-16 12 Vid initiering av RNA-polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilket/vilka påstående(n) om denna process stämmer? Välj ett eller flera alternativ: A: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIE binder till TATA-boxen. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. Rätt svar rna-syntes Vid initiering av RNA-polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilket/vilka påstående(n) om denna process stämmer? Välj ett eller flera alternativ: A: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIE binder till TATA-boxen. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. Rätt svar D
248 2021-12-16 27 Vilket/vilka av följande påståenden är helt korrekta avseende kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? Välj ett eller flera alternativ: A: Merparten av kroppens kolesterol härrör från födointag, ny-syntes av kroppens celler bidrar normalt i liten utsträckning. B: Kolesterol utsöndras normalt sett via levern (gallan) i form av gallsyror och, i mindre utsträckning, fritt kolesterol. C: Kroppens enda sätt att göra sig av med kolesterol är genom utsöndring via njurarna (efter konjugering till aminosyran glycin i levern). D: Kolesterolets funktioner inkluderar bl.a. att vara utgångsmaterial i syntesen av steriodhormoner. kolesterol Vilket/vilka av följande påståenden är helt korrekta avseende kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? Välj ett eller flera alternativ: A: Merparten av kroppens kolesterol härrör från födointag, ny-syntes av kroppens celler bidrar normalt i liten utsträckning. B: Kolesterol utsöndras normalt sett via levern (gallan) i form av gallsyror och, i mindre utsträckning, fritt kolesterol. C: Kroppens enda sätt att göra sig av med kolesterol är genom utsöndring via njurarna (efter konjugering till aminosyran glycin i levern). D: Kolesterolets funktioner inkluderar bl.a. att vara utgångsmaterial i syntesen av steriodhormoner. B och D
249 2021-12-16 13 Describe mechanistically how an antibiotic may interfere with transcription of a bacterial genome. / Beskriv en mekanism för hur antibiotika kan störa transkription av ett bakteriellt genom. kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Describe mechanistically how an antibiotic may interfere with transcription of a bacterial genome. / Beskriv en mekanism för hur antibiotika kan störa transkription av ett bakteriellt genom. Antibiotics can work as repressors. They can bind in to the operator region of an operon and thereby inhibiting the transcription of the genes that the operon contains.
250 2021-12-16 17 The coupling of ATP synthesis to a glycolytic reaction is described below. PEP + H₂O → pyruvate + Pi (ΔG = −78 kJ/mol) ADP + Pi → ATP + H₂O (ΔG = +55 kJ/mol) PEP + ADP → pyruvate + ATP (ΔG = −23 kJ/mol) Which of the following statements is correct for the reaction ADP + Pi → ATP + H₂O? Välj ett alternativ: A: The reaction is exergonic and thermodynamically unfavorable. B: The reaction is endergonic and thermodynamically favorable. C: The reaction is endergonic and thermodynamically unfavorable. D: The reaction is exergonic and thermodynamically favorable. Rätt svar termodynamik The coupling of ATP synthesis to a glycolytic reaction is described below. PEP + H₂O → pyruvate + Pi (ΔG = −78 kJ/mol) ADP + Pi → ATP + H₂O (ΔG = +55 kJ/mol) PEP + ADP → pyruvate + ATP (ΔG = −23 kJ/mol) Which of the following statements is correct for the reaction ADP + Pi → ATP + H₂O? Välj ett alternativ: A: The reaction is exergonic and thermodynamically unfavorable. B: The reaction is endergonic and thermodynamically favorable. C: The reaction is endergonic and thermodynamically unfavorable. D: The reaction is exergonic and thermodynamically favorable. Rätt svar D
251 2021-12-16 23 Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. Cytokrom C FADH₂ Fe i heme a₃ i komplex IV O₂ elektrontransportkedjan Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. Cytokrom C FADH₂ Fe i heme a₃ i komplex IV O₂ 1. FADH₂ 2. Cytokrom C 3. Fe i heme a₃ i komplex IV 4. O₂
252 2021-12-16 33 Vilken/vilka av nedanstående transportörer är en antiport? Välj ett eller flera alternativ: A: Adeninnukleotidtranslokas B: CFTR (Cystisk fibros transmembrane conductance regulator) C: Na⁺/K⁺-pumpen D: GLUT4 (glukostransportör 4) Rätt svar transport-över-cellmembran Vilken/vilka av nedanstående transportörer är en antiport? Välj ett eller flera alternativ: A: Adeninnukleotidtranslokas B: CFTR (Cystisk fibros transmembrane conductance regulator) C: Na⁺/K⁺-pumpen D: GLUT4 (glukostransportör 4) Rätt svar A och C
253 2021-12-16 24 I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande intermediärer: alfaketoglutarat, 3-fosfoglycerat, glyceraldehyd 3-fosfat, oxalacetat? 3-fosfoglycerat alfaketoglutarat glyceraldehyd 3-fosfat oxalacetat (Drag-och-släpp-fråga) glukosmetabolism I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande intermediärer: alfaketoglutarat, 3-fosfoglycerat, glyceraldehyd 3-fosfat, oxalacetat? 3-fosfoglycerat alfaketoglutarat glyceraldehyd 3-fosfat oxalacetat (Drag-och-släpp-fråga) 1. glyceraldehyd 3-fosfat 2. 3-fosfoglycerat 3. alfaketoglutarat 4. oxalacetat
254 2021-12-16 10 Fråga 10 Vilket/vilka av följande alternativ om DNA-replikation är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA-replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Opoisomeraser kan förändra ”linking number” hos DNA. D: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. dna-replikation Fråga 10 Vilket/vilka av följande alternativ om DNA-replikation är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA-replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Opoisomeraser kan förändra ”linking number” hos DNA. D: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. A & B
255 2021-12-16 9 Vid eukaryot DNA-replikation så spelar CMG-helikaset en viktig roll. Detta helikas består av tre delar: MCM, Gins och Cdc45. (Max 50 ord.) a. I vilken fas av cellcykeln binder MCM till replikations-origin? b. I vilken fas av cellcykeln binder Gins och Cdc45 till MCM? c. Varför är det viktigt att separera laddningen av MCM-helikaset från dess aktivering med hjälp av Gins och Cdc45? dna-replikation Vid eukaryot DNA-replikation så spelar CMG-helikaset en viktig roll. Detta helikas består av tre delar: MCM, Gins och Cdc45. (Max 50 ord.) a. I vilken fas av cellcykeln binder MCM till replikations-origin? b. I vilken fas av cellcykeln binder Gins och Cdc45 till MCM? c. Varför är det viktigt att separera laddningen av MCM-helikaset från dess aktivering med hjälp av Gins och Cdc45? a) I G1-fasen binder MCM m.h.a. ORC och laddningsfaktorerna Cdc6 och Cdt1. b) Ökad nivå av CDK (kinaser) bidrar till att binda Gins och Cdc45 i S-fasen. c) För att försäkra att replikationen bara sker en gång per cellcykel. Därför är nivåerna av CDK låga i G1 och stiger i S.
256 2021-12-16 34 Plasmid DNA purified from colonies grown on blue/white screening plates was verified by electrophoresis. Samples in Lanes C and D are digested by enzyme for verification whilst Lanes A and B are non-digested samples. Select the correct description/descriptions based on the gel picture below. ![[Pasted image 20251128080404.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: The band in Lane A that migrates the furthest is in supercoiled form and we can predict its size by a comparison with the size markers. B: The sample in Lane C has the largest size of DNA because it displays the brightest intensity under UV light. C: By comparing Lanes C and D, we can infer that the sample in Lane D is a plasmid with an insert DNA whilst Lane C is an empty vector. D: By comparing Lanes A and B, we can infer that the sample in Lane B is a plasmid with an insert DNA whilst Lane A is an empty vector. plasmid Plasmid DNA purified from colonies grown on blue/white screening plates was verified by electrophoresis. Samples in Lanes C and D are digested by enzyme for verification whilst Lanes A and B are non-digested samples. Select the correct description/descriptions based on the gel picture below. ![[Pasted image 20251128080404.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: The band in Lane A that migrates the furthest is in supercoiled form and we can predict its size by a comparison with the size markers. B: The sample in Lane C has the largest size of DNA because it displays the brightest intensity under UV light. C: By comparing Lanes C and D, we can infer that the sample in Lane D is a plasmid with an insert DNA whilst Lane C is an empty vector. D: By comparing Lanes A and B, we can infer that the sample in Lane B is a plasmid with an insert DNA whilst Lane A is an empty vector. Rätt svar 1. C 2. D (Flersvarsfråga; i originalbilden är första påståendet felmarkerat, de två sista rättmarkerade.)
257 2021-12-16 14 Which of the following is/are true about bacterial transformation? / Vilket/vilka av nedanstående stämmer för bakteriell transformation? Välj ett eller flera alternativ: A: Competence is not required for all bacterial species. / Kompetens är inte nödvändigt för alla bakteriearter. B: The DNA is typically fragmented at the bacterium’s surface. / DNA fragmenteras vanligtvis vid bakteriens yta. C: Transformation may be general or specialized. / Transformation kan vara generell eller specialiserad. D: The DNA may or may not need to integrate into the host genome. / DNA måste inte alltid integreras i värdens genom. rekombinant-dna-teknik Which of the following is/are true about bacterial transformation? / Vilket/vilka av nedanstående stämmer för bakteriell transformation? Välj ett eller flera alternativ: A: Competence is not required for all bacterial species. / Kompetens är inte nödvändigt för alla bakteriearter. B: The DNA is typically fragmented at the bacterium’s surface. / DNA fragmenteras vanligtvis vid bakteriens yta. C: Transformation may be general or specialized. / Transformation kan vara generell eller specialiserad. D: The DNA may or may not need to integrate into the host genome. / DNA måste inte alltid integreras i värdens genom. B och D
258 2021-12-16 20 Ge ett exempel på och förklara mekanismen bakom en förändring i metabolismen som sker vid högintensivt muskelarbete för att vi ska bli bättre på att utföra anaerob glykolys framöver. (Max 120 ord.) glykolysen Ge ett exempel på och förklara mekanismen bakom en förändring i metabolismen som sker vid högintensivt muskelarbete för att vi ska bli bättre på att utföra anaerob glykolys framöver. (Max 120 ord.) Högintensivt muskelarbete kommer leda till syrebrist, när detta sker kommer transkriptionsfaktorn HIF-1 att aktiveras. Den kommer att stimulera ökad produktion av glukostransportörer, enzymer i glykolysen och även aktivera VEGF. VEGF ökar vaskulariseringen av vävnaden – mer blodkärl. Detta gör att musklerna kommer i kontakt med fler blodkärl och därmed mer glukos. Den ökade mängden glukostransportörer gör att cellerna kan ta upp glukos i större mängder när det behövs. Ökad mängd enzymer i glykolysen gör att musklerna kan ta hand om glukoset och omvandla det till energi i större utsträckning när det behövs. Vid anaeroba förhållanden kan musklerna bara använda sig av glykolys – genom HIF-1 blir de bättre på att ta upp glukos och bättre på att utnyttja den.
259 2021-12-16 30 Vilket/vilket av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Xantinoxidas är ett viktigt enzym involverat i nedbrydning av purin-nukleotider. B: Delar av pyrimidinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Bindningen mellan nukleosiders sockerstruktur och kvävebas klyvs genom hydrolys när nukleosider bryts ned. D: Urinsyra (urat) innehåller merparten av de kväveatomer som ingår i purinbaser. Rätt svar nukleotidnedbrytning Vilket/vilket av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Xantinoxidas är ett viktigt enzym involverat i nedbrydning av purin-nukleotider. B: Delar av pyrimidinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Bindningen mellan nukleosiders sockerstruktur och kvävebas klyvs genom hydrolys när nukleosider bryts ned. D: Urinsyra (urat) innehåller merparten av de kväveatomer som ingår i purinbaser. Rätt svar A, B och D
260 2021-12-16 15 In order for the lagging strand to become one single continuous strand, the Okazaki fragments (OF) must undergo a maturation process. / För att den släpande strängen ska bli en kontinuerlig sträng behöver Okazakifragment genomgå en mognadsprocess. A) Which two enzymes are involved in bacterial OF maturation? B) Briefly describe their specific functions in the process. dna-replikation In order for the lagging strand to become one single continuous strand, the Okazaki fragments (OF) must undergo a maturation process. / För att den släpande strängen ska bli en kontinuerlig sträng behöver Okazakifragment genomgå en mognadsprocess. A) Which two enzymes are involved in bacterial OF maturation? B) Briefly describe their specific functions in the process. a) Polymeras 1 och DNA-ligas. b) Polymeras 1 har en 5-3-exonukleas-aktivitet, den kommer att bryta upp RNA-primerna på Okazakifragmenten i 5-3-riktning. Den kommer också byta ut RNAt mot korresponderande DNA. För att detta ska ske korrekt har den även en 3-5-exonukleas-aktivitet som kan bryta fosfodiesterbindningar om fel nukleotid sätts på. Ligaset kommer att reparera "nicks", alltså små mellanrum som kommer finnas mellan det nysyntetiserade DNAt som tagit primerns plats och det "äldre" DNAt. Detta gör ligaset genom att skapa en fosfodiesterbindning mellan nukleotiderna, detta sker med hjälp av ATP.
261 2021-12-16 21 Förklara varför utbytet av ATP från en glukos som genomgår aerob katabolism inte alltid blir detsamma. (Max 120 ord.) integrering-av-metabolismen Förklara varför utbytet av ATP från en glukos som genomgår aerob katabolism inte alltid blir detsamma. (Max 120 ord.) Hur mycket ATP man får beror på vilken transportör som används för intaget av de 2 NADH till mitokondrien som tillverkats vid glykolys. Om glycerol-3-fosfatshunten används, där kommer NADH genom ett mellansteg donera sina elektroner till FAD som befinner sig i komplex 2 i elektrontransportkedjan. Därav kommer 2 st NADH inte att donera några elektroner till komplex 1 vilket skulle ha resulterat i utpumpandet av 2×4 väten som i sin tur skulle resulterat två mer ATP genererade. Om istället malat-aspartatshunten användas kommer inte två ATP att förloras. Där kommer NADH reducera oxaloacetat till malat → transporteras in i mitokondrien → omvända reaktionen sker → NAD⁺ i mitokondrien blir NADH → donerar elektroner till komplex 1 → inga protoner "tappas", två "extra" ATP.
262 2021-12-16 31 Beskriv översiktligt hur heme bryts ner och utsöndras. heme Beskriv översiktligt hur heme bryts ner och utsöndras. Heme kommer först att bilda biliverdin – sedan bildas bilirubin – sedan bildas bilrubin. Bilirubin är en hydrofob molekul – kan inte transporteras fritt i blodet – därför kommer den i levern att konjugeras med två stycken syror, glukaronsyror – bilrubin bildas som är amfipatisk och en mer vattenlöslig molekyl. Den kommer därmed att utsöndras genom gallan i levern → transporteras till tunntarmen → utsöndras slutligen i avföringen.
263 2021-12-16 25 Vilken är den huvudsakliga funktionen av glykogen i levern respektive skelettmuskulaturen? Ange även den huvudsakliga orsaken till denna skillnad samt vilken slutprodukt som bildas vid fullständig glykogenolys i respektive vävnad. glykogen Vilken är den huvudsakliga funktionen av glykogen i levern respektive skelettmuskulaturen? Ange även den huvudsakliga orsaken till denna skillnad samt vilken slutprodukt som bildas vid fullständig glykogenolys i respektive vävnad. Glykogen i levern fungerar som en glukosreserv för blodet – man vill kunna sänka blodglukosen om den är för hög – glykogen bildas – och kunna höja den om den är för låg – glykogen bryts ner – glukos släpps ut i blodet. I muskler fungerar glykogen som en glukosreserv för muskeln själv. Om det behövs ATP pga muskelarbete kommer glykogen att brytas ned och gå in i glykolysen. Anledningen till att bara levern kan skicka ut glukos till blodet är för att den har enzymet glukos-6-fosfatas i ER. Vid nedbrytning av glykogen kommer glukos-1-fosfat bildas → sedan isomeriseras detta m.h.a. fosfoglukosmutas (sker i både muskler och lever) till glukos-6-fosfat. Detta är den slutgiltiga produkt som bildas i glykogenolys i muskler → den kan gå in i glykolys eller andra metabola vägar. Glukos-6-fosfat kan dock inte transporteras ut ur cellerna. För att göra detta måste den omvandlas till glukos. Det är vad glukos-6-fosfatas-enzymet gör, den tar bort fosfatgruppen med hjälp av hydrolys. Då kan glukos släppas ut i blodet och transporteras till andra vävnader. Glukos är alltså slutprodukten i lever. Sammanfattat är alltså anledningen till varför glykogen har olika funktioner i muskler och lever för att lever innehåller enzymet glukos-6-fosfatas medan muskler inte innehåller detta enzym. Detta enzym möjliggör att glukos kan släppas ut i blodet och inte endast användas i den egna cellen.
264 2021-12-16 11 Beskriv nukleosomens uppbyggnad (Nucleosome core particle). Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade. kromatin Beskriv nukleosomens uppbyggnad (Nucleosome core particle). Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade. Nukleosomen består av histon-proteiner och DNA-helix. I mitten av nukleosomen finns två kopior av histonproteinerna H2A, H2B, H3 och H4. Detta bildar alltså en oktamer. Sedan lindas DNA runt histonerna ungefär 1,75 varv, ca 100–200 baspar långt. Sedan sätter sig en till histon, H1, utanpå DNA-strängen och oktameren för att stabilisera och motverka att strukturen lindas upp. Mellan två histoner kommer det finnas en fri bit av DNA som kallas linker-DNA.
265 2021-12-16 8 Du har fått i uppgift att analysera proteiner i en lösning med hjälp av SDS-PAGE. (Max 150 ord) A) Förklara principen för metoden. B) Vad fyller SDS för funktion? C) Vilken egenskap hos proteinet används för separation? utforska-proteiner Du har fått i uppgift att analysera proteiner i en lösning med hjälp av SDS-PAGE. (Max 150 ord) A) Förklara principen för metoden. B) Vad fyller SDS för funktion? C) Vilken egenskap hos proteinet används för separation? A) Principen med SDS-PAGE är att man vill analysera proteiner avseende massa. Man använder först en molekyl som heter SDS, en negativt laddad molekyl som binder till proteiner. Ju större massa proteinet har – desto större mängd SDS-molekyler binder – resulterar i en större negativ laddning (jämfört med mindre proteiner). Sedan låter man dessa proteiner vandra genom en polyakrylamid-gel från en negativ elektrod till en positiv elektrod. Ju större negativ laddning desto större motstånd i gelen. Detta leder till att små proteiner vandrar längst och stora kortast. Då får man alltså en separation i gelen avseende storlek. B) SDS som beskrivet är en negativ molekyl som binder till protein – funktionen är att skapa en laddningsskillnad mellan proteiner som korresponderar till storleken. C) Det är proteinernas massa som används för separation.
266 2021-12-16 35 Du sätter upp en studie för att avgöra om människor som migrerar löper en ökad risk att utveckla schizofreni jämfört med icke-migranter. Din nollhypotes är således följande: ”Risken att utveckla schizofreni är densamma bland migranter och icke-migranter”. Du genomför studien, sammanställer resultaten och utför ett statistiskt test för att avgöra om den eventuella skillnaden är statistiskt signifikant. När kan du förkasta nollhypotesen med viss säkerhet? Välj ett alternativ: A: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. B: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. C: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0. D: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0. introduktionslaboration Du sätter upp en studie för att avgöra om människor som migrerar löper en ökad risk att utveckla schizofreni jämfört med icke-migranter. Din nollhypotes är således följande: ”Risken att utveckla schizofreni är densamma bland migranter och icke-migranter”. Du genomför studien, sammanställer resultaten och utför ett statistiskt test för att avgöra om den eventuella skillnaden är statistiskt signifikant. När kan du förkasta nollhypotesen med viss säkerhet? Välj ett alternativ: A: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. B: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. C: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0. D: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0. C
267 2021-12-16 3 Rita en dipeptid bestående av de två (olika) aminosyror från vars sidokedjor det inte går att bilda glukos. Dipeptiden befinner sig i en lösning med pH-värde 2. Ange vilka aminosyrorna är. från-aminosyror-till-proteiner Rita en dipeptid bestående av de två (olika) aminosyror från vars sidokedjor det inte går att bilda glukos. Dipeptiden befinner sig i en lösning med pH-värde 2. Ange vilka aminosyrorna är. ![[Pasted image 20251128074813.png]] Ska stå Lysin, inte Lycin.
268 2021-12-16 7 Briefly describe the RNA world hypothesis with an example. / Beskriv kortfattat RNA-världs-hypotesen genom ett exempel. (Max 100 words.) evolution Briefly describe the RNA world hypothesis with an example. / Beskriv kortfattat RNA-världs-hypotesen genom ett exempel. (Max 100 words.) The RNA world hypothesis describes how living things has gone from using only RNA as storage of genetic material and catalyzing chemical processes (ribozymes) to being close to solely depending on proteins to catalyze many important chemical processes. One example is the enzyme RNAse P which function is cleave the 5´ end of tRNA-molecules. In bacteria the enzyme consits of almost only RNA and very little proteins (which are not even essentiall to the function). In archea there is less RNA and more protein, and in eukaryotes proteins make up the largest part of the enzyme. This is aligned with the hypothesis.
269 2021-12-16 6 Vilken/vilka av nedanstående faktorer leder till att hemoglobinets syrebindande förmåga minskar? Välj ett eller flera alternativ: A: Hög koncentration 2,3-BPG. B: Högt pH. C: Hög koncentration O₂. D: Hög koncentration CO₂. hemoglobin Vilken/vilka av nedanstående faktorer leder till att hemoglobinets syrebindande förmåga minskar? Välj ett eller flera alternativ: A: Hög koncentration 2,3-BPG. B: Högt pH. C: Hög koncentration O₂. D: Hög koncentration CO₂. A och D
270 2021-12-16 2 Ange en skillnad mellan mättade och omättade fettsyror avseende struktur och en skillnad avseende inverkan på fluiditeten hos cellens membran. lipider Ange en skillnad mellan mättade och omättade fettsyror avseende struktur och en skillnad avseende inverkan på fluiditeten hos cellens membran. Mättade fettsyror har inga dubbelbindningar – därav är deras fettsyrekedjor raka strukturer. Omättade fettsyror har däremot en eller flera dubbelbindningar – detta leder till en böjning i strukturen där dubbelbindningen sitter – fettsyrorna blir inte helt raka strukturer utan böjda på olika sätt beroende på vart dubbelbindningarna sitter och om de har trans eller cis-konfiguration. Eftersom att de mättade fettsyrorna har raka fettsyrasvansar kan dessa packas mycket tätt – fluiditeten i membranet minskar. Däremot kan de omättade fettsvansarna inte packas lika tätt på grund av att de inte är raka strukturer – fluiditeten i membranet ökar.
271 2023-12-18 28 Vilka två påståenden om heme är korrekta? (2p) A: Succinyl-CoA och glycin används vid hemesyntesen. B: Trypsin innehåller heme. C: Hememolekylen innehåller en magnesiumjon. D: Cytokrom C innehåller heme. heme Vilka två påståenden om heme är korrekta? (2p) A: Succinyl-CoA och glycin används vid hemesyntesen. B: Trypsin innehåller heme. C: Hememolekylen innehåller en magnesiumjon. D: Cytokrom C innehåller heme. A och D
272 2023-12-18 5 Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein baserat på laddning. (4p) (Max 200 ord) A) Beskriv vilken metod du skulle använda dig av och hur denna fungerar. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en förklaring till hur denna fungerar. utforska-proteiner Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein baserat på laddning. (4p) (Max 200 ord) A) Beskriv vilken metod du skulle använda dig av och hur denna fungerar. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en förklaring till hur denna fungerar. a) Jonbyteskromotografi. Efter att ha lösgjört proteinerna i homogenisat går reningsmetoden ut på att man för proteinlösningen genom en kolonn som innehåller kulor som antingen är positivt eller negativt laddade beroende på proteinets laddning som man vill ha ut. En katjonsbytare är negativt laddade kulor i kolonnen som kommer att attrahera positivt laddade proteiner från fasen man för igenom medan en anjonbytare däremot är positivt laddade kulor som kommer att attrahera negativt laddade proteiner. Det är proteinets totala laddning som selekteras. Sedan kan en buffert eller salt användas för att eluera proteinerna från de laddade kulorna i kolonnen för vidare analys. b) För att analysera storleken hade jag valt SDS page som är en elektrofores-metod där man först blandar i ämnet SDS (sodum dodecyl sulfate) som är negativt laddade molekyler som kommer att binda till aminosyrorna och slå ut proteinets tidigare laddning. Proteinetet kommer att binda SDS baserat på hur stort det är, ju större protein desto mer negativt laddat då fler aminosyror laddas av SDS och proteinerna får vandra i ett elektriskt fält där de minsta vandrar längst mot positiv pol då de hindras minst av de steriska hindrena i polyakrylamid-gelen. Separation map STORLEK
273 2023-12-18 18 Redogör för begreppet entalpi samt för hur den kan användas för att förutse tendensen för att en viss biokemisk reaktion att ske. (4p) termodynamik Redogör för begreppet entalpi samt för hur den kan användas för att förutse tendensen för att en viss biokemisk reaktion att ske. (4p) Entalpi (H) betyder energiinnehållet i en reaktion. Entalpi beror på bindningar som finns i de ämnen som är delaktiga i reaktionen och vilken art bindningarna har. I en exoterm reaktion kommer energiinnehållet minska eftersom energi släpps ut. Om ΔH är negativ för en reaktion är den exoterm och kan därmed ses som fördelaktig. När energi, t.ex. i form av värme, släpps ut till omgivningen kan det öka entropin i molekyler som finns runtom, vilket är fördelaktigt enligt termodynamikens andra lag. (Om temperaturen och trycket är konstant kan H tillsammans med systemets parametrar användas för att beräkna den fria energin. ΔG = ΔH − TΔS. Om ΔG är negativ är reaktionen spontan och benägen att ske.)
274 2023-12-18 1 I celler är vatten lösningsmedel. Förklara ur bindningssynpunkt varför detta är fördelaktigt. (4p) (Max 100 ord.) kemiska-bindingar I celler är vatten lösningsmedel. Förklara ur bindningssynpunkt varför detta är fördelaktigt. (4p) (Max 100 ord.) Vatten är en polär molekyl och har en dipol eftersom syret är mer elektronegativt än de två vätena. Polariteten gör att vattenmolekyler kan interagera med både positivt laddade molekyler och negativa laddade molekyler som finns i celler. Vid interaktioner med positivt laddade joner kommer den mer elektronegativa syret interagera med jonerna. I interaktioner med negativt laddade joner kommer istället väterna interagera. Vatten kan således bilda hydratiseringsskal runt joner som är essentiella för cellfunktion. Vatten har hög dielektricitetskonstant som gör att alltför starka jonbindningar inte bildas till ämnen, så att joner kan fortfarande utnyttjas i cellulära processer vid behov.
275 2023-12-18 19 Två fördelar med att mäta den initiala hastigheten för en reaktion, V₀, är att i början av en reaktion … (2p) A: kan produktinhibering inte påverka hastigheten. B: är förändringar i [S] försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. C: har variationer av [S] inte någon effekt på V₀. D: är förändringar i Kₘ försumbara, så Kₘ kan behandlas som en konstant. enzymer Två fördelar med att mäta den initiala hastigheten för en reaktion, V₀, är att i början av en reaktion … (2p) A: kan produktinhibering inte påverka hastigheten. B: är förändringar i [S] försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. C: har variationer av [S] inte någon effekt på V₀. D: är förändringar i Kₘ försumbara, så Kₘ kan behandlas som en konstant. A och B
276 2023-12-18 29 Redogör för hur ATP-syntaset fungerar. (4p) (Max 150 ord.) elektrontransportkedjan Redogör för hur ATP-syntaset fungerar. (4p) (Max 150 ord.) ATP-syntaset utnyttjar protongradienten som bildades i elektrontransportkedjan. Dess F₀-del finns i mitokondriens inre membran och har en a-subenhet som innehåller två hydrofila halvkanaler: mot mellanmembranutrymmet (MMU) respektive matrix. a-subenheten interagerar med en c-subenhet (som finns i en ring) som har en negativt laddad aspartat- eller glutamatrest. En proton kan komma in i halvkanalen mot MMU och interagera med aminosyraresten i c-subenheten. Neutralisering gör att c-subenheten roterar en enhet medsols. Därmed kan en proton komma in mot halvkanalen mot matrix och frisättas i matrix. F₀ är kopplad till F₁-delen i matrix via en γ-stjälk. F₁ har 3 alfa- och 3 betasubenheter i en ring. Betasubenheterna bildar ATP och antar tre konformationer: Loose (där ADP + Pi binder), Tight (där ATP bildas) och Open (där ATP frisläpps och en ny ADP + Pi kan binda in). Den roterande γ-stjälken kan leda till konformationsändringarna i betasubenheterna. 3 ATP bildas per varv.
277 2023-12-18 4 What does cooperative binding mean? Explain this in the context of hemoglobin. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max 100 words) hemoglobin What does cooperative binding mean? Explain this in the context of hemoglobin. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max 100 words) Cooperative binding means that the binding of an oxygen to hemoglobin makes it more likely for the molecule to bind more oxygen. This is because when an oxygen binds to hemoglobin the structure becomes less tense as one αβ-dimer rotates 15 degrees, which increases its affinity for oxygen at other binding sites. Release of an oxygen promotes also further release. Due to the cooperativity hemoglobin has a sigmoidal binding curve at different partial pressures of oxygen. Cooperativity enables hemoglobin to be a good oxygen transporter.
278 2023-12-18 16 Vad är en hydropatiplot och vad ger den information om? (4p) cellmembran Vad är en hydropatiplot och vad ger den information om? (4p) En hydropatiplot kan ge information om det är sannolikt att en viss sekvens är en transmembran alfahelix och hur många alfahelixar det kan motsvara. En hydropatiplot kan skapas genom att undersöka en aminosyrasekvens från N- till C-terminal i intervaller om 20 (aminosyra 1–20, 2–21, 3–22 osv.). Detta beror på att det krävs 20 aminosyror för att gå genom cellmembranet. Man tittar på den energimässiga kostnaden för att flytta respektive aminosyra från en hydrofob till hydrofil miljö. Värdena plottas i en graf där energinivån är på y-axeln och intervallerna är på x-axeln. Man sätter gränsvärdet på 84 kJ/mol (kommer från transmembrana alfahelixar med känd struktur). Om en graf går över gränsvärdet en gång är det sannolikt en transmembran alfahelix. Om den går ovanför gränsvärdet flera gånger tyder det på flera transmembrana alfahelixar.
279 2023-12-18 22 I glykolysen finns två reaktioner där ATP förbrukas och två reaktioner där ATP bildas. A) Vilka enzymer katalyserar dessa reaktioner? B) Förklara hur glykolysen trots detta ger ett nettoutbyte av två ATP. (4p) (Max 50 ord) glykolysen I glykolysen finns två reaktioner där ATP förbrukas och två reaktioner där ATP bildas. A) Vilka enzymer katalyserar dessa reaktioner? B) Förklara hur glykolysen trots detta ger ett nettoutbyte av två ATP. (4p) (Max 50 ord) A) Hexokinas (glukokinas) katalyserar första förbrukningen av ATP och fosfofruktokinas 1 katalyserar andra. Fosfoglyceratkinas katalyserar bildning av första ATP och pyruvatkinas katalyserar bildning av. B) Vid spjälning av fruktos 1,6 - bisfosfatas bildas två 3-kolsenheter, dihydroxyacetonfosfat och glyceraldehyd 3 fosfat. Dihydroxyacetonfosfat kommer bilda glyceraldehyd3fosfat och därmed går 2 glyceraldehyd3fosfat igenom
280 2023-12-18 32 Nämn det fullständiga namnet på en purin-nukleotid och ange i vilken molekyl kolskelettet respektive huvuddelen av molekylens kväveatomer slutligen hamnar då nukleotiden bryts ned. (2p) (Max 50 ord) nukleotidnedbrytning Nämn det fullständiga namnet på en purin-nukleotid och ange i vilken molekyl kolskelettet respektive huvuddelen av molekylens kväveatomer slutligen hamnar då nukleotiden bryts ned. (2p) (Max 50 ord) Adenosinmonofosfat (AMP). Kolskelettet samt huvuddelen av kvävet hamnar i urat.
281 2023-12-18 26 I aerob katabolism kommer glukos att omvandlas i ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande metaboliter? (2p) 2-fosfoglycerat Alfaketoglutarat Glyceraldehyd 3-fosfat Malat integrering-av-metabolismen I aerob katabolism kommer glukos att omvandlas i ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande metaboliter? (2p) 2-fosfoglycerat Alfaketoglutarat Glyceraldehyd 3-fosfat Malat 1. glyceraldehyd 3-fosfat 2. 2-fosfoglycerat 3. Alfaketoglutarat 4. Malat
282 2023-12-18 12 Hur kan en mutation i ett icke-kodande intron ge upphov till sjukdom, t.ex. talassemi? (4p) rna-syntes Hur kan en mutation i ett icke-kodande intron ge upphov till sjukdom, t.ex. talassemi? (4p) En mutation, t.ex. en punktmutation, kan leda till att en ny splice site bildas i mitten av en intron. När ett primärt mRNA senare ska genomgå splicing kan det nya splice-sitet leda till att en del av intronet blir kvar. Intronet kan t.ex. leda till att andra kodon finns kvar eller att stoppkodon blir kvar som leder till att felaktig genprodukt bildas när mRNA senare translateras. Detta kan i sin tur leda till proteiner som har defekter och inte kan utföra normal funktion.
283 2023-12-18 36 You amplified a gene of interest using the blue/white screening method. You extracted plasmids from two bacterial colonies (one blue colony and one white colony), then performed restriction enzyme digestion and ran the samples on a gel as follows: blue uncut, blue cut, white uncut, white cut (see gel below). When imaging the gel, however, you notice there is a faint band in the blue cut sample (see arrow), which should not be there. Explain why the faint band should not be present in that sample and what are the possible sources of error for this outcome? Refer to the size/number of bands in comparison to the bands in the other lanes for your explanation. This questions needs to be answered in English. (4p) ![[Pasted image 20251129235214.png]] plasmid You amplified a gene of interest using the blue/white screening method. You extracted plasmids from two bacterial colonies (one blue colony and one white colony), then performed restriction enzyme digestion and ran the samples on a gel as follows: blue uncut, blue cut, white uncut, white cut (see gel below). When imaging the gel, however, you notice there is a faint band in the blue cut sample (see arrow), which should not be there. Explain why the faint band should not be present in that sample and what are the possible sources of error for this outcome? Refer to the size/number of bands in comparison to the bands in the other lanes for your explanation. This questions needs to be answered in English. (4p) ![[Pasted image 20251129235214.png]] The blue samples are samples with no DNA-insert. They have an intact lacZ-gene and are able to produce β-galactosidase which breaks down X-gal to a blue pigment. Since the blue colony samples have no DNA insert, the blue sample should show one band on the gel electrophoresis. The reason that the blue cut shows two bands can be because a mixed colony was chosen, meaning one that also had white colonies. This could likely be the case because the second band has a 1500 bp size which the second band of the "white cut" also has. Another possible reason for this odd result is contamination. The "blue cut" sample could possibly have been contaminated with white cut samples when pipetting or by improper labelling of tubes. This could be the case as the samples in both lanes show similar sizes (even the larger band is approximately the same size in both, 3000 bp).
284 2023-12-18 27 Vilka två effekter har insulin på fettmetabolismen? (2p) A: Inhiberar acetyl-CoA-karboxylas. B: Inhiberar syntes av fettsyror. C: Aktiverar acetyl-CoA-karboxylas. D: Aktiverar syntes av fettsyror. betaoxidation Vilka två effekter har insulin på fettmetabolismen? (2p) A: Inhiberar acetyl-CoA-karboxylas. B: Inhiberar syntes av fettsyror. C: Aktiverar acetyl-CoA-karboxylas. D: Aktiverar syntes av fettsyror. C och D
285 2023-12-18 13 Vilka två påståenden stämmer om trp-operonet? (2p) A: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att bryta ner aminosyran tryptofan. B: När det inte finns tryptofan i omgivningen, binder tryptofan-repressorn till operatorsekvensen i trp-operonet. C: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att syntetisera aminosyran tryptofan. D: Trp-repressorn kan blockera bindning av RNA-polymeras till promotorn. kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Vilka två påståenden stämmer om trp-operonet? (2p) A: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att bryta ner aminosyran tryptofan. B: När det inte finns tryptofan i omgivningen, binder tryptofan-repressorn till operatorsekvensen i trp-operonet. C: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att syntetisera aminosyran tryptofan. D: Trp-repressorn kan blockera bindning av RNA-polymeras till promotorn. C och D
286 2023-12-18 17 Vilka två påståenden om glukostransportörer är korrekta? (2p) A: De utför aktiv transport. B: De faciliterar diffusion. C: De är bärarproteiner. D: De kan enbart transportera glukos i en riktning. transport-över-cellmembran Vilka två påståenden om glukostransportörer är korrekta? (2p) A: De utför aktiv transport. B: De faciliterar diffusion. C: De är bärarproteiner. D: De kan enbart transportera glukos i en riktning. B och C
287 2023-12-18 23 Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för flera enzymer. A) Vilka är enzymerna och hur påverkas deras aktivitet av fruktos 2,6-bisfosfat inbindning? B) Vad reglerar hur mycket fruktos 2,6-bisfosfat som bildas? (4p) (Max 75 ord.) Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för flera enzymer. A) Vilka är enzymerna och hur påverkas deras aktivitet av fruktos 2,6-bisfosfat inbindning? B) Vad reglerar hur mycket fruktos 2,6-bisfosfat som bildas? (4p) (Max 75 ord.) A) Fosfofruktokinas i glykolys aktiveras. Fruktos-1,6-bisfosfatas i glukoneogenes inhiberas. B) Fruktos 2,6-bisfosfat (F-2,6-BP) bildas av fosfofruktokinas 2 som ingår i ett bifunktionellt enzym med fruktos-2,6-bisfosfatas. Om insulin finns stimulerar det fosfoproteinfosfatas som defosforylerar och aktiverar fosfofruktokinas 2 vilket leder till ökad F-2,6-BP-produktion. Däremot, om glukagon finns, ger det upphov till cAMP-bildning som aktiverar proteinkinas A som fosforylerar fosfofruktokinas 2, som därmed inhiberar produktionen av fruktos-2,6-bisfosfat.
288 2023-12-18 33 En fullt funktionell pentosfosfatväg är viktig för röda blodkroppars skydd mot väteperoxid. Varför? (2p) (Max 50 ord) pentosfosfatvägen En fullt funktionell pentosfosfatväg är viktig för röda blodkroppars skydd mot väteperoxid. Varför? (2p) (Max 50 ord) När glutationperoxidas tar hand om väteperoxid oxideras glutation. För att skyddet ska fortsätta finnas mot väteperoxid måste den reducerade formen av glutation återbildas med reduktionsmedlet NADPH. I röda blodkroppar saknas mitokondrier och NADPH kan endast bildas genom pentosfosfatvägen. Därför är en funktionell pentosfosfatväg viktig.
289 2023-12-18 24 Vilka två av följande påståenden om glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Glykogen är kovalent bundet till enzymet glykogenin. B: Höga intracellulära nivåer av glukos-6-fosfat stimulerar glykogenolys i skelettmuskel. C: Skelettmuskel kan använda sig av glykogen som energikälla vid anaerobt arbete. D: Glykogenolys sker i huvudsak via så kallad hydrolys. glykogen Vilka två av följande påståenden om glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Glykogen är kovalent bundet till enzymet glykogenin. B: Höga intracellulära nivåer av glukos-6-fosfat stimulerar glykogenolys i skelettmuskel. C: Skelettmuskel kan använda sig av glykogen som energikälla vid anaerobt arbete. D: Glykogenolys sker i huvudsak via så kallad hydrolys. A och C
290 2023-12-18 10 På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. Fyra olika replikationsfaktorer är markerade på denna bild. Vad heter de olika faktorerna vid pil a, b, c och d? (4p) ![[Pasted image 20251129235154.png]] dna-replikation På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. Fyra olika replikationsfaktorer är markerade på denna bild. Vad heter de olika faktorerna vid pil a, b, c och d? (4p) ![[Pasted image 20251129235154.png]] a) CMG-helikas b) PCNA c) Replication protein A d) DNA-polymeras δ
291 2023-12-18 9 Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: En nukleosom innehåller 8 proteiner. B: Acetylering kan neutralisera positiva laddningar i histonsvansar. C: Med epigenetisk reglering menas reglering av genuttryck som endast beror av den nedärvda DNA-sekvensen. D: I en nukleosom lindas DNA 2,75 varv runt ett proteinkomplex. kromatin Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: En nukleosom innehåller 8 proteiner. B: Acetylering kan neutralisera positiva laddningar i histonsvansar. C: Med epigenetisk reglering menas reglering av genuttryck som endast beror av den nedärvda DNA-sekvensen. D: I en nukleosom lindas DNA 2,75 varv runt ett proteinkomplex. A och B
292 2023-12-18 34 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA reduktas (HMG-CoA-reduktas) har en nyckelroll i reglering av cellernas kolesterolsyntes. Beskriv hur detta enzym regleras på transkriptionell nivå; den viktigaste reglermekanismen. (4p) kolesterol 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA reduktas (HMG-CoA-reduktas) har en nyckelroll i reglering av cellernas kolesterolsyntes. Beskriv hur detta enzym regleras på transkriptionell nivå; den viktigaste reglermekanismen. (4p) Transkriptionen regleras av Sterol Regulator Element Binding Protein (SREBP) som har en transkriptionsfaktordel mot cytosolen. Vid låg kolesterol flyttas SREBP från det endoplasmatiska retiklet till golgiapparaten. Här klyvs transkriptionsfaktordelen av SREBP av Golgi localized site 1 proteaset. Därefter klyver site 2-proteaset vid N-terminalen. Den N-terminala delen som har transkriptionsfaktorn binder till Sterol Regulator Element 1 som finns i promotorn av bland annat HMGR, som leder till en ökad transkription av HMGR. Själva transporten av SREBP till golgiapparaten, som också påverkar transkriptionen, regleras av Insig 1, Insig 2 och Scap. Vid låg kolesterolnivå kommer Insig inte binda till SREBP–Scap-komplexet. Insig bryts därmed ned i proteasomen och SREBP–Scap-komplexet kan interagera med COPII, som är involverade i vesiklar som transporteras till golgi. Men om kolesterol finns och det binder till SREBP–Scap-komplexet kommer en konformationsändring ske som gör att Insig kan binda in. Detta förhindrar interaktion med COPII. SREBP går inte med i vesiklar till golgi, vilket betyder att transkription av HMGR inte ökar när mycket kolesterol finns.
293 2023-12-18 14 Wobble-effekten är en viktig aspekt av genetisk kodavläsning under translationen. Förklara vad wobble-effekten är och hur den bidrar till flexibiliteten i parningen mellan kodoner på mRNA och antikodonerna på tRNA. Diskutera även hur denna effekt kan bidra till tolerans mot vissa genetiska mutationer. (4p) (Max 150 ord) translation Wobble-effekten är en viktig aspekt av genetisk kodavläsning under translationen. Förklara vad wobble-effekten är och hur den bidrar till flexibiliteten i parningen mellan kodoner på mRNA och antikodonerna på tRNA. Diskutera även hur denna effekt kan bidra till tolerans mot vissa genetiska mutationer. (4p) (Max 150 ord) Wobble-effekten betyder att den första basen i ett antikodon kan binda till flera olika baser på den tredje basen av ett kodon. En kvävebas på tRNA-antikodon som har en sådan förmåga att binda till flera olika baser på den tredje basen i kodonet är inosin, som kan binda till uracil, cytosin och adenin. Att den första basen i antikodonet kan binda till flera baser leder till att ett tRNA kan binda till flera kodon på mRNA vilket ökar molekylens flexibilitet (en aminosyra kan kopplas till flera olika kodon). Wobble-effekten kan bidra till tolerans mot vissa genetiska mutationer, eftersom även om en mutation finns som gör att en annorlunda kvävebas finns, kan tRNA trots detta binda till det och binda korrekt aminosyra.
294 2023-12-18 20 Vad är syftet med den katalytiska klyftan som finns i ett enzym? Redogör för två fördelar den katalytiska klyftan ger för katalys. (4p) enzymer Vad är syftet med den katalytiska klyftan som finns i ett enzym? Redogör för två fördelar den katalytiska klyftan ger för katalys. (4p) Den katalytiska klyftan är den del av enzymet som substratet binder in och som reaktionen kan katalyseras i. och övergångstillståndet kan stabilseras så att reaktionen kan ske snabbare. Den katalytiska klyftan är en väldigt liten del av enzymet och består av aminosyrarester i proteinet som ger en specificitet för enbart vissa molekyler att binda in, detta ökar specificiteten och hindrar andra potentiella reaktanter från att komma nära och interagera. Den utesluter bland annat vatten som hade hämmat många reaktioner genom sin polaritet. Dessutom kommer den katalytiska klyftan att införa svaga bindingar som stabiliserar övergångstillståndet och bildningen av produkt, ett fenomen som i vanliga fall hade krävt betydligt högre aktiveringsenergi för att kunna ske. Dvs som hade krävt högre energi i omlopp som hade satt molekylerna i rörelse så att de kom nära varandra tillräckligt ofta för att det ostabila övergångstillståndet hade kunnat ske. Den katalytiska klyftan av enzymet sänker därför aktiveringsenergin till reaktionen.
295 2023-12-18 30 Beskriv med en reaktionsformel hur celler hanterar att syrgas ibland enbart tar upp en elektron. (2p) (Max 25 ord) elektrontransportkedjan Beskriv med en reaktionsformel hur celler hanterar att syrgas ibland enbart tar upp en elektron. (2p) (Max 25 ord) Superoxid + 2 H⁺ → H₂O₂ mha dismutas. (superoxid = O₂·⁻) (Väteperoxiden tas hand om av glutationperoxidas (2 H₂O₂ → O₂ + 2 H₂O, där 2 glutation oxideras))
296 2023-12-18 15 Lista fyra aspekter som är identiska för alla livsformer på jorden. (4p) evolution Lista fyra aspekter som är identiska för alla livsformer på jorden. (4p) 1. Alla livsformer lagrar sin arvsmassa/genetiska information i nukleinsyror i form av RNA eller DNA. 2. Den grundläggande metabolismen i alla livsformer är liknande. 3. Livsformer använder ATP som energivaluta i sina celler. 4. Alla livsformer använder cofaktorer i sina enzymer.
297 2023-12-18 21 Vilka två av nedanstående molekyler är beroende av en B-vitamin för sin syntes? (2p) A: Coenzym A B: Coenzym Q C: NADH D: ATP introduktion-till-metabolismen Vilka två av nedanstående molekyler är beroende av en B-vitamin för sin syntes? (2p) A: Coenzym A B: Coenzym Q C: NADH D: ATP A och C
298 2023-12-18 31 Ange det fullständiga namnet på ett kliniskt viktigt enzym som tillhör gruppen aminotransferaser, samt ange reaktionen enzymet katalyserar. (4p) (Max 50 ord) aminosyrametabolism Ange det fullständiga namnet på ett kliniskt viktigt enzym som tillhör gruppen aminotransferaser, samt ange reaktionen enzymet katalyserar. (4p) (Max 50 ord) Alanin aminotransferas (höga nivåer av detta tyder på leversjukdom). Den katalyserar följande reaktion: Alanin + α-ketoglutarat ⇌ Pyruvat + Glutamat.
299 2023-12-18 25 Vilka två av nedanstående molekyler reglerar något enzym i citronsyracykeln? (2p) A: NADH B: Pyruvat C: Acetyl-CoA D: ADP citronsyracykeln Vilka två av nedanstående molekyler reglerar något enzym i citronsyracykeln? (2p) A: NADH B: Pyruvat C: Acetyl-CoA D: ADP A och D
300 2023-12-18 11 a) Vilken roll spelar DNA-polymeras epsilon? b) Hur kan PCNA påverka aktiviteten hos DNA-polymeras epsilon? (4p) dna-replikation a) Vilken roll spelar DNA-polymeras epsilon? b) Hur kan PCNA påverka aktiviteten hos DNA-polymeras epsilon? (4p) a) DNA-polymeras epsilon är involverad i DNA-replikation på leading strand. Det katalyserar påkopplingen av kvävebaser från 5' till 3'-riktning. Det har en 3' till 5' exonukleasaktivitet och kan ta bort om en felaktig bas har kopplats på (proofreading). b) PCNA (sliding clamp) ökar processiviteten hos DNA-polymeras genom att hålla det fastbundet till DNA-mallen. På så sätt ramlar DNA-polymeraset inte av och kan arbeta med ökad processivitet.
301 2023-12-18 8 Glykaner kan vara O-länkade och N-länkade. Förklara kortfattat vad detta innebär på molekylär nivå. (4p) (Max 150 ord) kolhydrater Glykaner kan vara O-länkade och N-länkade. Förklara kortfattat vad detta innebär på molekylär nivå. (4p) (Max 150 ord) O-länkade glykaner betyder att kolhydraten är länkad via syre i sidokedjan av serin eller threonin. N-länkade betyder att kolhydraterna är länkade via kvävet i sidokedjan av asparagin.
302 2023-12-18 35 I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värde på 0,03 och ett 95% konfidensintervall på 6–17 mmHg. Nollhypotesen är att det inte finns någon skillnad i medelvärde i blodtryck mellan de två grupperna. Vilka två påståenden är korrekta baserat på dessa resultat? (2p) Välj ett eller flera alternativ: A: Ett p-värde på 0,03 innebär att det 95%-iga konfidensintervallet inte inkluderar nollan. B: Nollhypotesen kan förkastas. C: Det är 95% säkert att behandlingsgruppen har mellan 6 och 17 mmHg lägre blodtryck jämfört med placebogruppen. D: Det finns ingen statistisk signifikant skillnad i blodtryck mellan grupperna. introduktionslaboration I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värde på 0,03 och ett 95% konfidensintervall på 6–17 mmHg. Nollhypotesen är att det inte finns någon skillnad i medelvärde i blodtryck mellan de två grupperna. Vilka två påståenden är korrekta baserat på dessa resultat? (2p) Välj ett eller flera alternativ: A: Ett p-värde på 0,03 innebär att det 95%-iga konfidensintervallet inte inkluderar nollan. B: Nollhypotesen kan förkastas. C: Det är 95% säkert att behandlingsgruppen har mellan 6 och 17 mmHg lägre blodtryck jämfört med placebogruppen. D: Det finns ingen statistisk signifikant skillnad i blodtryck mellan grupperna. A och B
303 2023-12-18 3 Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för två enzymer. Förklara vilka egenskaper de aminosyror som binder till fruktos 2,6-bisfosfat behöver ha och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 75 ord.) från-aminosyror-till-proteiner Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för två enzymer. Förklara vilka egenskaper de aminosyror som binder till fruktos 2,6-bisfosfat behöver ha och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 75 ord.) Fruktos 2,6-bisfosfat har två fosfatgrupper som kan ha negativt laddade syren. För att binda in ämnet och skapa en elektrostatisk attraktion (jonbindning), kan det därmed vara fördelaktigt att ha aminosyror som har en positiv laddning. Lysin och arginin är två positivt laddade aminosyror som kan vara lämpliga.
304 2023-12-18 7 Den vanligaste formen som DNA antar kallas B-DNA. Vilka två påståenden stämmer om denna? (2p) A: Den är vänstervriden. B: Det är mellan 10–10,4 baspar per varv av helixen. C: Avståndet mellan baspar är cirka 3,4 Å. D: De två strängarna parallella. nukleotider Den vanligaste formen som DNA antar kallas B-DNA. Vilka två påståenden stämmer om denna? (2p) A: Den är vänstervriden. B: Det är mellan 10–10,4 baspar per varv av helixen. C: Avståndet mellan baspar är cirka 3,4 Å. D: De två strängarna parallella. B och C
305 2023-12-18 6 a) Rita strukturen för kolesterol. b) Visa hur kolesterol orienteras i ett membran. OBS! Den här frågan ska besvaras på separat papper som kommer att skannas in och bifogas tentamen. (4p) lipider a) Rita strukturen för kolesterol. b) Visa hur kolesterol orienteras i ett membran. OBS! Den här frågan ska besvaras på separat papper som kommer att skannas in och bifogas tentamen. (4p) se 2023-12-18-0114-EES
306 2023-12-18 2 Rangordna nedanstående aminosyror efter stigande polaritet (2p) Cystein Lysin Metionin Treonin från-aminosyror-till-proteiner Rangordna nedanstående aminosyror efter stigande polaritet (2p) Cystein Lysin Metionin Treonin 1. Metionin 2. Cystein 3. Treonin 4. Lysin
307 2024-05-15 28 Vilka två av följande faktorer stimulerar glykogenes (syntes av glykogen) i en skelettmuskelcell? (2p) A: Förhöjda koncentrationer av ATP i muskelcellen. B: Förhöjda koncentrationer av AMP i muskelcellen. C: Förhöjda koncentrationer av glukos-6-fosfat i muskelcellen. D: Intracellulär signalering inducerad av hormonet insulin. glykogen Vilka två av följande faktorer stimulerar glykogenes (syntes av glykogen) i en skelettmuskelcell? (2p) A: Förhöjda koncentrationer av ATP i muskelcellen. B: Förhöjda koncentrationer av AMP i muskelcellen. C: Förhöjda koncentrationer av glukos-6-fosfat i muskelcellen. D: Intracellulär signalering inducerad av hormonet insulin. C och D
308 2024-05-15 5 Du jobbar på ett labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein med hjälp av affinitetskromatografi. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med hjälp av affinitetskromatografi. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en kortfattad förklaring till hur denna fungerar. (4p) (Max 200 ord.) utforska-proteiner Du jobbar på ett labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein med hjälp av affinitetskromatografi. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med hjälp av affinitetskromatografi. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en kortfattad förklaring till hur denna fungerar. (4p) (Max 200 ord.) 3 av 4 poäng: A) Affinitetskromatografi är rening baserad på egenskaper hos proteinet. Ett exempel är att man kan sätta på 6 stycken histidin på proteinet på DNA nivå, sk 6xHis. Histidin har en hög affinitet för nickeljoner som man kan lägga i kolonnen. När man häller ner proteinblandningen kommer histidin att binda till nickeljonerna vilket gör att proteinet stannar i kolonnen. För att sedan få proteinet att släppa kan man använda sig av imidazol som har ännu högre affinitet för nickeljonerna för att eleduera ut proteinet. B) Man kan använda sig av SDS-Page. Då utsätter man proteinet för SDS molekyler som kommer att binda in till det. SDS molekylerna är negativt laddade och ju större protein, ju fler SDS molekyler kommer binda in, ju mer negativt laddat blir det. Sedan använder man sig av gelelektrofores (Page) för att få proteinet att röra på sig i ett elektromagnetiskt fält. Större protein kommer röra sig långsammare medan snabbare rör sig fortare. DVS Störst, sist.
309 2024-05-15 18 En ändring i entropi kan vara den huvudsakliga drivkraften för en reaktion. Nämn två sätt att ändra entropin i biokemiska reaktioner. Förklara med exempel. (4p) (Max 150 ord.) termodynamik En ändring i entropi kan vara den huvudsakliga drivkraften för en reaktion. Nämn två sätt att ändra entropin i biokemiska reaktioner. Förklara med exempel. (4p) (Max 150 ord.) 3 av 4: Entropi är ett mått på oordning. Enligt deltaG= deltaH - T deltaS. Vilket betyder att förändring i S/entropi kan man få utifrån (deltaH - deltaG)/T. Alltså kan man ändra entropin genom att ändra temperaturen. Då temperatur är mått på värmeenergi. Högre temperatur betyder mer oordning. Man kan ändra entropin genom att katalysera en reaktion med ett enzym. Enzymet minskar aktiveringsenergin som behövs för att reaktionen ska se.
310 2024-05-15 1 Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. (2p) Svagast → Starkast: A: van der Waals B: väte C: dubbel D: peptid kemiska-bindingar Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. (2p) Svagast → Starkast: A: van der Waals B: väte C: dubbel D: peptid (svar angivet i drag-och-släpp-formulär) Totalpoäng: 2
311 2024-05-15 19 Ett enzym uppvisar Michaelis-Mentens kinetik. A) Redogör för hur man i ett V mot [S] diagram kan avläsa de två konstanterna Km och Vmax. B) Förklara vad som händer med Km respektive Vmax om man tillsätter en icke-kompetitiv hämmare? (4p) (Max 150 ord.) enzymer Ett enzym uppvisar Michaelis-Mentens kinetik. A) Redogör för hur man i ett V mot [S] diagram kan avläsa de två konstanterna Km och Vmax. B) Förklara vad som händer med Km respektive Vmax om man tillsätter en icke-kompetitiv hämmare? (4p) (Max 150 ord.) A) Vmax kan avläsas som det y-värde på grafen som fås då substratoncentrationen går mot oändligheten dvs det y-värde som fås när grafen planar ut allt eftersom substratkoncentrationen ökar. Km kan avläsas som det x-värde som grafen antar då grafens y-värde är halva Vmax dvs hälften av grafens maxvärde. B) Det som sker är att Vmax kommer minska eftersom en icke-kompetitiv hämmare binder allostert till enzymet oavsett om substrat bundit eller ej och genför en konformationsändring i enzymet som gör att enzymet får sämre katalytisk förmåga dvs Vmax sänks. Däremot kommer Km att vara oförändrat då inhibitorn är oberoende av substratkoncentrationen eftersom den binder till enzymet oavsett om substrat finns och oavsett hur mycket/lite substrat som finns.
312 2024-05-15 29 Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolismen är korrekta? (2p) A: Skelettmuskel kan bara bryta ned glykogenet till glukos-6-fosfat eftersom muskelcellerna saknar enzymet glukos-6-fosfatas. B: Glykogenin är ett enzym som krävs för att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel. C: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet glukagon induceras glykogenolys i cellen. D: Glykogen upplagrat i skelettmuskel kan användas för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider. glykogen Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolismen är korrekta? (2p) A: Skelettmuskel kan bara bryta ned glykogenet till glukos-6-fosfat eftersom muskelcellerna saknar enzymet glukos-6-fosfatas. B: Glykogenin är ett enzym som krävs för att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel. C: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet glukagon induceras glykogenolys i cellen. D: Glykogen upplagrat i skelettmuskel kan användas för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider. A och B
313 2024-05-15 4 How does the partial pressure of oxygen influence binding and release of oxygen to/from hemoglobin? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words). hemoglobin How does the partial pressure of oxygen influence binding and release of oxygen to/from hemoglobin? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words). If the partial pressure is high it means that there is a high concentration of oxygen in the area which will increase the chance of oxygen binding to the hemoglobin. Once one oxygen has binded to the hemoglobin, the affinity for oxygen increases in its subunits. This occurs in the lungs, where the concentration of oxygen is very high. On the other hand, in the tissues where oxygen is needed, the partial pressure of oxygen is low which will lead to oxygen being released from the hemoglobin. Leading to the hemoglobin going inte T-state which facilitates oxygen release.
314 2024-05-15 16 Det finns tre olika typer av integrala cellmembranproteiner. Vilka? Beskriv kortfattat hur de är uppbyggda. (4p) cellmembran Det finns tre olika typer av integrala cellmembranproteiner. Vilka? Beskriv kortfattat hur de är uppbyggda. (4p) Alfa-helixar, dessa är vanliga alfahelixar som bildar en tunnel då hydrofob R-grupp är riktad utåt. Beta barrels, flera stycken antiparallella Beta flak som bildar en stor tunnel, likt en tunna. Därifrån namnet. Partiellt integrerade, dessa är alfahelixar som sitter bland de hydrofoba svansarna i membranet och sticker ut från membranet. Kan finnas på båda sidorna av membranet.
315 2024-05-15 22 Vilka två av nedanstående molekyler är mest reducerade? (2p) A: pyruvat B: glyceraldehyd 3-fosfat C: fruktos 6-fosfat D: citrat glykolysen Vilka två av nedanstående molekyler är mest reducerade? (2p) A: pyruvat B: glyceraldehyd 3-fosfat C: fruktos 6-fosfat D: citrat B & C
316 2024-05-15 32 Vilken molekyl utgör substratet som går in i pentosfosfatvägens oxidativa fas och vilka tre olika slutprodukter bildas i denna fas? (2p) Max 20 ord. pentosfosfatvägen Vilken molekyl utgör substratet som går in i pentosfosfatvägens oxidativa fas och vilka tre olika slutprodukter bildas i denna fas? (2p) Max 20 ord. 1.5 av 2: Glukos-6-fosfat går in i pentosfosfatvägen. I den oxidativa fasen bildas NADPH, Ribulose-5-fosfat och Ribos-5-fosfat.
317 2024-05-15 26 Vilka två av nedanstående enzymer katalyserar en reaktion där det sker en dekarboxylering? (2p) A: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas B: Alfaketoglutaratdehydrogenas C: Pyruvatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas citronsyracykeln Vilka två av nedanstående enzymer katalyserar en reaktion där det sker en dekarboxylering? (2p) A: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas B: Alfaketoglutaratdehydrogenas C: Pyruvatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas B och C
318 2024-05-15 12 Lac-operonet kodar för genprodukter som behövs för att bryta ner laktos. Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Allolaktos bildas av laktos och binder till CAP. B: cAMP bildas i frånvaro av glukos och binder till CAP. C: cAMP bildas i närvaro av glukos och binder till CAP. D: Allolaktos bildas av laktos och binder till lac-repressorn. kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Lac-operonet kodar för genprodukter som behövs för att bryta ner laktos. Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Allolaktos bildas av laktos och binder till CAP. B: cAMP bildas i frånvaro av glukos och binder till CAP. C: cAMP bildas i närvaro av glukos och binder till CAP. D: Allolaktos bildas av laktos och binder till lac-repressorn. B och D
319 2024-05-15 36 I vilken ordning genomförs stegen nedan när en gen ska amplifieras med rekombinant DNA-teknologi? (2p) amplifiering gelelektrofores plasmidrening transformation rekombinant-dna-teknik I vilken ordning genomförs stegen nedan när en gen ska amplifieras med rekombinant DNA-teknologi? (2p) amplifiering gelelektrofores plasmidrening transformation 1. transformation 2. amplifiering 3. plasmidrening 4. gelelektrofores
320 2024-05-15 27 I elektrontransportkedjan förflyttas elektroner mellan olika komponenter. Redogör för två förutsättningar för att förflyttningen ska fungera. (4p) (Max 80 ord.) elektrontransportkedjan I elektrontransportkedjan förflyttas elektroner mellan olika komponenter. Redogör för två förutsättningar för att förflyttningen ska fungera. (4p) (Max 80 ord.) Redoxpotentialen måste vara högre hos den som tar emot elektronen. Tex när FMNH2 lämnar över elektronerna till Q. Det fungerar då Q har en högre redoxpotential än FMNH2. Det är viktigt att påpeka att de olika komponenterna måste vara tillräckligt nära varandra också för att plocka upp elektronerna. Det måste också finnas en molekyl som tillslut plockar upp elektronerna, denna är O2. Syre kommet plocka upp elektronerna och reagera med protoner för att bilda vatten.
321 2024-05-15 13 Beskriv nukleosomens (Nucleosome core particle) uppbyggnad. Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade. (4p) kromatin Beskriv nukleosomens (Nucleosome core particle) uppbyggnad. Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade. (4p) Nukleosomen består av en kärna (en oktamer) på 8 histoner (2st H2A, 2st H2B, 2st H3, 2st H4). Den har också 146 baspar DNA som är lindat 1,75 varv runt oktameren. Dessutom ligger histonen H1 (som inte är lika konserverad som övriga ovannämda histoner) utanpå kärnan och binder till linker DNA (DNAt mellan nukelosomerna) och stabiliserar nukleosomen. H3 och H4 har även N-terminala svansar som ligger runt DNAt som är lindat runt oktameren och reglerar DNAts packning till nukleosomkärnan.
322 2024-05-15 17 Proteinet på bilden utför transport. ![[Pasted image 20251129235458.png]] A) Ange vilken grupp av transportörer proteinet tillhör och vad som karaktäriserar denna grupp av transportörer? B) I vilket av cellens membran finns transportören? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord. transport-över-cellmembran Proteinet på bilden utför transport. ![[Pasted image 20251129235458.png]] A) Ange vilken grupp av transportörer proteinet tillhör och vad som karaktäriserar denna grupp av transportörer? B) I vilket av cellens membran finns transportören? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord. A) Antiport som är en aktiv transportör av 2 olika föreningar som transporteras åt olika håll (en in och en ut) B) I mitokondriets inre membran C) Den elektrokemiska gradienten av vätejoner mellan MMU och matrix.
323 2024-05-15 23 En morgon när du var sen blev du tvungen att springa för att hinna med spårvagnen. Efter ett tag smärtade lårmusklerna och kort därefter blev de stumma. Förklara vad som har hänt metaboliskt på molekylär nivå och varför det har inträffat. (4p) (Max 100 ord.) glukosmetabolism En morgon när du var sen blev du tvungen att springa för att hinna med spårvagnen. Efter ett tag smärtade lårmusklerna och kort därefter blev de stumma. Förklara vad som har hänt metaboliskt på molekylär nivå och varför det har inträffat. (4p) (Max 100 ord.) Det har skett då man har sprungit, en snabb explosiv aktivitet, så har lite syre blivit upptagit. Detta har lett till att glykolysen som skett i musklerna har skett i anaeroba förhållanden. Detta har lett till att pyruvat som är slutprodukten i glykolysen, har reagerat med NADH (som behöver släppa av elektronerna till syret i elektrontransportkedjan vid aeroba förhållanden) som bildats tidigare i processen, katalyserat av laktatdehydrogenas för att bilda laktat, så NAD+ kan återbildas. Laktat i sin tur har sänkt pH:t i musklerna vilket har lett till smärtan. Laktatet kommer sedan transporteras till levern för att omvandlas till glukos.
324 2024-05-15 33 Beskriv schematiskt hur nedbrytningen och utsöndringen av heme går till, samt ange i vilka organ/vävnader de olika stegen sker. (4p) heme Beskriv schematiskt hur nedbrytningen och utsöndringen av heme går till, samt ange i vilka organ/vävnader de olika stegen sker. (4p) Erytrocyter bryts ned i mjälten. Från erytrocyterna kommer hemoglobin att frisläppas. Hemoglobinet bryts ned till fria aminosyror och heme. Heme kommer att brytas ned till biliverdin som kommer att omvandlas till bilirubin. Bilirubin är okonjugerat dvs fettlöslig och ej vattenlöslig, därför kommer det transporteras till levern med hjälp av albumin. I levern kommer bilirubin att konjugera genom att bindas med gluturonsyra vilket kommer att göra den amfipatisk och vattenlöslig. Det konjugerade bilirubinet kommer sedan utsöndras från levern med gallan till tarmarna. Där det sedan kan utsöndras genom avföring.
325 2024-05-15 24 Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter: fosfoenolpyruvat laktat oxalacetat succinat Vägar: citronsyracykeln Coricykeln glukoneogenes glykolysen glukoneogenes Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter: fosfoenolpyruvat laktat oxalacetat succinat Vägar: citronsyracykeln Coricykeln glukoneogenes glykolysen fosfoenolpyruvat: glykolysen laktat: Coricykeln oxalacetat: glukoneogenes succinat: citronsyracykeln
326 2024-05-15 10 Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en Watson–Crick helix. Vilka två påståenden är korrekta? (2p) A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning från 5´ till 3´. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är högervriden. nukleotider Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en Watson–Crick helix. Vilka två påståenden är korrekta? (2p) A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning från 5´ till 3´. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är högervriden. C och D
327 2024-05-15 9 Initiering av eukaryot DNA-replikation är en noggrant reglerad process. A) I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin. B) I vilken fas av cellcykeln binder Cdc45 och GINS till MCM-helikaset? C) Vad heter det proteinkomplex som är bundet till replikationsorigin under hela cellcykeln? D) Vad gör CMG-helikaset när DNA-replikationen skall initieras? (4p) (Max 15 ord.) dna-replikation Initiering av eukaryot DNA-replikation är en noggrant reglerad process. A) I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin. B) I vilken fas av cellcykeln binder Cdc45 och GINS till MCM-helikaset? C) Vad heter det proteinkomplex som är bundet till replikationsorigin under hela cellcykeln? D) Vad gör CMG-helikaset när DNA-replikationen skall initieras? (4p) (Max 15 ord.) A) G-fasen. B) S1-fasen. C) ORC, origin recognition complex. D) Smälter DNA-strängarna, dvs separerar dem.
328 2024-05-15 34 Vilka två av följande påståenden stämmer för kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? (2p) A: Kolesterol kan vid svält brytas ned till acetyl-CoA, som kan gå in i citronsyra-cykeln. B: En korrekt kolesterolkoncentration i cellens membran är viktig, då kolesterolkoncentrationen avgör membranets stelhet. C: Kolesterol och 7-dehydrokolesterol utgör utgångsmaterialet för syntes av steroidhormoner respektive D-vitamin. D: Kolesterol kan hos de flesta däggdjur (inklusive människa) endast syntetiseras i leverns celler (hepatocyter). kolesterol Vilka två av följande påståenden stämmer för kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? (2p) A: Kolesterol kan vid svält brytas ned till acetyl-CoA, som kan gå in i citronsyra-cykeln. B: En korrekt kolesterolkoncentration i cellens membran är viktig, då kolesterolkoncentrationen avgör membranets stelhet. C: Kolesterol och 7-dehydrokolesterol utgör utgångsmaterialet för syntes av steroidhormoner respektive D-vitamin. D: Kolesterol kan hos de flesta däggdjur (inklusive människa) endast syntetiseras i leverns celler (hepatocyter). B och C
329 2024-05-15 14 Vilken roll har fMet (N-formylmetionin) i initiering av translation? Beskriv kortfattat translationens initieringsprocess där fMet används. (4p) (Max 150 ord.) translation Vilken roll har fMet (N-formylmetionin) i initiering av translation? Beskriv kortfattat translationens initieringsprocess där fMet används. (4p) (Max 150 ord.) fMet finns enbart i prokaryoter. I eukaryota celler används istället Met. I prokaryot translation så initieras den genom att IF1 hittar en Shine-Delgarno sekvens, där binder sedan den lila ribosomala enheten in och letar tills ett AUG (startkodon) hittas. Denna startkodon kodar för aminosyran fMet som kommer bindas in då den sitter bundet till en tRNA-molekyl. tRNA:t binds in med hjälp av IF2 och sedan kommer den stora ribosomala enheten att binda in med hjälp av GTP. Alltså är fMet den första aminosyran som binder in, till startkodonet, i prokaryot translation.
330 2024-05-15 20 Om ∆G°´ för reaktionen A → B är -40 kJ/mol under standardförhållanden så… (2p) Välj de två korrekta alternativen: A: kommer den att fortsätta i snabb takt. B: är den långt ifrån jämvikt. C: kommer den att gå från vänster till höger spontant. D: kommer den aldrig att nå jämvikt. termodynamik Om ∆G°´ för reaktionen A → B är -40 kJ/mol under standardförhållanden så… (2p) Välj de två korrekta alternativen: A: kommer den att fortsätta i snabb takt. B: är den långt ifrån jämvikt. C: kommer den att gå från vänster till höger spontant. D: kommer den aldrig att nå jämvikt. B och C
331 2024-05-15 30 Allopurinol är en så kallad hypoxantinanalog som inhiberar nedbrytning av purin-nukleotider till urat. Vilket enzym hämmar denna läkemedelssubstans och vid vilken sjukdom används allopurinol som läkemedel? (2p) (Max 20 ord.) nukleotidnedbrytning Allopurinol är en så kallad hypoxantinanalog som inhiberar nedbrytning av purin-nukleotider till urat. Vilket enzym hämmar denna läkemedelssubstans och vid vilken sjukdom används allopurinol som läkemedel? (2p) (Max 20 ord.) Allopurinol hämmar enzymet xantinoxidas. Detta används vid sjukdomen gikt som beror på ökad uratnivå i kroppen.
332 2024-05-15 15 Vilka är det två viktigaste principerna bakom evolutionen? Beskriv med ett valfritt exempel hur dessa två principer är viktiga för att möjliggöra uppkomsten av nya arter/fenotyper/funktioner. (4p) (Max 150 ord.) evolution Vilka är det två viktigaste principerna bakom evolutionen? Beskriv med ett valfritt exempel hur dessa två principer är viktiga för att möjliggöra uppkomsten av nya arter/fenotyper/funktioner. (4p) (Max 150 ord.) Variation: Att det ska finnas ett brett urval av olika gener i en population. Detta stora urvalet leder till att olika individer inom samma art är olika bra anpassade. Tex om en individ från en art som i vanliga fall bara klarar varmare områden, får en gen som leder till att den klarar av kyla bättre, då kommer denna individ kunna migrera till kallare områden, eller överleva ifall kallare tider kommer. Detta gör att två individer från samma art kan utvecklas iväg från varandra, en i det varmare och en i det kallare. Naturligt urval/Survival of the fittest: Den säger att den som är best anpassad överlever. Samma exempel. Ifall en längre isperiod skulle börja så kommer de som har bäst kan anpassa sig, tex som att de kan växa extra mycket päls för att hålla inne värmen, kommer överleva medan de som ej kan anpassa sig kommer dö.
333 2024-05-15 21 Förklara vad ett kinas gör. (2p) (Max 20 ord.) enzymer Förklara vad ett kinas gör. (2p) (Max 20 ord.) Ett kinas katalyserar en reaktion där en fosfatgrupp sätts på ett substrat. Tex hexokinas som sätter på fosfat på glukos.
334 2024-05-15 31 Till vilka aminosyror kan nedanstående två alfa-ketosyror omvandlas i ett steg via transamineringsreaktioner? Ange även det fullständiga namnet på enzymet som katalyserar bildningen av respektive aminosyra. A) pyruvat B) oxalacetat (4p) (Max 20 ord.) aminosyrametabolism Till vilka aminosyror kan nedanstående två alfa-ketosyror omvandlas i ett steg via transamineringsreaktioner? Ange även det fullständiga namnet på enzymet som katalyserar bildningen av respektive aminosyra. A) pyruvat B) oxalacetat (4p) (Max 20 ord.) A) Pyruvat kan omvandlas till alanin mha enzymet alaninaminotransferas. B) Oxalacetat kan omvandlas till aspartat mha enzymet aspartataminotransferas.
335 2024-05-15 25 Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. En typ av reglering av komplexet sker via fosforylering. A) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? B) Vad händer med komplexets aktivitet när det fosforyleras? C) Redogör för hur energikvoten påverkar fosforyleringen av komplexet. (4p) (Max 100 ord) integrering-av-metabolismen Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. En typ av reglering av komplexet sker via fosforylering. A) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? B) Vad händer med komplexets aktivitet när det fosforyleras? C) Redogör för hur energikvoten påverkar fosforyleringen av komplexet. (4p) (Max 100 ord) A) PDH-komplexet katalyserar omvandlingen av pyruvat till Acetyl-CoA, detta är mellansteget mellan glykolys och citronsyracykeln. Det är viktigt det regleras så rätt mängd energi utvinns. Så att vi inte genererar ATP när vi ej behöver, tillexempel glukoneogenesen behövs sättas igång så vi kan omvandla pyruvat till glukos eller så att det istället lagras i kroppen. B) Komplexet kommer inhiberas vid fosforylering. C) Ifall energikvoten är hög, dvs mycket ATP finns kommer det att kunna hämma komplexet då fosforyleringen av komplexet kräver ATP. Då en fosfatgrupp kommer sättas på komplexet. Ifall hög mängd ADP finns kommer det ej att fosforylera komplexet.
336 2024-05-15 11 Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription samverkar flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två påståenden om denna process stämmer? (2p) A: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikasaktivitet. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TBP ingår som en subenhet i det större TFIIF-komplexet. D: TBP binder till TATA-boxen. rna-syntes Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription samverkar flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två påståenden om denna process stämmer? (2p) A: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikasaktivitet. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TBP ingår som en subenhet i det större TFIIF-komplexet. D: TBP binder till TATA-boxen. A och D
337 2024-05-15 8 Nukleotider bygger upp RNA och DNA. A) Vilken kemisk grupp finns i 2’-positionen hos ribonukleotider? B) I vilken position på sockret sitter kvävebasen? C) I vilken position på sockret sitter fosfatgruppen? D) Vad är dGDP förkortning för? (4p) nukleotider Nukleotider bygger upp RNA och DNA. A) Vilken kemisk grupp finns i 2’-positionen hos ribonukleotider? B) I vilken position på sockret sitter kvävebasen? C) I vilken position på sockret sitter fosfatgruppen? D) Vad är dGDP förkortning för? (4p) A) Hydroxylgrupp (OH-grupp) B) På 1'-kolet C) På 5'-kolet D) Deoxyguanosin 5'-difosfat
338 2024-05-15 35 Du befinner dig i labsalen när det plötsligt börjar brinna i en bägare med etanol. Efter att ha uppmärksammat de övriga i labbet på branden och konstaterat att den är begränsad bestämmer du dig för att släcka den. På labbet hittar du brandsläckare för bränder av klass A–C. A) Vad avses med bränder klass A, B och C? B) Förklara vilken klass av brand som har uppstått. (4p) Max 80 ord. introduktionslaboration Du befinner dig i labsalen när det plötsligt börjar brinna i en bägare med etanol. Efter att ha uppmärksammat de övriga i labbet på branden och konstaterat att den är begränsad bestämmer du dig för att släcka den. På labbet hittar du brandsläckare för bränder av klass A–C. A) Vad avses med bränder klass A, B och C? B) Förklara vilken klass av brand som har uppstått. (4p) Max 80 ord. 3 av 4: A= brand i textilier/trä B=brand i vätskor/alkoholer C=brand i gaser Det är en typ B brand som uppstått då etanol är en alkohol.
339 2024-05-15 3 Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för proteiners sekundärstruktur? (2p) A: En dubbelhelix är en av de två vanligaste formerna. B: Identiska aminosyrasekvenser kan ha olika sekundärstruktur i olika proteiner. C: Den stabiliseras av vätebindningar mellan aminosyrornas R-grupper. D: Olika sekundärstrukturdelar hos ett protein kan bindas samman med loopar. från-aminosyror-till-proteiner Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för proteiners sekundärstruktur? (2p) A: En dubbelhelix är en av de två vanligaste formerna. B: Identiska aminosyrasekvenser kan ha olika sekundärstruktur i olika proteiner. C: Den stabiliseras av vätebindningar mellan aminosyrornas R-grupper. D: Olika sekundärstrukturdelar hos ett protein kan bindas samman med loopar. (svar angivet i flervalsformulär) Totalpoäng: 2
340 2024-05-15 7 Laktosintolerans och galaktosemi: ge ett exempel på vad som är gemensamt för dessa tillstånd och ett exempel på vad som skiljer dem åt. (4p) (Max 200 ord.) kolhydrater Laktosintolerans och galaktosemi: ge ett exempel på vad som är gemensamt för dessa tillstånd och ett exempel på vad som skiljer dem åt. (4p) (Max 200 ord.) Gemensamt: Båda två sjukdomar beror på brist på funktion eller brist på respektive enzym som bryter ned laktos respektive galaktos. Skillnad: Laktosintolerans är brist på enzymet laktas som bryter ned laktos till galaktos och glukos, det leder till att kroppen ej bryter ned laktos i GI-kanalen, detta leder till att laktos kommer hamna i tarmarna där det kan jäsa vilket leder till magsmärtor, diarré och gasbildning. Galaktosemi beror på bristande funktion eller brist på enzymerna (en av dem är GALT) som omvandlar galaktos till glukos. Galaktos kan ta upp av tarmcellerna tillskillnad från laktos. Detta leder till ökad nivå av galaktos i plasman, galaktos blir till galaktilol som är ett toxiskt ämne. Detta kan leda till neurologisk skador och i värsta fall död. Alltså är skillnaden vart de kommer ansamlas och påverkan på kroppen.
341 2024-05-15 6 Du är läkare på en vårdcentral och en patient har frågor om de prover som du just ordinerat i en ”lipidstatus”. Du tar hjälp av en ritning du lärde dig göra när du läste biokemi under din grundutbildning för att börja svara på frågan. A) Rita den principiella strukturen för den molekyl som framför allt används för att lagra energi i kroppen. B) Vilken sorts lipoprotein skickar levern ut i blodet för att transportera energilagringsmolekylen till resten av kroppens celler? 1 ord räcker som svar. (4p) lipider Du är läkare på en vårdcentral och en patient har frågor om de prover som du just ordinerat i en ”lipidstatus”. Du tar hjälp av en ritning du lärde dig göra när du läste biokemi under din grundutbildning för att börja svara på frågan. A) Rita den principiella strukturen för den molekyl som framför allt används för att lagra energi i kroppen. B) Vilken sorts lipoprotein skickar levern ut i blodet för att transportera energilagringsmolekylen till resten av kroppens celler? 1 ord räcker som svar. (4p) A) Triacylglycerol (TAG). B) VLDL. ![[Pasted image 20251129235437.png]] (Ritning på TAG-struktur finns på sida 11 i original-PDF.)
342 2024-05-15 2 På bilden visas en tripeptid. ![[Pasted image 20251129235411.png]] A) Ange vilken aminosyra som finns på C-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. B) Ange vilken aminosyra som finns på N-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. (4p) (Max 25 ord.) från-aminosyror-till-proteiner På bilden visas en tripeptid. ![[Pasted image 20251129235411.png]] A) Ange vilken aminosyra som finns på C-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. B) Ange vilken aminosyra som finns på N-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. (4p) (Max 25 ord.) A) Asparginsyra, en syra. Kan binda mha elektrostatiska interaktioner då den är negativt laddad. B) Glycin, en alifatisk aminosyra. Opolär.
343 2022-12-19 28 I elektrontransportkedjan pumpas protoner när elektroner förflyttas mellan olika komponenter. A) Var i elektrontransportkedjan pumpas protoner? B) Vilken är drivkraften bakom protonpumpningen? Max 50 ord. elektrontransportkedjan I elektrontransportkedjan pumpas protoner när elektroner förflyttas mellan olika komponenter. A) Var i elektrontransportkedjan pumpas protoner? B) Vilken är drivkraften bakom protonpumpningen? Max 50 ord. A) I komplex I, III och IV B) I elektrontransportkedjans komplex flyttas elektroner från komponenter med lägre redoxpotential till komponenter med högre. Detta är en energimässigt gynnsam process och energin kan då utnyttjas för att pumpa protoner från matrix till mellanmembransutrymmet mot gradienten. Energin omvandlas då till elektrokemisk energi.
344 2022-12-19 5 Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att köra affinitetskromatografi med en 6xHis-tag. A) Beskriv kortfattat principen för affinitetskromatografi. B) Hur kan man eluera proteinet? C) Ange en metod som kan användas för analys av det eluerade proteinet. Max 200 ord. utforska-proteiner Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att köra affinitetskromatografi med en 6xHis-tag. A) Beskriv kortfattat principen för affinitetskromatografi. B) Hur kan man eluera proteinet? C) Ange en metod som kan användas för analys av det eluerade proteinet. Max 200 ord. A) Affinitetskromatografi är en kromatografimetod som bygger på att separera proteiner baserat på en viss egeskap. Exempelvis kan glykosylerade proteiner separeras ut genom att kulorna i kolonnen har molekyler som binder till sockerenheterna. Man kan även, som i detta fall, modifiera DNA-sekvensen för proteinet man är ute efter genom att lägga till en tag av histidin vilken binder väl till nickeljoner på kulorna. B) För att få proteinet att lossna från kulorna krävs att man eluerar. Det kan ske med hjälp av en stark buffert eller saltlösning, ofta en kombination av båda. C) Gelelektrofores, SDS-PAGE, kan användas för att analysera proteinets storlek samt hur väl proteinreningen lyckats.
345 2022-12-19 18 Diffusion är en viktig process för att fördela molekyler i gaser och vätskor. Vad beror den på och vilken termodynamisk drivkraft finns bakom den? termodynamik Diffusion är en viktig process för att fördela molekyler i gaser och vätskor. Vad beror den på och vilken termodynamisk drivkraft finns bakom den? 1.5p Diffusion beror på att det finns många fler sätt för ett ämne i en vätska eller gas att vara oordnat än ordnat, alltså är sannolikheten för ett oordnat tillstånd större och molekylerna kommer då till följd av sin konstanta rörelse att hamna i ett oordnat tillstånd. Den termodynamiska drivkraften bakom diffusion är således termodynamikens andra lag, att ett system tenderar att gå mot mer oordnade tillstånd, alltså att entropin ökar. 2.0p Brownsk rörelse (stavning?) innebär att en liten molekyl har större sannolikhet att inte stöta på något (annan molekyl) på ena sidan än andra. Det leder till att molekyler rör sig mot där det är mindre molekyl-tätt, och således sprids ämnet jämt. Ämnet vill fördela sig, eftersom att ha det ordnat = låg entropi => ofördelaktigt (om molekylen är löslig i sin omgiving, om olja i vatten är det mer fördelaktigt att oljan är samlad i en stor klump)
346 2022-12-19 1 Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. Jon Peptid van der Waals Väte kemiska-bindingar Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. Jon Peptid van der Waals Väte 1. van der Waals 2. Väte 3. Jon 4. Peptid
347 2022-12-19 19 Vilka påståenden om övergångstillståndet för en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det har högre energi än för en icke-katalyserad reaktion. B: Det har lägre energi än reaktionens substrat. C: Det är mycket kortvarigt. D: Det har lägre energi än för en icke-katalyserad reaktion. enzymer Vilka påståenden om övergångstillståndet för en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det har högre energi än för en icke-katalyserad reaktion. B: Det har lägre energi än reaktionens substrat. C: Det är mycket kortvarigt. D: Det har lägre energi än för en icke-katalyserad reaktion. Rätt svar 1. C 2. D
348 2022-12-19 29 I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzym i den processen? alfaketoglutaratdehydrogenas glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas malatdehydrogenas pyruvatdehydrogenas integrering-av-metabolismen I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzym i den processen? alfaketoglutaratdehydrogenas glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas malatdehydrogenas pyruvatdehydrogenas 1. glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas 2. pyruvatdehydrogenas 3. alfaketoglutaratdehydrogenas 4. malatdehydrogenas
349 2022-12-19 4 Hemoglobin och myoglobin innehåller den prostetiska gruppen heme. Denna innehåller ett järn (Fe²⁺) som ansvarar för inbindningen av syremolekyler. Beskriv varför bindning till syre påverkar hemoglobinets struktur och hur det i sin tur påverkar hemoglobinets syreaffinitet. Max 70 ord. hemoglobin Hemoglobin och myoglobin innehåller den prostetiska gruppen heme. Denna innehåller ett järn (Fe²⁺) som ansvarar för inbindningen av syremolekyler. Beskriv varför bindning till syre påverkar hemoglobinets struktur och hur det i sin tur påverkar hemoglobinets syreaffinitet. Max 70 ord. Järnatomens storlek gör att den inte får plats i mitten av hemegruppen. När syre binder in blir järnets atommoln mindre och kan således flyttas upp 0,4 Å in i hemeplanet. Då kommer även det proximala histidinet kopplat till järnet att flyttas upp samt den alfahelix den är kopplad till. Det påverkar strukturen på hemoglobinet där subenheterna totalt kommer vridas upp 15 grader till R-state med ökad affinitet för syre.
350 2022-12-19 16 Vilka påståenden om det eukaryota cellmembranet är korrekta? A: Fosfatidylserin finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. B: Kolesterol finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. C: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cellens utsida. D: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cytoplasman. cellmembran Vilka påståenden om det eukaryota cellmembranet är korrekta? A: Fosfatidylserin finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. B: Kolesterol finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. C: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cellens utsida. D: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cytoplasman. Rätt svar 1. A 2. C
351 2022-12-19 22 Ett enzym uppvisar Michaelis–Menten-kinetik. Behöver du känna till den totala enzymkoncentrationen för att bestämma konstanterna (i) Kₘ, (ii) Vmax eller (iii) kcat? Motivera ditt svar. ![[Pasted image 20251128085625.png]] enzymer Ett enzym uppvisar Michaelis–Menten-kinetik. Behöver du känna till den totala enzymkoncentrationen för att bestämma konstanterna (i) Kₘ, (ii) Vmax eller (iii) kcat? Motivera ditt svar. ![[Pasted image 20251128085625.png]] Vmax motsvarar den maximala reaktionshastighet som är möjlig för en enzymkatalyserad reaktion och uppnås då alla enzym är bundna i enzym-substratkomplex. Vmax beror alltså av enzymkoncentratonen. Kₘ motsvarar den substratkoncentration då V = Vmax/2, alltså när hälften av enzymen har bundit substratet och är upptagna med katalys. Kₘ och Vmax kan bestämmas experimentellt för en reaktion genom att mäta den initiella reaktionshastigheten för varierande substratkoncentrationer men med samma enzymkoncentration. Värdena förs in i ett diagram där reaktionshastigheten blir en funktion av substratkoncentrationen (se nedan). När substratkoncentrationen går mot oändligheten kommer då V gå mot Vmax och man kan då matematiskt bestämma Vmax utan att känna till den exakta enzymkoncentrationen. Kₘ kan sedan bestämmas utifrån vid vilken substratkoncentration som V = Vmax/2. kcat är ett mått på hur många molekyler produkt som bildas per sekund och enzym, turnover number, och räknas således fram ur den maximala reaktionshastigheten dividerat med den totala enzymkoncentrationen. För att bestämma kcat krävs alltså att känna till den maximala enzymkoncentrationen.
352 2022-12-19 32 Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? A: Den huvudsakliga regleringspunkten i pentosfosfatvägen är enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas. B: Ribulos-5-fosfat kan omvandlas till glukos-6-fosfat i den reversibla oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. C: NADPH är ett mycket viktigt oxidationsmedel i celler. D: Nedsatt funktion i pentosfosfatvägen kan orsaka hemolytisk anemi. Rätt svar pentosfosfatvägen Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? A: Den huvudsakliga regleringspunkten i pentosfosfatvägen är enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas. B: Ribulos-5-fosfat kan omvandlas till glukos-6-fosfat i den reversibla oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. C: NADPH är ett mycket viktigt oxidationsmedel i celler. D: Nedsatt funktion i pentosfosfatvägen kan orsaka hemolytisk anemi. Rätt svar A och D
353 2022-12-19 26 A) Vilka två enzymer hjälps åt att återuppbygga en delvis nedbruten glykogenpartikel genom att addera nya glukosenheter till strukturen? B) Vilken typ av bindning skapar respektive enzym? glykogen A) Vilka två enzymer hjälps åt att återuppbygga en delvis nedbruten glykogenpartikel genom att addera nya glukosenheter till strukturen? B) Vilken typ av bindning skapar respektive enzym? A) En delvis nedbruten glykogenpartikel har redan en primer i form av glykogenin, alltså behöver bara kedjorna elongeras och förgreningar bildas. Glykogensyntas kommer att förlänga kedjorna genom att addera glukosenheter medan branching enzyme kommer skapa förgreningar genom att flytta 7 glukosenheter. B) Glykogensyntas – alfa 1–4 glykosidbindning Branching enzyme – alfa 1–6 glykosidbindning
354 2022-12-19 12 Vilka två av följande alternativ beskriver funktioner för poly-A-svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? A: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Stimulerar translation. D: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid. rna-syntes Vilka två av följande alternativ beskriver funktioner för poly-A-svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? A: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Stimulerar translation. D: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid. Rätt svar 1. C 2. D
355 2022-12-19 27 A) Vilka molekyler av betydelse för energiomvandling bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Varför är citronsyracykeln inte aktiv i frånvaro av syre? Max 50 ord. citronsyracykeln A) Vilka molekyler av betydelse för energiomvandling bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Varför är citronsyracykeln inte aktiv i frånvaro av syre? Max 50 ord. A) 3 NADH och 1 FADH₂ B) För att citronsyracykeln ska ske krävs att det finns mitokondriellt NAD⁺ och FAD. Utan syre avstannar elektrontransportkedjan då syre behövs i komplex IV och därmed kan inte NADH och FADH₂ oxideras vilket är det enda sättet att återbilda NAD⁺ och FAD i mitokondriens matrix.
356 2022-12-19 13 Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. rna-syntes Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. Rätt svar 1. A 2. D
357 2022-12-19 17 Proteinet på bilden förflyttas till plasmamembranet hos skelettmuskler som ett svar på insulinsignalering. A) Vilken är transportören? B) Vilken typ av transport sker? C) Vad händer med glukos när den kommit in i cellen och varför? Max 50 ord. ![[Pasted image 20251128085555.png]] transport-över-cellmembran Proteinet på bilden förflyttas till plasmamembranet hos skelettmuskler som ett svar på insulinsignalering. A) Vilken är transportören? B) Vilken typ av transport sker? C) Vad händer med glukos när den kommit in i cellen och varför? Max 50 ord. ![[Pasted image 20251128085555.png]] A) GLUT-4 B) Faciliterad diffusion C) Den kommer genom enzymet Hexokinas och förbrukning av 1 ATP bilda glukos 6-fosfat. Fosforyleringen gör att bärarproteinet inte längre känner igen glukosmolekylen och därmed kan den inte transporteras ut igen utan kommer, beroende på energikvoten, brytas ned i glykolysen eller användas för uppbyggnad av glykogen.
358 2022-12-19 23 Vad har molekylerna NADH, ATP, CoA och FADH₂ gemensamt? A: De är kinetiskt stabila. B: De är kinetiskt instabila. C: De är termodynamiskt stabila. D: De är termodynamiskt instabila. integrering-av-metabolismen Vad har molekylerna NADH, ATP, CoA och FADH₂ gemensamt? A: De är kinetiskt stabila. B: De är kinetiskt instabila. C: De är termodynamiskt stabila. D: De är termodynamiskt instabila. A och D
359 2022-12-19 33 Vilka av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? A: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol till en fettsyra. B: Den regleras främst via tillgången på fritt extracellulärt kolesterol. C: Den regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet HMG-CoA-reduktas. D: Att bilda kolesterolestrar är i de flesta celler irreversibelt – för att återbildas till kolesterol behöver kolesterolestern först transporteras till levern via HDL. Rätt svar kolesterol Vilka av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? A: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol till en fettsyra. B: Den regleras främst via tillgången på fritt extracellulärt kolesterol. C: Den regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet HMG-CoA-reduktas. D: Att bilda kolesterolestrar är i de flesta celler irreversibelt – för att återbildas till kolesterol behöver kolesterolestern först transporteras till levern via HDL. Rätt svar A och C
360 2022-12-19 24 Det pyruvat som bildas vid anaerob glykolys behöver metaboliseras vidare. A) Vad bildas av pyruvatet? B) Vilken är orsaken till det? C) Vilket enzym katalyserar reaktionen? Max 50 ord. glukosmetabolism Det pyruvat som bildas vid anaerob glykolys behöver metaboliseras vidare. A) Vad bildas av pyruvatet? B) Vilken är orsaken till det? C) Vilket enzym katalyserar reaktionen? Max 50 ord. A) Laktat B) Cellen behöver återbilda NAD⁺ i cytoplasman för att inte glykolysen ska avstanna då det krävs i steg 6. Vid anaerob glykolys sker detta genom fermentering där pyruvat reduceras till laktat och NADH oxideras till NAD⁺. C) Laktatdehydrogenas
361 2022-12-19 10 Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en Watson–Crick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Helixen är högervriden. D: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'. nukleotider Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en Watson–Crick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Helixen är högervriden. D: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'. Rätt svar 1. A 2. C
362 2022-12-19 9 A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Vilken form har denna faktor? dna-replikation A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Vilken form har denna faktor? A) PCNA, eller sliding clamp som den också kallas, har funktionen att den sitter runt en av DNA-strängarna under replikation och håller fast DNA-polymeras på strängen. Det gör att processiviteten ökar upp till 50 gånger jämfört med utan PCNA då DNA-polymeras kan syntetisera långa sträckor DNA utan att ramla av. B) Ringformad
363 2022-12-19 34 Beskriv vad som karaktäriserar plasmider med konformationen supercoiled respektive relaxerad cirkulär, hur de bildas och hur de kan skiljas åt med gelelektrofores. Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska i tabellform eller i fritext. Max 75 ord. plasmid Beskriv vad som karaktäriserar plasmider med konformationen supercoiled respektive relaxerad cirkulär, hur de bildas och hur de kan skiljas åt med gelelektrofores. Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska i tabellform eller i fritext. Max 75 ord. I supercoiled kommer DNAt i plasmiden vara överdrivet tvinnat, så kallat supercoiled med högre linkingnumber än normalt. Därmed kommer det bildas en linjär struktur. I relaxerad cirkulär är plasmiden istället ringformat. De två olika konformationerna kommer möta olika stort motstånd av gelen under gelelektrofores till följd av att de har olika form och de kan således separeras baserat på att de kommer färdas olika långt. ![[Pasted image 20251128085752.png]]
364 2022-12-19 14 Beskriv sekundärstrukturen hos molekylen som transporterar aminosyror till ribosomen och förklara vilken funktionen är för varje del av strukturen. Rita gärna. ![[Pasted image 20251128085533.png]] translation Beskriv sekundärstrukturen hos molekylen som transporterar aminosyror till ribosomen och förklara vilken funktionen är för varje del av strukturen. Rita gärna. ![[Pasted image 20251128085533.png]] Strukturen som transporterar aminosyror till ribosomen kallas tRNA och byggs upp av RNA. I 2D, sekundärstruktur, är tRNA klöverformad och stabiliseras av vätebindningar mellan komplementära baspar i RNA kedjan. Den nedersta loopen, Antikodon loopen, innehåller ett antikodon på tre baser som är komplementärt till kodonet på mRNA och därmed aggerar som mellanhand mellan kodon och aminosyra vilket möjliggör för den genetiska koden. De andra två looparna spelar roll för interaktioner med exempelvis aminoacyl-tRNA syntetaser som kopplar ihop rätt aminosyra med rätt tRNA. De bidrar alltså till identifiering av det specifika tRNA:t. 5'-änden av tRNA kedjan är fosforylerad och i 3'-änden sitter en CCA-sekvens, så kallad acceptor stem. Till den fria OH-gruppen på 3'-änden av adenosin i acceptor stem kopplas aminosyran av aminoacyl-tRNA syntetaser.
365 2022-12-19 20 Redogör för hur heme bryts ner och utsöndras. (2p) heme Redogör för hur heme bryts ner och utsöndras. (2p) Heme bryts ner i mjälten när röda blodkroppar bryts ner. Först bildas biliverdin som sedan omvandlas till bilirubin. Då bilirubin är en hydrofob molekyl kommer den att transporteras bunden till blodproteinet albumin via blodet till levern. I levern kommer bilirubinet konjugeras och då bli amfipatiskt för att sedan utsöndras via gallan.
366 2022-12-19 30 Nämn två aminosyror som genom transaminering kan omvandlas till citronsyracykelintermediärer vilket gör dem till glukogena aminosyror. Ange även vilken citronsyracykelintermediär respektive aminosyra bildar. aminosyrametabolism Nämn två aminosyror som genom transaminering kan omvandlas till citronsyracykelintermediärer vilket gör dem till glukogena aminosyror. Ange även vilken citronsyracykelintermediär respektive aminosyra bildar. Glutamat kan omvandlas till alfaketoglutarat Aspartat kan omvandlas till oxalacetat
367 2022-12-19 15 Cancerceller utvecklas från normala celler. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till. evolution Cancerceller utvecklas från normala celler. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till. 2.0p Evolution beror på variation och naturligt urval. Det sker mutationer "ofta", vilket ökar variationen inom en population. Många gånger är mutationen som uppstår sämre och försvinner. Ibland är en mutation bra och den blir selekterad (survival of the fittest) och lever kvar inom en population (evolution) Vid cancer så sker likaså mutationer, det kan vara mutationer som stör delningsprocessen i en cell (så att den ohämmat delar sig) eller mutationer som hämmar vårt immunsystem (vi kan ej bekämpa tumörer, p53). Cancerceller utvecklas alltså från våra egna celler (fast de är muterade och orsakar sjukdom). Cancerceller genomgår också mutationer. "Vanligt" är mutationer som stimulerar ohämmad delning och gör dem mer maligna. Cancerceller har en variation som gör dem "starka" och tar därför över i kroppen. 1.5p Evolutionen utgår från att det finns en genetisk variation och ett naturligt urval där de egenskaper som gynnar överlevnad i den aktuella miljön kommer föras vidare till nästa generation i större utsträckning. Genetisk variation uppnås bland annat genom slumpmässiga spontana mutationer i DNA. Mutationer kan då uppkomma i en cell som stänger av en tumörsupressorgen vilket då är "gynnsamt" för den individuella cellen som kan fortsätta dela sig. Andra mutationer kan då uppstå i en gen som kodar för reparation av DNA vilket möjliggör för ytterligare mutationer som aktiverar oncogener och stänger av andra tumörsupressorgener. Genom ett flertal steg där mutationer möjliggör för cellen att dela sig oftare och för fler mutationer att uppstå kan således en cancertumör utvecklas ur en normal cell.
368 2022-12-19 21 Vilka av följande är ketonkroppar? A: Acetoacetat B: Hydroxy-metyl-glutarat C: Aceton D: Beta-hydroxy-acetat Rätt svar betaoxidation Vilka av följande är ketonkroppar? A: Acetoacetat B: Hydroxy-metyl-glutarat C: Aceton D: Beta-hydroxy-acetat Rätt svar A och C
369 2022-12-19 31 Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? A: Gikt är en sjukdom som kan orsakas av defekter i enzymerna som bryter ner pyrimidin-nukleotider. B: Urat är en molekyl med två ringstrukturer. C: Nukleotidaser omvandlar nukleotider till nukleosider. D: Vid nedbrytning av nukleotiden AMP kommer molekylens samtliga kväveatomer slutligen hamna i urea som utsöndras med urinen. nukleotidnedbrytning Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? A: Gikt är en sjukdom som kan orsakas av defekter i enzymerna som bryter ner pyrimidin-nukleotider. B: Urat är en molekyl med två ringstrukturer. C: Nukleotidaser omvandlar nukleotider till nukleosider. D: Vid nedbrytning av nukleotiden AMP kommer molekylens samtliga kväveatomer slutligen hamna i urea som utsöndras med urinen. Rätt svar 1. B 2. C
370 2022-12-19 25 Vilka faktorer är viktiga för regleringen av fosfofruktokinas 2/fruktos 2,6-bisfosfatas? A: Hormoner B: Cellens energikvot C: pH D: Fosforylering glukosmetabolism Vilka faktorer är viktiga för regleringen av fosfofruktokinas 2/fruktos 2,6-bisfosfatas? A: Hormoner B: Cellens energikvot C: pH D: Fosforylering Rätt svar 1. A 2. D
371 2022-12-19 11 A) Var återfinns alfa-amanitin i naturen? B) Vilket enzym inhiberar denna substans? rna-syntes A) Var återfinns alfa-amanitin i naturen? B) Vilket enzym inhiberar denna substans? A) I den lömska flugsvampen B) Substansen inhiberar RNA-polymeras II
372 2022-12-19 8 A) Vilken kemisk grupp finns i 2’-positionen hos ribonukleotider? B) Vad är AMP förkortning för? nukleotider A) Vilken kemisk grupp finns i 2’-positionen hos ribonukleotider? B) Vad är AMP förkortning för? A) Hydroxylgrupp (OH) B) Adenosinmonofosfat
373 2022-12-19 35 Du arbetar på en vårdcentral som specialistläkare. En försäljare från ett läkemedelsföretag är inbjuden för att presentera en ny medicin som påstås sänka kolesterolnivåerna i blodet med 30%. Vilka två 95%:iga konfidensintervall (CI95%) stöder detta påstående i minst utsträckning? A: 29,5% – 30,5% B: 27% – 33% C: 1% – 60% D: −10% – 70% introduktionslaboration Du arbetar på en vårdcentral som specialistläkare. En försäljare från ett läkemedelsföretag är inbjuden för att presentera en ny medicin som påstås sänka kolesterolnivåerna i blodet med 30%. Vilka två 95%:iga konfidensintervall (CI95%) stöder detta påstående i minst utsträckning? A: 29,5% – 30,5% B: 27% – 33% C: 1% – 60% D: −10% – 70% C och D
374 2022-12-19 3 Nyligen har det konstaterats att sjukdomen ALS (amyotrofisk lateral skleros) karaktäriseras av bildning av amyloider. Hur bildas de? Max 75 ord. från-aminosyror-till-proteiner Nyligen har det konstaterats att sjukdomen ALS (amyotrofisk lateral skleros) karaktäriseras av bildning av amyloider. Hur bildas de? Max 75 ord. Amyloider bildas då ett protein med alfahelixrik struktur övergår i en betaflaksrik struktur. Betaflaken kan sedan aggregeras och bilda långa fibrer, så kallade amyloider.
375 2022-12-19 7 Kolhydrater finns förutom i fri form även bundna till lipider och proteiner. Vilka är de två vanligaste typerna av bindningar mellan kolhydrater och proteiner? (2p) kolhydrater Kolhydrater finns förutom i fri form även bundna till lipider och proteiner. Vilka är de två vanligaste typerna av bindningar mellan kolhydrater och proteiner? (2p) O-link: kolhydraten binder till OH-gruppen i sidokedjan på serin eller treonin i proteinet. N-link: kolhydraten binder till aminogruppen i en asparaginrests sidokedja i proteinet.
376 2022-12-19 6 Namnge och rita: A) Den principiella strukturen för lipiden som lagrar energi i adipocyter. B) Strukturen för den vanligaste membranlipiden. lipider Namnge och rita: A) Den principiella strukturen för lipiden som lagrar energi i adipocyter. B) Strukturen för den vanligaste membranlipiden. Se 2022-12-19-0097-TUX för 2/2
377 2022-12-19 2 I metabolismen är det vanligt att enzymer regleras av cellens energikvot. A) Nämn två aminosyror som kan interagera med olika delar hos de molekyler som då fungerar som allosteriska regulatorer. B) Förklara vad som gör dessa aminosyror lämpliga för uppdraget. Max 75 ord. från-aminosyror-till-proteiner I metabolismen är det vanligt att enzymer regleras av cellens energikvot. A) Nämn två aminosyror som kan interagera med olika delar hos de molekyler som då fungerar som allosteriska regulatorer. B) Förklara vad som gör dessa aminosyror lämpliga för uppdraget. Max 75 ord. A) Negativt laddad – lysin Som kan bilda vätebindningar – Asparagin B) Vid allosterisk reglering av cellens energikvot kommer ATP respektive ADP/AMP binda in till enzymet. Fosfatgrupperna är negativt laddade vilket gör att de kan interaggera med positivt laddade sidokedjor som lysin genom jonbindningar. Kvävebasen adenin som är en del av molekylerna kommer innehålla kvävegrupper som kan bilda vätebindningar med en aminosyra som har karbonyl, hydroxyl- eller aminogrupper, som asparagin med både amino- och karbonylgrupp.
378 2023-05-15 28 Vad menas med respirationskontroll? (1p) Max 25 ord. elektrontransportkedjan Vad menas med respirationskontroll? (1p) Max 25 ord. Reglering av cellandningen, dvs bildningen av ATP genom oxidativ fosforylering. Drivs av elektrontransportkedjan och den elektrokemiska gradient som uppstår, och regleras av cellens energikvot.
379 2023-05-15 5 Du har fått i uppgift att göra en proteinrening med hjälp av gelfiltrering samt att analysera resultatet av denna. (2p) Max 200 ord. A) Beskriv metoden för gelfiltrering. B) Vilken egenskap hos proteinet bygger metoden på? utforska-proteiner Du har fått i uppgift att göra en proteinrening med hjälp av gelfiltrering samt att analysera resultatet av denna. (2p) Max 200 ord. A) Beskriv metoden för gelfiltrering. B) Vilken egenskap hos proteinet bygger metoden på? A) Gelfiltrering är en separationsmetod med avseende på storlek. Man preparerar en kolonn med "beads", dvs porösa gelékulor. Detta utgör den fasta fasen. Sedan tillsätts en lösning med det protein man vill separera ut, detta kallas för den mobila fasen. När den mobila fasen hälls till kolonnen kommer den att rinna igenom och elueras under kolonnen. Stora proteiner kommer att ta vägen förbi kulorna och därmed komma ut först. De små proteinerna kommer istället att gå igenom de porösa kulorna. Detta tar längre tid och de kommer därför komma ut sist. Resultatet blir en separation med avseende på storlek där störst går först. B) Separation med avseende på storlek, där störst går först.
380 2023-05-15 18 A) Redogör kort för vikten av jämviktskonstanten för biokemiska reaktioner. B) Hur är jämviktskonstanten definierad? (2p) termodynamik A) Redogör kort för vikten av jämviktskonstanten för biokemiska reaktioner. B) Hur är jämviktskonstanten definierad? (2p) A) Jämviktskonstanten K anger förhållandet mellan substrat/reaktant och produkt. Om K = 1 betyder det att systemet är i jämvikt, mängden reaktant är lika stor som mängden produkt. Om K > 1 finns mer produkt än reaktant. Om K < 1 finns mer reaktant än produkt. Detta kan visa åt vilket håll en reaktion är förskjuten, och visar förhållandet mellan olika ämnen i ett system. I cellen är ofta flera reaktioner kopplade eller sker som en kedjereaktion. Det innebär att det som är produkt i en reaktion går vidare och utgör reaktant i en annan reaktion. Detta dynamiska samspel gör att jämviktskonstanten hela tiden kommer att förändras och gå åt olika håll. Det är bra, vi vill inte ha jämvikt (K = 1) i cellerna eftersom det då inte finns några gradienter eller någon reaktionsbenägenhet, vilket skulle innebära att alla livsviktiga processer avstannar och vi skulle dö. B) K = [produkt]/[reaktant]
381 2023-05-15 1 Rita aminosyran serin, R = CH₂OH, i S-konfiguration vid: A) pH 2 B) pH 7 C) pH 12 (2p) från-aminosyror-till-proteiner Rita aminosyran serin, R = CH₂OH, i S-konfiguration vid: A) pH 2 B) pH 7 C) pH 12 (2p) 1.5 av 2 Svar (text + ritning på separat papper) A) Vid lågt pH finns mycket fria H⁺, aminogruppen kommer att vilja motverka pH-sänkningen och ta upp en H⁺ och får således en positiv laddning. B) Vid neutralt pH kommer aminosyran vara en zwitterjon, dvs ha både en positiv och en negativ laddning men ingen nettoladdning. C) Vid högt pH kommer karboxylgruppen vilja motverka detta genom att avge H⁺, därav kommer denna att få en negativ laddning. ![[Pasted image 20251129235001.png]]
382 2023-05-15 19 Ett enzym uppvisar Michaelis–Menten-kinetik. A) Hur kan man i ett V mot [S]-diagram avläsa de två konstanterna Kₘ och Vmax? B) Förklara vad som händer med Kₘ respektive Vmax om man tillsätter en kompetitiv hämmare. (2p) enzymer Ett enzym uppvisar Michaelis–Menten-kinetik. A) Hur kan man i ett V mot [S]-diagram avläsa de två konstanterna Kₘ och Vmax? B) Förklara vad som händer med Kₘ respektive Vmax om man tillsätter en kompetitiv hämmare. (2p) A) Om ett enzym uppvisar Michaelis–Menten-kinetik kommer vi i ett sådant diagram se en hyperbol kurva där reaktionshastigheten ökar och går mot den maximala reaktionshastigheten med ökningen av substratets koncentration. Varje reaktion har ett Vmax, det vill säga den maximala hastighet en reaktion kan nå då samtliga enzym är bundna till substratet. När kurvan planar ut är V nära Vmax och kommer mycket långsamt fortsätta gå mot Vmax med en ökande substratkoncentration. Kₘ är den substratkoncentration för vilken reaktionshastigheten uppnår 1/2 Vmax. Kₘ är alltså den punkt på kurvan där V når halva Vmax. B) En kompetitiv inhibitor kommer att binda till enzymets aktiva säte och hindra det tänkta substratet från att binda in. Det uppstår alltså konkurrens om att binda in till de enzym som finns. Detta innebär att enzymets affinitet för substratet minskar och det betyder att vi vid närvaro av inhibitorn kommer att få ett lägre Kₘ-värde än utan. Om substratet hinner binda enzymet innan inhibitorn gör det finns det inget som hindrar att den tänkta produkten bildas. Vmax kommer alltså inte att förändras, det kommer bara krävas en högre substratkoncentration för att lyckas konkurrera ut inhibitorn.
383 2023-05-15 29 Från vilka alfa-ketosyror kan aminosyrorna nedan bildas med hjälp av två kliniskt viktiga enzymer tillhörande gruppen aminotransferaser? Ange också från vilken metabol väg respektive alfa-ketosyra hämtas. (2p) A) Alanin B) Aspartat aminosyrametabolism Från vilka alfa-ketosyror kan aminosyrorna nedan bildas med hjälp av två kliniskt viktiga enzymer tillhörande gruppen aminotransferaser? Ange också från vilken metabol väg respektive alfa-ketosyra hämtas. (2p) A) Alanin B) Aspartat A) Pyruvat → Alanin. Sker med hjälp av ALAT (alaninaminotransferas). Alfaketosyran är pyruvat och hämtas från glykolysen. B) Oxaloacetat → Aspartat. Sker med hjälp av ASAT (aspartataminotransferas). Alfaketosyran är oxaloacetat och hämtas från citronsyracykeln.
384 2023-05-15 4 Nämn de allosteriska regulatorerna för hemoglobin och ange om de höjer eller sänker hemoglobinets syreaffinitet. (2p) Max 25 ord. hemoglobin Nämn de allosteriska regulatorerna för hemoglobin och ange om de höjer eller sänker hemoglobinets syreaffinitet. (2p) Max 25 ord. 1.5 av 2: CO₂: bildar kolsyra & karbamatjoner, sänker pH. H⁺: interagerar med sidokedjor, uppstår jonbindningar. 2,3-BPG: binder subenheterna, förhindrar konformationsändring. Samtliga stabiliserar T-state, sänker affiniteten för syre.
385 2023-05-15 16 ![[Pasted image 20251129235023.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns det? C) Vilken är drivkraften för transporten? (2p) Max 30 ord. transport-över-cellmembran ![[Pasted image 20251129235023.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns det? C) Vilken är drivkraften för transporten? (2p) Max 30 ord. A) En antiport. B) I mitokondriens inre membran. C) Energikvoten. Dvs fördelningen mellan ATP och ADP innanför respektive utanför mitokondriens inre membran.
386 2023-05-15 22 Du är lite sen till bussen och behöver springa den sista biten för att inte missa den. När du slår dig ned är du varm och andas häftigt. Det gör också lite ont i lårmusklerna. A) Vilka metabola vägar aktiverades när du började springa och varför? B) Förklara med hjälp av termodynamik varför du har blivit varm. (Max 120 ord) (3p) glykolysen Du är lite sen till bussen och behöver springa den sista biten för att inte missa den. När du slår dig ned är du varm och andas häftigt. Det gör också lite ont i lårmusklerna. A) Vilka metabola vägar aktiverades när du började springa och varför? B) Förklara med hjälp av termodynamik varför du har blivit varm. (Max 120 ord) (3p) 2 av 3: A) När jag började springa förbrukades energi. Glykolysen omvandlade blodglukos till pyruvat för att skapa mer ATP via citronsyracykeln, ETK och oxidativ fosforylering. Glykogen lagrat i musklerna bröts ner för att frigöra energi där. B) När ett arbete utförs kommer alltid lite av energin att gå till spillo och bli till kinetisk energi/värme. Tack vare att alla processer i kroppen är uppdelade i många men mindre steg kan vi ta tillvara på en större del av den tillgängliga energin, vi får alltså en större verkningsgrad än t.ex. en förbränningsmotor. Vår verkningsgrad är ca 50%, det innebär att hälften av den energi jag förbrukade när jag sprang frigjordes i form av värme och det var därför jag blev varm.
387 2023-05-15 32 I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i nedanstående två nukleosider när dessa bryts ner? Ange en molekyl för respektive nukleosid. (1p) A) Inosin B) Cytidin nukleotidnedbrytning I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i nedanstående två nukleosider när dessa bryts ner? Ange en molekyl för respektive nukleosid. (1p) A) Inosin B) Cytidin A) Urat. B) Urea.
388 2023-05-15 26 Din kompis har bestämt sig för att utesluta fett ur sin diet med målet att minska sina fettförråd. Du som har studerat metabolism ser en svaghet i strategin. Redogör för den svagheten på molekylär nivå. (Max 75 ord) (2p) lipider Din kompis har bestämt sig för att utesluta fett ur sin diet med målet att minska sina fettförråd. Du som har studerat metabolism ser en svaghet i strategin. Redogör för den svagheten på molekylär nivå. (Max 75 ord) (2p) AI: Utan fett i kosten minskar tillgången på essentiella fettsyror och framför allt på oxaloacetat, som krävs för att acetyl-CoA ska kunna gå in i citronsyracykeln. Brist på kolhydrater och fett gör att oxaloacetat används för glukoneogenes, vilket hindrar fullständig fettoxidation. Fettförbränningen bromsas alltså snarare än ökar, och ketonkroppar kan bildas.
389 2023-05-15 12 Vilka två påståenden om kromatin stämmer bäst? (1p) A: Acetylering gör histonsvansar mer positivt laddade. B: Topoisomeraser kan reglera aktiviteten i en kromatinfiber-loop. C: Histon H1 destabiliserar nukleosomen. D: Nukleosomen har en kärna av 8 histonproteiner. kromatin Vilka två påståenden om kromatin stämmer bäst? (1p) A: Acetylering gör histonsvansar mer positivt laddade. B: Topoisomeraser kan reglera aktiviteten i en kromatinfiber-loop. C: Histon H1 destabiliserar nukleosomen. D: Nukleosomen har en kärna av 8 histonproteiner. B och C
390 2023-05-15 27 Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (1p) Komponenter: Coenzym Q CuB Cytokrom C NADH elektrontransportkedjan Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (1p) Komponenter: Coenzym Q CuB Cytokrom C NADH 1. NADH 2. Coenzym Q 3. Cytokrom C 4. CuB
391 2023-05-15 13 Vilken roll spelar sigma-faktorn vid prokaryot transkription? (2p) kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Vilken roll spelar sigma-faktorn vid prokaryot transkription? (2p) Sigmafaktorn är en av de 6 subenheter som ingår i det prokaryota polymeraset. Sigmafaktorns uppgift är att hjälpa polymeraset att snabbare hitta fram till rätt promotor. Polymeraset med sigmafaktorn åker längs med DNA till dess att rätt promotor hittas. Sigmafaktorns effekt är att polymeraset binder lösare till ospecifikt DNA, vilket gör att det kan glida längs DNA utan att fastna på fel ställe. Utan sigmafaktorn hade polymeraset bundit mycket starkare till ospecifikt DNA, vilket hade försvårat processen då det hade haft problem med att glida längs DNA utan att fastna på fel ställe. När sigmafaktorn väl hittat och bundit till rätt promotor kan transkriptionen börja. Då kommer sigmafaktorn att falla av, eftersom vi nu vill att polymeraset ska sitta fast vid DNA för att kunna utföra transkriptionen korrekt.
392 2023-05-15 17 Var hittas ett GPI-ankare och vad har det för funktion? (2p) cellmembran Var hittas ett GPI-ankare och vad har det för funktion? (2p) Ett GPI-ankare är ett perifert membranprotein. Det sitter förankrat till cellmembranet via fosfatgrupper och sockerstrukturer. GPI-ankaret kan mobiliseras väldigt snabbt genom att klippas loss med hjälp av lipaser. Vid en synaps i t.ex. en muskel kommer transmittorsubstansen acetylkolin på en impuls frisättas och leda till muskelkontraktion. För att kontraktionen ska upphöra måste acetylkolin plockas bort från muskelcellens receptorer, och det sker via acetylkolinesteras. Acetylkolinesteras sitter bundet till axonterminalen via ett GPI-ankare, vilket gör att det då snabbt kan frigöras och avsluta muskelkontraktionen.
393 2023-05-15 23 Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (1p) A: Glykogenet i skelettmuskel bryts ner hela vägen till glukos som sedan används för att generera energi i form av ATP till muskelcellen själv. B: Höga intracellulära nivåer av AMP kan stimulera glykogenolys i skelettmuskel. C: Intracellulär signalering inducerad av hormonet glukagon stimulerar glykogenolys och hämmar glykogenes i skelettmuskel. D: Utan ett funktionellt debranching enzyme kan bara en mindre del av leverns glykogenförråd utnyttjas för att höja blodets glukoskoncentration i en fastesituation. glykogen Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (1p) A: Glykogenet i skelettmuskel bryts ner hela vägen till glukos som sedan används för att generera energi i form av ATP till muskelcellen själv. B: Höga intracellulära nivåer av AMP kan stimulera glykogenolys i skelettmuskel. C: Intracellulär signalering inducerad av hormonet glukagon stimulerar glykogenolys och hämmar glykogenes i skelettmuskel. D: Utan ett funktionellt debranching enzyme kan bara en mindre del av leverns glykogenförråd utnyttjas för att höja blodets glukoskoncentration i en fastesituation. C och D
394 2023-05-15 33 Vilken typ av bilirubin är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? (1p) heme Vilken typ av bilirubin är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? (1p) Det okonjugerade bilirubinet. Bilirubin är en hydrofob molekyl. I normala fall kommer bilirubin i levern att konjugeras med två glukuronsyra som gör att molekylen blir vattenlöslig och kan utsöndras med gallsyran. Om denna konjugering inte sker kan bilirubin inte utsöndras, och därför är det denna variant vi kommer att se förhöjda halter av vid sjukdom.
395 2023-05-15 24 Vilka två av nedanstående enzymer återfinns i citronsyracykeln? (1p) A: Succinatdehydrogenas B: Pyruvatdehydrogenas C: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas citronsyracykeln Vilka två av nedanstående enzymer återfinns i citronsyracykeln? (1p) A: Succinatdehydrogenas B: Pyruvatdehydrogenas C: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas A och D
396 2023-05-15 10 Vilka två alternativ är korrekta vad gäller 5' cap hos eukaryot mRNA? (1p) A: Stimulerar syntes av polyA-svansen. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Skyddar mRNA från nedbrytning. D: Består av nukleotid bunden via en 5’–5’ bindning. rna-syntes Vilka två alternativ är korrekta vad gäller 5' cap hos eukaryot mRNA? (1p) A: Stimulerar syntes av polyA-svansen. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Skyddar mRNA från nedbrytning. D: Består av nukleotid bunden via en 5’–5’ bindning. C och D
397 2023-05-15 9 Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en Watson–Crick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'. B: Ett varv av DNA motsvarar ca 10,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är vänstervriden. nukleotider Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en Watson–Crick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'. B: Ett varv av DNA motsvarar ca 10,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är vänstervriden. B och C
398 2023-05-15 34 Du ska labba! Beskriv fyra saker som du behöver göra innan du börjar experimentera. (2p) Max 50 ord. introduktionslaboration Du ska labba! Beskriv fyra saker som du behöver göra innan du börjar experimentera. (2p) Max 50 ord. Förbereda mig genom att läsa igenom labb-handledningen så att jag vet vad jag ska göra. Lämna ytterkläder och väska och ta på mig labbrock. Tvätta av bänken med minst 75% etanol. Vid behov, ta på mig handskar.
399 2023-05-15 14 Beskriv strukturen och funktionen av aminoacyl-tRNA syntetas översiktligt samt förklara vad som sker i aminoacyl-tRNA syntetas om fel aminosyra binder till tRNA. (2p) Max 150 ord. translation Beskriv strukturen och funktionen av aminoacyl-tRNA syntetas översiktligt samt förklara vad som sker i aminoacyl-tRNA syntetas om fel aminosyra binder till tRNA. (2p) Max 150 ord. Aminoacyl-tRNA syntetas är ett enzym som katalyserar inbindning av en aminosyra till sin motsvarande tRNA-molekyl för att kunna nyttjas i translationen och kopplas ihop med andra aminosyror. Aminoacyl-tRNA syntetas har två olika delar som är avgörande för funktionen. Det finns ett active site, dit aminosyran binder för att sedan kunna länkas till en OH-grupp på tRNA-molekylens CCA-svans. Sedan finns också ett editing site. Enzymet kommer att känna av om kopplingen mellan aminosyran och tRNA blev rätt eller inte. Om det blev fel kommer editing siten direkt att spjälka loss aminosyran från tRNA för att via active site kunna sätta dit en ny. Det finns en god flexibilitet hos enzymet som gör att dessa två olika delar enkelt kan samarbeta för att snabbt åtgärda ett eventuellt fel.
400 2023-05-15 20 Vilka två av nedanstående behöver du känna till för att beräkna omsättningstalet för ett enzym? (1p) A: Enzymstrukturen. B: Enzymkoncentrationen. C: Initialhastigheten för den katalyserade reaktionen vid [S] >> Kₘ. D: Kₘ för substratet. enzymer Vilka två av nedanstående behöver du känna till för att beräkna omsättningstalet för ett enzym? (1p) A: Enzymstrukturen. B: Enzymkoncentrationen. C: Initialhastigheten för den katalyserade reaktionen vid [S] >> Kₘ. D: Kₘ för substratet. B och C
401 2023-05-15 30 Varför är tillgång av NADPH essentiellt för ett fungerande glutationsystem? (1p) Max 50 ord. pentosfosfatvägen Varför är tillgång av NADPH essentiellt för ett fungerande glutationsystem? (1p) Max 50 ord. Glutation är en antioxidant som reducerar reaktiva syreföreningar, ex väteperoxid till vatten. För att reaktionen ska kunna ske igen måste glutation reduceras tillbaka till sin ursprungsform. Det är NADPH som fungerar som reduktionsmedel och oxideras till NADP⁺. Utan NADPH förblir glutation oxiderat och kan inte reducera fler farliga syreradikaler.
402 2023-05-15 15 Coronavirus ändrades mycket under pandemin, från en ganska dödlig variant som var lagom smittsam till en variant som är relativt ofarlig men mycket smittsam. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till. (2p) evolution Coronavirus ändrades mycket under pandemin, från en ganska dödlig variant som var lagom smittsam till en variant som är relativt ofarlig men mycket smittsam. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till. (2p) 1 av 2: Med tiden har celler, organismer och hela populationer förändrats efter rådande omständigheter. Miljön påverkar och leder till att egenskaper som är gynnsamma för en organisms överlevnad i den aktuella miljön kommer att bevaras medan egenskaper som inte är gynnsamma kommer att selekteras bort hos kommande generationer. Coronaviruset genomgick en sådan förändring. Till en början var viruset mindre smittsamt men hade en högre dödlighet hos de smittade. Människor kom fram med sätt att skydda sig mot viruset och metoder för att bli frisk om man blivit smittad. Viruset mötte motstånd som hotade dess fortsatta utveckling och överlevnad. Omgivningen fick alltså viruset att utveckla nya egenskaper som var mer gynnsamma för att kunna fortsätta utvecklas och leva vidare. Det var i detta fall att bli mindre dödligt men desto mer smittsamt. Omgivningens selektionstryck kommer alltså leda till en förändring hos organismen där de mest fördelaktiga egenskaperna för dess överlevnad kommer att bevaras och utvecklas vidare.
403 2023-05-15 21 Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) A: ATP stimulerar katabolism. B: ATP innehåller en energirik fosfoanhydridbindning för varje fosfatgrupp. C: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan negativa laddningar. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i CTP. introduktion-till-metabolismen Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) A: ATP stimulerar katabolism. B: ATP innehåller en energirik fosfoanhydridbindning för varje fosfatgrupp. C: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan negativa laddningar. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i CTP. C och D
404 2023-05-15 31 Beskriv översiktligt kolesterolets omsättning i kroppen: var det kommer ifrån, två viktiga funktioner och hur det kan utsöndras. (2p) kolesterol Beskriv översiktligt kolesterolets omsättning i kroppen: var det kommer ifrån, två viktiga funktioner och hur det kan utsöndras. (2p) Kolesterol kan antingen bildas i kroppen eller intas via födan. För en person som väger ca 70 kg och har en västerländsk diet får man i sig ca 500–700 mikrogram kolesterol via födan varje dygn och ca 50% av detta tas upp i kroppen. Syntes av kolesterol kommer att ske ändå, men i vilken utsträckning varierar beroende på kostsammansättningen. Kolesterol är en viktig komponent i våra cellmembran där det påverkar membranets fluiditet och skyddar membranet från att fluiditeten ska bli för hög eller låg vid temperaturförändringar i kroppen. Kolesterol utgör också grundstrukturen i syntesen av katekolaminer i binjuren, exempelvis testosteron, testosteron och progesteron. När kolesterol bryts ner kommer det att utsöndras gallan.
405 2023-05-15 25 Vilka två av nedanstående påståenden om ketonkroppar är korrekta? (1p) A: De syntetiseras i njuren. B: De kan betraktas som vattenlösliga transportformer av oxaloacetat i blodbanan. C: Höga halter av ketonkroppar ger metabol acidos. D: De används som energikälla i hjärtmuskel och njurcortex. betaoxidation Vilka två av nedanstående påståenden om ketonkroppar är korrekta? (1p) A: De syntetiseras i njuren. B: De kan betraktas som vattenlösliga transportformer av oxaloacetat i blodbanan. C: Höga halter av ketonkroppar ger metabol acidos. D: De används som energikälla i hjärtmuskel och njurcortex. C och D
406 2023-05-15 11 Enzymet flap endonuclease 1 (FEN1) är viktigt vid eukaryot DNA-replikation. Vad gör detta enzym? (2p) dna-replikation Enzymet flap endonuclease 1 (FEN1) är viktigt vid eukaryot DNA-replikation. Vad gör detta enzym? (2p) FEN1 är verksamt vid lagging strand under Okazaki fragment maturation. Eftersom lagging strand syntetiseras i flera sekvenser finns det flera primers med RNA inne i den nysyntetiserade strängen. I färdigt DNA vill vi inte ha något RNA kvar, detta måste på något sätt plockas bort. När polymeraset syntetiserar ett fragment kommer det slutligen krocka in i RNA-primern som utgjorde starten för det föregående fragmentet. När polymeraset och primern krockar kommer primern puttas bort och hänga som en liten svans från DNA-strängen. Då är det FEN1 som med sin endonukleasaktivitet klipper bort primern så att enbart DNA återstår i den nya strängen.
407 2023-05-15 8 De olika kolatomerna i ribos och deoxyribos numreras som 1', 2', 3', 4' och 5'. (2p) A) Vad skiljer ribos från deoxyribos? B) Till vilken position är basen kopplad? nukleotider De olika kolatomerna i ribos och deoxyribos numreras som 1', 2', 3', 4' och 5'. (2p) A) Vad skiljer ribos från deoxyribos? B) Till vilken position är basen kopplad? A) Ribos har en OH-grupp kopplad till både 2´ och 3´ position. Deoxyribos har också en OH-grupp vid 3´ position, men enbart ett väte i 2´ position. B) Kvävebasen är kopplad till pentosens 1´ position.
408 2023-05-15 35 Vilka två av nedanstående används som substrat för beta-galaktosidas vid blåvit screening? (1p) A: IPTG B: X-gal C: Beta-laktamas D: 5-Bromo-4-Chloro-3-Indolyl beta-D-Galctopyranoside plasmid Vilka två av nedanstående används som substrat för beta-galaktosidas vid blåvit screening? (1p) A: IPTG B: X-gal C: Beta-laktamas D: 5-Bromo-4-Chloro-3-Indolyl beta-D-Galctopyranoside B och D
409 2023-05-15 3 Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp vardera som deras R-grupper kan delta i när pH = 7. (1p) Aminosyror: Cystein Glutamat Treonin Tryptofan Bindningstyper: Jonbindning Kovalent bindning van der Waals interaktion Vätebindning från-aminosyror-till-proteiner Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp vardera som deras R-grupper kan delta i när pH = 7. (1p) Aminosyror: Cystein Glutamat Treonin Tryptofan Bindningstyper: Jonbindning Kovalent bindning van der Waals interaktion Vätebindning Cystein: Kovalent bindning Glutamat: Jonbindning Treonin: Vätebindning Tryptofan: van der Waals interaktion
410 2023-05-15 7 Membranlipider är amfipatiska. Vad betyder amfipati och varför är det en nödvändig egenskap för membranlipider? (2p) Max 75 ord. cellmembran Membranlipider är amfipatiska. Vad betyder amfipati och varför är det en nödvändig egenskap för membranlipider? (2p) Max 75 ord. En molekyl som är amfipatisk har både en hydrofob och en hydrofil del. Både fosfolipiderna och kolesterol är amfipatiska molekyler. Egenskapen gör att membranlipiderna kan orientera sig så att det bildas ett dubbellager med samtliga molekylers hydrofoba delar riktade in mot varandra och membranets mitt medan dess hydrofila delar riktas mot cytoplasman respektive extracellulärmatrix. Amfipati är alltså en nödvändig egenskap för att kunna bilda ett cellmembran som kan interagera med omgivningen och utgöra en barriärfunktion.
411 2023-05-15 6 A) Vad kallas den kovalenta bindningen som binder ihop två monosackarider (till exempel i en di- eller trisackarid)? B) Ange två skäl till varför tre hexoser kan resultera i många fler olika trisackarider än antalet olika tripeptider tre aminosyror kan resultera i. (2p) Max 100 ord. kolhydrater A) Vad kallas den kovalenta bindningen som binder ihop två monosackarider (till exempel i en di- eller trisackarid)? B) Ange två skäl till varför tre hexoser kan resultera i många fler olika trisackarider än antalet olika tripeptider tre aminosyror kan resultera i. (2p) Max 100 ord. 1 av 2: A) Glykosidbindning. B) Det finns 20 proteinogena aminosyror. Dessa kan förekomma i L- och D-form efter hur de bryter ljus. I kroppen finns bara aminosyror av L-form, det innebär att det i kroppen endast finns 20 olika aminosyror att välja mellan i skapandet av en tripeptid. Antalet möjliga kombinationer är begränsat. Det finns många olika monosackarider. Dessa kan likt aminosyrorna också förekomma i olika former, så kallade stereoisomerer. Skillnaden är att det finns väldigt många fler monosackarider och fler isomerer av dessa som kan förekomma i kroppen. Det gör att det finns en större möjlig variation vid bildandet av en trisackarid.
412 2023-05-15 2 I pyruvatdehydrogenaskomplexet överförs en av reaktionsintermediärerna från en subenhet till en annan och till det används sidogruppen av en aminosyra kopplad med en kovalent bindning till en prostetisk grupp. (2p) Max 30 ord. A) Vilken aminosyra är lämplig för uppdraget och varför? B) Förklara kortfattat syftet med överföringen. från-aminosyror-till-proteiner I pyruvatdehydrogenaskomplexet överförs en av reaktionsintermediärerna från en subenhet till en annan och till det används sidogruppen av en aminosyra kopplad med en kovalent bindning till en prostetisk grupp. (2p) Max 30 ord. A) Vilken aminosyra är lämplig för uppdraget och varför? B) Förklara kortfattat syftet med överföringen. A) Serin. Är en alkohol, har OH-grupp som kan bilda vätebindning till kväveatomer hos lipoamidarmen. B) Acetylgrupp överförs av lipoamidarmen från E1 till E2 där den blir acetyl-CoA.
413 2024-12-20 28 Vid reduktion av syre bildas små mängder reaktiva syreföreningar. Ange två enzymer som oskadliggör dessa. (2p) Max 10 ord. elektrontransportkedjan Vid reduktion av syre bildas små mängder reaktiva syreföreningar. Ange två enzymer som oskadliggör dessa. (2p) Max 10 ord. 1. Glutation perioxidas 2. Superoxid dismutas
414 2024-12-20 5 Redogör för hur bakterier/anpassning av cellmembranets fluiditet kan ske via fettsyrornas egenskaper. (4p) cellmembran Redogör för hur bakterier/anpassning av cellmembranets fluiditet kan ske via fettsyrornas egenskaper. (4p) Fettsyror i cellmembran är amfipatiska, och har alltså en polär del (huvud) och en opolär del (svans). Den opolära delen består av acylgrupper, som binder till varandra via VdW-krafter, vilket inte är så starka bindningar och börjar därför lossna vid värmetillförsel (även om det inte är så hög temperatur). Fluiditeten i cellmembran ökar när temperaturen ökar, eftersom fettsyrorna börjar att röra på sig av värmeenergin. För att cellmembranet inte ska bli alltför genomsläppligt så fungerar kolesterol som en buffert som minskar på rörelsen hos fettsyrorna. Och tvärtom gäller det att när temperaturen sjunker så minskar fettsyrornas rörelseenergi, och de börjar att binda hårdare till varandra. För att cellmembranet inte ska klumpa ihop sig, och bli helt ogenomsläppligt så fungerar kolesterolet även här som en buffert som sitter mellan fettsyrorna och sänker möjligheten för ihopklumpning av fettsyrorna.
415 2024-12-20 18 Chymotrypsin är ett enzym som använder kovalent katalys, vilken lämnar en kovalent bunden polypeptid till ett serin i enzymet efter att peptidbindningen har spjälkats. Redogör för den kemiska mekanism med vilken enzymet regenereras. (4p) enzymer Chymotrypsin är ett enzym som använder kovalent katalys, vilken lämnar en kovalent bunden polypeptid till ett serin i enzymet efter att peptidbindningen har spjälkats. Redogör för den kemiska mekanism med vilken enzymet regenereras. (4p) Brevid serinet finns histidin, som en del av den katalytiska triaden (med bredvid menas endast i den katalytiska triaden, eftersom i primärstrukturen ligger serin och histidin inte brevid varandra). När en vattenmolekyl kommer in i den katalytiska klyftan så kommer histidinet att ta upp ett väte från vattenmolekylen, vilket aktiverar syremolekylen i vattnet. Syremolekylen utför en nukleofil attack på bindningen mellan serin och polypeptiden, och syret från vattnet binder till polypeptiden istället för serin. Detta gör att peptiden och OH-gruppen från vattnet lämnar den katalytiska klyftan, och att histidin donerar sitt väte som den tog från vattnet till serinet så att serin återgår till att ha en OH-grupp i sin sidokedja så att enzymet regenereras till sin ursprungsform.
416 2024-12-20 1 Förklara vad som menas med att en molekyl är resonansstabiliserad och vad det innebär för molekylen. Illustrera med ett valfritt exempel. (4p) Max 30 ord. Illustrationen görs på ett separat papper. kemiska-bindingar Förklara vad som menas med att en molekyl är resonansstabiliserad och vad det innebär för molekylen. Illustrera med ett valfritt exempel. (4p) Max 30 ord. Illustrationen görs på ett separat papper. "Mellanläge" mellan enkelbindning och dubbelbindning, så styrkan på en resonansstabiliserad bindning är mellan enkelbindning och dubbelbindning. Atomer delar på elektronerna, så molekylen kan stabiliseras och finnas i flera konfigurationer. Ritning: ATP med streckade bindningar mellan P–O som visar resonans (sid 8). ![[Pasted image 20251129235730.png]]
417 2024-12-20 19 Ett enzym uppvisar Michaelis-Menten kinetik, vilket gör det möjligt att bestämma dess Km-värde. Km kan man använda för att förstå: (2p) A: Hur snabbt det går för bundet substrat att bli omsatt till frisatt produkt. B: Hur sannolikt det är att substrat binder till enzymet. C: Hur bra ett enzym kan skilja mellan olika möjliga substrat. D: Hur sannolikt det är att substrat lossnar från enzymet när det har bundit. enzymer Ett enzym uppvisar Michaelis-Menten kinetik, vilket gör det möjligt att bestämma dess Km-värde. Km kan man använda för att förstå: (2p) A: Hur snabbt det går för bundet substrat att bli omsatt till frisatt produkt. B: Hur sannolikt det är att substrat binder till enzymet. C: Hur bra ett enzym kan skilja mellan olika möjliga substrat. D: Hur sannolikt det är att substrat lossnar från enzymet när det har bundit. C och D
418 2024-12-20 29 Beskriv hur triacylglycerol i fettceller bryts ner till fria fettsyror. (4p) lipider Beskriv hur triacylglycerol i fettceller bryts ner till fria fettsyror. (4p) Adrenalin eller glukagon inducerar intracellulära reaktioner via 7TM, vilket omvandlar ATP till cAMP. cAMP aktiverar proteinkinas A, som i sin tur aktiverar perilipin. Perilipin omarrangerar TAG så att ATGL kan klyva den första fettsyran (TAG blir DAG). Proteinkinas A aktiverar HS lipas som spjälkar den andra fettsyran (DAG till MAG). MAG lipas spjälkar den tredje fettsyran, så att det bara blir kvar glycerol.
419 2024-12-20 4 Du ska rena ett protein med gelfiltrering. Proteinet innehåller också en his-tagg. (4p) Max 200 ord. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med gelfiltrering. B) Beskriv vad en his-tag är och hur den kan användas för rening och detektion. utforska-proteiner Du ska rena ett protein med gelfiltrering. Proteinet innehåller också en his-tagg. (4p) Max 200 ord. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med gelfiltrering. B) Beskriv vad en his-tag är och hur den kan användas för rening och detektion. A) Gelfiltrening består av en fast fas med porösa kulor i en kolonn, och en mobil fas med en buffert och proteinet som ska renas. Små molekyler kommer att fastna i håligheterna i kulorna, medan stora proteiner kommer att komma ut först. Reningsmetoden är alltså baserad på proteiners storlek. B) His-tagg är en sekvens av 6 histidin-aminosyror efter varandra. His-tagg binder starkt till nickel-joner och man kan därför använda den egenskapen vid rening av proteinet. Man använder då affinitetskromatografi, och renar proteinet baserat på selektivitet alltså en specifik egenskap. Proteinet kan sedan elueras med Imidazol, som konkurrerar ut His-taggen.
420 2024-12-20 16 Para ihop respektive molekyl med en typ av transport den kan genomgå. Varje alternativ får enbart användas en gång. (2p) A: Glukos B: O₂ C: K⁺ D: Vatten Transporttyper: A: Sekundär aktiv transport B: Primär aktiv transport C: Passiv transport D: Fri diffusion transport-över-cellmembran Para ihop respektive molekyl med en typ av transport den kan genomgå. Varje alternativ får enbart användas en gång. (2p) A: Glukos B: O₂ C: K⁺ D: Vatten Transporttyper: A: Sekundär aktiv transport B: Primär aktiv transport C: Passiv transport D: Fri diffusion Glukos → Sekundär aktiv transport O₂ → Fri diffusion K⁺ → Primär aktiv transport Vatten → Passiv transport (kanal/aquaporin)
421 2024-12-20 22 Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker när hormonet insulin utsöndras. B: Aminosyrorna alanin och lysin är glukogena. C: Glukoneogenes sker under nattens fasta. D: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat. glukoneogenes Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker när hormonet insulin utsöndras. B: Aminosyrorna alanin och lysin är glukogena. C: Glukoneogenes sker under nattens fasta. D: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat. C och D
422 2024-12-20 32 Nämn en vanlig sjukdom som är relaterad till nedbrytning av nukleotider, samt ange vilken av de två huvudtyperna av nukleotider som har en koppling till denna sjukdom. (2p) Max 10 ord. nukleotidnedbrytning Nämn en vanlig sjukdom som är relaterad till nedbrytning av nukleotider, samt ange vilken av de två huvudtyperna av nukleotider som har en koppling till denna sjukdom. (2p) Max 10 ord. Gikt, och puriner har en koppling till sjukdomen.
423 2024-12-20 26 Redogör för två sätt som metabolismen ändras vid träning och hur ändringarna leder till förbättrad prestation. (4p) Max 120 ord. integrering-av-metabolismen Redogör för två sätt som metabolismen ändras vid träning och hur ändringarna leder till förbättrad prestation. (4p) Max 120 ord. Laktat i muskeltyp IIb tas upp av hjärtat och av muskeltyp I, vilket gör att mängden laktat minskar i muskeltyp IIb så att anaerob metabolism kan fortgå längre. Hjärtats konkurrens om glukos minskar även då. Laktat tas även upp av levern, och omvandlas till pyruvat, och sedan till glukos som går ut till blodet och tas upp av muskeltyp IIb och används i glykolysen. Detta kallas för Coricykeln. Båda dessa metabola vägar leder till förbättrad prestation, eftersom kroppen orkar hålla på under längre tid.
424 2024-12-20 12 Vilka två påståenden om B-DNA (Watson–Crick helix) är korrekta? (2p) A: Avståndet mellan baspar i helixen är 5,0 Å. B: Helixen är vänstervriden. C: De två strängarna i helixen löper i motsatta riktningar. D: Ett varv av DNA består av ungefär 10 baspar. nukleotider Vilka två påståenden om B-DNA (Watson–Crick helix) är korrekta? (2p) A: Avståndet mellan baspar i helixen är 5,0 Å. B: Helixen är vänstervriden. C: De två strängarna i helixen löper i motsatta riktningar. D: Ett varv av DNA består av ungefär 10 baspar. C och D
425 2024-12-20 36 Vilka två påståenden om plasmidkloning är korrekta? (2p) A: När en miniprep görs centrifugeras lösningen direkt efter alkalisk lysering för att separera plasmider från bakterierester. B: IPTG används för att bryta ned X-gal vilket gör att kolonier som tagit upp plasmiden blir blå. C: LacZ-genen används för blåvit screening där vita kolonier indikerar rekombinant DNA och blå kolonier indikerar icke-rekombinant DNA. D: BamHI är ett restriktionsenzym som klyver DNA vid en specifik sekvens. plasmid Vilka två påståenden om plasmidkloning är korrekta? (2p) A: När en miniprep görs centrifugeras lösningen direkt efter alkalisk lysering för att separera plasmider från bakterierester. B: IPTG används för att bryta ned X-gal vilket gör att kolonier som tagit upp plasmiden blir blå. C: LacZ-genen används för blåvit screening där vita kolonier indikerar rekombinant DNA och blå kolonier indikerar icke-rekombinant DNA. D: BamHI är ett restriktionsenzym som klyver DNA vid en specifik sekvens. C och D
426 2024-12-20 27 I elektrontransportkedjan förekommer steg där elektrondonatorn och elektronacceptorn inte är bärare av lika många elektroner. Redogör för vad som händer vid ett sådant steg. (4p) Max 100 ord. elektrontransportkedjan I elektrontransportkedjan förekommer steg där elektrondonatorn och elektronacceptorn inte är bärare av lika många elektroner. Redogör för vad som händer vid ett sådant steg. (4p) Max 100 ord. Detta händer i komplex III i elektrontransportkedjan när coenzym Q ska donera 2 elektroner till cytokrom C som endast kan ta upp en elektron. Q-cykeln: QH₂ kommer till Q Cytokrom C oxidoreduktas (komplex III): 1 elektron tas upp av cytokrom C och ges till cytokrom C (elektronen transporteras till komplex IV) 1 elektron tas upp av Q som blir Q⁻ En annan QH₂ kommer in till komplex III 1 elektron tas upp av cytokrom C1 och ges till cytokrom C 1 elektron tas upp av Q⁻ blir till QH₂ (2 H⁺ tas upp från matrix)
427 2024-12-20 13 Describe the main features of the genetic code and explain their biological significance. (4p) Answer in English. translation Describe the main features of the genetic code and explain their biological significance. (4p) Answer in English. The genetic code is in humans stored in DNA (23 chromosome pairs). It stems from our mother and father. The DNA contains 4 different base-pairs. Adenin, Tymin, Cytosin och Guanin. The genetic code is not read one base-pair at a time, but rather in groups of three (i.e codons). For example AUG, ATT. The genetic code is also degenarative, leading to different codons being able to code for the same aminoacid. This leads to a protective function against mutations, since a mutation in a codon can lead to the same amino acid still being coded for example. The gentic code codes for all the proteins in an organism. The DNA can be transcribed into mRNA which can be translated into proteins
428 2024-12-20 17 Gibbs fria energi möjliggör att man kan förutsäga om en kemisk reaktion kan ske spontant. Ange vilka termer som ingår i formeln som beskriver förändringar i Gibbs fria energi. Förklara även hur ökad respektive minskad temperatur påverkar förändringen av Gibbs fria energi. (4p) termodynamik Gibbs fria energi möjliggör att man kan förutsäga om en kemisk reaktion kan ske spontant. Ange vilka termer som ingår i formeln som beskriver förändringar i Gibbs fria energi. Förklara även hur ökad respektive minskad temperatur påverkar förändringen av Gibbs fria energi. (4p) Gibbs fria energi = deltaG Entalpi = deltaH Temperatur = T Entropi = deltaS En ökad temperatur kommer ha inverkan på entropin, vilket kommer leda till att deltaG kommer bli mer negativ/gå mot ett lägre värde. Den kemiska reaktionen i fråga kommer då förkjutas mot ett läge där den kan ske spontant (kan ske spontant om delta G är <0) En minskad temperatur kommer också ha en inverkan på entropin, fast i detta fall kommer deltaG istälett gå mot ett högre värde. Den kemiska reaktionen i fråga kommer då kräva mer energi för att äga rum. Temperaturen påverkar entropin eftersom detta är ett diret mått på molekylers/atomernas rörelseenergi.
429 2024-12-20 23 Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet adrenalin induceras glykogenes i cellen. B: Glykogen upplagrat i skelettmuskel används främst för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider. C: Glukos-6-fosfat är slutprodukten vid glykogenolys i skelettmuskler. D: Glykogenin är ett enzym som är kovalent bundet till glykogen. glykogen Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet adrenalin induceras glykogenes i cellen. B: Glykogen upplagrat i skelettmuskel används främst för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider. C: Glukos-6-fosfat är slutprodukten vid glykogenolys i skelettmuskler. D: Glykogenin är ett enzym som är kovalent bundet till glykogen. C och D
430 2024-12-20 33 Var i cellen sker pentosfosfatvägen, och vilken biomolekyl, som kan användas vid reduktiv biosyntes, kan bildas i denna väg? (2p) Max 10 ord. pentosfosfatvägen Var i cellen sker pentosfosfatvägen, och vilken biomolekyl, som kan användas vid reduktiv biosyntes, kan bildas i denna väg? (2p) Max 10 ord. Pentosfosfatvägen sker i cytosolen, och bildar NADPH.
431 2024-12-20 24 Vilka av följande faktorer stimulerar glykogenolys i en skelettmuskelcell? (2p) A: Intracellulär signalering inducerad av hormonet adrenalin. B: Aktivering av proteinfosfatas 1 i cellen. C: En låg energistatus i cellen, vilket reflekteras av en förhöjd intracellulär koncentration av AMP. D: En förhöjd koncentration av ATP i cellen. glykogen Vilka av följande faktorer stimulerar glykogenolys i en skelettmuskelcell? (2p) A: Intracellulär signalering inducerad av hormonet adrenalin. B: Aktivering av proteinfosfatas 1 i cellen. C: En låg energistatus i cellen, vilket reflekteras av en förhöjd intracellulär koncentration av AMP. D: En förhöjd koncentration av ATP i cellen. A och C
432 2024-12-20 10 Vilken är den biologiska betydelsen av den 5’-cap som återfinns på mRNA i eukaryota celler? (4p) rna-syntes Vilken är den biologiska betydelsen av den 5’-cap som återfinns på mRNA i eukaryota celler? (4p) Så fort mRNA:et börjar komma ut från RNA polymeras II, så sätts det på en guaninmolekyl på 5'-ändan via en 5'-5' bindning. Detta gör att mRNA-sekvensen inte bryts ner och att transkriptionen kan fortgå. När transkriptionen är färdig och mRNA-sekvensen har fått sin poly(A)-svans på sin 3´-ända och ska translateras så krävs det att både 5´cap och poly(A) finns på mRNA:et för att det ska kännas igen av ribosomen och translateras. 5´-capen hämmar alltså nedbrytning av mRNA, och möjliggör intiering av translation (tillsammas med poly(A)-svansen).
433 2024-12-20 9 Histonmodifieringar spelar en viktig roll i kromatinets funktion. Vilken effekt har acetylering av histoner på kromatinstrukturen, och varför är detta viktigt för genuttryck? (4p) kromatin Histonmodifieringar spelar en viktig roll i kromatinets funktion. Vilken effekt har acetylering av histoner på kromatinstrukturen, och varför är detta viktigt för genuttryck? (4p) I nukleosomen finns bland annat dubbla uppsättningar av H3 och H4, och dessa 4 histoner har svansar av positivt laddade aminosyror (t.ex lysin och arginin) vid sin N-terminal. Dessa aminosyror binder till fosfatgrupperna på DNA:et ryggrad, eftersom fosfatgrupperna är negativt laddade. När svansarna blir acetylerade så neutraliseras de positiva laddningarna, och svansarna binder inte lika hårt till fosfatgrupperna. Detta möjliggör för enzymer att komma åt DNA:et, eftersom den inte är så hårt bunden till histonerna och möjliggör reglering av genuttryck (antingen mer eller mindre transkription beroende på gen och vilket enzym det handlar om).
434 2024-12-20 34 På vilka två sätt regleras kolesterolsyntesens hastighet? (2p) A: Via mängden aktivt 24-dehydrokolesterolreduktas, som styr aktiviteten i Kandutsch-Russel vägen för kolesterolsyntes. B: Via mängden aktivt HMG-CoA reduktas, som katalyserar bildningen av mevalonat. C: Via mängden aktivt squalenmonooxygenas, som katalyserar första steget i cykliseringen av squalen till lanosterol. D: Via mängden aktivt SLC25A1, ett transportprotein som transporterar citrat ut ur mitokondrien. kolesterol På vilka två sätt regleras kolesterolsyntesens hastighet? (2p) A: Via mängden aktivt 24-dehydrokolesterolreduktas, som styr aktiviteten i Kandutsch-Russel vägen för kolesterolsyntes. B: Via mängden aktivt HMG-CoA reduktas, som katalyserar bildningen av mevalonat. C: Via mängden aktivt squalenmonooxygenas, som katalyserar första steget i cykliseringen av squalen till lanosterol. D: Via mängden aktivt SLC25A1, ett transportprotein som transporterar citrat ut ur mitokondrien. B och C
435 2024-12-20 14 Hur kan man identifiera viktiga aminosyror i ett protein när man bara har sekvensinformation från många olika organismer att tillgå? (4p) från-aminosyror-till-proteiner Hur kan man identifiera viktiga aminosyror i ett protein när man bara har sekvensinformation från många olika organismer att tillgå? (4p) Sekvensanalys innebär att man kan identifiera viktiga aminosyror genom att jämföra sekvenser från flera olika organismer och hitta likheter mellan organismerna. Viktiga aminosyror, t.ex den katalytiska triaden i t.ex chymotrypsin tenderar att bevaras i organismer därför att det naturliga urvalet bevarar sekvenser som är gynnsamma för artens anpassning och överlevnad.
436 2024-12-20 20 Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs från ATP ökar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från glukos 6-fosfat. C: Det frigörs lika mycket energi när ATP och GTP hydrolyseras. D: ATP har högre fosforyltransferpotential än fosfoenolpyruvat. introduktion-till-metabolismen Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs från ATP ökar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från glukos 6-fosfat. C: Det frigörs lika mycket energi när ATP och GTP hydrolyseras. D: ATP har högre fosforyltransferpotential än fosfoenolpyruvat. A och C
437 2024-12-20 30 Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur hemesyntesen regleras. (4p) heme Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur hemesyntesen regleras. (4p) I första steget av hemesyntesen används enzymet ALA-syntas, och det är translationen av detta enzym som regleras. Det finns ett järn-bindande protein som binder till mRNA:et som kodar för ALA-syntas vid frånvaro av järn. När det finns järn så binder järnet till järn-bindande proteinet, och får det att lossna från mRNA:et. Då kan mRNA:et translateras och ALA-syntas bildas. Järn sätts in i heme som sista steg vid syntesen, så det hade varit onödigt om alla syntes-steg skedde trots att det inte finns något järn.
438 2024-12-20 15 Vilka två påståenden om jonkanaler är korrekta? (2p) A: Transport sker alltid med en gradient. B: Na⁺-kanalen är mer selektiv än K⁺-kanalen. C: ATP driver transporten. D: De kan aktiveras genom ligandbindning. transport-över-cellmembran Vilka två påståenden om jonkanaler är korrekta? (2p) A: Transport sker alltid med en gradient. B: Na⁺-kanalen är mer selektiv än K⁺-kanalen. C: ATP driver transporten. D: De kan aktiveras genom ligandbindning. A och D
439 2024-12-20 21 A) Förklara vad som menas med allosterisk reglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras allosteriskt och redogör för hur enzymets aktivitet ändras av regleringen. (4p) Max 50 ord. glykolysen A) Förklara vad som menas med allosterisk reglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras allosteriskt och redogör för hur enzymets aktivitet ändras av regleringen. (4p) Max 50 ord. A) När en molekyl binder till ett annat ställe på enzymet än på det aktiva sätet och ändrar enzymets form, vilket ändrar dess aktivitet. B) Fosfofruktokinas I stimuleras vid allosterisk reglering av AMP och fruktos-2,6-bisfofat. Den hämmas vid allosterisk reglering av ATP och citrat.
440 2024-12-20 31 Nämn en så kallad alfa-ketosyra, som via transaminering kan omvandlas till en aminosyra. Ange även vilken aminosyra som bildas från alfa-ketosyran, vad enzymet som katalyserar reaktionen heter, samt från vilken metabol väg alfa-ketosyran kan hämtas. (4p) Max 25 ord. aminosyrametabolism Nämn en så kallad alfa-ketosyra, som via transaminering kan omvandlas till en aminosyra. Ange även vilken aminosyra som bildas från alfa-ketosyran, vad enzymet som katalyserar reaktionen heter, samt från vilken metabol väg alfa-ketosyran kan hämtas. (4p) Max 25 ord. Oxaloacetat (alfaketosyra) transamineras vid deaminering av glutamat (aminosyra), och bilda aspartat (aminosyra som bildas) och alfa-ketoglutarat (alfa-ketosyran som bildas) Enzym: aspartataminotransferas (AST) Alfa-ketosyran från citronsyracykeln
441 2024-12-20 25 I vilken ordning kommer glukos att stöta på nedanstående enzymer under sin väg i katabolismen? (2p) A: succinyl-CoA syntetas B: glyceraldehyd 3-dehydrogenas C: malatdehydrogenas D: fosfoglyceratkinas integrering-av-metabolismen I vilken ordning kommer glukos att stöta på nedanstående enzymer under sin väg i katabolismen? (2p) A: succinyl-CoA syntetas B: glyceraldehyd 3-dehydrogenas C: malatdehydrogenas D: fosfoglyceratkinas 1. glyceraldehyd 3-dehydrogenas 2. fosfoglyceratkinas 3. succinyl-CoA syntetas 4. malatdehydrogenas
442 2024-12-20 11 Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Lac-repressorn kan binda till operatorn också när det finns mycket glukos. B: Lac-operonet uttrycks alltid, oavsett närvaro av laktos. C: I närvaro av laktos binder allolaktos till repressorn och förhindrar dess bindning till DNA. D: CAP-proteinet förhindrar transkription av lac-operonet när glukos är frånvarande. kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Lac-repressorn kan binda till operatorn också när det finns mycket glukos. B: Lac-operonet uttrycks alltid, oavsett närvaro av laktos. C: I närvaro av laktos binder allolaktos till repressorn och förhindrar dess bindning till DNA. D: CAP-proteinet förhindrar transkription av lac-operonet när glukos är frånvarande. A och C
443 2024-12-20 8 DNA-replikation är en noggrant reglerad process. I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin, och vilken funktion har detta komplex under replikationen? (4p) dna-replikation DNA-replikation är en noggrant reglerad process. I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin, och vilken funktion har detta komplex under replikationen? (4p) MCM-helikaset binder till replikationsorigin under G1-fasen när den lockas dit av ORC, och laddas av Cdc6 och Cdt1. Detta är möjligt under G1-fasen eftersom CDK-nivåerna är låga. Under S-fasen höjs CDK-nivåerna vilket lockar dit Gins och Cdc45, som binder till det laddade MCM-helikaset och skapar ett komplett CMG-helikas som kan börja öppna upp dubbelsträngen. Replikationen sker under S-fasen, och det möjliggörs alltså av de höga nivåerna av CDK, vilket säkerställer att replikationen endast sker en gång under cellcykeln. Helikaset är ett motorprotein som glider längs med DNA-ryggraden av fosfatgrupper och bryter vätebindningarna mellan kvävebaserna genom hydrolys av ATP.
444 2024-12-20 35 Du jämför ny kolesterolsänkande tablett mot standardbehandling. Efter tre månader görs t-test: p = 0,02, 95% KI för skillnaden 0,5–1,7 mmol/L. A) Formulera nollhypotes och alternativhypotes. B) Vilka slutsatser kan dras baserat på p-värdet och konfidensintervallet? (4p) introduktionslaboration Du jämför ny kolesterolsänkande tablett mot standardbehandling. Efter tre månader görs t-test: p = 0,02, 95% KI för skillnaden 0,5–1,7 mmol/L. A) Formulera nollhypotes och alternativhypotes. B) Vilka slutsatser kan dras baserat på p-värdet och konfidensintervallet? (4p) A) Nollhypotes: Det finns ingen skilland mellan blodtryckssänkningen om standradbehandling eller den nya tabletten används Alternativ hypotes: Det finns en skilland mellan blodtryckssänkningen om standradbehandling eller den nya tabletten används B) Testet visar statistisk signifikans, eftersom p-värdet är lägre än 0,05 och konfidensintervallet inte innehåller siffran noll. Nollhypotesen kan därför förkastas.
445 2024-12-20 3 A) Define cooperativity in the context of hemoglobin and myoglobin. B) Give an example where cooperativity is beneficial and explain how it is beneficial. (4p) Max 100 words. Answer in English. hemoglobin A) Define cooperativity in the context of hemoglobin and myoglobin. B) Give an example where cooperativity is beneficial and explain how it is beneficial. (4p) Max 100 words. Answer in English. A) Coopertivity means that once one hemegroup in hemoglobin binds to one oxygen molecule, it makes it easier to other oxygen molecules to bind in to the other hemegroups in the same hemoglobin molecule. Even when one oxygen molecule gets released from heme, it fascilitates for other oxygen molecules to get released. B) In hemoglobin there are 4 hememolecules, and each one of them can bind to one oxygen. In the lungs, the partial pressure of oxygen is high, which encourage hemoglobin to bind to oxygen. Coopevtivity here is benificial because it makes the oxygen transport in the body effective.
446 2024-12-20 7 Vilka två påståenden om nukleotider är korrekta? (2p) A: En nukleotid består av en kvävebas, ett socker och tre fosfatgrupper. B: Den innersta fosfatgruppen, närmast sockret, kallas gamma. C: Ribonukleotider har en OH-grupp på 3'-kolatomen. D: Deoxyribonukleotider innehåller en OH-grupp på 2'-kolatomen. nukleotider Vilka två påståenden om nukleotider är korrekta? (2p) A: En nukleotid består av en kvävebas, ett socker och tre fosfatgrupper. B: Den innersta fosfatgruppen, närmast sockret, kallas gamma. C: Ribonukleotider har en OH-grupp på 3'-kolatomen. D: Deoxyribonukleotider innehåller en OH-grupp på 2'-kolatomen. A och C
447 2024-12-20 6 Förklara kortfattat likheter och skillnader mellan glukos, glukopyranos och N-acetylglukosamin på strukturell/molekylär nivå. (4p) kolhydrater Förklara kortfattat likheter och skillnader mellan glukos, glukopyranos och N-acetylglukosamin på strukturell/molekylär nivå. (4p) 3 av 4 poäng: Linjär glukos blir cirkulär genom att aldehydgruppen på kol 1 binder till kol 5. Glukopyranos bildas genom att en aldehydgrupp på en molekyl binder till en hydroxylgrupp på en annan molekyl. Likheten är alltså att båda är cirkulära, men att antalet molekyler är olika. N-acetylglukosamin är en glukosmolekyl, som är bunden till en acetylamingrupp. Acetylamingruppen är bunden till glukoset via sitt kväve. Likheten är alltså att glukos och N-acetylglukosamin båda innehåller glukos, men att N-acetylglukosamin även innehåller en acetylamingrupp.
448 2024-12-20 2 En aminosyra har en sidogrupp bestående av en aminogrupp och en kedja med fyra CH₂-grupper. A) Vilken är aminosyran? B) Ange två egenskaper aminosyran har. C) Rita upp aminosyran vid pH = 2. (4p) Max 30 ord. Uppgift C på separat papper. från-aminosyror-till-proteiner En aminosyra har en sidogrupp bestående av en aminogrupp och en kedja med fyra CH₂-grupper. A) Vilken är aminosyran? B) Ange två egenskaper aminosyran har. C) Rita upp aminosyran vid pH = 2. (4p) Max 30 ord. Uppgift C på separat papper. A) Lysin B) Basisk, kan ta upp en H⁺ vid lågt pH. Fungerar i vissa enzymkomplex som en arm som flyttar prostetisk grupp mellan enzymer, t.ex lipoamiden i pyruvatdehydrogenaskomplexet. Ritning: Lysin vid pH 2, fullständigt protonerad (sid 12). ![[Pasted image 20251129235808.png]]

1
wip/.~lock.excel.csv# Normal file
View File

@@ -0,0 +1 @@
,johandahlin,MacBook-Air-som-tillhor-Johan.local,11.12.2025 08:36,file:///Users/johandahlin/Library/Application%20Support/LibreOffice/4;

425
wip/excel.csv Normal file
View File

@@ -0,0 +1,425 @@
"date";"question_number";"category";"question";"maxpoints";"question";"answer"
"2024-01-27";"28";"elektrontransportkedjan";"A) Var i cellen och i vilken metabol process sker cellandning? B) Beskriv cellandningen med en formel. (4p) (Max 50 ord.)";"";"A) Var i cellen och i vilken metabol process sker cellandning? B) Beskriv cellandningen med en formel. (4p) (Max 50 ord.)";"3 av 4: A. I elektrontransportkedjan i mitokondriens innre membran. B. Syre + elektroner --> H O Själva cellandningen sker i komplex 4 i elektrontransportkedjan."
"2024-01-27";"5";"utforska-proteiner";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av COVID-19 (4p). (Max 200 ord.) a) Beskriv en analysmetod för att undersöka detta. b) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod?";"";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av COVID-19 (4p). (Max 200 ord.) a) Beskriv en analysmetod för att undersöka detta. b) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod?";"Jag väljer att använda en ELISA, närmare bestämt en sandwich ELISA som identifierar om patienten har antigen. I en sandwich ELISA tillsätts patientens prov till en brunn där det finns en fast antikropp, i detta fall för COVID-19. Om patienten har antigen för COVID-19 kommer dessa att binda till antikroppen. Efter detta sköljer man provet för att göra sig av med andra antigen och antikroppar. Därefter tillsätts en antikropp bunden till ett enzym, mha detta kan man få fram en färgskiftning i provet om det är positivt. Efter att den enzymbundna antikroppen tillsatts sköljer man ytterliggare en gång och tillsist tillsätter man ett substrat som inducerar en färgskiftning i provet om den enzymbunda antikroppen lyckats binda, om färgskiftning sker är provet positivt och patienten har således antigen för COVID-19."
"2024-01-27";"18";"termodynamik";"Varför ökar entropin i en spontan reaktion? Hur kan man förklara det molekylärt? (4p)";"";"Varför ökar entropin i en spontan reaktion? Hur kan man förklara det molekylärt? (4p)";"I en spontant reaktion ökar alltid entropin enligt termodynamikens lagar. Molekyler har en förmåga att vilja sprida ut sig och således öka entropin. Detta sker genom Brownsk rörelse, alltså när molekyler ""krockar"" med varandra och ändrar riktning. Molekyler kommer röra sig mot det område där minst krockar uppstår. Som exempel kan vi ta salt i vatten. Saltet kommer spontant att lösa upp sig i vattnet, öka entropin. Genom Brownsk rörelse, krockar mellan molekylerna, fördelas saltet i vätskan."
"2024-01-27";"1";"kemiska-bindingar";"Förklara vad van der Waals krafter är och ge ett exempel på hur de kan uppkomma i en biologisk molekyl. (4p) (Max 75 ord.)";"";"Förklara vad van der Waals krafter är och ge ett exempel på hur de kan uppkomma i en biologisk molekyl. (4p) (Max 75 ord.)";"Van der Waals krafter är de svagaste av bindingstyper. Runt en molekyl finns elektroner i elektronskal och vid något tillfälle är den lite mer positiv respektive negativ på ena sidan. Detta påverkar molekyler runt ikring som blir s.k. transienta dipoler. När dessa uppstår medkommer krafter mellan molekylerna som kallas van der Waals krafter/bindningar. Ett exempel på molekyler med mycket van der Waals krafter är aromatiska aminosyror som kan packas tätt pga sin planstruktur. Totalpoäng: 4"
"2024-01-27";"19";"enzymer";"Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.04 mM är, och för D-fruktos = 1.7 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (4p)";"";"Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.04 mM är, och för D-fruktos = 1.7 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (4p)";"Km är den koncentration substrat som behövs för att halva Vmax ska vara uppnått. I detta fall är Km betydligt lägre för D-glukos än för D-fruktos. I och med att Km är lägre för D-glukos uppnår enzymet en högre hastighet med D-glukos eftersom koncentrationen för båda substraten var 1mM. Km för D-frukots var 1,7 mM vilket betyder att vi inte ens uppnåt halva Vmax vid koncentrationen 1 mM D-fruktos. Eftersom Vmax är detsamma för båda substraten kan man utgå från att det substrat med lägst Km värde är det som kommer förbrukas först. Detta stämmer också in med att glukos är det primära bränslet som vi fått lära oss på föreläsningar."
"2024-01-27";"29";"betaoxidation";"Vilka två av följande påståenden om beta-oxidationen är korrekta? (2p) A: Vid beta-oxidation av en 16-kolatomers fettsyra produceras 8 acetyl-CoA. B: Beta-oxidationen sker framför allt i cytoplasman. C: Vid beta-oxidationen bryts framför allt trans-fettsyror ner. D: Beta-oxidationen kräver en fungerande citronsyracykel för att ATP ska produceras.";"";"Vilka två av följande påståenden om beta-oxidationen är korrekta? (2p) A: Vid beta-oxidation av en 16-kolatomers fettsyra produceras 8 acetyl-CoA. B: Beta-oxidationen sker framför allt i cytoplasman. C: Vid beta-oxidationen bryts framför allt trans-fettsyror ner. D: Beta-oxidationen kräver en fungerande citronsyracykel för att ATP ska produceras.";"A och D"
"2024-01-27";"4";"hemoglobin";"Describe the allosteric regulation of hemoglobin with an example. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words)";"";"Describe the allosteric regulation of hemoglobin with an example. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words)";"2 av 4: Hemoglobin is an oxygentransport protein which transport oxygen from our lungs to our muscles and tissue. Hemoglobin consists of four subunits, two alfa and two beta, with one Fe per unit. When oxygen binds to the first Fe it moves 0,4 Å upwards, closer to the heme-group. This induce a conformatioin change in hemoglobin which increases the affinty for oxygen for the next subunit. This is why hemoglobins curve is hyperbol. This is called cooperativity."
"2024-01-27";"16";"cellmembran";"Vilka två av dessa lipider hittas i det eukaryota cellmembranet? (2p) A: Sfingomyelin B: Kolesterol C: Fria fettsyror D: Triacylglycerol";"";"Vilka två av dessa lipider hittas i det eukaryota cellmembranet? (2p) A: Sfingomyelin B: Kolesterol C: Fria fettsyror D: Triacylglycerol";"A och B"
"2024-01-27";"22";"";"I katabolismen hittar vi många enzymer som tillhör gruppen (välj två) A: Dehydrogenaser B: Isomeraser C: Polymeraser D: Karboxylaser";"";"I katabolismen hittar vi många enzymer som tillhör gruppen (välj två) A: Dehydrogenaser B: Isomeraser C: Polymeraser D: Karboxylaser";"A och B"
"2024-01-27";"32";"nukleotidnedbrytning";"Varför måste ureacykeln användas vid nedbrytning av purin-nukleotider? (2p) (Max 50 ord)";"";"Varför måste ureacykeln användas vid nedbrytning av purin-nukleotider? (2p) (Max 50 ord)";"1 av 2: Puriner har två ringstruktur. I puriner finns det kväve och väte som bildar ammoniak vilket i höga koncentrationer är farligt för kroppen. Ureacyklen används för att göra sig av med ammoniaken genom urat och sedan urinen. AI: Nedbrytning av purinnukleotider frigör aminogrupper, som omvandlas till ammoniak via transaminering och glutamatdehydrogenas. Ammoniak är starkt toxiskt, särskilt för CNS, och måste därför oskadliggöras. Ureacykeln omvandlar ammoniak till urea, som kan utsöndras säkert via njurarna."
"2024-01-27";"26";"glykogen";"Beskriv översiktligt den allostera regleringen av glykogenfosforylas i skelettmuskel och lever, dvs de viktigaste allostera modulatorerna som reglerar enzymet i respektive vävnad. Ange om modulatorerna stimulerar eller hämmar enzymets aktivitet. Rätt kombination av alloster modulator och påverkan på enzymaktivitet krävs för poäng. (4p) (Max 75 ord)";"";"Beskriv översiktligt den allostera regleringen av glykogenfosforylas i skelettmuskel och lever, dvs de viktigaste allostera modulatorerna som reglerar enzymet i respektive vävnad. Ange om modulatorerna stimulerar eller hämmar enzymets aktivitet. Rätt kombination av alloster modulator och påverkan på enzymaktivitet krävs för poäng. (4p) (Max 75 ord)";"2 av 4: Glykogen fosforylas är ett av enzymen som bryter ner glykogen. I muskler ska glykogenet brytas ner och användas som bränsle. Cellen känner av energikvoten. Detta betyder att om energikvoten är låg och vi har mycket ADP kommer enzymet att stimuleras. Om det finns mycket ATP hämmas enzymet. I levern ska glykogenet brytas ner och reglera blodsockret mellan måltider. Om glukosnivåerna är låga kommer enzymet stimuleras och vice versa. Glukagon kommer då stimulera medan insulin hämmar. AI: Skelettmuskel: Glykogenfosforylas aktiveras allostert av AMP, som signalerar låg energi. Det hämmas av ATP och glukos-6-fosfat, som signalerar god energitillgång. Lever: Glykogenfosforylas hämmas av glukos, vilket speglar höga blodglukosnivåer. Levern saknar AMP-aktivering i fysiologiskt relevant grad, eftersom dess uppgift är att frisätta glukos, inte att reglera sin egen energistatus."
"2024-01-27";"12";"rna-syntes";"Vilka två påståenden stämmer om splicing? (2p) A: Vid alternativ splicing kan även exon tas bort. B: Greningsstället är alltid ett G. C: Spliceosomen består av både proteiner och RNA. D: En lariatstruktur består alltid av två sammanlänkade exoner.";"";"Vilka två påståenden stämmer om splicing? (2p) A: Vid alternativ splicing kan även exon tas bort. B: Greningsstället är alltid ett G. C: Spliceosomen består av både proteiner och RNA. D: En lariatstruktur består alltid av två sammanlänkade exoner.";"A och C"
"2024-01-27";"36";"plasmid";"Which two statements about restriction enzymes such as BamHI are correct? (2p) A: They allow the visualization of the DNA at the end of gel electrophoresis. B: They perform the ligation of an insert into a vector. C: They generate “sticky ends” or “blunt ends”. D: They recognise and cleave DNA at specific sequences. (Svar markerat Totalpoäng: 2)";"";"Which two statements about restriction enzymes such as BamHI are correct? (2p) A: They allow the visualization of the DNA at the end of gel electrophoresis. B: They perform the ligation of an insert into a vector. C: They generate “sticky ends” or “blunt ends”. D: They recognise and cleave DNA at specific sequences. (Svar markerat Totalpoäng: 2)";"C och D"
"2024-01-27";"27";"citronsyracykeln";"A) Vilka energirika föreningar bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Vilken är kopplingen mellan cellens energikvot och citronsyracykeln? (4p) (Max 75 ord.)";"";"A) Vilka energirika föreningar bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Vilken är kopplingen mellan cellens energikvot och citronsyracykeln? (4p) (Max 75 ord.)";"2 av 4: A. Tre NADH och en FADH2 B. NADH och FADH2 behövs för att transportera elektoner till elektrontransportkedjan som kan bygga upp en elektrokemisk gradient för att bilda ATP genom ATP syntaset. En låg energikvot betyder därav att det inte finns tillräckligt med NADH och FADH2 från citronsyracyklen. AI: A) Ett varv i citronsyracykeln bildar 3 NADH, 1 FADH₂ och 1 GTP (≈ATP). B) Hög energikvot (mycket ATP, NADH) hämmar cykeln, främst via isocitratdehydrogenas och α-ketoglutaratdehydrogenas. Låg energikvot (mycket ADP, NAD⁺) stimulerar cykeln. Cykeln regleras alltså efter cellens energibehov."
"2024-01-27";"13";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Lac-operonet behövs för att uttrycka enzymer som kan bryta ner laktos (mjölksocker). Vilka två påståenden stämmer? (2p) A: När allolaktos finns närvarande kan lac-repressorn inte binda till operator-sekvensen. B: I närvaro av laktos är lac-operonet fullt påslaget, även om det finns rikligt med glukos i omgivningen. C: I närvaro av höga mängder glukos stimuleras bildning av cAMP. D: cAMP binder till CAP och stimulerar aktiviteten hos detta aktivator-protein.";"";"Lac-operonet behövs för att uttrycka enzymer som kan bryta ner laktos (mjölksocker). Vilka två påståenden stämmer? (2p) A: När allolaktos finns närvarande kan lac-repressorn inte binda till operator-sekvensen. B: I närvaro av laktos är lac-operonet fullt påslaget, även om det finns rikligt med glukos i omgivningen. C: I närvaro av höga mängder glukos stimuleras bildning av cAMP. D: cAMP binder till CAP och stimulerar aktiviteten hos detta aktivator-protein.";"A och D"
"2024-01-27";"17";"transport-över-cellmembran";"Redogör för den principiella uppbyggnaden av spänningsaktiverade katjonkanaler och hur de öppnas. (4p) (Max 100 ord)";"";"Redogör för den principiella uppbyggnaden av spänningsaktiverade katjonkanaler och hur de öppnas. (4p) (Max 100 ord)";"2 av 4: En jonkanal består av sex olika segment. Segment 5 och 6 bildar själva centralporen medan segment 1-3 tillsammans med segment 4 bildar den spännings känsliga padeln. Segment 4 är det segment som känner av själva spänningsförändringen. När en en spänningsförändring i membranet sker registeras detta hos padlen vilket inducerar en konformationsändring och får den att ställa sig på ""högkant"". Detta öppnar katjonkanalen och joner kan flöda in eller ut ur cellen. AI: Spänningsaktiverade katjonkanaler består av fyra domäner (eller fyra separata subenheter) som vardera har sex transmembransegment (S1S6). Segmentet S4 innehåller positivt laddade aminosyror och fungerar som spänningssensor. När membranet depolariseras rör sig S4 utåt, vilket drar i kopplade segment (framför allt S5S6) och öppnar poren. En selektivitetsfilterregion bestämmer vilka katjoner som passerar. Kanalen kan även inaktiveras via en separat “inaktiveringsgrind” efter öppning."
"2024-01-27";"23";"glykolysen";"Vilka två av nedanstående metaboliter ingår i glykolysen? A: Fruktos 2,6-bisfosfat B: Glukos 1-fosfat C: Glyceraldehyd 3-fosfat D: Fosfoenolpyruvat";"";"Vilka två av nedanstående metaboliter ingår i glykolysen? A: Fruktos 2,6-bisfosfat B: Glukos 1-fosfat C: Glyceraldehyd 3-fosfat D: Fosfoenolpyruvat";"C och D"
"2024-01-27";"33";"pentosfosfatvägen";"Mutationer i genen som kodar för enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas kan leda till ett defekt enzym vilket i sin tur kan orsaka hemolytisk anemi i vissa situationer. Vilken är grundorsaken till detta? (2p) (Max 50 ord)";"";"Mutationer i genen som kodar för enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas kan leda till ett defekt enzym vilket i sin tur kan orsaka hemolytisk anemi i vissa situationer. Vilken är grundorsaken till detta? (2p) (Max 50 ord)";"1 av 2: Glukos 6-fosfatdehydrogenas är det första enzymet i pentosfosfatvägen, som körs för att bilda NADPH och ribos 5-fosfat. Vid deffekt i detta enzym bildas inte tillräckligt med NADPH som skyddar mot reaktiva syreföreningar. Detta är speceillt farligt för t.ex. eretrocyter som saknar mitokondrier och måste få allt sitt NADPH från pentosfofsfatvägen. AI: Glukos-6-fosfatdehydrogenas behövs för att bilda NADPH i pentosfosfatvägen. NADPH håller glutation reducerat, vilket skyddar erytrocyter mot oxidativ skada. Vid enzymdefekt saknar cellen detta skydd → oxidativ stress skadar membran och hemoglobin → erytrocyterna hemolyserar."
"2024-01-27";"24";"integrering-av-metabolismen";"Förklara hur arsenikförgiftning påverkar metabolismen och varför liknande påverkan ses vid alkoholism. (4p) (Max 120 ord)";"";"Förklara hur arsenikförgiftning påverkar metabolismen och varför liknande påverkan ses vid alkoholism. (4p) (Max 120 ord)";"3 av 4: Arsenit har affiniet för sulfhydrylgrupper. En viktig del i PDH komplexet är den arm som för intermediärerna mellan E1, E2 och E3. Denna arm bygger på just svavel. Armen inhiberas således av arsenit när bindningar mellan arsenit och armen bildas vilket medför att vi inte kan producera lika mycket eller ingen acetyl-CoA. Utan acetyl-CoA kan vi inte köra citronsyracyklen och således inte få fram NADH och FADH2 till elektrontransport kedjan. Alkholism leder till liknande effekter då de polära alkholerna kan binda till den intermediär-transportrande armen och inhibiera PDH komplexet. PDH=Pyruvat dehydrogenas"
"2024-01-27";"10";"dna-replikation";"![[Pasted image 20251129235332.png]] På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. A) Ange för positionerna a, b, c och d om de motsvarar en 5 eller 3-ände. Vid DNA replikation skapas de två strängarna på litet olika vis. B) Vad kallas strängen som markerats med e? C) Vad kallas strängen som markerats med f? (4p)";"";"![[Pasted image 20251129235332.png]] På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. A) Ange för positionerna a, b, c och d om de motsvarar en 5 eller 3-ände. Vid DNA replikation skapas de två strängarna på litet olika vis. B) Vad kallas strängen som markerats med e? C) Vad kallas strängen som markerats med f? (4p)";"a = 5´ b = 3´ c = 5´ d = 5´ B) Leadning strand C) Lagging strand"
"2024-01-27";"9";"kromatin";"Var binder histon H1? Vilken roll spelar detta protein? (4p)";"";"Var binder histon H1? Vilken roll spelar detta protein? (4p)";"Histon 1, H1, upptäcktes senare än de andra histonen, H2A, H2B, H3 och H4. H1 har i uppgift att stabilisera och binder till linker DNA som finns mellan ""histonpärlorna"""
"2024-01-27";"34";"kolesterol";"Vilket av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten in vivo? (2p) A: Den intracellulära kolesterolhalten regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet lysosomal acid lipas (LAL). B: Den intracellulära kolesterolhalten regleras i princip enbart via endogen syntes - upptaget av kolesterol från det extracellulära rummet är normalt försumbart. C: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol på en fettsyra. D: Celler utanför levern kan göra sig av med ett överskott av kolesterol genom att överföra detta till HDL-partiklar, som för kolesterolet tillbaka till levern.";"";"Vilket av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten in vivo? (2p) A: Den intracellulära kolesterolhalten regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet lysosomal acid lipas (LAL). B: Den intracellulära kolesterolhalten regleras i princip enbart via endogen syntes - upptaget av kolesterol från det extracellulära rummet är normalt försumbart. C: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol på en fettsyra. D: Celler utanför levern kan göra sig av med ett överskott av kolesterol genom att överföra detta till HDL-partiklar, som för kolesterolet tillbaka till levern.";"C och D"
"2024-01-27";"14";"translation";"Beskriv i detalj hur terminationssteget i proteinsyntesen fungerar med särskilt fokus på funktionen av stoppkodon och ribosomens struktur. Förklara även hur Release Factor 1 (RF1) bidrar till processen. (4p) (Max 150 ord)";"";"Beskriv i detalj hur terminationssteget i proteinsyntesen fungerar med särskilt fokus på funktionen av stoppkodon och ribosomens struktur. Förklara även hur Release Factor 1 (RF1) bidrar till processen. (4p) (Max 150 ord)";"3 av 4: Ribosomen består av två subenheter, hos människan heter dessa 40 och 60. Den lilla subenheten, 40, har i uppgift leta efter starkodonet men också känna av stoppkodonet. Den stora subenheten, 60, har i uppgift att katalysera inbindingen av rätt aminosyra till en växande aminosyra sekvens i P-site. I terminations steget kommer ribosomen, 40 enheten, att känna av en cleavage signal som får RF1 att avsluta translationen. Cleavage signal är alltså ett stoppkodon. Det som sker är att RF1 kommer klyva den nu färdig byggda aminosyra sekvens som växt fram i P-site så att den transporteras till sin ämmnade destination."
"2024-01-27";"20";"enzymer";"Vilka två påståenden om kompetitiva hämmare är korrekta? (2p) A: De binder reversibelt till det aktiva stället. B: De binder till flera olika ställen på ett enzym. C: De sänker reaktionens karakteristiska Km. D: De binder kovalent till enzymet.";"";"Vilka två påståenden om kompetitiva hämmare är korrekta? (2p) A: De binder reversibelt till det aktiva stället. B: De binder till flera olika ställen på ett enzym. C: De sänker reaktionens karakteristiska Km. D: De binder kovalent till enzymet.";"A och C"
"2024-01-27";"30";"heme";"Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur detta sker. (4p)";"";"Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur detta sker. (4p)";"AI: Hemesyntesen styrs av hur mycket järn som finns i cellen genom reglering av ALA-syntas (erytroid isoform). När järn är lågt binder IRP till en IRE-sekvens i 5-änden av ALAS-mRNA och blockerar translationen, vilket bromsar hemesyntesen. När järn är tillräckligt släpper IRP → ALA-syntas kan översättas → hemesyntesen ökar. På så sätt matchas hemeproduktionen med tillgängligt järn."
"2024-01-27";"15";"evolution";"Hur kan man bestämma släktskap mellan olika arter med DNA-teknik och varför fungerar det? (4p)";"";"Hur kan man bestämma släktskap mellan olika arter med DNA-teknik och varför fungerar det? (4p)";"Genom att sekvensera DNA kan man se hur mycket som stämmer överens mellan olika arter. Även om majoriteten av vårt DNA är sig likt hos många arter kan man ändå se skillnader på t.ex. mutationer. För att exemplifiera: DNA't hos en människa och en orangutang är mycket likt varandra, men pga DNA'ts ordning, proteinveckning och epigentik kan det uttryckas väldigt olika och således ge upphov till olika utseende, beetende och andra egenskaper. Således kan okika arter vara nära besläktande med varandra, alltså ha liknade DNA, men ändå vara olika arter."
"2024-01-27";"21";"introduktion-till-metabolismen";"Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs minskar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från fruktos 1,6-bisfosfat. C: ATP innehåller färre fosfoanhydridbindningar än fosfatgrupper. D: I en välmående cell finns mer ATP än ADP.";"";"Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs minskar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från fruktos 1,6-bisfosfat. C: ATP innehåller färre fosfoanhydridbindningar än fosfatgrupper. D: I en välmående cell finns mer ATP än ADP.";"C och D"
"2024-01-27";"31";"aminosyrametabolism";"Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Vid fenylketonuri blir aminosyran fenylalanin essentiell. B: Ureacykeldefekter leder till hyperammonemi. C: Det kliniskt viktiga enzymet aspartataminotransferas kan bilda aspartat från pyruvat i en så kallad transamineringsreaktion. D: Aspartat är en glukogen aminosyra.";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Vid fenylketonuri blir aminosyran fenylalanin essentiell. B: Ureacykeldefekter leder till hyperammonemi. C: Det kliniskt viktiga enzymet aspartataminotransferas kan bilda aspartat från pyruvat i en så kallad transamineringsreaktion. D: Aspartat är en glukogen aminosyra.";"B och D"
"2024-01-27";"25";"glukoneogenes";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker främst i levern. B: Kol oxideras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 1,6-bisfosfat. D: Aminosyrorna cystein och metionin är glukogena.";"";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker främst i levern. B: Kol oxideras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 1,6-bisfosfat. D: Aminosyrorna cystein och metionin är glukogena.";"A och D"
"2024-01-27";"11";"dna-replikation";"Telomeras är ett omvänt transkriptas. Vad använder detta enzym som templat (mall)? Nämn också två typer av celler i vilka detta enzym återfinns. (4p)";"";"Telomeras är ett omvänt transkriptas. Vad använder detta enzym som templat (mall)? Nämn också två typer av celler i vilka detta enzym återfinns. (4p)";"Telomeras har med sig en egen RNA sekvens som den använder som mall när det ska förlänga telomererna. Detta enzym återfinns i t.ex. stamceller och cancer celler."
"2024-01-27";"8";"nukleotider";"Vilka två nedanstående påståenden är korrekta? (2p) A: Uracil är en kvävebas i DNA. B: Kolatomen i position 1' hos sockret är bunden till kvävebasen via en β-glykosid-bindning. C: Adenosin är en nukleosid. D: ATP innehåller två fosfatgrupper.";"";"Vilka två nedanstående påståenden är korrekta? (2p) A: Uracil är en kvävebas i DNA. B: Kolatomen i position 1' hos sockret är bunden till kvävebasen via en β-glykosid-bindning. C: Adenosin är en nukleosid. D: ATP innehåller två fosfatgrupper.";"B och C"
"2024-01-27";"35";"introduktionslaboration";"I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värdet på 0.03 och ett 95% konfidensintervall på 6-17 mmHg. Diskutera vad dessa resultat ger oss för information och huruvida nollhypotesen kan förkastas. (4p) (Max 100 ord).";"";"I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värdet på 0.03 och ett 95% konfidensintervall på 6-17 mmHg. Diskutera vad dessa resultat ger oss för information och huruvida nollhypotesen kan förkastas. (4p) (Max 100 ord).";"2 av 4: Detta resultat visar att nollhypotesen kan förkastas då p-värdet är under 0,05 då det finns sk. statistisk signifikans. Hade p-värdet varit över 0,05 hade man inte kunnat förkasta nollhypotesen. Vidare visar konfidensintervallet att 95% av de som fick den blodtryckssänknade medicinen fick ett lägre blodtryck med 6-17 mmHg. AI: p-värdet 0,03 innebär att om nollhypotesen (ingen skillnad i medelblodtryck) vore sann, skulle en så här stor eller större skillnad uppstå bara i cirka 3 % av fallen. Nollhypotesen kan därför förkastas vid 5 %-nivån. Ett 95 % konfidensintervall på 617 mmHg innebär att vi med 95 % säkerhet skattar den sanna medelreduktionen i blodtryck till mellan 6 och 17 mmHg, och eftersom intervallet inte innehåller 0 talar det också för en statistiskt signifikant blodtryckssänkande effekt."
"2024-01-27";"3";"från-aminosyror-till-proteiner";"Lista fyra egenskaper hos en alfahelix. (4p) (Max 75 ord.)";"";"Lista fyra egenskaper hos en alfahelix. (4p) (Max 75 ord.)";"3 av 4: 1. Har en konstant diameter. 2. Har kvävebaserna innåt och fosfatgrupperna och sockret utåt. (Pga hydrofob/hydrofil) 3. Kan polymeriseras till beta flaks liknande strukturer och bilda amyloider => Sjukdom. 4. Kan bilda transmembran-alfahelixar om det finns mycket hydrofoba aminosyror. Går att undersöka genom hydropatiplot."
"2024-01-27";"7";"kolhydrater";"Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och proteoglykaner. (4p) (Max 150 ord)";"";"Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och proteoglykaner. (4p) (Max 150 ord)";"2 av 4: Glykoproteiner och proteoglykaner är båda former av glykokonjugat och består båda av proteiner och socker. Glykoproteiner är väldigt långa och repetativa, tillskillnad från proteoglykaner. Både glykoproteiner och proteoglykaner finns ut mot ECM och har något att göra med cellens kommunikation/interaktion med andra celler, bakterier och virus. De kan också utgöra skydd. Glykoproteiner kan vara O-länkade eller N-länkade. Det vill säga om de är länkade via syret (O) i serin eller teronins funktionella grupp eller via kvävet (N) i aspargins funktionella grupp."
"2024-01-27";"6";"cellmembran";"Rita den principiella strukturen för en glykolipid. (4p)";"";"Rita den principiella strukturen för en glykolipid. (4p)";""
"2024-01-27";"2";"från-aminosyror-till-proteiner";"Vilka två av nedanstående aminosyror är de mest troliga att förekomma mot ytan av ett cytoplasmatiskt protein? A: Fenylalanin B: Serin C: Alanin D: Cystein";"";"Vilka två av nedanstående aminosyror är de mest troliga att förekomma mot ytan av ett cytoplasmatiskt protein? A: Fenylalanin B: Serin C: Alanin D: Cystein";"B och D"
"2022-01-29";"28";"pentosfosfatvägen";"Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: En fungerande pentosfosfatväg behövs för att upprätthålla ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar i röda blodkroppar. B: Fruktos 6-fosfat och glyceraldehyd 3-fosfat kan bildas i pentosfosfatvägens oxidatativa fas. C: Det som styr om glukos 6-fosfat ska slussas in i pentosfosfatvägens oxidataiva fas är de intracellulära nivåerna av NADP+ och NADPH. D: Pentosfosfatvägen är förlagd i mitokondriens matrix.";"";"Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: En fungerande pentosfosfatväg behövs för att upprätthålla ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar i röda blodkroppar. B: Fruktos 6-fosfat och glyceraldehyd 3-fosfat kan bildas i pentosfosfatvägens oxidatativa fas. C: Det som styr om glukos 6-fosfat ska slussas in i pentosfosfatvägens oxidataiva fas är de intracellulära nivåerna av NADP+ och NADPH. D: Pentosfosfatvägen är förlagd i mitokondriens matrix.";"A och C"
"2022-01-29";"5";"nukleotider";"Fråga 5 A. Hur många vätebindningar finns i AT resp. GC baspar? B. Hur påverkar baskompositionen DNA stabiliteten? (2p)";"";"Fråga 5 A. Hur många vätebindningar finns i AT resp. GC baspar? B. Hur påverkar baskompositionen DNA stabiliteten? (2p)";"A. AT har 2 vätebidningar GC har 3 vätebidningar B. Detta gör att vätebidningarna mellan G och C är stabilare eftersom det finns fler bidningspunkter. AT-bidningarna som har färre bindningspunkter /par är därmed ostabilare, detta är något som kan utnyttjas vid bl.a. transkription, eftersom DNA blir mer lättsmält vid AT-rika sekvenser som TATA-boxen."
"2022-01-29";"18";"enzymer";"För ett enzym är Michaelis-Mentens konstant (KM) 15 mM. Vid en substratkoncentration på 5 mM, vad är förhållandet mellan reaktionshastigheten V och den maximala reaktionshastigheten Vmax? Motivera ditt svar. (Max 150 ord) (2p) ![[Pasted image 20251128081722.png]]";"";"För ett enzym är Michaelis-Mentens konstant (KM) 15 mM. Vid en substratkoncentration på 5 mM, vad är förhållandet mellan reaktionshastigheten V och den maximala reaktionshastigheten Vmax? Motivera ditt svar. (Max 150 ord) (2p) ![[Pasted image 20251128081722.png]]";"Reaktionshastigheten vid 5mM är alltså en fjärdedel av hastigheten vid Vmax"
"2022-01-29";"1";"från-aminosyror-till-proteiner";"A) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en vätebindning kan bildas. Ange vilka atomer som är donator respektive acceptor i vätebindningen. B) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en jonbindning kan bildas vid pH = 7.";"";"A) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en vätebindning kan bildas. Ange vilka atomer som är donator respektive acceptor i vätebindningen. B) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en jonbindning kan bildas vid pH = 7.";"a) Serin syre är donator, Asparagin kväve är acceptor b) Lysin, Aspartat"
"2022-01-29";"19";"enzymer";"I en av delreaktionerna som katalyseras av chymotrypsin krävs närvaro av vatten, medan i en annan delreaktion krävs det att inget vatten är närvarande. Vilka är dessa delreaktioner och varför krävs närvaro respektive frånvaro av vatten i de respektive stegen? (Max 150 ord) (2p)";"";"I en av delreaktionerna som katalyseras av chymotrypsin krävs närvaro av vatten, medan i en annan delreaktion krävs det att inget vatten är närvarande. Vilka är dessa delreaktioner och varför krävs närvaro respektive frånvaro av vatten i de respektive stegen? (Max 150 ord) (2p)";"I delreaktion 1 krävs inget vatten, då his tar emot vätet från asp som gör en nukleofilattack på den inkommande peptidbidningen. I delreaktion 2 krävs vatten, för att den peptiden ska klyvas och släppa från chymotrypsin"
"2022-01-29";"29";"nukleotidnedbrytning";"Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Nukleosidaser spjälkar av fosfatgrupper från nukleotider. B: Delar av purinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Kvävebaser som frisätts vid nedbrydning av nukleotider återanvänds ofta för nukleotidsyntes. D: Kväveatomerna i pyrimidinerna hamnar huvudsakligen i urat då dessa kvävebaser bryts ned.";"";"Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Nukleosidaser spjälkar av fosfatgrupper från nukleotider. B: Delar av purinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Kvävebaser som frisätts vid nedbrydning av nukleotider återanvänds ofta för nukleotidsyntes. D: Kväveatomerna i pyrimidinerna hamnar huvudsakligen i urat då dessa kvävebaser bryts ned.";"Rätt svar 1. C"
"2022-01-29";"4";"lipider";"Fråga 4 Vilken/vilka av dessa är en omega-3 fettsyra? (1p) ![[Pasted image 20251128081622.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: B B: C C: A D: D";"";"Fråga 4 Vilken/vilka av dessa är en omega-3 fettsyra? (1p) ![[Pasted image 20251128081622.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: B B: C C: A D: D";"Rätt svar 1. A 2. B"
"2022-01-29";"16";"rekombinant-dna-teknik";"Bacterial DNA may end up in a bacteriophage due to (choose one or more)/Bakteriellt DNA kan hamna i en bakteriofag för att (välj ett eller flera alternativ): (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Errors during the assembly of new bacteriophages./Fel som sker när nya bakteriofager sätts samman. B: The small and circular nature of bacterial DNA./Bakteriellt DNA är cirkulärt och litet. C: Template switching during bacterophage DNA replication./Ändring av mall när bakteriofagens DNA replikeras. D: Imprecise excision of the prophage./Inexakt utklippning av profagen.";"";"Bacterial DNA may end up in a bacteriophage due to (choose one or more)/Bakteriellt DNA kan hamna i en bakteriofag för att (välj ett eller flera alternativ): (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Errors during the assembly of new bacteriophages./Fel som sker när nya bakteriofager sätts samman. B: The small and circular nature of bacterial DNA./Bakteriellt DNA är cirkulärt och litet. C: Template switching during bacterophage DNA replication./Ändring av mall när bakteriofagens DNA replikeras. D: Imprecise excision of the prophage./Inexakt utklippning av profagen.";"Rätt svar 1. D"
"2022-01-29";"22";"glukosmetabolism";"Redogör för hur enzymet fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktokinas 2 regleras och spelar en central roll i glukosmetabolismen. Max 150 ord. (2p)";"";"Redogör för hur enzymet fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktokinas 2 regleras och spelar en central roll i glukosmetabolismen. Max 150 ord. (2p)";"Enzymets aktivitet styrs av hormonreglering och fosforylering. När insulin binder in till cellens recptor stimuleras PP1. Funktionen för PP1 är att defosforylera enzymet. När fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2 är defosforylerat inhiberas fosfatasdelen medan kinasdelen aktiveras. När kinasdelen är aktiverad katalyseras reaktionen där fruktos 6-fosfat blir fruktos-2,6-bisfosfat. När glukagon binder in till cellens receptor sätter en kaskadreaktion igång där cAMP genereras, vilket aktiverar PKA. PKAs aktivitet leder till en inhibering av PP1 och en fosforylering av enzymet fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2. Fosforyleringen inhiberar kinas delen och aktiverar fosfataset. När fosfatasdelen är aktiv katalyseras reaktionen där fruktos-2,6-bisfosfat återbildas till fruktos 6-fosfat. Detta spelar en central roll i metabolismen då hög koncentration av fruktos-2,6-bisfosfat (vilket bildas när enzymet är defosforylerat) stimulerar glykolysenzymet fosfofruktikinas 1 (som katalyserar reaktionen fruktos 6-fosfat --> fruktos 1,6-bisfosfat) samtidigt som det inhiberar glykoneogenes enzymet fruktos 1,6-bisfosfatas (som katalyserar reaktionen fruktos 1,6-bisfosfat --> fruktos 6-fosfat). Alltså fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2 styr mängden fruktos-2,6-bisfosfat vilket reglerar om cellen ska köra glykolys eller glukoneogenes."
"2022-01-29";"32";"cellmembran";"Beskriv uppbyggnaden av ett GPI-ankare. (2p)";"";"Beskriv uppbyggnaden av ett GPI-ankare. (2p)";"En GPI-ankare består av 3 olika molekyler bundna till varandra, den innersta delen fäster till cellmembranet och den yttersta delen binder till tex. en kolhydrat."
"2022-01-29";"26";"elektrontransportkedjan";"Redogör för mekanismen hos ATP-syntas i mitokondriens innermembran. Max 150 ord. (2p)";"";"Redogör för mekanismen hos ATP-syntas i mitokondriens innermembran. Max 150 ord. (2p)";"ATP-syntas funktion är att utnyttja den elektrokemiska gradienten som skapats av de protonpumpande komplexen i ETK, för att omvandla vätejoners rörelseenergi till kemisk bidningsenergi mellan fosfatgrupperna i ATP. Detta sker genom att vätejoner som strävar efter att ta sig från mmu genom innermembranet till matrix för att jämna ut gradienten åker in och neutraliserar en halvkanal i F0s c-ring, som roterar ett steg för varje vätejon som binder in. (När vätejonen åkt ett helt varv släpps den ut i matrix.) Rörelseenergin som skapas av rotationen i c-ringen leds genom den roterande gammasjälken till F1-enheten som finns i matrix och inducerar konformationsändringar i dess subenheter. ADP + Pi binder in i B-subeneheterna under Loose state, binds samman under Tense state och släpps ut som ATP under Open state."
"2022-01-29";"12";"rna-syntes";"Vilket/vilka av följande alternativ beskriver en funktion för poly-A svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid B: Skyddar mot felaktig splicing C: Samverkar med 5'-cap för att stimulera translation D: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan";"";"Vilket/vilka av följande alternativ beskriver en funktion för poly-A svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid B: Skyddar mot felaktig splicing C: Samverkar med 5'-cap för att stimulera translation D: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan";"Rätt svar 1. A 2. C"
"2022-01-29";"27";"aminosyrametabolism";"Vilka är de två viktigaste transportörerna av kväve från kroppens vävnader till levern, och via vilka två andra molekyler kommer de två kväveatomerna, som slutligen hamnar i urea, föras in i ureacykelns cykliska del? (2p)";"";"Vilka är de två viktigaste transportörerna av kväve från kroppens vävnader till levern, och via vilka två andra molekyler kommer de två kväveatomerna, som slutligen hamnar i urea, föras in i ureacykelns cykliska del? (2p)";"De två viktigate transportörerna av kväve från kroppen vävnader är alanin och asparagin. Kväveatomerna hamnar i urea cykeln genom glutamat, vars kvävegrupp reagerar med koldioxid och bildar karbamoyl som sedan reagerar och bildar citrulin. Och asparaginsyra som i nästa steg lämnar av sin kvävegrupp till citrulin som då bildar argininsuccinat."
"2022-01-29";"13";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Which protein is often required to initiate transcription by a bacterial RNA polymerase? How does it mediate initiation?/Vilket protein behövs ofta för att initiera transkription av bakteriellt RNA-polymeras? Hur underlättar det initieringen? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska.";"";"Which protein is often required to initiate transcription by a bacterial RNA polymerase? How does it mediate initiation?/Vilket protein behövs ofta för att initiera transkription av bakteriellt RNA-polymeras? Hur underlättar det initieringen? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska.";"Proteinet CAP behövs för att binda in cAMP för att aktivera RNA-polymeraset, så att det sedan kan hitta fram till promotorn och där starta transkriptionen."
"2022-01-29";"17";"termodynamik";"Alexandra and Bill were the finalists of the Swedish Thermodynamics championship quiz. In a crucial tie-breaker, they were asked to say something about exergonic and endergonic reactions. Alexandra said: In an exergonic reaction, energy is released from the system to the surroundings. Bill said: In an endergonic reaction, ∆G is negative./Alexandra och Bill var finalister i Sveriges termodynamiska mästerskapsquiz. I en utslagsfråga blev de ombedda att säga något om exergona och endergona reaktioner. Alexandra sa: ”I en exergon reaktion avges energi från systemet till omgivningen”. Bill sa: ”I en endergon reaktion är ∆G negativt.” (1p) Välj ett alternativ: A: Both Alexandra and Bill are correct./Både Alexandra och Bill har rätt. B: Only Alexandra is correct./Enbart Alexandra har rätt. C: Only Bill is correct./Enbart Bill har rätt D: Both Alexandra and Bill are wrong./Både Alexandra och Bill har fel.";"";"Alexandra and Bill were the finalists of the Swedish Thermodynamics championship quiz. In a crucial tie-breaker, they were asked to say something about exergonic and endergonic reactions. Alexandra said: In an exergonic reaction, energy is released from the system to the surroundings. Bill said: In an endergonic reaction, ∆G is negative./Alexandra och Bill var finalister i Sveriges termodynamiska mästerskapsquiz. I en utslagsfråga blev de ombedda att säga något om exergona och endergona reaktioner. Alexandra sa: ”I en exergon reaktion avges energi från systemet till omgivningen”. Bill sa: ”I en endergon reaktion är ∆G negativt.” (1p) Välj ett alternativ: A: Both Alexandra and Bill are correct./Både Alexandra och Bill har rätt. B: Only Alexandra is correct./Enbart Alexandra har rätt. C: Only Bill is correct./Enbart Bill har rätt D: Both Alexandra and Bill are wrong./Både Alexandra och Bill har fel.";"Rätt svar 1. B"
"2022-01-29";"23";"glykogen";"Vad gör proteinet glykogenin och vilken viktig roll spelar enzymet i relation till glykogenmetabolism? (2p)";"";"Vad gör proteinet glykogenin och vilken viktig roll spelar enzymet i relation till glykogenmetabolism? (2p)";"Glykogenin är ett protein som fungerar som en primer i glykogensyntesen. Det har en enzymaktivitet som fäster några glukos-enheter på sig själv för att utgöra en primer som glykogensyntataset kan syntetisera vidare på. Utan glykogenin skulle inte glykogensyntaset ha någon reducerad ände att starta sin glykogensyntes ifrån och vi skulle därmed inte kunna få någon glykogensyntes."
"2022-01-29";"33";"transport-över-cellmembran";"Rangordna molekylerna vatten, leucin, glukos och kväveoxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den molekyl som har lättast att passera. Ange två egenskaper hos varje molekyl av betydelse för deras placering i listan. (2p)";"";"Rangordna molekylerna vatten, leucin, glukos och kväveoxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den molekyl som har lättast att passera. Ange två egenskaper hos varje molekyl av betydelse för deras placering i listan. (2p)";"Vatten - liten, oladdad molekyl Glukos - hydrofob, relativt stor molekyl Leucin - oladdad, hydrofil ""kropp"" (alltså NH3+ och COO-, inte R-kedjan) Kväveoxid - laddad, hydrofil"
"2022-01-29";"24";"integrering-av-metabolismen";"Redogör för vilket sätt arsenikförgiftning påverkar metabolismen och vad som kan göras för att häva förgiftningen. Max 150 ord. (2p)";"";"Redogör för vilket sätt arsenikförgiftning påverkar metabolismen och vad som kan göras för att häva förgiftningen. Max 150 ord. (2p)";"Arsenikförgiftning hämmar natrium/kalium-pumpen vilket förstör gradienterna. Pumpen upprätthåller gradienter över membranet som annars skulle utjämnas av jonkanalerna. Cellen är beroende av gradienten för att upprätthålla vissa reaktioner i cellen och transporter över cellmembranet. Bl.a. så utnyttjas den uppbyggda kaliumgradienten för att aktivit (sekundär aktiv transport) transportera glukos in i cellen genom att kalium som transporteras med sin gradient drar med sig glukosmolekylen mot sin gradient in i cellen."
"2022-01-29";"10";"dna-replikation";"Explain how proofreading works at the molecular level during bacterial replication./Förklara hur korrekturläsning fungerar på molekylär nivå under bakteriell replikation. (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska.";"";"Explain how proofreading works at the molecular level during bacterial replication./Förklara hur korrekturläsning fungerar på molekylär nivå under bakteriell replikation. (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska.";"DNA-polymeras 3 har både en DNA-syntetiserande del och en exonukleas del, detta gör det möjligt för polymeraset att ""backtracka"" om den skulle upptäcka att något basparat fel. Detta gör den genom sin exonukleas-aktivitet där den klyver peptidbidningar (genom att backa) 3´ till 5´. När den klyvt bort den/de felparade baserna syntetiserar den nya baser 5´ till 3´ och fortsätter som vanligt. DNA-polymeras 1 vars funktion är att klippa bort RNA-primer och syntetisera nya baser i gapsen har samma exonukleasa funktion (3´ till 5´ radering) för att korrigera den korta del den nyligen syntetiserat om ett fel skulle upptäckas."
"2022-01-29";"9";"evolution";"Discuss the evolutionary origin of RNase P. This question needs to be answered in English. (Max 100 words.) (2p)";"";"Discuss the evolutionary origin of RNase P. This question needs to be answered in English. (Max 100 words.) (2p)";"The RNaseP is an enzyme consisting of both RNA and protein. By comparing the level of protein in different organisms we can see that in less complex organisms like bacteria the enzyme consists of most RNA and only one protein unit, comparing with ""arkener"" which is a more complex organism there is shorter/smaller RNA unit and more protein units. In even more complex organisms like humans the protein units are much greater than the RNA-unit. This provens the hypothesis that RNA also acted as enzymes long time ago, before ""the tasks were split"" to proteins to be more efficient."
"2022-01-29";"34";"plasmid";"I vilken ordning genomförs nedanstående steg när plasmider ska renas? (1p) Eluera plasmiderna från kolumnen Lysera cellerna Neutralisera lysatet Pelletera cellkulturen som växt under natten";"";"I vilken ordning genomförs nedanstående steg när plasmider ska renas? (1p) Eluera plasmiderna från kolumnen Lysera cellerna Neutralisera lysatet Pelletera cellkulturen som växt under natten";"1. Pelletera cellkulturen som växt under natten 2. Lysera cellerna 3. Neutralisera lysatet 4. Eluera plasmiderna från kolumnen"
"2022-01-29";"14";"rna-syntes";"Vad är intron och exon? (2p)";"";"Vad är intron och exon? (2p)";"Intron och exon är båda en del av den transkriberade omogna RNA-kedjan. För att skapa ett moget mRNA klipps introner (""onödiga"" RNA-sekvenser) bort genom splicing. Medan de sekvenser som krävs för transaltion utgör den mogna RNA-kedjan och används som mall i proteinsyntesen. Det finns flera exon på samma mRNA kedja, vissa exon kan också klippas bort för att samma gen kan koda för olika protein. Vilket protein som uttryck styrs av miljön i cellen och beror alltså på vilka exon som sparas."
"2022-01-29";"20";"introduktion-till-metabolismen";"Vilket/vilka av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan positiva laddningar. B: När en fosfatgrupp avges kan ADP resonansstabiliseras. C: När en fosfatgrupp frigörs ökar entropin. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i GTP.";"";"Vilket/vilka av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan positiva laddningar. B: När en fosfatgrupp avges kan ADP resonansstabiliseras. C: När en fosfatgrupp frigörs ökar entropin. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i GTP.";"Rätt svar 1. C 2. D"
"2022-01-29";"30";"heme";"Syntes av heme beror på cellens tillgång till järn. Beskriv vad som sker när järntillgången är låg. (2p)";"";"Syntes av heme beror på cellens tillgång till järn. Beskriv vad som sker när järntillgången är låg. (2p)";"På mRNA som används som mall för att syntetisera ALA-syntetaset som behövs vid hemsyntes finns den reglerande sekvensen IRE, Ire Respossible Element. När järntillgången är låg binder IRP, IRE-binding protein, till IRE vilket hämmar translationen av det nödvändiga enzymet ALA-syntas. Detta inhiberar hemsyntesen, vilket är syftet eftersom vi inte har något järn."
"2022-01-29";"15";"translation";"What regions of a tRNA are recognized by amino-acyl-tRNA synthetases?/Vilka regioner hos tRNA känns igen av amino-acyl-rRNA syntetaser? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska.";"";"What regions of a tRNA are recognized by amino-acyl-tRNA synthetases?/Vilka regioner hos tRNA känns igen av amino-acyl-rRNA syntetaser? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska.";"OH-gruppen på 3´änden Den specifika nukleotidsekvensen näst längst ut på 3´änden"
"2022-01-29";"21";"introduktion-till-metabolismen";"Vilken av nedanstående metaboliter är mest reducerad? (1p) Välj ett alternativ: A: Pyruvat B: 3-fosfoglycerat C: Citrat D: Fruktos 6-fosfat";"";"Vilken av nedanstående metaboliter är mest reducerad? (1p) Välj ett alternativ: A: Pyruvat B: 3-fosfoglycerat C: Citrat D: Fruktos 6-fosfat";"Rätt svar 1. D"
"2022-01-29";"31";"kolesterol";"Vilket av följande påståenden är helt korrekt avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom transkriptionsfaktorn SRE-1. Ökad SRE-1 signalering leder till ökat uttryck av proteinet CETP, som defosforylerar HMGR och gör det inaktivt. B: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom halten av kolesterol i blodet. Hög halt leder till att den intracellulära koncentrationen ökar genom passivt upptag. C: Endast några få celltyper i kroppen (exempelvis hepatocyter) har förmåga att syntetisera kolesterol. Övriga celltyper är helt beroende av tillförsel av kolesterol utifrån, via blodet. Kolesterol tas upp av dessa celler genom transportproteinet CETP. D: Transkriptionsfaktorn SREBP-2 är viktig för relgering av kolesterolsyntesens hastighet. SREBP-2 aktiveras genom att proteinet transporteras från det endoplasmatiska nätverket till Golgiapparaten, där transkriptionsfaktordelen klyvs av.";"";"Vilket av följande påståenden är helt korrekt avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom transkriptionsfaktorn SRE-1. Ökad SRE-1 signalering leder till ökat uttryck av proteinet CETP, som defosforylerar HMGR och gör det inaktivt. B: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom halten av kolesterol i blodet. Hög halt leder till att den intracellulära koncentrationen ökar genom passivt upptag. C: Endast några få celltyper i kroppen (exempelvis hepatocyter) har förmåga att syntetisera kolesterol. Övriga celltyper är helt beroende av tillförsel av kolesterol utifrån, via blodet. Kolesterol tas upp av dessa celler genom transportproteinet CETP. D: Transkriptionsfaktorn SREBP-2 är viktig för relgering av kolesterolsyntesens hastighet. SREBP-2 aktiveras genom att proteinet transporteras från det endoplasmatiska nätverket till Golgiapparaten, där transkriptionsfaktordelen klyvs av.";"Rätt svar 1. D"
"2022-01-29";"25";"betaoxidation";"Vilken/vilka av nedanstående produceras vid beta-oxidation? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Pyruvat B: Acetyl-CoA C: Malonyl-CoA D: Acetoacetat E: Oxaloacetat";"";"Vilken/vilka av nedanstående produceras vid beta-oxidation? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Pyruvat B: Acetyl-CoA C: Malonyl-CoA D: Acetoacetat E: Oxaloacetat";"Rätt svar 1. B"
"2022-01-29";"11";"rna-syntes";"Vilken roll spelar Mediatorn vid transkriptionell aktivering? (2p)";"";"Vilken roll spelar Mediatorn vid transkriptionell aktivering? (2p)";"Mediatorn fungerar som en sambandscentral mellan enhancern (och dess aktivatorprotein) och promotorsekvensen, enhancern ligger ca 1000 baspar bort, men påverkar transkriptionen för sin specifika gen."
"2022-01-29";"8";"utforska-proteiner";"Du träffar en patient som du misstänker har drabbats av HIV. Du kommer att använda en Indirekt ELISA för att ta reda på detta. (Max 150 ord.) (2p) A) Beskriv de olika stegen för en Indirekt ELISA. B) Detekterar denna metod patientens antikropp eller antigen?";"";"Du träffar en patient som du misstänker har drabbats av HIV. Du kommer att använda en Indirekt ELISA för att ta reda på detta. (Max 150 ord.) (2p) A) Beskriv de olika stegen för en Indirekt ELISA. B) Detekterar denna metod patientens antikropp eller antigen?";"A. Ett specifikt antigen fästs i en brunn, patientens prov tillsätts, sköljning genomförs för att sortera bort de antikroppar som inte fäst till antigenet, ytterligare en antikropp tillsätts som binder till den första antikroppen, färg som binder till den andra antikroppen tillsätts, provet färgas om antikroppen är detekterad. B. Antikropp"
"2022-01-29";"35";"introduktionslaboration";"Du arbetar på en vårdcentral där du förvånas över att många patienter med njursvikt (=dålig njurfunktion) tidigare har haft gikt (”portvinstå”). Du bestämmer dig därför för att undersöka om patienter med gikt löper en högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. Vilken av nedanstående är den mest rimliga nollhypotesen? (1p) Välj ett alternativ: A: Patienter med gikt har högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. B: Patienter med gikt har samma risk att utveckla njursvikt som patienter utan gikt. C: Det finns en skillnad i risken att utveckla njursvikt mellan giktpatienter och patienter utan gikt. D: Patienter med gikt har lägre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt.";"";"Du arbetar på en vårdcentral där du förvånas över att många patienter med njursvikt (=dålig njurfunktion) tidigare har haft gikt (”portvinstå”). Du bestämmer dig därför för att undersöka om patienter med gikt löper en högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. Vilken av nedanstående är den mest rimliga nollhypotesen? (1p) Välj ett alternativ: A: Patienter med gikt har högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. B: Patienter med gikt har samma risk att utveckla njursvikt som patienter utan gikt. C: Det finns en skillnad i risken att utveckla njursvikt mellan giktpatienter och patienter utan gikt. D: Patienter med gikt har lägre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt.";"B"
"2022-01-29";"3";"kolhydrater";"Fråga 3 Diskutera molekylära likheter och skillnader mellan mekanismerna bakom galaktosemi och laktosintolerans. (2p)";"";"Fråga 3 Diskutera molekylära likheter och skillnader mellan mekanismerna bakom galaktosemi och laktosintolerans. (2p)";"Laktos är en molekyl som består av glukos och galaktos. Båda sjukdommarna beror på brist av enzymet som bryter ned den specifika molekylen. I laktosintolerans handlar det om enzymet laktas som spjälkar laktos till galaktos och glukos, medan det i galaktosemi handlar om enzymet som omvandlar galaktos till glukos. Vid obehandlad galaktosemi ansamlas galaktos, vilket leder till att galaktos går ut i blodet och omvandlas till den toxiska molekylen galaktitol, vilket är mycket farligt. Vid obehandlad laktos bryts inte laktosmolekylen ned i tunntarmen som kroppen annars hade gjort, utan den fortsätter genom magtarmkanalen tills den hamnar i tjocktramen där den fermenteras av bakterier, vilket leder till gasbildning och buksmärtor. Ometaboliserad laktos blir alltså inte toxiskt som galaktos(--> galaktitol). Den vanligaste behandlingen för båda intoleranserna handlar främst om att utesluta den sjukdomsframkallande molekylen. Båda molekylerna finns i komjölk, vilket alltså ska undvikas. Vid laktosintolerans finns laktosfria mjölkprodukter, det finns däremot inte galaktosfria mjölkprodukter."
"2022-01-29";"7";"hemoglobin";"En allvarlig komplikation till bl.a. Covid-19 är så kallad Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS), vilket ger en gravt sviktande lungfunktion orsakad av inflammation och vätskeansamling (ödem) i alveolerna. Ödemet leder till att mindre syre når blodet och att mindre koldioxid lämnar blodet. Beskriv i detalj hur den minskade mängden syre och den ökade mängden koldioxid påverkar hemoglobinets struktur och funktion. (2p)";"";"En allvarlig komplikation till bl.a. Covid-19 är så kallad Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS), vilket ger en gravt sviktande lungfunktion orsakad av inflammation och vätskeansamling (ödem) i alveolerna. Ödemet leder till att mindre syre når blodet och att mindre koldioxid lämnar blodet. Beskriv i detalj hur den minskade mängden syre och den ökade mängden koldioxid påverkar hemoglobinets struktur och funktion. (2p)";"Den ökande mängden koldioxid stabiliserar T-state, deoxy-formen, av hemoglobin vilket minskar hemoglobinets affinitet för syre och gör det svårare för syremolekylen att binda in. Detta sker bl.a. genom att koldioxid binder i till hemoglobins ena peptidände, vilket gör det möjligt för saltbryggor att återskapas vilket stabiliserar T-state (tense state). Ökad mängd koldioxid innebär även lägre PH i blodet, dvs. ökad mängd vätejoner - vilka kan binda in till hemoglobin och de möjliggör också återskapandet av saltbryggor för hemoglobinet. Vid lungorna ska normalt sett den höga syrehalten och det högre PHt leda till att koldioxidet och vätejoner släpper, för att destabilisera T-state. När syrehalten är låg är PH i blodet vid lungorna något lägre än normalt vilket gör det svårare för denna reaktion att ske. Syrehalten ska också bidra till att en syremolekyl initialt binder in till järnet i en subenhet. Eftersom hemoglobin är ett kooperativ av 4 subenheter med 4 hemgrupper leder inbidningen av syre i en enhet till en konformationsändring i de andra subenheterna vilket gör järnemolekylerna mer tillgängliga för syre att binda in till. Detta stimulerar R-state och oxy-formen av hemoglobin. Den låga syrehalten gör ""sannolikheten lägre"" för det första syret att binda in, och konformationsändringen sker då inte. Vanligtvis sker denna växling mellan T- och R-state på så vis att koldioxid konc. är högst i muskler och stimulerar T-state vilket gör att syret släpps av där det behövs. Å andra sidan är koncentrationen syre tillräckligt hög vid lungorna för att stimulera R-state och binda in syre. Dessa konformationsändringar är nödvändiga för ett så effektivt gasutbyte som möjligt och för att syre ska binda och släppa på rätt ställe. När dessa koncentrationer ändras och koldioxidhalten i bloden blir för hög i relation till syrehalten rubbas samspelet mellan dessa konformationsformer och T-state, deoxyformen blir dominerande."
"2022-01-29";"6";"nukleotider";"Vilket/vilka av följande påståenden om RNA är korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ryggraden i RNA hålls samman av fosfodiester-bindningar. B: Uracil kan deamineras till cytosin. C: RNA använder kvävebasen uracil istället för tymin. D: Ribonukleotider har en OH-grupp i 1'-position.";"";"Vilket/vilka av följande påståenden om RNA är korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ryggraden i RNA hålls samman av fosfodiester-bindningar. B: Uracil kan deamineras till cytosin. C: RNA använder kvävebasen uracil istället för tymin. D: Ribonukleotider har en OH-grupp i 1'-position.";"Rätt svar 1. A 2. C"
"2022-01-29";"2";"från-aminosyror-till-proteiner";"Fråga 2 Vilket/vilka av nedanstående kan hittas i ett protein? Välj ett eller flera alternativ: A: En alfahelix. B: En hårnålsböj. C: En dubbelhelix. D: En loop.";"";"Fråga 2 Vilket/vilka av nedanstående kan hittas i ett protein? Välj ett eller flera alternativ: A: En alfahelix. B: En hårnålsböj. C: En dubbelhelix. D: En loop.";"Rätt svar 1. A 2. B 3. D"
"2022-05-16";"28";"nukleotidnedbrytning";"I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i följande två nukleotider då dessa bryts ner? (1p) A: AMP B: CMP";"";"I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i följande två nukleotider då dessa bryts ner? (1p) A: AMP B: CMP";"A: Urat B: Urea"
"2022-05-16";"5";"hemoglobin";"Rita syredissociationskurvan för hemoglobin och myoglobin. Vilken strukturell skillnad mellan myoglobin och hemoglobin förklarar skillnaden i dissociationskurvorna? (2p) (Max 100 ord)";"";"Rita syredissociationskurvan för hemoglobin och myoglobin. Vilken strukturell skillnad mellan myoglobin och hemoglobin förklarar skillnaden i dissociationskurvorna? (2p) (Max 100 ord)";"Myoglobin består av en subenhet och har mycket affinitet för syre. Myoglobin har en mycket brant dissociationskurva. Man kan säga att myoglobin fungerar som en on-off knapp, då den antingen är oxiderad (oxyform) eller deoxiderad (deoxyform). Myoglobin är därför bra för lagring av syre men väldigt dåligt för syretransport. Tillskillnad från myoglobin består hemoglobin av fyra subenheter. Hemoglobin har inte lika brant dissociationskurva, vilket innebär att hemoglobin är lämplig för transport av syre. Hemoglobin blir oxyform i lungorna där syrehalten är stor. I musklerna släpper hemoglobinet sina syre atomer gradvist och till slut blir den deoxyform. ![[Pasted image 20251129234842.png]]"
"2022-05-16";"18";"integrering-av-metabolismen";"Vilka två av nedanstående molekyler har sitt ursprung i en B vitamin? A: Coenzym A B: ATP C: Liponsyra D: NADH";"";"Vilka två av nedanstående molekyler har sitt ursprung i en B vitamin? A: Coenzym A B: ATP C: Liponsyra D: NADH";"Rätt svar 1. A 2. D"
"2022-05-16";"1";"kolhydrater";"A) Vad är mukopolysackaridos? B) Beskriv den biokemiska bakgrunden för mukopolysackaridos. (2p)";"";"A) Vad är mukopolysackaridos? B) Beskriv den biokemiska bakgrunden för mukopolysackaridos. (2p)";"A. Mukopolysackaridos är en sjukdom som innebär att GAG (glukoaminoglukaner) inte kan brytas ner. Då ansamlas GAGs i blodet och kroppens vävnader vilket har negativa konsekvenser på kroppen. B. GAG finns i proteoglykaner och består av repeterande disackarid enheter. Disackariden består av en negativt laddad monosackarid och en annan monosackarid som innehåller en acetylamin grupp (till exempel acetylgalaktosamin). Nedbrytningen av GAG behöver speciella enzymer. När dessa enzymer fungerar inte som de ska bryts GAGs inte ner. Då ansamlas stora mängder av GAG i kroppen."
"2022-05-16";"19";"glykolysen";"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzymer att vara verksamma i den processen? (1p) alfaketoglutaratdehydrogenas fosfofruktokinas hexokinas succinatdehydrogenas";"";"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzymer att vara verksamma i den processen? (1p) alfaketoglutaratdehydrogenas fosfofruktokinas hexokinas succinatdehydrogenas";"1. hexokinas 2. fosfofruktokinas 3. alfaketoglutaratdehydrogenas 4. succinatdehydrogenas"
"2022-05-16";"29";"pentosfosfatvägen";"Ribos-5-fosfat kan bildas på två olika sätt i pentosfosfatvägen. I det ena fallet utnyttjas enbart den icke-oxidativa fasen av denna metabola väg. Vilka två glykolysintermediärer utnyttjas i detta fall för syntesen av ribos-5-fosfat? Ange molekylernas fullständiga namn, inte förkortningar. (1p)";"";"Ribos-5-fosfat kan bildas på två olika sätt i pentosfosfatvägen. I det ena fallet utnyttjas enbart den icke-oxidativa fasen av denna metabola väg. Vilka två glykolysintermediärer utnyttjas i detta fall för syntesen av ribos-5-fosfat? Ange molekylernas fullständiga namn, inte förkortningar. (1p)";"fruktos-6-fosfat och glyceraldehyd-3-fosfat"
"2022-05-16";"4";"från-aminosyror-till-proteiner";"Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp som deras R-grupper kan delta i när pH är 7. (1p) Möjliga bindningstyper: kovalent bindning jonbindning van der Waals interaktion vätebindning Aminosyror: Arginin Asparagin Fenylalanin Tyrosin";"";"Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp som deras R-grupper kan delta i när pH är 7. (1p) Möjliga bindningstyper: kovalent bindning jonbindning van der Waals interaktion vätebindning Aminosyror: Arginin Asparagin Fenylalanin Tyrosin";"Fenylalanin: van der Waals interaktion Asparagin: vätebindning Arginin: jonbindning Tyrosin: van der Waals interaktion"
"2022-05-16";"16";"enzymer";"Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.05 mM är, och för D-fruktos = 1.5 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (2p)";"";"Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.05 mM är, och för D-fruktos = 1.5 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (2p)";"Km är substratkoncentrationen när enzymhastigheten är hälften av den maximala enzymhastigheten (Vmax/2). Ett lägre Km-värde innebär att enzymet kommer att nå hälften av sin maximala hastigheten vid en mindre substratkoncentration. Om vi jämför Km-värdet för D-glukos och D-fruktos så ser vi att Km-värdet är lägre för D-glukos. Detta innebär att hexokinas kommer att förbruka D-glukos snabbare."
"2022-05-16";"22";"betaoxidation";"Ange vilka två av följande som är en ketonkropp. (1p) A: Acetyl-CoA B: Aceton C: Adenosin D: Acetoacetat";"";"Ange vilka två av följande som är en ketonkropp. (1p) A: Acetyl-CoA B: Aceton C: Adenosin D: Acetoacetat";"Rätt svar 1. B 2. D"
"2022-05-16";"32";"cellmembran";"Beskriv hur lipid rafts är uppbyggda. (2p)";"";"Beskriv hur lipid rafts är uppbyggda. (2p)";"Lipid rafts är uppbyggda av kolesterol, sphingomyelin och glukolipider."
"2022-05-16";"26";"aminosyrametabolism";"Vilka två av följande aminosyror räknas som rent glukogena? A: Glutamat B: Leucin C: Lysin D: Alanin";"";"Vilka två av följande aminosyror räknas som rent glukogena? A: Glutamat B: Leucin C: Lysin D: Alanin";"A och D"
"2022-05-16";"12";"dna-replikation";"Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: Flap endonuklease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. D: Topoisomeraser har en 5´ till 3´ exonukleas-aktivitet.";"";"Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: Flap endonuklease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. D: Topoisomeraser har en 5´ till 3´ exonukleas-aktivitet.";"Rätt svar 1. A 2. B"
"2022-05-16";"27";"aminosyrametabolism";"Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? A: Ureacykelns delreaktioner sker uteslutande i cytosolen. B: Ureacykeldefekter ger upphov till förhöjda plasmanivåer av ammoniak som är mycket toxiskt för framförallt hjärnan. C: De två kväveatomer som finalt hamnar i urea har förts in i ureacykelns cykliska del via karbamoylfosfat och aspartat. D: Enzymet argininosuccinatlyas utgör den viktigaste regleringspunkten i ureacykeln.";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? A: Ureacykelns delreaktioner sker uteslutande i cytosolen. B: Ureacykeldefekter ger upphov till förhöjda plasmanivåer av ammoniak som är mycket toxiskt för framförallt hjärnan. C: De två kväveatomer som finalt hamnar i urea har förts in i ureacykelns cykliska del via karbamoylfosfat och aspartat. D: Enzymet argininosuccinatlyas utgör den viktigaste regleringspunkten i ureacykeln.";"B och C"
"2022-05-16";"13";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Vilken roll spelar tryptofanrepressorn vid tryptofanoperonet? Hur styrs dess aktivitet av mängden tryptofan? (2p)";"";"Vilken roll spelar tryptofanrepressorn vid tryptofanoperonet? Hur styrs dess aktivitet av mängden tryptofan? (2p)";"Tryptofanoperonet kodar för enzymer som är essentiella för bildningen av tryptofan. Tryptofanrepressorn binder till operatorn i tryptofanoperonet och hämmar transkriptionen. När en tryptofan molekyl binder sig till tryptofanrepressorn, kommer tryptofanrepressorn att kunna binda till operatorn och hämma transkriptionen av tryptofanoperonet. Vid brist på tryptofan, kommer trymptofanrepressorn inte att vara bunden till några tryptofan molekyler och därmed kommer tryptofanrepressorn att lösna från operatorn och tillåta transkriptionen av tryptofanoperonet. Mycket tryptofan => tryptofanrepressorn binder => Transkriptionen hämmas Lite tryptofan => tryptofanrepressorn lössnar => Transkriptionen stimuleras"
"2022-05-16";"17";"enzymer";"Vilka två av nedanstående påståenden om övergångstillståndet vid en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det ändrar enzymets optimala pH. B: Det tillåter reaktioner att fortgå vid en acceptabel temperatur. C: Det tillåter kemikalier att reagera som annars inte skulle göra det. D: Det tillåter reaktioner att fortskrida snabbare.";"";"Vilka två av nedanstående påståenden om övergångstillståndet vid en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det ändrar enzymets optimala pH. B: Det tillåter reaktioner att fortgå vid en acceptabel temperatur. C: Det tillåter kemikalier att reagera som annars inte skulle göra det. D: Det tillåter reaktioner att fortskrida snabbare.";"Rätt svar 1. A 2. C"
"2022-05-16";"23";"citronsyracykeln";"2,4-dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord)";"";"2,4-dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord)";"2,4-dinitrofenol är en frikopplare, vilket innebär att den förstör protongradienten över mitokondriens inremembran. 2,4-dinitrofenol är en hydrofob molekyl som kan lätt diffundera från mitokondriens intermembranutrymmet till matrix. 2,4-dinitrofenol kan binda till vätejoner och transportera de över mitokondriens inre membran, vilket förstör protongradienter och ger upphov till värme. Protongradienten behövs för att producera ATP. När protongradienter förstörs kommer cellen att bryta mer fettsyror ner för att upprätthålla gradienter. Detta gör att upptag av 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning, då kroppen bryter ner en stor mängd av fett. Vilka två av nedanstående enzymer katalyserar en dekarboxylering? Isocitratdehydrogenas Alfaketoglutaratdehydrogenas Malatdehydrogenas Succinatdehydrogenas"
"2022-05-16";"33";"transport-över-cellmembran";"Proteinet på bilden transporterar glukos och Na⁺ från tarmen in i epitelceller. A) Vilken typ av transportör är det? B) Vilken typ av transport sker för glukos? C) Vilken är drivkraften bakom transporten av glukos? (Max 75 ord) ![[Pasted image 20251128083857.png]]";"";"Proteinet på bilden transporterar glukos och Na⁺ från tarmen in i epitelceller. A) Vilken typ av transportör är det? B) Vilken typ av transport sker för glukos? C) Vilken är drivkraften bakom transporten av glukos? (Max 75 ord) ![[Pasted image 20251128083857.png]]";"A. Symport B. Sekundär-aktivtransport C. Vid sekundär-aktivtransport används en molekyl koncentrationsgradient för att transportera en annan molekyl mot sin koncentrationsgradient. Vid transport av glukos används Na jonernas koncentrationsgradient som drivkraften. Det är termodynamiskt fördelaktigt att transportera Na in i cellen då det sker med koncentrationsgradienten."
"2022-05-16";"24";"integrering-av-metabolismen";"2,4 -dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4 -dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord)";"";"2,4 -dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4 -dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord)";"1.5p av 2: 2,4-dinitrofenol är en frikopplare, vilket innebär att den förstör protongradienten över mitokondriens inremembran. 2,4-dinitrofenol är en hydrofob molekyl som kan lätt diffundera från mitokondriens intermembranutrymmet till matrix. 2,4-dinitrofenol kan binda till vätejoner och transportera de över mitokondriens inre membran, vilket förstör protongradienter och ger upphov till värme. Protongradienten behövs för att producera ATP. När protongradienter förstörs kommer cellen att bryta mer fettsyror ner för att upprätthålla gradienter. Detta gör att upptag av 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning, då kroppen bryter ner en stor mängd av fett. AI: 2,4-Dinitrofenol (DNP) frikopplar oxidativ fosforylering genom att transportera protoner över det inre mitokondriemembranet. När protongradienten kortsluts kan ATP-syntas inte använda energin i elektrontransportkedjan för att bilda ATP. Cellerna svarar genom att öka oxidationen av fett och kolhydrater för att försöka upprätthålla ATP-nivåerna, vilket kraftigt ökar metabolismen och värmeproduktionen. Denna ineffektiva energiomvandling gör att mer bränsle förbrukas per producerad ATP → snabb viktminskning. Den ökade syreförbrukningen och värmeproduktionen kan bli livshotande, eftersom DNP ger hypertermi, acidos och organsvikt vid relativt små doser."
"2022-05-16";"10";"rna-syntes";"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet.";"";"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet.";"Rätt svar 1. A 2. D"
"2022-05-16";"9";"rna-syntes";"Hur kan en punktmutation i ett intron leda till human sjukdom? (2p) (Max 25 ord).";"";"Hur kan en punktmutation i ett intron leda till human sjukdom? (2p) (Max 25 ord).";"Genom att skapa nya splice-sites i intronen som leder till att mRNAt klivs felaktigt, som gör att mRNAt kan koda för fel proteiner."
"2022-05-16";"34";"plasmid";"Förklara kortfattat vad som menas med A) Selektion av antibiotikaresistenta bakterier B) Blåvit screening (2p) Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska.";"";"Förklara kortfattat vad som menas med A) Selektion av antibiotikaresistenta bakterier B) Blåvit screening (2p) Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska.";"A. Selektion av antibiotikaresistenta bakterier innebär att odla bakterier i en miljö med antibiotika. Då kommer bara de bakterier med antibiotikaresistens att överleva, medan de bakterier utan antibiotika resistens kommer att dö ut. Ampicillin är ett exempel av antibiotika som används vid selektion av antibiotikaresistenta bakterier. Genom att använda plasmider som innehåller antibiotikaresistens-gener kommer endast de bakterier som bär på dessa plasmider att överleva i en antibiotikarik miljö. B. Blåvit screening är ett metod att skilja mellan bakterier med plasmider och bakterier utan plasmider. Bakterier med plasmider har en klyvd lac-operon och därför kommer inte de färgas vid addition av x-GAL, då säger man att de är vita kolonier. Bakterier utan plasmider har en fullt fungerande lac-operon och kommer att färgas blått vid addition av x-GAL, då säger man att de är blå kolonier."
"2022-05-16";"14";"translation";"Hur är det möjligt för en bakterie att initiera proteinsyntes av flera olika proteiner från enbart ett mRNA-transkript? (2p)";"";"Hur är det möjligt för en bakterie att initiera proteinsyntes av flera olika proteiner från enbart ett mRNA-transkript? (2p)";"Till skillnad från eukaryouter där mRNAt har endast en startkodon (AUG), har bakterier flera start kodoner inom samma mRNA molekyl. I bakterier har mRNAt ""shine dalgarno"" sekvenser i närhet till startkodonerna AUG. Dessa ""shine dalgarno"" sekvenser känns igen med hjälp av S16 subenheten som i sin tur finns i S30 subenheten av ribosomen (också kallad den lilla subenheten). Detta förklarar hur det är möjligt att initiera proteinsyntes av flera olika proteiner från enbart ett mRNA-transkript i bakterier."
"2022-05-16";"20";"glykogen";"I vilka två vävnader hittar vi framförallt glykogen hos människa, och vilken huvudsakliga funktion har glykogenet i respektive vävnad? (2p)";"";"I vilka två vävnader hittar vi framförallt glykogen hos människa, och vilken huvudsakliga funktion har glykogenet i respektive vävnad? (2p)";"Glykogen finns i muskelvävnad och i levern. Glykogen i levern används för att reglera glukoshalten i blodet. Glykogen bryts ner till glukos-1-fosfat och omvandlas senare till glukos-6-fosfat med hjälp av enzymet fosfoglukomutas. Glukos-6-fosfat kan defosforyliseras till glukos med hjälp av enzymet glukos-6-fosfatas som endast finns i levern. Senare kan glukos molekylerna frisättas från levern till blodet. Muskler saknar enzymet glukos-6-fosfatas vilket innebär att muskler kan inte skapa glukos och frisätta det i blodet. Glykogenet i muskler används därför som energireserv, genom att brytas ner till glukos-6-fosfat som kan fortsätta i glykolysen och till sist producera ATP."
"2022-05-16";"30";"heme";"Vilken typ av bilirubin (konjugerat eller okonjugerat) är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? Förklara varför. (2p)";"";"Vilken typ av bilirubin (konjugerat eller okonjugerat) är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? Förklara varför. (2p)";"I mjälten bryts hem ner till biliverdin och sedan omvandlas till okonjugerat bilirubin som frisätts i blodet. I levern konjugeras bilirubinet och utsöndras via galla. Konjugeringen sker för att göra den hydrofoba bilirubinet amfipatisk och vattenlöslig. Vid hemolytiska sjukdomar ökar nedbrytningen av röda blodkroppar i mjälten vilket ger upphov till förhöjt koncentration av okonjugerat bilirubin. Om levern inte kan ta hand om de stora koncentrationer av okonjugerat bilirubin i blodet ansamlas okonjugerat bilirubin i stora koncentrationer."
"2022-05-16";"15";"termodynamik";"A biologist studying a new bacterial strain identified in Göteborg is interested in the following two new biochemical reactions: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) What does ∆G mean in Thermodynamics? Which of the two reactions is spontaneous and what is the explanation for this? / En biolog som studerar en ny bakteriestam som har identifierats i Göteborg är intresserad av följande biokemiska reaktioner: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) Vad avses med ∆G inom termodynamiken? Vilken av reaktionerna är spontan och vilken är anledningen till det? This question needs to be answered in English. (2p) (Max 100 words)";"";"A biologist studying a new bacterial strain identified in Göteborg is interested in the following two new biochemical reactions: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) What does ∆G mean in Thermodynamics? Which of the two reactions is spontaneous and what is the explanation for this? / En biolog som studerar en ny bakteriestam som har identifierats i Göteborg är intresserad av följande biokemiska reaktioner: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) Vad avses med ∆G inom termodynamiken? Vilken av reaktionerna är spontan och vilken är anledningen till det? This question needs to be answered in English. (2p) (Max 100 words)";"G (Gibbs free energi) means the change of free energy in the system. Delta-G explains how the free energi in the system change after a specific reaction. Negative delta-G means the reaction is spontaneous, while positive delta-G indicates that the reaction is not spontaneous and is not thermodynamicly favorable. The spontaneous reaction is P + H₂O -> Q + Pi because it has negativ Delta-G."
"2022-05-16";"21";"integrering-av-metabolismen";"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (2p) (Max 120 ord) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? C) En typ av reglering av komplexet är av feedforwardtyp. Redogör för vad feedforwardreglering innebär samt vad som ger feedforwardreglering av komplexet och hur.";"";"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (2p) (Max 120 ord) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? C) En typ av reglering av komplexet är av feedforwardtyp. Redogör för vad feedforwardreglering innebär samt vad som ger feedforwardreglering av komplexet och hur.";"A. Pyruvatdehydrogenaskomplexet är länken mellan glykolysen och citronsyracykeln. Komplexet katalyserar den irreversibla nedbrytningen av pyruvat till koldioxid och acetyl-Coa. B. Komplexet styr en irreversibel reaktion där pyruvat bryts ner till Acetyl-Coa. Acetyl-Coa kan inte användas för återbilda pyruvat och därför måste den användas i andra metabola vägar. Därför är enormt viktigt att reglera komplexet för att inte slösa pyruvat onödigt. C. Feedforwardreglering innebär att substraten i en reaktion stimulerar enzymet som katalyserar denna reaktion. Pyruvat ger feedforwardreglering av pyruvatdehydrogenaskomplexet, då ökade koncentrationen av pyruvat leder till att komplexet stimuleras. Då bryts pyruvat till Acetyl-Coa för att minska koncentrationen av pyruvat."
"2022-05-16";"31";"kolesterol";"Beskriv kortfattat två huvudsakliga mekanismer för hur cellens intracellulära kolesterolkoncentration regleras. (2p)";"";"Beskriv kortfattat två huvudsakliga mekanismer för hur cellens intracellulära kolesterolkoncentration regleras. (2p)";"1. Transkriptionen av HMGR kan regleras. Vid låg halt av kolesterol kommer Insig-proteinet att lössna från scap-SREBP komplexet i ER, vilket gör att scap-SREBP transporteras till golgia apparaten med hjälp av COPII. SREBP bryts ner av enzymerna S1P och S2P, vilket gör att den N-terminala delen av SREBP frigörs till cellkärnan. I cellkärnan kan den N-terminala delen av SREBP binda till SRE-1, vilket bland annat ökar transkriptionen av enzymet HMGR. HMGR katalyserar första steget i kolesterolsyntesen där HMG omvandlas till mevalonat. 2. Translationen av HMGR-mRNAt kan regleras med hjälp av oxylanesterol-halten i cellen. En hög halt oxylanesterol (orsakad av hög halt av kolesterol) leder till att mindre polysomer binder till HMGR-mRNAt, vilket leder till mindre translation av HMGR. Å andra sidan kommer en låg oxylanesterol-halt (orsakad av låg halt av kolesterol) i cellen att leda till att fler polysomer binder sig till HMGR-mRNAt, då translateras fler HMGR som stimulerar kolesterolsyntes."
"2022-05-16";"25";"elektrontransportkedjan";"A. Vad innebär redoxpotential? B. Ge två exempel på redoxpar som förekommer i elektrontransportkedjan. (2p) (Max 75 ord)";"";"A. Vad innebär redoxpotential? B. Ge två exempel på redoxpar som förekommer i elektrontransportkedjan. (2p) (Max 75 ord)";"A. Redoxpotential innebär ett molekyls förmåga att ta upp elektroner. Hög redoxpotential innebär att molekylen har stor affinitet till elektroner (molekylen vill ta upp mer elektroner), medan låg redoxpotential innebär att molekylen har låg affinitet till elektroner (molekylen vill avge sina elektroner). B. Ubiquiton (Q) och Ubiquinol (QH₂). QH₂ har lägre redoxpotential än Q, då QH₂ vill avge sina två elektroner. FADH₂ och FAD är ett annat redoxpar i elektrontransportkedjan."
"2022-05-16";"11";"kromatin";"Vilka två av följande påståenden om histoner är korrekta? A: I kromatin ingår endast DNA, ej proteiner. B: I en nukleosom är ~146 bp av DNA lindat kring en kärna av åtta histonproteiner. C: Acetylering av histonsvansar kan neutralisera positiva laddningar. D: Med begreppet histonkod avses DNA-sekvensen hos histongener.";"";"Vilka två av följande påståenden om histoner är korrekta? A: I kromatin ingår endast DNA, ej proteiner. B: I en nukleosom är ~146 bp av DNA lindat kring en kärna av åtta histonproteiner. C: Acetylering av histonsvansar kan neutralisera positiva laddningar. D: Med begreppet histonkod avses DNA-sekvensen hos histongener.";"Rätt svar 1. B 2. C"
"2022-05-16";"8";"evolution";"Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p)";"";"Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p)";"Endosymbios är en teori som förklarar mitokondriens uppkomst i eukaryota celler. Teorin går ut på att en stor anaerob eukaryotcell har endocyterat en aerob bakterie. Den eukaryota cellen och bakterien lever i symbios, där den eukaryota cellen försörjer bakterien med metaboliter medan bakterien utför aerob metabolism åt den eukaryotacellen. Bakterien har senare utvecklats till mitokondrie. En bevis på att endosymbios teorin stämmer är att mitokondrier har egna DNA."
"2022-05-16";"35";"introduktionslaboration";"Du vill sätta upp en studie för att ta reda på hur lång tid det tar för blod att koagulera hos friska individer. Du vill få ett relativt litet standardfel (SE) för att känna att du har lyckats få en bra skattning av hur lång tid det brukar ta för blod att koagulera. SE kan härledas fram med hjälp av två parametrar. Vilka är parametrarna och hur ska de se ut om du vill få ett litet värde på SE? (2p) (Max 50 ord.)";"";"Du vill sätta upp en studie för att ta reda på hur lång tid det tar för blod att koagulera hos friska individer. Du vill få ett relativt litet standardfel (SE) för att känna att du har lyckats få en bra skattning av hur lång tid det brukar ta för blod att koagulera. SE kan härledas fram med hjälp av två parametrar. Vilka är parametrarna och hur ska de se ut om du vill få ett litet värde på SE? (2p) (Max 50 ord.)";"1- Ju större antal individer som försöket utförs på desto lägre SE. 2- Ju mer lika dessa individers egenskaper är (ålder, kön, hälsa, kost mm.) desto lägre SE."
"2022-05-16";"3";"från-aminosyror-till-proteiner";"När protoner transporteras över mitokondriens inre membran genom ATPsyntas spelar specifika aminosyror en viktig roll. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar protontransporten behöver ha och vad som möjliggör protontransporten. Ge även ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (2p) (Max 100 ord)";"";"När protoner transporteras över mitokondriens inre membran genom ATPsyntas spelar specifika aminosyror en viktig roll. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar protontransporten behöver ha och vad som möjliggör protontransporten. Ge även ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (2p) (Max 100 ord)";"ATPsyntasets transmembranella del (F0) ansvarar för transporten av protoner över mitokondriens inre membran. F0 innehåller en roterande c-ring som består av 10 c-subenheter samt en a-subenhet som protoniserar och deprotoniserar c-subenheterna. När en c-subenhet protoniseras, nutraliseras ett negativt laddat aminosyra i c-subenheten, vilket leder till en konformationsändring som tillåter c-ringen att rotera. En protoniserad c-subenhet roterar en varv runt c-ringen innan den släpper sin proton, då blir aminosyran negativt laddad som i början. Exempel på ett negativt laddad aminosyra: Aspartat"
"2022-05-16";"7";"nukleotider";"Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p)";"";"Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p)";"Endosymbios är en teori som förklarar mitokondriens uppkomst i eukaryota celler. Teorin går ut på att en stor anaerob eukaryotcell har endocyterat en aerob bakterie. Den eukaryota cellen och bakterien lever i symbios, där den eukaryota cellen försörjer bakterien med metaboliter medan bakterien utför aerob metabolism åt den eukaryotacellen. Bakterien har senare utvecklats till mitokondrie. En bevis på att endosymbios teorin stämmer är att mitokondrier har egna DNA. A. Hur skiljer sig endonukleaser från exonukleaser? B. Skriv det fullständiga namnet för dADP? (2p) A. Endonukleaser klipper nukleinsyror från mitten, medan exonukleaser klipper nukleinsyror från ändarna (antingen från 3' till 5' riktning eller från 5' till 3'). Detta utförs genom att bryta fosfodiesterbindningen mellan nukleotiderna. B. Deoxyadinosindifosfat"
"2022-05-16";"6";"utforska-proteiner";"Du har fått i uppgift att preparera fram ett protein ur ett homogenisat och du kommer använda tre olika metoder för detta. Beskriv varje metod kortfattat samt ange vilken proteinegenskap som används för separationen (2p) (Max 200 ord) A. Gelfiltrering B. Jonbyteskromatografi C. Affinitetskromatografi";"";"Du har fått i uppgift att preparera fram ett protein ur ett homogenisat och du kommer använda tre olika metoder för detta. Beskriv varje metod kortfattat samt ange vilken proteinegenskap som används för separationen (2p) (Max 200 ord) A. Gelfiltrering B. Jonbyteskromatografi C. Affinitetskromatografi";"A. Vid gelfiltrering består den fasta fasen av kulor med håligheter. Vid gelfiltrering filtreras proteinerna storleksmässigt, där små proteiner binder till kulorna medan de stora proteiner fortsätter vidare genom kolumnen. Därför kommer protienerna med störst massa först ut, och proteinerna med låg massa hamnar sist i filtreringen. B. Jonbyteskromatografi filtrerar protiener beroende på laddning. De finns två typer av jonbyteskromatografi. Första typen är anjonsbytare, där proteinerna med positiv laddning kommer ut först. Andra typen är katjonsbytare där jonerna med negativ laddning kommer ut först. Den fasta fasen består av kulor med antingen negativ eller positiv laddning som kan fästa till de laddade proteinerna med hjälp av jonbindningar. C. Affinitetskromatografi är en filtreringsmetod som är baserad på att filtrera protiener med hjälp av en speciell egenskap hos proteinerna. Till exempel kan proteinernas glykolysering användas för att filtrera protienerna."
"2022-05-16";"2";"lipider";"Nya regler från EU ska se till att minimera mängden transfetter i livsmedel. Vilka två påståenden stämmer om transfetter? (1p) A: Transfetter kan i regel packas tätare än cisfetter och bidrar därmed till minskad fluiditet i cellmembranet. B: Transfetter kan inte brytas ner av kroppens enzymer. C: Transfetter höjer koncentrationen av det ”goda” kolesterolet HDL i blodet. D: Transfetter består av mättade fettsyror.";"";"Nya regler från EU ska se till att minimera mängden transfetter i livsmedel. Vilka två påståenden stämmer om transfetter? (1p) A: Transfetter kan i regel packas tätare än cisfetter och bidrar därmed till minskad fluiditet i cellmembranet. B: Transfetter kan inte brytas ner av kroppens enzymer. C: Transfetter höjer koncentrationen av det ”goda” kolesterolet HDL i blodet. D: Transfetter består av mättade fettsyror.";"Rätt svar 1. A 2. B"
"2025-02-01";"28";"elektrontransportkedjan";"Redogör för ett skäl till att man inte kan säga exakt hur många protoner som behöver förflyttas över mitokondriens inre membran för varje ATP som bildas av ATP-syntaset. Förklara också hur protonerna förflyttas i ATP-syntaset. (4p) Max 80 ord.";"";"Redogör för ett skäl till att man inte kan säga exakt hur många protoner som behöver förflyttas över mitokondriens inre membran för varje ATP som bildas av ATP-syntaset. Förklara också hur protonerna förflyttas i ATP-syntaset. (4p) Max 80 ord.";"3.5 av 4 poäng C-ringen är bunden till ATP-syntasets matrix del via en gamma stjälk. Inre delen består av 6 subenheter, 3 beta och 3 alfa. Det är beta subenheterna som sköter produktion av ATP då de har 3 konformationer, loose(tar emot ADP+pi), tense (bildar ATP) och open (ATP lämnar). När en proton binder till c-subenhet neutraliserar det en negativladdad aa --> c ringen roterar - -> gamma-stjälken + b-subenheter roterar-->ATP-produktion. -Svårt att säga exakt atntal H+ eftersom frikopplare utjämnar gradienten utan att tillverka ATP. Ord: 80 Totalpoäng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen AI-rättning 1. Det korrekta skälet: antalet c-subenheter varierar mellan arter C-ringen i ATP-syntas har olika antal c-subenheter (t.ex. 815). Varje subenhet kräver 1 H⁺ per 360° rotation. Därför varierar H⁺/ATP mellan organismer. Det är detta examinatorerna är ute efter. 2. Övriga faktorer som påverkar (godkända som komplettering): Protonläckage (inkl. UCP/frikopplare). Energiåtgång för fosfattransport och ADP/ATP-translokas."
"2025-02-01";"5";"utforska-proteiner";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av HIV. (4p) Max 200 ord. (Lista AB i ditt svar nedan!) A) Nämn en analysmetod som kan användas för att undersöka detta samt beskriv de olika stegen i metoden. B) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod?";"";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av HIV. (4p) Max 200 ord. (Lista AB i ditt svar nedan!) A) Nämn en analysmetod som kan användas för att undersöka detta samt beskriv de olika stegen i metoden. B) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod?";"a) För att undersöka huruvida en patient är smittad av HIV eller inte, kan metoden indirekt ELISA användas. I denna metod har vi först en brunn med HIV-antigener. Prov från patienten tillsätts för att senare kunna se om dess antikroppar binder till antigenerna, och därefter sköljer vi för att undvika att oönskade substanser ska påverka resultatet. Senare tillsätts enzymbundna antikroppar till provet, och sedan sköljer vi igen. Efteråt tillsätts ett substrat som binder till enzymet. Om patienten har antikroppar, kommer patientens antikroppar ha bundit till antigenena och därmed kommer provet att färgas. Om patientens antikroppar inte binder, kommer vi inte få något färgämne, vilket tyder på att patienten inte har antikropparna och har därmed inte HIV. b) antikroppar"
"2025-02-01";"18";"termodynamik";"Redogör för begreppet entalpi. Vilka termer/aspekter ingår och hur kan man använda entalpiförändringar för att förutse benägenheten för en viss biokemisk reaktion att ske? (4p)";"";"Redogör för begreppet entalpi. Vilka termer/aspekter ingår och hur kan man använda entalpiförändringar för att förutse benägenheten för en viss biokemisk reaktion att ske? (4p)";"Elev 1 - 2 av 4 poäng Entalpi är skillnaden mellan produkternas och reaktanternas energi i en reaktion. Om entalpivärdet är positivt, innebär det att reaktionen kommer kräva energitillförsel, då produkterna kommer ha högre energi än reaktanterna. Om entalpivärdet är negativt innebär det att reaktionen kan ske spontant då det frigörs energi och det är därmed fördelaktig. Elev 2 - 2 av 4 poäng Entalpi är värme energi, betecknas H. En reaktion mellan x och y, där y har högre entalpi än x är ofördelaktig eller har positiv deltaG för man går från att ha lite energi till att ha mer, vilket innebär att energiförändringen (E2-E1) är negativ --> alltså behöver energi tillföras för att reaktionen ska ske. Om reaktionen skulle vara spontant istället så behöver entalpin hos y vara lägre än X --> deltaG < 0. H = S - T x deltaG AI-rättning: Den riktiga definitionen: H = U + pV. ΔH = värmeutbyte vid konstant tryck. ΔH ensamt räcker inte för spontanitet → måste kopplas till ΔG = ΔH TΔS. Entropi och temperatur som avgörande delar av bedömningen. Biokemisk kontext: bindningsstyrka, värmeutbyte, och hur ΔH vägs mot ΔS för att avgöra om en reaktion går åt rätt håll."
"2025-02-01";"1";"kemiska-bindingar";"Vilka två påståenden om vätebindningar är korrekta? (2p) A: De stabiliserar primärstrukturen hos proteiner. B: De bildas mellan dipoler. C: Ju rakare bindning, desto svagare. D: Acceptoratomerna har hög elektronegativet.";"";"Vilka två påståenden om vätebindningar är korrekta? (2p) A: De stabiliserar primärstrukturen hos proteiner. B: De bildas mellan dipoler. C: Ju rakare bindning, desto svagare. D: Acceptoratomerna har hög elektronegativet.";"B och D"
"2025-02-01";"19";"enzymer";"Fördelen med att mäta den initiala hastigheten V i början av en reaktion är att (välj två av nedanstående): (2p) A: Förändringar i [S] är försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. B: Produktinhibering kan då inte påverka hastigheten. C: Förändringar i Km är försumbara, så Km kan behandlas som en konstant. D: Variationer av [S] har ingen effekt på V₀.";"";"Fördelen med att mäta den initiala hastigheten V i början av en reaktion är att (välj två av nedanstående): (2p) A: Förändringar i [S] är försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. B: Produktinhibering kan då inte påverka hastigheten. C: Förändringar i Km är försumbara, så Km kan behandlas som en konstant. D: Variationer av [S] har ingen effekt på V₀.";"A och B"
"2025-02-01";"29";"aminosyrametabolism";"Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? (2p) A: Nedsatt funktion av enzymer som verkar i ureacykeln leder till förhöjda plasmanivåer av ammoniak. B: Ureacykeln sker i ibland i muskel när denna vävnad använder sig av aminosyror som energikälla. C: De två kväveatomer som slutligen hamnar i urea har förts in i ureacykeln via karbamoylfosfat och aspartat. D: Ureacykelns huvudsakliga funktion är att omvandla urea, som bildas vid nedbrytning av tex aminosyror, till ammoniak som kan utsöndras med urinen.";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? (2p) A: Nedsatt funktion av enzymer som verkar i ureacykeln leder till förhöjda plasmanivåer av ammoniak. B: Ureacykeln sker i ibland i muskel när denna vävnad använder sig av aminosyror som energikälla. C: De två kväveatomer som slutligen hamnar i urea har förts in i ureacykeln via karbamoylfosfat och aspartat. D: Ureacykelns huvudsakliga funktion är att omvandla urea, som bildas vid nedbrytning av tex aminosyror, till ammoniak som kan utsöndras med urinen.";"B och C OBS: Fel i facit, föreläsaren bekräftat att B och C är rätt"
"2025-02-01";"4";"hemoglobin";"A) Name two allosteric regulators of oxygen binding to hemoglobin. B) Explain an outcome for each regulator. (Max 100 words.) Please answer this question in English. (4p)";"";"A) Name two allosteric regulators of oxygen binding to hemoglobin. B) Explain an outcome for each regulator. (Max 100 words.) Please answer this question in English. (4p)";"a) O₂ and CO₂ b) O₂: Hemoglobin has four subunits that bind to O₂ through cooperativity, meaning that if one subunit binds to an O₂, the other subunits' affinity for O₂ will increase, leading to all subunits binding to O₂. When O₂ binds, the state goes from T-state (deoxy; tense) to R-state (oxy; relaxed). CO₂: When CO₂ binds to hemoglobin, the hemoglobin's affinity to oxygen decreases, leading to a stabilization of the T-state instead."
"2025-02-01";"16";"transport-över-cellmembran";"![[Pasted image 20251129235913.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns proteinet? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord.";"";"![[Pasted image 20251129235913.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns proteinet? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord.";"A) ATPaser, specifikt ABCaset. Exempel på aktiv transport. B) Ligger på cellmembranet, transporterar substrat från cytoplasman till ECM. C) ATP hydrolys --> fosfoanhydridbindningar bryts --> energi frigörs, det sker konformationsändringar som växlar mellan att proteinet öppnar mot cytoplasman respektive ECM. Ord: 40 Totalpoäng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen"
"2025-02-01";"22";"glykolysen";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glykolysen? (2p) A: När glukos fosforyleras av hexokinas kan produkten enbart användas i glykolysen. B: För varje glukosmolekyl bildas 4 ATP. C: Den sker i cellens cytoplasma. D: Den kräver syre.";"";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glykolysen? (2p) A: När glukos fosforyleras av hexokinas kan produkten enbart användas i glykolysen. B: För varje glukosmolekyl bildas 4 ATP. C: Den sker i cellens cytoplasma. D: Den kräver syre.";"B och C"
"2025-02-01";"32";"pentosfosfatvägen";"Nämn två metabola vägar som är integrerade med pentosfosfatvägen eftersom de sker i samma del av cellen och har gemensamma intermediärer. (2p) Max 10 ord.";"";"Nämn två metabola vägar som är integrerade med pentosfosfatvägen eftersom de sker i samma del av cellen och har gemensamma intermediärer. (2p) Max 10 ord.";"Glykolysen och glukoneogenesen"
"2025-02-01";"26";"lipider";"Beskriv hur acetyl-CoA karboxylas regleras. (4p)";"";"Beskriv hur acetyl-CoA karboxylas regleras. (4p)";"Elev 1 - 1 av 4 Insulin stimulerar enzymet medan glukagon hämmar. Enzymet är aktivt i dess defosforylerade form, och insulin stimulerar defosforylering. Acetyl-CoA-karboxylas fosforyleras när glukagon är dominerande, och därmed hämmas enzymet av glukagon. Feedforwardreglering av pyruvat där höga mängder pyruvat hämmar och låga mängder stimulerar. Elev 2 - 1 av 4 Acetyl-CoA karboxylas stimuleras av insulin och hämmas av glukagon. Den regleras även av energikvoten där ATP stimulerar och ADP/AMP hämmar. AI-rättning Citrat aktiverar (allosteriskt + polymerisering) Palmitoyl-CoA hämmar (feedback + depolymerisering) AMPK fosforylerar och inaktiverar → energikontroll Polymeriseringstillståndet styr enzymets aktivitet (Insulin/glukagon ska nämnas, men räcker inte ens nära för 4p)"
"2025-02-01";"12";"rna-syntes";"Vilka två påståenden om RNA-splicing är korrekta? (2p) A: Spliceosomen består av både RNA och proteiner. B: Splicingprocessen sker i cellens cytoplasma. C: Splicing sker endast i prokaryoter. D: En lariatstruktur bildas.";"";"Vilka två påståenden om RNA-splicing är korrekta? (2p) A: Spliceosomen består av både RNA och proteiner. B: Splicingprocessen sker i cellens cytoplasma. C: Splicing sker endast i prokaryoter. D: En lariatstruktur bildas.";"A och D"
"2025-02-01";"27";"elektrontransportkedjan";"Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (2p) Börja med lägst redoxpotential: cytokrom c FADH₂ NADH O₂";"";"Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (2p) Börja med lägst redoxpotential: cytokrom c FADH₂ NADH O₂";"A: NADH B: FADH₂ C: cytokrom c D: O₂"
"2025-02-01";"13";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Lac-operonet reglerar nedbrytningen av laktos i bakterier. Vilken roll spelar allolaktos vid lac-operonet, och hur påverkar detta transkriptionen av generna som är inblandade i laktosmetabolismen? (4p)";"";"Lac-operonet reglerar nedbrytningen av laktos i bakterier. Vilken roll spelar allolaktos vid lac-operonet, och hur påverkar detta transkriptionen av generna som är inblandade i laktosmetabolismen? (4p)";"Allolaktos är en korepressor som binder till repressorn på lac-operonet vid närvaro av laktos. När allolaktos binder, kommer repressorn att flyttas och därmed kommer gener som kodar för enzymer som bryter ner laktos att kunna transkriberas."
"2025-02-01";"17";"cellmembran";"Perifera membranproteiner kan vara bundna till cellmembranet på flera olika sätt. Beskriv tre olika varianter. (4p)";"";"Perifera membranproteiner kan vara bundna till cellmembranet på flera olika sätt. Beskriv tre olika varianter. (4p)";"1. Kan binda mha adhesions molekyler, ex integriner som binder via komponenter i ECM (ex kollagen). 2. GPI ankare. Kan frisättas när som helst vid behov, då den binder perifert till nervcellernas cellmembran. 3. Kan binda till delen av membranproteiner som finns utanför cellmembranet. Exempelvis har alfa helixar en del av sig utanför cellmembranet, kan binda till cellmembranet genom den."
"2025-02-01";"23";"glukosmetabolism";"Redogör för hur glukosmetabolismen regleras på hormonell nivå. (4p) Max 150 ord.";"";"Redogör för hur glukosmetabolismen regleras på hormonell nivå. (4p) Max 150 ord.";"Elev 1 - 3 av 4 poäng Glukagon aktiverar glukoneogenesen, det vill säga återbildning av glukos. Detta då glukagon aktiverar cAMP som fosforylerar PKA. PKA, i sin tur, fosforylerar Fosfofruktokinas 2 (PFK2) /fruktos-2,6-bisfosfatas (FBPase-2). Vid fosforylering kommer PFK2-delen att hämmas, samtidigt som FBPase-2-delen aktiveras. När FBPase-2 är aktivt, kommer fruktos-2,6-bisfosfat att brytas ner. Då fruktos-2,6-bisfosfat är en allosterisk regluator som aktiverar fosfofruktokinas 1 i glykolysen, kommer glykolysen att hämmas då f-2,6-bp kommer att brytas ned. Om insulin är dominerande, kommer det däremot signalera defosforylering som medför att PFK2 blir aktivt och bilda fruktos-2,6-bisfosfat som kan stimulera glykolysen. (Sen tror jag också att även glukokinas i levern regleras hormonellt där insulin aktiverar och glukagon hämmar) Elev 2 - 3 av 4 poäng Insulin: Frisätts när glukos nivåer i blodet höjs. Insulin stimulerar enzymer i glykolysen, mycket glukos --> den behöver metaboliseras och användas till ATP produktion. Insulin hämmar enzymer i glukoneogenesen såsom fruktos-1,6-bisfosfatas. Den gör detta genom att aktivera PKA som i sin tur aktiverar fosfofruktokinas-2, enzym som fosforylerar fruktos-6-fosfat för att omvandlas till fruktos-2,6-bisfosfat. Fruktos-2,6-bisfosfat stimulerar glykolysen och hämmar glukoneogenesen, som jag nämnt innan så inhiberar den fruktos- 1,6-fosfatas. Fosfofruktokinas-1 stimuleras av insulin för att omvandla fruktos-6-fosfat till fruktos-1,6-bisfosfat. Glukagon: Frisätts när glukos nivåer i blodet är låga. Den har motsatt effekt till insulin, den stimulerar glukoneogenesen och hämmar glykolysen. Glukagon verkar mest på levern och stimulerar enzymer i som pyruvatkarboxykinasdehydrogenas som är en del av glukoneogenesen. Adrenalin verkar likt glukagon men mer på skelettmuskulatur. All hormonell reglering sker genom att hormonet binder till 7TM receptorer på cellmembranet --> ATP--> cAMP --> aktivt/inaktivt PKA beroende på om enzymet behöver fosforyleras eller defosforyleras. AI-rättning: Att insulin/glukagon reglerar både glykolys, glukoneogenes och glykogenmetabolism. Att insulin verkar via defosforylering och glukagon via fosforylering kopplat till flera enzym, inte bara PFK-2. Att adrenalin har en tydlig roll i muskel."
"2025-02-01";"33";"kolesterol";"Beskriv två huvudsakliga och principiellt olika sätt, på vilka cellen reglerar mängden fritt intracellulärt kolesterol. (4p)";"";"Beskriv två huvudsakliga och principiellt olika sätt, på vilka cellen reglerar mängden fritt intracellulärt kolesterol. (4p)";"1. Man kan reglera transkriptionen av HMG-CoA reduktas för det är en irreversibel steg i kolesterol syntesen. Om mängden kolesterol ökar så kommer kolesterol binda till scap protein. Denna förhindrar SERBP transkriptionsfaktorn i ER från att transporteras till golgi där den kan binda till en sekvens SRE-1 och transkribera genen för HMG-CoA reduktas. Då kommer mängden HMG-CoA reduktas minska --> mindre kolesterol syntetiseras. Om det är låg kolesterol däremot så kommer insig proteiner vid ER binda till scap så att den inte blockerar SERBP transkriptionsfaktorn från att gå och binda till SRE-1 och starta transkription. 2. Då kolesterol lagras i kolesterolestrat så kommer cellen att bryta loss fettsyran när den har behov för kolesterol. Kolesterolestrarna transporteras först mha lipoproteiner till cellen för att där inne bryta sig loss och bilda fri kolesterol. 3. (extra) Man kan reglerar kolesterol syntes translationellt genom att låta proteiner binda till mRNA under translation för att inhibera den vid höga kolesterolhalter. Kolesterol kan även binda in sig mellan DNA och mRNA för att störa replikation/translation --> inget kolesterol."
"2025-02-01";"24";"glykogen";"Hur skiljer sig glykogenets huvudsakliga funktion i levern från dess funktion i skelettmuskulaturen? Vilket enzym är avgörande för denna skillnad och i vilken av vävnaderna uttrycks det? (4p) Max 50 ord.";"";"Hur skiljer sig glykogenets huvudsakliga funktion i levern från dess funktion i skelettmuskulaturen? Vilket enzym är avgörande för denna skillnad och i vilken av vävnaderna uttrycks det? (4p) Max 50 ord.";"Glykogen i levern används för att upprätthålla stabilt blodsocker. Glykogen i muskler används till ATP eftersom den saknar glukos-6-fosfatas. Glukos bryts som glukos-1-fosfat från glykogen och omvandlas sedan till glukos-6-fosfat(fosfoglukomutas). I levern finns enzymet glukos-6-fosfatas som omvandlar glukos-6-fosfat till glukos men i skelettmuskler metaboliseras glukos-6-fosfat vidare i glykolysen för ATP-produktion."
"2025-02-01";"10";"kromatin";"Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: Histon H1 binder linker-DNA och stabiliserar nukleosomen. B: Kromatin består endast av DNA. C: Acetylering av histoner leder till en mer kondenserad kromatinstruktur. D: Kromatin finns endast i eukaryota celler.";"";"Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: Histon H1 binder linker-DNA och stabiliserar nukleosomen. B: Kromatin består endast av DNA. C: Acetylering av histoner leder till en mer kondenserad kromatinstruktur. D: Kromatin finns endast i eukaryota celler.";"A och D"
"2025-02-01";"9";"dna-replikation";"Vilka två påståenden om eukaryot DNA-replikation är korrekta? (2p) A: ORC binder till replikationsorigin under hela cellcykeln. B: DNA-syntes initieras i M-fas. C: CMG-komplexet bildas genom bindning av MCM, GINS och Cdc45. D: MCM-helikaset är aktivt under hela cellcykeln.";"";"Vilka två påståenden om eukaryot DNA-replikation är korrekta? (2p) A: ORC binder till replikationsorigin under hela cellcykeln. B: DNA-syntes initieras i M-fas. C: CMG-komplexet bildas genom bindning av MCM, GINS och Cdc45. D: MCM-helikaset är aktivt under hela cellcykeln.";"A och C"
"2025-02-01";"34";"introduktionslaboration";"Du arbetar som läkare och följer upp hemoglobin (Hb) hos 200 patienter behandlade för järnbrist. Hb följer en normalfördelning med medelvärde 130 g/L och standardavvikelse 10 g/L. Vilka två av följande påståenden är korrekta? (2p) A: Cirka 68% av patienterna har ett Hb mellan 120 och 140 g/L. B: Standardavvikelsen beskriver hur spridda Hb-värdena är kring medelvärdet. C: Cirka 99% av patienterna har ett Hb under 120 g/L. D: Cirka 95% av patienterna har ett Hb mellan 100 och 200 g/L.";"";"Du arbetar som läkare och följer upp hemoglobin (Hb) hos 200 patienter behandlade för järnbrist. Hb följer en normalfördelning med medelvärde 130 g/L och standardavvikelse 10 g/L. Vilka två av följande påståenden är korrekta? (2p) A: Cirka 68% av patienterna har ett Hb mellan 120 och 140 g/L. B: Standardavvikelsen beskriver hur spridda Hb-värdena är kring medelvärdet. C: Cirka 99% av patienterna har ett Hb under 120 g/L. D: Cirka 95% av patienterna har ett Hb mellan 100 och 200 g/L.";"A och B"
"2025-02-01";"14";"translation";"Aminoacyl-tRNA synthetases have an activation site and an editing site. Account for their function in translation. (4p) Please answer this question in English.";"";"Aminoacyl-tRNA synthetases have an activation site and an editing site. Account for their function in translation. (4p) Please answer this question in English.";"The activation site is where the binding of an aminoacid to the 3´amino acid pocket in tRNA happens. The enzym catalyzes the reaction between these two to create an ""esterbindning"" between the CCA in tRNA's amino acid seat/pocket to the C in the aminoacid. More specfically, it is adenine that directly binds to the tRNA. The aminoacyl-tRNA is then moved to the editing site where it gets checked that the right aminoacid has bound to the tRNA to see if its anticodons are compatible with the mRNAs codons. Ord: 88 Totalpoäng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen"
"2025-02-01";"20";"enzymer";"Enzymer har ofta en katalytisk klyfta där den katalyserade reaktionen sker. Redogör för två olika kemiska fördelar med detta. (4p)";"";"Enzymer har ofta en katalytisk klyfta där den katalyserade reaktionen sker. Redogör för två olika kemiska fördelar med detta. (4p)";"1. Unik kemisk miljö där den specifika reaktionen som enzymet katalyserar kan ske utan störningar från omgivningen då katalytiska klyftan isoleras från omgivande miljö. Då kan ex hydrofoba molekyler reagera utan att behöver aggregeras eller påverkas av hydrofob effekt. 2. Vatten kan trängas ut så attt den inte stör eller står i väg när substratet kommer och binder till enzymet. 3. (Extra: katalytiska klyftan är specifikt för en substrat)"
"2025-02-01";"30";"aminosyrametabolism";"Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Glutamat och serin utgör de två viktigaste transportformerna av kväve från extrahepatiska vävnader till levern. B: Vid nedbrytning av flera olika aminosyror hamnar deras aminogrupper i glutamat, som i sin tur är molekylen som kan avge aminogruppen som ammoniak i levercellernas mitokondrier. C: Rent ketogena aminosyror kan omvandlas till oxaloacetat. D: Vid leverskada ses oftast förhöjda plasmanivåer av två aminotransferaser, alaninaminotransferas och aspartataminotransferas.";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Glutamat och serin utgör de två viktigaste transportformerna av kväve från extrahepatiska vävnader till levern. B: Vid nedbrytning av flera olika aminosyror hamnar deras aminogrupper i glutamat, som i sin tur är molekylen som kan avge aminogruppen som ammoniak i levercellernas mitokondrier. C: Rent ketogena aminosyror kan omvandlas till oxaloacetat. D: Vid leverskada ses oftast förhöjda plasmanivåer av två aminotransferaser, alaninaminotransferas och aspartataminotransferas.";"B och D"
"2025-02-01";"15";"evolution";"Redogör för de två viktigaste principerna som förklarar hur nya egenskaper kan utvecklas i ett evolutionärt sammanhang samt hur de två principerna är beroende av varandra. (4p)";"";"Redogör för de två viktigaste principerna som förklarar hur nya egenskaper kan utvecklas i ett evolutionärt sammanhang samt hur de två principerna är beroende av varandra. (4p)";"De två viktigaste principerna är variation och naturligt urval. I en population förekommer en genetisk variation mellan individerna. Den genetiska variationen beror på mutationer bland annat. Alla individer har inte samma egenskaper och är därför olika anpassade efter miljön som dessa lever i. De individer som är bäst anpassade till miljön kommer ha en större chans att utnyttja resurserna och kunna överleva samt föröka sig och föra vidare sina gynnsamma gener. Detta i sin tur är kallat naturligt urval där miljön ""selekterar"" de bäst anpassade. Exempel på det är hur giraffens långa hals kan ha uppstått. I en giraffpopulation förekom en genetisk variation med giraffer som hade både korta och långa halser. I en miljö med korta träd kunde båda nyttjas, men i samband med att träden blev allt högre, kunde de som hade långt hals nå upp och utnyttja det. Dessa blev de bäst anpassade och därmed överförde vidare de gynnsamma generna, medan de som hade kort hals kunde inte utnyttja resurserna på samma sätt i just den specifika miljön."
"2025-02-01";"21";"integrering-av-metabolismen";"Vilka två av nedanstående molekyler innehåller delar från en B-vitamin? (2p) A: Cyt c B: ATP C: CoA D: NADH";"";"Vilka två av nedanstående molekyler innehåller delar från en B-vitamin? (2p) A: Cyt c B: ATP C: CoA D: NADH";"C och D"
"2025-02-01";"31";"nukleotidnedbrytning";"Namnge en nukleosid och ange i vilken molekyl merparten av nukleosidens kväveatomer hamnar när den bryts ned. Molekylen utsöndras slutligen med urinen. (2p) Max 10 ord.";"";"Namnge en nukleosid och ange i vilken molekyl merparten av nukleosidens kväveatomer hamnar när den bryts ned. Molekylen utsöndras slutligen med urinen. (2p) Max 10 ord.";"Adenosin. Hamnar i Urat"
"2025-02-01";"25";"citronsyracykeln";"I citronsyracykeln deltar fyra dehydrogenaser. A) Vad gör ett dehydrogenas? B) Vilka två av de fyra dehydrogenaserna utför också en annan gemensam reaktion? C) Vilken är den andra gemensamma reaktionen? (4p) Max 30 ord.";"";"I citronsyracykeln deltar fyra dehydrogenaser. A) Vad gör ett dehydrogenas? B) Vilka två av de fyra dehydrogenaserna utför också en annan gemensam reaktion? C) Vilken är den andra gemensamma reaktionen? (4p) Max 30 ord.";"a) Tar bort väte b) Isocitratdehydrogenas och alfa-ketoglutaratdehydrogenas c) Dekarboxylering; frigör CO₂"
"2025-02-01";"11";"dna-replikation";"Telomeras är ett enzym som spelar en viktig roll i bevarandet av kromosomernas integritet under DNA-replikation. Vad gör telomeras, och varför är det viktigt för celler som delar sig ofta, som stamceller och könsceller? (4p)";"";"Telomeras är ett enzym som spelar en viktig roll i bevarandet av kromosomernas integritet under DNA-replikation. Vad gör telomeras, och varför är det viktigt för celler som delar sig ofta, som stamceller och könsceller? (4p)";"Vid replikation av DNA har vi en ledande sträng som syntetiseras kontinuerligt, och en lagging sträng som syntetiseras i olika fragment kallade Okazakifragment. Då replikationen sker i 5'- till 3'-riktning, måste Okazakifragmenten ha olika RNA-primers som de startar vid. Just här uppstår ett problem, då vi inte kan lägga till primers på ändarna, så lagging strand kommer inte kunna syntetisera där. I normala fall leder detta till att DNA förkortas efter varje replikation. Men i celler som stamceller och cancerceller kommer telomeraset att ha med sig en egen RNA-mall och utför omvänd transkriptas, det vill säga att göra RNA till DNA. Så telomeraset kommer att förlänga ändarna med en repeterande sekvens. Det som händer då är att vid nästa replikation kommer DNA att förkortas vid de sekvenserna som lades till av telomeraset, men ingen viktig information kommer att tas bort. Detta utnyttjas av stamceller och cancerceller för att cellerna ska kunna dela sig utan att dö eller tappa viktiga gener."
"2025-02-01";"8";"nukleotider";"Nukleotider är de byggstenar som bygger upp både DNA och RNA. Vilken kemisk grupp finns i 2'-position hos ribonukleotider, och hur skiljer sig denna från deoxyribonukleotider? (4p)";"";"Nukleotider är de byggstenar som bygger upp både DNA och RNA. Vilken kemisk grupp finns i 2'-position hos ribonukleotider, och hur skiljer sig denna från deoxyribonukleotider? (4p)";"Hos ribonukleotider finns en OH-grupp i 2´positioinen medan det i DNA finns H. Detta beror på att enzymet ribonukleotidreduktas ersätter OH gruppen i RNA med H för att omvandla ribos till deoxyribos. RNA: Ribos har OH på kol nr 2. DNA: Deoxyribos har H på kol nr 2."
"2025-02-01";"35";"plasmid";"Explain how gel electrophoresis can be used to analyze different conformations of plasmid DNA. Discuss how the migration patterns of these conformations differ and how comparing them with the ladder (marker) helps interpreting the gel results and understand the structure of the plasmid DNA. (4p) Max 150 words. Answer in English.";"";"Explain how gel electrophoresis can be used to analyze different conformations of plasmid DNA. Discuss how the migration patterns of these conformations differ and how comparing them with the ladder (marker) helps interpreting the gel results and understand the structure of the plasmid DNA. (4p) Max 150 words. Answer in English.";"The electrophoresis has two differently charged ends, one positive and one negative. The plasmids get injected into the gel electrophoresis in a well from the negatively charged end. When we then give it a current, the plasmids will travel to the positive end (because DNA is negative). The bigger the plasmid is, the further it will travel, because it has more negative charges than a small one. Supercoiled and circular DNA will meet different amount of friction, since they have different forms, which will result in one traveling further than the other even though they have the same size. The marker will help identify how many base pairs the plasmid have. But if we analyze two of the same plasmids and they travel different distances, then it means that they have different conformations where one is supercoiled and the other is circular. The circular meets more friction."
"2025-02-01";"3";"från-aminosyror-till-proteiner";"Ange två likheter och två skillnader mellan en alfahelix och en hårnålsböj (reverse turn). (4p) Max 50 ord.";"";"Ange två likheter och två skillnader mellan en alfahelix och en hårnålsböj (reverse turn). (4p) Max 50 ord.";"Alfahelixar har vätebindningar mellan var fjärde aminosyra, medan hårnålsböj har mellan var tredje. Båda är en typ av primärstruktur. Alfahelixar är ofta högervridna."
"2025-02-01";"7";"glykogen";"Glukos lagras hos människan i form av glykogen. Hos växter lagras glukos som stärkelse. Beskriv skillnader och likheter mellan glykogen och stärkelse. (4p)";"";"Glukos lagras hos människan i form av glykogen. Hos växter lagras glukos som stärkelse. Beskriv skillnader och likheter mellan glykogen och stärkelse. (4p)";"Elev 1 - 3 av 4 poäng: Båda är långa kedjor av kolhydrater. Skillnaden är dock att glykogen består av förgrenade kedjor där vi har 1,4-glykosidbindningar mellan linjära delar, och 1,6-glykosidbindningar mellan förgreningar. Stärkelse är en enda linjär kedja som inte förgrenas. Elev 2 - 3 av 4 poäng Stärkelse i växter bildas av fotosyntes, utav koldioxid och vatten där solenergin utnyttjas för att skapa bindningar mellan dessa molekyler, då får vi bl.a glukos. Det glukos som tillverkas i växter av fotosyntes är samma glukos vi äter och bryter dess bindningar för energi. Att glukos lagras som glykogen hos oss är för att glukos är för osmotiskt aktiv för att lagras som den är. Men stärkelse lagras inte för växternas skull, utan det är ett sätt att omvandla koldioxid som vi andas ut till syrgas, annars skulle syrgas i atmosfären ha tagit slut. AI-rättning: Kort sammanfattning av vad som typiskt ger full poäng: Likhet: båda består av α-D-glukos. Likhet: båda använder α-1,4- och α-1,6-bindningar. Skillnad: stärkelse = amylose (linjär) + amylopektin (lätt förgrenad). Skillnad: glykogen = mycket mer förgrenat."
"2025-02-01";"6";"cellmembran";"Du gör forskar-ST inom infektionsmedicin och studerar hur Helicobacter pylori binder till glykolipider. Du ritar upp en glykolipid i cellmembranet och markerar hur den del som sitter på utsidan är den bakterierna binder till. Principiell struktur räcker. (4p)";"";"Du gör forskar-ST inom infektionsmedicin och studerar hur Helicobacter pylori binder till glykolipider. Du ritar upp en glykolipid i cellmembranet och markerar hur den del som sitter på utsidan är den bakterierna binder till. Principiell struktur räcker. (4p)";". Ritning: På ritningen (sida 11) visas ett cellmembran med glykolipider: hydrofila huvuden utåt, hydofoba fettsyrasvansar i membranet och en kolhydrat kopplad via glycerol (kommentar: ”kan också vara sfingosin”). Lärarens kommentar: Det absolut vanligaste är att glykolipider har sfingosin som bas och inte glycerol, och när man säger glykolipid utan att specificera mer så menar man nästan alltid de med sfingosin som bas. Ord (textsvar): 1"
"2025-02-01";"2";"från-aminosyror-till-proteiner";"Vilka två av nedanstående påstående stämmer för proteinveckning? (2p) A: Den är reversibel. B: Det är en ofördelaktig process. C: Den börjar på lokal nivå. D: En aminosyrasekvens veckas alltid till samma struktur.";"";"Vilka två av nedanstående påstående stämmer för proteinveckning? (2p) A: Den är reversibel. B: Det är en ofördelaktig process. C: Den börjar på lokal nivå. D: En aminosyrasekvens veckas alltid till samma struktur.";"A och C"
"2024-08-01";"28";"elektrontransportkedjan";"Vad får det för konsekvens när NADH som bildats i glykolysen transporteras till mitokondriens matrix med glycerol 3-fosfatshunten istället för med malat-aspartatshunten? (2p) (Max 30 ord)";"";"Vad får det för konsekvens när NADH som bildats i glykolysen transporteras till mitokondriens matrix med glycerol 3-fosfatshunten istället för med malat-aspartatshunten? (2p) (Max 30 ord)";"0 poäng: Konsekvensen blir att vi kommer behöva förbruka en atp för att glycerol 3 fosfat ska kunna bildas. Det kräver mer energi AI-svar: När elektroner från cytosoliskt NADH går via glycerol-3-fosfatshunten i stället för malataspartatshunten blir konsekvensen: → Färre ATP per NADH. Glycerol-3-fosfatshunten överför elektroner till FAD i mitokondriens inre membran → FADH₂ → komplex II → ger ~1,5 ATP. Malataspartatshunten överför elektroner direkt till mitokondriellt NAD⁺ → NADH → komplex I → ger ~2,5 ATP. Konsekvens: lägre ATP-utbyte från glykolysen när glycerol-3-fosfatshunten används."
"2024-08-01";"5";"cellmembran";"Du är läkare och handleder en läkarstudent som är stressad över sin biokemitenta. Läkarstudenten kommer inte ihåg membranlipiderna så bra och undrar om du kan hjälpa till att förklara, vilket du gör genom att: A) Rita den principiella strukturen för den vanligaste membranlipiden. B) Markera i bilden som du har ritat den del som är polär, samt den del som är hydrofob. (4p) ![[Pasted image 20251129235536.png]]";"";"Du är läkare och handleder en läkarstudent som är stressad över sin biokemitenta. Läkarstudenten kommer inte ihåg membranlipiderna så bra och undrar om du kan hjälpa till att förklara, vilket du gör genom att: A) Rita den principiella strukturen för den vanligaste membranlipiden. B) Markera i bilden som du har ritat den del som är polär, samt den del som är hydrofob. (4p) ![[Pasted image 20251129235536.png]]";"Svar på ritpapper: fosfolipid med alkohol + fosfat (polär del) kopplad till glycerol och två fettsyrasvansar (hydrofob del)."
"2024-08-01";"18";"termodynamik";"Kemiska reaktioner i vätskor och gaser sker snabbare när temperaturen höjs. Hur kan det förklaras? (4p) (Max 150 ord.)";"";"Kemiska reaktioner i vätskor och gaser sker snabbare när temperaturen höjs. Hur kan det förklaras? (4p) (Max 150 ord.)";"Det går snabbare därför att en ökning i värmeenergi kommer omvandlas till en ökning i rörelseenergin (termodynamikens första lag, energi kan inte skapas eller förstöras men det kan omvandlas). När vi höjer rörelseenergi kommer detta innebära att varje partikel befinner sig på en högre energinivå än vad den var innan. Detta ökar både chansen för att två partiklar med rätt konformation krockar med varandra, men också att de krockar med varandra med tillräckligt mycket energi för att kunna nå övergångstillståndet och således reagera."
"2024-08-01";"1";"glukosmetabolism";"I glykolysens första steg binder glukos till en klyfta i enzymet som utför reaktionen från vilken vatten stängs ute. Förklara vilka egenskaper de aminosyror behöver ha som binder till glukos och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 60 ord.)";"";"I glykolysens första steg binder glukos till en klyfta i enzymet som utför reaktionen från vilken vatten stängs ute. Förklara vilka egenskaper de aminosyror behöver ha som binder till glukos och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 60 ord.)";"Glukos är en vattenlöslig molekyl - den är polär. De som binder till glukos behöver då också vara polära och vattenlösliga. två aminosyror som har dessa egenskaper är serin och treonin. Det som utmärker dessa är att de är alkoholer - så de binder gärna till glukos via sina OH-grupper."
"2024-08-01";"19";"enzymer";"Enzymet A som omvandlar S till P har ett Km på 10 µM och ett Vmax på 100 nmol/s. Enzymet B som omvandlar S till Q har ett Km på 1 mM och ett Vmax på 200 nmol/s. Lika mängder av A och B blandas med 100 µM S i ett och samma kärl. Vad kommer man att ha mest av när reaktionerna är klara - P eller Q? Motivera ditt svar. (4p) (Max 150 ord.)";"";"Enzymet A som omvandlar S till P har ett Km på 10 µM och ett Vmax på 100 nmol/s. Enzymet B som omvandlar S till Q har ett Km på 1 mM och ett Vmax på 200 nmol/s. Lika mängder av A och B blandas med 100 µM S i ett och samma kärl. Vad kommer man att ha mest av när reaktionerna är klara - P eller Q? Motivera ditt svar. (4p) (Max 150 ord.)";"1 av 4: Km = ([E]+[S])/[ES] och Vmax = K + Etot k2=turnover number Med hjälp av formlerna ovan har jag kunnat dra slutsatsen att Enzym A har både en mindre kapacitet för att forma enzym-substrat komplex och har även en lägre turnover number än vad Enzym B har. Denna slutsats drar jag då enzym A har ett större Km värde än vad Enzym B har, vilket innebär att [ES] är mindre hos Enzym A än Enzym B enligt michealis mentes kinetiken. Enzym A har alltså lägre affinitet för sitt substrat än Enzym B Vmax är också lägre hos enzymA än vad den är hos enxym B, detta beror på turnover number som är det värde som talar om hur bra ett enzym bildar produkt. Enzym A måste ha ett lägre turnover-number än enzym B då dess Vmax är lägre. Enzym B har alltså både större [ES] och bildar produkt bättre(K )->Q kommer bildas."
"2024-08-01";"29";"elektrontransportkedjan";"Vilka två av nedanstående komponenter deltar i elektrontransportkedjan? (2p) A: Cu2+ B: Coenzym A C: Mn2+ D: Fe-S-kluster";"";"Vilka två av nedanstående komponenter deltar i elektrontransportkedjan? (2p) A: Cu2+ B: Coenzym A C: Mn2+ D: Fe-S-kluster";"A och D"
"2024-08-01";"4";"utforska-proteiner";"Du jobbar på labb över sommaren och du har fått i uppgift att utföra en ELISA för att undersöka om en patient har HIV. Beskriv vilken typ av ELISA som skall utföras, vilka steg som utförs och ange vilken substans hos patienten som undersöks med metoden. (4p). (Max 200 ord.)";"";"Du jobbar på labb över sommaren och du har fått i uppgift att utföra en ELISA för att undersöka om en patient har HIV. Beskriv vilken typ av ELISA som skall utföras, vilka steg som utförs och ange vilken substans hos patienten som undersöks med metoden. (4p). (Max 200 ord.)";"För att undersöka om en patient har HIV så vill man kolla ifall den har antikroppar för det. Då använder man sig av indirekt ELIZA samt ett prov innehållande patientens plasma-komponenter - då det är där antikropparna finns. Vid indirekt ELIZA kommer det i en behållare finnas antigener bundna till botten, dessa ska ha en epitop som HIV-antikroppen känner igen. Man kommer tillsätta ett prov innehållande patientens plasma-komponenter till behållaren. HIV-antikropparna kommer binda till antigenerna och sedan kommer provet att sköljas. efter sköjlning kommer man tillsätta en substans innehållande enzymlänkade antikroppar som kommer binda till HIV-antikropparna. Efter dessa har fått tid att binda sköljer man provet en gång till. sedan så tillsätter man en annan substans som innehåller ett substrat som enzymerna binder. Detta substrat kommer orsaka ett färgskifte om det finns HIV-antikroppar i provet, om det inte finns hiv-antikroppar blir det inget färgskifte och man vet att patienten inte har HIV. det är viktigt att man sköljer ordentligt mellan stegen, annars kan det uppstå en falsk positiv, detta då antikropparna ju skulle finnas kvar i provet, som då de enzymbundna antikropparna kan binda till, som då kommer ge färgskifte vid tillsatts av substrat."
"2024-08-01";"16";"transport-över-cellmembran";"Vilka två av nedanstående proteiner utför aktiv transport? A: Aquaporiner B: ABC-transportörer C: Adeninnukleotidtranslokas D: GLUT4 (2p)";"";"Vilka två av nedanstående proteiner utför aktiv transport? A: Aquaporiner B: ABC-transportörer C: Adeninnukleotidtranslokas D: GLUT4 (2p)";"B och C"
"2024-08-01";"22";"glykolysen";"A) Förklara vad som menas med feedbackreglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras med feedbackreglering och ange vad det är som ger feedbackregleringen. (4p) (50 ord)";"";"A) Förklara vad som menas med feedbackreglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras med feedbackreglering och ange vad det är som ger feedbackregleringen. (4p) (50 ord)";"A) Feedback reglering är att en produkt som bildas kommer reglera aktiviteten hos ett enzym som katalyserar en reaktion som sker innan den reglerande produkten har bildats. B) Hexokinas katalyserar reaktionen Glukos + ATP -> glukos-6-fosfat + ADP, den feedbackinhiberas av sin egen produkt, glukos-6-fosfat."
"2024-08-01";"32";"pentosfosfatvägen";"Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? (2p) A: En funktionell pentosfosfatväg är viktig för att celler skall kunna upprätthålla ett fullgott skydd mot skadliga reaktiva syreföreningar (ROS). B: Glykolysintermediärerna glukos-6-fosfat och glyceraldehyd-3-fosfat är slutprodukterna som bildas i pentosfosfatvägens icke-oxidativa fas. C: En väldigt viktig uppgift för pentosfosfatvägen är att bilda NADPH och ribos-5-fosfat. D: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla och det är cellens behov som styr riktningen av reaktionerna.";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? (2p) A: En funktionell pentosfosfatväg är viktig för att celler skall kunna upprätthålla ett fullgott skydd mot skadliga reaktiva syreföreningar (ROS). B: Glykolysintermediärerna glukos-6-fosfat och glyceraldehyd-3-fosfat är slutprodukterna som bildas i pentosfosfatvägens icke-oxidativa fas. C: En väldigt viktig uppgift för pentosfosfatvägen är att bilda NADPH och ribos-5-fosfat. D: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla och det är cellens behov som styr riktningen av reaktionerna.";"A och C"
"2024-08-01";"26";"citronsyracykeln";"Kan citronsyracykeln gå åt vilket håll som helst? Motivera svaret. (4p) (Max 75 ord)";"";"Kan citronsyracykeln gå åt vilket håll som helst? Motivera svaret. (4p) (Max 75 ord)";"Jag förstår inte helt frågan som ställs, CSC kan inte gå bakåt i cykeln då vi har två reglerande steg då koldioxid avges. Isocitratdehdyrogenas och alfaketoglutaratdehydrogenas är reglerade dels av sina produkter men även av energikvoten, dessa kan inte gå bakåt hur som helst. Då det är en cykel kan vi dock återbilda en produkt genom att låta cykeln fortgå efter oxalacetat har bildats tills vi får den produkten som vi ville återbilda."
"2024-08-01";"12";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Vid prokaryot transkription spelar sigma-faktorn en avgörande roll. Vilka två påståenden om sigma-faktorn stämmer? (2p) A: Sigma-faktorn gör så att bakteriellt RNA-polymeras binder starkare till alla typer av DNA. B: En bakterie innehåller ofta flera typer av sigma-faktorer. C: Sigma-faktorn styr bakteriellt RNA-polymeras till promotorn. D: Sigma-faktorn gör RNA-polymeraset mer processivt.";"";"Vid prokaryot transkription spelar sigma-faktorn en avgörande roll. Vilka två påståenden om sigma-faktorn stämmer? (2p) A: Sigma-faktorn gör så att bakteriellt RNA-polymeras binder starkare till alla typer av DNA. B: En bakterie innehåller ofta flera typer av sigma-faktorer. C: Sigma-faktorn styr bakteriellt RNA-polymeras till promotorn. D: Sigma-faktorn gör RNA-polymeraset mer processivt.";"B och C"
"2024-08-01";"27";"glukoneogenes";"Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter / vägar: fosfofruktokinas 1 fosfoglyceratkinas fumaras laktatdehydrogenas citronsyracykeln Coricykeln glykolysen glukoneogenes";"";"Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter / vägar: fosfofruktokinas 1 fosfoglyceratkinas fumaras laktatdehydrogenas citronsyracykeln Coricykeln glykolysen glukoneogenes";"fosfofruktokinas 1: glykoneogenesen fosfoglyceratkinas: glykolysen fumaras: citronsyracykeln laktatdehydrogenas: Coricykeln"
"2024-08-01";"13";"translation";"Hur sker matchningen mellan den kodande sekvensen på mRNA och antikodonsekvensen på tRNA? Beskriv var i ribosomer som denna matchning sker under translationen. (4p) (Max 150 ord.)";"";"Hur sker matchningen mellan den kodande sekvensen på mRNA och antikodonsekvensen på tRNA? Beskriv var i ribosomer som denna matchning sker under translationen. (4p) (Max 150 ord.)";"3 av 4: Ribosomen består av en liten subenhet - 30S och en stor subenhetet 50S. den stora subenheten kommer sköta matchningen av kodon till antikodon och den lilla kommer hålla i mRNA strängen. Matchningen mellan den kodande sekvensen på mRNA och antikodonssekvensen på tRNA sker på Aminoadenyl siten (A-site) i ribosomen. En aminosyra-laddad tRNA kommer att vandra in i A-siten på en riboosom. Där kommer antikodonerna matchas med kodonerna och vätebindingar kommer bildas mellan dem. Om dessa har matchat rätt kommer elongation factors göra att tRNA släpper ifrån och fortsätter till peptidyl-site och sedan ut via exit-site i ribosomen."
"2024-08-01";"17";"transport-över-cellmembran";"Rangordna molekylerna etanol, fruktos, leucin och koldioxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den som har lättast att passera. (2p) Lättast → Svårast: Etanol Fruktos Koldioxid Leucin";"";"Rangordna molekylerna etanol, fruktos, leucin och koldioxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den som har lättast att passera. (2p) Lättast → Svårast: Etanol Fruktos Koldioxid Leucin";"1. Koldioxid 2. Etanol 3. Fruktos 4. Leucin"
"2024-08-01";"23";"glukoneogenes";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Aminosyrorna isoleucin och leucin är glukogena. B: Kol reduceras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat. D: Glukoneogenes sker framför allt när insulinnivån är hög.";"";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Aminosyrorna isoleucin och leucin är glukogena. B: Kol reduceras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat. D: Glukoneogenes sker framför allt när insulinnivån är hög.";"B och C"
"2024-08-01";"33";"kolesterol";"Beskriv kortfattat vad det enterohepatiska kretsloppet är och förklara dess koppling till kolesterolsyntes. (4p)";"";"Beskriv kortfattat vad det enterohepatiska kretsloppet är och förklara dess koppling till kolesterolsyntes. (4p)";"2 av 4: Nedbruten kolesterol kommer att utsöndras med gallsyror, därför är det viktigt att vi har gallsyror så att vi inte får en ackumulering av kolesterol. Enterohepatiska kretsloppet är att vi har en 95-procentig reabsorption av gallsyror i hepatocyterna - vilket gör att vi ständigt har galla. AI: Det enterohepatiska kretsloppet innebär att gallsyror som bildats från kolesterol i levern utsöndras till tarmen och därefter till största delen återabsorberas i ileum och förs tillbaka till levern via portavenen. Detta sparar kolesterol, eftersom färre nya gallsyror behöver syntetiseras. Om återcirkulationen minskar måste levern istället öka sin kolesterolsyntes och uppreglera LDL-receptorer för att få mer kolesterol till ny gallsyrabildning."
"2024-08-01";"24";"betaoxidation";"A) Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar och varför sker detta? B) Vilka är de tre ketonkropparna som bildas? (4p)";"";"A) Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar och varför sker detta? B) Vilka är de tre ketonkropparna som bildas? (4p)";"1 av 4: a) bildningen av ketonkroppar sker vid svält. Vid svält kommer glukosreserverna att ha brutits ned och vi kommer gå över till att bryta ner våra fettreserver. Då kommer det bildas ketonkroppar och detta är ffa för att förse hjärnan med energi, då den inte längre kan få det från glukos. b) acyl-CoA, acetoacyl-CoA och aceton."
"2024-08-01";"10";"rna-syntes";"Vilka två påståenden stämmer om RNA processning? (2p) A: En lariatstruktur bildas som restprodukt vid splicing av mRNA B: mRNA har en polyA-svans som bildas i cytoplasman. C: 5-cap hämmar translation. D: Introner bevaras i moget mRNA.";"";"Vilka två påståenden stämmer om RNA processning? (2p) A: En lariatstruktur bildas som restprodukt vid splicing av mRNA B: mRNA har en polyA-svans som bildas i cytoplasman. C: 5-cap hämmar translation. D: Introner bevaras i moget mRNA.";"A och B"
"2024-08-01";"9";"dna-replikation";"A) Vad är skillnaden mellan exo- och endonukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för CMP. (4p)";"";"A) Vad är skillnaden mellan exo- och endonukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för CMP. (4p)";"a) exonukleaser kommer att bryta fosfodiesterbindingar på änden av en DNA- kedja medan endonukelaser kommer bryta en fosfodiesterbindning någonstans i mitten av DNA-kedjan. b) cytidinmonofosfat."
"2024-08-01";"34";"introduktionslaboration";"Vilka två faropiktogram visas i bild nedan? ![[Pasted image 20251129235602.png]] A: Oxiderande B: Brandfarlig C: Skadlig D: Giftig (2p)";"";"Vilka två faropiktogram visas i bild nedan? ![[Pasted image 20251129235602.png]] A: Oxiderande B: Brandfarlig C: Skadlig D: Giftig (2p)";"A & C"
"2024-08-01";"14";"evolution";"Beskriv kortfattat hur den första eukaryota cellen bildades. (4p) (Max 150 ord.)";"";"Beskriv kortfattat hur den första eukaryota cellen bildades. (4p) (Max 150 ord.)";"Den första eukaryota cellen bildades tack vare endosymbios. Med endosymbios menas att två bakterier har gått ihop och har haft ett utbyte mellan varandra som gynnar båda. Detta sker genom att en mindre bakterie vandrar in i en större bakterie med en egenskap som gynnar överlevnaden hos både sig själv och den större bakterien. Tillslut kommer den större bakterien att ta över vissa processer som den lilla gör genom att den lilla bakteriens DNA överförs till den större bakterien - på så sätt får vi en cell med flera organeller. Exempel: mitokondrien mitokondrien - som var en aerob bakterie, vandrade en gång in i en anaerob, större cell. den gav energi i form av ATP och den större anaeroba cellen gav den näring. tillslut överfördes DNA från den aeroba bakterien till den anaeroba cellen - på så sätt kunde cellen börja styra vissa processer och vi fick en cellandande cell."
"2024-08-01";"20";"enzymer";"Vilka två av nedanstående påståenden om enzymer är korrekta? (2p) A: Enzymer förändrar den fria energin i en reaktion. B: Enzymernas tredimensionella form är nyckeln till deras funktion. C: Enzymer påskyndar reaktioner genom att sänka aktiveringsenergin. D: Enzymer är alltid proteiner.";"";"Vilka två av nedanstående påståenden om enzymer är korrekta? (2p) A: Enzymer förändrar den fria energin i en reaktion. B: Enzymernas tredimensionella form är nyckeln till deras funktion. C: Enzymer påskyndar reaktioner genom att sänka aktiveringsenergin. D: Enzymer är alltid proteiner.";"B och C"
"2024-08-01";"30";"aminosyrametabolism";"Alanin kan bildas i en så kallad transamineringsreaktion med hjälp av ett kliniskt viktigt enzym. Ange det fullständiga namnet på enzymet, samt beskriv reaktionen som enzymet katalyserar med en reaktionsformel. (4p) (Max 20 ord.)";"";"Alanin kan bildas i en så kallad transamineringsreaktion med hjälp av ett kliniskt viktigt enzym. Ange det fullständiga namnet på enzymet, samt beskriv reaktionen som enzymet katalyserar med en reaktionsformel. (4p) (Max 20 ord.)";"3 av 4: Alanin-aminotransferas pyruvat + glutamat -> alanin + alfa-ketoglutarat"
"2024-08-01";"15";"cellmembran";"Ange två typer av celladhesionsmolekyler och beskriv kortfattat deras funktion. (4p)";"";"Ange två typer av celladhesionsmolekyler och beskriv kortfattat deras funktion. (4p)";"integriner - förankrar cellen med ECM. Detta gör de genom att binda till cytoskelettet som aktinfilament och sedan binda till ECM komponenter såsom fibrinogen samt kollagen. cadheriner - finns i desmosomer och adherensjunctions, de förankrar cellerna i varandra. Detta gör de genom att binda till andra cedheriner med homophilic bindings samt till cytoskelletet, på så sätt binder de ihop cellerna."
"2024-08-01";"21";"introduktion-till-metabolismen";"Ange vad som används som cellens energivaluta och förklara vad som gör molekylen lämplig för ändamålet. (4p) (Max 100 ord).";"";"Ange vad som används som cellens energivaluta och förklara vad som gör molekylen lämplig för ändamålet. (4p) (Max 100 ord).";"Det som används som cellens energivaluta är ATP. Det som gör ATP lämplig är att den innehåller tre stycken fosfatgrupper som binder till varandra med fosfoanhybridbindniningar. Fosfoanhybridbindingen är instabil och kräver energi för att hållas ihop då det är en repulsion mellan fosfatgrupperna. Då en fosfat spjälkas av så kommer det att frisättas energi genom att repulsionen minskar, dessutom uppstår resonans mellan de två övriga fosfatgrupperna som gör dem stabilare - mer energi avges. Energin som avges kan då gå till andra energikrävadne processer ex. bilda gradienter och makromolekyler."
"2024-08-01";"31";"nukleotidnedbrytning";"Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? (2p) A: Gikt är en sjukdom orsakad av förhöjda plasmakoncentrationer av urea. B: Sockerstrukturerna i både purin- och pyrimidin-nukleotider spjälkas loss från kvävebaserna via fosforolys. C: UMP och CMP är purin-nukleotider. D: Då purin-nukleotider bryts ned kommer merparten av purinbasernas kväveatomer slutligen hamna i urat, men en mindre andel av basernas kväveatomer hamnar slutligen i urea.";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? (2p) A: Gikt är en sjukdom orsakad av förhöjda plasmakoncentrationer av urea. B: Sockerstrukturerna i både purin- och pyrimidin-nukleotider spjälkas loss från kvävebaserna via fosforolys. C: UMP och CMP är purin-nukleotider. D: Då purin-nukleotider bryts ned kommer merparten av purinbasernas kväveatomer slutligen hamna i urat, men en mindre andel av basernas kväveatomer hamnar slutligen i urea.";"B och D"
"2024-08-01";"25";"glykogen";"För att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel, det vill säga börja bilda en glykogenpartikel ""från början"", så behövs en så kallad glykogen-primer, dvs en kort sträcka linjärt glykogen. Hur bildas denna primer, och varför måste strukturen bildas för att glykogenpartikeln sedan skall kunna byggas upp? (4p) (Max 50 ord.)";"";"För att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel, det vill säga börja bilda en glykogenpartikel ""från början"", så behövs en så kallad glykogen-primer, dvs en kort sträcka linjärt glykogen. Hur bildas denna primer, och varför måste strukturen bildas för att glykogenpartikeln sedan skall kunna byggas upp? (4p) (Max 50 ord.)";"Glykogenin kommer att autokatalysera bildningen av en glykogenprimer genom att sätta på den aktiva formen av glukos (UDP-glukos) på sin tyrosins OH-grupp. Sedan forsätter den att binda ca. 10-20 glukosenheter innan glykogensyntas tar över. Glykogensyntas kan bara bilda alfa-1,4-bindningar om det finns en kedja att koppa dem till."
"2024-08-01";"11";"kromatin";"Var sitter histon H1 och vilken roll spelar denna faktor? (4p)";"";"Var sitter histon H1 och vilken roll spelar denna faktor? (4p)";"H1 sitter på den yttre regionen av en nukleosom. Dess uppgift är att stabilisera nukleosomen genom att binda till/över DNA:t som är virat kring histonbunten och se till att DNAt förankras med histonerna. Utan H1 hade dnat främst hållts kvar av H3 och H4s positivt laddade N-terminaler som binder till den negativt laddade DNA strängen. Detta hade inneburit att så fort dessa histoner hade genomgått acetylering eller metylering så hade nukleosomen varit väldigt instabil."
"2024-08-01";"8";"dna-replikation";"Vilka två påståenden om DNA-replikation stämmer? (2p) A: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. B: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. C: Topoisomeraser kan ta bort supercoils. D: DNA replikation sker alltid i 3´ till 5´-riktning.";"";"Vilka två påståenden om DNA-replikation stämmer? (2p) A: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. B: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. C: Topoisomeraser kan ta bort supercoils. D: DNA replikation sker alltid i 3´ till 5´-riktning.";"(svar angivet i flervalsformulär)"
"2024-08-01";"35";"plasmid";"A gene of interest was amplified and verified using the blue/white screening method. The plasmids from two bacterial colonies, one blue colony and one white colony, were purified. Then restriction enzyme digestion was performed, and the samples were run on a gel as follows: white uncut, white cut, blue uncut, blue cut (see figure below). After imaging the gel, we can conclude that while there is plasmid DNA in all samples, the white sample was probably mixed with the blue sample. Explain what finding in the gel indicates the white sample was probably mixed with the blue sample by referring to the size/number of bands. Account for the other source of error for this outcome besides pipette tip contamination from sample to sample. (4p) (Max 200 words) OBS! This question needs to be answered in English. ![[Pasted image 20251129235633.png]]";"";"A gene of interest was amplified and verified using the blue/white screening method. The plasmids from two bacterial colonies, one blue colony and one white colony, were purified. Then restriction enzyme digestion was performed, and the samples were run on a gel as follows: white uncut, white cut, blue uncut, blue cut (see figure below). After imaging the gel, we can conclude that while there is plasmid DNA in all samples, the white sample was probably mixed with the blue sample. Explain what finding in the gel indicates the white sample was probably mixed with the blue sample by referring to the size/number of bands. Account for the other source of error for this outcome besides pipette tip contamination from sample to sample. (4p) (Max 200 words) OBS! This question needs to be answered in English. ![[Pasted image 20251129235633.png]]";"the findings in the gel that indicate that the samples were mixed are the lines in the white uncut sample. It has two visible bands, with one lining up quite nicely with the blue uncut bands in size. If the plasmid is uncut, than there shouldn't be two distinct bands because the sample only consists of an uncut product. The white uncut should also have a larger amount of base pairs than the blue uncut because we have transformed a gene of interest into it, but they seem to have the same amount. a source of error for this outcome could be that the colony picked for the white cut may have been close to a blue colony - causing a small amount of the blue colony to be accidentaly picked."
"2024-08-01";"3";"hemoglobin";"How does fetal hemoglobin (HbF) differ from adult hemoglobin (HbA) and what effect does this have? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words).";"";"How does fetal hemoglobin (HbF) differ from adult hemoglobin (HbA) and what effect does this have? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words).";"3 av 4: Adult hemoglobin consists of two beta subunits and two alfa subunits, while fetal hemoglobin consists of two alfa subunits and two gamma subunits. HbA has a lower affinity for oxygen than HbF. Beta subunits allow for the allosteric regulator 2,3-BPG to bind. when 2,3-bpg binds it enhances T-state because it becomes a type of blockage for the conformational change to R-state, meaning that the affinity for oxygen is lowered. 2,3-BPG cannot bind to the gamma subunits - meaning that the affinity for oxygen increases."
"2024-08-01";"7";"dna-replikation";"A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Hur ser denna faktor ut? (4p)";"";"A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Hur ser denna faktor ut? (4p)";"a) PCNA, eller en sliding clamp, ökar DNA-polymerasets processivitet, den kan öka hastigheten med upp till 50x. Den fungerar på det sättet att den håller i DNA strängen så att dna-polymeraset lätt kan glida fram b) Den ser ungefär ut som en ring som omringar leading/lagging strand."
"2024-08-01";"6";"cellmembran";"Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och glykolipider. (4p)";"";"Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och glykolipider. (4p)";"3 av 4: glykoproteiner är glykosylerade proteiner, dessa består alltså av ett protein med ""barr"" av kolhydrater. de kan vara o-länkade, via serin och treonins OH-grupp, eller så kan de vara n-länkade via aspargin. Glykoproteiner bygger upp extra- cellulär-matrix och finns i ledvätska, brosk, ögat mm. likt glykoproteiner är glykolipider glykosylerade, men de består av sfingosin + en fettsyra + en sackarid/flera sackarider. Denna finns i outer leaflet i cellmembran och bl.a. bygger upp glykokalyx som är på cellen och inte i ECM. Dessa har som en ""svans"" med sackarider medan glykoproteiners kolhydrater är mer som ovannämnt, ""barr"" som kan finnas över hela proteinet."
"2024-08-01";"2";"från-aminosyror-till-proteiner";"Stamceller behöver skyddas från det åldrande som drabbar andra celler. En sak som skyddar dem är ökat uttryck av chaperoniner. Förklara hur det kan skydda mot något som är skadligt för celler. (4p) (Max 60 ord.)";"";"Stamceller behöver skyddas från det åldrande som drabbar andra celler. En sak som skyddar dem är ökat uttryck av chaperoniner. Förklara hur det kan skydda mot något som är skadligt för celler. (4p) (Max 60 ord.)";"chaperoniner - som hsp60 har två stycken ringstrukturer och en hålighet. I håligheten erbjuds en isolerad plats för proteiner att vecka sig genom att proteinet går in i håligheten och ett lock rekryteras - den veckas ""som vanligt"" oavsett hur miljön utanför. utan detta skulle prioner kunna bildas - vilka kan infektera andra proteiner att veckas fel, vilket skadar cellen."
"";"28";"";"";"";"";""
"";"5";"";"";"";"";""
"";"18";"";"";"";"";""
"";"1";"";"";"";"";""
"";"19";"";"";"";"";""
"";"29";"";"";"";"";""
"";"4";"";"";"";"";""
"";"16";"";"";"";"";""
"";"22";"";"";"";"";""
"";"32";"";"";"";"";""
"";"26";"";"";"";"";""
"";"12";"";"";"";"";""
"";"27";"";"";"";"";""
"";"13";"";"";"";"";""
"";"17";"";"";"";"";""
"";"23";"";"";"";"";""
"";"33";"";"";"";"";""
"";"24";"";"";"";"";""
"";"10";"";"";"";"";""
"";"9";"";"";"";"";""
"";"34";"";"";"";"";""
"";"14";"";"";"";"";""
"";"20";"";"";"";"";""
"";"30";"";"";"";"";""
"";"15";"";"";"";"";""
"";"21";"";"";"";"";""
"";"31";"";"";"";"";""
"";"25";"";"";"";"";""
"";"11";"";"";"";"";""
"";"8";"";"";"";"";""
"";"35";"";"";"";"";""
"";"3";"";"";"";"";""
"";"7";"";"";"";"";""
"";"6";"";"";"";"";""
"";"2";"";"";"";"";""
"2021-12-16";"28";"aminosyrametabolism";"ALAT är ett kliniskt mycket viktigt enzym. Beskriv reaktionen enzymet katalyserar samt vad en ökad plasmakoncentration av enzymet vanligen indikerar.";"";"ALAT är ett kliniskt mycket viktigt enzym. Beskriv reaktionen enzymet katalyserar samt vad en ökad plasmakoncentration av enzymet vanligen indikerar.";"ALAT alaninaminotransferas. Enzymet utför en transaminering glutamat slås ihop med pyruvat aminogruppen från glutamat överförs till pyruvat pyruvat blir då alanin och glutamat alfaketoglutarat. ALAT kan även genomföra omvänd reaktion. ALAT är vanligtvis ett intracellulärt enzym, om man uppmäter en hög koncentration av detta antyder det på att det läckt ut ur cellerna. Detta indikerar därav på vävnadsskada. ALAT finns i hög utsträckning i levern. Därför kan man se höga koncentrationer av ALAT i plasma vid många typer av leversjukdomar t.ex. hepatit."
"2021-12-16";"5";"nukleotider";"A) Vilken typ av bindning bryter nukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för dCMP.";"";"A) Vilken typ av bindning bryter nukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för dCMP.";"A) Nukleaser bryter bindningar mellan nukleotider därav fosfodiesterbindningar. B) dehydroxyriboscytosinmonofosfat (fel) rätt: - deoxycytidinmonofosfat"
"2021-12-16";"18";"nukleotider";"Vid syntes av DNA eller RNA måste var och en av de nukleotider som ska adderas till den växande strängen ha tre fosfatgrupper på sig. Man får ingen reaktion om det bara sitter en eller två fosfatgrupper på nukleotiderna. Förklara varför de tre fosfatgrupperna behövs. (Max 150 ord.)";"";"Vid syntes av DNA eller RNA måste var och en av de nukleotider som ska adderas till den växande strängen ha tre fosfatgrupper på sig. Man får ingen reaktion om det bara sitter en eller två fosfatgrupper på nukleotiderna. Förklara varför de tre fosfatgrupperna behövs. (Max 150 ord.)";"Nukleotider kopplas ihop med fosfodiesterbindningar. Bildningen av denna bindning är termodynamiskt ofördelaktig eftersom att entropin minskar reaktionen kräver tillförd energi. Fosfatgrupperna på nukleotiden är kopplade med mycket energirika fosfoanhydridbindningar. När dessa hydrolyseras frigörs mycket energi. När nukleotiden ska binda in kommer då två av fosfatgrupperna att släppa först frigörs det energi när de bryter från det ena fosfatet (som fortfarande sitter på nukleotiden) och sedan ännu mer energi när bindningen bryts mellan de två frigjorda fosfatgrupperna sinsemellan. Med hjälp av denna energi kan man då driva den energikrävande processen av att skapa en fosfodiesterbindning mellan den nya nukleotiden och den som redan finns på DNA/RNA-strängen. För att få tillräckligt med energi för att driva fosfodiesterbindningen behöver man alltså bryta två fosfoanhydridbindningar m.h.a. hydrolys. Därför krävs det totalt tre stycken fosfat (två släpps av och en hamnar i DNA/RNA-skelettet)."
"2021-12-16";"1";"kolhydrater";"Blodgrupperna ABO är kolhydratstrukturer som bland annat finns på våra röda blodkroppar. A) Hur skiljer sig A, B och O strukturerna från varandra? B) När man ska ge röda blodkroppar till patienter kan man ge röda blodkroppar från O-donatorer till patienter med blodgrupp A, B och AB, men man kan inte ge patienter med blodgrupp O röda blodkroppar från donatorer med blodgrupp A, B eller AB. Varför?";"";"Blodgrupperna ABO är kolhydratstrukturer som bland annat finns på våra röda blodkroppar. A) Hur skiljer sig A, B och O strukturerna från varandra? B) När man ska ge röda blodkroppar till patienter kan man ge röda blodkroppar från O-donatorer till patienter med blodgrupp A, B och AB, men man kan inte ge patienter med blodgrupp O röda blodkroppar från donatorer med blodgrupp A, B eller AB. Varför?";"A) De har olika uppsättning av sockerenheter. A har fucos + galaktos + acetylgalaktosamin B har fucos + galaktos + galaktos 0 har fucos + galaktos Alltså skiljer sig dessa sekvenser från varandra, därför binder olika antikroppar in till olika sorter. B) Beroende på vilken blodgrupp man har kommer man ha olika antigen och antikroppar A har A-antigen och antikroppar mot B B har B-antigen och antikroppar mot A AB har A+B-antigen och inga antikroppar mot vare sig A eller B 0 har ""inget antigen"" och därav antikroppar mot både A och B Anledningen varför en person med blodgrupp 0 då inte kan få röda blodkroppar från vare sig A, B eller AB är att den har antikroppar mot både A och B. Dessa skulle då fästa sig på de transfererade blodkropparnas antigen och aktivera immunförsvaret → autoimmun reaktion. Däremot går det bra att personer som har blodgrupp A, B eller AB får 0-röda blodkroppar eftersom dessa inte innehåller några antigen som deras immunförsvar (antikroppar) skulle känna igen."
"2021-12-16";"19";"enzymer";"![[Pasted image 20251128080420.png]] Diagrammet ovan visar koncentrationen av ämnet A som funktion av tiden i en reaktion där A omvandlas till ämnet B i närvaro av en låg koncentration av ett enzym som katalyserar reaktionen. Enzymet tillsattes omedelbart efter tiden t₀. Vi upprepar nu försöket på samma sätt, men med den skillnaden att vi nu tillsätter 10 gånger högre koncentration av enzymet omedelbart efter tiden t₀. Ange för var och en av tidpunkterna t₀, t₁ och t₂ om [A] kommer att vara högre, lägre eller oförändrad jämfört med i diagrammet ovan. Ange också en motivation till ditt svar vid varje tidpunkt. (Max 150 ord.)";"";"![[Pasted image 20251128080420.png]] Diagrammet ovan visar koncentrationen av ämnet A som funktion av tiden i en reaktion där A omvandlas till ämnet B i närvaro av en låg koncentration av ett enzym som katalyserar reaktionen. Enzymet tillsattes omedelbart efter tiden t₀. Vi upprepar nu försöket på samma sätt, men med den skillnaden att vi nu tillsätter 10 gånger högre koncentration av enzymet omedelbart efter tiden t₀. Ange för var och en av tidpunkterna t₀, t₁ och t₂ om [A] kommer att vara högre, lägre eller oförändrad jämfört med i diagrammet ovan. Ange också en motivation till ditt svar vid varje tidpunkt. (Max 150 ord.)";"t₀ kommer att vara oförändrad. Detta pga att utgångskoncentrationen av A inte kommer att minska bara för att man adderar mer enzym. t₁ kommer vara lägre. Detta pga att enzymet katalyserar reaktionen den kommer ske mycket snabbare A kommer att bildas till B snabbare när man tillsätter mer enzym därför sänks koncentrationen av A snabbare. t₂ kommer även den att vara oförändrad eftersom man i kurvan ser att reaktionen vid den tidpunkten uppnått jämvikt (koncentrationen förändras inte). Enzymer påverkar inte jämviktskonstanten alltså vid vilket förhållande mellan koncentrationerna av A och B som reaktionshastigheten av A→B och B→A är lika. Därför kommer koncentrationen av A vid jämvikt (t₂) inte att påverkas av ökad koncentration av enzym."
"2021-12-16";"29";"pentosfosfatvägen";"Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ribulos 5-fosfat kan bildas i både den oxidativa och icke-oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. B: I röda blodkroppar är pentosfosfatvägen essentiell för att upprätthålla ett funktionellt glutation-system och därmed ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar. C: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla. D: Pentosfosfatvägens samtliga reaktioner sker i cytoplasman. Rätt svar";"";"Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ribulos 5-fosfat kan bildas i både den oxidativa och icke-oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. B: I röda blodkroppar är pentosfosfatvägen essentiell för att upprätthålla ett funktionellt glutation-system och därmed ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar. C: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla. D: Pentosfosfatvägens samtliga reaktioner sker i cytoplasman. Rätt svar";"A, B och D"
"2021-12-16";"4";"elektrontransportkedjan";"När elektroner från NADH genom transport i NADH-Q oxidoreduktas når Q sker en konformationsförändring i komplexet som tillåter protontransport över mitokondriens inre membran. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar konformationsändringen behöver ha, varför den behöver ha den egenskapen samt ge ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (Max 75 ord.)";"";"När elektroner från NADH genom transport i NADH-Q oxidoreduktas når Q sker en konformationsförändring i komplexet som tillåter protontransport över mitokondriens inre membran. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar konformationsändringen behöver ha, varför den behöver ha den egenskapen samt ge ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (Max 75 ord.)";"När Q tar upp två elektroner kommer den innan upptaget av protoner att vara negativt laddad, Q²⁻. Eftersom den är negativt laddad kommer den då att interagera med aminosyror som har en laddning (kommer ske repulsion eller attraktion), därför krävs det att aminosyran som förmedlar konformationsändringen är positivt eller negativt laddad. Ett exempel på en sådan aminosyra är arginin (Arg) som är positivt laddad vid pH runt 7."
"2021-12-16";"16";"translation";"Which basic building blocks is the ribosome made of? / Vad är ribosomen huvudsakligen uppbyggd av?";"";"Which basic building blocks is the ribosome made of? / Vad är ribosomen huvudsakligen uppbyggd av?";"It is made of rRNA and proteins. rRNA is in the center of both the large subunit and the small subunit. The proteins are more in the periphery. As described the ribosome has a large and a small subunit. In prokaryotes the small subunit is 30S and the large is 50S they together form the 70S ribosome. In eukaryotes the ribosome is a bigger, the small subunit is 40S and the bigger is 60S they form the 80S ribosome. The small subunits is where the t-RNA´s anticodon pairs with the codon on the RNA strand, in the large subunit the peptide-bond is formed."
"2021-12-16";"22";"integrering-av-metabolismen";"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (Max 120 ord.) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Ange summaformeln för de reaktioner som katalyseras av komplexet. C) En typ av reglering av komplexet är av feedforward-typ. Vad innebär feedforwardreglering, vad ger feedforwardreglering av komplexet och hur? Rita gärna.";"";"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (Max 120 ord.) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Ange summaformeln för de reaktioner som katalyseras av komplexet. C) En typ av reglering av komplexet är av feedforward-typ. Vad innebär feedforwardreglering, vad ger feedforwardreglering av komplexet och hur? Rita gärna.";"a) Eftersom att den omvandlar pyruvat till acetyl-CoA ett irreversibelt steg glukoneogenes kan ej ske (eftersom pyruvat omvandlats). b) Pyruvat + CoA + NAD⁺ → Acetyl-CoA + CO₂ + NADH + H⁺ c) PDC kommer att feedforward-stimuleras av pyruvat. Feedforwardreglering innebär att en metabolit i något steg innan det aktuella steget kommer att reglera den aktuella reaktionen. Stor mängd pyruvat det finns tillräckligt pyruvat inhiberar PD-kinas (enzym som fosforylerar och därmed inhiberar PDC) PDC är ej fosforylerat och därmed aktivt. Pyruvatet signalerar alltså att det finns tillräckligt pyruvat bättre att omvandlas till acetyl-CoA för andra användningsområden."
"2021-12-16";"32";"cellmembran";"cVilken typ av molekyler passerar lättast genom ett cellmembran? Välj ett alternativ: A: Små polära B: Laddade C: Stora polära D: Stora hydrofoba E: Små hydrofoba Rätt svar";"";"cVilken typ av molekyler passerar lättast genom ett cellmembran? Välj ett alternativ: A: Små polära B: Laddade C: Stora polära D: Stora hydrofoba E: Små hydrofoba Rätt svar";"E"
"2021-12-16";"26";"betaoxidation";"Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar. Varför sker detta? Beskriv den molekylära mekanismen.";"";"Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar. Varför sker detta? Beskriv den molekylära mekanismen.";"Bildning av ketonkroppar sker vid svält/fasta men kan även ske vid diabetes typ 1. Vid båda dessa tillstånd kommer det finnas en låg nivå av insulin i blodet. Vid svält för att glukoshalten är mycket låg vid diabetes typ 1 för att pankreas ej kan producera insulin. Levern kommer att tolka de låga nivåerna av insulin som att kroppen svälter den kommer genomföra mycket glukoneogenes för att bilda glukos för att släppa ut till kroppens vävnader. Vid glukoneogenes används oxaloacetat när levern kör glukoneogenes i högvarv kommer den därför nästan helt ta slut. Den behövs även för att slås ihop med acetyl-CoA för att kunna påbörja citronsyracykeln. Vid avsaknad av oxaloacetat kommer därav acetyl-CoA att ansamlas den kommer då att brytas ner till ketonkroppar. Dessa är vattenlösliga (till skillnad från lipider) och kan därav ta sig igenom blod-hjärnbarriären. Hjärnan kan då omvandla ketonkropparna till acetyl-CoA och använda det som energi. Hjärnan tar dock endast upp dessa vid svält (då finns ju ingen glukos i blodet) men inte vid diabetes (då är glukoshalten hög). Bildningen av ketonkroppar är alltså ett sätt att se till att hjärnan får energi vid svält. Vid svält kan andra celler bilda energi m.h.a lipider men det kan inte hjärnan eftersom dessa inte kan passera blod-hjärnbarriären. Vid svält (lågt glukos) måste därför hjärnan få energi på annat sätt än glukos. Detta sker genom bildningen av ketonkroppar."
"2021-12-16";"12";"rna-syntes";"Vid initiering av RNA-polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilket/vilka påstående(n) om denna process stämmer? Välj ett eller flera alternativ: A: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIE binder till TATA-boxen. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. Rätt svar";"";"Vid initiering av RNA-polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilket/vilka påstående(n) om denna process stämmer? Välj ett eller flera alternativ: A: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIE binder till TATA-boxen. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. Rätt svar";"D"
"2021-12-16";"27";"kolesterol";"Vilket/vilka av följande påståenden är helt korrekta avseende kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? Välj ett eller flera alternativ: A: Merparten av kroppens kolesterol härrör från födointag, ny-syntes av kroppens celler bidrar normalt i liten utsträckning. B: Kolesterol utsöndras normalt sett via levern (gallan) i form av gallsyror och, i mindre utsträckning, fritt kolesterol. C: Kroppens enda sätt att göra sig av med kolesterol är genom utsöndring via njurarna (efter konjugering till aminosyran glycin i levern). D: Kolesterolets funktioner inkluderar bl.a. att vara utgångsmaterial i syntesen av steriodhormoner.";"";"Vilket/vilka av följande påståenden är helt korrekta avseende kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? Välj ett eller flera alternativ: A: Merparten av kroppens kolesterol härrör från födointag, ny-syntes av kroppens celler bidrar normalt i liten utsträckning. B: Kolesterol utsöndras normalt sett via levern (gallan) i form av gallsyror och, i mindre utsträckning, fritt kolesterol. C: Kroppens enda sätt att göra sig av med kolesterol är genom utsöndring via njurarna (efter konjugering till aminosyran glycin i levern). D: Kolesterolets funktioner inkluderar bl.a. att vara utgångsmaterial i syntesen av steriodhormoner.";"B och D"
"2021-12-16";"13";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Describe mechanistically how an antibiotic may interfere with transcription of a bacterial genome. / Beskriv en mekanism för hur antibiotika kan störa transkription av ett bakteriellt genom.";"";"Describe mechanistically how an antibiotic may interfere with transcription of a bacterial genome. / Beskriv en mekanism för hur antibiotika kan störa transkription av ett bakteriellt genom.";"Antibiotics can work as repressors. They can bind in to the operator region of an operon and thereby inhibiting the transcription of the genes that the operon contains."
"2021-12-16";"17";"termodynamik";"The coupling of ATP synthesis to a glycolytic reaction is described below. PEP + H₂O → pyruvate + Pi (ΔG = 78 kJ/mol) ADP + Pi → ATP + H₂O (ΔG = +55 kJ/mol) PEP + ADP → pyruvate + ATP (ΔG = 23 kJ/mol) Which of the following statements is correct for the reaction ADP + Pi → ATP + H₂O? Välj ett alternativ: A: The reaction is exergonic and thermodynamically unfavorable. B: The reaction is endergonic and thermodynamically favorable. C: The reaction is endergonic and thermodynamically unfavorable. D: The reaction is exergonic and thermodynamically favorable. Rätt svar";"";"The coupling of ATP synthesis to a glycolytic reaction is described below. PEP + H₂O → pyruvate + Pi (ΔG = 78 kJ/mol) ADP + Pi → ATP + H₂O (ΔG = +55 kJ/mol) PEP + ADP → pyruvate + ATP (ΔG = 23 kJ/mol) Which of the following statements is correct for the reaction ADP + Pi → ATP + H₂O? Välj ett alternativ: A: The reaction is exergonic and thermodynamically unfavorable. B: The reaction is endergonic and thermodynamically favorable. C: The reaction is endergonic and thermodynamically unfavorable. D: The reaction is exergonic and thermodynamically favorable. Rätt svar";"D"
"2021-12-16";"23";"elektrontransportkedjan";"Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. Cytokrom C FADH₂ Fe i heme a₃ i komplex IV O₂";"";"Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. Cytokrom C FADH₂ Fe i heme a₃ i komplex IV O₂";"1. FADH₂ 2. Cytokrom C 3. Fe i heme a₃ i komplex IV 4. O₂"
"2021-12-16";"33";"transport-över-cellmembran";"Vilken/vilka av nedanstående transportörer är en antiport? Välj ett eller flera alternativ: A: Adeninnukleotidtranslokas B: CFTR (Cystisk fibros transmembrane conductance regulator) C: Na⁺/K⁺-pumpen D: GLUT4 (glukostransportör 4) Rätt svar";"";"Vilken/vilka av nedanstående transportörer är en antiport? Välj ett eller flera alternativ: A: Adeninnukleotidtranslokas B: CFTR (Cystisk fibros transmembrane conductance regulator) C: Na⁺/K⁺-pumpen D: GLUT4 (glukostransportör 4) Rätt svar";"A och C"
"2021-12-16";"24";"glukosmetabolism";"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande intermediärer: alfaketoglutarat, 3-fosfoglycerat, glyceraldehyd 3-fosfat, oxalacetat? 3-fosfoglycerat alfaketoglutarat glyceraldehyd 3-fosfat oxalacetat (Drag-och-släpp-fråga)";"";"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande intermediärer: alfaketoglutarat, 3-fosfoglycerat, glyceraldehyd 3-fosfat, oxalacetat? 3-fosfoglycerat alfaketoglutarat glyceraldehyd 3-fosfat oxalacetat (Drag-och-släpp-fråga)";"1. glyceraldehyd 3-fosfat 2. 3-fosfoglycerat 3. alfaketoglutarat 4. oxalacetat"
"2021-12-16";"10";"dna-replikation";"Fråga 10 Vilket/vilka av följande alternativ om DNA-replikation är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA-replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Opoisomeraser kan förändra ”linking number” hos DNA. D: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”.";"";"Fråga 10 Vilket/vilka av följande alternativ om DNA-replikation är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA-replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Opoisomeraser kan förändra ”linking number” hos DNA. D: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”.";"A & B"
"2021-12-16";"9";"dna-replikation";"Vid eukaryot DNA-replikation så spelar CMG-helikaset en viktig roll. Detta helikas består av tre delar: MCM, Gins och Cdc45. (Max 50 ord.) a. I vilken fas av cellcykeln binder MCM till replikations-origin? b. I vilken fas av cellcykeln binder Gins och Cdc45 till MCM? c. Varför är det viktigt att separera laddningen av MCM-helikaset från dess aktivering med hjälp av Gins och Cdc45?";"";"Vid eukaryot DNA-replikation så spelar CMG-helikaset en viktig roll. Detta helikas består av tre delar: MCM, Gins och Cdc45. (Max 50 ord.) a. I vilken fas av cellcykeln binder MCM till replikations-origin? b. I vilken fas av cellcykeln binder Gins och Cdc45 till MCM? c. Varför är det viktigt att separera laddningen av MCM-helikaset från dess aktivering med hjälp av Gins och Cdc45?";"a) I G1-fasen binder MCM m.h.a. ORC och laddningsfaktorerna Cdc6 och Cdt1. b) Ökad nivå av CDK (kinaser) bidrar till att binda Gins och Cdc45 i S-fasen. c) För att försäkra att replikationen bara sker en gång per cellcykel. Därför är nivåerna av CDK låga i G1 och stiger i S."
"2021-12-16";"34";"plasmid";"Plasmid DNA purified from colonies grown on blue/white screening plates was verified by electrophoresis. Samples in Lanes C and D are digested by enzyme for verification whilst Lanes A and B are non-digested samples. Select the correct description/descriptions based on the gel picture below. ![[Pasted image 20251128080404.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: The band in Lane A that migrates the furthest is in supercoiled form and we can predict its size by a comparison with the size markers. B: The sample in Lane C has the largest size of DNA because it displays the brightest intensity under UV light. C: By comparing Lanes C and D, we can infer that the sample in Lane D is a plasmid with an insert DNA whilst Lane C is an empty vector. D: By comparing Lanes A and B, we can infer that the sample in Lane B is a plasmid with an insert DNA whilst Lane A is an empty vector.";"";"Plasmid DNA purified from colonies grown on blue/white screening plates was verified by electrophoresis. Samples in Lanes C and D are digested by enzyme for verification whilst Lanes A and B are non-digested samples. Select the correct description/descriptions based on the gel picture below. ![[Pasted image 20251128080404.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: The band in Lane A that migrates the furthest is in supercoiled form and we can predict its size by a comparison with the size markers. B: The sample in Lane C has the largest size of DNA because it displays the brightest intensity under UV light. C: By comparing Lanes C and D, we can infer that the sample in Lane D is a plasmid with an insert DNA whilst Lane C is an empty vector. D: By comparing Lanes A and B, we can infer that the sample in Lane B is a plasmid with an insert DNA whilst Lane A is an empty vector.";"Rätt svar 1. C 2. D (Flersvarsfråga; i originalbilden är första påståendet felmarkerat, de två sista rättmarkerade.)"
"2021-12-16";"14";"rekombinant-dna-teknik";"Which of the following is/are true about bacterial transformation? / Vilket/vilka av nedanstående stämmer för bakteriell transformation? Välj ett eller flera alternativ: A: Competence is not required for all bacterial species. / Kompetens är inte nödvändigt för alla bakteriearter. B: The DNA is typically fragmented at the bacteriums surface. / DNA fragmenteras vanligtvis vid bakteriens yta. C: Transformation may be general or specialized. / Transformation kan vara generell eller specialiserad. D: The DNA may or may not need to integrate into the host genome. / DNA måste inte alltid integreras i värdens genom.";"";"Which of the following is/are true about bacterial transformation? / Vilket/vilka av nedanstående stämmer för bakteriell transformation? Välj ett eller flera alternativ: A: Competence is not required for all bacterial species. / Kompetens är inte nödvändigt för alla bakteriearter. B: The DNA is typically fragmented at the bacteriums surface. / DNA fragmenteras vanligtvis vid bakteriens yta. C: Transformation may be general or specialized. / Transformation kan vara generell eller specialiserad. D: The DNA may or may not need to integrate into the host genome. / DNA måste inte alltid integreras i värdens genom.";"B och D"
"2021-12-16";"20";"glykolysen";"Ge ett exempel på och förklara mekanismen bakom en förändring i metabolismen som sker vid högintensivt muskelarbete för att vi ska bli bättre på att utföra anaerob glykolys framöver. (Max 120 ord.)";"";"Ge ett exempel på och förklara mekanismen bakom en förändring i metabolismen som sker vid högintensivt muskelarbete för att vi ska bli bättre på att utföra anaerob glykolys framöver. (Max 120 ord.)";"Högintensivt muskelarbete kommer leda till syrebrist, när detta sker kommer transkriptionsfaktorn HIF-1 att aktiveras. Den kommer att stimulera ökad produktion av glukostransportörer, enzymer i glykolysen och även aktivera VEGF. VEGF ökar vaskulariseringen av vävnaden mer blodkärl. Detta gör att musklerna kommer i kontakt med fler blodkärl och därmed mer glukos. Den ökade mängden glukostransportörer gör att cellerna kan ta upp glukos i större mängder när det behövs. Ökad mängd enzymer i glykolysen gör att musklerna kan ta hand om glukoset och omvandla det till energi i större utsträckning när det behövs. Vid anaeroba förhållanden kan musklerna bara använda sig av glykolys genom HIF-1 blir de bättre på att ta upp glukos och bättre på att utnyttja den."
"2021-12-16";"30";"nukleotidnedbrytning";"Vilket/vilket av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Xantinoxidas är ett viktigt enzym involverat i nedbrydning av purin-nukleotider. B: Delar av pyrimidinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Bindningen mellan nukleosiders sockerstruktur och kvävebas klyvs genom hydrolys när nukleosider bryts ned. D: Urinsyra (urat) innehåller merparten av de kväveatomer som ingår i purinbaser. Rätt svar";"";"Vilket/vilket av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Xantinoxidas är ett viktigt enzym involverat i nedbrydning av purin-nukleotider. B: Delar av pyrimidinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Bindningen mellan nukleosiders sockerstruktur och kvävebas klyvs genom hydrolys när nukleosider bryts ned. D: Urinsyra (urat) innehåller merparten av de kväveatomer som ingår i purinbaser. Rätt svar";"A, B och D"
"2021-12-16";"15";"dna-replikation";"In order for the lagging strand to become one single continuous strand, the Okazaki fragments (OF) must undergo a maturation process. / För att den släpande strängen ska bli en kontinuerlig sträng behöver Okazakifragment genomgå en mognadsprocess. A) Which two enzymes are involved in bacterial OF maturation? B) Briefly describe their specific functions in the process.";"";"In order for the lagging strand to become one single continuous strand, the Okazaki fragments (OF) must undergo a maturation process. / För att den släpande strängen ska bli en kontinuerlig sträng behöver Okazakifragment genomgå en mognadsprocess. A) Which two enzymes are involved in bacterial OF maturation? B) Briefly describe their specific functions in the process.";"a) Polymeras 1 och DNA-ligas. b) Polymeras 1 har en 5-3-exonukleas-aktivitet, den kommer att bryta upp RNA-primerna på Okazakifragmenten i 5-3-riktning. Den kommer också byta ut RNAt mot korresponderande DNA. För att detta ska ske korrekt har den även en 3-5-exonukleas-aktivitet som kan bryta fosfodiesterbindningar om fel nukleotid sätts på. Ligaset kommer att reparera ""nicks"", alltså små mellanrum som kommer finnas mellan det nysyntetiserade DNAt som tagit primerns plats och det ""äldre"" DNAt. Detta gör ligaset genom att skapa en fosfodiesterbindning mellan nukleotiderna, detta sker med hjälp av ATP."
"2021-12-16";"21";"integrering-av-metabolismen";"Förklara varför utbytet av ATP från en glukos som genomgår aerob katabolism inte alltid blir detsamma. (Max 120 ord.)";"";"Förklara varför utbytet av ATP från en glukos som genomgår aerob katabolism inte alltid blir detsamma. (Max 120 ord.)";"Hur mycket ATP man får beror på vilken transportör som används för intaget av de 2 NADH till mitokondrien som tillverkats vid glykolys. Om glycerol-3-fosfatshunten används, där kommer NADH genom ett mellansteg donera sina elektroner till FAD som befinner sig i komplex 2 i elektrontransportkedjan. Därav kommer 2 st NADH inte att donera några elektroner till komplex 1 vilket skulle ha resulterat i utpumpandet av 2×4 väten som i sin tur skulle resulterat två mer ATP genererade. Om istället malat-aspartatshunten användas kommer inte två ATP att förloras. Där kommer NADH reducera oxaloacetat till malat → transporteras in i mitokondrien → omvända reaktionen sker → NAD⁺ i mitokondrien blir NADH → donerar elektroner till komplex 1 → inga protoner ""tappas"", två ""extra"" ATP."
"2021-12-16";"31";"heme";"Beskriv översiktligt hur heme bryts ner och utsöndras.";"";"Beskriv översiktligt hur heme bryts ner och utsöndras.";"Heme kommer först att bilda biliverdin sedan bildas bilirubin sedan bildas bilrubin. Bilirubin är en hydrofob molekul kan inte transporteras fritt i blodet därför kommer den i levern att konjugeras med två stycken syror, glukaronsyror bilrubin bildas som är amfipatisk och en mer vattenlöslig molekyl. Den kommer därmed att utsöndras genom gallan i levern → transporteras till tunntarmen → utsöndras slutligen i avföringen."
"2021-12-16";"25";"glykogen";"Vilken är den huvudsakliga funktionen av glykogen i levern respektive skelettmuskulaturen? Ange även den huvudsakliga orsaken till denna skillnad samt vilken slutprodukt som bildas vid fullständig glykogenolys i respektive vävnad.";"";"Vilken är den huvudsakliga funktionen av glykogen i levern respektive skelettmuskulaturen? Ange även den huvudsakliga orsaken till denna skillnad samt vilken slutprodukt som bildas vid fullständig glykogenolys i respektive vävnad.";"Glykogen i levern fungerar som en glukosreserv för blodet man vill kunna sänka blodglukosen om den är för hög glykogen bildas och kunna höja den om den är för låg glykogen bryts ner glukos släpps ut i blodet. I muskler fungerar glykogen som en glukosreserv för muskeln själv. Om det behövs ATP pga muskelarbete kommer glykogen att brytas ned och gå in i glykolysen. Anledningen till att bara levern kan skicka ut glukos till blodet är för att den har enzymet glukos-6-fosfatas i ER. Vid nedbrytning av glykogen kommer glukos-1-fosfat bildas → sedan isomeriseras detta m.h.a. fosfoglukosmutas (sker i både muskler och lever) till glukos-6-fosfat. Detta är den slutgiltiga produkt som bildas i glykogenolys i muskler → den kan gå in i glykolys eller andra metabola vägar. Glukos-6-fosfat kan dock inte transporteras ut ur cellerna. För att göra detta måste den omvandlas till glukos. Det är vad glukos-6-fosfatas-enzymet gör, den tar bort fosfatgruppen med hjälp av hydrolys. Då kan glukos släppas ut i blodet och transporteras till andra vävnader. Glukos är alltså slutprodukten i lever. Sammanfattat är alltså anledningen till varför glykogen har olika funktioner i muskler och lever för att lever innehåller enzymet glukos-6-fosfatas medan muskler inte innehåller detta enzym. Detta enzym möjliggör att glukos kan släppas ut i blodet och inte endast användas i den egna cellen."
"2021-12-16";"11";"kromatin";"Beskriv nukleosomens uppbyggnad (Nucleosome core particle). Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade.";"";"Beskriv nukleosomens uppbyggnad (Nucleosome core particle). Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade.";"Nukleosomen består av histon-proteiner och DNA-helix. I mitten av nukleosomen finns två kopior av histonproteinerna H2A, H2B, H3 och H4. Detta bildar alltså en oktamer. Sedan lindas DNA runt histonerna ungefär 1,75 varv, ca 100200 baspar långt. Sedan sätter sig en till histon, H1, utanpå DNA-strängen och oktameren för att stabilisera och motverka att strukturen lindas upp. Mellan två histoner kommer det finnas en fri bit av DNA som kallas linker-DNA."
"2021-12-16";"8";"utforska-proteiner";"Du har fått i uppgift att analysera proteiner i en lösning med hjälp av SDS-PAGE. (Max 150 ord) A) Förklara principen för metoden. B) Vad fyller SDS för funktion? C) Vilken egenskap hos proteinet används för separation?";"";"Du har fått i uppgift att analysera proteiner i en lösning med hjälp av SDS-PAGE. (Max 150 ord) A) Förklara principen för metoden. B) Vad fyller SDS för funktion? C) Vilken egenskap hos proteinet används för separation?";"A) Principen med SDS-PAGE är att man vill analysera proteiner avseende massa. Man använder först en molekyl som heter SDS, en negativt laddad molekyl som binder till proteiner. Ju större massa proteinet har desto större mängd SDS-molekyler binder resulterar i en större negativ laddning (jämfört med mindre proteiner). Sedan låter man dessa proteiner vandra genom en polyakrylamid-gel från en negativ elektrod till en positiv elektrod. Ju större negativ laddning desto större motstånd i gelen. Detta leder till att små proteiner vandrar längst och stora kortast. Då får man alltså en separation i gelen avseende storlek. B) SDS som beskrivet är en negativ molekyl som binder till protein funktionen är att skapa en laddningsskillnad mellan proteiner som korresponderar till storleken. C) Det är proteinernas massa som används för separation."
"2021-12-16";"35";"introduktionslaboration";"Du sätter upp en studie för att avgöra om människor som migrerar löper en ökad risk att utveckla schizofreni jämfört med icke-migranter. Din nollhypotes är således följande: ”Risken att utveckla schizofreni är densamma bland migranter och icke-migranter”. Du genomför studien, sammanställer resultaten och utför ett statistiskt test för att avgöra om den eventuella skillnaden är statistiskt signifikant. När kan du förkasta nollhypotesen med viss säkerhet? Välj ett alternativ: A: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. B: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. C: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0. D: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0.";"";"Du sätter upp en studie för att avgöra om människor som migrerar löper en ökad risk att utveckla schizofreni jämfört med icke-migranter. Din nollhypotes är således följande: ”Risken att utveckla schizofreni är densamma bland migranter och icke-migranter”. Du genomför studien, sammanställer resultaten och utför ett statistiskt test för att avgöra om den eventuella skillnaden är statistiskt signifikant. När kan du förkasta nollhypotesen med viss säkerhet? Välj ett alternativ: A: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. B: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. C: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0. D: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0.";"C"
"2021-12-16";"3";"från-aminosyror-till-proteiner";"Rita en dipeptid bestående av de två (olika) aminosyror från vars sidokedjor det inte går att bilda glukos. Dipeptiden befinner sig i en lösning med pH-värde 2. Ange vilka aminosyrorna är.";"";"Rita en dipeptid bestående av de två (olika) aminosyror från vars sidokedjor det inte går att bilda glukos. Dipeptiden befinner sig i en lösning med pH-värde 2. Ange vilka aminosyrorna är.";"![[Pasted image 20251128074813.png]] Ska stå Lysin, inte Lycin."
"2021-12-16";"7";"evolution";"Briefly describe the RNA world hypothesis with an example. / Beskriv kortfattat RNA-världs-hypotesen genom ett exempel. (Max 100 words.)";"";"Briefly describe the RNA world hypothesis with an example. / Beskriv kortfattat RNA-världs-hypotesen genom ett exempel. (Max 100 words.)";"The RNA world hypothesis describes how living things has gone from using only RNA as storage of genetic material and catalyzing chemical processes (ribozymes) to being close to solely depending on proteins to catalyze many important chemical processes. One example is the enzyme RNAse P which function is cleave the 5´ end of tRNA-molecules. In bacteria the enzyme consits of almost only RNA and very little proteins (which are not even essentiall to the function). In archea there is less RNA and more protein, and in eukaryotes proteins make up the largest part of the enzyme. This is aligned with the hypothesis."
"2021-12-16";"6";"hemoglobin";"Vilken/vilka av nedanstående faktorer leder till att hemoglobinets syrebindande förmåga minskar? Välj ett eller flera alternativ: A: Hög koncentration 2,3-BPG. B: Högt pH. C: Hög koncentration O₂. D: Hög koncentration CO₂.";"";"Vilken/vilka av nedanstående faktorer leder till att hemoglobinets syrebindande förmåga minskar? Välj ett eller flera alternativ: A: Hög koncentration 2,3-BPG. B: Högt pH. C: Hög koncentration O₂. D: Hög koncentration CO₂.";"A och D"
"2021-12-16";"2";"lipider";"Ange en skillnad mellan mättade och omättade fettsyror avseende struktur och en skillnad avseende inverkan på fluiditeten hos cellens membran.";"";"Ange en skillnad mellan mättade och omättade fettsyror avseende struktur och en skillnad avseende inverkan på fluiditeten hos cellens membran.";"Mättade fettsyror har inga dubbelbindningar därav är deras fettsyrekedjor raka strukturer. Omättade fettsyror har däremot en eller flera dubbelbindningar detta leder till en böjning i strukturen där dubbelbindningen sitter fettsyrorna blir inte helt raka strukturer utan böjda på olika sätt beroende på vart dubbelbindningarna sitter och om de har trans eller cis-konfiguration. Eftersom att de mättade fettsyrorna har raka fettsyrasvansar kan dessa packas mycket tätt fluiditeten i membranet minskar. Däremot kan de omättade fettsvansarna inte packas lika tätt på grund av att de inte är raka strukturer fluiditeten i membranet ökar."
"2023-12-18";"28";"heme";"Vilka två påståenden om heme är korrekta? (2p) A: Succinyl-CoA och glycin används vid hemesyntesen. B: Trypsin innehåller heme. C: Hememolekylen innehåller en magnesiumjon. D: Cytokrom C innehåller heme.";"";"Vilka två påståenden om heme är korrekta? (2p) A: Succinyl-CoA och glycin används vid hemesyntesen. B: Trypsin innehåller heme. C: Hememolekylen innehåller en magnesiumjon. D: Cytokrom C innehåller heme.";"A och D"
"2023-12-18";"5";"utforska-proteiner";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein baserat på laddning. (4p) (Max 200 ord) A) Beskriv vilken metod du skulle använda dig av och hur denna fungerar. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en förklaring till hur denna fungerar.";"";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein baserat på laddning. (4p) (Max 200 ord) A) Beskriv vilken metod du skulle använda dig av och hur denna fungerar. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en förklaring till hur denna fungerar.";"a) Jonbyteskromotografi. Efter att ha lösgjört proteinerna i homogenisat går reningsmetoden ut på att man för proteinlösningen genom en kolonn som innehåller kulor som antingen är positivt eller negativt laddade beroende på proteinets laddning som man vill ha ut. En katjonsbytare är negativt laddade kulor i kolonnen som kommer att attrahera positivt laddade proteiner från fasen man för igenom medan en anjonbytare däremot är positivt laddade kulor som kommer att attrahera negativt laddade proteiner. Det är proteinets totala laddning som selekteras. Sedan kan en buffert eller salt användas för att eluera proteinerna från de laddade kulorna i kolonnen för vidare analys. b) För att analysera storleken hade jag valt SDS page som är en elektrofores-metod där man först blandar i ämnet SDS (sodum dodecyl sulfate) som är negativt laddade molekyler som kommer att binda till aminosyrorna och slå ut proteinets tidigare laddning. Proteinetet kommer att binda SDS baserat på hur stort det är, ju större protein desto mer negativt laddat då fler aminosyror laddas av SDS och proteinerna får vandra i ett elektriskt fält där de minsta vandrar längst mot positiv pol då de hindras minst av de steriska hindrena i polyakrylamid-gelen. Separation map STORLEK"
"2023-12-18";"18";"termodynamik";"Redogör för begreppet entalpi samt för hur den kan användas för att förutse tendensen för att en viss biokemisk reaktion att ske. (4p)";"";"Redogör för begreppet entalpi samt för hur den kan användas för att förutse tendensen för att en viss biokemisk reaktion att ske. (4p)";"Entalpi (H) betyder energiinnehållet i en reaktion. Entalpi beror på bindningar som finns i de ämnen som är delaktiga i reaktionen och vilken art bindningarna har. I en exoterm reaktion kommer energiinnehållet minska eftersom energi släpps ut. Om ΔH är negativ för en reaktion är den exoterm och kan därmed ses som fördelaktig. När energi, t.ex. i form av värme, släpps ut till omgivningen kan det öka entropin i molekyler som finns runtom, vilket är fördelaktigt enligt termodynamikens andra lag. (Om temperaturen och trycket är konstant kan H tillsammans med systemets parametrar användas för att beräkna den fria energin. ΔG = ΔH TΔS. Om ΔG är negativ är reaktionen spontan och benägen att ske.)"
"2023-12-18";"1";"kemiska-bindingar";"I celler är vatten lösningsmedel. Förklara ur bindningssynpunkt varför detta är fördelaktigt. (4p) (Max 100 ord.)";"";"I celler är vatten lösningsmedel. Förklara ur bindningssynpunkt varför detta är fördelaktigt. (4p) (Max 100 ord.)";"Vatten är en polär molekyl och har en dipol eftersom syret är mer elektronegativt än de två vätena. Polariteten gör att vattenmolekyler kan interagera med både positivt laddade molekyler och negativa laddade molekyler som finns i celler. Vid interaktioner med positivt laddade joner kommer den mer elektronegativa syret interagera med jonerna. I interaktioner med negativt laddade joner kommer istället väterna interagera. Vatten kan således bilda hydratiseringsskal runt joner som är essentiella för cellfunktion. Vatten har hög dielektricitetskonstant som gör att alltför starka jonbindningar inte bildas till ämnen, så att joner kan fortfarande utnyttjas i cellulära processer vid behov."
"2023-12-18";"19";"enzymer";"Två fördelar med att mäta den initiala hastigheten för en reaktion, V₀, är att i början av en reaktion … (2p) A: kan produktinhibering inte påverka hastigheten. B: är förändringar i [S] försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. C: har variationer av [S] inte någon effekt på V₀. D: är förändringar i Kₘ försumbara, så Kₘ kan behandlas som en konstant.";"";"Två fördelar med att mäta den initiala hastigheten för en reaktion, V₀, är att i början av en reaktion … (2p) A: kan produktinhibering inte påverka hastigheten. B: är förändringar i [S] försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. C: har variationer av [S] inte någon effekt på V₀. D: är förändringar i Kₘ försumbara, så Kₘ kan behandlas som en konstant.";"A och B"
"2023-12-18";"29";"elektrontransportkedjan";"Redogör för hur ATP-syntaset fungerar. (4p) (Max 150 ord.)";"";"Redogör för hur ATP-syntaset fungerar. (4p) (Max 150 ord.)";"ATP-syntaset utnyttjar protongradienten som bildades i elektrontransportkedjan. Dess F₀-del finns i mitokondriens inre membran och har en a-subenhet som innehåller två hydrofila halvkanaler: mot mellanmembranutrymmet (MMU) respektive matrix. a-subenheten interagerar med en c-subenhet (som finns i en ring) som har en negativt laddad aspartat- eller glutamatrest. En proton kan komma in i halvkanalen mot MMU och interagera med aminosyraresten i c-subenheten. Neutralisering gör att c-subenheten roterar en enhet medsols. Därmed kan en proton komma in mot halvkanalen mot matrix och frisättas i matrix. F₀ är kopplad till F₁-delen i matrix via en γ-stjälk. F₁ har 3 alfa- och 3 betasubenheter i en ring. Betasubenheterna bildar ATP och antar tre konformationer: Loose (där ADP + Pi binder), Tight (där ATP bildas) och Open (där ATP frisläpps och en ny ADP + Pi kan binda in). Den roterande γ-stjälken kan leda till konformationsändringarna i betasubenheterna. 3 ATP bildas per varv."
"2023-12-18";"4";"hemoglobin";"What does cooperative binding mean? Explain this in the context of hemoglobin. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max 100 words)";"";"What does cooperative binding mean? Explain this in the context of hemoglobin. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max 100 words)";"Cooperative binding means that the binding of an oxygen to hemoglobin makes it more likely for the molecule to bind more oxygen. This is because when an oxygen binds to hemoglobin the structure becomes less tense as one αβ-dimer rotates 15 degrees, which increases its affinity for oxygen at other binding sites. Release of an oxygen promotes also further release. Due to the cooperativity hemoglobin has a sigmoidal binding curve at different partial pressures of oxygen. Cooperativity enables hemoglobin to be a good oxygen transporter."
"2023-12-18";"16";"cellmembran";"Vad är en hydropatiplot och vad ger den information om? (4p)";"";"Vad är en hydropatiplot och vad ger den information om? (4p)";"En hydropatiplot kan ge information om det är sannolikt att en viss sekvens är en transmembran alfahelix och hur många alfahelixar det kan motsvara. En hydropatiplot kan skapas genom att undersöka en aminosyrasekvens från N- till C-terminal i intervaller om 20 (aminosyra 120, 221, 322 osv.). Detta beror på att det krävs 20 aminosyror för att gå genom cellmembranet. Man tittar på den energimässiga kostnaden för att flytta respektive aminosyra från en hydrofob till hydrofil miljö. Värdena plottas i en graf där energinivån är på y-axeln och intervallerna är på x-axeln. Man sätter gränsvärdet på 84 kJ/mol (kommer från transmembrana alfahelixar med känd struktur). Om en graf går över gränsvärdet en gång är det sannolikt en transmembran alfahelix. Om den går ovanför gränsvärdet flera gånger tyder det på flera transmembrana alfahelixar."
"2023-12-18";"22";"glykolysen";"I glykolysen finns två reaktioner där ATP förbrukas och två reaktioner där ATP bildas. A) Vilka enzymer katalyserar dessa reaktioner? B) Förklara hur glykolysen trots detta ger ett nettoutbyte av två ATP. (4p) (Max 50 ord)";"";"I glykolysen finns två reaktioner där ATP förbrukas och två reaktioner där ATP bildas. A) Vilka enzymer katalyserar dessa reaktioner? B) Förklara hur glykolysen trots detta ger ett nettoutbyte av två ATP. (4p) (Max 50 ord)";"A) Hexokinas (glukokinas) katalyserar första förbrukningen av ATP och fosfofruktokinas 1 katalyserar andra. Fosfoglyceratkinas katalyserar bildning av första ATP och pyruvatkinas katalyserar bildning av. B) Vid spjälning av fruktos 1,6 - bisfosfatas bildas två 3-kolsenheter, dihydroxyacetonfosfat och glyceraldehyd 3 fosfat. Dihydroxyacetonfosfat kommer bilda glyceraldehyd3fosfat och därmed går 2 glyceraldehyd3fosfat igenom"
"2023-12-18";"32";"nukleotidnedbrytning";"Nämn det fullständiga namnet på en purin-nukleotid och ange i vilken molekyl kolskelettet respektive huvuddelen av molekylens kväveatomer slutligen hamnar då nukleotiden bryts ned. (2p) (Max 50 ord)";"";"Nämn det fullständiga namnet på en purin-nukleotid och ange i vilken molekyl kolskelettet respektive huvuddelen av molekylens kväveatomer slutligen hamnar då nukleotiden bryts ned. (2p) (Max 50 ord)";"Adenosinmonofosfat (AMP). Kolskelettet samt huvuddelen av kvävet hamnar i urat."
"2023-12-18";"26";"integrering-av-metabolismen";"I aerob katabolism kommer glukos att omvandlas i ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande metaboliter? (2p) 2-fosfoglycerat Alfaketoglutarat Glyceraldehyd 3-fosfat Malat";"";"I aerob katabolism kommer glukos att omvandlas i ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande metaboliter? (2p) 2-fosfoglycerat Alfaketoglutarat Glyceraldehyd 3-fosfat Malat";"1. glyceraldehyd 3-fosfat 2. 2-fosfoglycerat 3. Alfaketoglutarat 4. Malat"
"2023-12-18";"12";"rna-syntes";"Hur kan en mutation i ett icke-kodande intron ge upphov till sjukdom, t.ex. talassemi? (4p)";"";"Hur kan en mutation i ett icke-kodande intron ge upphov till sjukdom, t.ex. talassemi? (4p)";"En mutation, t.ex. en punktmutation, kan leda till att en ny splice site bildas i mitten av en intron. När ett primärt mRNA senare ska genomgå splicing kan det nya splice-sitet leda till att en del av intronet blir kvar. Intronet kan t.ex. leda till att andra kodon finns kvar eller att stoppkodon blir kvar som leder till att felaktig genprodukt bildas när mRNA senare translateras. Detta kan i sin tur leda till proteiner som har defekter och inte kan utföra normal funktion."
"2023-12-18";"36";"plasmid";"You amplified a gene of interest using the blue/white screening method. You extracted plasmids from two bacterial colonies (one blue colony and one white colony), then performed restriction enzyme digestion and ran the samples on a gel as follows: blue uncut, blue cut, white uncut, white cut (see gel below). When imaging the gel, however, you notice there is a faint band in the blue cut sample (see arrow), which should not be there. Explain why the faint band should not be present in that sample and what are the possible sources of error for this outcome? Refer to the size/number of bands in comparison to the bands in the other lanes for your explanation. This questions needs to be answered in English. (4p) ![[Pasted image 20251129235214.png]]";"";"You amplified a gene of interest using the blue/white screening method. You extracted plasmids from two bacterial colonies (one blue colony and one white colony), then performed restriction enzyme digestion and ran the samples on a gel as follows: blue uncut, blue cut, white uncut, white cut (see gel below). When imaging the gel, however, you notice there is a faint band in the blue cut sample (see arrow), which should not be there. Explain why the faint band should not be present in that sample and what are the possible sources of error for this outcome? Refer to the size/number of bands in comparison to the bands in the other lanes for your explanation. This questions needs to be answered in English. (4p) ![[Pasted image 20251129235214.png]]";"The blue samples are samples with no DNA-insert. They have an intact lacZ-gene and are able to produce β-galactosidase which breaks down X-gal to a blue pigment. Since the blue colony samples have no DNA insert, the blue sample should show one band on the gel electrophoresis. The reason that the blue cut shows two bands can be because a mixed colony was chosen, meaning one that also had white colonies. This could likely be the case because the second band has a 1500 bp size which the second band of the ""white cut"" also has. Another possible reason for this odd result is contamination. The ""blue cut"" sample could possibly have been contaminated with white cut samples when pipetting or by improper labelling of tubes. This could be the case as the samples in both lanes show similar sizes (even the larger band is approximately the same size in both, 3000 bp)."
"2023-12-18";"27";"betaoxidation";"Vilka två effekter har insulin på fettmetabolismen? (2p) A: Inhiberar acetyl-CoA-karboxylas. B: Inhiberar syntes av fettsyror. C: Aktiverar acetyl-CoA-karboxylas. D: Aktiverar syntes av fettsyror.";"";"Vilka två effekter har insulin på fettmetabolismen? (2p) A: Inhiberar acetyl-CoA-karboxylas. B: Inhiberar syntes av fettsyror. C: Aktiverar acetyl-CoA-karboxylas. D: Aktiverar syntes av fettsyror.";"C och D"
"2023-12-18";"13";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Vilka två påståenden stämmer om trp-operonet? (2p) A: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att bryta ner aminosyran tryptofan. B: När det inte finns tryptofan i omgivningen, binder tryptofan-repressorn till operatorsekvensen i trp-operonet. C: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att syntetisera aminosyran tryptofan. D: Trp-repressorn kan blockera bindning av RNA-polymeras till promotorn.";"";"Vilka två påståenden stämmer om trp-operonet? (2p) A: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att bryta ner aminosyran tryptofan. B: När det inte finns tryptofan i omgivningen, binder tryptofan-repressorn till operatorsekvensen i trp-operonet. C: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att syntetisera aminosyran tryptofan. D: Trp-repressorn kan blockera bindning av RNA-polymeras till promotorn.";"C och D"
"2023-12-18";"17";"transport-över-cellmembran";"Vilka två påståenden om glukostransportörer är korrekta? (2p) A: De utför aktiv transport. B: De faciliterar diffusion. C: De är bärarproteiner. D: De kan enbart transportera glukos i en riktning.";"";"Vilka två påståenden om glukostransportörer är korrekta? (2p) A: De utför aktiv transport. B: De faciliterar diffusion. C: De är bärarproteiner. D: De kan enbart transportera glukos i en riktning.";"B och C"
"2023-12-18";"23";"";"Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för flera enzymer. A) Vilka är enzymerna och hur påverkas deras aktivitet av fruktos 2,6-bisfosfat inbindning? B) Vad reglerar hur mycket fruktos 2,6-bisfosfat som bildas? (4p) (Max 75 ord.)";"";"Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för flera enzymer. A) Vilka är enzymerna och hur påverkas deras aktivitet av fruktos 2,6-bisfosfat inbindning? B) Vad reglerar hur mycket fruktos 2,6-bisfosfat som bildas? (4p) (Max 75 ord.)";"A) Fosfofruktokinas i glykolys aktiveras. Fruktos-1,6-bisfosfatas i glukoneogenes inhiberas. B) Fruktos 2,6-bisfosfat (F-2,6-BP) bildas av fosfofruktokinas 2 som ingår i ett bifunktionellt enzym med fruktos-2,6-bisfosfatas. Om insulin finns stimulerar det fosfoproteinfosfatas som defosforylerar och aktiverar fosfofruktokinas 2 vilket leder till ökad F-2,6-BP-produktion. Däremot, om glukagon finns, ger det upphov till cAMP-bildning som aktiverar proteinkinas A som fosforylerar fosfofruktokinas 2, som därmed inhiberar produktionen av fruktos-2,6-bisfosfat."
"2023-12-18";"33";"pentosfosfatvägen";"En fullt funktionell pentosfosfatväg är viktig för röda blodkroppars skydd mot väteperoxid. Varför? (2p) (Max 50 ord)";"";"En fullt funktionell pentosfosfatväg är viktig för röda blodkroppars skydd mot väteperoxid. Varför? (2p) (Max 50 ord)";"När glutationperoxidas tar hand om väteperoxid oxideras glutation. För att skyddet ska fortsätta finnas mot väteperoxid måste den reducerade formen av glutation återbildas med reduktionsmedlet NADPH. I röda blodkroppar saknas mitokondrier och NADPH kan endast bildas genom pentosfosfatvägen. Därför är en funktionell pentosfosfatväg viktig."
"2023-12-18";"24";"glykogen";"Vilka två av följande påståenden om glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Glykogen är kovalent bundet till enzymet glykogenin. B: Höga intracellulära nivåer av glukos-6-fosfat stimulerar glykogenolys i skelettmuskel. C: Skelettmuskel kan använda sig av glykogen som energikälla vid anaerobt arbete. D: Glykogenolys sker i huvudsak via så kallad hydrolys.";"";"Vilka två av följande påståenden om glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Glykogen är kovalent bundet till enzymet glykogenin. B: Höga intracellulära nivåer av glukos-6-fosfat stimulerar glykogenolys i skelettmuskel. C: Skelettmuskel kan använda sig av glykogen som energikälla vid anaerobt arbete. D: Glykogenolys sker i huvudsak via så kallad hydrolys.";"A och C"
"2023-12-18";"10";"dna-replikation";"På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. Fyra olika replikationsfaktorer är markerade på denna bild. Vad heter de olika faktorerna vid pil a, b, c och d? (4p) ![[Pasted image 20251129235154.png]]";"";"På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. Fyra olika replikationsfaktorer är markerade på denna bild. Vad heter de olika faktorerna vid pil a, b, c och d? (4p) ![[Pasted image 20251129235154.png]]";"a) CMG-helikas b) PCNA c) Replication protein A d) DNA-polymeras δ"
"2023-12-18";"9";"kromatin";"Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: En nukleosom innehåller 8 proteiner. B: Acetylering kan neutralisera positiva laddningar i histonsvansar. C: Med epigenetisk reglering menas reglering av genuttryck som endast beror av den nedärvda DNA-sekvensen. D: I en nukleosom lindas DNA 2,75 varv runt ett proteinkomplex.";"";"Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: En nukleosom innehåller 8 proteiner. B: Acetylering kan neutralisera positiva laddningar i histonsvansar. C: Med epigenetisk reglering menas reglering av genuttryck som endast beror av den nedärvda DNA-sekvensen. D: I en nukleosom lindas DNA 2,75 varv runt ett proteinkomplex.";"A och B"
"2023-12-18";"34";"kolesterol";"3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA reduktas (HMG-CoA-reduktas) har en nyckelroll i reglering av cellernas kolesterolsyntes. Beskriv hur detta enzym regleras på transkriptionell nivå; den viktigaste reglermekanismen. (4p)";"";"3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA reduktas (HMG-CoA-reduktas) har en nyckelroll i reglering av cellernas kolesterolsyntes. Beskriv hur detta enzym regleras på transkriptionell nivå; den viktigaste reglermekanismen. (4p)";"Transkriptionen regleras av Sterol Regulator Element Binding Protein (SREBP) som har en transkriptionsfaktordel mot cytosolen. Vid låg kolesterol flyttas SREBP från det endoplasmatiska retiklet till golgiapparaten. Här klyvs transkriptionsfaktordelen av SREBP av Golgi localized site 1 proteaset. Därefter klyver site 2-proteaset vid N-terminalen. Den N-terminala delen som har transkriptionsfaktorn binder till Sterol Regulator Element 1 som finns i promotorn av bland annat HMGR, som leder till en ökad transkription av HMGR. Själva transporten av SREBP till golgiapparaten, som också påverkar transkriptionen, regleras av Insig 1, Insig 2 och Scap. Vid låg kolesterolnivå kommer Insig inte binda till SREBPScap-komplexet. Insig bryts därmed ned i proteasomen och SREBPScap-komplexet kan interagera med COPII, som är involverade i vesiklar som transporteras till golgi. Men om kolesterol finns och det binder till SREBPScap-komplexet kommer en konformationsändring ske som gör att Insig kan binda in. Detta förhindrar interaktion med COPII. SREBP går inte med i vesiklar till golgi, vilket betyder att transkription av HMGR inte ökar när mycket kolesterol finns."
"2023-12-18";"14";"translation";"Wobble-effekten är en viktig aspekt av genetisk kodavläsning under translationen. Förklara vad wobble-effekten är och hur den bidrar till flexibiliteten i parningen mellan kodoner på mRNA och antikodonerna på tRNA. Diskutera även hur denna effekt kan bidra till tolerans mot vissa genetiska mutationer. (4p) (Max 150 ord)";"";"Wobble-effekten är en viktig aspekt av genetisk kodavläsning under translationen. Förklara vad wobble-effekten är och hur den bidrar till flexibiliteten i parningen mellan kodoner på mRNA och antikodonerna på tRNA. Diskutera även hur denna effekt kan bidra till tolerans mot vissa genetiska mutationer. (4p) (Max 150 ord)";"Wobble-effekten betyder att den första basen i ett antikodon kan binda till flera olika baser på den tredje basen av ett kodon. En kvävebas på tRNA-antikodon som har en sådan förmåga att binda till flera olika baser på den tredje basen i kodonet är inosin, som kan binda till uracil, cytosin och adenin. Att den första basen i antikodonet kan binda till flera baser leder till att ett tRNA kan binda till flera kodon på mRNA vilket ökar molekylens flexibilitet (en aminosyra kan kopplas till flera olika kodon). Wobble-effekten kan bidra till tolerans mot vissa genetiska mutationer, eftersom även om en mutation finns som gör att en annorlunda kvävebas finns, kan tRNA trots detta binda till det och binda korrekt aminosyra."
"2023-12-18";"20";"enzymer";"Vad är syftet med den katalytiska klyftan som finns i ett enzym? Redogör för två fördelar den katalytiska klyftan ger för katalys. (4p)";"";"Vad är syftet med den katalytiska klyftan som finns i ett enzym? Redogör för två fördelar den katalytiska klyftan ger för katalys. (4p)";"Den katalytiska klyftan är den del av enzymet som substratet binder in och som reaktionen kan katalyseras i. och övergångstillståndet kan stabilseras så att reaktionen kan ske snabbare. Den katalytiska klyftan är en väldigt liten del av enzymet och består av aminosyrarester i proteinet som ger en specificitet för enbart vissa molekyler att binda in, detta ökar specificiteten och hindrar andra potentiella reaktanter från att komma nära och interagera. Den utesluter bland annat vatten som hade hämmat många reaktioner genom sin polaritet. Dessutom kommer den katalytiska klyftan att införa svaga bindingar som stabiliserar övergångstillståndet och bildningen av produkt, ett fenomen som i vanliga fall hade krävt betydligt högre aktiveringsenergi för att kunna ske. Dvs som hade krävt högre energi i omlopp som hade satt molekylerna i rörelse så att de kom nära varandra tillräckligt ofta för att det ostabila övergångstillståndet hade kunnat ske. Den katalytiska klyftan av enzymet sänker därför aktiveringsenergin till reaktionen."
"2023-12-18";"30";"elektrontransportkedjan";"Beskriv med en reaktionsformel hur celler hanterar att syrgas ibland enbart tar upp en elektron. (2p) (Max 25 ord)";"";"Beskriv med en reaktionsformel hur celler hanterar att syrgas ibland enbart tar upp en elektron. (2p) (Max 25 ord)";"Superoxid + 2 H⁺ → H₂O₂ mha dismutas. (superoxid = O₂·⁻) (Väteperoxiden tas hand om av glutationperoxidas (2 H₂O₂ → O₂ + 2 H₂O, där 2 glutation oxideras))"
"2023-12-18";"15";"evolution";"Lista fyra aspekter som är identiska för alla livsformer på jorden. (4p)";"";"Lista fyra aspekter som är identiska för alla livsformer på jorden. (4p)";"1. Alla livsformer lagrar sin arvsmassa/genetiska information i nukleinsyror i form av RNA eller DNA. 2. Den grundläggande metabolismen i alla livsformer är liknande. 3. Livsformer använder ATP som energivaluta i sina celler. 4. Alla livsformer använder cofaktorer i sina enzymer."
"2023-12-18";"21";"introduktion-till-metabolismen";"Vilka två av nedanstående molekyler är beroende av en B-vitamin för sin syntes? (2p) A: Coenzym A B: Coenzym Q C: NADH D: ATP";"";"Vilka två av nedanstående molekyler är beroende av en B-vitamin för sin syntes? (2p) A: Coenzym A B: Coenzym Q C: NADH D: ATP";"A och C"
"2023-12-18";"31";"aminosyrametabolism";"Ange det fullständiga namnet på ett kliniskt viktigt enzym som tillhör gruppen aminotransferaser, samt ange reaktionen enzymet katalyserar. (4p) (Max 50 ord)";"";"Ange det fullständiga namnet på ett kliniskt viktigt enzym som tillhör gruppen aminotransferaser, samt ange reaktionen enzymet katalyserar. (4p) (Max 50 ord)";"Alanin aminotransferas (höga nivåer av detta tyder på leversjukdom). Den katalyserar följande reaktion: Alanin + α-ketoglutarat ⇌ Pyruvat + Glutamat."
"2023-12-18";"25";"citronsyracykeln";"Vilka två av nedanstående molekyler reglerar något enzym i citronsyracykeln? (2p) A: NADH B: Pyruvat C: Acetyl-CoA D: ADP";"";"Vilka två av nedanstående molekyler reglerar något enzym i citronsyracykeln? (2p) A: NADH B: Pyruvat C: Acetyl-CoA D: ADP";"A och D"
"2023-12-18";"11";"dna-replikation";"a) Vilken roll spelar DNA-polymeras epsilon? b) Hur kan PCNA påverka aktiviteten hos DNA-polymeras epsilon? (4p)";"";"a) Vilken roll spelar DNA-polymeras epsilon? b) Hur kan PCNA påverka aktiviteten hos DNA-polymeras epsilon? (4p)";"a) DNA-polymeras epsilon är involverad i DNA-replikation på leading strand. Det katalyserar påkopplingen av kvävebaser från 5' till 3'-riktning. Det har en 3' till 5' exonukleasaktivitet och kan ta bort om en felaktig bas har kopplats på (proofreading). b) PCNA (sliding clamp) ökar processiviteten hos DNA-polymeras genom att hålla det fastbundet till DNA-mallen. På så sätt ramlar DNA-polymeraset inte av och kan arbeta med ökad processivitet."
"2023-12-18";"8";"kolhydrater";"Glykaner kan vara O-länkade och N-länkade. Förklara kortfattat vad detta innebär på molekylär nivå. (4p) (Max 150 ord)";"";"Glykaner kan vara O-länkade och N-länkade. Förklara kortfattat vad detta innebär på molekylär nivå. (4p) (Max 150 ord)";"O-länkade glykaner betyder att kolhydraten är länkad via syre i sidokedjan av serin eller threonin. N-länkade betyder att kolhydraterna är länkade via kvävet i sidokedjan av asparagin."
"2023-12-18";"35";"introduktionslaboration";"I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värde på 0,03 och ett 95% konfidensintervall på 617 mmHg. Nollhypotesen är att det inte finns någon skillnad i medelvärde i blodtryck mellan de två grupperna. Vilka två påståenden är korrekta baserat på dessa resultat? (2p) Välj ett eller flera alternativ: A: Ett p-värde på 0,03 innebär att det 95%-iga konfidensintervallet inte inkluderar nollan. B: Nollhypotesen kan förkastas. C: Det är 95% säkert att behandlingsgruppen har mellan 6 och 17 mmHg lägre blodtryck jämfört med placebogruppen. D: Det finns ingen statistisk signifikant skillnad i blodtryck mellan grupperna.";"";"I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värde på 0,03 och ett 95% konfidensintervall på 617 mmHg. Nollhypotesen är att det inte finns någon skillnad i medelvärde i blodtryck mellan de två grupperna. Vilka två påståenden är korrekta baserat på dessa resultat? (2p) Välj ett eller flera alternativ: A: Ett p-värde på 0,03 innebär att det 95%-iga konfidensintervallet inte inkluderar nollan. B: Nollhypotesen kan förkastas. C: Det är 95% säkert att behandlingsgruppen har mellan 6 och 17 mmHg lägre blodtryck jämfört med placebogruppen. D: Det finns ingen statistisk signifikant skillnad i blodtryck mellan grupperna.";"A och B"
"2023-12-18";"3";"från-aminosyror-till-proteiner";"Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för två enzymer. Förklara vilka egenskaper de aminosyror som binder till fruktos 2,6-bisfosfat behöver ha och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 75 ord.)";"";"Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för två enzymer. Förklara vilka egenskaper de aminosyror som binder till fruktos 2,6-bisfosfat behöver ha och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 75 ord.)";"Fruktos 2,6-bisfosfat har två fosfatgrupper som kan ha negativt laddade syren. För att binda in ämnet och skapa en elektrostatisk attraktion (jonbindning), kan det därmed vara fördelaktigt att ha aminosyror som har en positiv laddning. Lysin och arginin är två positivt laddade aminosyror som kan vara lämpliga."
"2023-12-18";"7";"nukleotider";"Den vanligaste formen som DNA antar kallas B-DNA. Vilka två påståenden stämmer om denna? (2p) A: Den är vänstervriden. B: Det är mellan 1010,4 baspar per varv av helixen. C: Avståndet mellan baspar är cirka 3,4 Å. D: De två strängarna parallella.";"";"Den vanligaste formen som DNA antar kallas B-DNA. Vilka två påståenden stämmer om denna? (2p) A: Den är vänstervriden. B: Det är mellan 1010,4 baspar per varv av helixen. C: Avståndet mellan baspar är cirka 3,4 Å. D: De två strängarna parallella.";"B och C"
"2023-12-18";"6";"lipider";"a) Rita strukturen för kolesterol. b) Visa hur kolesterol orienteras i ett membran. OBS! Den här frågan ska besvaras på separat papper som kommer att skannas in och bifogas tentamen. (4p)";"";"a) Rita strukturen för kolesterol. b) Visa hur kolesterol orienteras i ett membran. OBS! Den här frågan ska besvaras på separat papper som kommer att skannas in och bifogas tentamen. (4p)";"se 2023-12-18-0114-EES"
"2023-12-18";"2";"från-aminosyror-till-proteiner";"Rangordna nedanstående aminosyror efter stigande polaritet (2p) Cystein Lysin Metionin Treonin";"";"Rangordna nedanstående aminosyror efter stigande polaritet (2p) Cystein Lysin Metionin Treonin";"1. Metionin 2. Cystein 3. Treonin 4. Lysin"
"2024-05-15";"28";"glykogen";"Vilka två av följande faktorer stimulerar glykogenes (syntes av glykogen) i en skelettmuskelcell? (2p) A: Förhöjda koncentrationer av ATP i muskelcellen. B: Förhöjda koncentrationer av AMP i muskelcellen. C: Förhöjda koncentrationer av glukos-6-fosfat i muskelcellen. D: Intracellulär signalering inducerad av hormonet insulin.";"";"Vilka två av följande faktorer stimulerar glykogenes (syntes av glykogen) i en skelettmuskelcell? (2p) A: Förhöjda koncentrationer av ATP i muskelcellen. B: Förhöjda koncentrationer av AMP i muskelcellen. C: Förhöjda koncentrationer av glukos-6-fosfat i muskelcellen. D: Intracellulär signalering inducerad av hormonet insulin.";"C och D"
"2024-05-15";"5";"utforska-proteiner";"Du jobbar på ett labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein med hjälp av affinitetskromatografi. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med hjälp av affinitetskromatografi. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en kortfattad förklaring till hur denna fungerar. (4p) (Max 200 ord.)";"";"Du jobbar på ett labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein med hjälp av affinitetskromatografi. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med hjälp av affinitetskromatografi. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en kortfattad förklaring till hur denna fungerar. (4p) (Max 200 ord.)";"3 av 4 poäng: A) Affinitetskromatografi är rening baserad på egenskaper hos proteinet. Ett exempel är att man kan sätta på 6 stycken histidin på proteinet på DNA nivå, sk 6xHis. Histidin har en hög affinitet för nickeljoner som man kan lägga i kolonnen. När man häller ner proteinblandningen kommer histidin att binda till nickeljonerna vilket gör att proteinet stannar i kolonnen. För att sedan få proteinet att släppa kan man använda sig av imidazol som har ännu högre affinitet för nickeljonerna för att eleduera ut proteinet. B) Man kan använda sig av SDS-Page. Då utsätter man proteinet för SDS molekyler som kommer att binda in till det. SDS molekylerna är negativt laddade och ju större protein, ju fler SDS molekyler kommer binda in, ju mer negativt laddat blir det. Sedan använder man sig av gelelektrofores (Page) för att få proteinet att röra på sig i ett elektromagnetiskt fält. Större protein kommer röra sig långsammare medan snabbare rör sig fortare. DVS Störst, sist."
"2024-05-15";"18";"termodynamik";"En ändring i entropi kan vara den huvudsakliga drivkraften för en reaktion. Nämn två sätt att ändra entropin i biokemiska reaktioner. Förklara med exempel. (4p) (Max 150 ord.)";"";"En ändring i entropi kan vara den huvudsakliga drivkraften för en reaktion. Nämn två sätt att ändra entropin i biokemiska reaktioner. Förklara med exempel. (4p) (Max 150 ord.)";"3 av 4: Entropi är ett mått på oordning. Enligt deltaG= deltaH - T deltaS. Vilket betyder att förändring i S/entropi kan man få utifrån (deltaH - deltaG)/T. Alltså kan man ändra entropin genom att ändra temperaturen. Då temperatur är mått på värmeenergi. Högre temperatur betyder mer oordning. Man kan ändra entropin genom att katalysera en reaktion med ett enzym. Enzymet minskar aktiveringsenergin som behövs för att reaktionen ska se."
"2024-05-15";"1";"kemiska-bindingar";"Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. (2p) Svagast → Starkast: A: van der Waals B: väte C: dubbel D: peptid";"";"Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. (2p) Svagast → Starkast: A: van der Waals B: väte C: dubbel D: peptid";"(svar angivet i drag-och-släpp-formulär) Totalpoäng: 2"
"2024-05-15";"19";"enzymer";"Ett enzym uppvisar Michaelis-Mentens kinetik. A) Redogör för hur man i ett V mot [S] diagram kan avläsa de två konstanterna Km och Vmax. B) Förklara vad som händer med Km respektive Vmax om man tillsätter en icke-kompetitiv hämmare? (4p) (Max 150 ord.)";"";"Ett enzym uppvisar Michaelis-Mentens kinetik. A) Redogör för hur man i ett V mot [S] diagram kan avläsa de två konstanterna Km och Vmax. B) Förklara vad som händer med Km respektive Vmax om man tillsätter en icke-kompetitiv hämmare? (4p) (Max 150 ord.)";"A) Vmax kan avläsas som det y-värde på grafen som fås då substratoncentrationen går mot oändligheten dvs det y-värde som fås när grafen planar ut allt eftersom substratkoncentrationen ökar. Km kan avläsas som det x-värde som grafen antar då grafens y-värde är halva Vmax dvs hälften av grafens maxvärde. B) Det som sker är att Vmax kommer minska eftersom en icke-kompetitiv hämmare binder allostert till enzymet oavsett om substrat bundit eller ej och genför en konformationsändring i enzymet som gör att enzymet får sämre katalytisk förmåga dvs Vmax sänks. Däremot kommer Km att vara oförändrat då inhibitorn är oberoende av substratkoncentrationen eftersom den binder till enzymet oavsett om substrat finns och oavsett hur mycket/lite substrat som finns."
"2024-05-15";"29";"glykogen";"Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolismen är korrekta? (2p) A: Skelettmuskel kan bara bryta ned glykogenet till glukos-6-fosfat eftersom muskelcellerna saknar enzymet glukos-6-fosfatas. B: Glykogenin är ett enzym som krävs för att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel. C: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet glukagon induceras glykogenolys i cellen. D: Glykogen upplagrat i skelettmuskel kan användas för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider.";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolismen är korrekta? (2p) A: Skelettmuskel kan bara bryta ned glykogenet till glukos-6-fosfat eftersom muskelcellerna saknar enzymet glukos-6-fosfatas. B: Glykogenin är ett enzym som krävs för att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel. C: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet glukagon induceras glykogenolys i cellen. D: Glykogen upplagrat i skelettmuskel kan användas för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider.";"A och B"
"2024-05-15";"4";"hemoglobin";"How does the partial pressure of oxygen influence binding and release of oxygen to/from hemoglobin? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words).";"";"How does the partial pressure of oxygen influence binding and release of oxygen to/from hemoglobin? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words).";"If the partial pressure is high it means that there is a high concentration of oxygen in the area which will increase the chance of oxygen binding to the hemoglobin. Once one oxygen has binded to the hemoglobin, the affinity for oxygen increases in its subunits. This occurs in the lungs, where the concentration of oxygen is very high. On the other hand, in the tissues where oxygen is needed, the partial pressure of oxygen is low which will lead to oxygen being released from the hemoglobin. Leading to the hemoglobin going inte T-state which facilitates oxygen release."
"2024-05-15";"16";"cellmembran";"Det finns tre olika typer av integrala cellmembranproteiner. Vilka? Beskriv kortfattat hur de är uppbyggda. (4p)";"";"Det finns tre olika typer av integrala cellmembranproteiner. Vilka? Beskriv kortfattat hur de är uppbyggda. (4p)";"Alfa-helixar, dessa är vanliga alfahelixar som bildar en tunnel då hydrofob R-grupp är riktad utåt. Beta barrels, flera stycken antiparallella Beta flak som bildar en stor tunnel, likt en tunna. Därifrån namnet. Partiellt integrerade, dessa är alfahelixar som sitter bland de hydrofoba svansarna i membranet och sticker ut från membranet. Kan finnas på båda sidorna av membranet."
"2024-05-15";"22";"glykolysen";"Vilka två av nedanstående molekyler är mest reducerade? (2p) A: pyruvat B: glyceraldehyd 3-fosfat C: fruktos 6-fosfat D: citrat";"";"Vilka två av nedanstående molekyler är mest reducerade? (2p) A: pyruvat B: glyceraldehyd 3-fosfat C: fruktos 6-fosfat D: citrat";"B & C"
"2024-05-15";"32";"pentosfosfatvägen";"Vilken molekyl utgör substratet som går in i pentosfosfatvägens oxidativa fas och vilka tre olika slutprodukter bildas i denna fas? (2p) Max 20 ord.";"";"Vilken molekyl utgör substratet som går in i pentosfosfatvägens oxidativa fas och vilka tre olika slutprodukter bildas i denna fas? (2p) Max 20 ord.";"1.5 av 2: Glukos-6-fosfat går in i pentosfosfatvägen. I den oxidativa fasen bildas NADPH, Ribulose-5-fosfat och Ribos-5-fosfat."
"2024-05-15";"26";"citronsyracykeln";"Vilka två av nedanstående enzymer katalyserar en reaktion där det sker en dekarboxylering? (2p) A: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas B: Alfaketoglutaratdehydrogenas C: Pyruvatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas";"";"Vilka två av nedanstående enzymer katalyserar en reaktion där det sker en dekarboxylering? (2p) A: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas B: Alfaketoglutaratdehydrogenas C: Pyruvatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas";"B och C"
"2024-05-15";"12";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Lac-operonet kodar för genprodukter som behövs för att bryta ner laktos. Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Allolaktos bildas av laktos och binder till CAP. B: cAMP bildas i frånvaro av glukos och binder till CAP. C: cAMP bildas i närvaro av glukos och binder till CAP. D: Allolaktos bildas av laktos och binder till lac-repressorn.";"";"Lac-operonet kodar för genprodukter som behövs för att bryta ner laktos. Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Allolaktos bildas av laktos och binder till CAP. B: cAMP bildas i frånvaro av glukos och binder till CAP. C: cAMP bildas i närvaro av glukos och binder till CAP. D: Allolaktos bildas av laktos och binder till lac-repressorn.";"B och D"
"2024-05-15";"36";"rekombinant-dna-teknik";"I vilken ordning genomförs stegen nedan när en gen ska amplifieras med rekombinant DNA-teknologi? (2p) amplifiering gelelektrofores plasmidrening transformation";"";"I vilken ordning genomförs stegen nedan när en gen ska amplifieras med rekombinant DNA-teknologi? (2p) amplifiering gelelektrofores plasmidrening transformation";"1. transformation 2. amplifiering 3. plasmidrening 4. gelelektrofores"
"2024-05-15";"27";"elektrontransportkedjan";"I elektrontransportkedjan förflyttas elektroner mellan olika komponenter. Redogör för två förutsättningar för att förflyttningen ska fungera. (4p) (Max 80 ord.)";"";"I elektrontransportkedjan förflyttas elektroner mellan olika komponenter. Redogör för två förutsättningar för att förflyttningen ska fungera. (4p) (Max 80 ord.)";"Redoxpotentialen måste vara högre hos den som tar emot elektronen. Tex när FMNH2 lämnar över elektronerna till Q. Det fungerar då Q har en högre redoxpotential än FMNH2. Det är viktigt att påpeka att de olika komponenterna måste vara tillräckligt nära varandra också för att plocka upp elektronerna. Det måste också finnas en molekyl som tillslut plockar upp elektronerna, denna är O2. Syre kommet plocka upp elektronerna och reagera med protoner för att bilda vatten."
"2024-05-15";"13";"kromatin";"Beskriv nukleosomens (Nucleosome core particle) uppbyggnad. Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade. (4p)";"";"Beskriv nukleosomens (Nucleosome core particle) uppbyggnad. Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade. (4p)";"Nukleosomen består av en kärna (en oktamer) på 8 histoner (2st H2A, 2st H2B, 2st H3, 2st H4). Den har också 146 baspar DNA som är lindat 1,75 varv runt oktameren. Dessutom ligger histonen H1 (som inte är lika konserverad som övriga ovannämda histoner) utanpå kärnan och binder till linker DNA (DNAt mellan nukelosomerna) och stabiliserar nukleosomen. H3 och H4 har även N-terminala svansar som ligger runt DNAt som är lindat runt oktameren och reglerar DNAts packning till nukleosomkärnan."
"2024-05-15";"17";"transport-över-cellmembran";"Proteinet på bilden utför transport. ![[Pasted image 20251129235458.png]] A) Ange vilken grupp av transportörer proteinet tillhör och vad som karaktäriserar denna grupp av transportörer? B) I vilket av cellens membran finns transportören? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord.";"";"Proteinet på bilden utför transport. ![[Pasted image 20251129235458.png]] A) Ange vilken grupp av transportörer proteinet tillhör och vad som karaktäriserar denna grupp av transportörer? B) I vilket av cellens membran finns transportören? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord.";"A) Antiport som är en aktiv transportör av 2 olika föreningar som transporteras åt olika håll (en in och en ut) B) I mitokondriets inre membran C) Den elektrokemiska gradienten av vätejoner mellan MMU och matrix."
"2024-05-15";"23";"glukosmetabolism";"En morgon när du var sen blev du tvungen att springa för att hinna med spårvagnen. Efter ett tag smärtade lårmusklerna och kort därefter blev de stumma. Förklara vad som har hänt metaboliskt på molekylär nivå och varför det har inträffat. (4p) (Max 100 ord.)";"";"En morgon när du var sen blev du tvungen att springa för att hinna med spårvagnen. Efter ett tag smärtade lårmusklerna och kort därefter blev de stumma. Förklara vad som har hänt metaboliskt på molekylär nivå och varför det har inträffat. (4p) (Max 100 ord.)";"Det har skett då man har sprungit, en snabb explosiv aktivitet, så har lite syre blivit upptagit. Detta har lett till att glykolysen som skett i musklerna har skett i anaeroba förhållanden. Detta har lett till att pyruvat som är slutprodukten i glykolysen, har reagerat med NADH (som behöver släppa av elektronerna till syret i elektrontransportkedjan vid aeroba förhållanden) som bildats tidigare i processen, katalyserat av laktatdehydrogenas för att bilda laktat, så NAD+ kan återbildas. Laktat i sin tur har sänkt pH:t i musklerna vilket har lett till smärtan. Laktatet kommer sedan transporteras till levern för att omvandlas till glukos."
"2024-05-15";"33";"heme";"Beskriv schematiskt hur nedbrytningen och utsöndringen av heme går till, samt ange i vilka organ/vävnader de olika stegen sker. (4p)";"";"Beskriv schematiskt hur nedbrytningen och utsöndringen av heme går till, samt ange i vilka organ/vävnader de olika stegen sker. (4p)";"Erytrocyter bryts ned i mjälten. Från erytrocyterna kommer hemoglobin att frisläppas. Hemoglobinet bryts ned till fria aminosyror och heme. Heme kommer att brytas ned till biliverdin som kommer att omvandlas till bilirubin. Bilirubin är okonjugerat dvs fettlöslig och ej vattenlöslig, därför kommer det transporteras till levern med hjälp av albumin. I levern kommer bilirubin att konjugera genom att bindas med gluturonsyra vilket kommer att göra den amfipatisk och vattenlöslig. Det konjugerade bilirubinet kommer sedan utsöndras från levern med gallan till tarmarna. Där det sedan kan utsöndras genom avföring."
"2024-05-15";"24";"glukoneogenes";"Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter: fosfoenolpyruvat laktat oxalacetat succinat Vägar: citronsyracykeln Coricykeln glukoneogenes glykolysen";"";"Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter: fosfoenolpyruvat laktat oxalacetat succinat Vägar: citronsyracykeln Coricykeln glukoneogenes glykolysen";"fosfoenolpyruvat: glykolysen laktat: Coricykeln oxalacetat: glukoneogenes succinat: citronsyracykeln"
"2024-05-15";"10";"nukleotider";"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonCrick helix. Vilka två påståenden är korrekta? (2p) A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning från 5´ till 3´. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är högervriden.";"";"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonCrick helix. Vilka två påståenden är korrekta? (2p) A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning från 5´ till 3´. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är högervriden.";"C och D"
"2024-05-15";"9";"dna-replikation";"Initiering av eukaryot DNA-replikation är en noggrant reglerad process. A) I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin. B) I vilken fas av cellcykeln binder Cdc45 och GINS till MCM-helikaset? C) Vad heter det proteinkomplex som är bundet till replikationsorigin under hela cellcykeln? D) Vad gör CMG-helikaset när DNA-replikationen skall initieras? (4p) (Max 15 ord.)";"";"Initiering av eukaryot DNA-replikation är en noggrant reglerad process. A) I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin. B) I vilken fas av cellcykeln binder Cdc45 och GINS till MCM-helikaset? C) Vad heter det proteinkomplex som är bundet till replikationsorigin under hela cellcykeln? D) Vad gör CMG-helikaset när DNA-replikationen skall initieras? (4p) (Max 15 ord.)";"A) G-fasen. B) S1-fasen. C) ORC, origin recognition complex. D) Smälter DNA-strängarna, dvs separerar dem."
"2024-05-15";"34";"kolesterol";"Vilka två av följande påståenden stämmer för kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? (2p) A: Kolesterol kan vid svält brytas ned till acetyl-CoA, som kan gå in i citronsyra-cykeln. B: En korrekt kolesterolkoncentration i cellens membran är viktig, då kolesterolkoncentrationen avgör membranets stelhet. C: Kolesterol och 7-dehydrokolesterol utgör utgångsmaterialet för syntes av steroidhormoner respektive D-vitamin. D: Kolesterol kan hos de flesta däggdjur (inklusive människa) endast syntetiseras i leverns celler (hepatocyter).";"";"Vilka två av följande påståenden stämmer för kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? (2p) A: Kolesterol kan vid svält brytas ned till acetyl-CoA, som kan gå in i citronsyra-cykeln. B: En korrekt kolesterolkoncentration i cellens membran är viktig, då kolesterolkoncentrationen avgör membranets stelhet. C: Kolesterol och 7-dehydrokolesterol utgör utgångsmaterialet för syntes av steroidhormoner respektive D-vitamin. D: Kolesterol kan hos de flesta däggdjur (inklusive människa) endast syntetiseras i leverns celler (hepatocyter).";"B och C"
"2024-05-15";"14";"translation";"Vilken roll har fMet (N-formylmetionin) i initiering av translation? Beskriv kortfattat translationens initieringsprocess där fMet används. (4p) (Max 150 ord.)";"";"Vilken roll har fMet (N-formylmetionin) i initiering av translation? Beskriv kortfattat translationens initieringsprocess där fMet används. (4p) (Max 150 ord.)";"fMet finns enbart i prokaryoter. I eukaryota celler används istället Met. I prokaryot translation så initieras den genom att IF1 hittar en Shine-Delgarno sekvens, där binder sedan den lila ribosomala enheten in och letar tills ett AUG (startkodon) hittas. Denna startkodon kodar för aminosyran fMet som kommer bindas in då den sitter bundet till en tRNA-molekyl. tRNA:t binds in med hjälp av IF2 och sedan kommer den stora ribosomala enheten att binda in med hjälp av GTP. Alltså är fMet den första aminosyran som binder in, till startkodonet, i prokaryot translation."
"2024-05-15";"20";"termodynamik";"Om ∆G°´ för reaktionen A → B är -40 kJ/mol under standardförhållanden så… (2p) Välj de två korrekta alternativen: A: kommer den att fortsätta i snabb takt. B: är den långt ifrån jämvikt. C: kommer den att gå från vänster till höger spontant. D: kommer den aldrig att nå jämvikt.";"";"Om ∆G°´ för reaktionen A → B är -40 kJ/mol under standardförhållanden så… (2p) Välj de två korrekta alternativen: A: kommer den att fortsätta i snabb takt. B: är den långt ifrån jämvikt. C: kommer den att gå från vänster till höger spontant. D: kommer den aldrig att nå jämvikt.";"B och C"
"2024-05-15";"30";"nukleotidnedbrytning";"Allopurinol är en så kallad hypoxantinanalog som inhiberar nedbrytning av purin-nukleotider till urat. Vilket enzym hämmar denna läkemedelssubstans och vid vilken sjukdom används allopurinol som läkemedel? (2p) (Max 20 ord.)";"";"Allopurinol är en så kallad hypoxantinanalog som inhiberar nedbrytning av purin-nukleotider till urat. Vilket enzym hämmar denna läkemedelssubstans och vid vilken sjukdom används allopurinol som läkemedel? (2p) (Max 20 ord.)";"Allopurinol hämmar enzymet xantinoxidas. Detta används vid sjukdomen gikt som beror på ökad uratnivå i kroppen."
"2024-05-15";"15";"evolution";"Vilka är det två viktigaste principerna bakom evolutionen? Beskriv med ett valfritt exempel hur dessa två principer är viktiga för att möjliggöra uppkomsten av nya arter/fenotyper/funktioner. (4p) (Max 150 ord.)";"";"Vilka är det två viktigaste principerna bakom evolutionen? Beskriv med ett valfritt exempel hur dessa två principer är viktiga för att möjliggöra uppkomsten av nya arter/fenotyper/funktioner. (4p) (Max 150 ord.)";"Variation: Att det ska finnas ett brett urval av olika gener i en population. Detta stora urvalet leder till att olika individer inom samma art är olika bra anpassade. Tex om en individ från en art som i vanliga fall bara klarar varmare områden, får en gen som leder till att den klarar av kyla bättre, då kommer denna individ kunna migrera till kallare områden, eller överleva ifall kallare tider kommer. Detta gör att två individer från samma art kan utvecklas iväg från varandra, en i det varmare och en i det kallare. Naturligt urval/Survival of the fittest: Den säger att den som är best anpassad överlever. Samma exempel. Ifall en längre isperiod skulle börja så kommer de som har bäst kan anpassa sig, tex som att de kan växa extra mycket päls för att hålla inne värmen, kommer överleva medan de som ej kan anpassa sig kommer dö."
"2024-05-15";"21";"enzymer";"Förklara vad ett kinas gör. (2p) (Max 20 ord.)";"";"Förklara vad ett kinas gör. (2p) (Max 20 ord.)";"Ett kinas katalyserar en reaktion där en fosfatgrupp sätts på ett substrat. Tex hexokinas som sätter på fosfat på glukos."
"2024-05-15";"31";"aminosyrametabolism";"Till vilka aminosyror kan nedanstående två alfa-ketosyror omvandlas i ett steg via transamineringsreaktioner? Ange även det fullständiga namnet på enzymet som katalyserar bildningen av respektive aminosyra. A) pyruvat B) oxalacetat (4p) (Max 20 ord.)";"";"Till vilka aminosyror kan nedanstående två alfa-ketosyror omvandlas i ett steg via transamineringsreaktioner? Ange även det fullständiga namnet på enzymet som katalyserar bildningen av respektive aminosyra. A) pyruvat B) oxalacetat (4p) (Max 20 ord.)";"A) Pyruvat kan omvandlas till alanin mha enzymet alaninaminotransferas. B) Oxalacetat kan omvandlas till aspartat mha enzymet aspartataminotransferas."
"2024-05-15";"25";"integrering-av-metabolismen";"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. En typ av reglering av komplexet sker via fosforylering. A) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? B) Vad händer med komplexets aktivitet när det fosforyleras? C) Redogör för hur energikvoten påverkar fosforyleringen av komplexet. (4p) (Max 100 ord)";"";"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. En typ av reglering av komplexet sker via fosforylering. A) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? B) Vad händer med komplexets aktivitet när det fosforyleras? C) Redogör för hur energikvoten påverkar fosforyleringen av komplexet. (4p) (Max 100 ord)";"A) PDH-komplexet katalyserar omvandlingen av pyruvat till Acetyl-CoA, detta är mellansteget mellan glykolys och citronsyracykeln. Det är viktigt det regleras så rätt mängd energi utvinns. Så att vi inte genererar ATP när vi ej behöver, tillexempel glukoneogenesen behövs sättas igång så vi kan omvandla pyruvat till glukos eller så att det istället lagras i kroppen. B) Komplexet kommer inhiberas vid fosforylering. C) Ifall energikvoten är hög, dvs mycket ATP finns kommer det att kunna hämma komplexet då fosforyleringen av komplexet kräver ATP. Då en fosfatgrupp kommer sättas på komplexet. Ifall hög mängd ADP finns kommer det ej att fosforylera komplexet."
"2024-05-15";"11";"rna-syntes";"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription samverkar flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två påståenden om denna process stämmer? (2p) A: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikasaktivitet. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TBP ingår som en subenhet i det större TFIIF-komplexet. D: TBP binder till TATA-boxen.";"";"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription samverkar flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två påståenden om denna process stämmer? (2p) A: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikasaktivitet. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TBP ingår som en subenhet i det större TFIIF-komplexet. D: TBP binder till TATA-boxen.";"A och D"
"2024-05-15";"8";"nukleotider";"Nukleotider bygger upp RNA och DNA. A) Vilken kemisk grupp finns i 2-positionen hos ribonukleotider? B) I vilken position på sockret sitter kvävebasen? C) I vilken position på sockret sitter fosfatgruppen? D) Vad är dGDP förkortning för? (4p)";"";"Nukleotider bygger upp RNA och DNA. A) Vilken kemisk grupp finns i 2-positionen hos ribonukleotider? B) I vilken position på sockret sitter kvävebasen? C) I vilken position på sockret sitter fosfatgruppen? D) Vad är dGDP förkortning för? (4p)";"A) Hydroxylgrupp (OH-grupp) B) På 1'-kolet C) På 5'-kolet D) Deoxyguanosin 5'-difosfat"
"2024-05-15";"35";"introduktionslaboration";"Du befinner dig i labsalen när det plötsligt börjar brinna i en bägare med etanol. Efter att ha uppmärksammat de övriga i labbet på branden och konstaterat att den är begränsad bestämmer du dig för att släcka den. På labbet hittar du brandsläckare för bränder av klass AC. A) Vad avses med bränder klass A, B och C? B) Förklara vilken klass av brand som har uppstått. (4p) Max 80 ord.";"";"Du befinner dig i labsalen när det plötsligt börjar brinna i en bägare med etanol. Efter att ha uppmärksammat de övriga i labbet på branden och konstaterat att den är begränsad bestämmer du dig för att släcka den. På labbet hittar du brandsläckare för bränder av klass AC. A) Vad avses med bränder klass A, B och C? B) Förklara vilken klass av brand som har uppstått. (4p) Max 80 ord.";"3 av 4: A= brand i textilier/trä B=brand i vätskor/alkoholer C=brand i gaser Det är en typ B brand som uppstått då etanol är en alkohol."
"2024-05-15";"3";"från-aminosyror-till-proteiner";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för proteiners sekundärstruktur? (2p) A: En dubbelhelix är en av de två vanligaste formerna. B: Identiska aminosyrasekvenser kan ha olika sekundärstruktur i olika proteiner. C: Den stabiliseras av vätebindningar mellan aminosyrornas R-grupper. D: Olika sekundärstrukturdelar hos ett protein kan bindas samman med loopar.";"";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för proteiners sekundärstruktur? (2p) A: En dubbelhelix är en av de två vanligaste formerna. B: Identiska aminosyrasekvenser kan ha olika sekundärstruktur i olika proteiner. C: Den stabiliseras av vätebindningar mellan aminosyrornas R-grupper. D: Olika sekundärstrukturdelar hos ett protein kan bindas samman med loopar.";"(svar angivet i flervalsformulär) Totalpoäng: 2"
"2024-05-15";"7";"kolhydrater";"Laktosintolerans och galaktosemi: ge ett exempel på vad som är gemensamt för dessa tillstånd och ett exempel på vad som skiljer dem åt. (4p) (Max 200 ord.)";"";"Laktosintolerans och galaktosemi: ge ett exempel på vad som är gemensamt för dessa tillstånd och ett exempel på vad som skiljer dem åt. (4p) (Max 200 ord.)";"Gemensamt: Båda två sjukdomar beror på brist på funktion eller brist på respektive enzym som bryter ned laktos respektive galaktos. Skillnad: Laktosintolerans är brist på enzymet laktas som bryter ned laktos till galaktos och glukos, det leder till att kroppen ej bryter ned laktos i GI-kanalen, detta leder till att laktos kommer hamna i tarmarna där det kan jäsa vilket leder till magsmärtor, diarré och gasbildning. Galaktosemi beror på bristande funktion eller brist på enzymerna (en av dem är GALT) som omvandlar galaktos till glukos. Galaktos kan ta upp av tarmcellerna tillskillnad från laktos. Detta leder till ökad nivå av galaktos i plasman, galaktos blir till galaktilol som är ett toxiskt ämne. Detta kan leda till neurologisk skador och i värsta fall död. Alltså är skillnaden vart de kommer ansamlas och påverkan på kroppen."
"2024-05-15";"6";"lipider";"Du är läkare på en vårdcentral och en patient har frågor om de prover som du just ordinerat i en ”lipidstatus”. Du tar hjälp av en ritning du lärde dig göra när du läste biokemi under din grundutbildning för att börja svara på frågan. A) Rita den principiella strukturen för den molekyl som framför allt används för att lagra energi i kroppen. B) Vilken sorts lipoprotein skickar levern ut i blodet för att transportera energilagringsmolekylen till resten av kroppens celler? 1 ord räcker som svar. (4p)";"";"Du är läkare på en vårdcentral och en patient har frågor om de prover som du just ordinerat i en ”lipidstatus”. Du tar hjälp av en ritning du lärde dig göra när du läste biokemi under din grundutbildning för att börja svara på frågan. A) Rita den principiella strukturen för den molekyl som framför allt används för att lagra energi i kroppen. B) Vilken sorts lipoprotein skickar levern ut i blodet för att transportera energilagringsmolekylen till resten av kroppens celler? 1 ord räcker som svar. (4p)";"A) Triacylglycerol (TAG). B) VLDL. ![[Pasted image 20251129235437.png]] (Ritning på TAG-struktur finns på sida 11 i original-PDF.)"
"2024-05-15";"2";"från-aminosyror-till-proteiner";"På bilden visas en tripeptid. ![[Pasted image 20251129235411.png]] A) Ange vilken aminosyra som finns på C-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. B) Ange vilken aminosyra som finns på N-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. (4p) (Max 25 ord.)";"";"På bilden visas en tripeptid. ![[Pasted image 20251129235411.png]] A) Ange vilken aminosyra som finns på C-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. B) Ange vilken aminosyra som finns på N-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. (4p) (Max 25 ord.)";"A) Asparginsyra, en syra. Kan binda mha elektrostatiska interaktioner då den är negativt laddad. B) Glycin, en alifatisk aminosyra. Opolär."
"2022-12-19";"28";"elektrontransportkedjan";"I elektrontransportkedjan pumpas protoner när elektroner förflyttas mellan olika komponenter. A) Var i elektrontransportkedjan pumpas protoner? B) Vilken är drivkraften bakom protonpumpningen? Max 50 ord.";"";"I elektrontransportkedjan pumpas protoner när elektroner förflyttas mellan olika komponenter. A) Var i elektrontransportkedjan pumpas protoner? B) Vilken är drivkraften bakom protonpumpningen? Max 50 ord.";"A) I komplex I, III och IV B) I elektrontransportkedjans komplex flyttas elektroner från komponenter med lägre redoxpotential till komponenter med högre. Detta är en energimässigt gynnsam process och energin kan då utnyttjas för att pumpa protoner från matrix till mellanmembransutrymmet mot gradienten. Energin omvandlas då till elektrokemisk energi."
"2022-12-19";"5";"utforska-proteiner";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att köra affinitetskromatografi med en 6xHis-tag. A) Beskriv kortfattat principen för affinitetskromatografi. B) Hur kan man eluera proteinet? C) Ange en metod som kan användas för analys av det eluerade proteinet. Max 200 ord.";"";"Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att köra affinitetskromatografi med en 6xHis-tag. A) Beskriv kortfattat principen för affinitetskromatografi. B) Hur kan man eluera proteinet? C) Ange en metod som kan användas för analys av det eluerade proteinet. Max 200 ord.";"A) Affinitetskromatografi är en kromatografimetod som bygger på att separera proteiner baserat på en viss egeskap. Exempelvis kan glykosylerade proteiner separeras ut genom att kulorna i kolonnen har molekyler som binder till sockerenheterna. Man kan även, som i detta fall, modifiera DNA-sekvensen för proteinet man är ute efter genom att lägga till en tag av histidin vilken binder väl till nickeljoner på kulorna. B) För att få proteinet att lossna från kulorna krävs att man eluerar. Det kan ske med hjälp av en stark buffert eller saltlösning, ofta en kombination av båda. C) Gelelektrofores, SDS-PAGE, kan användas för att analysera proteinets storlek samt hur väl proteinreningen lyckats."
"2022-12-19";"18";"termodynamik";"Diffusion är en viktig process för att fördela molekyler i gaser och vätskor. Vad beror den på och vilken termodynamisk drivkraft finns bakom den?";"";"Diffusion är en viktig process för att fördela molekyler i gaser och vätskor. Vad beror den på och vilken termodynamisk drivkraft finns bakom den?";"1.5p Diffusion beror på att det finns många fler sätt för ett ämne i en vätska eller gas att vara oordnat än ordnat, alltså är sannolikheten för ett oordnat tillstånd större och molekylerna kommer då till följd av sin konstanta rörelse att hamna i ett oordnat tillstånd. Den termodynamiska drivkraften bakom diffusion är således termodynamikens andra lag, att ett system tenderar att gå mot mer oordnade tillstånd, alltså att entropin ökar. 2.0p Brownsk rörelse (stavning?) innebär att en liten molekyl har större sannolikhet att inte stöta på något (annan molekyl) på ena sidan än andra. Det leder till att molekyler rör sig mot där det är mindre molekyl-tätt, och således sprids ämnet jämt. Ämnet vill fördela sig, eftersom att ha det ordnat = låg entropi => ofördelaktigt (om molekylen är löslig i sin omgiving, om olja i vatten är det mer fördelaktigt att oljan är samlad i en stor klump)"
"2022-12-19";"1";"kemiska-bindingar";"Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. Jon Peptid van der Waals Väte";"";"Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. Jon Peptid van der Waals Väte";"1. van der Waals 2. Väte 3. Jon 4. Peptid"
"2022-12-19";"19";"enzymer";"Vilka påståenden om övergångstillståndet för en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det har högre energi än för en icke-katalyserad reaktion. B: Det har lägre energi än reaktionens substrat. C: Det är mycket kortvarigt. D: Det har lägre energi än för en icke-katalyserad reaktion.";"";"Vilka påståenden om övergångstillståndet för en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det har högre energi än för en icke-katalyserad reaktion. B: Det har lägre energi än reaktionens substrat. C: Det är mycket kortvarigt. D: Det har lägre energi än för en icke-katalyserad reaktion.";"Rätt svar 1. C 2. D"
"2022-12-19";"29";"integrering-av-metabolismen";"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzym i den processen? alfaketoglutaratdehydrogenas glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas malatdehydrogenas pyruvatdehydrogenas";"";"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzym i den processen? alfaketoglutaratdehydrogenas glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas malatdehydrogenas pyruvatdehydrogenas";"1. glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas 2. pyruvatdehydrogenas 3. alfaketoglutaratdehydrogenas 4. malatdehydrogenas"
"2022-12-19";"4";"hemoglobin";"Hemoglobin och myoglobin innehåller den prostetiska gruppen heme. Denna innehåller ett järn (Fe²⁺) som ansvarar för inbindningen av syremolekyler. Beskriv varför bindning till syre påverkar hemoglobinets struktur och hur det i sin tur påverkar hemoglobinets syreaffinitet. Max 70 ord.";"";"Hemoglobin och myoglobin innehåller den prostetiska gruppen heme. Denna innehåller ett järn (Fe²⁺) som ansvarar för inbindningen av syremolekyler. Beskriv varför bindning till syre påverkar hemoglobinets struktur och hur det i sin tur påverkar hemoglobinets syreaffinitet. Max 70 ord.";"Järnatomens storlek gör att den inte får plats i mitten av hemegruppen. När syre binder in blir järnets atommoln mindre och kan således flyttas upp 0,4 Å in i hemeplanet. Då kommer även det proximala histidinet kopplat till järnet att flyttas upp samt den alfahelix den är kopplad till. Det påverkar strukturen på hemoglobinet där subenheterna totalt kommer vridas upp 15 grader till R-state med ökad affinitet för syre."
"2022-12-19";"16";"cellmembran";"Vilka påståenden om det eukaryota cellmembranet är korrekta? A: Fosfatidylserin finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. B: Kolesterol finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. C: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cellens utsida. D: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cytoplasman.";"";"Vilka påståenden om det eukaryota cellmembranet är korrekta? A: Fosfatidylserin finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. B: Kolesterol finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. C: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cellens utsida. D: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cytoplasman.";"Rätt svar 1. A 2. C"
"2022-12-19";"22";"enzymer";"Ett enzym uppvisar MichaelisMenten-kinetik. Behöver du känna till den totala enzymkoncentrationen för att bestämma konstanterna (i) Kₘ, (ii) Vmax eller (iii) kcat? Motivera ditt svar. ![[Pasted image 20251128085625.png]]";"";"Ett enzym uppvisar MichaelisMenten-kinetik. Behöver du känna till den totala enzymkoncentrationen för att bestämma konstanterna (i) Kₘ, (ii) Vmax eller (iii) kcat? Motivera ditt svar. ![[Pasted image 20251128085625.png]]";"Vmax motsvarar den maximala reaktionshastighet som är möjlig för en enzymkatalyserad reaktion och uppnås då alla enzym är bundna i enzym-substratkomplex. Vmax beror alltså av enzymkoncentratonen. Kₘ motsvarar den substratkoncentration då V = Vmax/2, alltså när hälften av enzymen har bundit substratet och är upptagna med katalys. Kₘ och Vmax kan bestämmas experimentellt för en reaktion genom att mäta den initiella reaktionshastigheten för varierande substratkoncentrationer men med samma enzymkoncentration. Värdena förs in i ett diagram där reaktionshastigheten blir en funktion av substratkoncentrationen (se nedan). När substratkoncentrationen går mot oändligheten kommer då V gå mot Vmax och man kan då matematiskt bestämma Vmax utan att känna till den exakta enzymkoncentrationen. Kₘ kan sedan bestämmas utifrån vid vilken substratkoncentration som V = Vmax/2. kcat är ett mått på hur många molekyler produkt som bildas per sekund och enzym, turnover number, och räknas således fram ur den maximala reaktionshastigheten dividerat med den totala enzymkoncentrationen. För att bestämma kcat krävs alltså att känna till den maximala enzymkoncentrationen."
"2022-12-19";"32";"pentosfosfatvägen";"Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? A: Den huvudsakliga regleringspunkten i pentosfosfatvägen är enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas. B: Ribulos-5-fosfat kan omvandlas till glukos-6-fosfat i den reversibla oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. C: NADPH är ett mycket viktigt oxidationsmedel i celler. D: Nedsatt funktion i pentosfosfatvägen kan orsaka hemolytisk anemi. Rätt svar";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? A: Den huvudsakliga regleringspunkten i pentosfosfatvägen är enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas. B: Ribulos-5-fosfat kan omvandlas till glukos-6-fosfat i den reversibla oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. C: NADPH är ett mycket viktigt oxidationsmedel i celler. D: Nedsatt funktion i pentosfosfatvägen kan orsaka hemolytisk anemi. Rätt svar";"A och D"
"2022-12-19";"26";"glykogen";"A) Vilka två enzymer hjälps åt att återuppbygga en delvis nedbruten glykogenpartikel genom att addera nya glukosenheter till strukturen? B) Vilken typ av bindning skapar respektive enzym?";"";"A) Vilka två enzymer hjälps åt att återuppbygga en delvis nedbruten glykogenpartikel genom att addera nya glukosenheter till strukturen? B) Vilken typ av bindning skapar respektive enzym?";"A) En delvis nedbruten glykogenpartikel har redan en primer i form av glykogenin, alltså behöver bara kedjorna elongeras och förgreningar bildas. Glykogensyntas kommer att förlänga kedjorna genom att addera glukosenheter medan branching enzyme kommer skapa förgreningar genom att flytta 7 glukosenheter. B) Glykogensyntas alfa 14 glykosidbindning Branching enzyme alfa 16 glykosidbindning"
"2022-12-19";"12";"rna-syntes";"Vilka två av följande alternativ beskriver funktioner för poly-A-svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? A: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Stimulerar translation. D: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid.";"";"Vilka två av följande alternativ beskriver funktioner för poly-A-svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? A: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Stimulerar translation. D: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid.";"Rätt svar 1. C 2. D"
"2022-12-19";"27";"citronsyracykeln";"A) Vilka molekyler av betydelse för energiomvandling bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Varför är citronsyracykeln inte aktiv i frånvaro av syre? Max 50 ord.";"";"A) Vilka molekyler av betydelse för energiomvandling bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Varför är citronsyracykeln inte aktiv i frånvaro av syre? Max 50 ord.";"A) 3 NADH och 1 FADH₂ B) För att citronsyracykeln ska ske krävs att det finns mitokondriellt NAD⁺ och FAD. Utan syre avstannar elektrontransportkedjan då syre behövs i komplex IV och därmed kan inte NADH och FADH₂ oxideras vilket är det enda sättet att återbilda NAD⁺ och FAD i mitokondriens matrix."
"2022-12-19";"13";"rna-syntes";"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet.";"";"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet.";"Rätt svar 1. A 2. D"
"2022-12-19";"17";"transport-över-cellmembran";"Proteinet på bilden förflyttas till plasmamembranet hos skelettmuskler som ett svar på insulinsignalering. A) Vilken är transportören? B) Vilken typ av transport sker? C) Vad händer med glukos när den kommit in i cellen och varför? Max 50 ord. ![[Pasted image 20251128085555.png]]";"";"Proteinet på bilden förflyttas till plasmamembranet hos skelettmuskler som ett svar på insulinsignalering. A) Vilken är transportören? B) Vilken typ av transport sker? C) Vad händer med glukos när den kommit in i cellen och varför? Max 50 ord. ![[Pasted image 20251128085555.png]]";"A) GLUT-4 B) Faciliterad diffusion C) Den kommer genom enzymet Hexokinas och förbrukning av 1 ATP bilda glukos 6-fosfat. Fosforyleringen gör att bärarproteinet inte längre känner igen glukosmolekylen och därmed kan den inte transporteras ut igen utan kommer, beroende på energikvoten, brytas ned i glykolysen eller användas för uppbyggnad av glykogen."
"2022-12-19";"23";"integrering-av-metabolismen";"Vad har molekylerna NADH, ATP, CoA och FADH₂ gemensamt? A: De är kinetiskt stabila. B: De är kinetiskt instabila. C: De är termodynamiskt stabila. D: De är termodynamiskt instabila.";"";"Vad har molekylerna NADH, ATP, CoA och FADH₂ gemensamt? A: De är kinetiskt stabila. B: De är kinetiskt instabila. C: De är termodynamiskt stabila. D: De är termodynamiskt instabila.";"A och D"
"2022-12-19";"33";"kolesterol";"Vilka av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? A: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol till en fettsyra. B: Den regleras främst via tillgången på fritt extracellulärt kolesterol. C: Den regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet HMG-CoA-reduktas. D: Att bilda kolesterolestrar är i de flesta celler irreversibelt för att återbildas till kolesterol behöver kolesterolestern först transporteras till levern via HDL. Rätt svar";"";"Vilka av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? A: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol till en fettsyra. B: Den regleras främst via tillgången på fritt extracellulärt kolesterol. C: Den regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet HMG-CoA-reduktas. D: Att bilda kolesterolestrar är i de flesta celler irreversibelt för att återbildas till kolesterol behöver kolesterolestern först transporteras till levern via HDL. Rätt svar";"A och C"
"2022-12-19";"24";"glukosmetabolism";"Det pyruvat som bildas vid anaerob glykolys behöver metaboliseras vidare. A) Vad bildas av pyruvatet? B) Vilken är orsaken till det? C) Vilket enzym katalyserar reaktionen? Max 50 ord.";"";"Det pyruvat som bildas vid anaerob glykolys behöver metaboliseras vidare. A) Vad bildas av pyruvatet? B) Vilken är orsaken till det? C) Vilket enzym katalyserar reaktionen? Max 50 ord.";"A) Laktat B) Cellen behöver återbilda NAD⁺ i cytoplasman för att inte glykolysen ska avstanna då det krävs i steg 6. Vid anaerob glykolys sker detta genom fermentering där pyruvat reduceras till laktat och NADH oxideras till NAD⁺. C) Laktatdehydrogenas"
"2022-12-19";"10";"nukleotider";"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonCrick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Helixen är högervriden. D: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'.";"";"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonCrick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Helixen är högervriden. D: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'.";"Rätt svar 1. A 2. C"
"2022-12-19";"9";"dna-replikation";"A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Vilken form har denna faktor?";"";"A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Vilken form har denna faktor?";"A) PCNA, eller sliding clamp som den också kallas, har funktionen att den sitter runt en av DNA-strängarna under replikation och håller fast DNA-polymeras på strängen. Det gör att processiviteten ökar upp till 50 gånger jämfört med utan PCNA då DNA-polymeras kan syntetisera långa sträckor DNA utan att ramla av. B) Ringformad"
"2022-12-19";"34";"plasmid";"Beskriv vad som karaktäriserar plasmider med konformationen supercoiled respektive relaxerad cirkulär, hur de bildas och hur de kan skiljas åt med gelelektrofores. Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska i tabellform eller i fritext. Max 75 ord.";"";"Beskriv vad som karaktäriserar plasmider med konformationen supercoiled respektive relaxerad cirkulär, hur de bildas och hur de kan skiljas åt med gelelektrofores. Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska i tabellform eller i fritext. Max 75 ord.";"I supercoiled kommer DNAt i plasmiden vara överdrivet tvinnat, så kallat supercoiled med högre linkingnumber än normalt. Därmed kommer det bildas en linjär struktur. I relaxerad cirkulär är plasmiden istället ringformat. De två olika konformationerna kommer möta olika stort motstånd av gelen under gelelektrofores till följd av att de har olika form och de kan således separeras baserat på att de kommer färdas olika långt. ![[Pasted image 20251128085752.png]]"
"2022-12-19";"14";"translation";"Beskriv sekundärstrukturen hos molekylen som transporterar aminosyror till ribosomen och förklara vilken funktionen är för varje del av strukturen. Rita gärna. ![[Pasted image 20251128085533.png]]";"";"Beskriv sekundärstrukturen hos molekylen som transporterar aminosyror till ribosomen och förklara vilken funktionen är för varje del av strukturen. Rita gärna. ![[Pasted image 20251128085533.png]]";"Strukturen som transporterar aminosyror till ribosomen kallas tRNA och byggs upp av RNA. I 2D, sekundärstruktur, är tRNA klöverformad och stabiliseras av vätebindningar mellan komplementära baspar i RNA kedjan. Den nedersta loopen, Antikodon loopen, innehåller ett antikodon på tre baser som är komplementärt till kodonet på mRNA och därmed aggerar som mellanhand mellan kodon och aminosyra vilket möjliggör för den genetiska koden. De andra två looparna spelar roll för interaktioner med exempelvis aminoacyl-tRNA syntetaser som kopplar ihop rätt aminosyra med rätt tRNA. De bidrar alltså till identifiering av det specifika tRNA:t. 5'-änden av tRNA kedjan är fosforylerad och i 3'-änden sitter en CCA-sekvens, så kallad acceptor stem. Till den fria OH-gruppen på 3'-änden av adenosin i acceptor stem kopplas aminosyran av aminoacyl-tRNA syntetaser."
"2022-12-19";"20";"heme";"Redogör för hur heme bryts ner och utsöndras. (2p)";"";"Redogör för hur heme bryts ner och utsöndras. (2p)";"Heme bryts ner i mjälten när röda blodkroppar bryts ner. Först bildas biliverdin som sedan omvandlas till bilirubin. Då bilirubin är en hydrofob molekyl kommer den att transporteras bunden till blodproteinet albumin via blodet till levern. I levern kommer bilirubinet konjugeras och då bli amfipatiskt för att sedan utsöndras via gallan."
"2022-12-19";"30";"aminosyrametabolism";"Nämn två aminosyror som genom transaminering kan omvandlas till citronsyracykelintermediärer vilket gör dem till glukogena aminosyror. Ange även vilken citronsyracykelintermediär respektive aminosyra bildar.";"";"Nämn två aminosyror som genom transaminering kan omvandlas till citronsyracykelintermediärer vilket gör dem till glukogena aminosyror. Ange även vilken citronsyracykelintermediär respektive aminosyra bildar.";"Glutamat kan omvandlas till alfaketoglutarat Aspartat kan omvandlas till oxalacetat"
"2022-12-19";"15";"evolution";"Cancerceller utvecklas från normala celler. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till.";"";"Cancerceller utvecklas från normala celler. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till.";"2.0p Evolution beror på variation och naturligt urval. Det sker mutationer ""ofta"", vilket ökar variationen inom en population. Många gånger är mutationen som uppstår sämre och försvinner. Ibland är en mutation bra och den blir selekterad (survival of the fittest) och lever kvar inom en population (evolution) Vid cancer så sker likaså mutationer, det kan vara mutationer som stör delningsprocessen i en cell (så att den ohämmat delar sig) eller mutationer som hämmar vårt immunsystem (vi kan ej bekämpa tumörer, p53). Cancerceller utvecklas alltså från våra egna celler (fast de är muterade och orsakar sjukdom). Cancerceller genomgår också mutationer. ""Vanligt"" är mutationer som stimulerar ohämmad delning och gör dem mer maligna. Cancerceller har en variation som gör dem ""starka"" och tar därför över i kroppen. 1.5p Evolutionen utgår från att det finns en genetisk variation och ett naturligt urval där de egenskaper som gynnar överlevnad i den aktuella miljön kommer föras vidare till nästa generation i större utsträckning. Genetisk variation uppnås bland annat genom slumpmässiga spontana mutationer i DNA. Mutationer kan då uppkomma i en cell som stänger av en tumörsupressorgen vilket då är ""gynnsamt"" för den individuella cellen som kan fortsätta dela sig. Andra mutationer kan då uppstå i en gen som kodar för reparation av DNA vilket möjliggör för ytterligare mutationer som aktiverar oncogener och stänger av andra tumörsupressorgener. Genom ett flertal steg där mutationer möjliggör för cellen att dela sig oftare och för fler mutationer att uppstå kan således en cancertumör utvecklas ur en normal cell."
"2022-12-19";"21";"betaoxidation";"Vilka av följande är ketonkroppar? A: Acetoacetat B: Hydroxy-metyl-glutarat C: Aceton D: Beta-hydroxy-acetat Rätt svar";"";"Vilka av följande är ketonkroppar? A: Acetoacetat B: Hydroxy-metyl-glutarat C: Aceton D: Beta-hydroxy-acetat Rätt svar";"A och C"
"2022-12-19";"31";"nukleotidnedbrytning";"Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? A: Gikt är en sjukdom som kan orsakas av defekter i enzymerna som bryter ner pyrimidin-nukleotider. B: Urat är en molekyl med två ringstrukturer. C: Nukleotidaser omvandlar nukleotider till nukleosider. D: Vid nedbrytning av nukleotiden AMP kommer molekylens samtliga kväveatomer slutligen hamna i urea som utsöndras med urinen.";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? A: Gikt är en sjukdom som kan orsakas av defekter i enzymerna som bryter ner pyrimidin-nukleotider. B: Urat är en molekyl med två ringstrukturer. C: Nukleotidaser omvandlar nukleotider till nukleosider. D: Vid nedbrytning av nukleotiden AMP kommer molekylens samtliga kväveatomer slutligen hamna i urea som utsöndras med urinen.";"Rätt svar 1. B 2. C"
"2022-12-19";"25";"glukosmetabolism";"Vilka faktorer är viktiga för regleringen av fosfofruktokinas 2/fruktos 2,6-bisfosfatas? A: Hormoner B: Cellens energikvot C: pH D: Fosforylering";"";"Vilka faktorer är viktiga för regleringen av fosfofruktokinas 2/fruktos 2,6-bisfosfatas? A: Hormoner B: Cellens energikvot C: pH D: Fosforylering";"Rätt svar 1. A 2. D"
"2022-12-19";"11";"rna-syntes";"A) Var återfinns alfa-amanitin i naturen? B) Vilket enzym inhiberar denna substans?";"";"A) Var återfinns alfa-amanitin i naturen? B) Vilket enzym inhiberar denna substans?";"A) I den lömska flugsvampen B) Substansen inhiberar RNA-polymeras II"
"2022-12-19";"8";"nukleotider";"A) Vilken kemisk grupp finns i 2-positionen hos ribonukleotider? B) Vad är AMP förkortning för?";"";"A) Vilken kemisk grupp finns i 2-positionen hos ribonukleotider? B) Vad är AMP förkortning för?";"A) Hydroxylgrupp (OH) B) Adenosinmonofosfat"
"2022-12-19";"35";"introduktionslaboration";"Du arbetar på en vårdcentral som specialistläkare. En försäljare från ett läkemedelsföretag är inbjuden för att presentera en ny medicin som påstås sänka kolesterolnivåerna i blodet med 30%. Vilka två 95%:iga konfidensintervall (CI95%) stöder detta påstående i minst utsträckning? A: 29,5% 30,5% B: 27% 33% C: 1% 60% D: 10% 70%";"";"Du arbetar på en vårdcentral som specialistläkare. En försäljare från ett läkemedelsföretag är inbjuden för att presentera en ny medicin som påstås sänka kolesterolnivåerna i blodet med 30%. Vilka två 95%:iga konfidensintervall (CI95%) stöder detta påstående i minst utsträckning? A: 29,5% 30,5% B: 27% 33% C: 1% 60% D: 10% 70%";"C och D"
"2022-12-19";"3";"från-aminosyror-till-proteiner";"Nyligen har det konstaterats att sjukdomen ALS (amyotrofisk lateral skleros) karaktäriseras av bildning av amyloider. Hur bildas de? Max 75 ord.";"";"Nyligen har det konstaterats att sjukdomen ALS (amyotrofisk lateral skleros) karaktäriseras av bildning av amyloider. Hur bildas de? Max 75 ord.";"Amyloider bildas då ett protein med alfahelixrik struktur övergår i en betaflaksrik struktur. Betaflaken kan sedan aggregeras och bilda långa fibrer, så kallade amyloider."
"2022-12-19";"7";"kolhydrater";"Kolhydrater finns förutom i fri form även bundna till lipider och proteiner. Vilka är de två vanligaste typerna av bindningar mellan kolhydrater och proteiner? (2p)";"";"Kolhydrater finns förutom i fri form även bundna till lipider och proteiner. Vilka är de två vanligaste typerna av bindningar mellan kolhydrater och proteiner? (2p)";"O-link: kolhydraten binder till OH-gruppen i sidokedjan på serin eller treonin i proteinet. N-link: kolhydraten binder till aminogruppen i en asparaginrests sidokedja i proteinet."
"2022-12-19";"6";"lipider";"Namnge och rita: A) Den principiella strukturen för lipiden som lagrar energi i adipocyter. B) Strukturen för den vanligaste membranlipiden.";"";"Namnge och rita: A) Den principiella strukturen för lipiden som lagrar energi i adipocyter. B) Strukturen för den vanligaste membranlipiden.";"Se 2022-12-19-0097-TUX för 2/2"
"2022-12-19";"2";"från-aminosyror-till-proteiner";"I metabolismen är det vanligt att enzymer regleras av cellens energikvot. A) Nämn två aminosyror som kan interagera med olika delar hos de molekyler som då fungerar som allosteriska regulatorer. B) Förklara vad som gör dessa aminosyror lämpliga för uppdraget. Max 75 ord.";"";"I metabolismen är det vanligt att enzymer regleras av cellens energikvot. A) Nämn två aminosyror som kan interagera med olika delar hos de molekyler som då fungerar som allosteriska regulatorer. B) Förklara vad som gör dessa aminosyror lämpliga för uppdraget. Max 75 ord.";"A) Negativt laddad lysin Som kan bilda vätebindningar Asparagin B) Vid allosterisk reglering av cellens energikvot kommer ATP respektive ADP/AMP binda in till enzymet. Fosfatgrupperna är negativt laddade vilket gör att de kan interaggera med positivt laddade sidokedjor som lysin genom jonbindningar. Kvävebasen adenin som är en del av molekylerna kommer innehålla kvävegrupper som kan bilda vätebindningar med en aminosyra som har karbonyl, hydroxyl- eller aminogrupper, som asparagin med både amino- och karbonylgrupp."
"2023-05-15";"28";"elektrontransportkedjan";"Vad menas med respirationskontroll? (1p) Max 25 ord.";"";"Vad menas med respirationskontroll? (1p) Max 25 ord.";"Reglering av cellandningen, dvs bildningen av ATP genom oxidativ fosforylering. Drivs av elektrontransportkedjan och den elektrokemiska gradient som uppstår, och regleras av cellens energikvot."
"2023-05-15";"5";"utforska-proteiner";"Du har fått i uppgift att göra en proteinrening med hjälp av gelfiltrering samt att analysera resultatet av denna. (2p) Max 200 ord. A) Beskriv metoden för gelfiltrering. B) Vilken egenskap hos proteinet bygger metoden på?";"";"Du har fått i uppgift att göra en proteinrening med hjälp av gelfiltrering samt att analysera resultatet av denna. (2p) Max 200 ord. A) Beskriv metoden för gelfiltrering. B) Vilken egenskap hos proteinet bygger metoden på?";"A) Gelfiltrering är en separationsmetod med avseende på storlek. Man preparerar en kolonn med ""beads"", dvs porösa gelékulor. Detta utgör den fasta fasen. Sedan tillsätts en lösning med det protein man vill separera ut, detta kallas för den mobila fasen. När den mobila fasen hälls till kolonnen kommer den att rinna igenom och elueras under kolonnen. Stora proteiner kommer att ta vägen förbi kulorna och därmed komma ut först. De små proteinerna kommer istället att gå igenom de porösa kulorna. Detta tar längre tid och de kommer därför komma ut sist. Resultatet blir en separation med avseende på storlek där störst går först. B) Separation med avseende på storlek, där störst går först."
"2023-05-15";"18";"termodynamik";"A) Redogör kort för vikten av jämviktskonstanten för biokemiska reaktioner. B) Hur är jämviktskonstanten definierad? (2p)";"";"A) Redogör kort för vikten av jämviktskonstanten för biokemiska reaktioner. B) Hur är jämviktskonstanten definierad? (2p)";"A) Jämviktskonstanten K anger förhållandet mellan substrat/reaktant och produkt. Om K = 1 betyder det att systemet är i jämvikt, mängden reaktant är lika stor som mängden produkt. Om K > 1 finns mer produkt än reaktant. Om K < 1 finns mer reaktant än produkt. Detta kan visa åt vilket håll en reaktion är förskjuten, och visar förhållandet mellan olika ämnen i ett system. I cellen är ofta flera reaktioner kopplade eller sker som en kedjereaktion. Det innebär att det som är produkt i en reaktion går vidare och utgör reaktant i en annan reaktion. Detta dynamiska samspel gör att jämviktskonstanten hela tiden kommer att förändras och gå åt olika håll. Det är bra, vi vill inte ha jämvikt (K = 1) i cellerna eftersom det då inte finns några gradienter eller någon reaktionsbenägenhet, vilket skulle innebära att alla livsviktiga processer avstannar och vi skulle dö. B) K = [produkt]/[reaktant]"
"2023-05-15";"1";"från-aminosyror-till-proteiner";"Rita aminosyran serin, R = CH₂OH, i S-konfiguration vid: A) pH 2 B) pH 7 C) pH 12 (2p)";"";"Rita aminosyran serin, R = CH₂OH, i S-konfiguration vid: A) pH 2 B) pH 7 C) pH 12 (2p)";"1.5 av 2 Svar (text + ritning på separat papper) A) Vid lågt pH finns mycket fria H⁺, aminogruppen kommer att vilja motverka pH-sänkningen och ta upp en H⁺ och får således en positiv laddning. B) Vid neutralt pH kommer aminosyran vara en zwitterjon, dvs ha både en positiv och en negativ laddning men ingen nettoladdning. C) Vid högt pH kommer karboxylgruppen vilja motverka detta genom att avge H⁺, därav kommer denna att få en negativ laddning. ![[Pasted image 20251129235001.png]]"
"2023-05-15";"19";"enzymer";"Ett enzym uppvisar MichaelisMenten-kinetik. A) Hur kan man i ett V mot [S]-diagram avläsa de två konstanterna Kₘ och Vmax? B) Förklara vad som händer med Kₘ respektive Vmax om man tillsätter en kompetitiv hämmare. (2p)";"";"Ett enzym uppvisar MichaelisMenten-kinetik. A) Hur kan man i ett V mot [S]-diagram avläsa de två konstanterna Kₘ och Vmax? B) Förklara vad som händer med Kₘ respektive Vmax om man tillsätter en kompetitiv hämmare. (2p)";"A) Om ett enzym uppvisar MichaelisMenten-kinetik kommer vi i ett sådant diagram se en hyperbol kurva där reaktionshastigheten ökar och går mot den maximala reaktionshastigheten med ökningen av substratets koncentration. Varje reaktion har ett Vmax, det vill säga den maximala hastighet en reaktion kan nå då samtliga enzym är bundna till substratet. När kurvan planar ut är V nära Vmax och kommer mycket långsamt fortsätta gå mot Vmax med en ökande substratkoncentration. Kₘ är den substratkoncentration för vilken reaktionshastigheten uppnår 1/2 Vmax. Kₘ är alltså den punkt på kurvan där V når halva Vmax. B) En kompetitiv inhibitor kommer att binda till enzymets aktiva säte och hindra det tänkta substratet från att binda in. Det uppstår alltså konkurrens om att binda in till de enzym som finns. Detta innebär att enzymets affinitet för substratet minskar och det betyder att vi vid närvaro av inhibitorn kommer att få ett lägre Kₘ-värde än utan. Om substratet hinner binda enzymet innan inhibitorn gör det finns det inget som hindrar att den tänkta produkten bildas. Vmax kommer alltså inte att förändras, det kommer bara krävas en högre substratkoncentration för att lyckas konkurrera ut inhibitorn."
"2023-05-15";"29";"aminosyrametabolism";"Från vilka alfa-ketosyror kan aminosyrorna nedan bildas med hjälp av två kliniskt viktiga enzymer tillhörande gruppen aminotransferaser? Ange också från vilken metabol väg respektive alfa-ketosyra hämtas. (2p) A) Alanin B) Aspartat";"";"Från vilka alfa-ketosyror kan aminosyrorna nedan bildas med hjälp av två kliniskt viktiga enzymer tillhörande gruppen aminotransferaser? Ange också från vilken metabol väg respektive alfa-ketosyra hämtas. (2p) A) Alanin B) Aspartat";"A) Pyruvat → Alanin. Sker med hjälp av ALAT (alaninaminotransferas). Alfaketosyran är pyruvat och hämtas från glykolysen. B) Oxaloacetat → Aspartat. Sker med hjälp av ASAT (aspartataminotransferas). Alfaketosyran är oxaloacetat och hämtas från citronsyracykeln."
"2023-05-15";"4";"hemoglobin";"Nämn de allosteriska regulatorerna för hemoglobin och ange om de höjer eller sänker hemoglobinets syreaffinitet. (2p) Max 25 ord.";"";"Nämn de allosteriska regulatorerna för hemoglobin och ange om de höjer eller sänker hemoglobinets syreaffinitet. (2p) Max 25 ord.";"1.5 av 2: CO₂: bildar kolsyra & karbamatjoner, sänker pH. H⁺: interagerar med sidokedjor, uppstår jonbindningar. 2,3-BPG: binder subenheterna, förhindrar konformationsändring. Samtliga stabiliserar T-state, sänker affiniteten för syre."
"2023-05-15";"16";"transport-över-cellmembran";"![[Pasted image 20251129235023.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns det? C) Vilken är drivkraften för transporten? (2p) Max 30 ord.";"";"![[Pasted image 20251129235023.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns det? C) Vilken är drivkraften för transporten? (2p) Max 30 ord.";"A) En antiport. B) I mitokondriens inre membran. C) Energikvoten. Dvs fördelningen mellan ATP och ADP innanför respektive utanför mitokondriens inre membran."
"2023-05-15";"22";"glykolysen";"Du är lite sen till bussen och behöver springa den sista biten för att inte missa den. När du slår dig ned är du varm och andas häftigt. Det gör också lite ont i lårmusklerna. A) Vilka metabola vägar aktiverades när du började springa och varför? B) Förklara med hjälp av termodynamik varför du har blivit varm. (Max 120 ord) (3p)";"";"Du är lite sen till bussen och behöver springa den sista biten för att inte missa den. När du slår dig ned är du varm och andas häftigt. Det gör också lite ont i lårmusklerna. A) Vilka metabola vägar aktiverades när du började springa och varför? B) Förklara med hjälp av termodynamik varför du har blivit varm. (Max 120 ord) (3p)";"2 av 3: A) När jag började springa förbrukades energi. Glykolysen omvandlade blodglukos till pyruvat för att skapa mer ATP via citronsyracykeln, ETK och oxidativ fosforylering. Glykogen lagrat i musklerna bröts ner för att frigöra energi där. B) När ett arbete utförs kommer alltid lite av energin att gå till spillo och bli till kinetisk energi/värme. Tack vare att alla processer i kroppen är uppdelade i många men mindre steg kan vi ta tillvara på en större del av den tillgängliga energin, vi får alltså en större verkningsgrad än t.ex. en förbränningsmotor. Vår verkningsgrad är ca 50%, det innebär att hälften av den energi jag förbrukade när jag sprang frigjordes i form av värme och det var därför jag blev varm."
"2023-05-15";"32";"nukleotidnedbrytning";"I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i nedanstående två nukleosider när dessa bryts ner? Ange en molekyl för respektive nukleosid. (1p) A) Inosin B) Cytidin";"";"I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i nedanstående två nukleosider när dessa bryts ner? Ange en molekyl för respektive nukleosid. (1p) A) Inosin B) Cytidin";"A) Urat. B) Urea."
"2023-05-15";"26";"lipider";"Din kompis har bestämt sig för att utesluta fett ur sin diet med målet att minska sina fettförråd. Du som har studerat metabolism ser en svaghet i strategin. Redogör för den svagheten på molekylär nivå. (Max 75 ord) (2p)";"";"Din kompis har bestämt sig för att utesluta fett ur sin diet med målet att minska sina fettförråd. Du som har studerat metabolism ser en svaghet i strategin. Redogör för den svagheten på molekylär nivå. (Max 75 ord) (2p)";"AI: Utan fett i kosten minskar tillgången på essentiella fettsyror och framför allt på oxaloacetat, som krävs för att acetyl-CoA ska kunna gå in i citronsyracykeln. Brist på kolhydrater och fett gör att oxaloacetat används för glukoneogenes, vilket hindrar fullständig fettoxidation. Fettförbränningen bromsas alltså snarare än ökar, och ketonkroppar kan bildas."
"2023-05-15";"12";"kromatin";"Vilka två påståenden om kromatin stämmer bäst? (1p) A: Acetylering gör histonsvansar mer positivt laddade. B: Topoisomeraser kan reglera aktiviteten i en kromatinfiber-loop. C: Histon H1 destabiliserar nukleosomen. D: Nukleosomen har en kärna av 8 histonproteiner.";"";"Vilka två påståenden om kromatin stämmer bäst? (1p) A: Acetylering gör histonsvansar mer positivt laddade. B: Topoisomeraser kan reglera aktiviteten i en kromatinfiber-loop. C: Histon H1 destabiliserar nukleosomen. D: Nukleosomen har en kärna av 8 histonproteiner.";"B och C"
"2023-05-15";"27";"elektrontransportkedjan";"Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (1p) Komponenter: Coenzym Q CuB Cytokrom C NADH";"";"Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (1p) Komponenter: Coenzym Q CuB Cytokrom C NADH";"1. NADH 2. Coenzym Q 3. Cytokrom C 4. CuB"
"2023-05-15";"13";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Vilken roll spelar sigma-faktorn vid prokaryot transkription? (2p)";"";"Vilken roll spelar sigma-faktorn vid prokaryot transkription? (2p)";"Sigmafaktorn är en av de 6 subenheter som ingår i det prokaryota polymeraset. Sigmafaktorns uppgift är att hjälpa polymeraset att snabbare hitta fram till rätt promotor. Polymeraset med sigmafaktorn åker längs med DNA till dess att rätt promotor hittas. Sigmafaktorns effekt är att polymeraset binder lösare till ospecifikt DNA, vilket gör att det kan glida längs DNA utan att fastna på fel ställe. Utan sigmafaktorn hade polymeraset bundit mycket starkare till ospecifikt DNA, vilket hade försvårat processen då det hade haft problem med att glida längs DNA utan att fastna på fel ställe. När sigmafaktorn väl hittat och bundit till rätt promotor kan transkriptionen börja. Då kommer sigmafaktorn att falla av, eftersom vi nu vill att polymeraset ska sitta fast vid DNA för att kunna utföra transkriptionen korrekt."
"2023-05-15";"17";"cellmembran";"Var hittas ett GPI-ankare och vad har det för funktion? (2p)";"";"Var hittas ett GPI-ankare och vad har det för funktion? (2p)";"Ett GPI-ankare är ett perifert membranprotein. Det sitter förankrat till cellmembranet via fosfatgrupper och sockerstrukturer. GPI-ankaret kan mobiliseras väldigt snabbt genom att klippas loss med hjälp av lipaser. Vid en synaps i t.ex. en muskel kommer transmittorsubstansen acetylkolin på en impuls frisättas och leda till muskelkontraktion. För att kontraktionen ska upphöra måste acetylkolin plockas bort från muskelcellens receptorer, och det sker via acetylkolinesteras. Acetylkolinesteras sitter bundet till axonterminalen via ett GPI-ankare, vilket gör att det då snabbt kan frigöras och avsluta muskelkontraktionen."
"2023-05-15";"23";"glykogen";"Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (1p) A: Glykogenet i skelettmuskel bryts ner hela vägen till glukos som sedan används för att generera energi i form av ATP till muskelcellen själv. B: Höga intracellulära nivåer av AMP kan stimulera glykogenolys i skelettmuskel. C: Intracellulär signalering inducerad av hormonet glukagon stimulerar glykogenolys och hämmar glykogenes i skelettmuskel. D: Utan ett funktionellt debranching enzyme kan bara en mindre del av leverns glykogenförråd utnyttjas för att höja blodets glukoskoncentration i en fastesituation.";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (1p) A: Glykogenet i skelettmuskel bryts ner hela vägen till glukos som sedan används för att generera energi i form av ATP till muskelcellen själv. B: Höga intracellulära nivåer av AMP kan stimulera glykogenolys i skelettmuskel. C: Intracellulär signalering inducerad av hormonet glukagon stimulerar glykogenolys och hämmar glykogenes i skelettmuskel. D: Utan ett funktionellt debranching enzyme kan bara en mindre del av leverns glykogenförråd utnyttjas för att höja blodets glukoskoncentration i en fastesituation.";"C och D"
"2023-05-15";"33";"heme";"Vilken typ av bilirubin är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? (1p)";"";"Vilken typ av bilirubin är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? (1p)";"Det okonjugerade bilirubinet. Bilirubin är en hydrofob molekyl. I normala fall kommer bilirubin i levern att konjugeras med två glukuronsyra som gör att molekylen blir vattenlöslig och kan utsöndras med gallsyran. Om denna konjugering inte sker kan bilirubin inte utsöndras, och därför är det denna variant vi kommer att se förhöjda halter av vid sjukdom."
"2023-05-15";"24";"citronsyracykeln";"Vilka två av nedanstående enzymer återfinns i citronsyracykeln? (1p) A: Succinatdehydrogenas B: Pyruvatdehydrogenas C: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas";"";"Vilka två av nedanstående enzymer återfinns i citronsyracykeln? (1p) A: Succinatdehydrogenas B: Pyruvatdehydrogenas C: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas";"A och D"
"2023-05-15";"10";"rna-syntes";"Vilka två alternativ är korrekta vad gäller 5' cap hos eukaryot mRNA? (1p) A: Stimulerar syntes av polyA-svansen. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Skyddar mRNA från nedbrytning. D: Består av nukleotid bunden via en 55 bindning.";"";"Vilka två alternativ är korrekta vad gäller 5' cap hos eukaryot mRNA? (1p) A: Stimulerar syntes av polyA-svansen. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Skyddar mRNA från nedbrytning. D: Består av nukleotid bunden via en 55 bindning.";"C och D"
"2023-05-15";"9";"nukleotider";"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonCrick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'. B: Ett varv av DNA motsvarar ca 10,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är vänstervriden.";"";"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonCrick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'. B: Ett varv av DNA motsvarar ca 10,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är vänstervriden.";"B och C"
"2023-05-15";"34";"introduktionslaboration";"Du ska labba! Beskriv fyra saker som du behöver göra innan du börjar experimentera. (2p) Max 50 ord.";"";"Du ska labba! Beskriv fyra saker som du behöver göra innan du börjar experimentera. (2p) Max 50 ord.";"Förbereda mig genom att läsa igenom labb-handledningen så att jag vet vad jag ska göra. Lämna ytterkläder och väska och ta på mig labbrock. Tvätta av bänken med minst 75% etanol. Vid behov, ta på mig handskar."
"2023-05-15";"14";"translation";"Beskriv strukturen och funktionen av aminoacyl-tRNA syntetas översiktligt samt förklara vad som sker i aminoacyl-tRNA syntetas om fel aminosyra binder till tRNA. (2p) Max 150 ord.";"";"Beskriv strukturen och funktionen av aminoacyl-tRNA syntetas översiktligt samt förklara vad som sker i aminoacyl-tRNA syntetas om fel aminosyra binder till tRNA. (2p) Max 150 ord.";"Aminoacyl-tRNA syntetas är ett enzym som katalyserar inbindning av en aminosyra till sin motsvarande tRNA-molekyl för att kunna nyttjas i translationen och kopplas ihop med andra aminosyror. Aminoacyl-tRNA syntetas har två olika delar som är avgörande för funktionen. Det finns ett active site, dit aminosyran binder för att sedan kunna länkas till en OH-grupp på tRNA-molekylens CCA-svans. Sedan finns också ett editing site. Enzymet kommer att känna av om kopplingen mellan aminosyran och tRNA blev rätt eller inte. Om det blev fel kommer editing siten direkt att spjälka loss aminosyran från tRNA för att via active site kunna sätta dit en ny. Det finns en god flexibilitet hos enzymet som gör att dessa två olika delar enkelt kan samarbeta för att snabbt åtgärda ett eventuellt fel."
"2023-05-15";"20";"enzymer";"Vilka två av nedanstående behöver du känna till för att beräkna omsättningstalet för ett enzym? (1p) A: Enzymstrukturen. B: Enzymkoncentrationen. C: Initialhastigheten för den katalyserade reaktionen vid [S] >> Kₘ. D: Kₘ för substratet.";"";"Vilka två av nedanstående behöver du känna till för att beräkna omsättningstalet för ett enzym? (1p) A: Enzymstrukturen. B: Enzymkoncentrationen. C: Initialhastigheten för den katalyserade reaktionen vid [S] >> Kₘ. D: Kₘ för substratet.";"B och C"
"2023-05-15";"30";"pentosfosfatvägen";"Varför är tillgång av NADPH essentiellt för ett fungerande glutationsystem? (1p) Max 50 ord.";"";"Varför är tillgång av NADPH essentiellt för ett fungerande glutationsystem? (1p) Max 50 ord.";"Glutation är en antioxidant som reducerar reaktiva syreföreningar, ex väteperoxid till vatten. För att reaktionen ska kunna ske igen måste glutation reduceras tillbaka till sin ursprungsform. Det är NADPH som fungerar som reduktionsmedel och oxideras till NADP⁺. Utan NADPH förblir glutation oxiderat och kan inte reducera fler farliga syreradikaler."
"2023-05-15";"15";"evolution";"Coronavirus ändrades mycket under pandemin, från en ganska dödlig variant som var lagom smittsam till en variant som är relativt ofarlig men mycket smittsam. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till. (2p)";"";"Coronavirus ändrades mycket under pandemin, från en ganska dödlig variant som var lagom smittsam till en variant som är relativt ofarlig men mycket smittsam. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till. (2p)";"1 av 2: Med tiden har celler, organismer och hela populationer förändrats efter rådande omständigheter. Miljön påverkar och leder till att egenskaper som är gynnsamma för en organisms överlevnad i den aktuella miljön kommer att bevaras medan egenskaper som inte är gynnsamma kommer att selekteras bort hos kommande generationer. Coronaviruset genomgick en sådan förändring. Till en början var viruset mindre smittsamt men hade en högre dödlighet hos de smittade. Människor kom fram med sätt att skydda sig mot viruset och metoder för att bli frisk om man blivit smittad. Viruset mötte motstånd som hotade dess fortsatta utveckling och överlevnad. Omgivningen fick alltså viruset att utveckla nya egenskaper som var mer gynnsamma för att kunna fortsätta utvecklas och leva vidare. Det var i detta fall att bli mindre dödligt men desto mer smittsamt. Omgivningens selektionstryck kommer alltså leda till en förändring hos organismen där de mest fördelaktiga egenskaperna för dess överlevnad kommer att bevaras och utvecklas vidare."
"2023-05-15";"21";"introduktion-till-metabolismen";"Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) A: ATP stimulerar katabolism. B: ATP innehåller en energirik fosfoanhydridbindning för varje fosfatgrupp. C: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan negativa laddningar. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i CTP.";"";"Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) A: ATP stimulerar katabolism. B: ATP innehåller en energirik fosfoanhydridbindning för varje fosfatgrupp. C: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan negativa laddningar. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i CTP.";"C och D"
"2023-05-15";"31";"kolesterol";"Beskriv översiktligt kolesterolets omsättning i kroppen: var det kommer ifrån, två viktiga funktioner och hur det kan utsöndras. (2p)";"";"Beskriv översiktligt kolesterolets omsättning i kroppen: var det kommer ifrån, två viktiga funktioner och hur det kan utsöndras. (2p)";"Kolesterol kan antingen bildas i kroppen eller intas via födan. För en person som väger ca 70 kg och har en västerländsk diet får man i sig ca 500700 mikrogram kolesterol via födan varje dygn och ca 50% av detta tas upp i kroppen. Syntes av kolesterol kommer att ske ändå, men i vilken utsträckning varierar beroende på kostsammansättningen. Kolesterol är en viktig komponent i våra cellmembran där det påverkar membranets fluiditet och skyddar membranet från att fluiditeten ska bli för hög eller låg vid temperaturförändringar i kroppen. Kolesterol utgör också grundstrukturen i syntesen av katekolaminer i binjuren, exempelvis testosteron, testosteron och progesteron. När kolesterol bryts ner kommer det att utsöndras gallan."
"2023-05-15";"25";"betaoxidation";"Vilka två av nedanstående påståenden om ketonkroppar är korrekta? (1p) A: De syntetiseras i njuren. B: De kan betraktas som vattenlösliga transportformer av oxaloacetat i blodbanan. C: Höga halter av ketonkroppar ger metabol acidos. D: De används som energikälla i hjärtmuskel och njurcortex.";"";"Vilka två av nedanstående påståenden om ketonkroppar är korrekta? (1p) A: De syntetiseras i njuren. B: De kan betraktas som vattenlösliga transportformer av oxaloacetat i blodbanan. C: Höga halter av ketonkroppar ger metabol acidos. D: De används som energikälla i hjärtmuskel och njurcortex.";"C och D"
"2023-05-15";"11";"dna-replikation";"Enzymet flap endonuclease 1 (FEN1) är viktigt vid eukaryot DNA-replikation. Vad gör detta enzym? (2p)";"";"Enzymet flap endonuclease 1 (FEN1) är viktigt vid eukaryot DNA-replikation. Vad gör detta enzym? (2p)";"FEN1 är verksamt vid lagging strand under Okazaki fragment maturation. Eftersom lagging strand syntetiseras i flera sekvenser finns det flera primers med RNA inne i den nysyntetiserade strängen. I färdigt DNA vill vi inte ha något RNA kvar, detta måste på något sätt plockas bort. När polymeraset syntetiserar ett fragment kommer det slutligen krocka in i RNA-primern som utgjorde starten för det föregående fragmentet. När polymeraset och primern krockar kommer primern puttas bort och hänga som en liten svans från DNA-strängen. Då är det FEN1 som med sin endonukleasaktivitet klipper bort primern så att enbart DNA återstår i den nya strängen."
"2023-05-15";"8";"nukleotider";"De olika kolatomerna i ribos och deoxyribos numreras som 1', 2', 3', 4' och 5'. (2p) A) Vad skiljer ribos från deoxyribos? B) Till vilken position är basen kopplad?";"";"De olika kolatomerna i ribos och deoxyribos numreras som 1', 2', 3', 4' och 5'. (2p) A) Vad skiljer ribos från deoxyribos? B) Till vilken position är basen kopplad?";"A) Ribos har en OH-grupp kopplad till både 2´ och 3´ position. Deoxyribos har också en OH-grupp vid 3´ position, men enbart ett väte i 2´ position. B) Kvävebasen är kopplad till pentosens 1´ position."
"2023-05-15";"35";"plasmid";"Vilka två av nedanstående används som substrat för beta-galaktosidas vid blåvit screening? (1p) A: IPTG B: X-gal C: Beta-laktamas D: 5-Bromo-4-Chloro-3-Indolyl beta-D-Galctopyranoside";"";"Vilka två av nedanstående används som substrat för beta-galaktosidas vid blåvit screening? (1p) A: IPTG B: X-gal C: Beta-laktamas D: 5-Bromo-4-Chloro-3-Indolyl beta-D-Galctopyranoside";"B och D"
"2023-05-15";"3";"från-aminosyror-till-proteiner";"Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp vardera som deras R-grupper kan delta i när pH = 7. (1p) Aminosyror: Cystein Glutamat Treonin Tryptofan Bindningstyper: Jonbindning Kovalent bindning van der Waals interaktion Vätebindning";"";"Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp vardera som deras R-grupper kan delta i när pH = 7. (1p) Aminosyror: Cystein Glutamat Treonin Tryptofan Bindningstyper: Jonbindning Kovalent bindning van der Waals interaktion Vätebindning";"Cystein: Kovalent bindning Glutamat: Jonbindning Treonin: Vätebindning Tryptofan: van der Waals interaktion"
"2023-05-15";"7";"cellmembran";"Membranlipider är amfipatiska. Vad betyder amfipati och varför är det en nödvändig egenskap för membranlipider? (2p) Max 75 ord.";"";"Membranlipider är amfipatiska. Vad betyder amfipati och varför är det en nödvändig egenskap för membranlipider? (2p) Max 75 ord.";"En molekyl som är amfipatisk har både en hydrofob och en hydrofil del. Både fosfolipiderna och kolesterol är amfipatiska molekyler. Egenskapen gör att membranlipiderna kan orientera sig så att det bildas ett dubbellager med samtliga molekylers hydrofoba delar riktade in mot varandra och membranets mitt medan dess hydrofila delar riktas mot cytoplasman respektive extracellulärmatrix. Amfipati är alltså en nödvändig egenskap för att kunna bilda ett cellmembran som kan interagera med omgivningen och utgöra en barriärfunktion."
"2023-05-15";"6";"kolhydrater";"A) Vad kallas den kovalenta bindningen som binder ihop två monosackarider (till exempel i en di- eller trisackarid)? B) Ange två skäl till varför tre hexoser kan resultera i många fler olika trisackarider än antalet olika tripeptider tre aminosyror kan resultera i. (2p) Max 100 ord.";"";"A) Vad kallas den kovalenta bindningen som binder ihop två monosackarider (till exempel i en di- eller trisackarid)? B) Ange två skäl till varför tre hexoser kan resultera i många fler olika trisackarider än antalet olika tripeptider tre aminosyror kan resultera i. (2p) Max 100 ord.";"1 av 2: A) Glykosidbindning. B) Det finns 20 proteinogena aminosyror. Dessa kan förekomma i L- och D-form efter hur de bryter ljus. I kroppen finns bara aminosyror av L-form, det innebär att det i kroppen endast finns 20 olika aminosyror att välja mellan i skapandet av en tripeptid. Antalet möjliga kombinationer är begränsat. Det finns många olika monosackarider. Dessa kan likt aminosyrorna också förekomma i olika former, så kallade stereoisomerer. Skillnaden är att det finns väldigt många fler monosackarider och fler isomerer av dessa som kan förekomma i kroppen. Det gör att det finns en större möjlig variation vid bildandet av en trisackarid."
"2023-05-15";"2";"från-aminosyror-till-proteiner";"I pyruvatdehydrogenaskomplexet överförs en av reaktionsintermediärerna från en subenhet till en annan och till det används sidogruppen av en aminosyra kopplad med en kovalent bindning till en prostetisk grupp. (2p) Max 30 ord. A) Vilken aminosyra är lämplig för uppdraget och varför? B) Förklara kortfattat syftet med överföringen.";"";"I pyruvatdehydrogenaskomplexet överförs en av reaktionsintermediärerna från en subenhet till en annan och till det används sidogruppen av en aminosyra kopplad med en kovalent bindning till en prostetisk grupp. (2p) Max 30 ord. A) Vilken aminosyra är lämplig för uppdraget och varför? B) Förklara kortfattat syftet med överföringen.";"A) Serin. Är en alkohol, har OH-grupp som kan bilda vätebindning till kväveatomer hos lipoamidarmen. B) Acetylgrupp överförs av lipoamidarmen från E1 till E2 där den blir acetyl-CoA."
"2024-12-20";"28";"elektrontransportkedjan";"Vid reduktion av syre bildas små mängder reaktiva syreföreningar. Ange två enzymer som oskadliggör dessa. (2p) Max 10 ord.";"";"Vid reduktion av syre bildas små mängder reaktiva syreföreningar. Ange två enzymer som oskadliggör dessa. (2p) Max 10 ord.";"1. Glutation perioxidas 2. Superoxid dismutas"
"2024-12-20";"5";"cellmembran";"Redogör för hur bakterier/anpassning av cellmembranets fluiditet kan ske via fettsyrornas egenskaper. (4p)";"";"Redogör för hur bakterier/anpassning av cellmembranets fluiditet kan ske via fettsyrornas egenskaper. (4p)";"Fettsyror i cellmembran är amfipatiska, och har alltså en polär del (huvud) och en opolär del (svans). Den opolära delen består av acylgrupper, som binder till varandra via VdW-krafter, vilket inte är så starka bindningar och börjar därför lossna vid värmetillförsel (även om det inte är så hög temperatur). Fluiditeten i cellmembran ökar när temperaturen ökar, eftersom fettsyrorna börjar att röra på sig av värmeenergin. För att cellmembranet inte ska bli alltför genomsläppligt så fungerar kolesterol som en buffert som minskar på rörelsen hos fettsyrorna. Och tvärtom gäller det att när temperaturen sjunker så minskar fettsyrornas rörelseenergi, och de börjar att binda hårdare till varandra. För att cellmembranet inte ska klumpa ihop sig, och bli helt ogenomsläppligt så fungerar kolesterolet även här som en buffert som sitter mellan fettsyrorna och sänker möjligheten för ihopklumpning av fettsyrorna."
"2024-12-20";"18";"enzymer";"Chymotrypsin är ett enzym som använder kovalent katalys, vilken lämnar en kovalent bunden polypeptid till ett serin i enzymet efter att peptidbindningen har spjälkats. Redogör för den kemiska mekanism med vilken enzymet regenereras. (4p)";"";"Chymotrypsin är ett enzym som använder kovalent katalys, vilken lämnar en kovalent bunden polypeptid till ett serin i enzymet efter att peptidbindningen har spjälkats. Redogör för den kemiska mekanism med vilken enzymet regenereras. (4p)";"Brevid serinet finns histidin, som en del av den katalytiska triaden (med bredvid menas endast i den katalytiska triaden, eftersom i primärstrukturen ligger serin och histidin inte brevid varandra). När en vattenmolekyl kommer in i den katalytiska klyftan så kommer histidinet att ta upp ett väte från vattenmolekylen, vilket aktiverar syremolekylen i vattnet. Syremolekylen utför en nukleofil attack på bindningen mellan serin och polypeptiden, och syret från vattnet binder till polypeptiden istället för serin. Detta gör att peptiden och OH-gruppen från vattnet lämnar den katalytiska klyftan, och att histidin donerar sitt väte som den tog från vattnet till serinet så att serin återgår till att ha en OH-grupp i sin sidokedja så att enzymet regenereras till sin ursprungsform."
"2024-12-20";"1";"kemiska-bindingar";"Förklara vad som menas med att en molekyl är resonansstabiliserad och vad det innebär för molekylen. Illustrera med ett valfritt exempel. (4p) Max 30 ord. Illustrationen görs på ett separat papper.";"";"Förklara vad som menas med att en molekyl är resonansstabiliserad och vad det innebär för molekylen. Illustrera med ett valfritt exempel. (4p) Max 30 ord. Illustrationen görs på ett separat papper.";"""Mellanläge"" mellan enkelbindning och dubbelbindning, så styrkan på en resonansstabiliserad bindning är mellan enkelbindning och dubbelbindning. Atomer delar på elektronerna, så molekylen kan stabiliseras och finnas i flera konfigurationer. Ritning: ATP med streckade bindningar mellan PO som visar resonans (sid 8). ![[Pasted image 20251129235730.png]]"
"2024-12-20";"19";"enzymer";"Ett enzym uppvisar Michaelis-Menten kinetik, vilket gör det möjligt att bestämma dess Km-värde. Km kan man använda för att förstå: (2p) A: Hur snabbt det går för bundet substrat att bli omsatt till frisatt produkt. B: Hur sannolikt det är att substrat binder till enzymet. C: Hur bra ett enzym kan skilja mellan olika möjliga substrat. D: Hur sannolikt det är att substrat lossnar från enzymet när det har bundit.";"";"Ett enzym uppvisar Michaelis-Menten kinetik, vilket gör det möjligt att bestämma dess Km-värde. Km kan man använda för att förstå: (2p) A: Hur snabbt det går för bundet substrat att bli omsatt till frisatt produkt. B: Hur sannolikt det är att substrat binder till enzymet. C: Hur bra ett enzym kan skilja mellan olika möjliga substrat. D: Hur sannolikt det är att substrat lossnar från enzymet när det har bundit.";"C och D"
"2024-12-20";"29";"lipider";"Beskriv hur triacylglycerol i fettceller bryts ner till fria fettsyror. (4p)";"";"Beskriv hur triacylglycerol i fettceller bryts ner till fria fettsyror. (4p)";"Adrenalin eller glukagon inducerar intracellulära reaktioner via 7TM, vilket omvandlar ATP till cAMP. cAMP aktiverar proteinkinas A, som i sin tur aktiverar perilipin. Perilipin omarrangerar TAG så att ATGL kan klyva den första fettsyran (TAG blir DAG). Proteinkinas A aktiverar HS lipas som spjälkar den andra fettsyran (DAG till MAG). MAG lipas spjälkar den tredje fettsyran, så att det bara blir kvar glycerol."
"2024-12-20";"4";"utforska-proteiner";"Du ska rena ett protein med gelfiltrering. Proteinet innehåller också en his-tagg. (4p) Max 200 ord. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med gelfiltrering. B) Beskriv vad en his-tag är och hur den kan användas för rening och detektion.";"";"Du ska rena ett protein med gelfiltrering. Proteinet innehåller också en his-tagg. (4p) Max 200 ord. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med gelfiltrering. B) Beskriv vad en his-tag är och hur den kan användas för rening och detektion.";"A) Gelfiltrening består av en fast fas med porösa kulor i en kolonn, och en mobil fas med en buffert och proteinet som ska renas. Små molekyler kommer att fastna i håligheterna i kulorna, medan stora proteiner kommer att komma ut först. Reningsmetoden är alltså baserad på proteiners storlek. B) His-tagg är en sekvens av 6 histidin-aminosyror efter varandra. His-tagg binder starkt till nickel-joner och man kan därför använda den egenskapen vid rening av proteinet. Man använder då affinitetskromatografi, och renar proteinet baserat på selektivitet alltså en specifik egenskap. Proteinet kan sedan elueras med Imidazol, som konkurrerar ut His-taggen."
"2024-12-20";"16";"transport-över-cellmembran";"Para ihop respektive molekyl med en typ av transport den kan genomgå. Varje alternativ får enbart användas en gång. (2p) A: Glukos B: O₂ C: K⁺ D: Vatten Transporttyper: A: Sekundär aktiv transport B: Primär aktiv transport C: Passiv transport D: Fri diffusion";"";"Para ihop respektive molekyl med en typ av transport den kan genomgå. Varje alternativ får enbart användas en gång. (2p) A: Glukos B: O₂ C: K⁺ D: Vatten Transporttyper: A: Sekundär aktiv transport B: Primär aktiv transport C: Passiv transport D: Fri diffusion";"Glukos → Sekundär aktiv transport O₂ → Fri diffusion K⁺ → Primär aktiv transport Vatten → Passiv transport (kanal/aquaporin)"
"2024-12-20";"22";"glukoneogenes";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker när hormonet insulin utsöndras. B: Aminosyrorna alanin och lysin är glukogena. C: Glukoneogenes sker under nattens fasta. D: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat.";"";"Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker när hormonet insulin utsöndras. B: Aminosyrorna alanin och lysin är glukogena. C: Glukoneogenes sker under nattens fasta. D: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat.";"C och D"
"2024-12-20";"32";"nukleotidnedbrytning";"Nämn en vanlig sjukdom som är relaterad till nedbrytning av nukleotider, samt ange vilken av de två huvudtyperna av nukleotider som har en koppling till denna sjukdom. (2p) Max 10 ord.";"";"Nämn en vanlig sjukdom som är relaterad till nedbrytning av nukleotider, samt ange vilken av de två huvudtyperna av nukleotider som har en koppling till denna sjukdom. (2p) Max 10 ord.";"Gikt, och puriner har en koppling till sjukdomen."
"2024-12-20";"26";"integrering-av-metabolismen";"Redogör för två sätt som metabolismen ändras vid träning och hur ändringarna leder till förbättrad prestation. (4p) Max 120 ord.";"";"Redogör för två sätt som metabolismen ändras vid träning och hur ändringarna leder till förbättrad prestation. (4p) Max 120 ord.";"Laktat i muskeltyp IIb tas upp av hjärtat och av muskeltyp I, vilket gör att mängden laktat minskar i muskeltyp IIb så att anaerob metabolism kan fortgå längre. Hjärtats konkurrens om glukos minskar även då. Laktat tas även upp av levern, och omvandlas till pyruvat, och sedan till glukos som går ut till blodet och tas upp av muskeltyp IIb och används i glykolysen. Detta kallas för Coricykeln. Båda dessa metabola vägar leder till förbättrad prestation, eftersom kroppen orkar hålla på under längre tid."
"2024-12-20";"12";"nukleotider";"Vilka två påståenden om B-DNA (WatsonCrick helix) är korrekta? (2p) A: Avståndet mellan baspar i helixen är 5,0 Å. B: Helixen är vänstervriden. C: De två strängarna i helixen löper i motsatta riktningar. D: Ett varv av DNA består av ungefär 10 baspar.";"";"Vilka två påståenden om B-DNA (WatsonCrick helix) är korrekta? (2p) A: Avståndet mellan baspar i helixen är 5,0 Å. B: Helixen är vänstervriden. C: De två strängarna i helixen löper i motsatta riktningar. D: Ett varv av DNA består av ungefär 10 baspar.";"C och D"
"2024-12-20";"36";"plasmid";"Vilka två påståenden om plasmidkloning är korrekta? (2p) A: När en miniprep görs centrifugeras lösningen direkt efter alkalisk lysering för att separera plasmider från bakterierester. B: IPTG används för att bryta ned X-gal vilket gör att kolonier som tagit upp plasmiden blir blå. C: LacZ-genen används för blåvit screening där vita kolonier indikerar rekombinant DNA och blå kolonier indikerar icke-rekombinant DNA. D: BamHI är ett restriktionsenzym som klyver DNA vid en specifik sekvens.";"";"Vilka två påståenden om plasmidkloning är korrekta? (2p) A: När en miniprep görs centrifugeras lösningen direkt efter alkalisk lysering för att separera plasmider från bakterierester. B: IPTG används för att bryta ned X-gal vilket gör att kolonier som tagit upp plasmiden blir blå. C: LacZ-genen används för blåvit screening där vita kolonier indikerar rekombinant DNA och blå kolonier indikerar icke-rekombinant DNA. D: BamHI är ett restriktionsenzym som klyver DNA vid en specifik sekvens.";"C och D"
"2024-12-20";"27";"elektrontransportkedjan";"I elektrontransportkedjan förekommer steg där elektrondonatorn och elektronacceptorn inte är bärare av lika många elektroner. Redogör för vad som händer vid ett sådant steg. (4p) Max 100 ord.";"";"I elektrontransportkedjan förekommer steg där elektrondonatorn och elektronacceptorn inte är bärare av lika många elektroner. Redogör för vad som händer vid ett sådant steg. (4p) Max 100 ord.";"Detta händer i komplex III i elektrontransportkedjan när coenzym Q ska donera 2 elektroner till cytokrom C som endast kan ta upp en elektron. Q-cykeln: QH₂ kommer till Q Cytokrom C oxidoreduktas (komplex III): 1 elektron tas upp av cytokrom C och ges till cytokrom C (elektronen transporteras till komplex IV) 1 elektron tas upp av Q som blir Q⁻ En annan QH₂ kommer in till komplex III 1 elektron tas upp av cytokrom C1 och ges till cytokrom C 1 elektron tas upp av Q⁻ blir till QH₂ (2 H⁺ tas upp från matrix)"
"2024-12-20";"13";"translation";"Describe the main features of the genetic code and explain their biological significance. (4p) Answer in English.";"";"Describe the main features of the genetic code and explain their biological significance. (4p) Answer in English.";"The genetic code is in humans stored in DNA (23 chromosome pairs). It stems from our mother and father. The DNA contains 4 different base-pairs. Adenin, Tymin, Cytosin och Guanin. The genetic code is not read one base-pair at a time, but rather in groups of three (i.e codons). For example AUG, ATT. The genetic code is also degenarative, leading to different codons being able to code for the same aminoacid. This leads to a protective function against mutations, since a mutation in a codon can lead to the same amino acid still being coded for example. The gentic code codes for all the proteins in an organism. The DNA can be transcribed into mRNA which can be translated into proteins"
"2024-12-20";"17";"termodynamik";"Gibbs fria energi möjliggör att man kan förutsäga om en kemisk reaktion kan ske spontant. Ange vilka termer som ingår i formeln som beskriver förändringar i Gibbs fria energi. Förklara även hur ökad respektive minskad temperatur påverkar förändringen av Gibbs fria energi. (4p)";"";"Gibbs fria energi möjliggör att man kan förutsäga om en kemisk reaktion kan ske spontant. Ange vilka termer som ingår i formeln som beskriver förändringar i Gibbs fria energi. Förklara även hur ökad respektive minskad temperatur påverkar förändringen av Gibbs fria energi. (4p)";"Gibbs fria energi = deltaG Entalpi = deltaH Temperatur = T Entropi = deltaS En ökad temperatur kommer ha inverkan på entropin, vilket kommer leda till att deltaG kommer bli mer negativ/gå mot ett lägre värde. Den kemiska reaktionen i fråga kommer då förkjutas mot ett läge där den kan ske spontant (kan ske spontant om delta G är <0) En minskad temperatur kommer också ha en inverkan på entropin, fast i detta fall kommer deltaG istälett gå mot ett högre värde. Den kemiska reaktionen i fråga kommer då kräva mer energi för att äga rum. Temperaturen påverkar entropin eftersom detta är ett diret mått på molekylers/atomernas rörelseenergi."
"2024-12-20";"23";"glykogen";"Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet adrenalin induceras glykogenes i cellen. B: Glykogen upplagrat i skelettmuskel används främst för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider. C: Glukos-6-fosfat är slutprodukten vid glykogenolys i skelettmuskler. D: Glykogenin är ett enzym som är kovalent bundet till glykogen.";"";"Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet adrenalin induceras glykogenes i cellen. B: Glykogen upplagrat i skelettmuskel används främst för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider. C: Glukos-6-fosfat är slutprodukten vid glykogenolys i skelettmuskler. D: Glykogenin är ett enzym som är kovalent bundet till glykogen.";"C och D"
"2024-12-20";"33";"pentosfosfatvägen";"Var i cellen sker pentosfosfatvägen, och vilken biomolekyl, som kan användas vid reduktiv biosyntes, kan bildas i denna väg? (2p) Max 10 ord.";"";"Var i cellen sker pentosfosfatvägen, och vilken biomolekyl, som kan användas vid reduktiv biosyntes, kan bildas i denna väg? (2p) Max 10 ord.";"Pentosfosfatvägen sker i cytosolen, och bildar NADPH."
"2024-12-20";"24";"glykogen";"Vilka av följande faktorer stimulerar glykogenolys i en skelettmuskelcell? (2p) A: Intracellulär signalering inducerad av hormonet adrenalin. B: Aktivering av proteinfosfatas 1 i cellen. C: En låg energistatus i cellen, vilket reflekteras av en förhöjd intracellulär koncentration av AMP. D: En förhöjd koncentration av ATP i cellen.";"";"Vilka av följande faktorer stimulerar glykogenolys i en skelettmuskelcell? (2p) A: Intracellulär signalering inducerad av hormonet adrenalin. B: Aktivering av proteinfosfatas 1 i cellen. C: En låg energistatus i cellen, vilket reflekteras av en förhöjd intracellulär koncentration av AMP. D: En förhöjd koncentration av ATP i cellen.";"A och C"
"2024-12-20";"10";"rna-syntes";"Vilken är den biologiska betydelsen av den 5-cap som återfinns på mRNA i eukaryota celler? (4p)";"";"Vilken är den biologiska betydelsen av den 5-cap som återfinns på mRNA i eukaryota celler? (4p)";"Så fort mRNA:et börjar komma ut från RNA polymeras II, så sätts det på en guaninmolekyl på 5'-ändan via en 5'-5' bindning. Detta gör att mRNA-sekvensen inte bryts ner och att transkriptionen kan fortgå. När transkriptionen är färdig och mRNA-sekvensen har fått sin poly(A)-svans på sin 3´-ända och ska translateras så krävs det att både 5´cap och poly(A) finns på mRNA:et för att det ska kännas igen av ribosomen och translateras. 5´-capen hämmar alltså nedbrytning av mRNA, och möjliggör intiering av translation (tillsammas med poly(A)-svansen)."
"2024-12-20";"9";"kromatin";"Histonmodifieringar spelar en viktig roll i kromatinets funktion. Vilken effekt har acetylering av histoner på kromatinstrukturen, och varför är detta viktigt för genuttryck? (4p)";"";"Histonmodifieringar spelar en viktig roll i kromatinets funktion. Vilken effekt har acetylering av histoner på kromatinstrukturen, och varför är detta viktigt för genuttryck? (4p)";"I nukleosomen finns bland annat dubbla uppsättningar av H3 och H4, och dessa 4 histoner har svansar av positivt laddade aminosyror (t.ex lysin och arginin) vid sin N-terminal. Dessa aminosyror binder till fosfatgrupperna på DNA:et ryggrad, eftersom fosfatgrupperna är negativt laddade. När svansarna blir acetylerade så neutraliseras de positiva laddningarna, och svansarna binder inte lika hårt till fosfatgrupperna. Detta möjliggör för enzymer att komma åt DNA:et, eftersom den inte är så hårt bunden till histonerna och möjliggör reglering av genuttryck (antingen mer eller mindre transkription beroende på gen och vilket enzym det handlar om)."
"2024-12-20";"34";"kolesterol";"På vilka två sätt regleras kolesterolsyntesens hastighet? (2p) A: Via mängden aktivt 24-dehydrokolesterolreduktas, som styr aktiviteten i Kandutsch-Russel vägen för kolesterolsyntes. B: Via mängden aktivt HMG-CoA reduktas, som katalyserar bildningen av mevalonat. C: Via mängden aktivt squalenmonooxygenas, som katalyserar första steget i cykliseringen av squalen till lanosterol. D: Via mängden aktivt SLC25A1, ett transportprotein som transporterar citrat ut ur mitokondrien.";"";"På vilka två sätt regleras kolesterolsyntesens hastighet? (2p) A: Via mängden aktivt 24-dehydrokolesterolreduktas, som styr aktiviteten i Kandutsch-Russel vägen för kolesterolsyntes. B: Via mängden aktivt HMG-CoA reduktas, som katalyserar bildningen av mevalonat. C: Via mängden aktivt squalenmonooxygenas, som katalyserar första steget i cykliseringen av squalen till lanosterol. D: Via mängden aktivt SLC25A1, ett transportprotein som transporterar citrat ut ur mitokondrien.";"B och C"
"2024-12-20";"14";"från-aminosyror-till-proteiner";"Hur kan man identifiera viktiga aminosyror i ett protein när man bara har sekvensinformation från många olika organismer att tillgå? (4p)";"";"Hur kan man identifiera viktiga aminosyror i ett protein när man bara har sekvensinformation från många olika organismer att tillgå? (4p)";"Sekvensanalys innebär att man kan identifiera viktiga aminosyror genom att jämföra sekvenser från flera olika organismer och hitta likheter mellan organismerna. Viktiga aminosyror, t.ex den katalytiska triaden i t.ex chymotrypsin tenderar att bevaras i organismer därför att det naturliga urvalet bevarar sekvenser som är gynnsamma för artens anpassning och överlevnad."
"2024-12-20";"20";"introduktion-till-metabolismen";"Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs från ATP ökar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från glukos 6-fosfat. C: Det frigörs lika mycket energi när ATP och GTP hydrolyseras. D: ATP har högre fosforyltransferpotential än fosfoenolpyruvat.";"";"Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs från ATP ökar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från glukos 6-fosfat. C: Det frigörs lika mycket energi när ATP och GTP hydrolyseras. D: ATP har högre fosforyltransferpotential än fosfoenolpyruvat.";"A och C"
"2024-12-20";"30";"heme";"Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur hemesyntesen regleras. (4p)";"";"Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur hemesyntesen regleras. (4p)";"I första steget av hemesyntesen används enzymet ALA-syntas, och det är translationen av detta enzym som regleras. Det finns ett järn-bindande protein som binder till mRNA:et som kodar för ALA-syntas vid frånvaro av järn. När det finns järn så binder järnet till järn-bindande proteinet, och får det att lossna från mRNA:et. Då kan mRNA:et translateras och ALA-syntas bildas. Järn sätts in i heme som sista steg vid syntesen, så det hade varit onödigt om alla syntes-steg skedde trots att det inte finns något järn."
"2024-12-20";"15";"transport-över-cellmembran";"Vilka två påståenden om jonkanaler är korrekta? (2p) A: Transport sker alltid med en gradient. B: Na⁺-kanalen är mer selektiv än K⁺-kanalen. C: ATP driver transporten. D: De kan aktiveras genom ligandbindning.";"";"Vilka två påståenden om jonkanaler är korrekta? (2p) A: Transport sker alltid med en gradient. B: Na⁺-kanalen är mer selektiv än K⁺-kanalen. C: ATP driver transporten. D: De kan aktiveras genom ligandbindning.";"A och D"
"2024-12-20";"21";"glykolysen";"A) Förklara vad som menas med allosterisk reglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras allosteriskt och redogör för hur enzymets aktivitet ändras av regleringen. (4p) Max 50 ord.";"";"A) Förklara vad som menas med allosterisk reglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras allosteriskt och redogör för hur enzymets aktivitet ändras av regleringen. (4p) Max 50 ord.";"A) När en molekyl binder till ett annat ställe på enzymet än på det aktiva sätet och ändrar enzymets form, vilket ändrar dess aktivitet. B) Fosfofruktokinas I stimuleras vid allosterisk reglering av AMP och fruktos-2,6-bisfofat. Den hämmas vid allosterisk reglering av ATP och citrat."
"2024-12-20";"31";"aminosyrametabolism";"Nämn en så kallad alfa-ketosyra, som via transaminering kan omvandlas till en aminosyra. Ange även vilken aminosyra som bildas från alfa-ketosyran, vad enzymet som katalyserar reaktionen heter, samt från vilken metabol väg alfa-ketosyran kan hämtas. (4p) Max 25 ord.";"";"Nämn en så kallad alfa-ketosyra, som via transaminering kan omvandlas till en aminosyra. Ange även vilken aminosyra som bildas från alfa-ketosyran, vad enzymet som katalyserar reaktionen heter, samt från vilken metabol väg alfa-ketosyran kan hämtas. (4p) Max 25 ord.";"Oxaloacetat (alfaketosyra) transamineras vid deaminering av glutamat (aminosyra), och bilda aspartat (aminosyra som bildas) och alfa-ketoglutarat (alfa-ketosyran som bildas) Enzym: aspartataminotransferas (AST) Alfa-ketosyran från citronsyracykeln"
"2024-12-20";"25";"integrering-av-metabolismen";"I vilken ordning kommer glukos att stöta på nedanstående enzymer under sin väg i katabolismen? (2p) A: succinyl-CoA syntetas B: glyceraldehyd 3-dehydrogenas C: malatdehydrogenas D: fosfoglyceratkinas";"";"I vilken ordning kommer glukos att stöta på nedanstående enzymer under sin väg i katabolismen? (2p) A: succinyl-CoA syntetas B: glyceraldehyd 3-dehydrogenas C: malatdehydrogenas D: fosfoglyceratkinas";"1. glyceraldehyd 3-dehydrogenas 2. fosfoglyceratkinas 3. succinyl-CoA syntetas 4. malatdehydrogenas"
"2024-12-20";"11";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Lac-repressorn kan binda till operatorn också när det finns mycket glukos. B: Lac-operonet uttrycks alltid, oavsett närvaro av laktos. C: I närvaro av laktos binder allolaktos till repressorn och förhindrar dess bindning till DNA. D: CAP-proteinet förhindrar transkription av lac-operonet när glukos är frånvarande.";"";"Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Lac-repressorn kan binda till operatorn också när det finns mycket glukos. B: Lac-operonet uttrycks alltid, oavsett närvaro av laktos. C: I närvaro av laktos binder allolaktos till repressorn och förhindrar dess bindning till DNA. D: CAP-proteinet förhindrar transkription av lac-operonet när glukos är frånvarande.";"A och C"
"2024-12-20";"8";"dna-replikation";"DNA-replikation är en noggrant reglerad process. I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin, och vilken funktion har detta komplex under replikationen? (4p)";"";"DNA-replikation är en noggrant reglerad process. I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin, och vilken funktion har detta komplex under replikationen? (4p)";"MCM-helikaset binder till replikationsorigin under G1-fasen när den lockas dit av ORC, och laddas av Cdc6 och Cdt1. Detta är möjligt under G1-fasen eftersom CDK-nivåerna är låga. Under S-fasen höjs CDK-nivåerna vilket lockar dit Gins och Cdc45, som binder till det laddade MCM-helikaset och skapar ett komplett CMG-helikas som kan börja öppna upp dubbelsträngen. Replikationen sker under S-fasen, och det möjliggörs alltså av de höga nivåerna av CDK, vilket säkerställer att replikationen endast sker en gång under cellcykeln. Helikaset är ett motorprotein som glider längs med DNA-ryggraden av fosfatgrupper och bryter vätebindningarna mellan kvävebaserna genom hydrolys av ATP."
"2024-12-20";"35";"introduktionslaboration";"Du jämför ny kolesterolsänkande tablett mot standardbehandling. Efter tre månader görs t-test: p = 0,02, 95% KI för skillnaden 0,51,7 mmol/L. A) Formulera nollhypotes och alternativhypotes. B) Vilka slutsatser kan dras baserat på p-värdet och konfidensintervallet? (4p)";"";"Du jämför ny kolesterolsänkande tablett mot standardbehandling. Efter tre månader görs t-test: p = 0,02, 95% KI för skillnaden 0,51,7 mmol/L. A) Formulera nollhypotes och alternativhypotes. B) Vilka slutsatser kan dras baserat på p-värdet och konfidensintervallet? (4p)";"A) Nollhypotes: Det finns ingen skilland mellan blodtryckssänkningen om standradbehandling eller den nya tabletten används Alternativ hypotes: Det finns en skilland mellan blodtryckssänkningen om standradbehandling eller den nya tabletten används B) Testet visar statistisk signifikans, eftersom p-värdet är lägre än 0,05 och konfidensintervallet inte innehåller siffran noll. Nollhypotesen kan därför förkastas."
"2024-12-20";"3";"hemoglobin";"A) Define cooperativity in the context of hemoglobin and myoglobin. B) Give an example where cooperativity is beneficial and explain how it is beneficial. (4p) Max 100 words. Answer in English.";"";"A) Define cooperativity in the context of hemoglobin and myoglobin. B) Give an example where cooperativity is beneficial and explain how it is beneficial. (4p) Max 100 words. Answer in English.";"A) Coopertivity means that once one hemegroup in hemoglobin binds to one oxygen molecule, it makes it easier to other oxygen molecules to bind in to the other hemegroups in the same hemoglobin molecule. Even when one oxygen molecule gets released from heme, it fascilitates for other oxygen molecules to get released. B) In hemoglobin there are 4 hememolecules, and each one of them can bind to one oxygen. In the lungs, the partial pressure of oxygen is high, which encourage hemoglobin to bind to oxygen. Coopevtivity here is benificial because it makes the oxygen transport in the body effective."
"2024-12-20";"7";"nukleotider";"Vilka två påståenden om nukleotider är korrekta? (2p) A: En nukleotid består av en kvävebas, ett socker och tre fosfatgrupper. B: Den innersta fosfatgruppen, närmast sockret, kallas gamma. C: Ribonukleotider har en OH-grupp på 3'-kolatomen. D: Deoxyribonukleotider innehåller en OH-grupp på 2'-kolatomen.";"";"Vilka två påståenden om nukleotider är korrekta? (2p) A: En nukleotid består av en kvävebas, ett socker och tre fosfatgrupper. B: Den innersta fosfatgruppen, närmast sockret, kallas gamma. C: Ribonukleotider har en OH-grupp på 3'-kolatomen. D: Deoxyribonukleotider innehåller en OH-grupp på 2'-kolatomen.";"A och C"
"2024-12-20";"6";"kolhydrater";"Förklara kortfattat likheter och skillnader mellan glukos, glukopyranos och N-acetylglukosamin på strukturell/molekylär nivå. (4p)";"";"Förklara kortfattat likheter och skillnader mellan glukos, glukopyranos och N-acetylglukosamin på strukturell/molekylär nivå. (4p)";"3 av 4 poäng: Linjär glukos blir cirkulär genom att aldehydgruppen på kol 1 binder till kol 5. Glukopyranos bildas genom att en aldehydgrupp på en molekyl binder till en hydroxylgrupp på en annan molekyl. Likheten är alltså att båda är cirkulära, men att antalet molekyler är olika. N-acetylglukosamin är en glukosmolekyl, som är bunden till en acetylamingrupp. Acetylamingruppen är bunden till glukoset via sitt kväve. Likheten är alltså att glukos och N-acetylglukosamin båda innehåller glukos, men att N-acetylglukosamin även innehåller en acetylamingrupp."
"2024-12-20";"2";"från-aminosyror-till-proteiner";"En aminosyra har en sidogrupp bestående av en aminogrupp och en kedja med fyra CH₂-grupper. A) Vilken är aminosyran? B) Ange två egenskaper aminosyran har. C) Rita upp aminosyran vid pH = 2. (4p) Max 30 ord. Uppgift C på separat papper.";"";"En aminosyra har en sidogrupp bestående av en aminogrupp och en kedja med fyra CH₂-grupper. A) Vilken är aminosyran? B) Ange två egenskaper aminosyran har. C) Rita upp aminosyran vid pH = 2. (4p) Max 30 ord. Uppgift C på separat papper.";"A) Lysin B) Basisk, kan ta upp en H⁺ vid lågt pH. Fungerar i vissa enzymkomplex som en arm som flyttar prostetisk grupp mellan enzymer, t.ex lipoamiden i pyruvatdehydrogenaskomplexet. Ritning: Lysin vid pH 2, fullständigt protonerad (sid 12). ![[Pasted image 20251129235808.png]]"
1 date question_number category question maxpoints question answer
2 2024-01-27 28 elektrontransportkedjan A) Var i cellen och i vilken metabol process sker cellandning? B) Beskriv cellandningen med en formel. (4p) (Max 50 ord.) A) Var i cellen och i vilken metabol process sker cellandning? B) Beskriv cellandningen med en formel. (4p) (Max 50 ord.) 3 av 4: A. I elektrontransportkedjan i mitokondriens innre membran. B. Syre + elektroner --> H O Själva cellandningen sker i komplex 4 i elektrontransportkedjan.
3 2024-01-27 5 utforska-proteiner Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av COVID-19 (4p). (Max 200 ord.) a) Beskriv en analysmetod för att undersöka detta. b) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod? Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av COVID-19 (4p). (Max 200 ord.) a) Beskriv en analysmetod för att undersöka detta. b) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod? Jag väljer att använda en ELISA, närmare bestämt en sandwich ELISA som identifierar om patienten har antigen. I en sandwich ELISA tillsätts patientens prov till en brunn där det finns en fast antikropp, i detta fall för COVID-19. Om patienten har antigen för COVID-19 kommer dessa att binda till antikroppen. Efter detta sköljer man provet för att göra sig av med andra antigen och antikroppar. Därefter tillsätts en antikropp bunden till ett enzym, mha detta kan man få fram en färgskiftning i provet om det är positivt. Efter att den enzymbundna antikroppen tillsatts sköljer man ytterliggare en gång och tillsist tillsätter man ett substrat som inducerar en färgskiftning i provet om den enzymbunda antikroppen lyckats binda, om färgskiftning sker är provet positivt och patienten har således antigen för COVID-19.
4 2024-01-27 18 termodynamik Varför ökar entropin i en spontan reaktion? Hur kan man förklara det molekylärt? (4p) Varför ökar entropin i en spontan reaktion? Hur kan man förklara det molekylärt? (4p) I en spontant reaktion ökar alltid entropin enligt termodynamikens lagar. Molekyler har en förmåga att vilja sprida ut sig och således öka entropin. Detta sker genom Brownsk rörelse, alltså när molekyler "krockar" med varandra och ändrar riktning. Molekyler kommer röra sig mot det område där minst krockar uppstår. Som exempel kan vi ta salt i vatten. Saltet kommer spontant att lösa upp sig i vattnet, öka entropin. Genom Brownsk rörelse, krockar mellan molekylerna, fördelas saltet i vätskan.
5 2024-01-27 1 kemiska-bindingar Förklara vad van der Waals krafter är och ge ett exempel på hur de kan uppkomma i en biologisk molekyl. (4p) (Max 75 ord.) Förklara vad van der Waals krafter är och ge ett exempel på hur de kan uppkomma i en biologisk molekyl. (4p) (Max 75 ord.) Van der Waals krafter är de svagaste av bindingstyper. Runt en molekyl finns elektroner i elektronskal och vid något tillfälle är den lite mer positiv respektive negativ på ena sidan. Detta påverkar molekyler runt ikring som blir s.k. transienta dipoler. När dessa uppstår medkommer krafter mellan molekylerna som kallas van der Waals krafter/bindningar. Ett exempel på molekyler med mycket van der Waals krafter är aromatiska aminosyror som kan packas tätt pga sin planstruktur. Totalpoäng: 4
6 2024-01-27 19 enzymer Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.04 mM är, och för D-fruktos = 1.7 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (4p) Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.04 mM är, och för D-fruktos = 1.7 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (4p) Km är den koncentration substrat som behövs för att halva Vmax ska vara uppnått. I detta fall är Km betydligt lägre för D-glukos än för D-fruktos. I och med att Km är lägre för D-glukos uppnår enzymet en högre hastighet med D-glukos eftersom koncentrationen för båda substraten var 1mM. Km för D-frukots var 1,7 mM vilket betyder att vi inte ens uppnåt halva Vmax vid koncentrationen 1 mM D-fruktos. Eftersom Vmax är detsamma för båda substraten kan man utgå från att det substrat med lägst Km värde är det som kommer förbrukas först. Detta stämmer också in med att glukos är det primära bränslet som vi fått lära oss på föreläsningar.
7 2024-01-27 29 betaoxidation Vilka två av följande påståenden om beta-oxidationen är korrekta? (2p) A: Vid beta-oxidation av en 16-kolatomers fettsyra produceras 8 acetyl-CoA. B: Beta-oxidationen sker framför allt i cytoplasman. C: Vid beta-oxidationen bryts framför allt trans-fettsyror ner. D: Beta-oxidationen kräver en fungerande citronsyracykel för att ATP ska produceras. Vilka två av följande påståenden om beta-oxidationen är korrekta? (2p) A: Vid beta-oxidation av en 16-kolatomers fettsyra produceras 8 acetyl-CoA. B: Beta-oxidationen sker framför allt i cytoplasman. C: Vid beta-oxidationen bryts framför allt trans-fettsyror ner. D: Beta-oxidationen kräver en fungerande citronsyracykel för att ATP ska produceras. A och D
8 2024-01-27 4 hemoglobin Describe the allosteric regulation of hemoglobin with an example. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words) Describe the allosteric regulation of hemoglobin with an example. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words) 2 av 4: Hemoglobin is an oxygentransport protein which transport oxygen from our lungs to our muscles and tissue. Hemoglobin consists of four subunits, two alfa and two beta, with one Fe per unit. When oxygen binds to the first Fe it moves 0,4 Å upwards, closer to the heme-group. This induce a conformatioin change in hemoglobin which increases the affinty for oxygen for the next subunit. This is why hemoglobins curve is hyperbol. This is called cooperativity.
9 2024-01-27 16 cellmembran Vilka två av dessa lipider hittas i det eukaryota cellmembranet? (2p) A: Sfingomyelin B: Kolesterol C: Fria fettsyror D: Triacylglycerol Vilka två av dessa lipider hittas i det eukaryota cellmembranet? (2p) A: Sfingomyelin B: Kolesterol C: Fria fettsyror D: Triacylglycerol A och B
10 2024-01-27 22 I katabolismen hittar vi många enzymer som tillhör gruppen (välj två) A: Dehydrogenaser B: Isomeraser C: Polymeraser D: Karboxylaser I katabolismen hittar vi många enzymer som tillhör gruppen (välj två) A: Dehydrogenaser B: Isomeraser C: Polymeraser D: Karboxylaser A och B
11 2024-01-27 32 nukleotidnedbrytning Varför måste ureacykeln användas vid nedbrytning av purin-nukleotider? (2p) (Max 50 ord) Varför måste ureacykeln användas vid nedbrytning av purin-nukleotider? (2p) (Max 50 ord) 1 av 2: Puriner har två ringstruktur. I puriner finns det kväve och väte som bildar ammoniak vilket i höga koncentrationer är farligt för kroppen. Ureacyklen används för att göra sig av med ammoniaken genom urat och sedan urinen. AI: Nedbrytning av purinnukleotider frigör aminogrupper, som omvandlas till ammoniak via transaminering och glutamatdehydrogenas. Ammoniak är starkt toxiskt, särskilt för CNS, och måste därför oskadliggöras. Ureacykeln omvandlar ammoniak till urea, som kan utsöndras säkert via njurarna.
12 2024-01-27 26 glykogen Beskriv översiktligt den allostera regleringen av glykogenfosforylas i skelettmuskel och lever, dvs de viktigaste allostera modulatorerna som reglerar enzymet i respektive vävnad. Ange om modulatorerna stimulerar eller hämmar enzymets aktivitet. Rätt kombination av alloster modulator och påverkan på enzymaktivitet krävs för poäng. (4p) (Max 75 ord) Beskriv översiktligt den allostera regleringen av glykogenfosforylas i skelettmuskel och lever, dvs de viktigaste allostera modulatorerna som reglerar enzymet i respektive vävnad. Ange om modulatorerna stimulerar eller hämmar enzymets aktivitet. Rätt kombination av alloster modulator och påverkan på enzymaktivitet krävs för poäng. (4p) (Max 75 ord) 2 av 4: Glykogen fosforylas är ett av enzymen som bryter ner glykogen. I muskler ska glykogenet brytas ner och användas som bränsle. Cellen känner av energikvoten. Detta betyder att om energikvoten är låg och vi har mycket ADP kommer enzymet att stimuleras. Om det finns mycket ATP hämmas enzymet. I levern ska glykogenet brytas ner och reglera blodsockret mellan måltider. Om glukosnivåerna är låga kommer enzymet stimuleras och vice versa. Glukagon kommer då stimulera medan insulin hämmar. AI: Skelettmuskel: Glykogenfosforylas aktiveras allostert av AMP, som signalerar låg energi. Det hämmas av ATP och glukos-6-fosfat, som signalerar god energitillgång. Lever: Glykogenfosforylas hämmas av glukos, vilket speglar höga blodglukosnivåer. Levern saknar AMP-aktivering i fysiologiskt relevant grad, eftersom dess uppgift är att frisätta glukos, inte att reglera sin egen energistatus.
13 2024-01-27 12 rna-syntes Vilka två påståenden stämmer om splicing? (2p) A: Vid alternativ splicing kan även exon tas bort. B: Greningsstället är alltid ett G. C: Spliceosomen består av både proteiner och RNA. D: En lariatstruktur består alltid av två sammanlänkade exoner. Vilka två påståenden stämmer om splicing? (2p) A: Vid alternativ splicing kan även exon tas bort. B: Greningsstället är alltid ett G. C: Spliceosomen består av både proteiner och RNA. D: En lariatstruktur består alltid av två sammanlänkade exoner. A och C
14 2024-01-27 36 plasmid Which two statements about restriction enzymes such as BamHI are correct? (2p) A: They allow the visualization of the DNA at the end of gel electrophoresis. B: They perform the ligation of an insert into a vector. C: They generate “sticky ends” or “blunt ends”. D: They recognise and cleave DNA at specific sequences. (Svar markerat – Totalpoäng: 2) Which two statements about restriction enzymes such as BamHI are correct? (2p) A: They allow the visualization of the DNA at the end of gel electrophoresis. B: They perform the ligation of an insert into a vector. C: They generate “sticky ends” or “blunt ends”. D: They recognise and cleave DNA at specific sequences. (Svar markerat – Totalpoäng: 2) C och D
15 2024-01-27 27 citronsyracykeln A) Vilka energirika föreningar bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Vilken är kopplingen mellan cellens energikvot och citronsyracykeln? (4p) (Max 75 ord.) A) Vilka energirika föreningar bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Vilken är kopplingen mellan cellens energikvot och citronsyracykeln? (4p) (Max 75 ord.) 2 av 4: A. Tre NADH och en FADH2 B. NADH och FADH2 behövs för att transportera elektoner till elektrontransportkedjan som kan bygga upp en elektrokemisk gradient för att bilda ATP genom ATP syntaset. En låg energikvot betyder därav att det inte finns tillräckligt med NADH och FADH2 från citronsyracyklen. AI: A) Ett varv i citronsyracykeln bildar 3 NADH, 1 FADH₂ och 1 GTP (≈ATP). B) Hög energikvot (mycket ATP, NADH) hämmar cykeln, främst via isocitratdehydrogenas och α-ketoglutaratdehydrogenas. Låg energikvot (mycket ADP, NAD⁺) stimulerar cykeln. Cykeln regleras alltså efter cellens energibehov.
16 2024-01-27 13 kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Lac-operonet behövs för att uttrycka enzymer som kan bryta ner laktos (mjölksocker). Vilka två påståenden stämmer? (2p) A: När allolaktos finns närvarande kan lac-repressorn inte binda till operator-sekvensen. B: I närvaro av laktos är lac-operonet fullt påslaget, även om det finns rikligt med glukos i omgivningen. C: I närvaro av höga mängder glukos stimuleras bildning av cAMP. D: cAMP binder till CAP och stimulerar aktiviteten hos detta aktivator-protein. Lac-operonet behövs för att uttrycka enzymer som kan bryta ner laktos (mjölksocker). Vilka två påståenden stämmer? (2p) A: När allolaktos finns närvarande kan lac-repressorn inte binda till operator-sekvensen. B: I närvaro av laktos är lac-operonet fullt påslaget, även om det finns rikligt med glukos i omgivningen. C: I närvaro av höga mängder glukos stimuleras bildning av cAMP. D: cAMP binder till CAP och stimulerar aktiviteten hos detta aktivator-protein. A och D
17 2024-01-27 17 transport-över-cellmembran Redogör för den principiella uppbyggnaden av spänningsaktiverade katjonkanaler och hur de öppnas. (4p) (Max 100 ord) Redogör för den principiella uppbyggnaden av spänningsaktiverade katjonkanaler och hur de öppnas. (4p) (Max 100 ord) 2 av 4: En jonkanal består av sex olika segment. Segment 5 och 6 bildar själva centralporen medan segment 1-3 tillsammans med segment 4 bildar den spännings känsliga padeln. Segment 4 är det segment som känner av själva spänningsförändringen. När en en spänningsförändring i membranet sker registeras detta hos padlen vilket inducerar en konformationsändring och får den att ställa sig på "högkant". Detta öppnar katjonkanalen och joner kan flöda in eller ut ur cellen. AI: Spänningsaktiverade katjonkanaler består av fyra domäner (eller fyra separata subenheter) som vardera har sex transmembransegment (S1–S6). Segmentet S4 innehåller positivt laddade aminosyror och fungerar som spänningssensor. När membranet depolariseras rör sig S4 utåt, vilket drar i kopplade segment (framför allt S5–S6) och öppnar poren. En selektivitetsfilterregion bestämmer vilka katjoner som passerar. Kanalen kan även inaktiveras via en separat “inaktiveringsgrind” efter öppning.
18 2024-01-27 23 glykolysen Vilka två av nedanstående metaboliter ingår i glykolysen? A: Fruktos 2,6-bisfosfat B: Glukos 1-fosfat C: Glyceraldehyd 3-fosfat D: Fosfoenolpyruvat Vilka två av nedanstående metaboliter ingår i glykolysen? A: Fruktos 2,6-bisfosfat B: Glukos 1-fosfat C: Glyceraldehyd 3-fosfat D: Fosfoenolpyruvat C och D
19 2024-01-27 33 pentosfosfatvägen Mutationer i genen som kodar för enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas kan leda till ett defekt enzym vilket i sin tur kan orsaka hemolytisk anemi i vissa situationer. Vilken är grundorsaken till detta? (2p) (Max 50 ord) Mutationer i genen som kodar för enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas kan leda till ett defekt enzym vilket i sin tur kan orsaka hemolytisk anemi i vissa situationer. Vilken är grundorsaken till detta? (2p) (Max 50 ord) 1 av 2: Glukos 6-fosfatdehydrogenas är det första enzymet i pentosfosfatvägen, som körs för att bilda NADPH och ribos 5-fosfat. Vid deffekt i detta enzym bildas inte tillräckligt med NADPH som skyddar mot reaktiva syreföreningar. Detta är speceillt farligt för t.ex. eretrocyter som saknar mitokondrier och måste få allt sitt NADPH från pentosfofsfatvägen. AI: Glukos-6-fosfatdehydrogenas behövs för att bilda NADPH i pentosfosfatvägen. NADPH håller glutation reducerat, vilket skyddar erytrocyter mot oxidativ skada. Vid enzymdefekt saknar cellen detta skydd → oxidativ stress skadar membran och hemoglobin → erytrocyterna hemolyserar.
20 2024-01-27 24 integrering-av-metabolismen Förklara hur arsenikförgiftning påverkar metabolismen och varför liknande påverkan ses vid alkoholism. (4p) (Max 120 ord) Förklara hur arsenikförgiftning påverkar metabolismen och varför liknande påverkan ses vid alkoholism. (4p) (Max 120 ord) 3 av 4: Arsenit har affiniet för sulfhydrylgrupper. En viktig del i PDH komplexet är den arm som för intermediärerna mellan E1, E2 och E3. Denna arm bygger på just svavel. Armen inhiberas således av arsenit när bindningar mellan arsenit och armen bildas vilket medför att vi inte kan producera lika mycket eller ingen acetyl-CoA. Utan acetyl-CoA kan vi inte köra citronsyracyklen och således inte få fram NADH och FADH2 till elektrontransport kedjan. Alkholism leder till liknande effekter då de polära alkholerna kan binda till den intermediär-transportrande armen och inhibiera PDH komplexet. PDH=Pyruvat dehydrogenas
21 2024-01-27 10 dna-replikation ![[Pasted image 20251129235332.png]] På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. A) Ange för positionerna a, b, c och d om de motsvarar en 5’ eller 3’-ände. Vid DNA replikation skapas de två strängarna på litet olika vis. B) Vad kallas strängen som markerats med e? C) Vad kallas strängen som markerats med f? (4p) ![[Pasted image 20251129235332.png]] På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. A) Ange för positionerna a, b, c och d om de motsvarar en 5’ eller 3’-ände. Vid DNA replikation skapas de två strängarna på litet olika vis. B) Vad kallas strängen som markerats med e? C) Vad kallas strängen som markerats med f? (4p) a = 5´ b = 3´ c = 5´ d = 5´ B) Leadning strand C) Lagging strand
22 2024-01-27 9 kromatin Var binder histon H1? Vilken roll spelar detta protein? (4p) Var binder histon H1? Vilken roll spelar detta protein? (4p) Histon 1, H1, upptäcktes senare än de andra histonen, H2A, H2B, H3 och H4. H1 har i uppgift att stabilisera och binder till linker DNA som finns mellan "histonpärlorna"
23 2024-01-27 34 kolesterol Vilket av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten in vivo? (2p) A: Den intracellulära kolesterolhalten regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet lysosomal acid lipas (LAL). B: Den intracellulära kolesterolhalten regleras i princip enbart via endogen syntes - upptaget av kolesterol från det extracellulära rummet är normalt försumbart. C: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol på en fettsyra. D: Celler utanför levern kan göra sig av med ett överskott av kolesterol genom att överföra detta till HDL-partiklar, som för kolesterolet tillbaka till levern. Vilket av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten in vivo? (2p) A: Den intracellulära kolesterolhalten regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet lysosomal acid lipas (LAL). B: Den intracellulära kolesterolhalten regleras i princip enbart via endogen syntes - upptaget av kolesterol från det extracellulära rummet är normalt försumbart. C: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol på en fettsyra. D: Celler utanför levern kan göra sig av med ett överskott av kolesterol genom att överföra detta till HDL-partiklar, som för kolesterolet tillbaka till levern. C och D
24 2024-01-27 14 translation Beskriv i detalj hur terminationssteget i proteinsyntesen fungerar med särskilt fokus på funktionen av stoppkodon och ribosomens struktur. Förklara även hur Release Factor 1 (RF1) bidrar till processen. (4p) (Max 150 ord) Beskriv i detalj hur terminationssteget i proteinsyntesen fungerar med särskilt fokus på funktionen av stoppkodon och ribosomens struktur. Förklara även hur Release Factor 1 (RF1) bidrar till processen. (4p) (Max 150 ord) 3 av 4: Ribosomen består av två subenheter, hos människan heter dessa 40 och 60. Den lilla subenheten, 40, har i uppgift leta efter starkodonet men också känna av stoppkodonet. Den stora subenheten, 60, har i uppgift att katalysera inbindingen av rätt aminosyra till en växande aminosyra sekvens i P-site. I terminations steget kommer ribosomen, 40 enheten, att känna av en cleavage signal som får RF1 att avsluta translationen. Cleavage signal är alltså ett stoppkodon. Det som sker är att RF1 kommer klyva den nu färdig byggda aminosyra sekvens som växt fram i P-site så att den transporteras till sin ämmnade destination.
25 2024-01-27 20 enzymer Vilka två påståenden om kompetitiva hämmare är korrekta? (2p) A: De binder reversibelt till det aktiva stället. B: De binder till flera olika ställen på ett enzym. C: De sänker reaktionens karakteristiska Km. D: De binder kovalent till enzymet. Vilka två påståenden om kompetitiva hämmare är korrekta? (2p) A: De binder reversibelt till det aktiva stället. B: De binder till flera olika ställen på ett enzym. C: De sänker reaktionens karakteristiska Km. D: De binder kovalent till enzymet. A och C
26 2024-01-27 30 heme Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur detta sker. (4p) Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur detta sker. (4p) AI: Hemesyntesen styrs av hur mycket järn som finns i cellen genom reglering av ALA-syntas (erytroid isoform). När järn är lågt binder IRP till en IRE-sekvens i 5’-änden av ALAS-mRNA och blockerar translationen, vilket bromsar hemesyntesen. När järn är tillräckligt släpper IRP → ALA-syntas kan översättas → hemesyntesen ökar. På så sätt matchas hemeproduktionen med tillgängligt järn.
27 2024-01-27 15 evolution Hur kan man bestämma släktskap mellan olika arter med DNA-teknik och varför fungerar det? (4p) Hur kan man bestämma släktskap mellan olika arter med DNA-teknik och varför fungerar det? (4p) Genom att sekvensera DNA kan man se hur mycket som stämmer överens mellan olika arter. Även om majoriteten av vårt DNA är sig likt hos många arter kan man ändå se skillnader på t.ex. mutationer. För att exemplifiera: DNA't hos en människa och en orangutang är mycket likt varandra, men pga DNA'ts ordning, proteinveckning och epigentik kan det uttryckas väldigt olika och således ge upphov till olika utseende, beetende och andra egenskaper. Således kan okika arter vara nära besläktande med varandra, alltså ha liknade DNA, men ändå vara olika arter.
28 2024-01-27 21 introduktion-till-metabolismen Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs minskar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från fruktos 1,6-bisfosfat. C: ATP innehåller färre fosfoanhydridbindningar än fosfatgrupper. D: I en välmående cell finns mer ATP än ADP. Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs minskar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från fruktos 1,6-bisfosfat. C: ATP innehåller färre fosfoanhydridbindningar än fosfatgrupper. D: I en välmående cell finns mer ATP än ADP. C och D
29 2024-01-27 31 aminosyrametabolism Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Vid fenylketonuri blir aminosyran fenylalanin essentiell. B: Ureacykeldefekter leder till hyperammonemi. C: Det kliniskt viktiga enzymet aspartataminotransferas kan bilda aspartat från pyruvat i en så kallad transamineringsreaktion. D: Aspartat är en glukogen aminosyra. Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Vid fenylketonuri blir aminosyran fenylalanin essentiell. B: Ureacykeldefekter leder till hyperammonemi. C: Det kliniskt viktiga enzymet aspartataminotransferas kan bilda aspartat från pyruvat i en så kallad transamineringsreaktion. D: Aspartat är en glukogen aminosyra. B och D
30 2024-01-27 25 glukoneogenes Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker främst i levern. B: Kol oxideras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 1,6-bisfosfat. D: Aminosyrorna cystein och metionin är glukogena. Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker främst i levern. B: Kol oxideras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 1,6-bisfosfat. D: Aminosyrorna cystein och metionin är glukogena. A och D
31 2024-01-27 11 dna-replikation Telomeras är ett omvänt transkriptas. Vad använder detta enzym som templat (mall)? Nämn också två typer av celler i vilka detta enzym återfinns. (4p) Telomeras är ett omvänt transkriptas. Vad använder detta enzym som templat (mall)? Nämn också två typer av celler i vilka detta enzym återfinns. (4p) Telomeras har med sig en egen RNA sekvens som den använder som mall när det ska förlänga telomererna. Detta enzym återfinns i t.ex. stamceller och cancer celler.
32 2024-01-27 8 nukleotider Vilka två nedanstående påståenden är korrekta? (2p) A: Uracil är en kvävebas i DNA. B: Kolatomen i position 1' hos sockret är bunden till kvävebasen via en β-glykosid-bindning. C: Adenosin är en nukleosid. D: ATP innehåller två fosfatgrupper. Vilka två nedanstående påståenden är korrekta? (2p) A: Uracil är en kvävebas i DNA. B: Kolatomen i position 1' hos sockret är bunden till kvävebasen via en β-glykosid-bindning. C: Adenosin är en nukleosid. D: ATP innehåller två fosfatgrupper. B och C
33 2024-01-27 35 introduktionslaboration I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värdet på 0.03 och ett 95% konfidensintervall på 6-17 mmHg. Diskutera vad dessa resultat ger oss för information och huruvida nollhypotesen kan förkastas. (4p) (Max 100 ord). I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värdet på 0.03 och ett 95% konfidensintervall på 6-17 mmHg. Diskutera vad dessa resultat ger oss för information och huruvida nollhypotesen kan förkastas. (4p) (Max 100 ord). 2 av 4: Detta resultat visar att nollhypotesen kan förkastas då p-värdet är under 0,05 då det finns sk. statistisk signifikans. Hade p-värdet varit över 0,05 hade man inte kunnat förkasta nollhypotesen. Vidare visar konfidensintervallet att 95% av de som fick den blodtryckssänknade medicinen fick ett lägre blodtryck med 6-17 mmHg. AI: p-värdet 0,03 innebär att om nollhypotesen (ingen skillnad i medelblodtryck) vore sann, skulle en så här stor eller större skillnad uppstå bara i cirka 3 % av fallen. Nollhypotesen kan därför förkastas vid 5 %-nivån. Ett 95 % konfidensintervall på 6–17 mmHg innebär att vi med 95 % säkerhet skattar den sanna medelreduktionen i blodtryck till mellan 6 och 17 mmHg, och eftersom intervallet inte innehåller 0 talar det också för en statistiskt signifikant blodtryckssänkande effekt.
34 2024-01-27 3 från-aminosyror-till-proteiner Lista fyra egenskaper hos en alfahelix. (4p) (Max 75 ord.) Lista fyra egenskaper hos en alfahelix. (4p) (Max 75 ord.) 3 av 4: 1. Har en konstant diameter. 2. Har kvävebaserna innåt och fosfatgrupperna och sockret utåt. (Pga hydrofob/hydrofil) 3. Kan polymeriseras till beta flaks liknande strukturer och bilda amyloider => Sjukdom. 4. Kan bilda transmembran-alfahelixar om det finns mycket hydrofoba aminosyror. Går att undersöka genom hydropatiplot.
35 2024-01-27 7 kolhydrater Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och proteoglykaner. (4p) (Max 150 ord) Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och proteoglykaner. (4p) (Max 150 ord) 2 av 4: Glykoproteiner och proteoglykaner är båda former av glykokonjugat och består båda av proteiner och socker. Glykoproteiner är väldigt långa och repetativa, tillskillnad från proteoglykaner. Både glykoproteiner och proteoglykaner finns ut mot ECM och har något att göra med cellens kommunikation/interaktion med andra celler, bakterier och virus. De kan också utgöra skydd. Glykoproteiner kan vara O-länkade eller N-länkade. Det vill säga om de är länkade via syret (O) i serin eller teronins funktionella grupp eller via kvävet (N) i aspargins funktionella grupp.
36 2024-01-27 6 cellmembran Rita den principiella strukturen för en glykolipid. (4p) Rita den principiella strukturen för en glykolipid. (4p)
37 2024-01-27 2 från-aminosyror-till-proteiner Vilka två av nedanstående aminosyror är de mest troliga att förekomma mot ytan av ett cytoplasmatiskt protein? A: Fenylalanin B: Serin C: Alanin D: Cystein Vilka två av nedanstående aminosyror är de mest troliga att förekomma mot ytan av ett cytoplasmatiskt protein? A: Fenylalanin B: Serin C: Alanin D: Cystein B och D
38 2022-01-29 28 pentosfosfatvägen Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: En fungerande pentosfosfatväg behövs för att upprätthålla ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar i röda blodkroppar. B: Fruktos 6-fosfat och glyceraldehyd 3-fosfat kan bildas i pentosfosfatvägens oxidatativa fas. C: Det som styr om glukos 6-fosfat ska slussas in i pentosfosfatvägens oxidataiva fas är de intracellulära nivåerna av NADP+ och NADPH. D: Pentosfosfatvägen är förlagd i mitokondriens matrix. Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: En fungerande pentosfosfatväg behövs för att upprätthålla ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar i röda blodkroppar. B: Fruktos 6-fosfat och glyceraldehyd 3-fosfat kan bildas i pentosfosfatvägens oxidatativa fas. C: Det som styr om glukos 6-fosfat ska slussas in i pentosfosfatvägens oxidataiva fas är de intracellulära nivåerna av NADP+ och NADPH. D: Pentosfosfatvägen är förlagd i mitokondriens matrix. A och C
39 2022-01-29 5 nukleotider Fråga 5 A. Hur många vätebindningar finns i AT resp. GC baspar? B. Hur påverkar baskompositionen DNA stabiliteten? (2p) Fråga 5 A. Hur många vätebindningar finns i AT resp. GC baspar? B. Hur påverkar baskompositionen DNA stabiliteten? (2p) A. AT har 2 vätebidningar GC har 3 vätebidningar B. Detta gör att vätebidningarna mellan G och C är stabilare eftersom det finns fler bidningspunkter. AT-bidningarna som har färre bindningspunkter /par är därmed ostabilare, detta är något som kan utnyttjas vid bl.a. transkription, eftersom DNA blir mer lättsmält vid AT-rika sekvenser som TATA-boxen.
40 2022-01-29 18 enzymer För ett enzym är Michaelis-Mentens konstant (KM) 15 mM. Vid en substratkoncentration på 5 mM, vad är förhållandet mellan reaktionshastigheten V och den maximala reaktionshastigheten Vmax? Motivera ditt svar. (Max 150 ord) (2p) ![[Pasted image 20251128081722.png]] För ett enzym är Michaelis-Mentens konstant (KM) 15 mM. Vid en substratkoncentration på 5 mM, vad är förhållandet mellan reaktionshastigheten V och den maximala reaktionshastigheten Vmax? Motivera ditt svar. (Max 150 ord) (2p) ![[Pasted image 20251128081722.png]] Reaktionshastigheten vid 5mM är alltså en fjärdedel av hastigheten vid Vmax
41 2022-01-29 1 från-aminosyror-till-proteiner A) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en vätebindning kan bildas. Ange vilka atomer som är donator respektive acceptor i vätebindningen. B) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en jonbindning kan bildas vid pH = 7. A) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en vätebindning kan bildas. Ange vilka atomer som är donator respektive acceptor i vätebindningen. B) Nämn två olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en jonbindning kan bildas vid pH = 7. a) Serin syre är donator, Asparagin kväve är acceptor b) Lysin, Aspartat
42 2022-01-29 19 enzymer I en av delreaktionerna som katalyseras av chymotrypsin krävs närvaro av vatten, medan i en annan delreaktion krävs det att inget vatten är närvarande. Vilka är dessa delreaktioner och varför krävs närvaro respektive frånvaro av vatten i de respektive stegen? (Max 150 ord) (2p) I en av delreaktionerna som katalyseras av chymotrypsin krävs närvaro av vatten, medan i en annan delreaktion krävs det att inget vatten är närvarande. Vilka är dessa delreaktioner och varför krävs närvaro respektive frånvaro av vatten i de respektive stegen? (Max 150 ord) (2p) I delreaktion 1 krävs inget vatten, då his tar emot vätet från asp som gör en nukleofilattack på den inkommande peptidbidningen. I delreaktion 2 krävs vatten, för att den peptiden ska klyvas och släppa från chymotrypsin
43 2022-01-29 29 nukleotidnedbrytning Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Nukleosidaser spjälkar av fosfatgrupper från nukleotider. B: Delar av purinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Kvävebaser som frisätts vid nedbrydning av nukleotider återanvänds ofta för nukleotidsyntes. D: Kväveatomerna i pyrimidinerna hamnar huvudsakligen i urat då dessa kvävebaser bryts ned. Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Nukleosidaser spjälkar av fosfatgrupper från nukleotider. B: Delar av purinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Kvävebaser som frisätts vid nedbrydning av nukleotider återanvänds ofta för nukleotidsyntes. D: Kväveatomerna i pyrimidinerna hamnar huvudsakligen i urat då dessa kvävebaser bryts ned. Rätt svar 1. C
44 2022-01-29 4 lipider Fråga 4 Vilken/vilka av dessa är en omega-3 fettsyra? (1p) ![[Pasted image 20251128081622.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: B B: C C: A D: D Fråga 4 Vilken/vilka av dessa är en omega-3 fettsyra? (1p) ![[Pasted image 20251128081622.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: B B: C C: A D: D Rätt svar 1. A 2. B
45 2022-01-29 16 rekombinant-dna-teknik Bacterial DNA may end up in a bacteriophage due to (choose one or more)/Bakteriellt DNA kan hamna i en bakteriofag för att (välj ett eller flera alternativ): (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Errors during the assembly of new bacteriophages./Fel som sker när nya bakteriofager sätts samman. B: The small and circular nature of bacterial DNA./Bakteriellt DNA är cirkulärt och litet. C: Template switching during bacterophage DNA replication./Ändring av mall när bakteriofagens DNA replikeras. D: Imprecise excision of the prophage./Inexakt utklippning av profagen. Bacterial DNA may end up in a bacteriophage due to (choose one or more)/Bakteriellt DNA kan hamna i en bakteriofag för att (välj ett eller flera alternativ): (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Errors during the assembly of new bacteriophages./Fel som sker när nya bakteriofager sätts samman. B: The small and circular nature of bacterial DNA./Bakteriellt DNA är cirkulärt och litet. C: Template switching during bacterophage DNA replication./Ändring av mall när bakteriofagens DNA replikeras. D: Imprecise excision of the prophage./Inexakt utklippning av profagen. Rätt svar 1. D
46 2022-01-29 22 glukosmetabolism Redogör för hur enzymet fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktokinas 2 regleras och spelar en central roll i glukosmetabolismen. Max 150 ord. (2p) Redogör för hur enzymet fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktokinas 2 regleras och spelar en central roll i glukosmetabolismen. Max 150 ord. (2p) Enzymets aktivitet styrs av hormonreglering och fosforylering. När insulin binder in till cellens recptor stimuleras PP1. Funktionen för PP1 är att defosforylera enzymet. När fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2 är defosforylerat inhiberas fosfatasdelen medan kinasdelen aktiveras. När kinasdelen är aktiverad katalyseras reaktionen där fruktos 6-fosfat blir fruktos-2,6-bisfosfat. När glukagon binder in till cellens receptor sätter en kaskadreaktion igång där cAMP genereras, vilket aktiverar PKA. PKAs aktivitet leder till en inhibering av PP1 och en fosforylering av enzymet fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2. Fosforyleringen inhiberar kinas delen och aktiverar fosfataset. När fosfatasdelen är aktiv katalyseras reaktionen där fruktos-2,6-bisfosfat återbildas till fruktos 6-fosfat. Detta spelar en central roll i metabolismen då hög koncentration av fruktos-2,6-bisfosfat (vilket bildas när enzymet är defosforylerat) stimulerar glykolysenzymet fosfofruktikinas 1 (som katalyserar reaktionen fruktos 6-fosfat --> fruktos 1,6-bisfosfat) samtidigt som det inhiberar glykoneogenes enzymet fruktos 1,6-bisfosfatas (som katalyserar reaktionen fruktos 1,6-bisfosfat --> fruktos 6-fosfat). Alltså fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2 styr mängden fruktos-2,6-bisfosfat vilket reglerar om cellen ska köra glykolys eller glukoneogenes.
47 2022-01-29 32 cellmembran Beskriv uppbyggnaden av ett GPI-ankare. (2p) Beskriv uppbyggnaden av ett GPI-ankare. (2p) En GPI-ankare består av 3 olika molekyler bundna till varandra, den innersta delen fäster till cellmembranet och den yttersta delen binder till tex. en kolhydrat.
48 2022-01-29 26 elektrontransportkedjan Redogör för mekanismen hos ATP-syntas i mitokondriens innermembran. Max 150 ord. (2p) Redogör för mekanismen hos ATP-syntas i mitokondriens innermembran. Max 150 ord. (2p) ATP-syntas funktion är att utnyttja den elektrokemiska gradienten som skapats av de protonpumpande komplexen i ETK, för att omvandla vätejoners rörelseenergi till kemisk bidningsenergi mellan fosfatgrupperna i ATP. Detta sker genom att vätejoner som strävar efter att ta sig från mmu genom innermembranet till matrix för att jämna ut gradienten åker in och neutraliserar en halvkanal i F0s c-ring, som roterar ett steg för varje vätejon som binder in. (När vätejonen åkt ett helt varv släpps den ut i matrix.) Rörelseenergin som skapas av rotationen i c-ringen leds genom den roterande gammasjälken till F1-enheten som finns i matrix och inducerar konformationsändringar i dess subenheter. ADP + Pi binder in i B-subeneheterna under Loose state, binds samman under Tense state och släpps ut som ATP under Open state.
49 2022-01-29 12 rna-syntes Vilket/vilka av följande alternativ beskriver en funktion för poly-A svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid B: Skyddar mot felaktig splicing C: Samverkar med 5'-cap för att stimulera translation D: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan Vilket/vilka av följande alternativ beskriver en funktion för poly-A svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid B: Skyddar mot felaktig splicing C: Samverkar med 5'-cap för att stimulera translation D: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan Rätt svar 1. A 2. C
50 2022-01-29 27 aminosyrametabolism Vilka är de två viktigaste transportörerna av kväve från kroppens vävnader till levern, och via vilka två andra molekyler kommer de två kväveatomerna, som slutligen hamnar i urea, föras in i ureacykelns cykliska del? (2p) Vilka är de två viktigaste transportörerna av kväve från kroppens vävnader till levern, och via vilka två andra molekyler kommer de två kväveatomerna, som slutligen hamnar i urea, föras in i ureacykelns cykliska del? (2p) De två viktigate transportörerna av kväve från kroppen vävnader är alanin och asparagin. Kväveatomerna hamnar i urea cykeln genom glutamat, vars kvävegrupp reagerar med koldioxid och bildar karbamoyl som sedan reagerar och bildar citrulin. Och asparaginsyra som i nästa steg lämnar av sin kvävegrupp till citrulin som då bildar argininsuccinat.
51 2022-01-29 13 kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Which protein is often required to initiate transcription by a bacterial RNA polymerase? How does it mediate initiation?/Vilket protein behövs ofta för att initiera transkription av bakteriellt RNA-polymeras? Hur underlättar det initieringen? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska. Which protein is often required to initiate transcription by a bacterial RNA polymerase? How does it mediate initiation?/Vilket protein behövs ofta för att initiera transkription av bakteriellt RNA-polymeras? Hur underlättar det initieringen? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska. Proteinet CAP behövs för att binda in cAMP för att aktivera RNA-polymeraset, så att det sedan kan hitta fram till promotorn och där starta transkriptionen.
52 2022-01-29 17 termodynamik Alexandra and Bill were the finalists of the Swedish Thermodynamics championship quiz. In a crucial tie-breaker, they were asked to say something about exergonic and endergonic reactions. Alexandra said: ‘In an exergonic reaction, energy is released from the system to the surroundings’. Bill said: ‘In an endergonic reaction, ∆G is negative’./Alexandra och Bill var finalister i Sveriges termodynamiska mästerskapsquiz. I en utslagsfråga blev de ombedda att säga något om exergona och endergona reaktioner. Alexandra sa: ”I en exergon reaktion avges energi från systemet till omgivningen”. Bill sa: ”I en endergon reaktion är ∆G negativt.” (1p) Välj ett alternativ: A: Both Alexandra and Bill are correct./Både Alexandra och Bill har rätt. B: Only Alexandra is correct./Enbart Alexandra har rätt. C: Only Bill is correct./Enbart Bill har rätt D: Both Alexandra and Bill are wrong./Både Alexandra och Bill har fel. Alexandra and Bill were the finalists of the Swedish Thermodynamics championship quiz. In a crucial tie-breaker, they were asked to say something about exergonic and endergonic reactions. Alexandra said: ‘In an exergonic reaction, energy is released from the system to the surroundings’. Bill said: ‘In an endergonic reaction, ∆G is negative’./Alexandra och Bill var finalister i Sveriges termodynamiska mästerskapsquiz. I en utslagsfråga blev de ombedda att säga något om exergona och endergona reaktioner. Alexandra sa: ”I en exergon reaktion avges energi från systemet till omgivningen”. Bill sa: ”I en endergon reaktion är ∆G negativt.” (1p) Välj ett alternativ: A: Both Alexandra and Bill are correct./Både Alexandra och Bill har rätt. B: Only Alexandra is correct./Enbart Alexandra har rätt. C: Only Bill is correct./Enbart Bill har rätt D: Both Alexandra and Bill are wrong./Både Alexandra och Bill har fel. Rätt svar 1. B
53 2022-01-29 23 glykogen Vad gör proteinet glykogenin och vilken viktig roll spelar enzymet i relation till glykogenmetabolism? (2p) Vad gör proteinet glykogenin och vilken viktig roll spelar enzymet i relation till glykogenmetabolism? (2p) Glykogenin är ett protein som fungerar som en primer i glykogensyntesen. Det har en enzymaktivitet som fäster några glukos-enheter på sig själv för att utgöra en primer som glykogensyntataset kan syntetisera vidare på. Utan glykogenin skulle inte glykogensyntaset ha någon reducerad ände att starta sin glykogensyntes ifrån och vi skulle därmed inte kunna få någon glykogensyntes.
54 2022-01-29 33 transport-över-cellmembran Rangordna molekylerna vatten, leucin, glukos och kväveoxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den molekyl som har lättast att passera. Ange två egenskaper hos varje molekyl av betydelse för deras placering i listan. (2p) Rangordna molekylerna vatten, leucin, glukos och kväveoxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den molekyl som har lättast att passera. Ange två egenskaper hos varje molekyl av betydelse för deras placering i listan. (2p) Vatten - liten, oladdad molekyl Glukos - hydrofob, relativt stor molekyl Leucin - oladdad, hydrofil "kropp" (alltså NH3+ och COO-, inte R-kedjan) Kväveoxid - laddad, hydrofil
55 2022-01-29 24 integrering-av-metabolismen Redogör för vilket sätt arsenikförgiftning påverkar metabolismen och vad som kan göras för att häva förgiftningen. Max 150 ord. (2p) Redogör för vilket sätt arsenikförgiftning påverkar metabolismen och vad som kan göras för att häva förgiftningen. Max 150 ord. (2p) Arsenikförgiftning hämmar natrium/kalium-pumpen vilket förstör gradienterna. Pumpen upprätthåller gradienter över membranet som annars skulle utjämnas av jonkanalerna. Cellen är beroende av gradienten för att upprätthålla vissa reaktioner i cellen och transporter över cellmembranet. Bl.a. så utnyttjas den uppbyggda kaliumgradienten för att aktivit (sekundär aktiv transport) transportera glukos in i cellen genom att kalium som transporteras med sin gradient drar med sig glukosmolekylen mot sin gradient in i cellen.
56 2022-01-29 10 dna-replikation Explain how proofreading works at the molecular level during bacterial replication./Förklara hur korrekturläsning fungerar på molekylär nivå under bakteriell replikation. (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska. Explain how proofreading works at the molecular level during bacterial replication./Förklara hur korrekturläsning fungerar på molekylär nivå under bakteriell replikation. (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska. DNA-polymeras 3 har både en DNA-syntetiserande del och en exonukleas del, detta gör det möjligt för polymeraset att "backtracka" om den skulle upptäcka att något basparat fel. Detta gör den genom sin exonukleas-aktivitet där den klyver peptidbidningar (genom att backa) 3´ till 5´. När den klyvt bort den/de felparade baserna syntetiserar den nya baser 5´ till 3´ och fortsätter som vanligt. DNA-polymeras 1 vars funktion är att klippa bort RNA-primer och syntetisera nya baser i gapsen har samma exonukleasa funktion (3´ till 5´ radering) för att korrigera den korta del den nyligen syntetiserat om ett fel skulle upptäckas.
57 2022-01-29 9 evolution Discuss the evolutionary origin of RNase P. This question needs to be answered in English. (Max 100 words.) (2p) Discuss the evolutionary origin of RNase P. This question needs to be answered in English. (Max 100 words.) (2p) The RNaseP is an enzyme consisting of both RNA and protein. By comparing the level of protein in different organisms we can see that in less complex organisms like bacteria the enzyme consists of most RNA and only one protein unit, comparing with "arkener" which is a more complex organism there is shorter/smaller RNA unit and more protein units. In even more complex organisms like humans the protein units are much greater than the RNA-unit. This provens the hypothesis that RNA also acted as enzymes long time ago, before "the tasks were split" to proteins to be more efficient.
58 2022-01-29 34 plasmid I vilken ordning genomförs nedanstående steg när plasmider ska renas? (1p) Eluera plasmiderna från kolumnen Lysera cellerna Neutralisera lysatet Pelletera cellkulturen som växt under natten I vilken ordning genomförs nedanstående steg när plasmider ska renas? (1p) Eluera plasmiderna från kolumnen Lysera cellerna Neutralisera lysatet Pelletera cellkulturen som växt under natten 1. Pelletera cellkulturen som växt under natten 2. Lysera cellerna 3. Neutralisera lysatet 4. Eluera plasmiderna från kolumnen
59 2022-01-29 14 rna-syntes Vad är intron och exon? (2p) Vad är intron och exon? (2p) Intron och exon är båda en del av den transkriberade omogna RNA-kedjan. För att skapa ett moget mRNA klipps introner ("onödiga" RNA-sekvenser) bort genom splicing. Medan de sekvenser som krävs för transaltion utgör den mogna RNA-kedjan och används som mall i proteinsyntesen. Det finns flera exon på samma mRNA kedja, vissa exon kan också klippas bort för att samma gen kan koda för olika protein. Vilket protein som uttryck styrs av miljön i cellen och beror alltså på vilka exon som sparas.
60 2022-01-29 20 introduktion-till-metabolismen Vilket/vilka av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan positiva laddningar. B: När en fosfatgrupp avges kan ADP resonansstabiliseras. C: När en fosfatgrupp frigörs ökar entropin. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i GTP. Vilket/vilka av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan positiva laddningar. B: När en fosfatgrupp avges kan ADP resonansstabiliseras. C: När en fosfatgrupp frigörs ökar entropin. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i GTP. Rätt svar 1. C 2. D
61 2022-01-29 30 heme Syntes av heme beror på cellens tillgång till järn. Beskriv vad som sker när järntillgången är låg. (2p) Syntes av heme beror på cellens tillgång till järn. Beskriv vad som sker när järntillgången är låg. (2p) På mRNA som används som mall för att syntetisera ALA-syntetaset som behövs vid hemsyntes finns den reglerande sekvensen IRE, Ire Respossible Element. När järntillgången är låg binder IRP, IRE-binding protein, till IRE vilket hämmar translationen av det nödvändiga enzymet ALA-syntas. Detta inhiberar hemsyntesen, vilket är syftet eftersom vi inte har något järn.
62 2022-01-29 15 translation What regions of a tRNA are recognized by amino-acyl-tRNA synthetases?/Vilka regioner hos tRNA känns igen av amino-acyl-rRNA syntetaser? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska. What regions of a tRNA are recognized by amino-acyl-tRNA synthetases?/Vilka regioner hos tRNA känns igen av amino-acyl-rRNA syntetaser? (2p) Denna fråga kan besvaras på svenska eller engelska. OH-gruppen på 3´änden Den specifika nukleotidsekvensen näst längst ut på 3´änden
63 2022-01-29 21 introduktion-till-metabolismen Vilken av nedanstående metaboliter är mest reducerad? (1p) Välj ett alternativ: A: Pyruvat B: 3-fosfoglycerat C: Citrat D: Fruktos 6-fosfat Vilken av nedanstående metaboliter är mest reducerad? (1p) Välj ett alternativ: A: Pyruvat B: 3-fosfoglycerat C: Citrat D: Fruktos 6-fosfat Rätt svar 1. D
64 2022-01-29 31 kolesterol Vilket av följande påståenden är helt korrekt avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom transkriptionsfaktorn SRE-1. Ökad SRE-1 signalering leder till ökat uttryck av proteinet CETP, som defosforylerar HMGR och gör det inaktivt. B: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom halten av kolesterol i blodet. Hög halt leder till att den intracellulära koncentrationen ökar genom passivt upptag. C: Endast några få celltyper i kroppen (exempelvis hepatocyter) har förmåga att syntetisera kolesterol. Övriga celltyper är helt beroende av tillförsel av kolesterol utifrån, via blodet. Kolesterol tas upp av dessa celler genom transportproteinet CETP. D: Transkriptionsfaktorn SREBP-2 är viktig för relgering av kolesterolsyntesens hastighet. SREBP-2 aktiveras genom att proteinet transporteras från det endoplasmatiska nätverket till Golgiapparaten, där transkriptionsfaktordelen klyvs av. Vilket av följande påståenden är helt korrekt avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom transkriptionsfaktorn SRE-1. Ökad SRE-1 signalering leder till ökat uttryck av proteinet CETP, som defosforylerar HMGR och gör det inaktivt. B: Den intracellulära kolesterolkoncentrationen regleras i huvudsak genom halten av kolesterol i blodet. Hög halt leder till att den intracellulära koncentrationen ökar genom passivt upptag. C: Endast några få celltyper i kroppen (exempelvis hepatocyter) har förmåga att syntetisera kolesterol. Övriga celltyper är helt beroende av tillförsel av kolesterol utifrån, via blodet. Kolesterol tas upp av dessa celler genom transportproteinet CETP. D: Transkriptionsfaktorn SREBP-2 är viktig för relgering av kolesterolsyntesens hastighet. SREBP-2 aktiveras genom att proteinet transporteras från det endoplasmatiska nätverket till Golgiapparaten, där transkriptionsfaktordelen klyvs av. Rätt svar 1. D
65 2022-01-29 25 betaoxidation Vilken/vilka av nedanstående produceras vid beta-oxidation? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Pyruvat B: Acetyl-CoA C: Malonyl-CoA D: Acetoacetat E: Oxaloacetat Vilken/vilka av nedanstående produceras vid beta-oxidation? (1p) Välj ett eller flera alternativ: A: Pyruvat B: Acetyl-CoA C: Malonyl-CoA D: Acetoacetat E: Oxaloacetat Rätt svar 1. B
66 2022-01-29 11 rna-syntes Vilken roll spelar Mediatorn vid transkriptionell aktivering? (2p) Vilken roll spelar Mediatorn vid transkriptionell aktivering? (2p) Mediatorn fungerar som en sambandscentral mellan enhancern (och dess aktivatorprotein) och promotorsekvensen, enhancern ligger ca 1000 baspar bort, men påverkar transkriptionen för sin specifika gen.
67 2022-01-29 8 utforska-proteiner Du träffar en patient som du misstänker har drabbats av HIV. Du kommer att använda en Indirekt ELISA för att ta reda på detta. (Max 150 ord.) (2p) A) Beskriv de olika stegen för en Indirekt ELISA. B) Detekterar denna metod patientens antikropp eller antigen? Du träffar en patient som du misstänker har drabbats av HIV. Du kommer att använda en Indirekt ELISA för att ta reda på detta. (Max 150 ord.) (2p) A) Beskriv de olika stegen för en Indirekt ELISA. B) Detekterar denna metod patientens antikropp eller antigen? A. Ett specifikt antigen fästs i en brunn, patientens prov tillsätts, sköljning genomförs för att sortera bort de antikroppar som inte fäst till antigenet, ytterligare en antikropp tillsätts som binder till den första antikroppen, färg som binder till den andra antikroppen tillsätts, provet färgas om antikroppen är detekterad. B. Antikropp
68 2022-01-29 35 introduktionslaboration Du arbetar på en vårdcentral där du förvånas över att många patienter med njursvikt (=dålig njurfunktion) tidigare har haft gikt (”portvinstå”). Du bestämmer dig därför för att undersöka om patienter med gikt löper en högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. Vilken av nedanstående är den mest rimliga nollhypotesen? (1p) Välj ett alternativ: A: Patienter med gikt har högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. B: Patienter med gikt har samma risk att utveckla njursvikt som patienter utan gikt. C: Det finns en skillnad i risken att utveckla njursvikt mellan giktpatienter och patienter utan gikt. D: Patienter med gikt har lägre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. Du arbetar på en vårdcentral där du förvånas över att många patienter med njursvikt (=dålig njurfunktion) tidigare har haft gikt (”portvinstå”). Du bestämmer dig därför för att undersöka om patienter med gikt löper en högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. Vilken av nedanstående är den mest rimliga nollhypotesen? (1p) Välj ett alternativ: A: Patienter med gikt har högre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. B: Patienter med gikt har samma risk att utveckla njursvikt som patienter utan gikt. C: Det finns en skillnad i risken att utveckla njursvikt mellan giktpatienter och patienter utan gikt. D: Patienter med gikt har lägre risk att utveckla njursvikt än patienter utan gikt. B
69 2022-01-29 3 kolhydrater Fråga 3 Diskutera molekylära likheter och skillnader mellan mekanismerna bakom galaktosemi och laktosintolerans. (2p) Fråga 3 Diskutera molekylära likheter och skillnader mellan mekanismerna bakom galaktosemi och laktosintolerans. (2p) Laktos är en molekyl som består av glukos och galaktos. Båda sjukdommarna beror på brist av enzymet som bryter ned den specifika molekylen. I laktosintolerans handlar det om enzymet laktas som spjälkar laktos till galaktos och glukos, medan det i galaktosemi handlar om enzymet som omvandlar galaktos till glukos. Vid obehandlad galaktosemi ansamlas galaktos, vilket leder till att galaktos går ut i blodet och omvandlas till den toxiska molekylen galaktitol, vilket är mycket farligt. Vid obehandlad laktos bryts inte laktosmolekylen ned i tunntarmen som kroppen annars hade gjort, utan den fortsätter genom magtarmkanalen tills den hamnar i tjocktramen där den fermenteras av bakterier, vilket leder till gasbildning och buksmärtor. Ometaboliserad laktos blir alltså inte toxiskt som galaktos(--> galaktitol). Den vanligaste behandlingen för båda intoleranserna handlar främst om att utesluta den sjukdomsframkallande molekylen. Båda molekylerna finns i komjölk, vilket alltså ska undvikas. Vid laktosintolerans finns laktosfria mjölkprodukter, det finns däremot inte galaktosfria mjölkprodukter.
70 2022-01-29 7 hemoglobin En allvarlig komplikation till bl.a. Covid-19 är så kallad Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS), vilket ger en gravt sviktande lungfunktion orsakad av inflammation och vätskeansamling (ödem) i alveolerna. Ödemet leder till att mindre syre når blodet och att mindre koldioxid lämnar blodet. Beskriv i detalj hur den minskade mängden syre och den ökade mängden koldioxid påverkar hemoglobinets struktur och funktion. (2p) En allvarlig komplikation till bl.a. Covid-19 är så kallad Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS), vilket ger en gravt sviktande lungfunktion orsakad av inflammation och vätskeansamling (ödem) i alveolerna. Ödemet leder till att mindre syre når blodet och att mindre koldioxid lämnar blodet. Beskriv i detalj hur den minskade mängden syre och den ökade mängden koldioxid påverkar hemoglobinets struktur och funktion. (2p) Den ökande mängden koldioxid stabiliserar T-state, deoxy-formen, av hemoglobin vilket minskar hemoglobinets affinitet för syre och gör det svårare för syremolekylen att binda in. Detta sker bl.a. genom att koldioxid binder i till hemoglobins ena peptidände, vilket gör det möjligt för saltbryggor att återskapas vilket stabiliserar T-state (tense state). Ökad mängd koldioxid innebär även lägre PH i blodet, dvs. ökad mängd vätejoner - vilka kan binda in till hemoglobin och de möjliggör också återskapandet av saltbryggor för hemoglobinet. Vid lungorna ska normalt sett den höga syrehalten och det högre PHt leda till att koldioxidet och vätejoner släpper, för att destabilisera T-state. När syrehalten är låg är PH i blodet vid lungorna något lägre än normalt vilket gör det svårare för denna reaktion att ske. Syrehalten ska också bidra till att en syremolekyl initialt binder in till järnet i en subenhet. Eftersom hemoglobin är ett kooperativ av 4 subenheter med 4 hemgrupper leder inbidningen av syre i en enhet till en konformationsändring i de andra subenheterna vilket gör järnemolekylerna mer tillgängliga för syre att binda in till. Detta stimulerar R-state och oxy-formen av hemoglobin. Den låga syrehalten gör "sannolikheten lägre" för det första syret att binda in, och konformationsändringen sker då inte. Vanligtvis sker denna växling mellan T- och R-state på så vis att koldioxid konc. är högst i muskler och stimulerar T-state vilket gör att syret släpps av där det behövs. Å andra sidan är koncentrationen syre tillräckligt hög vid lungorna för att stimulera R-state och binda in syre. Dessa konformationsändringar är nödvändiga för ett så effektivt gasutbyte som möjligt och för att syre ska binda och släppa på rätt ställe. När dessa koncentrationer ändras och koldioxidhalten i bloden blir för hög i relation till syrehalten rubbas samspelet mellan dessa konformationsformer och T-state, deoxyformen blir dominerande.
71 2022-01-29 6 nukleotider Vilket/vilka av följande påståenden om RNA är korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ryggraden i RNA hålls samman av fosfodiester-bindningar. B: Uracil kan deamineras till cytosin. C: RNA använder kvävebasen uracil istället för tymin. D: Ribonukleotider har en OH-grupp i 1'-position. Vilket/vilka av följande påståenden om RNA är korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ryggraden i RNA hålls samman av fosfodiester-bindningar. B: Uracil kan deamineras till cytosin. C: RNA använder kvävebasen uracil istället för tymin. D: Ribonukleotider har en OH-grupp i 1'-position. Rätt svar 1. A 2. C
72 2022-01-29 2 från-aminosyror-till-proteiner Fråga 2 Vilket/vilka av nedanstående kan hittas i ett protein? Välj ett eller flera alternativ: A: En alfahelix. B: En hårnålsböj. C: En dubbelhelix. D: En loop. Fråga 2 Vilket/vilka av nedanstående kan hittas i ett protein? Välj ett eller flera alternativ: A: En alfahelix. B: En hårnålsböj. C: En dubbelhelix. D: En loop. Rätt svar 1. A 2. B 3. D
73 2022-05-16 28 nukleotidnedbrytning I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i följande två nukleotider då dessa bryts ner? (1p) A: AMP B: CMP I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i följande två nukleotider då dessa bryts ner? (1p) A: AMP B: CMP A: Urat B: Urea
74 2022-05-16 5 hemoglobin Rita syredissociationskurvan för hemoglobin och myoglobin. Vilken strukturell skillnad mellan myoglobin och hemoglobin förklarar skillnaden i dissociationskurvorna? (2p) (Max 100 ord) Rita syredissociationskurvan för hemoglobin och myoglobin. Vilken strukturell skillnad mellan myoglobin och hemoglobin förklarar skillnaden i dissociationskurvorna? (2p) (Max 100 ord) Myoglobin består av en subenhet och har mycket affinitet för syre. Myoglobin har en mycket brant dissociationskurva. Man kan säga att myoglobin fungerar som en on-off knapp, då den antingen är oxiderad (oxyform) eller deoxiderad (deoxyform). Myoglobin är därför bra för lagring av syre men väldigt dåligt för syretransport. Tillskillnad från myoglobin består hemoglobin av fyra subenheter. Hemoglobin har inte lika brant dissociationskurva, vilket innebär att hemoglobin är lämplig för transport av syre. Hemoglobin blir oxyform i lungorna där syrehalten är stor. I musklerna släpper hemoglobinet sina syre atomer gradvist och till slut blir den deoxyform. ![[Pasted image 20251129234842.png]]
75 2022-05-16 18 integrering-av-metabolismen Vilka två av nedanstående molekyler har sitt ursprung i en B vitamin? A: Coenzym A B: ATP C: Liponsyra D: NADH Vilka två av nedanstående molekyler har sitt ursprung i en B vitamin? A: Coenzym A B: ATP C: Liponsyra D: NADH Rätt svar 1. A 2. D
76 2022-05-16 1 kolhydrater A) Vad är mukopolysackaridos? B) Beskriv den biokemiska bakgrunden för mukopolysackaridos. (2p) A) Vad är mukopolysackaridos? B) Beskriv den biokemiska bakgrunden för mukopolysackaridos. (2p) A. Mukopolysackaridos är en sjukdom som innebär att GAG (glukoaminoglukaner) inte kan brytas ner. Då ansamlas GAGs i blodet och kroppens vävnader vilket har negativa konsekvenser på kroppen. B. GAG finns i proteoglykaner och består av repeterande disackarid enheter. Disackariden består av en negativt laddad monosackarid och en annan monosackarid som innehåller en acetylamin grupp (till exempel acetylgalaktosamin). Nedbrytningen av GAG behöver speciella enzymer. När dessa enzymer fungerar inte som de ska bryts GAGs inte ner. Då ansamlas stora mängder av GAG i kroppen.
77 2022-05-16 19 glykolysen I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzymer att vara verksamma i den processen? (1p) alfaketoglutaratdehydrogenas fosfofruktokinas hexokinas succinatdehydrogenas I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzymer att vara verksamma i den processen? (1p) alfaketoglutaratdehydrogenas fosfofruktokinas hexokinas succinatdehydrogenas 1. hexokinas 2. fosfofruktokinas 3. alfaketoglutaratdehydrogenas 4. succinatdehydrogenas
78 2022-05-16 29 pentosfosfatvägen Ribos-5-fosfat kan bildas på två olika sätt i pentosfosfatvägen. I det ena fallet utnyttjas enbart den icke-oxidativa fasen av denna metabola väg. Vilka två glykolysintermediärer utnyttjas i detta fall för syntesen av ribos-5-fosfat? Ange molekylernas fullständiga namn, inte förkortningar. (1p) Ribos-5-fosfat kan bildas på två olika sätt i pentosfosfatvägen. I det ena fallet utnyttjas enbart den icke-oxidativa fasen av denna metabola väg. Vilka två glykolysintermediärer utnyttjas i detta fall för syntesen av ribos-5-fosfat? Ange molekylernas fullständiga namn, inte förkortningar. (1p) fruktos-6-fosfat och glyceraldehyd-3-fosfat
79 2022-05-16 4 från-aminosyror-till-proteiner Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp som deras R-grupper kan delta i när pH är 7. (1p) Möjliga bindningstyper: kovalent bindning jonbindning van der Waals interaktion vätebindning Aminosyror: Arginin Asparagin Fenylalanin Tyrosin Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp som deras R-grupper kan delta i när pH är 7. (1p) Möjliga bindningstyper: kovalent bindning jonbindning van der Waals interaktion vätebindning Aminosyror: Arginin Asparagin Fenylalanin Tyrosin Fenylalanin: van der Waals interaktion Asparagin: vätebindning Arginin: jonbindning Tyrosin: van der Waals interaktion
80 2022-05-16 16 enzymer Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.05 mM är, och för D-fruktos = 1.5 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (2p) Hexokinas är ett enzym som kan använda både D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.05 mM är, och för D-fruktos = 1.5 mM. Vmax är detsamma för båda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av båda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (2p) Km är substratkoncentrationen när enzymhastigheten är hälften av den maximala enzymhastigheten (Vmax/2). Ett lägre Km-värde innebär att enzymet kommer att nå hälften av sin maximala hastigheten vid en mindre substratkoncentration. Om vi jämför Km-värdet för D-glukos och D-fruktos så ser vi att Km-värdet är lägre för D-glukos. Detta innebär att hexokinas kommer att förbruka D-glukos snabbare.
81 2022-05-16 22 betaoxidation Ange vilka två av följande som är en ketonkropp. (1p) A: Acetyl-CoA B: Aceton C: Adenosin D: Acetoacetat Ange vilka två av följande som är en ketonkropp. (1p) A: Acetyl-CoA B: Aceton C: Adenosin D: Acetoacetat Rätt svar 1. B 2. D
82 2022-05-16 32 cellmembran Beskriv hur lipid rafts är uppbyggda. (2p) Beskriv hur lipid rafts är uppbyggda. (2p) Lipid rafts är uppbyggda av kolesterol, sphingomyelin och glukolipider.
83 2022-05-16 26 aminosyrametabolism Vilka två av följande aminosyror räknas som rent glukogena? A: Glutamat B: Leucin C: Lysin D: Alanin Vilka två av följande aminosyror räknas som rent glukogena? A: Glutamat B: Leucin C: Lysin D: Alanin A och D
84 2022-05-16 12 dna-replikation Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: Flap endonuklease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. D: Topoisomeraser har en 5´ till 3´ exonukleas-aktivitet. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: Flap endonuklease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. D: Topoisomeraser har en 5´ till 3´ exonukleas-aktivitet. Rätt svar 1. A 2. B
85 2022-05-16 27 aminosyrametabolism Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? A: Ureacykelns delreaktioner sker uteslutande i cytosolen. B: Ureacykeldefekter ger upphov till förhöjda plasmanivåer av ammoniak som är mycket toxiskt för framförallt hjärnan. C: De två kväveatomer som finalt hamnar i urea har förts in i ureacykelns cykliska del via karbamoylfosfat och aspartat. D: Enzymet argininosuccinatlyas utgör den viktigaste regleringspunkten i ureacykeln. Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? A: Ureacykelns delreaktioner sker uteslutande i cytosolen. B: Ureacykeldefekter ger upphov till förhöjda plasmanivåer av ammoniak som är mycket toxiskt för framförallt hjärnan. C: De två kväveatomer som finalt hamnar i urea har förts in i ureacykelns cykliska del via karbamoylfosfat och aspartat. D: Enzymet argininosuccinatlyas utgör den viktigaste regleringspunkten i ureacykeln. B och C
86 2022-05-16 13 kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Vilken roll spelar tryptofanrepressorn vid tryptofanoperonet? Hur styrs dess aktivitet av mängden tryptofan? (2p) Vilken roll spelar tryptofanrepressorn vid tryptofanoperonet? Hur styrs dess aktivitet av mängden tryptofan? (2p) Tryptofanoperonet kodar för enzymer som är essentiella för bildningen av tryptofan. Tryptofanrepressorn binder till operatorn i tryptofanoperonet och hämmar transkriptionen. När en tryptofan molekyl binder sig till tryptofanrepressorn, kommer tryptofanrepressorn att kunna binda till operatorn och hämma transkriptionen av tryptofanoperonet. Vid brist på tryptofan, kommer trymptofanrepressorn inte att vara bunden till några tryptofan molekyler och därmed kommer tryptofanrepressorn att lösna från operatorn och tillåta transkriptionen av tryptofanoperonet. Mycket tryptofan => tryptofanrepressorn binder => Transkriptionen hämmas Lite tryptofan => tryptofanrepressorn lössnar => Transkriptionen stimuleras
87 2022-05-16 17 enzymer Vilka två av nedanstående påståenden om övergångstillståndet vid en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det ändrar enzymets optimala pH. B: Det tillåter reaktioner att fortgå vid en acceptabel temperatur. C: Det tillåter kemikalier att reagera som annars inte skulle göra det. D: Det tillåter reaktioner att fortskrida snabbare. Vilka två av nedanstående påståenden om övergångstillståndet vid en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det ändrar enzymets optimala pH. B: Det tillåter reaktioner att fortgå vid en acceptabel temperatur. C: Det tillåter kemikalier att reagera som annars inte skulle göra det. D: Det tillåter reaktioner att fortskrida snabbare. Rätt svar 1. A 2. C
88 2022-05-16 23 citronsyracykeln 2,4-dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord) 2,4-dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord) 2,4-dinitrofenol är en frikopplare, vilket innebär att den förstör protongradienten över mitokondriens inremembran. 2,4-dinitrofenol är en hydrofob molekyl som kan lätt diffundera från mitokondriens intermembranutrymmet till matrix. 2,4-dinitrofenol kan binda till vätejoner och transportera de över mitokondriens inre membran, vilket förstör protongradienter och ger upphov till värme. Protongradienten behövs för att producera ATP. När protongradienter förstörs kommer cellen att bryta mer fettsyror ner för att upprätthålla gradienter. Detta gör att upptag av 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning, då kroppen bryter ner en stor mängd av fett. Vilka två av nedanstående enzymer katalyserar en dekarboxylering? Isocitratdehydrogenas Alfaketoglutaratdehydrogenas Malatdehydrogenas Succinatdehydrogenas
89 2022-05-16 33 transport-över-cellmembran Proteinet på bilden transporterar glukos och Na⁺ från tarmen in i epitelceller. A) Vilken typ av transportör är det? B) Vilken typ av transport sker för glukos? C) Vilken är drivkraften bakom transporten av glukos? (Max 75 ord) ![[Pasted image 20251128083857.png]] Proteinet på bilden transporterar glukos och Na⁺ från tarmen in i epitelceller. A) Vilken typ av transportör är det? B) Vilken typ av transport sker för glukos? C) Vilken är drivkraften bakom transporten av glukos? (Max 75 ord) ![[Pasted image 20251128083857.png]] A. Symport B. Sekundär-aktivtransport C. Vid sekundär-aktivtransport används en molekyl koncentrationsgradient för att transportera en annan molekyl mot sin koncentrationsgradient. Vid transport av glukos används Na jonernas koncentrationsgradient som drivkraften. Det är termodynamiskt fördelaktigt att transportera Na in i cellen då det sker med koncentrationsgradienten.
90 2022-05-16 24 integrering-av-metabolismen 2,4 -dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4 -dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord) 2,4 -dinitrofenol är en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4 -dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord) 1.5p av 2: 2,4-dinitrofenol är en frikopplare, vilket innebär att den förstör protongradienten över mitokondriens inremembran. 2,4-dinitrofenol är en hydrofob molekyl som kan lätt diffundera från mitokondriens intermembranutrymmet till matrix. 2,4-dinitrofenol kan binda till vätejoner och transportera de över mitokondriens inre membran, vilket förstör protongradienter och ger upphov till värme. Protongradienten behövs för att producera ATP. När protongradienter förstörs kommer cellen att bryta mer fettsyror ner för att upprätthålla gradienter. Detta gör att upptag av 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning, då kroppen bryter ner en stor mängd av fett. AI: 2,4-Dinitrofenol (DNP) frikopplar oxidativ fosforylering genom att transportera protoner över det inre mitokondriemembranet. När protongradienten kortsluts kan ATP-syntas inte använda energin i elektrontransportkedjan för att bilda ATP. Cellerna svarar genom att öka oxidationen av fett och kolhydrater för att försöka upprätthålla ATP-nivåerna, vilket kraftigt ökar metabolismen och värmeproduktionen. Denna ineffektiva energiomvandling gör att mer bränsle förbrukas per producerad ATP → snabb viktminskning. Den ökade syreförbrukningen och värmeproduktionen kan bli livshotande, eftersom DNP ger hypertermi, acidos och organsvikt vid relativt små doser.
91 2022-05-16 10 rna-syntes Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. Rätt svar 1. A 2. D
92 2022-05-16 9 rna-syntes Hur kan en punktmutation i ett intron leda till human sjukdom? (2p) (Max 25 ord). Hur kan en punktmutation i ett intron leda till human sjukdom? (2p) (Max 25 ord). Genom att skapa nya splice-sites i intronen som leder till att mRNAt klivs felaktigt, som gör att mRNAt kan koda för fel proteiner.
93 2022-05-16 34 plasmid Förklara kortfattat vad som menas med A) Selektion av antibiotikaresistenta bakterier B) Blåvit screening (2p) Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska. Förklara kortfattat vad som menas med A) Selektion av antibiotikaresistenta bakterier B) Blåvit screening (2p) Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska. A. Selektion av antibiotikaresistenta bakterier innebär att odla bakterier i en miljö med antibiotika. Då kommer bara de bakterier med antibiotikaresistens att överleva, medan de bakterier utan antibiotika resistens kommer att dö ut. Ampicillin är ett exempel av antibiotika som används vid selektion av antibiotikaresistenta bakterier. Genom att använda plasmider som innehåller antibiotikaresistens-gener kommer endast de bakterier som bär på dessa plasmider att överleva i en antibiotikarik miljö. B. Blåvit screening är ett metod att skilja mellan bakterier med plasmider och bakterier utan plasmider. Bakterier med plasmider har en klyvd lac-operon och därför kommer inte de färgas vid addition av x-GAL, då säger man att de är vita kolonier. Bakterier utan plasmider har en fullt fungerande lac-operon och kommer att färgas blått vid addition av x-GAL, då säger man att de är blå kolonier.
94 2022-05-16 14 translation Hur är det möjligt för en bakterie att initiera proteinsyntes av flera olika proteiner från enbart ett mRNA-transkript? (2p) Hur är det möjligt för en bakterie att initiera proteinsyntes av flera olika proteiner från enbart ett mRNA-transkript? (2p) Till skillnad från eukaryouter där mRNAt har endast en startkodon (AUG), har bakterier flera start kodoner inom samma mRNA molekyl. I bakterier har mRNAt "shine dalgarno" sekvenser i närhet till startkodonerna AUG. Dessa "shine dalgarno" sekvenser känns igen med hjälp av S16 subenheten som i sin tur finns i S30 subenheten av ribosomen (också kallad den lilla subenheten). Detta förklarar hur det är möjligt att initiera proteinsyntes av flera olika proteiner från enbart ett mRNA-transkript i bakterier.
95 2022-05-16 20 glykogen I vilka två vävnader hittar vi framförallt glykogen hos människa, och vilken huvudsakliga funktion har glykogenet i respektive vävnad? (2p) I vilka två vävnader hittar vi framförallt glykogen hos människa, och vilken huvudsakliga funktion har glykogenet i respektive vävnad? (2p) Glykogen finns i muskelvävnad och i levern. Glykogen i levern används för att reglera glukoshalten i blodet. Glykogen bryts ner till glukos-1-fosfat och omvandlas senare till glukos-6-fosfat med hjälp av enzymet fosfoglukomutas. Glukos-6-fosfat kan defosforyliseras till glukos med hjälp av enzymet glukos-6-fosfatas som endast finns i levern. Senare kan glukos molekylerna frisättas från levern till blodet. Muskler saknar enzymet glukos-6-fosfatas vilket innebär att muskler kan inte skapa glukos och frisätta det i blodet. Glykogenet i muskler används därför som energireserv, genom att brytas ner till glukos-6-fosfat som kan fortsätta i glykolysen och till sist producera ATP.
96 2022-05-16 30 heme Vilken typ av bilirubin (konjugerat eller okonjugerat) är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? Förklara varför. (2p) Vilken typ av bilirubin (konjugerat eller okonjugerat) är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? Förklara varför. (2p) I mjälten bryts hem ner till biliverdin och sedan omvandlas till okonjugerat bilirubin som frisätts i blodet. I levern konjugeras bilirubinet och utsöndras via galla. Konjugeringen sker för att göra den hydrofoba bilirubinet amfipatisk och vattenlöslig. Vid hemolytiska sjukdomar ökar nedbrytningen av röda blodkroppar i mjälten vilket ger upphov till förhöjt koncentration av okonjugerat bilirubin. Om levern inte kan ta hand om de stora koncentrationer av okonjugerat bilirubin i blodet ansamlas okonjugerat bilirubin i stora koncentrationer.
97 2022-05-16 15 termodynamik A biologist studying a new bacterial strain identified in Göteborg is interested in the following two new biochemical reactions: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) What does ∆G mean in Thermodynamics? Which of the two reactions is spontaneous and what is the explanation for this? / En biolog som studerar en ny bakteriestam som har identifierats i Göteborg är intresserad av följande biokemiska reaktioner: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) Vad avses med ∆G inom termodynamiken? Vilken av reaktionerna är spontan och vilken är anledningen till det? This question needs to be answered in English. (2p) (Max 100 words) A biologist studying a new bacterial strain identified in Göteborg is interested in the following two new biochemical reactions: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) What does ∆G mean in Thermodynamics? Which of the two reactions is spontaneous and what is the explanation for this? / En biolog som studerar en ny bakteriestam som har identifierats i Göteborg är intresserad av följande biokemiska reaktioner: P + H₂O -> Q + Pi (∆G = -38 kJ/mol) X + Y -> Z + H₂O (∆G = +55 kJ/mol) Vad avses med ∆G inom termodynamiken? Vilken av reaktionerna är spontan och vilken är anledningen till det? This question needs to be answered in English. (2p) (Max 100 words) G (Gibbs free energi) means the change of free energy in the system. Delta-G explains how the free energi in the system change after a specific reaction. Negative delta-G means the reaction is spontaneous, while positive delta-G indicates that the reaction is not spontaneous and is not thermodynamicly favorable. The spontaneous reaction is P + H₂O -> Q + Pi because it has negativ Delta-G.
98 2022-05-16 21 integrering-av-metabolismen Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (2p) (Max 120 ord) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? C) En typ av reglering av komplexet är av feedforwardtyp. Redogör för vad feedforwardreglering innebär samt vad som ger feedforwardreglering av komplexet och hur. Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (2p) (Max 120 ord) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? C) En typ av reglering av komplexet är av feedforwardtyp. Redogör för vad feedforwardreglering innebär samt vad som ger feedforwardreglering av komplexet och hur. A. Pyruvatdehydrogenaskomplexet är länken mellan glykolysen och citronsyracykeln. Komplexet katalyserar den irreversibla nedbrytningen av pyruvat till koldioxid och acetyl-Coa. B. Komplexet styr en irreversibel reaktion där pyruvat bryts ner till Acetyl-Coa. Acetyl-Coa kan inte användas för återbilda pyruvat och därför måste den användas i andra metabola vägar. Därför är enormt viktigt att reglera komplexet för att inte slösa pyruvat onödigt. C. Feedforwardreglering innebär att substraten i en reaktion stimulerar enzymet som katalyserar denna reaktion. Pyruvat ger feedforwardreglering av pyruvatdehydrogenaskomplexet, då ökade koncentrationen av pyruvat leder till att komplexet stimuleras. Då bryts pyruvat till Acetyl-Coa för att minska koncentrationen av pyruvat.
99 2022-05-16 31 kolesterol Beskriv kortfattat två huvudsakliga mekanismer för hur cellens intracellulära kolesterolkoncentration regleras. (2p) Beskriv kortfattat två huvudsakliga mekanismer för hur cellens intracellulära kolesterolkoncentration regleras. (2p) 1. Transkriptionen av HMGR kan regleras. Vid låg halt av kolesterol kommer Insig-proteinet att lössna från scap-SREBP komplexet i ER, vilket gör att scap-SREBP transporteras till golgia apparaten med hjälp av COPII. SREBP bryts ner av enzymerna S1P och S2P, vilket gör att den N-terminala delen av SREBP frigörs till cellkärnan. I cellkärnan kan den N-terminala delen av SREBP binda till SRE-1, vilket bland annat ökar transkriptionen av enzymet HMGR. HMGR katalyserar första steget i kolesterolsyntesen där HMG omvandlas till mevalonat. 2. Translationen av HMGR-mRNAt kan regleras med hjälp av oxylanesterol-halten i cellen. En hög halt oxylanesterol (orsakad av hög halt av kolesterol) leder till att mindre polysomer binder till HMGR-mRNAt, vilket leder till mindre translation av HMGR. Å andra sidan kommer en låg oxylanesterol-halt (orsakad av låg halt av kolesterol) i cellen att leda till att fler polysomer binder sig till HMGR-mRNAt, då translateras fler HMGR som stimulerar kolesterolsyntes.
100 2022-05-16 25 elektrontransportkedjan A. Vad innebär redoxpotential? B. Ge två exempel på redoxpar som förekommer i elektrontransportkedjan. (2p) (Max 75 ord) A. Vad innebär redoxpotential? B. Ge två exempel på redoxpar som förekommer i elektrontransportkedjan. (2p) (Max 75 ord) A. Redoxpotential innebär ett molekyls förmåga att ta upp elektroner. Hög redoxpotential innebär att molekylen har stor affinitet till elektroner (molekylen vill ta upp mer elektroner), medan låg redoxpotential innebär att molekylen har låg affinitet till elektroner (molekylen vill avge sina elektroner). B. Ubiquiton (Q) och Ubiquinol (QH₂). QH₂ har lägre redoxpotential än Q, då QH₂ vill avge sina två elektroner. FADH₂ och FAD är ett annat redoxpar i elektrontransportkedjan.
101 2022-05-16 11 kromatin Vilka två av följande påståenden om histoner är korrekta? A: I kromatin ingår endast DNA, ej proteiner. B: I en nukleosom är ~146 bp av DNA lindat kring en kärna av åtta histonproteiner. C: Acetylering av histonsvansar kan neutralisera positiva laddningar. D: Med begreppet histonkod avses DNA-sekvensen hos histongener. Vilka två av följande påståenden om histoner är korrekta? A: I kromatin ingår endast DNA, ej proteiner. B: I en nukleosom är ~146 bp av DNA lindat kring en kärna av åtta histonproteiner. C: Acetylering av histonsvansar kan neutralisera positiva laddningar. D: Med begreppet histonkod avses DNA-sekvensen hos histongener. Rätt svar 1. B 2. C
102 2022-05-16 8 evolution Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p) Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p) Endosymbios är en teori som förklarar mitokondriens uppkomst i eukaryota celler. Teorin går ut på att en stor anaerob eukaryotcell har endocyterat en aerob bakterie. Den eukaryota cellen och bakterien lever i symbios, där den eukaryota cellen försörjer bakterien med metaboliter medan bakterien utför aerob metabolism åt den eukaryotacellen. Bakterien har senare utvecklats till mitokondrie. En bevis på att endosymbios teorin stämmer är att mitokondrier har egna DNA.
103 2022-05-16 35 introduktionslaboration Du vill sätta upp en studie för att ta reda på hur lång tid det tar för blod att koagulera hos friska individer. Du vill få ett relativt litet standardfel (SE) för att känna att du har lyckats få en bra skattning av hur lång tid det brukar ta för blod att koagulera. SE kan härledas fram med hjälp av två parametrar. Vilka är parametrarna och hur ska de se ut om du vill få ett litet värde på SE? (2p) (Max 50 ord.) Du vill sätta upp en studie för att ta reda på hur lång tid det tar för blod att koagulera hos friska individer. Du vill få ett relativt litet standardfel (SE) för att känna att du har lyckats få en bra skattning av hur lång tid det brukar ta för blod att koagulera. SE kan härledas fram med hjälp av två parametrar. Vilka är parametrarna och hur ska de se ut om du vill få ett litet värde på SE? (2p) (Max 50 ord.) 1- Ju större antal individer som försöket utförs på desto lägre SE. 2- Ju mer lika dessa individers egenskaper är (ålder, kön, hälsa, kost mm.) desto lägre SE.
104 2022-05-16 3 från-aminosyror-till-proteiner När protoner transporteras över mitokondriens inre membran genom ATPsyntas spelar specifika aminosyror en viktig roll. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar protontransporten behöver ha och vad som möjliggör protontransporten. Ge även ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (2p) (Max 100 ord) När protoner transporteras över mitokondriens inre membran genom ATPsyntas spelar specifika aminosyror en viktig roll. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar protontransporten behöver ha och vad som möjliggör protontransporten. Ge även ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (2p) (Max 100 ord) ATPsyntasets transmembranella del (F0) ansvarar för transporten av protoner över mitokondriens inre membran. F0 innehåller en roterande c-ring som består av 10 c-subenheter samt en a-subenhet som protoniserar och deprotoniserar c-subenheterna. När en c-subenhet protoniseras, nutraliseras ett negativt laddat aminosyra i c-subenheten, vilket leder till en konformationsändring som tillåter c-ringen att rotera. En protoniserad c-subenhet roterar en varv runt c-ringen innan den släpper sin proton, då blir aminosyran negativt laddad som i början. Exempel på ett negativt laddad aminosyra: Aspartat
105 2022-05-16 7 nukleotider Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p) Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i våra celler. (2p) Endosymbios är en teori som förklarar mitokondriens uppkomst i eukaryota celler. Teorin går ut på att en stor anaerob eukaryotcell har endocyterat en aerob bakterie. Den eukaryota cellen och bakterien lever i symbios, där den eukaryota cellen försörjer bakterien med metaboliter medan bakterien utför aerob metabolism åt den eukaryotacellen. Bakterien har senare utvecklats till mitokondrie. En bevis på att endosymbios teorin stämmer är att mitokondrier har egna DNA. A. Hur skiljer sig endonukleaser från exonukleaser? B. Skriv det fullständiga namnet för dADP? (2p) A. Endonukleaser klipper nukleinsyror från mitten, medan exonukleaser klipper nukleinsyror från ändarna (antingen från 3' till 5' riktning eller från 5' till 3'). Detta utförs genom att bryta fosfodiesterbindningen mellan nukleotiderna. B. Deoxyadinosindifosfat
106 2022-05-16 6 utforska-proteiner Du har fått i uppgift att preparera fram ett protein ur ett homogenisat och du kommer använda tre olika metoder för detta. Beskriv varje metod kortfattat samt ange vilken proteinegenskap som används för separationen (2p) (Max 200 ord) A. Gelfiltrering B. Jonbyteskromatografi C. Affinitetskromatografi Du har fått i uppgift att preparera fram ett protein ur ett homogenisat och du kommer använda tre olika metoder för detta. Beskriv varje metod kortfattat samt ange vilken proteinegenskap som används för separationen (2p) (Max 200 ord) A. Gelfiltrering B. Jonbyteskromatografi C. Affinitetskromatografi A. Vid gelfiltrering består den fasta fasen av kulor med håligheter. Vid gelfiltrering filtreras proteinerna storleksmässigt, där små proteiner binder till kulorna medan de stora proteiner fortsätter vidare genom kolumnen. Därför kommer protienerna med störst massa först ut, och proteinerna med låg massa hamnar sist i filtreringen. B. Jonbyteskromatografi filtrerar protiener beroende på laddning. De finns två typer av jonbyteskromatografi. Första typen är anjonsbytare, där proteinerna med positiv laddning kommer ut först. Andra typen är katjonsbytare där jonerna med negativ laddning kommer ut först. Den fasta fasen består av kulor med antingen negativ eller positiv laddning som kan fästa till de laddade proteinerna med hjälp av jonbindningar. C. Affinitetskromatografi är en filtreringsmetod som är baserad på att filtrera protiener med hjälp av en speciell egenskap hos proteinerna. Till exempel kan proteinernas glykolysering användas för att filtrera protienerna.
107 2022-05-16 2 lipider Nya regler från EU ska se till att minimera mängden transfetter i livsmedel. Vilka två påståenden stämmer om transfetter? (1p) A: Transfetter kan i regel packas tätare än cisfetter och bidrar därmed till minskad fluiditet i cellmembranet. B: Transfetter kan inte brytas ner av kroppens enzymer. C: Transfetter höjer koncentrationen av det ”goda” kolesterolet HDL i blodet. D: Transfetter består av mättade fettsyror. Nya regler från EU ska se till att minimera mängden transfetter i livsmedel. Vilka två påståenden stämmer om transfetter? (1p) A: Transfetter kan i regel packas tätare än cisfetter och bidrar därmed till minskad fluiditet i cellmembranet. B: Transfetter kan inte brytas ner av kroppens enzymer. C: Transfetter höjer koncentrationen av det ”goda” kolesterolet HDL i blodet. D: Transfetter består av mättade fettsyror. Rätt svar 1. A 2. B
108 2025-02-01 28 elektrontransportkedjan Redogör för ett skäl till att man inte kan säga exakt hur många protoner som behöver förflyttas över mitokondriens inre membran för varje ATP som bildas av ATP-syntaset. Förklara också hur protonerna förflyttas i ATP-syntaset. (4p) Max 80 ord. Redogör för ett skäl till att man inte kan säga exakt hur många protoner som behöver förflyttas över mitokondriens inre membran för varje ATP som bildas av ATP-syntaset. Förklara också hur protonerna förflyttas i ATP-syntaset. (4p) Max 80 ord. 3.5 av 4 poäng C-ringen är bunden till ATP-syntasets matrix del via en gamma stjälk. Inre delen består av 6 subenheter, 3 beta och 3 alfa. Det är beta subenheterna som sköter produktion av ATP då de har 3 konformationer, loose(tar emot ADP+pi), tense (bildar ATP) och open (ATP lämnar). När en proton binder till c-subenhet neutraliserar det en negativladdad aa --> c ringen roterar - -> gamma-stjälken + b-subenheter roterar-->ATP-produktion. -Svårt att säga exakt atntal H+ eftersom frikopplare utjämnar gradienten utan att tillverka ATP. Ord: 80 Totalpoäng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen AI-rättning 1. Det korrekta skälet: antalet c-subenheter varierar mellan arter C-ringen i ATP-syntas har olika antal c-subenheter (t.ex. 8–15). Varje subenhet kräver 1 H⁺ per 360° rotation. Därför varierar H⁺/ATP mellan organismer. Det är detta examinatorerna är ute efter. 2. Övriga faktorer som påverkar (godkända som komplettering): Protonläckage (inkl. UCP/frikopplare). Energiåtgång för fosfattransport och ADP/ATP-translokas.
109 2025-02-01 5 utforska-proteiner Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av HIV. (4p) Max 200 ord. (Lista A–B i ditt svar nedan!) A) Nämn en analysmetod som kan användas för att undersöka detta samt beskriv de olika stegen i metoden. B) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod? Du jobbar på labb över sommaren och har fått in en patient som du misstänker är smittad av HIV. (4p) Max 200 ord. (Lista A–B i ditt svar nedan!) A) Nämn en analysmetod som kan användas för att undersöka detta samt beskriv de olika stegen i metoden. B) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod? a) För att undersöka huruvida en patient är smittad av HIV eller inte, kan metoden indirekt ELISA användas. I denna metod har vi först en brunn med HIV-antigener. Prov från patienten tillsätts för att senare kunna se om dess antikroppar binder till antigenerna, och därefter sköljer vi för att undvika att oönskade substanser ska påverka resultatet. Senare tillsätts enzymbundna antikroppar till provet, och sedan sköljer vi igen. Efteråt tillsätts ett substrat som binder till enzymet. Om patienten har antikroppar, kommer patientens antikroppar ha bundit till antigenena och därmed kommer provet att färgas. Om patientens antikroppar inte binder, kommer vi inte få något färgämne, vilket tyder på att patienten inte har antikropparna och har därmed inte HIV. b) antikroppar
110 2025-02-01 18 termodynamik Redogör för begreppet entalpi. Vilka termer/aspekter ingår och hur kan man använda entalpiförändringar för att förutse benägenheten för en viss biokemisk reaktion att ske? (4p) Redogör för begreppet entalpi. Vilka termer/aspekter ingår och hur kan man använda entalpiförändringar för att förutse benägenheten för en viss biokemisk reaktion att ske? (4p) Elev 1 - 2 av 4 poäng Entalpi är skillnaden mellan produkternas och reaktanternas energi i en reaktion. Om entalpivärdet är positivt, innebär det att reaktionen kommer kräva energitillförsel, då produkterna kommer ha högre energi än reaktanterna. Om entalpivärdet är negativt innebär det att reaktionen kan ske spontant då det frigörs energi och det är därmed fördelaktig. Elev 2 - 2 av 4 poäng Entalpi är värme energi, betecknas H. En reaktion mellan x och y, där y har högre entalpi än x är ofördelaktig eller har positiv deltaG för man går från att ha lite energi till att ha mer, vilket innebär att energiförändringen (E2-E1) är negativ --> alltså behöver energi tillföras för att reaktionen ska ske. Om reaktionen skulle vara spontant istället så behöver entalpin hos y vara lägre än X --> deltaG < 0. H = S - T x deltaG AI-rättning: Den riktiga definitionen: H = U + pV. ΔH = värmeutbyte vid konstant tryck. ΔH ensamt räcker inte för spontanitet → måste kopplas till ΔG = ΔH − TΔS. Entropi och temperatur som avgörande delar av bedömningen. Biokemisk kontext: bindningsstyrka, värmeutbyte, och hur ΔH vägs mot ΔS för att avgöra om en reaktion går åt rätt håll.
111 2025-02-01 1 kemiska-bindingar Vilka två påståenden om vätebindningar är korrekta? (2p) A: De stabiliserar primärstrukturen hos proteiner. B: De bildas mellan dipoler. C: Ju rakare bindning, desto svagare. D: Acceptoratomerna har hög elektronegativet. Vilka två påståenden om vätebindningar är korrekta? (2p) A: De stabiliserar primärstrukturen hos proteiner. B: De bildas mellan dipoler. C: Ju rakare bindning, desto svagare. D: Acceptoratomerna har hög elektronegativet. B och D
112 2025-02-01 19 enzymer Fördelen med att mäta den initiala hastigheten V i början av en reaktion är att (välj två av nedanstående): (2p) A: Förändringar i [S] är försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. B: Produktinhibering kan då inte påverka hastigheten. C: Förändringar i Km är försumbara, så Km kan behandlas som en konstant. D: Variationer av [S] har ingen effekt på V₀. Fördelen med att mäta den initiala hastigheten V i början av en reaktion är att (välj två av nedanstående): (2p) A: Förändringar i [S] är försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. B: Produktinhibering kan då inte påverka hastigheten. C: Förändringar i Km är försumbara, så Km kan behandlas som en konstant. D: Variationer av [S] har ingen effekt på V₀. A och B
113 2025-02-01 29 aminosyrametabolism Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? (2p) A: Nedsatt funktion av enzymer som verkar i ureacykeln leder till förhöjda plasmanivåer av ammoniak. B: Ureacykeln sker i ibland i muskel när denna vävnad använder sig av aminosyror som energikälla. C: De två kväveatomer som slutligen hamnar i urea har förts in i ureacykeln via karbamoylfosfat och aspartat. D: Ureacykelns huvudsakliga funktion är att omvandla urea, som bildas vid nedbrytning av tex aminosyror, till ammoniak som kan utsöndras med urinen. Vilka två av följande påståenden relaterade till ureacykeln är korrekta? (2p) A: Nedsatt funktion av enzymer som verkar i ureacykeln leder till förhöjda plasmanivåer av ammoniak. B: Ureacykeln sker i ibland i muskel när denna vävnad använder sig av aminosyror som energikälla. C: De två kväveatomer som slutligen hamnar i urea har förts in i ureacykeln via karbamoylfosfat och aspartat. D: Ureacykelns huvudsakliga funktion är att omvandla urea, som bildas vid nedbrytning av tex aminosyror, till ammoniak som kan utsöndras med urinen. B och C OBS: Fel i facit, föreläsaren bekräftat att B och C är rätt
114 2025-02-01 4 hemoglobin A) Name two allosteric regulators of oxygen binding to hemoglobin. B) Explain an outcome for each regulator. (Max 100 words.) Please answer this question in English. (4p) A) Name two allosteric regulators of oxygen binding to hemoglobin. B) Explain an outcome for each regulator. (Max 100 words.) Please answer this question in English. (4p) a) O₂ and CO₂ b) O₂: Hemoglobin has four subunits that bind to O₂ through cooperativity, meaning that if one subunit binds to an O₂, the other subunits' affinity for O₂ will increase, leading to all subunits binding to O₂. When O₂ binds, the state goes from T-state (deoxy; tense) to R-state (oxy; relaxed). CO₂: When CO₂ binds to hemoglobin, the hemoglobin's affinity to oxygen decreases, leading to a stabilization of the T-state instead.
115 2025-02-01 16 transport-över-cellmembran ![[Pasted image 20251129235913.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns proteinet? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord. ![[Pasted image 20251129235913.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns proteinet? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord. A) ATPaser, specifikt ABCaset. Exempel på aktiv transport. B) Ligger på cellmembranet, transporterar substrat från cytoplasman till ECM. C) ATP hydrolys --> fosfoanhydridbindningar bryts --> energi frigörs, det sker konformationsändringar som växlar mellan att proteinet öppnar mot cytoplasman respektive ECM. Ord: 40 Totalpoäng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen
116 2025-02-01 22 glykolysen Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glykolysen? (2p) A: När glukos fosforyleras av hexokinas kan produkten enbart användas i glykolysen. B: För varje glukosmolekyl bildas 4 ATP. C: Den sker i cellens cytoplasma. D: Den kräver syre. Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glykolysen? (2p) A: När glukos fosforyleras av hexokinas kan produkten enbart användas i glykolysen. B: För varje glukosmolekyl bildas 4 ATP. C: Den sker i cellens cytoplasma. D: Den kräver syre. B och C
117 2025-02-01 32 pentosfosfatvägen Nämn två metabola vägar som är integrerade med pentosfosfatvägen eftersom de sker i samma del av cellen och har gemensamma intermediärer. (2p) Max 10 ord. Nämn två metabola vägar som är integrerade med pentosfosfatvägen eftersom de sker i samma del av cellen och har gemensamma intermediärer. (2p) Max 10 ord. Glykolysen och glukoneogenesen
118 2025-02-01 26 lipider Beskriv hur acetyl-CoA karboxylas regleras. (4p) Beskriv hur acetyl-CoA karboxylas regleras. (4p) Elev 1 - 1 av 4 Insulin stimulerar enzymet medan glukagon hämmar. Enzymet är aktivt i dess defosforylerade form, och insulin stimulerar defosforylering. Acetyl-CoA-karboxylas fosforyleras när glukagon är dominerande, och därmed hämmas enzymet av glukagon. Feedforwardreglering av pyruvat där höga mängder pyruvat hämmar och låga mängder stimulerar. Elev 2 - 1 av 4 Acetyl-CoA karboxylas stimuleras av insulin och hämmas av glukagon. Den regleras även av energikvoten där ATP stimulerar och ADP/AMP hämmar. AI-rättning Citrat aktiverar (allosteriskt + polymerisering) Palmitoyl-CoA hämmar (feedback + depolymerisering) AMPK fosforylerar och inaktiverar → energikontroll Polymeriseringstillståndet styr enzymets aktivitet (Insulin/glukagon ska nämnas, men räcker inte ens nära för 4p)
119 2025-02-01 12 rna-syntes Vilka två påståenden om RNA-splicing är korrekta? (2p) A: Spliceosomen består av både RNA och proteiner. B: Splicingprocessen sker i cellens cytoplasma. C: Splicing sker endast i prokaryoter. D: En lariatstruktur bildas. Vilka två påståenden om RNA-splicing är korrekta? (2p) A: Spliceosomen består av både RNA och proteiner. B: Splicingprocessen sker i cellens cytoplasma. C: Splicing sker endast i prokaryoter. D: En lariatstruktur bildas. A och D
120 2025-02-01 27 elektrontransportkedjan Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (2p) Börja med lägst redoxpotential: cytokrom c FADH₂ NADH O₂ Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (2p) Börja med lägst redoxpotential: cytokrom c FADH₂ NADH O₂ A: NADH B: FADH₂ C: cytokrom c D: O₂
121 2025-02-01 13 kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Lac-operonet reglerar nedbrytningen av laktos i bakterier. Vilken roll spelar allolaktos vid lac-operonet, och hur påverkar detta transkriptionen av generna som är inblandade i laktosmetabolismen? (4p) Lac-operonet reglerar nedbrytningen av laktos i bakterier. Vilken roll spelar allolaktos vid lac-operonet, och hur påverkar detta transkriptionen av generna som är inblandade i laktosmetabolismen? (4p) Allolaktos är en korepressor som binder till repressorn på lac-operonet vid närvaro av laktos. När allolaktos binder, kommer repressorn att flyttas och därmed kommer gener som kodar för enzymer som bryter ner laktos att kunna transkriberas.
122 2025-02-01 17 cellmembran Perifera membranproteiner kan vara bundna till cellmembranet på flera olika sätt. Beskriv tre olika varianter. (4p) Perifera membranproteiner kan vara bundna till cellmembranet på flera olika sätt. Beskriv tre olika varianter. (4p) 1. Kan binda mha adhesions molekyler, ex integriner som binder via komponenter i ECM (ex kollagen). 2. GPI ankare. Kan frisättas när som helst vid behov, då den binder perifert till nervcellernas cellmembran. 3. Kan binda till delen av membranproteiner som finns utanför cellmembranet. Exempelvis har alfa helixar en del av sig utanför cellmembranet, kan binda till cellmembranet genom den.
123 2025-02-01 23 glukosmetabolism Redogör för hur glukosmetabolismen regleras på hormonell nivå. (4p) Max 150 ord. Redogör för hur glukosmetabolismen regleras på hormonell nivå. (4p) Max 150 ord. Elev 1 - 3 av 4 poäng Glukagon aktiverar glukoneogenesen, det vill säga återbildning av glukos. Detta då glukagon aktiverar cAMP som fosforylerar PKA. PKA, i sin tur, fosforylerar Fosfofruktokinas 2 (PFK2) /fruktos-2,6-bisfosfatas (FBPase-2). Vid fosforylering kommer PFK2-delen att hämmas, samtidigt som FBPase-2-delen aktiveras. När FBPase-2 är aktivt, kommer fruktos-2,6-bisfosfat att brytas ner. Då fruktos-2,6-bisfosfat är en allosterisk regluator som aktiverar fosfofruktokinas 1 i glykolysen, kommer glykolysen att hämmas då f-2,6-bp kommer att brytas ned. Om insulin är dominerande, kommer det däremot signalera defosforylering som medför att PFK2 blir aktivt och bilda fruktos-2,6-bisfosfat som kan stimulera glykolysen. (Sen tror jag också att även glukokinas i levern regleras hormonellt där insulin aktiverar och glukagon hämmar) Elev 2 - 3 av 4 poäng Insulin: Frisätts när glukos nivåer i blodet höjs. Insulin stimulerar enzymer i glykolysen, mycket glukos --> den behöver metaboliseras och användas till ATP produktion. Insulin hämmar enzymer i glukoneogenesen såsom fruktos-1,6-bisfosfatas. Den gör detta genom att aktivera PKA som i sin tur aktiverar fosfofruktokinas-2, enzym som fosforylerar fruktos-6-fosfat för att omvandlas till fruktos-2,6-bisfosfat. Fruktos-2,6-bisfosfat stimulerar glykolysen och hämmar glukoneogenesen, som jag nämnt innan så inhiberar den fruktos- 1,6-fosfatas. Fosfofruktokinas-1 stimuleras av insulin för att omvandla fruktos-6-fosfat till fruktos-1,6-bisfosfat. Glukagon: Frisätts när glukos nivåer i blodet är låga. Den har motsatt effekt till insulin, den stimulerar glukoneogenesen och hämmar glykolysen. Glukagon verkar mest på levern och stimulerar enzymer i som pyruvatkarboxykinasdehydrogenas som är en del av glukoneogenesen. Adrenalin verkar likt glukagon men mer på skelettmuskulatur. All hormonell reglering sker genom att hormonet binder till 7TM receptorer på cellmembranet --> ATP--> cAMP --> aktivt/inaktivt PKA beroende på om enzymet behöver fosforyleras eller defosforyleras. AI-rättning: Att insulin/glukagon reglerar både glykolys, glukoneogenes och glykogenmetabolism. Att insulin verkar via defosforylering och glukagon via fosforylering – kopplat till flera enzym, inte bara PFK-2. Att adrenalin har en tydlig roll i muskel.
124 2025-02-01 33 kolesterol Beskriv två huvudsakliga och principiellt olika sätt, på vilka cellen reglerar mängden fritt intracellulärt kolesterol. (4p) Beskriv två huvudsakliga och principiellt olika sätt, på vilka cellen reglerar mängden fritt intracellulärt kolesterol. (4p) 1. Man kan reglera transkriptionen av HMG-CoA reduktas för det är en irreversibel steg i kolesterol syntesen. Om mängden kolesterol ökar så kommer kolesterol binda till scap protein. Denna förhindrar SERBP transkriptionsfaktorn i ER från att transporteras till golgi där den kan binda till en sekvens SRE-1 och transkribera genen för HMG-CoA reduktas. Då kommer mängden HMG-CoA reduktas minska --> mindre kolesterol syntetiseras. Om det är låg kolesterol däremot så kommer insig proteiner vid ER binda till scap så att den inte blockerar SERBP transkriptionsfaktorn från att gå och binda till SRE-1 och starta transkription. 2. Då kolesterol lagras i kolesterolestrat så kommer cellen att bryta loss fettsyran när den har behov för kolesterol. Kolesterolestrarna transporteras först mha lipoproteiner till cellen för att där inne bryta sig loss och bilda fri kolesterol. 3. (extra) Man kan reglerar kolesterol syntes translationellt genom att låta proteiner binda till mRNA under translation för att inhibera den vid höga kolesterolhalter. Kolesterol kan även binda in sig mellan DNA och mRNA för att störa replikation/translation --> inget kolesterol.
125 2025-02-01 24 glykogen Hur skiljer sig glykogenets huvudsakliga funktion i levern från dess funktion i skelettmuskulaturen? Vilket enzym är avgörande för denna skillnad och i vilken av vävnaderna uttrycks det? (4p) Max 50 ord. Hur skiljer sig glykogenets huvudsakliga funktion i levern från dess funktion i skelettmuskulaturen? Vilket enzym är avgörande för denna skillnad och i vilken av vävnaderna uttrycks det? (4p) Max 50 ord. Glykogen i levern används för att upprätthålla stabilt blodsocker. Glykogen i muskler används till ATP eftersom den saknar glukos-6-fosfatas. Glukos bryts som glukos-1-fosfat från glykogen och omvandlas sedan till glukos-6-fosfat(fosfoglukomutas). I levern finns enzymet glukos-6-fosfatas som omvandlar glukos-6-fosfat till glukos men i skelettmuskler metaboliseras glukos-6-fosfat vidare i glykolysen för ATP-produktion.
126 2025-02-01 10 kromatin Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: Histon H1 binder linker-DNA och stabiliserar nukleosomen. B: Kromatin består endast av DNA. C: Acetylering av histoner leder till en mer kondenserad kromatinstruktur. D: Kromatin finns endast i eukaryota celler. Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: Histon H1 binder linker-DNA och stabiliserar nukleosomen. B: Kromatin består endast av DNA. C: Acetylering av histoner leder till en mer kondenserad kromatinstruktur. D: Kromatin finns endast i eukaryota celler. A och D
127 2025-02-01 9 dna-replikation Vilka två påståenden om eukaryot DNA-replikation är korrekta? (2p) A: ORC binder till replikationsorigin under hela cellcykeln. B: DNA-syntes initieras i M-fas. C: CMG-komplexet bildas genom bindning av MCM, GINS och Cdc45. D: MCM-helikaset är aktivt under hela cellcykeln. Vilka två påståenden om eukaryot DNA-replikation är korrekta? (2p) A: ORC binder till replikationsorigin under hela cellcykeln. B: DNA-syntes initieras i M-fas. C: CMG-komplexet bildas genom bindning av MCM, GINS och Cdc45. D: MCM-helikaset är aktivt under hela cellcykeln. A och C
128 2025-02-01 34 introduktionslaboration Du arbetar som läkare och följer upp hemoglobin (Hb) hos 200 patienter behandlade för järnbrist. Hb följer en normalfördelning med medelvärde 130 g/L och standardavvikelse 10 g/L. Vilka två av följande påståenden är korrekta? (2p) A: Cirka 68% av patienterna har ett Hb mellan 120 och 140 g/L. B: Standardavvikelsen beskriver hur spridda Hb-värdena är kring medelvärdet. C: Cirka 99% av patienterna har ett Hb under 120 g/L. D: Cirka 95% av patienterna har ett Hb mellan 100 och 200 g/L. Du arbetar som läkare och följer upp hemoglobin (Hb) hos 200 patienter behandlade för järnbrist. Hb följer en normalfördelning med medelvärde 130 g/L och standardavvikelse 10 g/L. Vilka två av följande påståenden är korrekta? (2p) A: Cirka 68% av patienterna har ett Hb mellan 120 och 140 g/L. B: Standardavvikelsen beskriver hur spridda Hb-värdena är kring medelvärdet. C: Cirka 99% av patienterna har ett Hb under 120 g/L. D: Cirka 95% av patienterna har ett Hb mellan 100 och 200 g/L. A och B
129 2025-02-01 14 translation Aminoacyl-tRNA synthetases have an activation site and an editing site. Account for their function in translation. (4p) Please answer this question in English. Aminoacyl-tRNA synthetases have an activation site and an editing site. Account for their function in translation. (4p) Please answer this question in English. The activation site is where the binding of an aminoacid to the 3´amino acid pocket in tRNA happens. The enzym catalyzes the reaction between these two to create an "esterbindning" between the CCA in tRNA's amino acid seat/pocket to the C in the aminoacid. More specfically, it is adenine that directly binds to the tRNA. The aminoacyl-tRNA is then moved to the editing site where it gets checked that the right aminoacid has bound to the tRNA to see if its anticodons are compatible with the mRNAs codons. Ord: 88 Totalpoäng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen
130 2025-02-01 20 enzymer Enzymer har ofta en katalytisk klyfta där den katalyserade reaktionen sker. Redogör för två olika kemiska fördelar med detta. (4p) Enzymer har ofta en katalytisk klyfta där den katalyserade reaktionen sker. Redogör för två olika kemiska fördelar med detta. (4p) 1. Unik kemisk miljö där den specifika reaktionen som enzymet katalyserar kan ske utan störningar från omgivningen då katalytiska klyftan isoleras från omgivande miljö. Då kan ex hydrofoba molekyler reagera utan att behöver aggregeras eller påverkas av hydrofob effekt. 2. Vatten kan trängas ut så attt den inte stör eller står i väg när substratet kommer och binder till enzymet. 3. (Extra: katalytiska klyftan är specifikt för en substrat)
131 2025-02-01 30 aminosyrametabolism Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Glutamat och serin utgör de två viktigaste transportformerna av kväve från extrahepatiska vävnader till levern. B: Vid nedbrytning av flera olika aminosyror hamnar deras aminogrupper i glutamat, som i sin tur är molekylen som kan avge aminogruppen som ammoniak i levercellernas mitokondrier. C: Rent ketogena aminosyror kan omvandlas till oxaloacetat. D: Vid leverskada ses oftast förhöjda plasmanivåer av två aminotransferaser, alaninaminotransferas och aspartataminotransferas. Vilka två av följande påståenden relaterade till aminosyrametabolism är korrekta? (2p) A: Glutamat och serin utgör de två viktigaste transportformerna av kväve från extrahepatiska vävnader till levern. B: Vid nedbrytning av flera olika aminosyror hamnar deras aminogrupper i glutamat, som i sin tur är molekylen som kan avge aminogruppen som ammoniak i levercellernas mitokondrier. C: Rent ketogena aminosyror kan omvandlas till oxaloacetat. D: Vid leverskada ses oftast förhöjda plasmanivåer av två aminotransferaser, alaninaminotransferas och aspartataminotransferas. B och D
132 2025-02-01 15 evolution Redogör för de två viktigaste principerna som förklarar hur nya egenskaper kan utvecklas i ett evolutionärt sammanhang samt hur de två principerna är beroende av varandra. (4p) Redogör för de två viktigaste principerna som förklarar hur nya egenskaper kan utvecklas i ett evolutionärt sammanhang samt hur de två principerna är beroende av varandra. (4p) De två viktigaste principerna är variation och naturligt urval. I en population förekommer en genetisk variation mellan individerna. Den genetiska variationen beror på mutationer bland annat. Alla individer har inte samma egenskaper och är därför olika anpassade efter miljön som dessa lever i. De individer som är bäst anpassade till miljön kommer ha en större chans att utnyttja resurserna och kunna överleva samt föröka sig och föra vidare sina gynnsamma gener. Detta i sin tur är kallat naturligt urval där miljön "selekterar" de bäst anpassade. Exempel på det är hur giraffens långa hals kan ha uppstått. I en giraffpopulation förekom en genetisk variation med giraffer som hade både korta och långa halser. I en miljö med korta träd kunde båda nyttjas, men i samband med att träden blev allt högre, kunde de som hade långt hals nå upp och utnyttja det. Dessa blev de bäst anpassade och därmed överförde vidare de gynnsamma generna, medan de som hade kort hals kunde inte utnyttja resurserna på samma sätt i just den specifika miljön.
133 2025-02-01 21 integrering-av-metabolismen Vilka två av nedanstående molekyler innehåller delar från en B-vitamin? (2p) A: Cyt c B: ATP C: CoA D: NADH Vilka två av nedanstående molekyler innehåller delar från en B-vitamin? (2p) A: Cyt c B: ATP C: CoA D: NADH C och D
134 2025-02-01 31 nukleotidnedbrytning Namnge en nukleosid och ange i vilken molekyl merparten av nukleosidens kväveatomer hamnar när den bryts ned. Molekylen utsöndras slutligen med urinen. (2p) Max 10 ord. Namnge en nukleosid och ange i vilken molekyl merparten av nukleosidens kväveatomer hamnar när den bryts ned. Molekylen utsöndras slutligen med urinen. (2p) Max 10 ord. Adenosin. Hamnar i Urat
135 2025-02-01 25 citronsyracykeln I citronsyracykeln deltar fyra dehydrogenaser. A) Vad gör ett dehydrogenas? B) Vilka två av de fyra dehydrogenaserna utför också en annan gemensam reaktion? C) Vilken är den andra gemensamma reaktionen? (4p) Max 30 ord. I citronsyracykeln deltar fyra dehydrogenaser. A) Vad gör ett dehydrogenas? B) Vilka två av de fyra dehydrogenaserna utför också en annan gemensam reaktion? C) Vilken är den andra gemensamma reaktionen? (4p) Max 30 ord. a) Tar bort väte b) Isocitratdehydrogenas och alfa-ketoglutaratdehydrogenas c) Dekarboxylering; frigör CO₂
136 2025-02-01 11 dna-replikation Telomeras är ett enzym som spelar en viktig roll i bevarandet av kromosomernas integritet under DNA-replikation. Vad gör telomeras, och varför är det viktigt för celler som delar sig ofta, som stamceller och könsceller? (4p) Telomeras är ett enzym som spelar en viktig roll i bevarandet av kromosomernas integritet under DNA-replikation. Vad gör telomeras, och varför är det viktigt för celler som delar sig ofta, som stamceller och könsceller? (4p) Vid replikation av DNA har vi en ledande sträng som syntetiseras kontinuerligt, och en lagging sträng som syntetiseras i olika fragment kallade Okazakifragment. Då replikationen sker i 5'- till 3'-riktning, måste Okazakifragmenten ha olika RNA-primers som de startar vid. Just här uppstår ett problem, då vi inte kan lägga till primers på ändarna, så lagging strand kommer inte kunna syntetisera där. I normala fall leder detta till att DNA förkortas efter varje replikation. Men i celler som stamceller och cancerceller kommer telomeraset att ha med sig en egen RNA-mall och utför omvänd transkriptas, det vill säga att göra RNA till DNA. Så telomeraset kommer att förlänga ändarna med en repeterande sekvens. Det som händer då är att vid nästa replikation kommer DNA att förkortas vid de sekvenserna som lades till av telomeraset, men ingen viktig information kommer att tas bort. Detta utnyttjas av stamceller och cancerceller för att cellerna ska kunna dela sig utan att dö eller tappa viktiga gener.
137 2025-02-01 8 nukleotider Nukleotider är de byggstenar som bygger upp både DNA och RNA. Vilken kemisk grupp finns i 2'-position hos ribonukleotider, och hur skiljer sig denna från deoxyribonukleotider? (4p) Nukleotider är de byggstenar som bygger upp både DNA och RNA. Vilken kemisk grupp finns i 2'-position hos ribonukleotider, och hur skiljer sig denna från deoxyribonukleotider? (4p) Hos ribonukleotider finns en OH-grupp i 2´positioinen medan det i DNA finns H. Detta beror på att enzymet ribonukleotidreduktas ersätter OH gruppen i RNA med H för att omvandla ribos till deoxyribos. RNA: Ribos har OH på kol nr 2. DNA: Deoxyribos har H på kol nr 2.
138 2025-02-01 35 plasmid Explain how gel electrophoresis can be used to analyze different conformations of plasmid DNA. Discuss how the migration patterns of these conformations differ and how comparing them with the ladder (marker) helps interpreting the gel results and understand the structure of the plasmid DNA. (4p) Max 150 words. Answer in English. Explain how gel electrophoresis can be used to analyze different conformations of plasmid DNA. Discuss how the migration patterns of these conformations differ and how comparing them with the ladder (marker) helps interpreting the gel results and understand the structure of the plasmid DNA. (4p) Max 150 words. Answer in English. The electrophoresis has two differently charged ends, one positive and one negative. The plasmids get injected into the gel electrophoresis in a well from the negatively charged end. When we then give it a current, the plasmids will travel to the positive end (because DNA is negative). The bigger the plasmid is, the further it will travel, because it has more negative charges than a small one. Supercoiled and circular DNA will meet different amount of friction, since they have different forms, which will result in one traveling further than the other even though they have the same size. The marker will help identify how many base pairs the plasmid have. But if we analyze two of the same plasmids and they travel different distances, then it means that they have different conformations where one is supercoiled and the other is circular. The circular meets more friction.
139 2025-02-01 3 från-aminosyror-till-proteiner Ange två likheter och två skillnader mellan en alfahelix och en hårnålsböj (reverse turn). (4p) Max 50 ord. Ange två likheter och två skillnader mellan en alfahelix och en hårnålsböj (reverse turn). (4p) Max 50 ord. Alfahelixar har vätebindningar mellan var fjärde aminosyra, medan hårnålsböj har mellan var tredje. Båda är en typ av primärstruktur. Alfahelixar är ofta högervridna.
140 2025-02-01 7 glykogen Glukos lagras hos människan i form av glykogen. Hos växter lagras glukos som stärkelse. Beskriv skillnader och likheter mellan glykogen och stärkelse. (4p) Glukos lagras hos människan i form av glykogen. Hos växter lagras glukos som stärkelse. Beskriv skillnader och likheter mellan glykogen och stärkelse. (4p) Elev 1 - 3 av 4 poäng: Båda är långa kedjor av kolhydrater. Skillnaden är dock att glykogen består av förgrenade kedjor där vi har 1,4-glykosidbindningar mellan linjära delar, och 1,6-glykosidbindningar mellan förgreningar. Stärkelse är en enda linjär kedja som inte förgrenas. Elev 2 - 3 av 4 poäng Stärkelse i växter bildas av fotosyntes, utav koldioxid och vatten där solenergin utnyttjas för att skapa bindningar mellan dessa molekyler, då får vi bl.a glukos. Det glukos som tillverkas i växter av fotosyntes är samma glukos vi äter och bryter dess bindningar för energi. Att glukos lagras som glykogen hos oss är för att glukos är för osmotiskt aktiv för att lagras som den är. Men stärkelse lagras inte för växternas skull, utan det är ett sätt att omvandla koldioxid som vi andas ut till syrgas, annars skulle syrgas i atmosfären ha tagit slut. AI-rättning: Kort sammanfattning av vad som typiskt ger full poäng: Likhet: båda består av α-D-glukos. Likhet: båda använder α-1,4- och α-1,6-bindningar. Skillnad: stärkelse = amylose (linjär) + amylopektin (lätt förgrenad). Skillnad: glykogen = mycket mer förgrenat.
141 2025-02-01 6 cellmembran Du gör forskar-ST inom infektionsmedicin och studerar hur Helicobacter pylori binder till glykolipider. Du ritar upp en glykolipid i cellmembranet och markerar hur den del som sitter på utsidan är den bakterierna binder till. Principiell struktur räcker. (4p) Du gör forskar-ST inom infektionsmedicin och studerar hur Helicobacter pylori binder till glykolipider. Du ritar upp en glykolipid i cellmembranet och markerar hur den del som sitter på utsidan är den bakterierna binder till. Principiell struktur räcker. (4p) . Ritning: På ritningen (sida 11) visas ett cellmembran med glykolipider: hydrofila huvuden utåt, hydofoba fettsyrasvansar i membranet och en kolhydrat kopplad via glycerol (kommentar: ”kan också vara sfingosin”). Lärarens kommentar: Det absolut vanligaste är att glykolipider har sfingosin som bas och inte glycerol, och när man säger glykolipid utan att specificera mer så menar man nästan alltid de med sfingosin som bas. Ord (textsvar): 1
142 2025-02-01 2 från-aminosyror-till-proteiner Vilka två av nedanstående påstående stämmer för proteinveckning? (2p) A: Den är reversibel. B: Det är en ofördelaktig process. C: Den börjar på lokal nivå. D: En aminosyrasekvens veckas alltid till samma struktur. Vilka två av nedanstående påstående stämmer för proteinveckning? (2p) A: Den är reversibel. B: Det är en ofördelaktig process. C: Den börjar på lokal nivå. D: En aminosyrasekvens veckas alltid till samma struktur. A och C
143 2024-08-01 28 elektrontransportkedjan Vad får det för konsekvens när NADH som bildats i glykolysen transporteras till mitokondriens matrix med glycerol 3-fosfatshunten istället för med malat-aspartatshunten? (2p) (Max 30 ord) Vad får det för konsekvens när NADH som bildats i glykolysen transporteras till mitokondriens matrix med glycerol 3-fosfatshunten istället för med malat-aspartatshunten? (2p) (Max 30 ord) 0 poäng: Konsekvensen blir att vi kommer behöva förbruka en atp för att glycerol 3 fosfat ska kunna bildas. Det kräver mer energi AI-svar: När elektroner från cytosoliskt NADH går via glycerol-3-fosfatshunten i stället för malat–aspartatshunten blir konsekvensen: → Färre ATP per NADH. Glycerol-3-fosfatshunten överför elektroner till FAD i mitokondriens inre membran → FADH₂ → komplex II → ger ~1,5 ATP. Malat–aspartatshunten överför elektroner direkt till mitokondriellt NAD⁺ → NADH → komplex I → ger ~2,5 ATP. Konsekvens: lägre ATP-utbyte från glykolysen när glycerol-3-fosfatshunten används.
144 2024-08-01 5 cellmembran Du är läkare och handleder en läkarstudent som är stressad över sin biokemitenta. Läkarstudenten kommer inte ihåg membranlipiderna så bra och undrar om du kan hjälpa till att förklara, vilket du gör genom att: A) Rita den principiella strukturen för den vanligaste membranlipiden. B) Markera i bilden som du har ritat den del som är polär, samt den del som är hydrofob. (4p) ![[Pasted image 20251129235536.png]] Du är läkare och handleder en läkarstudent som är stressad över sin biokemitenta. Läkarstudenten kommer inte ihåg membranlipiderna så bra och undrar om du kan hjälpa till att förklara, vilket du gör genom att: A) Rita den principiella strukturen för den vanligaste membranlipiden. B) Markera i bilden som du har ritat den del som är polär, samt den del som är hydrofob. (4p) ![[Pasted image 20251129235536.png]] Svar på ritpapper: fosfolipid med alkohol + fosfat (polär del) kopplad till glycerol och två fettsyrasvansar (hydrofob del).
145 2024-08-01 18 termodynamik Kemiska reaktioner i vätskor och gaser sker snabbare när temperaturen höjs. Hur kan det förklaras? (4p) (Max 150 ord.) Kemiska reaktioner i vätskor och gaser sker snabbare när temperaturen höjs. Hur kan det förklaras? (4p) (Max 150 ord.) Det går snabbare därför att en ökning i värmeenergi kommer omvandlas till en ökning i rörelseenergin (termodynamikens första lag, energi kan inte skapas eller förstöras men det kan omvandlas). När vi höjer rörelseenergi kommer detta innebära att varje partikel befinner sig på en högre energinivå än vad den var innan. Detta ökar både chansen för att två partiklar med rätt konformation krockar med varandra, men också att de krockar med varandra med tillräckligt mycket energi för att kunna nå övergångstillståndet och således reagera.
146 2024-08-01 1 glukosmetabolism I glykolysens första steg binder glukos till en klyfta i enzymet som utför reaktionen från vilken vatten stängs ute. Förklara vilka egenskaper de aminosyror behöver ha som binder till glukos och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 60 ord.) I glykolysens första steg binder glukos till en klyfta i enzymet som utför reaktionen från vilken vatten stängs ute. Förklara vilka egenskaper de aminosyror behöver ha som binder till glukos och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 60 ord.) Glukos är en vattenlöslig molekyl - den är polär. De som binder till glukos behöver då också vara polära och vattenlösliga. två aminosyror som har dessa egenskaper är serin och treonin. Det som utmärker dessa är att de är alkoholer - så de binder gärna till glukos via sina OH-grupper.
147 2024-08-01 19 enzymer Enzymet A som omvandlar S till P har ett Km på 10 µM och ett Vmax på 100 nmol/s. Enzymet B som omvandlar S till Q har ett Km på 1 mM och ett Vmax på 200 nmol/s. Lika mängder av A och B blandas med 100 µM S i ett och samma kärl. Vad kommer man att ha mest av när reaktionerna är klara - P eller Q? Motivera ditt svar. (4p) (Max 150 ord.) Enzymet A som omvandlar S till P har ett Km på 10 µM och ett Vmax på 100 nmol/s. Enzymet B som omvandlar S till Q har ett Km på 1 mM och ett Vmax på 200 nmol/s. Lika mängder av A och B blandas med 100 µM S i ett och samma kärl. Vad kommer man att ha mest av när reaktionerna är klara - P eller Q? Motivera ditt svar. (4p) (Max 150 ord.) 1 av 4: Km = ([E]+[S])/[ES] och Vmax = K + Etot k2=turnover number Med hjälp av formlerna ovan har jag kunnat dra slutsatsen att Enzym A har både en mindre kapacitet för att forma enzym-substrat komplex och har även en lägre turnover number än vad Enzym B har. Denna slutsats drar jag då enzym A har ett större Km värde än vad Enzym B har, vilket innebär att [ES] är mindre hos Enzym A än Enzym B enligt michealis mentes kinetiken. Enzym A har alltså lägre affinitet för sitt substrat än Enzym B Vmax är också lägre hos enzymA än vad den är hos enxym B, detta beror på turnover number som är det värde som talar om hur bra ett enzym bildar produkt. Enzym A måste ha ett lägre turnover-number än enzym B då dess Vmax är lägre. Enzym B har alltså både större [ES] och bildar produkt bättre(K )->Q kommer bildas.
148 2024-08-01 29 elektrontransportkedjan Vilka två av nedanstående komponenter deltar i elektrontransportkedjan? (2p) A: Cu2+ B: Coenzym A C: Mn2+ D: Fe-S-kluster Vilka två av nedanstående komponenter deltar i elektrontransportkedjan? (2p) A: Cu2+ B: Coenzym A C: Mn2+ D: Fe-S-kluster A och D
149 2024-08-01 4 utforska-proteiner Du jobbar på labb över sommaren och du har fått i uppgift att utföra en ELISA för att undersöka om en patient har HIV. Beskriv vilken typ av ELISA som skall utföras, vilka steg som utförs och ange vilken substans hos patienten som undersöks med metoden. (4p). (Max 200 ord.) Du jobbar på labb över sommaren och du har fått i uppgift att utföra en ELISA för att undersöka om en patient har HIV. Beskriv vilken typ av ELISA som skall utföras, vilka steg som utförs och ange vilken substans hos patienten som undersöks med metoden. (4p). (Max 200 ord.) För att undersöka om en patient har HIV så vill man kolla ifall den har antikroppar för det. Då använder man sig av indirekt ELIZA samt ett prov innehållande patientens plasma-komponenter - då det är där antikropparna finns. Vid indirekt ELIZA kommer det i en behållare finnas antigener bundna till botten, dessa ska ha en epitop som HIV-antikroppen känner igen. Man kommer tillsätta ett prov innehållande patientens plasma-komponenter till behållaren. HIV-antikropparna kommer binda till antigenerna och sedan kommer provet att sköljas. efter sköjlning kommer man tillsätta en substans innehållande enzymlänkade antikroppar som kommer binda till HIV-antikropparna. Efter dessa har fått tid att binda sköljer man provet en gång till. sedan så tillsätter man en annan substans som innehåller ett substrat som enzymerna binder. Detta substrat kommer orsaka ett färgskifte om det finns HIV-antikroppar i provet, om det inte finns hiv-antikroppar blir det inget färgskifte och man vet att patienten inte har HIV. det är viktigt att man sköljer ordentligt mellan stegen, annars kan det uppstå en falsk positiv, detta då antikropparna ju skulle finnas kvar i provet, som då de enzymbundna antikropparna kan binda till, som då kommer ge färgskifte vid tillsatts av substrat.
150 2024-08-01 16 transport-över-cellmembran Vilka två av nedanstående proteiner utför aktiv transport? A: Aquaporiner B: ABC-transportörer C: Adeninnukleotidtranslokas D: GLUT4 (2p) Vilka två av nedanstående proteiner utför aktiv transport? A: Aquaporiner B: ABC-transportörer C: Adeninnukleotidtranslokas D: GLUT4 (2p) B och C
151 2024-08-01 22 glykolysen A) Förklara vad som menas med feedbackreglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras med feedbackreglering och ange vad det är som ger feedbackregleringen. (4p) (50 ord) A) Förklara vad som menas med feedbackreglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras med feedbackreglering och ange vad det är som ger feedbackregleringen. (4p) (50 ord) A) Feedback reglering är att en produkt som bildas kommer reglera aktiviteten hos ett enzym som katalyserar en reaktion som sker innan den reglerande produkten har bildats. B) Hexokinas katalyserar reaktionen Glukos + ATP -> glukos-6-fosfat + ADP, den feedbackinhiberas av sin egen produkt, glukos-6-fosfat.
152 2024-08-01 32 pentosfosfatvägen Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? (2p) A: En funktionell pentosfosfatväg är viktig för att celler skall kunna upprätthålla ett fullgott skydd mot skadliga reaktiva syreföreningar (ROS). B: Glykolysintermediärerna glukos-6-fosfat och glyceraldehyd-3-fosfat är slutprodukterna som bildas i pentosfosfatvägens icke-oxidativa fas. C: En väldigt viktig uppgift för pentosfosfatvägen är att bilda NADPH och ribos-5-fosfat. D: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla och det är cellens behov som styr riktningen av reaktionerna. Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? (2p) A: En funktionell pentosfosfatväg är viktig för att celler skall kunna upprätthålla ett fullgott skydd mot skadliga reaktiva syreföreningar (ROS). B: Glykolysintermediärerna glukos-6-fosfat och glyceraldehyd-3-fosfat är slutprodukterna som bildas i pentosfosfatvägens icke-oxidativa fas. C: En väldigt viktig uppgift för pentosfosfatvägen är att bilda NADPH och ribos-5-fosfat. D: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla och det är cellens behov som styr riktningen av reaktionerna. A och C
153 2024-08-01 26 citronsyracykeln Kan citronsyracykeln gå åt vilket håll som helst? Motivera svaret. (4p) (Max 75 ord) Kan citronsyracykeln gå åt vilket håll som helst? Motivera svaret. (4p) (Max 75 ord) Jag förstår inte helt frågan som ställs, CSC kan inte gå bakåt i cykeln då vi har två reglerande steg då koldioxid avges. Isocitratdehdyrogenas och alfaketoglutaratdehydrogenas är reglerade dels av sina produkter men även av energikvoten, dessa kan inte gå bakåt hur som helst. Då det är en cykel kan vi dock återbilda en produkt genom att låta cykeln fortgå efter oxalacetat har bildats tills vi får den produkten som vi ville återbilda.
154 2024-08-01 12 kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Vid prokaryot transkription spelar sigma-faktorn en avgörande roll. Vilka två påståenden om sigma-faktorn stämmer? (2p) A: Sigma-faktorn gör så att bakteriellt RNA-polymeras binder starkare till alla typer av DNA. B: En bakterie innehåller ofta flera typer av sigma-faktorer. C: Sigma-faktorn styr bakteriellt RNA-polymeras till promotorn. D: Sigma-faktorn gör RNA-polymeraset mer processivt. Vid prokaryot transkription spelar sigma-faktorn en avgörande roll. Vilka två påståenden om sigma-faktorn stämmer? (2p) A: Sigma-faktorn gör så att bakteriellt RNA-polymeras binder starkare till alla typer av DNA. B: En bakterie innehåller ofta flera typer av sigma-faktorer. C: Sigma-faktorn styr bakteriellt RNA-polymeras till promotorn. D: Sigma-faktorn gör RNA-polymeraset mer processivt. B och C
155 2024-08-01 27 glukoneogenes Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter / vägar: fosfofruktokinas 1 fosfoglyceratkinas fumaras laktatdehydrogenas citronsyracykeln Coricykeln glykolysen glukoneogenes Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter / vägar: fosfofruktokinas 1 fosfoglyceratkinas fumaras laktatdehydrogenas citronsyracykeln Coricykeln glykolysen glukoneogenes fosfofruktokinas 1: glykoneogenesen fosfoglyceratkinas: glykolysen fumaras: citronsyracykeln laktatdehydrogenas: Coricykeln
156 2024-08-01 13 translation Hur sker matchningen mellan den kodande sekvensen på mRNA och antikodonsekvensen på tRNA? Beskriv var i ribosomer som denna matchning sker under translationen. (4p) (Max 150 ord.) Hur sker matchningen mellan den kodande sekvensen på mRNA och antikodonsekvensen på tRNA? Beskriv var i ribosomer som denna matchning sker under translationen. (4p) (Max 150 ord.) 3 av 4: Ribosomen består av en liten subenhet - 30S och en stor subenhetet 50S. den stora subenheten kommer sköta matchningen av kodon till antikodon och den lilla kommer hålla i mRNA strängen. Matchningen mellan den kodande sekvensen på mRNA och antikodonssekvensen på tRNA sker på Aminoadenyl siten (A-site) i ribosomen. En aminosyra-laddad tRNA kommer att vandra in i A-siten på en riboosom. Där kommer antikodonerna matchas med kodonerna och vätebindingar kommer bildas mellan dem. Om dessa har matchat rätt kommer elongation factors göra att tRNA släpper ifrån och fortsätter till peptidyl-site och sedan ut via exit-site i ribosomen.
157 2024-08-01 17 transport-över-cellmembran Rangordna molekylerna etanol, fruktos, leucin och koldioxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den som har lättast att passera. (2p) Lättast → Svårast: Etanol Fruktos Koldioxid Leucin Rangordna molekylerna etanol, fruktos, leucin och koldioxid efter deras förmåga att passera cellens plasmamembran. Starta med den som har lättast att passera. (2p) Lättast → Svårast: Etanol Fruktos Koldioxid Leucin 1. Koldioxid 2. Etanol 3. Fruktos 4. Leucin
158 2024-08-01 23 glukoneogenes Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Aminosyrorna isoleucin och leucin är glukogena. B: Kol reduceras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat. D: Glukoneogenes sker framför allt när insulinnivån är hög. Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Aminosyrorna isoleucin och leucin är glukogena. B: Kol reduceras vid glukoneogenes. C: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat. D: Glukoneogenes sker framför allt när insulinnivån är hög. B och C
159 2024-08-01 33 kolesterol Beskriv kortfattat vad det enterohepatiska kretsloppet är och förklara dess koppling till kolesterolsyntes. (4p) Beskriv kortfattat vad det enterohepatiska kretsloppet är och förklara dess koppling till kolesterolsyntes. (4p) 2 av 4: Nedbruten kolesterol kommer att utsöndras med gallsyror, därför är det viktigt att vi har gallsyror så att vi inte får en ackumulering av kolesterol. Enterohepatiska kretsloppet är att vi har en 95-procentig reabsorption av gallsyror i hepatocyterna - vilket gör att vi ständigt har galla. AI: Det enterohepatiska kretsloppet innebär att gallsyror som bildats från kolesterol i levern utsöndras till tarmen och därefter till största delen återabsorberas i ileum och förs tillbaka till levern via portavenen. Detta sparar kolesterol, eftersom färre nya gallsyror behöver syntetiseras. Om återcirkulationen minskar måste levern istället öka sin kolesterolsyntes och uppreglera LDL-receptorer för att få mer kolesterol till ny gallsyrabildning.
160 2024-08-01 24 betaoxidation A) Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar och varför sker detta? B) Vilka är de tre ketonkropparna som bildas? (4p) A) Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar och varför sker detta? B) Vilka är de tre ketonkropparna som bildas? (4p) 1 av 4: a) bildningen av ketonkroppar sker vid svält. Vid svält kommer glukosreserverna att ha brutits ned och vi kommer gå över till att bryta ner våra fettreserver. Då kommer det bildas ketonkroppar och detta är ffa för att förse hjärnan med energi, då den inte längre kan få det från glukos. b) acyl-CoA, acetoacyl-CoA och aceton.
161 2024-08-01 10 rna-syntes Vilka två påståenden stämmer om RNA processning? (2p) A: En lariatstruktur bildas som restprodukt vid splicing av mRNA B: mRNA har en polyA-svans som bildas i cytoplasman. C: 5’-cap hämmar translation. D: Introner bevaras i moget mRNA. Vilka två påståenden stämmer om RNA processning? (2p) A: En lariatstruktur bildas som restprodukt vid splicing av mRNA B: mRNA har en polyA-svans som bildas i cytoplasman. C: 5’-cap hämmar translation. D: Introner bevaras i moget mRNA. A och B
162 2024-08-01 9 dna-replikation A) Vad är skillnaden mellan exo- och endonukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för CMP. (4p) A) Vad är skillnaden mellan exo- och endonukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för CMP. (4p) a) exonukleaser kommer att bryta fosfodiesterbindingar på änden av en DNA- kedja medan endonukelaser kommer bryta en fosfodiesterbindning någonstans i mitten av DNA-kedjan. b) cytidinmonofosfat.
163 2024-08-01 34 introduktionslaboration Vilka två faropiktogram visas i bild nedan? ![[Pasted image 20251129235602.png]] A: Oxiderande B: Brandfarlig C: Skadlig D: Giftig (2p) Vilka två faropiktogram visas i bild nedan? ![[Pasted image 20251129235602.png]] A: Oxiderande B: Brandfarlig C: Skadlig D: Giftig (2p) A & C
164 2024-08-01 14 evolution Beskriv kortfattat hur den första eukaryota cellen bildades. (4p) (Max 150 ord.) Beskriv kortfattat hur den första eukaryota cellen bildades. (4p) (Max 150 ord.) Den första eukaryota cellen bildades tack vare endosymbios. Med endosymbios menas att två bakterier har gått ihop och har haft ett utbyte mellan varandra som gynnar båda. Detta sker genom att en mindre bakterie vandrar in i en större bakterie med en egenskap som gynnar överlevnaden hos både sig själv och den större bakterien. Tillslut kommer den större bakterien att ta över vissa processer som den lilla gör genom att den lilla bakteriens DNA överförs till den större bakterien - på så sätt får vi en cell med flera organeller. Exempel: mitokondrien mitokondrien - som var en aerob bakterie, vandrade en gång in i en anaerob, större cell. den gav energi i form av ATP och den större anaeroba cellen gav den näring. tillslut överfördes DNA från den aeroba bakterien till den anaeroba cellen - på så sätt kunde cellen börja styra vissa processer och vi fick en cellandande cell.
165 2024-08-01 20 enzymer Vilka två av nedanstående påståenden om enzymer är korrekta? (2p) A: Enzymer förändrar den fria energin i en reaktion. B: Enzymernas tredimensionella form är nyckeln till deras funktion. C: Enzymer påskyndar reaktioner genom att sänka aktiveringsenergin. D: Enzymer är alltid proteiner. Vilka två av nedanstående påståenden om enzymer är korrekta? (2p) A: Enzymer förändrar den fria energin i en reaktion. B: Enzymernas tredimensionella form är nyckeln till deras funktion. C: Enzymer påskyndar reaktioner genom att sänka aktiveringsenergin. D: Enzymer är alltid proteiner. B och C
166 2024-08-01 30 aminosyrametabolism Alanin kan bildas i en så kallad transamineringsreaktion med hjälp av ett kliniskt viktigt enzym. Ange det fullständiga namnet på enzymet, samt beskriv reaktionen som enzymet katalyserar med en reaktionsformel. (4p) (Max 20 ord.) Alanin kan bildas i en så kallad transamineringsreaktion med hjälp av ett kliniskt viktigt enzym. Ange det fullständiga namnet på enzymet, samt beskriv reaktionen som enzymet katalyserar med en reaktionsformel. (4p) (Max 20 ord.) 3 av 4: Alanin-aminotransferas pyruvat + glutamat -> alanin + alfa-ketoglutarat
167 2024-08-01 15 cellmembran Ange två typer av celladhesionsmolekyler och beskriv kortfattat deras funktion. (4p) Ange två typer av celladhesionsmolekyler och beskriv kortfattat deras funktion. (4p) integriner - förankrar cellen med ECM. Detta gör de genom att binda till cytoskelettet som aktinfilament och sedan binda till ECM komponenter såsom fibrinogen samt kollagen. cadheriner - finns i desmosomer och adherensjunctions, de förankrar cellerna i varandra. Detta gör de genom att binda till andra cedheriner med homophilic bindings samt till cytoskelletet, på så sätt binder de ihop cellerna.
168 2024-08-01 21 introduktion-till-metabolismen Ange vad som används som cellens energivaluta och förklara vad som gör molekylen lämplig för ändamålet. (4p) (Max 100 ord). Ange vad som används som cellens energivaluta och förklara vad som gör molekylen lämplig för ändamålet. (4p) (Max 100 ord). Det som används som cellens energivaluta är ATP. Det som gör ATP lämplig är att den innehåller tre stycken fosfatgrupper som binder till varandra med fosfoanhybridbindniningar. Fosfoanhybridbindingen är instabil och kräver energi för att hållas ihop då det är en repulsion mellan fosfatgrupperna. Då en fosfat spjälkas av så kommer det att frisättas energi genom att repulsionen minskar, dessutom uppstår resonans mellan de två övriga fosfatgrupperna som gör dem stabilare - mer energi avges. Energin som avges kan då gå till andra energikrävadne processer ex. bilda gradienter och makromolekyler.
169 2024-08-01 31 nukleotidnedbrytning Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? (2p) A: Gikt är en sjukdom orsakad av förhöjda plasmakoncentrationer av urea. B: Sockerstrukturerna i både purin- och pyrimidin-nukleotider spjälkas loss från kvävebaserna via fosforolys. C: UMP och CMP är purin-nukleotider. D: Då purin-nukleotider bryts ned kommer merparten av purinbasernas kväveatomer slutligen hamna i urat, men en mindre andel av basernas kväveatomer hamnar slutligen i urea. Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? (2p) A: Gikt är en sjukdom orsakad av förhöjda plasmakoncentrationer av urea. B: Sockerstrukturerna i både purin- och pyrimidin-nukleotider spjälkas loss från kvävebaserna via fosforolys. C: UMP och CMP är purin-nukleotider. D: Då purin-nukleotider bryts ned kommer merparten av purinbasernas kväveatomer slutligen hamna i urat, men en mindre andel av basernas kväveatomer hamnar slutligen i urea. B och D
170 2024-08-01 25 glykogen För att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel, det vill säga börja bilda en glykogenpartikel "från början", så behövs en så kallad glykogen-primer, dvs en kort sträcka linjärt glykogen. Hur bildas denna primer, och varför måste strukturen bildas för att glykogenpartikeln sedan skall kunna byggas upp? (4p) (Max 50 ord.) För att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel, det vill säga börja bilda en glykogenpartikel "från början", så behövs en så kallad glykogen-primer, dvs en kort sträcka linjärt glykogen. Hur bildas denna primer, och varför måste strukturen bildas för att glykogenpartikeln sedan skall kunna byggas upp? (4p) (Max 50 ord.) Glykogenin kommer att autokatalysera bildningen av en glykogenprimer genom att sätta på den aktiva formen av glukos (UDP-glukos) på sin tyrosins OH-grupp. Sedan forsätter den att binda ca. 10-20 glukosenheter innan glykogensyntas tar över. Glykogensyntas kan bara bilda alfa-1,4-bindningar om det finns en kedja att koppa dem till.
171 2024-08-01 11 kromatin Var sitter histon H1 och vilken roll spelar denna faktor? (4p) Var sitter histon H1 och vilken roll spelar denna faktor? (4p) H1 sitter på den yttre regionen av en nukleosom. Dess uppgift är att stabilisera nukleosomen genom att binda till/över DNA:t som är virat kring histonbunten och se till att DNAt förankras med histonerna. Utan H1 hade dnat främst hållts kvar av H3 och H4s positivt laddade N-terminaler som binder till den negativt laddade DNA strängen. Detta hade inneburit att så fort dessa histoner hade genomgått acetylering eller metylering så hade nukleosomen varit väldigt instabil.
172 2024-08-01 8 dna-replikation Vilka två påståenden om DNA-replikation stämmer? (2p) A: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. B: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. C: Topoisomeraser kan ta bort supercoils. D: DNA replikation sker alltid i 3´ till 5´-riktning. Vilka två påståenden om DNA-replikation stämmer? (2p) A: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. B: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. C: Topoisomeraser kan ta bort supercoils. D: DNA replikation sker alltid i 3´ till 5´-riktning. (svar angivet i flervalsformulär)
173 2024-08-01 35 plasmid A gene of interest was amplified and verified using the blue/white screening method. The plasmids from two bacterial colonies, one blue colony and one white colony, were purified. Then restriction enzyme digestion was performed, and the samples were run on a gel as follows: white uncut, white cut, blue uncut, blue cut (see figure below). After imaging the gel, we can conclude that while there is plasmid DNA in all samples, the white sample was probably mixed with the blue sample. Explain what finding in the gel indicates the white sample was probably mixed with the blue sample by referring to the size/number of bands. Account for the other source of error for this outcome besides pipette tip contamination from sample to sample. (4p) (Max 200 words) OBS! This question needs to be answered in English. ![[Pasted image 20251129235633.png]] A gene of interest was amplified and verified using the blue/white screening method. The plasmids from two bacterial colonies, one blue colony and one white colony, were purified. Then restriction enzyme digestion was performed, and the samples were run on a gel as follows: white uncut, white cut, blue uncut, blue cut (see figure below). After imaging the gel, we can conclude that while there is plasmid DNA in all samples, the white sample was probably mixed with the blue sample. Explain what finding in the gel indicates the white sample was probably mixed with the blue sample by referring to the size/number of bands. Account for the other source of error for this outcome besides pipette tip contamination from sample to sample. (4p) (Max 200 words) OBS! This question needs to be answered in English. ![[Pasted image 20251129235633.png]] the findings in the gel that indicate that the samples were mixed are the lines in the white uncut sample. It has two visible bands, with one lining up quite nicely with the blue uncut bands in size. If the plasmid is uncut, than there shouldn't be two distinct bands because the sample only consists of an uncut product. The white uncut should also have a larger amount of base pairs than the blue uncut because we have transformed a gene of interest into it, but they seem to have the same amount. a source of error for this outcome could be that the colony picked for the white cut may have been close to a blue colony - causing a small amount of the blue colony to be accidentaly picked.
174 2024-08-01 3 hemoglobin How does fetal hemoglobin (HbF) differ from adult hemoglobin (HbA) and what effect does this have? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words). How does fetal hemoglobin (HbF) differ from adult hemoglobin (HbA) and what effect does this have? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words). 3 av 4: Adult hemoglobin consists of two beta subunits and two alfa subunits, while fetal hemoglobin consists of two alfa subunits and two gamma subunits. HbA has a lower affinity for oxygen than HbF. Beta subunits allow for the allosteric regulator 2,3-BPG to bind. when 2,3-bpg binds it enhances T-state because it becomes a type of blockage for the conformational change to R-state, meaning that the affinity for oxygen is lowered. 2,3-BPG cannot bind to the gamma subunits - meaning that the affinity for oxygen increases.
175 2024-08-01 7 dna-replikation A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Hur ser denna faktor ut? (4p) A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Hur ser denna faktor ut? (4p) a) PCNA, eller en sliding clamp, ökar DNA-polymerasets processivitet, den kan öka hastigheten med upp till 50x. Den fungerar på det sättet att den håller i DNA strängen så att dna-polymeraset lätt kan glida fram b) Den ser ungefär ut som en ring som omringar leading/lagging strand.
176 2024-08-01 6 cellmembran Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och glykolipider. (4p) Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och glykolipider. (4p) 3 av 4: glykoproteiner är glykosylerade proteiner, dessa består alltså av ett protein med "barr" av kolhydrater. de kan vara o-länkade, via serin och treonins OH-grupp, eller så kan de vara n-länkade via aspargin. Glykoproteiner bygger upp extra- cellulär-matrix och finns i ledvätska, brosk, ögat mm. likt glykoproteiner är glykolipider glykosylerade, men de består av sfingosin + en fettsyra + en sackarid/flera sackarider. Denna finns i outer leaflet i cellmembran och bl.a. bygger upp glykokalyx som är på cellen och inte i ECM. Dessa har som en "svans" med sackarider medan glykoproteiners kolhydrater är mer som ovannämnt, "barr" som kan finnas över hela proteinet.
177 2024-08-01 2 från-aminosyror-till-proteiner Stamceller behöver skyddas från det åldrande som drabbar andra celler. En sak som skyddar dem är ökat uttryck av chaperoniner. Förklara hur det kan skydda mot något som är skadligt för celler. (4p) (Max 60 ord.) Stamceller behöver skyddas från det åldrande som drabbar andra celler. En sak som skyddar dem är ökat uttryck av chaperoniner. Förklara hur det kan skydda mot något som är skadligt för celler. (4p) (Max 60 ord.) chaperoniner - som hsp60 har två stycken ringstrukturer och en hålighet. I håligheten erbjuds en isolerad plats för proteiner att vecka sig genom att proteinet går in i håligheten och ett lock rekryteras - den veckas "som vanligt" oavsett hur miljön utanför. utan detta skulle prioner kunna bildas - vilka kan infektera andra proteiner att veckas fel, vilket skadar cellen.
178 28
179 5
180 18
181 1
182 19
183 29
184 4
185 16
186 22
187 32
188 26
189 12
190 27
191 13
192 17
193 23
194 33
195 24
196 10
197 9
198 34
199 14
200 20
201 30
202 15
203 21
204 31
205 25
206 11
207 8
208 35
209 3
210 7
211 6
212 2
213 2021-12-16 28 aminosyrametabolism ALAT är ett kliniskt mycket viktigt enzym. Beskriv reaktionen enzymet katalyserar samt vad en ökad plasmakoncentration av enzymet vanligen indikerar. ALAT är ett kliniskt mycket viktigt enzym. Beskriv reaktionen enzymet katalyserar samt vad en ökad plasmakoncentration av enzymet vanligen indikerar. ALAT – alaninaminotransferas. Enzymet utför en transaminering – glutamat slås ihop med pyruvat – aminogruppen från glutamat överförs till pyruvat – pyruvat blir då alanin och glutamat alfaketoglutarat. ALAT kan även genomföra omvänd reaktion. ALAT är vanligtvis ett intracellulärt enzym, om man uppmäter en hög koncentration av detta antyder det på att det läckt ut ur cellerna. Detta indikerar därav på vävnadsskada. ALAT finns i hög utsträckning i levern. Därför kan man se höga koncentrationer av ALAT i plasma vid många typer av leversjukdomar t.ex. hepatit.
214 2021-12-16 5 nukleotider A) Vilken typ av bindning bryter nukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för dCMP. A) Vilken typ av bindning bryter nukleaser? B) Skriv det fullständiga namnet för dCMP. A) Nukleaser bryter bindningar mellan nukleotider – därav fosfodiesterbindningar. B) dehydroxyriboscytosinmonofosfat (fel) rätt: - deoxycytidinmonofosfat
215 2021-12-16 18 nukleotider Vid syntes av DNA eller RNA måste var och en av de nukleotider som ska adderas till den växande strängen ha tre fosfatgrupper på sig. Man får ingen reaktion om det bara sitter en eller två fosfatgrupper på nukleotiderna. Förklara varför de tre fosfatgrupperna behövs. (Max 150 ord.) Vid syntes av DNA eller RNA måste var och en av de nukleotider som ska adderas till den växande strängen ha tre fosfatgrupper på sig. Man får ingen reaktion om det bara sitter en eller två fosfatgrupper på nukleotiderna. Förklara varför de tre fosfatgrupperna behövs. (Max 150 ord.) Nukleotider kopplas ihop med fosfodiesterbindningar. Bildningen av denna bindning är termodynamiskt ofördelaktig eftersom att entropin minskar – reaktionen kräver tillförd energi. Fosfatgrupperna på nukleotiden är kopplade med mycket energirika fosfoanhydridbindningar. När dessa hydrolyseras frigörs mycket energi. När nukleotiden ska binda in kommer då två av fosfatgrupperna att släppa – först frigörs det energi när de bryter från det ena fosfatet (som fortfarande sitter på nukleotiden) – och sedan ännu mer energi när bindningen bryts mellan de två frigjorda fosfatgrupperna sinsemellan. Med hjälp av denna energi kan man då driva den energikrävande processen av att skapa en fosfodiesterbindning mellan den nya nukleotiden och den som redan finns på DNA/RNA-strängen. För att få tillräckligt med energi för att driva fosfodiesterbindningen behöver man alltså bryta två fosfoanhydridbindningar m.h.a. hydrolys. Därför krävs det totalt tre stycken fosfat (två släpps av och en hamnar i DNA/RNA-skelettet).
216 2021-12-16 1 kolhydrater Blodgrupperna ABO är kolhydratstrukturer som bland annat finns på våra röda blodkroppar. A) Hur skiljer sig A, B och O strukturerna från varandra? B) När man ska ge röda blodkroppar till patienter kan man ge röda blodkroppar från O-donatorer till patienter med blodgrupp A, B och AB, men man kan inte ge patienter med blodgrupp O röda blodkroppar från donatorer med blodgrupp A, B eller AB. Varför? Blodgrupperna ABO är kolhydratstrukturer som bland annat finns på våra röda blodkroppar. A) Hur skiljer sig A, B och O strukturerna från varandra? B) När man ska ge röda blodkroppar till patienter kan man ge röda blodkroppar från O-donatorer till patienter med blodgrupp A, B och AB, men man kan inte ge patienter med blodgrupp O röda blodkroppar från donatorer med blodgrupp A, B eller AB. Varför? A) De har olika uppsättning av sockerenheter. A har fucos + galaktos + acetylgalaktosamin B har fucos + galaktos + galaktos 0 har fucos + galaktos Alltså skiljer sig dessa sekvenser från varandra, därför binder olika antikroppar in till olika sorter. B) Beroende på vilken blodgrupp man har kommer man ha olika antigen och antikroppar A har A-antigen och antikroppar mot B B har B-antigen och antikroppar mot A AB har A+B-antigen och inga antikroppar mot vare sig A eller B 0 har "inget antigen" och därav antikroppar mot både A och B Anledningen varför en person med blodgrupp 0 då inte kan få röda blodkroppar från vare sig A, B eller AB är att den har antikroppar mot både A och B. Dessa skulle då fästa sig på de transfererade blodkropparnas antigen och aktivera immunförsvaret → autoimmun reaktion. Däremot går det bra att personer som har blodgrupp A, B eller AB får 0-röda blodkroppar eftersom dessa inte innehåller några antigen som deras immunförsvar (antikroppar) skulle känna igen.
217 2021-12-16 19 enzymer ![[Pasted image 20251128080420.png]] Diagrammet ovan visar koncentrationen av ämnet A som funktion av tiden i en reaktion där A omvandlas till ämnet B i närvaro av en låg koncentration av ett enzym som katalyserar reaktionen. Enzymet tillsattes omedelbart efter tiden t₀. Vi upprepar nu försöket på samma sätt, men med den skillnaden att vi nu tillsätter 10 gånger högre koncentration av enzymet omedelbart efter tiden t₀. Ange för var och en av tidpunkterna t₀, t₁ och t₂ om [A] kommer att vara högre, lägre eller oförändrad jämfört med i diagrammet ovan. Ange också en motivation till ditt svar vid varje tidpunkt. (Max 150 ord.) ![[Pasted image 20251128080420.png]] Diagrammet ovan visar koncentrationen av ämnet A som funktion av tiden i en reaktion där A omvandlas till ämnet B i närvaro av en låg koncentration av ett enzym som katalyserar reaktionen. Enzymet tillsattes omedelbart efter tiden t₀. Vi upprepar nu försöket på samma sätt, men med den skillnaden att vi nu tillsätter 10 gånger högre koncentration av enzymet omedelbart efter tiden t₀. Ange för var och en av tidpunkterna t₀, t₁ och t₂ om [A] kommer att vara högre, lägre eller oförändrad jämfört med i diagrammet ovan. Ange också en motivation till ditt svar vid varje tidpunkt. (Max 150 ord.) t₀ kommer att vara oförändrad. Detta pga att utgångskoncentrationen av A inte kommer att minska bara för att man adderar mer enzym. t₁ kommer vara lägre. Detta pga att enzymet katalyserar reaktionen – den kommer ske mycket snabbare – A kommer att bildas till B snabbare när man tillsätter mer enzym – därför sänks koncentrationen av A snabbare. t₂ kommer även den att vara oförändrad eftersom man i kurvan ser att reaktionen vid den tidpunkten uppnått jämvikt (koncentrationen förändras inte). Enzymer påverkar inte jämviktskonstanten – alltså vid vilket förhållande mellan koncentrationerna av A och B som reaktionshastigheten av A→B och B→A är lika. Därför kommer koncentrationen av A vid jämvikt (t₂) inte att påverkas av ökad koncentration av enzym.
218 2021-12-16 29 pentosfosfatvägen Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ribulos 5-fosfat kan bildas i både den oxidativa och icke-oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. B: I röda blodkroppar är pentosfosfatvägen essentiell för att upprätthålla ett funktionellt glutation-system och därmed ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar. C: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla. D: Pentosfosfatvägens samtliga reaktioner sker i cytoplasman. Rätt svar Vilket/vilka av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Ribulos 5-fosfat kan bildas i både den oxidativa och icke-oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. B: I röda blodkroppar är pentosfosfatvägen essentiell för att upprätthålla ett funktionellt glutation-system och därmed ett fullgott skydd mot reaktiva syreföreningar. C: Reaktionerna i pentosfosfatvägens oxidativa fas är fullt reversibla. D: Pentosfosfatvägens samtliga reaktioner sker i cytoplasman. Rätt svar A, B och D
219 2021-12-16 4 elektrontransportkedjan När elektroner från NADH genom transport i NADH-Q oxidoreduktas når Q sker en konformationsförändring i komplexet som tillåter protontransport över mitokondriens inre membran. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar konformationsändringen behöver ha, varför den behöver ha den egenskapen samt ge ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (Max 75 ord.) När elektroner från NADH genom transport i NADH-Q oxidoreduktas når Q sker en konformationsförändring i komplexet som tillåter protontransport över mitokondriens inre membran. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar konformationsändringen behöver ha, varför den behöver ha den egenskapen samt ge ett exempel på en aminosyra som har den egenskapen. (Max 75 ord.) När Q tar upp två elektroner kommer den innan upptaget av protoner att vara negativt laddad, Q²⁻. Eftersom den är negativt laddad kommer den då att interagera med aminosyror som har en laddning (kommer ske repulsion eller attraktion), därför krävs det att aminosyran som förmedlar konformationsändringen är positivt eller negativt laddad. Ett exempel på en sådan aminosyra är arginin (Arg) – som är positivt laddad vid pH runt 7.
220 2021-12-16 16 translation Which basic building blocks is the ribosome made of? / Vad är ribosomen huvudsakligen uppbyggd av? Which basic building blocks is the ribosome made of? / Vad är ribosomen huvudsakligen uppbyggd av? It is made of rRNA and proteins. rRNA is in the center of both the large subunit and the small subunit. The proteins are more in the periphery. As described the ribosome has a large and a small subunit. In prokaryotes the small subunit is 30S and the large is 50S – they together form the 70S ribosome. In eukaryotes the ribosome is a bigger, the small subunit is 40S and the bigger is 60S – they form the 80S ribosome. The small subunits is where the t-RNA´s anticodon pairs with the codon on the RNA strand, in the large subunit the peptide-bond is formed.
221 2021-12-16 22 integrering-av-metabolismen Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (Max 120 ord.) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Ange summaformeln för de reaktioner som katalyseras av komplexet. C) En typ av reglering av komplexet är av feedforward-typ. Vad innebär feedforwardreglering, vad ger feedforwardreglering av komplexet och hur? Rita gärna. Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. (Max 120 ord.) A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen? B) Ange summaformeln för de reaktioner som katalyseras av komplexet. C) En typ av reglering av komplexet är av feedforward-typ. Vad innebär feedforwardreglering, vad ger feedforwardreglering av komplexet och hur? Rita gärna. a) Eftersom att den omvandlar pyruvat till acetyl-CoA – ett irreversibelt steg – glukoneogenes kan ej ske (eftersom pyruvat omvandlats). b) Pyruvat + CoA + NAD⁺ → Acetyl-CoA + CO₂ + NADH + H⁺ c) PDC kommer att feedforward-stimuleras av pyruvat. Feedforwardreglering innebär att en metabolit i något steg innan det aktuella steget kommer att reglera den aktuella reaktionen. Stor mängd pyruvat – det finns tillräckligt – pyruvat inhiberar PD-kinas (enzym som fosforylerar och därmed inhiberar PDC) – PDC är ej fosforylerat och därmed aktivt. Pyruvatet signalerar alltså att det finns tillräckligt pyruvat – bättre att omvandlas till acetyl-CoA för andra användningsområden.
222 2021-12-16 32 cellmembran cVilken typ av molekyler passerar lättast genom ett cellmembran? Välj ett alternativ: A: Små polära B: Laddade C: Stora polära D: Stora hydrofoba E: Små hydrofoba Rätt svar cVilken typ av molekyler passerar lättast genom ett cellmembran? Välj ett alternativ: A: Små polära B: Laddade C: Stora polära D: Stora hydrofoba E: Små hydrofoba Rätt svar E
223 2021-12-16 26 betaoxidation Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar. Varför sker detta? Beskriv den molekylära mekanismen. Under vilka omständigheter sker bildning av ketonkroppar. Varför sker detta? Beskriv den molekylära mekanismen. Bildning av ketonkroppar sker vid svält/fasta men kan även ske vid diabetes typ 1. Vid båda dessa tillstånd kommer det finnas en låg nivå av insulin i blodet. Vid svält för att glukoshalten är mycket låg – vid diabetes typ 1 för att pankreas ej kan producera insulin. Levern kommer att tolka de låga nivåerna av insulin som att kroppen svälter – den kommer genomföra mycket glukoneogenes för att bilda glukos för att släppa ut till kroppens vävnader. Vid glukoneogenes används oxaloacetat – när levern kör glukoneogenes i högvarv kommer den därför nästan helt ta slut. Den behövs även för att slås ihop med acetyl-CoA för att kunna påbörja citronsyracykeln. Vid avsaknad av oxaloacetat kommer därav acetyl-CoA att ansamlas – den kommer då att brytas ner till ketonkroppar. Dessa är vattenlösliga (till skillnad från lipider) och kan därav ta sig igenom blod-hjärnbarriären. Hjärnan kan då omvandla ketonkropparna till acetyl-CoA och använda det som energi. Hjärnan tar dock endast upp dessa vid svält (då finns ju ingen glukos i blodet) men inte vid diabetes (då är glukoshalten hög). Bildningen av ketonkroppar är alltså ett sätt att se till att hjärnan får energi vid svält. Vid svält kan andra celler bilda energi m.h.a lipider men det kan inte hjärnan eftersom dessa inte kan passera blod-hjärnbarriären. Vid svält (lågt glukos) måste därför hjärnan få energi på annat sätt än glukos. Detta sker genom bildningen av ketonkroppar.
224 2021-12-16 12 rna-syntes Vid initiering av RNA-polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilket/vilka påstående(n) om denna process stämmer? Välj ett eller flera alternativ: A: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIE binder till TATA-boxen. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. Rätt svar Vid initiering av RNA-polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilket/vilka påstående(n) om denna process stämmer? Välj ett eller flera alternativ: A: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIE binder till TATA-boxen. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. Rätt svar D
225 2021-12-16 27 kolesterol Vilket/vilka av följande påståenden är helt korrekta avseende kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? Välj ett eller flera alternativ: A: Merparten av kroppens kolesterol härrör från födointag, ny-syntes av kroppens celler bidrar normalt i liten utsträckning. B: Kolesterol utsöndras normalt sett via levern (gallan) i form av gallsyror och, i mindre utsträckning, fritt kolesterol. C: Kroppens enda sätt att göra sig av med kolesterol är genom utsöndring via njurarna (efter konjugering till aminosyran glycin i levern). D: Kolesterolets funktioner inkluderar bl.a. att vara utgångsmaterial i syntesen av steriodhormoner. Vilket/vilka av följande påståenden är helt korrekta avseende kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? Välj ett eller flera alternativ: A: Merparten av kroppens kolesterol härrör från födointag, ny-syntes av kroppens celler bidrar normalt i liten utsträckning. B: Kolesterol utsöndras normalt sett via levern (gallan) i form av gallsyror och, i mindre utsträckning, fritt kolesterol. C: Kroppens enda sätt att göra sig av med kolesterol är genom utsöndring via njurarna (efter konjugering till aminosyran glycin i levern). D: Kolesterolets funktioner inkluderar bl.a. att vara utgångsmaterial i syntesen av steriodhormoner. B och D
226 2021-12-16 13 kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Describe mechanistically how an antibiotic may interfere with transcription of a bacterial genome. / Beskriv en mekanism för hur antibiotika kan störa transkription av ett bakteriellt genom. Describe mechanistically how an antibiotic may interfere with transcription of a bacterial genome. / Beskriv en mekanism för hur antibiotika kan störa transkription av ett bakteriellt genom. Antibiotics can work as repressors. They can bind in to the operator region of an operon and thereby inhibiting the transcription of the genes that the operon contains.
227 2021-12-16 17 termodynamik The coupling of ATP synthesis to a glycolytic reaction is described below. PEP + H₂O → pyruvate + Pi (ΔG = −78 kJ/mol) ADP + Pi → ATP + H₂O (ΔG = +55 kJ/mol) PEP + ADP → pyruvate + ATP (ΔG = −23 kJ/mol) Which of the following statements is correct for the reaction ADP + Pi → ATP + H₂O? Välj ett alternativ: A: The reaction is exergonic and thermodynamically unfavorable. B: The reaction is endergonic and thermodynamically favorable. C: The reaction is endergonic and thermodynamically unfavorable. D: The reaction is exergonic and thermodynamically favorable. Rätt svar The coupling of ATP synthesis to a glycolytic reaction is described below. PEP + H₂O → pyruvate + Pi (ΔG = −78 kJ/mol) ADP + Pi → ATP + H₂O (ΔG = +55 kJ/mol) PEP + ADP → pyruvate + ATP (ΔG = −23 kJ/mol) Which of the following statements is correct for the reaction ADP + Pi → ATP + H₂O? Välj ett alternativ: A: The reaction is exergonic and thermodynamically unfavorable. B: The reaction is endergonic and thermodynamically favorable. C: The reaction is endergonic and thermodynamically unfavorable. D: The reaction is exergonic and thermodynamically favorable. Rätt svar D
228 2021-12-16 23 elektrontransportkedjan Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. Cytokrom C FADH₂ Fe i heme a₃ i komplex IV O₂ Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. Cytokrom C FADH₂ Fe i heme a₃ i komplex IV O₂ 1. FADH₂ 2. Cytokrom C 3. Fe i heme a₃ i komplex IV 4. O₂
229 2021-12-16 33 transport-över-cellmembran Vilken/vilka av nedanstående transportörer är en antiport? Välj ett eller flera alternativ: A: Adeninnukleotidtranslokas B: CFTR (Cystisk fibros transmembrane conductance regulator) C: Na⁺/K⁺-pumpen D: GLUT4 (glukostransportör 4) Rätt svar Vilken/vilka av nedanstående transportörer är en antiport? Välj ett eller flera alternativ: A: Adeninnukleotidtranslokas B: CFTR (Cystisk fibros transmembrane conductance regulator) C: Na⁺/K⁺-pumpen D: GLUT4 (glukostransportör 4) Rätt svar A och C
230 2021-12-16 24 glukosmetabolism I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande intermediärer: alfaketoglutarat, 3-fosfoglycerat, glyceraldehyd 3-fosfat, oxalacetat? 3-fosfoglycerat alfaketoglutarat glyceraldehyd 3-fosfat oxalacetat (Drag-och-släpp-fråga) I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande intermediärer: alfaketoglutarat, 3-fosfoglycerat, glyceraldehyd 3-fosfat, oxalacetat? 3-fosfoglycerat alfaketoglutarat glyceraldehyd 3-fosfat oxalacetat (Drag-och-släpp-fråga) 1. glyceraldehyd 3-fosfat 2. 3-fosfoglycerat 3. alfaketoglutarat 4. oxalacetat
231 2021-12-16 10 dna-replikation Fråga 10 Vilket/vilka av följande alternativ om DNA-replikation är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA-replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Opoisomeraser kan förändra ”linking number” hos DNA. D: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. Fråga 10 Vilket/vilka av följande alternativ om DNA-replikation är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Flap endonuclease 1 (FEN1) kan hjälpa till att ta bort en RNA-primer. B: DNA-replikation sker alltid i 5´ till 3´-riktning. C: Opoisomeraser kan förändra ”linking number” hos DNA. D: Okazaki-fragment bildas under syntes av ”leading strand”. A & B
232 2021-12-16 9 dna-replikation Vid eukaryot DNA-replikation så spelar CMG-helikaset en viktig roll. Detta helikas består av tre delar: MCM, Gins och Cdc45. (Max 50 ord.) a. I vilken fas av cellcykeln binder MCM till replikations-origin? b. I vilken fas av cellcykeln binder Gins och Cdc45 till MCM? c. Varför är det viktigt att separera laddningen av MCM-helikaset från dess aktivering med hjälp av Gins och Cdc45? Vid eukaryot DNA-replikation så spelar CMG-helikaset en viktig roll. Detta helikas består av tre delar: MCM, Gins och Cdc45. (Max 50 ord.) a. I vilken fas av cellcykeln binder MCM till replikations-origin? b. I vilken fas av cellcykeln binder Gins och Cdc45 till MCM? c. Varför är det viktigt att separera laddningen av MCM-helikaset från dess aktivering med hjälp av Gins och Cdc45? a) I G1-fasen binder MCM m.h.a. ORC och laddningsfaktorerna Cdc6 och Cdt1. b) Ökad nivå av CDK (kinaser) bidrar till att binda Gins och Cdc45 i S-fasen. c) För att försäkra att replikationen bara sker en gång per cellcykel. Därför är nivåerna av CDK låga i G1 och stiger i S.
233 2021-12-16 34 plasmid Plasmid DNA purified from colonies grown on blue/white screening plates was verified by electrophoresis. Samples in Lanes C and D are digested by enzyme for verification whilst Lanes A and B are non-digested samples. Select the correct description/descriptions based on the gel picture below. ![[Pasted image 20251128080404.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: The band in Lane A that migrates the furthest is in supercoiled form and we can predict its size by a comparison with the size markers. B: The sample in Lane C has the largest size of DNA because it displays the brightest intensity under UV light. C: By comparing Lanes C and D, we can infer that the sample in Lane D is a plasmid with an insert DNA whilst Lane C is an empty vector. D: By comparing Lanes A and B, we can infer that the sample in Lane B is a plasmid with an insert DNA whilst Lane A is an empty vector. Plasmid DNA purified from colonies grown on blue/white screening plates was verified by electrophoresis. Samples in Lanes C and D are digested by enzyme for verification whilst Lanes A and B are non-digested samples. Select the correct description/descriptions based on the gel picture below. ![[Pasted image 20251128080404.png]] Välj ett eller flera alternativ: A: The band in Lane A that migrates the furthest is in supercoiled form and we can predict its size by a comparison with the size markers. B: The sample in Lane C has the largest size of DNA because it displays the brightest intensity under UV light. C: By comparing Lanes C and D, we can infer that the sample in Lane D is a plasmid with an insert DNA whilst Lane C is an empty vector. D: By comparing Lanes A and B, we can infer that the sample in Lane B is a plasmid with an insert DNA whilst Lane A is an empty vector. Rätt svar 1. C 2. D (Flersvarsfråga; i originalbilden är första påståendet felmarkerat, de två sista rättmarkerade.)
234 2021-12-16 14 rekombinant-dna-teknik Which of the following is/are true about bacterial transformation? / Vilket/vilka av nedanstående stämmer för bakteriell transformation? Välj ett eller flera alternativ: A: Competence is not required for all bacterial species. / Kompetens är inte nödvändigt för alla bakteriearter. B: The DNA is typically fragmented at the bacterium’s surface. / DNA fragmenteras vanligtvis vid bakteriens yta. C: Transformation may be general or specialized. / Transformation kan vara generell eller specialiserad. D: The DNA may or may not need to integrate into the host genome. / DNA måste inte alltid integreras i värdens genom. Which of the following is/are true about bacterial transformation? / Vilket/vilka av nedanstående stämmer för bakteriell transformation? Välj ett eller flera alternativ: A: Competence is not required for all bacterial species. / Kompetens är inte nödvändigt för alla bakteriearter. B: The DNA is typically fragmented at the bacterium’s surface. / DNA fragmenteras vanligtvis vid bakteriens yta. C: Transformation may be general or specialized. / Transformation kan vara generell eller specialiserad. D: The DNA may or may not need to integrate into the host genome. / DNA måste inte alltid integreras i värdens genom. B och D
235 2021-12-16 20 glykolysen Ge ett exempel på och förklara mekanismen bakom en förändring i metabolismen som sker vid högintensivt muskelarbete för att vi ska bli bättre på att utföra anaerob glykolys framöver. (Max 120 ord.) Ge ett exempel på och förklara mekanismen bakom en förändring i metabolismen som sker vid högintensivt muskelarbete för att vi ska bli bättre på att utföra anaerob glykolys framöver. (Max 120 ord.) Högintensivt muskelarbete kommer leda till syrebrist, när detta sker kommer transkriptionsfaktorn HIF-1 att aktiveras. Den kommer att stimulera ökad produktion av glukostransportörer, enzymer i glykolysen och även aktivera VEGF. VEGF ökar vaskulariseringen av vävnaden – mer blodkärl. Detta gör att musklerna kommer i kontakt med fler blodkärl och därmed mer glukos. Den ökade mängden glukostransportörer gör att cellerna kan ta upp glukos i större mängder när det behövs. Ökad mängd enzymer i glykolysen gör att musklerna kan ta hand om glukoset och omvandla det till energi i större utsträckning när det behövs. Vid anaeroba förhållanden kan musklerna bara använda sig av glykolys – genom HIF-1 blir de bättre på att ta upp glukos och bättre på att utnyttja den.
236 2021-12-16 30 nukleotidnedbrytning Vilket/vilket av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Xantinoxidas är ett viktigt enzym involverat i nedbrydning av purin-nukleotider. B: Delar av pyrimidinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Bindningen mellan nukleosiders sockerstruktur och kvävebas klyvs genom hydrolys när nukleosider bryts ned. D: Urinsyra (urat) innehåller merparten av de kväveatomer som ingår i purinbaser. Rätt svar Vilket/vilket av följande påståenden relaterade till nukleotiders nedbrytning är korrekt/korrekta? Välj ett eller flera alternativ: A: Xantinoxidas är ett viktigt enzym involverat i nedbrydning av purin-nukleotider. B: Delar av pyrimidinbasers kolskelett kan utnyttjas som energikälla. C: Bindningen mellan nukleosiders sockerstruktur och kvävebas klyvs genom hydrolys när nukleosider bryts ned. D: Urinsyra (urat) innehåller merparten av de kväveatomer som ingår i purinbaser. Rätt svar A, B och D
237 2021-12-16 15 dna-replikation In order for the lagging strand to become one single continuous strand, the Okazaki fragments (OF) must undergo a maturation process. / För att den släpande strängen ska bli en kontinuerlig sträng behöver Okazakifragment genomgå en mognadsprocess. A) Which two enzymes are involved in bacterial OF maturation? B) Briefly describe their specific functions in the process. In order for the lagging strand to become one single continuous strand, the Okazaki fragments (OF) must undergo a maturation process. / För att den släpande strängen ska bli en kontinuerlig sträng behöver Okazakifragment genomgå en mognadsprocess. A) Which two enzymes are involved in bacterial OF maturation? B) Briefly describe their specific functions in the process. a) Polymeras 1 och DNA-ligas. b) Polymeras 1 har en 5-3-exonukleas-aktivitet, den kommer att bryta upp RNA-primerna på Okazakifragmenten i 5-3-riktning. Den kommer också byta ut RNAt mot korresponderande DNA. För att detta ska ske korrekt har den även en 3-5-exonukleas-aktivitet som kan bryta fosfodiesterbindningar om fel nukleotid sätts på. Ligaset kommer att reparera "nicks", alltså små mellanrum som kommer finnas mellan det nysyntetiserade DNAt som tagit primerns plats och det "äldre" DNAt. Detta gör ligaset genom att skapa en fosfodiesterbindning mellan nukleotiderna, detta sker med hjälp av ATP.
238 2021-12-16 21 integrering-av-metabolismen Förklara varför utbytet av ATP från en glukos som genomgår aerob katabolism inte alltid blir detsamma. (Max 120 ord.) Förklara varför utbytet av ATP från en glukos som genomgår aerob katabolism inte alltid blir detsamma. (Max 120 ord.) Hur mycket ATP man får beror på vilken transportör som används för intaget av de 2 NADH till mitokondrien som tillverkats vid glykolys. Om glycerol-3-fosfatshunten används, där kommer NADH genom ett mellansteg donera sina elektroner till FAD som befinner sig i komplex 2 i elektrontransportkedjan. Därav kommer 2 st NADH inte att donera några elektroner till komplex 1 vilket skulle ha resulterat i utpumpandet av 2×4 väten som i sin tur skulle resulterat två mer ATP genererade. Om istället malat-aspartatshunten användas kommer inte två ATP att förloras. Där kommer NADH reducera oxaloacetat till malat → transporteras in i mitokondrien → omvända reaktionen sker → NAD⁺ i mitokondrien blir NADH → donerar elektroner till komplex 1 → inga protoner "tappas", två "extra" ATP.
239 2021-12-16 31 heme Beskriv översiktligt hur heme bryts ner och utsöndras. Beskriv översiktligt hur heme bryts ner och utsöndras. Heme kommer först att bilda biliverdin – sedan bildas bilirubin – sedan bildas bilrubin. Bilirubin är en hydrofob molekul – kan inte transporteras fritt i blodet – därför kommer den i levern att konjugeras med två stycken syror, glukaronsyror – bilrubin bildas som är amfipatisk och en mer vattenlöslig molekyl. Den kommer därmed att utsöndras genom gallan i levern → transporteras till tunntarmen → utsöndras slutligen i avföringen.
240 2021-12-16 25 glykogen Vilken är den huvudsakliga funktionen av glykogen i levern respektive skelettmuskulaturen? Ange även den huvudsakliga orsaken till denna skillnad samt vilken slutprodukt som bildas vid fullständig glykogenolys i respektive vävnad. Vilken är den huvudsakliga funktionen av glykogen i levern respektive skelettmuskulaturen? Ange även den huvudsakliga orsaken till denna skillnad samt vilken slutprodukt som bildas vid fullständig glykogenolys i respektive vävnad. Glykogen i levern fungerar som en glukosreserv för blodet – man vill kunna sänka blodglukosen om den är för hög – glykogen bildas – och kunna höja den om den är för låg – glykogen bryts ner – glukos släpps ut i blodet. I muskler fungerar glykogen som en glukosreserv för muskeln själv. Om det behövs ATP pga muskelarbete kommer glykogen att brytas ned och gå in i glykolysen. Anledningen till att bara levern kan skicka ut glukos till blodet är för att den har enzymet glukos-6-fosfatas i ER. Vid nedbrytning av glykogen kommer glukos-1-fosfat bildas → sedan isomeriseras detta m.h.a. fosfoglukosmutas (sker i både muskler och lever) till glukos-6-fosfat. Detta är den slutgiltiga produkt som bildas i glykogenolys i muskler → den kan gå in i glykolys eller andra metabola vägar. Glukos-6-fosfat kan dock inte transporteras ut ur cellerna. För att göra detta måste den omvandlas till glukos. Det är vad glukos-6-fosfatas-enzymet gör, den tar bort fosfatgruppen med hjälp av hydrolys. Då kan glukos släppas ut i blodet och transporteras till andra vävnader. Glukos är alltså slutprodukten i lever. Sammanfattat är alltså anledningen till varför glykogen har olika funktioner i muskler och lever för att lever innehåller enzymet glukos-6-fosfatas medan muskler inte innehåller detta enzym. Detta enzym möjliggör att glukos kan släppas ut i blodet och inte endast användas i den egna cellen.
241 2021-12-16 11 kromatin Beskriv nukleosomens uppbyggnad (Nucleosome core particle). Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade. Beskriv nukleosomens uppbyggnad (Nucleosome core particle). Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade. Nukleosomen består av histon-proteiner och DNA-helix. I mitten av nukleosomen finns två kopior av histonproteinerna H2A, H2B, H3 och H4. Detta bildar alltså en oktamer. Sedan lindas DNA runt histonerna ungefär 1,75 varv, ca 100–200 baspar långt. Sedan sätter sig en till histon, H1, utanpå DNA-strängen och oktameren för att stabilisera och motverka att strukturen lindas upp. Mellan två histoner kommer det finnas en fri bit av DNA som kallas linker-DNA.
242 2021-12-16 8 utforska-proteiner Du har fått i uppgift att analysera proteiner i en lösning med hjälp av SDS-PAGE. (Max 150 ord) A) Förklara principen för metoden. B) Vad fyller SDS för funktion? C) Vilken egenskap hos proteinet används för separation? Du har fått i uppgift att analysera proteiner i en lösning med hjälp av SDS-PAGE. (Max 150 ord) A) Förklara principen för metoden. B) Vad fyller SDS för funktion? C) Vilken egenskap hos proteinet används för separation? A) Principen med SDS-PAGE är att man vill analysera proteiner avseende massa. Man använder först en molekyl som heter SDS, en negativt laddad molekyl som binder till proteiner. Ju större massa proteinet har – desto större mängd SDS-molekyler binder – resulterar i en större negativ laddning (jämfört med mindre proteiner). Sedan låter man dessa proteiner vandra genom en polyakrylamid-gel från en negativ elektrod till en positiv elektrod. Ju större negativ laddning desto större motstånd i gelen. Detta leder till att små proteiner vandrar längst och stora kortast. Då får man alltså en separation i gelen avseende storlek. B) SDS som beskrivet är en negativ molekyl som binder till protein – funktionen är att skapa en laddningsskillnad mellan proteiner som korresponderar till storleken. C) Det är proteinernas massa som används för separation.
243 2021-12-16 35 introduktionslaboration Du sätter upp en studie för att avgöra om människor som migrerar löper en ökad risk att utveckla schizofreni jämfört med icke-migranter. Din nollhypotes är således följande: ”Risken att utveckla schizofreni är densamma bland migranter och icke-migranter”. Du genomför studien, sammanställer resultaten och utför ett statistiskt test för att avgöra om den eventuella skillnaden är statistiskt signifikant. När kan du förkasta nollhypotesen med viss säkerhet? Välj ett alternativ: A: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. B: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. C: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0. D: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0. Du sätter upp en studie för att avgöra om människor som migrerar löper en ökad risk att utveckla schizofreni jämfört med icke-migranter. Din nollhypotes är således följande: ”Risken att utveckla schizofreni är densamma bland migranter och icke-migranter”. Du genomför studien, sammanställer resultaten och utför ett statistiskt test för att avgöra om den eventuella skillnaden är statistiskt signifikant. När kan du förkasta nollhypotesen med viss säkerhet? Välj ett alternativ: A: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. B: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden innehåller siffran 0. C: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≤ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0. D: Om det statistiska testet framställer ett p-värde ≥ 0,05 och det 95-iga konfidensintervallet för den skattade skillnaden inte innehåller siffran 0. C
244 2021-12-16 3 från-aminosyror-till-proteiner Rita en dipeptid bestående av de två (olika) aminosyror från vars sidokedjor det inte går att bilda glukos. Dipeptiden befinner sig i en lösning med pH-värde 2. Ange vilka aminosyrorna är. Rita en dipeptid bestående av de två (olika) aminosyror från vars sidokedjor det inte går att bilda glukos. Dipeptiden befinner sig i en lösning med pH-värde 2. Ange vilka aminosyrorna är. ![[Pasted image 20251128074813.png]] Ska stå Lysin, inte Lycin.
245 2021-12-16 7 evolution Briefly describe the RNA world hypothesis with an example. / Beskriv kortfattat RNA-världs-hypotesen genom ett exempel. (Max 100 words.) Briefly describe the RNA world hypothesis with an example. / Beskriv kortfattat RNA-världs-hypotesen genom ett exempel. (Max 100 words.) The RNA world hypothesis describes how living things has gone from using only RNA as storage of genetic material and catalyzing chemical processes (ribozymes) to being close to solely depending on proteins to catalyze many important chemical processes. One example is the enzyme RNAse P which function is cleave the 5´ end of tRNA-molecules. In bacteria the enzyme consits of almost only RNA and very little proteins (which are not even essentiall to the function). In archea there is less RNA and more protein, and in eukaryotes proteins make up the largest part of the enzyme. This is aligned with the hypothesis.
246 2021-12-16 6 hemoglobin Vilken/vilka av nedanstående faktorer leder till att hemoglobinets syrebindande förmåga minskar? Välj ett eller flera alternativ: A: Hög koncentration 2,3-BPG. B: Högt pH. C: Hög koncentration O₂. D: Hög koncentration CO₂. Vilken/vilka av nedanstående faktorer leder till att hemoglobinets syrebindande förmåga minskar? Välj ett eller flera alternativ: A: Hög koncentration 2,3-BPG. B: Högt pH. C: Hög koncentration O₂. D: Hög koncentration CO₂. A och D
247 2021-12-16 2 lipider Ange en skillnad mellan mättade och omättade fettsyror avseende struktur och en skillnad avseende inverkan på fluiditeten hos cellens membran. Ange en skillnad mellan mättade och omättade fettsyror avseende struktur och en skillnad avseende inverkan på fluiditeten hos cellens membran. Mättade fettsyror har inga dubbelbindningar – därav är deras fettsyrekedjor raka strukturer. Omättade fettsyror har däremot en eller flera dubbelbindningar – detta leder till en böjning i strukturen där dubbelbindningen sitter – fettsyrorna blir inte helt raka strukturer utan böjda på olika sätt beroende på vart dubbelbindningarna sitter och om de har trans eller cis-konfiguration. Eftersom att de mättade fettsyrorna har raka fettsyrasvansar kan dessa packas mycket tätt – fluiditeten i membranet minskar. Däremot kan de omättade fettsvansarna inte packas lika tätt på grund av att de inte är raka strukturer – fluiditeten i membranet ökar.
248 2023-12-18 28 heme Vilka två påståenden om heme är korrekta? (2p) A: Succinyl-CoA och glycin används vid hemesyntesen. B: Trypsin innehåller heme. C: Hememolekylen innehåller en magnesiumjon. D: Cytokrom C innehåller heme. Vilka två påståenden om heme är korrekta? (2p) A: Succinyl-CoA och glycin används vid hemesyntesen. B: Trypsin innehåller heme. C: Hememolekylen innehåller en magnesiumjon. D: Cytokrom C innehåller heme. A och D
249 2023-12-18 5 utforska-proteiner Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein baserat på laddning. (4p) (Max 200 ord) A) Beskriv vilken metod du skulle använda dig av och hur denna fungerar. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en förklaring till hur denna fungerar. Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein baserat på laddning. (4p) (Max 200 ord) A) Beskriv vilken metod du skulle använda dig av och hur denna fungerar. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en förklaring till hur denna fungerar. a) Jonbyteskromotografi. Efter att ha lösgjört proteinerna i homogenisat går reningsmetoden ut på att man för proteinlösningen genom en kolonn som innehåller kulor som antingen är positivt eller negativt laddade beroende på proteinets laddning som man vill ha ut. En katjonsbytare är negativt laddade kulor i kolonnen som kommer att attrahera positivt laddade proteiner från fasen man för igenom medan en anjonbytare däremot är positivt laddade kulor som kommer att attrahera negativt laddade proteiner. Det är proteinets totala laddning som selekteras. Sedan kan en buffert eller salt användas för att eluera proteinerna från de laddade kulorna i kolonnen för vidare analys. b) För att analysera storleken hade jag valt SDS page som är en elektrofores-metod där man först blandar i ämnet SDS (sodum dodecyl sulfate) som är negativt laddade molekyler som kommer att binda till aminosyrorna och slå ut proteinets tidigare laddning. Proteinetet kommer att binda SDS baserat på hur stort det är, ju större protein desto mer negativt laddat då fler aminosyror laddas av SDS och proteinerna får vandra i ett elektriskt fält där de minsta vandrar längst mot positiv pol då de hindras minst av de steriska hindrena i polyakrylamid-gelen. Separation map STORLEK
250 2023-12-18 18 termodynamik Redogör för begreppet entalpi samt för hur den kan användas för att förutse tendensen för att en viss biokemisk reaktion att ske. (4p) Redogör för begreppet entalpi samt för hur den kan användas för att förutse tendensen för att en viss biokemisk reaktion att ske. (4p) Entalpi (H) betyder energiinnehållet i en reaktion. Entalpi beror på bindningar som finns i de ämnen som är delaktiga i reaktionen och vilken art bindningarna har. I en exoterm reaktion kommer energiinnehållet minska eftersom energi släpps ut. Om ΔH är negativ för en reaktion är den exoterm och kan därmed ses som fördelaktig. När energi, t.ex. i form av värme, släpps ut till omgivningen kan det öka entropin i molekyler som finns runtom, vilket är fördelaktigt enligt termodynamikens andra lag. (Om temperaturen och trycket är konstant kan H tillsammans med systemets parametrar användas för att beräkna den fria energin. ΔG = ΔH − TΔS. Om ΔG är negativ är reaktionen spontan och benägen att ske.)
251 2023-12-18 1 kemiska-bindingar I celler är vatten lösningsmedel. Förklara ur bindningssynpunkt varför detta är fördelaktigt. (4p) (Max 100 ord.) I celler är vatten lösningsmedel. Förklara ur bindningssynpunkt varför detta är fördelaktigt. (4p) (Max 100 ord.) Vatten är en polär molekyl och har en dipol eftersom syret är mer elektronegativt än de två vätena. Polariteten gör att vattenmolekyler kan interagera med både positivt laddade molekyler och negativa laddade molekyler som finns i celler. Vid interaktioner med positivt laddade joner kommer den mer elektronegativa syret interagera med jonerna. I interaktioner med negativt laddade joner kommer istället väterna interagera. Vatten kan således bilda hydratiseringsskal runt joner som är essentiella för cellfunktion. Vatten har hög dielektricitetskonstant som gör att alltför starka jonbindningar inte bildas till ämnen, så att joner kan fortfarande utnyttjas i cellulära processer vid behov.
252 2023-12-18 19 enzymer Två fördelar med att mäta den initiala hastigheten för en reaktion, V₀, är att i början av en reaktion … (2p) A: kan produktinhibering inte påverka hastigheten. B: är förändringar i [S] försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. C: har variationer av [S] inte någon effekt på V₀. D: är förändringar i Kₘ försumbara, så Kₘ kan behandlas som en konstant. Två fördelar med att mäta den initiala hastigheten för en reaktion, V₀, är att i början av en reaktion … (2p) A: kan produktinhibering inte påverka hastigheten. B: är förändringar i [S] försumbara, så [S] kan behandlas som en konstant. C: har variationer av [S] inte någon effekt på V₀. D: är förändringar i Kₘ försumbara, så Kₘ kan behandlas som en konstant. A och B
253 2023-12-18 29 elektrontransportkedjan Redogör för hur ATP-syntaset fungerar. (4p) (Max 150 ord.) Redogör för hur ATP-syntaset fungerar. (4p) (Max 150 ord.) ATP-syntaset utnyttjar protongradienten som bildades i elektrontransportkedjan. Dess F₀-del finns i mitokondriens inre membran och har en a-subenhet som innehåller två hydrofila halvkanaler: mot mellanmembranutrymmet (MMU) respektive matrix. a-subenheten interagerar med en c-subenhet (som finns i en ring) som har en negativt laddad aspartat- eller glutamatrest. En proton kan komma in i halvkanalen mot MMU och interagera med aminosyraresten i c-subenheten. Neutralisering gör att c-subenheten roterar en enhet medsols. Därmed kan en proton komma in mot halvkanalen mot matrix och frisättas i matrix. F₀ är kopplad till F₁-delen i matrix via en γ-stjälk. F₁ har 3 alfa- och 3 betasubenheter i en ring. Betasubenheterna bildar ATP och antar tre konformationer: Loose (där ADP + Pi binder), Tight (där ATP bildas) och Open (där ATP frisläpps och en ny ADP + Pi kan binda in). Den roterande γ-stjälken kan leda till konformationsändringarna i betasubenheterna. 3 ATP bildas per varv.
254 2023-12-18 4 hemoglobin What does cooperative binding mean? Explain this in the context of hemoglobin. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max 100 words) What does cooperative binding mean? Explain this in the context of hemoglobin. (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max 100 words) Cooperative binding means that the binding of an oxygen to hemoglobin makes it more likely for the molecule to bind more oxygen. This is because when an oxygen binds to hemoglobin the structure becomes less tense as one αβ-dimer rotates 15 degrees, which increases its affinity for oxygen at other binding sites. Release of an oxygen promotes also further release. Due to the cooperativity hemoglobin has a sigmoidal binding curve at different partial pressures of oxygen. Cooperativity enables hemoglobin to be a good oxygen transporter.
255 2023-12-18 16 cellmembran Vad är en hydropatiplot och vad ger den information om? (4p) Vad är en hydropatiplot och vad ger den information om? (4p) En hydropatiplot kan ge information om det är sannolikt att en viss sekvens är en transmembran alfahelix och hur många alfahelixar det kan motsvara. En hydropatiplot kan skapas genom att undersöka en aminosyrasekvens från N- till C-terminal i intervaller om 20 (aminosyra 1–20, 2–21, 3–22 osv.). Detta beror på att det krävs 20 aminosyror för att gå genom cellmembranet. Man tittar på den energimässiga kostnaden för att flytta respektive aminosyra från en hydrofob till hydrofil miljö. Värdena plottas i en graf där energinivån är på y-axeln och intervallerna är på x-axeln. Man sätter gränsvärdet på 84 kJ/mol (kommer från transmembrana alfahelixar med känd struktur). Om en graf går över gränsvärdet en gång är det sannolikt en transmembran alfahelix. Om den går ovanför gränsvärdet flera gånger tyder det på flera transmembrana alfahelixar.
256 2023-12-18 22 glykolysen I glykolysen finns två reaktioner där ATP förbrukas och två reaktioner där ATP bildas. A) Vilka enzymer katalyserar dessa reaktioner? B) Förklara hur glykolysen trots detta ger ett nettoutbyte av två ATP. (4p) (Max 50 ord) I glykolysen finns två reaktioner där ATP förbrukas och två reaktioner där ATP bildas. A) Vilka enzymer katalyserar dessa reaktioner? B) Förklara hur glykolysen trots detta ger ett nettoutbyte av två ATP. (4p) (Max 50 ord) A) Hexokinas (glukokinas) katalyserar första förbrukningen av ATP och fosfofruktokinas 1 katalyserar andra. Fosfoglyceratkinas katalyserar bildning av första ATP och pyruvatkinas katalyserar bildning av. B) Vid spjälning av fruktos 1,6 - bisfosfatas bildas två 3-kolsenheter, dihydroxyacetonfosfat och glyceraldehyd 3 fosfat. Dihydroxyacetonfosfat kommer bilda glyceraldehyd3fosfat och därmed går 2 glyceraldehyd3fosfat igenom
257 2023-12-18 32 nukleotidnedbrytning Nämn det fullständiga namnet på en purin-nukleotid och ange i vilken molekyl kolskelettet respektive huvuddelen av molekylens kväveatomer slutligen hamnar då nukleotiden bryts ned. (2p) (Max 50 ord) Nämn det fullständiga namnet på en purin-nukleotid och ange i vilken molekyl kolskelettet respektive huvuddelen av molekylens kväveatomer slutligen hamnar då nukleotiden bryts ned. (2p) (Max 50 ord) Adenosinmonofosfat (AMP). Kolskelettet samt huvuddelen av kvävet hamnar i urat.
258 2023-12-18 26 integrering-av-metabolismen I aerob katabolism kommer glukos att omvandlas i ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande metaboliter? (2p) 2-fosfoglycerat Alfaketoglutarat Glyceraldehyd 3-fosfat Malat I aerob katabolism kommer glukos att omvandlas i ett flertal steg innan det oxiderats fullständigt. I vilken ordning kommer följande metaboliter? (2p) 2-fosfoglycerat Alfaketoglutarat Glyceraldehyd 3-fosfat Malat 1. glyceraldehyd 3-fosfat 2. 2-fosfoglycerat 3. Alfaketoglutarat 4. Malat
259 2023-12-18 12 rna-syntes Hur kan en mutation i ett icke-kodande intron ge upphov till sjukdom, t.ex. talassemi? (4p) Hur kan en mutation i ett icke-kodande intron ge upphov till sjukdom, t.ex. talassemi? (4p) En mutation, t.ex. en punktmutation, kan leda till att en ny splice site bildas i mitten av en intron. När ett primärt mRNA senare ska genomgå splicing kan det nya splice-sitet leda till att en del av intronet blir kvar. Intronet kan t.ex. leda till att andra kodon finns kvar eller att stoppkodon blir kvar som leder till att felaktig genprodukt bildas när mRNA senare translateras. Detta kan i sin tur leda till proteiner som har defekter och inte kan utföra normal funktion.
260 2023-12-18 36 plasmid You amplified a gene of interest using the blue/white screening method. You extracted plasmids from two bacterial colonies (one blue colony and one white colony), then performed restriction enzyme digestion and ran the samples on a gel as follows: blue uncut, blue cut, white uncut, white cut (see gel below). When imaging the gel, however, you notice there is a faint band in the blue cut sample (see arrow), which should not be there. Explain why the faint band should not be present in that sample and what are the possible sources of error for this outcome? Refer to the size/number of bands in comparison to the bands in the other lanes for your explanation. This questions needs to be answered in English. (4p) ![[Pasted image 20251129235214.png]] You amplified a gene of interest using the blue/white screening method. You extracted plasmids from two bacterial colonies (one blue colony and one white colony), then performed restriction enzyme digestion and ran the samples on a gel as follows: blue uncut, blue cut, white uncut, white cut (see gel below). When imaging the gel, however, you notice there is a faint band in the blue cut sample (see arrow), which should not be there. Explain why the faint band should not be present in that sample and what are the possible sources of error for this outcome? Refer to the size/number of bands in comparison to the bands in the other lanes for your explanation. This questions needs to be answered in English. (4p) ![[Pasted image 20251129235214.png]] The blue samples are samples with no DNA-insert. They have an intact lacZ-gene and are able to produce β-galactosidase which breaks down X-gal to a blue pigment. Since the blue colony samples have no DNA insert, the blue sample should show one band on the gel electrophoresis. The reason that the blue cut shows two bands can be because a mixed colony was chosen, meaning one that also had white colonies. This could likely be the case because the second band has a 1500 bp size which the second band of the "white cut" also has. Another possible reason for this odd result is contamination. The "blue cut" sample could possibly have been contaminated with white cut samples when pipetting or by improper labelling of tubes. This could be the case as the samples in both lanes show similar sizes (even the larger band is approximately the same size in both, 3000 bp).
261 2023-12-18 27 betaoxidation Vilka två effekter har insulin på fettmetabolismen? (2p) A: Inhiberar acetyl-CoA-karboxylas. B: Inhiberar syntes av fettsyror. C: Aktiverar acetyl-CoA-karboxylas. D: Aktiverar syntes av fettsyror. Vilka två effekter har insulin på fettmetabolismen? (2p) A: Inhiberar acetyl-CoA-karboxylas. B: Inhiberar syntes av fettsyror. C: Aktiverar acetyl-CoA-karboxylas. D: Aktiverar syntes av fettsyror. C och D
262 2023-12-18 13 kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Vilka två påståenden stämmer om trp-operonet? (2p) A: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att bryta ner aminosyran tryptofan. B: När det inte finns tryptofan i omgivningen, binder tryptofan-repressorn till operatorsekvensen i trp-operonet. C: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att syntetisera aminosyran tryptofan. D: Trp-repressorn kan blockera bindning av RNA-polymeras till promotorn. Vilka två påståenden stämmer om trp-operonet? (2p) A: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att bryta ner aminosyran tryptofan. B: När det inte finns tryptofan i omgivningen, binder tryptofan-repressorn till operatorsekvensen i trp-operonet. C: Trp-operonet kodar för enzymer som behövs för att syntetisera aminosyran tryptofan. D: Trp-repressorn kan blockera bindning av RNA-polymeras till promotorn. C och D
263 2023-12-18 17 transport-över-cellmembran Vilka två påståenden om glukostransportörer är korrekta? (2p) A: De utför aktiv transport. B: De faciliterar diffusion. C: De är bärarproteiner. D: De kan enbart transportera glukos i en riktning. Vilka två påståenden om glukostransportörer är korrekta? (2p) A: De utför aktiv transport. B: De faciliterar diffusion. C: De är bärarproteiner. D: De kan enbart transportera glukos i en riktning. B och C
264 2023-12-18 23 Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för flera enzymer. A) Vilka är enzymerna och hur påverkas deras aktivitet av fruktos 2,6-bisfosfat inbindning? B) Vad reglerar hur mycket fruktos 2,6-bisfosfat som bildas? (4p) (Max 75 ord.) Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för flera enzymer. A) Vilka är enzymerna och hur påverkas deras aktivitet av fruktos 2,6-bisfosfat inbindning? B) Vad reglerar hur mycket fruktos 2,6-bisfosfat som bildas? (4p) (Max 75 ord.) A) Fosfofruktokinas i glykolys aktiveras. Fruktos-1,6-bisfosfatas i glukoneogenes inhiberas. B) Fruktos 2,6-bisfosfat (F-2,6-BP) bildas av fosfofruktokinas 2 som ingår i ett bifunktionellt enzym med fruktos-2,6-bisfosfatas. Om insulin finns stimulerar det fosfoproteinfosfatas som defosforylerar och aktiverar fosfofruktokinas 2 vilket leder till ökad F-2,6-BP-produktion. Däremot, om glukagon finns, ger det upphov till cAMP-bildning som aktiverar proteinkinas A som fosforylerar fosfofruktokinas 2, som därmed inhiberar produktionen av fruktos-2,6-bisfosfat.
265 2023-12-18 33 pentosfosfatvägen En fullt funktionell pentosfosfatväg är viktig för röda blodkroppars skydd mot väteperoxid. Varför? (2p) (Max 50 ord) En fullt funktionell pentosfosfatväg är viktig för röda blodkroppars skydd mot väteperoxid. Varför? (2p) (Max 50 ord) När glutationperoxidas tar hand om väteperoxid oxideras glutation. För att skyddet ska fortsätta finnas mot väteperoxid måste den reducerade formen av glutation återbildas med reduktionsmedlet NADPH. I röda blodkroppar saknas mitokondrier och NADPH kan endast bildas genom pentosfosfatvägen. Därför är en funktionell pentosfosfatväg viktig.
266 2023-12-18 24 glykogen Vilka två av följande påståenden om glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Glykogen är kovalent bundet till enzymet glykogenin. B: Höga intracellulära nivåer av glukos-6-fosfat stimulerar glykogenolys i skelettmuskel. C: Skelettmuskel kan använda sig av glykogen som energikälla vid anaerobt arbete. D: Glykogenolys sker i huvudsak via så kallad hydrolys. Vilka två av följande påståenden om glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Glykogen är kovalent bundet till enzymet glykogenin. B: Höga intracellulära nivåer av glukos-6-fosfat stimulerar glykogenolys i skelettmuskel. C: Skelettmuskel kan använda sig av glykogen som energikälla vid anaerobt arbete. D: Glykogenolys sker i huvudsak via så kallad hydrolys. A och C
267 2023-12-18 10 dna-replikation På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. Fyra olika replikationsfaktorer är markerade på denna bild. Vad heter de olika faktorerna vid pil a, b, c och d? (4p) ![[Pasted image 20251129235154.png]] På bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. Fyra olika replikationsfaktorer är markerade på denna bild. Vad heter de olika faktorerna vid pil a, b, c och d? (4p) ![[Pasted image 20251129235154.png]] a) CMG-helikas b) PCNA c) Replication protein A d) DNA-polymeras δ
268 2023-12-18 9 kromatin Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: En nukleosom innehåller 8 proteiner. B: Acetylering kan neutralisera positiva laddningar i histonsvansar. C: Med epigenetisk reglering menas reglering av genuttryck som endast beror av den nedärvda DNA-sekvensen. D: I en nukleosom lindas DNA 2,75 varv runt ett proteinkomplex. Vilka två påståenden om kromatin är korrekta? (2p) A: En nukleosom innehåller 8 proteiner. B: Acetylering kan neutralisera positiva laddningar i histonsvansar. C: Med epigenetisk reglering menas reglering av genuttryck som endast beror av den nedärvda DNA-sekvensen. D: I en nukleosom lindas DNA 2,75 varv runt ett proteinkomplex. A och B
269 2023-12-18 34 kolesterol 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA reduktas (HMG-CoA-reduktas) har en nyckelroll i reglering av cellernas kolesterolsyntes. Beskriv hur detta enzym regleras på transkriptionell nivå; den viktigaste reglermekanismen. (4p) 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA reduktas (HMG-CoA-reduktas) har en nyckelroll i reglering av cellernas kolesterolsyntes. Beskriv hur detta enzym regleras på transkriptionell nivå; den viktigaste reglermekanismen. (4p) Transkriptionen regleras av Sterol Regulator Element Binding Protein (SREBP) som har en transkriptionsfaktordel mot cytosolen. Vid låg kolesterol flyttas SREBP från det endoplasmatiska retiklet till golgiapparaten. Här klyvs transkriptionsfaktordelen av SREBP av Golgi localized site 1 proteaset. Därefter klyver site 2-proteaset vid N-terminalen. Den N-terminala delen som har transkriptionsfaktorn binder till Sterol Regulator Element 1 som finns i promotorn av bland annat HMGR, som leder till en ökad transkription av HMGR. Själva transporten av SREBP till golgiapparaten, som också påverkar transkriptionen, regleras av Insig 1, Insig 2 och Scap. Vid låg kolesterolnivå kommer Insig inte binda till SREBP–Scap-komplexet. Insig bryts därmed ned i proteasomen och SREBP–Scap-komplexet kan interagera med COPII, som är involverade i vesiklar som transporteras till golgi. Men om kolesterol finns och det binder till SREBP–Scap-komplexet kommer en konformationsändring ske som gör att Insig kan binda in. Detta förhindrar interaktion med COPII. SREBP går inte med i vesiklar till golgi, vilket betyder att transkription av HMGR inte ökar när mycket kolesterol finns.
270 2023-12-18 14 translation Wobble-effekten är en viktig aspekt av genetisk kodavläsning under translationen. Förklara vad wobble-effekten är och hur den bidrar till flexibiliteten i parningen mellan kodoner på mRNA och antikodonerna på tRNA. Diskutera även hur denna effekt kan bidra till tolerans mot vissa genetiska mutationer. (4p) (Max 150 ord) Wobble-effekten är en viktig aspekt av genetisk kodavläsning under translationen. Förklara vad wobble-effekten är och hur den bidrar till flexibiliteten i parningen mellan kodoner på mRNA och antikodonerna på tRNA. Diskutera även hur denna effekt kan bidra till tolerans mot vissa genetiska mutationer. (4p) (Max 150 ord) Wobble-effekten betyder att den första basen i ett antikodon kan binda till flera olika baser på den tredje basen av ett kodon. En kvävebas på tRNA-antikodon som har en sådan förmåga att binda till flera olika baser på den tredje basen i kodonet är inosin, som kan binda till uracil, cytosin och adenin. Att den första basen i antikodonet kan binda till flera baser leder till att ett tRNA kan binda till flera kodon på mRNA vilket ökar molekylens flexibilitet (en aminosyra kan kopplas till flera olika kodon). Wobble-effekten kan bidra till tolerans mot vissa genetiska mutationer, eftersom även om en mutation finns som gör att en annorlunda kvävebas finns, kan tRNA trots detta binda till det och binda korrekt aminosyra.
271 2023-12-18 20 enzymer Vad är syftet med den katalytiska klyftan som finns i ett enzym? Redogör för två fördelar den katalytiska klyftan ger för katalys. (4p) Vad är syftet med den katalytiska klyftan som finns i ett enzym? Redogör för två fördelar den katalytiska klyftan ger för katalys. (4p) Den katalytiska klyftan är den del av enzymet som substratet binder in och som reaktionen kan katalyseras i. och övergångstillståndet kan stabilseras så att reaktionen kan ske snabbare. Den katalytiska klyftan är en väldigt liten del av enzymet och består av aminosyrarester i proteinet som ger en specificitet för enbart vissa molekyler att binda in, detta ökar specificiteten och hindrar andra potentiella reaktanter från att komma nära och interagera. Den utesluter bland annat vatten som hade hämmat många reaktioner genom sin polaritet. Dessutom kommer den katalytiska klyftan att införa svaga bindingar som stabiliserar övergångstillståndet och bildningen av produkt, ett fenomen som i vanliga fall hade krävt betydligt högre aktiveringsenergi för att kunna ske. Dvs som hade krävt högre energi i omlopp som hade satt molekylerna i rörelse så att de kom nära varandra tillräckligt ofta för att det ostabila övergångstillståndet hade kunnat ske. Den katalytiska klyftan av enzymet sänker därför aktiveringsenergin till reaktionen.
272 2023-12-18 30 elektrontransportkedjan Beskriv med en reaktionsformel hur celler hanterar att syrgas ibland enbart tar upp en elektron. (2p) (Max 25 ord) Beskriv med en reaktionsformel hur celler hanterar att syrgas ibland enbart tar upp en elektron. (2p) (Max 25 ord) Superoxid + 2 H⁺ → H₂O₂ mha dismutas. (superoxid = O₂·⁻) (Väteperoxiden tas hand om av glutationperoxidas (2 H₂O₂ → O₂ + 2 H₂O, där 2 glutation oxideras))
273 2023-12-18 15 evolution Lista fyra aspekter som är identiska för alla livsformer på jorden. (4p) Lista fyra aspekter som är identiska för alla livsformer på jorden. (4p) 1. Alla livsformer lagrar sin arvsmassa/genetiska information i nukleinsyror i form av RNA eller DNA. 2. Den grundläggande metabolismen i alla livsformer är liknande. 3. Livsformer använder ATP som energivaluta i sina celler. 4. Alla livsformer använder cofaktorer i sina enzymer.
274 2023-12-18 21 introduktion-till-metabolismen Vilka två av nedanstående molekyler är beroende av en B-vitamin för sin syntes? (2p) A: Coenzym A B: Coenzym Q C: NADH D: ATP Vilka två av nedanstående molekyler är beroende av en B-vitamin för sin syntes? (2p) A: Coenzym A B: Coenzym Q C: NADH D: ATP A och C
275 2023-12-18 31 aminosyrametabolism Ange det fullständiga namnet på ett kliniskt viktigt enzym som tillhör gruppen aminotransferaser, samt ange reaktionen enzymet katalyserar. (4p) (Max 50 ord) Ange det fullständiga namnet på ett kliniskt viktigt enzym som tillhör gruppen aminotransferaser, samt ange reaktionen enzymet katalyserar. (4p) (Max 50 ord) Alanin aminotransferas (höga nivåer av detta tyder på leversjukdom). Den katalyserar följande reaktion: Alanin + α-ketoglutarat ⇌ Pyruvat + Glutamat.
276 2023-12-18 25 citronsyracykeln Vilka två av nedanstående molekyler reglerar något enzym i citronsyracykeln? (2p) A: NADH B: Pyruvat C: Acetyl-CoA D: ADP Vilka två av nedanstående molekyler reglerar något enzym i citronsyracykeln? (2p) A: NADH B: Pyruvat C: Acetyl-CoA D: ADP A och D
277 2023-12-18 11 dna-replikation a) Vilken roll spelar DNA-polymeras epsilon? b) Hur kan PCNA påverka aktiviteten hos DNA-polymeras epsilon? (4p) a) Vilken roll spelar DNA-polymeras epsilon? b) Hur kan PCNA påverka aktiviteten hos DNA-polymeras epsilon? (4p) a) DNA-polymeras epsilon är involverad i DNA-replikation på leading strand. Det katalyserar påkopplingen av kvävebaser från 5' till 3'-riktning. Det har en 3' till 5' exonukleasaktivitet och kan ta bort om en felaktig bas har kopplats på (proofreading). b) PCNA (sliding clamp) ökar processiviteten hos DNA-polymeras genom att hålla det fastbundet till DNA-mallen. På så sätt ramlar DNA-polymeraset inte av och kan arbeta med ökad processivitet.
278 2023-12-18 8 kolhydrater Glykaner kan vara O-länkade och N-länkade. Förklara kortfattat vad detta innebär på molekylär nivå. (4p) (Max 150 ord) Glykaner kan vara O-länkade och N-länkade. Förklara kortfattat vad detta innebär på molekylär nivå. (4p) (Max 150 ord) O-länkade glykaner betyder att kolhydraten är länkad via syre i sidokedjan av serin eller threonin. N-länkade betyder att kolhydraterna är länkade via kvävet i sidokedjan av asparagin.
279 2023-12-18 35 introduktionslaboration I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värde på 0,03 och ett 95% konfidensintervall på 6–17 mmHg. Nollhypotesen är att det inte finns någon skillnad i medelvärde i blodtryck mellan de två grupperna. Vilka två påståenden är korrekta baserat på dessa resultat? (2p) Välj ett eller flera alternativ: A: Ett p-värde på 0,03 innebär att det 95%-iga konfidensintervallet inte inkluderar nollan. B: Nollhypotesen kan förkastas. C: Det är 95% säkert att behandlingsgruppen har mellan 6 och 17 mmHg lägre blodtryck jämfört med placebogruppen. D: Det finns ingen statistisk signifikant skillnad i blodtryck mellan grupperna. I en studie utvärderas effekten av en ny blodtryckssänkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten från studien visar ett p-värde på 0,03 och ett 95% konfidensintervall på 6–17 mmHg. Nollhypotesen är att det inte finns någon skillnad i medelvärde i blodtryck mellan de två grupperna. Vilka två påståenden är korrekta baserat på dessa resultat? (2p) Välj ett eller flera alternativ: A: Ett p-värde på 0,03 innebär att det 95%-iga konfidensintervallet inte inkluderar nollan. B: Nollhypotesen kan förkastas. C: Det är 95% säkert att behandlingsgruppen har mellan 6 och 17 mmHg lägre blodtryck jämfört med placebogruppen. D: Det finns ingen statistisk signifikant skillnad i blodtryck mellan grupperna. A och B
280 2023-12-18 3 från-aminosyror-till-proteiner Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för två enzymer. Förklara vilka egenskaper de aminosyror som binder till fruktos 2,6-bisfosfat behöver ha och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 75 ord.) Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för två enzymer. Förklara vilka egenskaper de aminosyror som binder till fruktos 2,6-bisfosfat behöver ha och nämn två aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 75 ord.) Fruktos 2,6-bisfosfat har två fosfatgrupper som kan ha negativt laddade syren. För att binda in ämnet och skapa en elektrostatisk attraktion (jonbindning), kan det därmed vara fördelaktigt att ha aminosyror som har en positiv laddning. Lysin och arginin är två positivt laddade aminosyror som kan vara lämpliga.
281 2023-12-18 7 nukleotider Den vanligaste formen som DNA antar kallas B-DNA. Vilka två påståenden stämmer om denna? (2p) A: Den är vänstervriden. B: Det är mellan 10–10,4 baspar per varv av helixen. C: Avståndet mellan baspar är cirka 3,4 Å. D: De två strängarna parallella. Den vanligaste formen som DNA antar kallas B-DNA. Vilka två påståenden stämmer om denna? (2p) A: Den är vänstervriden. B: Det är mellan 10–10,4 baspar per varv av helixen. C: Avståndet mellan baspar är cirka 3,4 Å. D: De två strängarna parallella. B och C
282 2023-12-18 6 lipider a) Rita strukturen för kolesterol. b) Visa hur kolesterol orienteras i ett membran. OBS! Den här frågan ska besvaras på separat papper som kommer att skannas in och bifogas tentamen. (4p) a) Rita strukturen för kolesterol. b) Visa hur kolesterol orienteras i ett membran. OBS! Den här frågan ska besvaras på separat papper som kommer att skannas in och bifogas tentamen. (4p) se 2023-12-18-0114-EES
283 2023-12-18 2 från-aminosyror-till-proteiner Rangordna nedanstående aminosyror efter stigande polaritet (2p) Cystein Lysin Metionin Treonin Rangordna nedanstående aminosyror efter stigande polaritet (2p) Cystein Lysin Metionin Treonin 1. Metionin 2. Cystein 3. Treonin 4. Lysin
284 2024-05-15 28 glykogen Vilka två av följande faktorer stimulerar glykogenes (syntes av glykogen) i en skelettmuskelcell? (2p) A: Förhöjda koncentrationer av ATP i muskelcellen. B: Förhöjda koncentrationer av AMP i muskelcellen. C: Förhöjda koncentrationer av glukos-6-fosfat i muskelcellen. D: Intracellulär signalering inducerad av hormonet insulin. Vilka två av följande faktorer stimulerar glykogenes (syntes av glykogen) i en skelettmuskelcell? (2p) A: Förhöjda koncentrationer av ATP i muskelcellen. B: Förhöjda koncentrationer av AMP i muskelcellen. C: Förhöjda koncentrationer av glukos-6-fosfat i muskelcellen. D: Intracellulär signalering inducerad av hormonet insulin. C och D
285 2024-05-15 5 utforska-proteiner Du jobbar på ett labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein med hjälp av affinitetskromatografi. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med hjälp av affinitetskromatografi. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en kortfattad förklaring till hur denna fungerar. (4p) (Max 200 ord.) Du jobbar på ett labb över sommaren och har fått i uppgift att göra en rening av ett protein med hjälp av affinitetskromatografi. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med hjälp av affinitetskromatografi. B) Ange en metod för att analysera storleken på ditt framrenade protein och ge en kortfattad förklaring till hur denna fungerar. (4p) (Max 200 ord.) 3 av 4 poäng: A) Affinitetskromatografi är rening baserad på egenskaper hos proteinet. Ett exempel är att man kan sätta på 6 stycken histidin på proteinet på DNA nivå, sk 6xHis. Histidin har en hög affinitet för nickeljoner som man kan lägga i kolonnen. När man häller ner proteinblandningen kommer histidin att binda till nickeljonerna vilket gör att proteinet stannar i kolonnen. För att sedan få proteinet att släppa kan man använda sig av imidazol som har ännu högre affinitet för nickeljonerna för att eleduera ut proteinet. B) Man kan använda sig av SDS-Page. Då utsätter man proteinet för SDS molekyler som kommer att binda in till det. SDS molekylerna är negativt laddade och ju större protein, ju fler SDS molekyler kommer binda in, ju mer negativt laddat blir det. Sedan använder man sig av gelelektrofores (Page) för att få proteinet att röra på sig i ett elektromagnetiskt fält. Större protein kommer röra sig långsammare medan snabbare rör sig fortare. DVS Störst, sist.
286 2024-05-15 18 termodynamik En ändring i entropi kan vara den huvudsakliga drivkraften för en reaktion. Nämn två sätt att ändra entropin i biokemiska reaktioner. Förklara med exempel. (4p) (Max 150 ord.) En ändring i entropi kan vara den huvudsakliga drivkraften för en reaktion. Nämn två sätt att ändra entropin i biokemiska reaktioner. Förklara med exempel. (4p) (Max 150 ord.) 3 av 4: Entropi är ett mått på oordning. Enligt deltaG= deltaH - T deltaS. Vilket betyder att förändring i S/entropi kan man få utifrån (deltaH - deltaG)/T. Alltså kan man ändra entropin genom att ändra temperaturen. Då temperatur är mått på värmeenergi. Högre temperatur betyder mer oordning. Man kan ändra entropin genom att katalysera en reaktion med ett enzym. Enzymet minskar aktiveringsenergin som behövs för att reaktionen ska se.
287 2024-05-15 1 kemiska-bindingar Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. (2p) Svagast → Starkast: A: van der Waals B: väte C: dubbel D: peptid Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. (2p) Svagast → Starkast: A: van der Waals B: väte C: dubbel D: peptid (svar angivet i drag-och-släpp-formulär) Totalpoäng: 2
288 2024-05-15 19 enzymer Ett enzym uppvisar Michaelis-Mentens kinetik. A) Redogör för hur man i ett V mot [S] diagram kan avläsa de två konstanterna Km och Vmax. B) Förklara vad som händer med Km respektive Vmax om man tillsätter en icke-kompetitiv hämmare? (4p) (Max 150 ord.) Ett enzym uppvisar Michaelis-Mentens kinetik. A) Redogör för hur man i ett V mot [S] diagram kan avläsa de två konstanterna Km och Vmax. B) Förklara vad som händer med Km respektive Vmax om man tillsätter en icke-kompetitiv hämmare? (4p) (Max 150 ord.) A) Vmax kan avläsas som det y-värde på grafen som fås då substratoncentrationen går mot oändligheten dvs det y-värde som fås när grafen planar ut allt eftersom substratkoncentrationen ökar. Km kan avläsas som det x-värde som grafen antar då grafens y-värde är halva Vmax dvs hälften av grafens maxvärde. B) Det som sker är att Vmax kommer minska eftersom en icke-kompetitiv hämmare binder allostert till enzymet oavsett om substrat bundit eller ej och genför en konformationsändring i enzymet som gör att enzymet får sämre katalytisk förmåga dvs Vmax sänks. Däremot kommer Km att vara oförändrat då inhibitorn är oberoende av substratkoncentrationen eftersom den binder till enzymet oavsett om substrat finns och oavsett hur mycket/lite substrat som finns.
289 2024-05-15 29 glykogen Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolismen är korrekta? (2p) A: Skelettmuskel kan bara bryta ned glykogenet till glukos-6-fosfat eftersom muskelcellerna saknar enzymet glukos-6-fosfatas. B: Glykogenin är ett enzym som krävs för att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel. C: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet glukagon induceras glykogenolys i cellen. D: Glykogen upplagrat i skelettmuskel kan användas för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider. Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolismen är korrekta? (2p) A: Skelettmuskel kan bara bryta ned glykogenet till glukos-6-fosfat eftersom muskelcellerna saknar enzymet glukos-6-fosfatas. B: Glykogenin är ett enzym som krävs för att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel. C: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet glukagon induceras glykogenolys i cellen. D: Glykogen upplagrat i skelettmuskel kan användas för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider. A och B
290 2024-05-15 4 hemoglobin How does the partial pressure of oxygen influence binding and release of oxygen to/from hemoglobin? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words). How does the partial pressure of oxygen influence binding and release of oxygen to/from hemoglobin? (4p) OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words). If the partial pressure is high it means that there is a high concentration of oxygen in the area which will increase the chance of oxygen binding to the hemoglobin. Once one oxygen has binded to the hemoglobin, the affinity for oxygen increases in its subunits. This occurs in the lungs, where the concentration of oxygen is very high. On the other hand, in the tissues where oxygen is needed, the partial pressure of oxygen is low which will lead to oxygen being released from the hemoglobin. Leading to the hemoglobin going inte T-state which facilitates oxygen release.
291 2024-05-15 16 cellmembran Det finns tre olika typer av integrala cellmembranproteiner. Vilka? Beskriv kortfattat hur de är uppbyggda. (4p) Det finns tre olika typer av integrala cellmembranproteiner. Vilka? Beskriv kortfattat hur de är uppbyggda. (4p) Alfa-helixar, dessa är vanliga alfahelixar som bildar en tunnel då hydrofob R-grupp är riktad utåt. Beta barrels, flera stycken antiparallella Beta flak som bildar en stor tunnel, likt en tunna. Därifrån namnet. Partiellt integrerade, dessa är alfahelixar som sitter bland de hydrofoba svansarna i membranet och sticker ut från membranet. Kan finnas på båda sidorna av membranet.
292 2024-05-15 22 glykolysen Vilka två av nedanstående molekyler är mest reducerade? (2p) A: pyruvat B: glyceraldehyd 3-fosfat C: fruktos 6-fosfat D: citrat Vilka två av nedanstående molekyler är mest reducerade? (2p) A: pyruvat B: glyceraldehyd 3-fosfat C: fruktos 6-fosfat D: citrat B & C
293 2024-05-15 32 pentosfosfatvägen Vilken molekyl utgör substratet som går in i pentosfosfatvägens oxidativa fas och vilka tre olika slutprodukter bildas i denna fas? (2p) Max 20 ord. Vilken molekyl utgör substratet som går in i pentosfosfatvägens oxidativa fas och vilka tre olika slutprodukter bildas i denna fas? (2p) Max 20 ord. 1.5 av 2: Glukos-6-fosfat går in i pentosfosfatvägen. I den oxidativa fasen bildas NADPH, Ribulose-5-fosfat och Ribos-5-fosfat.
294 2024-05-15 26 citronsyracykeln Vilka två av nedanstående enzymer katalyserar en reaktion där det sker en dekarboxylering? (2p) A: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas B: Alfaketoglutaratdehydrogenas C: Pyruvatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas Vilka två av nedanstående enzymer katalyserar en reaktion där det sker en dekarboxylering? (2p) A: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas B: Alfaketoglutaratdehydrogenas C: Pyruvatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas B och C
295 2024-05-15 12 kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Lac-operonet kodar för genprodukter som behövs för att bryta ner laktos. Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Allolaktos bildas av laktos och binder till CAP. B: cAMP bildas i frånvaro av glukos och binder till CAP. C: cAMP bildas i närvaro av glukos och binder till CAP. D: Allolaktos bildas av laktos och binder till lac-repressorn. Lac-operonet kodar för genprodukter som behövs för att bryta ner laktos. Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Allolaktos bildas av laktos och binder till CAP. B: cAMP bildas i frånvaro av glukos och binder till CAP. C: cAMP bildas i närvaro av glukos och binder till CAP. D: Allolaktos bildas av laktos och binder till lac-repressorn. B och D
296 2024-05-15 36 rekombinant-dna-teknik I vilken ordning genomförs stegen nedan när en gen ska amplifieras med rekombinant DNA-teknologi? (2p) amplifiering gelelektrofores plasmidrening transformation I vilken ordning genomförs stegen nedan när en gen ska amplifieras med rekombinant DNA-teknologi? (2p) amplifiering gelelektrofores plasmidrening transformation 1. transformation 2. amplifiering 3. plasmidrening 4. gelelektrofores
297 2024-05-15 27 elektrontransportkedjan I elektrontransportkedjan förflyttas elektroner mellan olika komponenter. Redogör för två förutsättningar för att förflyttningen ska fungera. (4p) (Max 80 ord.) I elektrontransportkedjan förflyttas elektroner mellan olika komponenter. Redogör för två förutsättningar för att förflyttningen ska fungera. (4p) (Max 80 ord.) Redoxpotentialen måste vara högre hos den som tar emot elektronen. Tex när FMNH2 lämnar över elektronerna till Q. Det fungerar då Q har en högre redoxpotential än FMNH2. Det är viktigt att påpeka att de olika komponenterna måste vara tillräckligt nära varandra också för att plocka upp elektronerna. Det måste också finnas en molekyl som tillslut plockar upp elektronerna, denna är O2. Syre kommet plocka upp elektronerna och reagera med protoner för att bilda vatten.
298 2024-05-15 13 kromatin Beskriv nukleosomens (Nucleosome core particle) uppbyggnad. Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade. (4p) Beskriv nukleosomens (Nucleosome core particle) uppbyggnad. Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade. (4p) Nukleosomen består av en kärna (en oktamer) på 8 histoner (2st H2A, 2st H2B, 2st H3, 2st H4). Den har också 146 baspar DNA som är lindat 1,75 varv runt oktameren. Dessutom ligger histonen H1 (som inte är lika konserverad som övriga ovannämda histoner) utanpå kärnan och binder till linker DNA (DNAt mellan nukelosomerna) och stabiliserar nukleosomen. H3 och H4 har även N-terminala svansar som ligger runt DNAt som är lindat runt oktameren och reglerar DNAts packning till nukleosomkärnan.
299 2024-05-15 17 transport-över-cellmembran Proteinet på bilden utför transport. ![[Pasted image 20251129235458.png]] A) Ange vilken grupp av transportörer proteinet tillhör och vad som karaktäriserar denna grupp av transportörer? B) I vilket av cellens membran finns transportören? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord. Proteinet på bilden utför transport. ![[Pasted image 20251129235458.png]] A) Ange vilken grupp av transportörer proteinet tillhör och vad som karaktäriserar denna grupp av transportörer? B) I vilket av cellens membran finns transportören? C) Vad driver transporten? (4p) Max 40 ord. A) Antiport som är en aktiv transportör av 2 olika föreningar som transporteras åt olika håll (en in och en ut) B) I mitokondriets inre membran C) Den elektrokemiska gradienten av vätejoner mellan MMU och matrix.
300 2024-05-15 23 glukosmetabolism En morgon när du var sen blev du tvungen att springa för att hinna med spårvagnen. Efter ett tag smärtade lårmusklerna och kort därefter blev de stumma. Förklara vad som har hänt metaboliskt på molekylär nivå och varför det har inträffat. (4p) (Max 100 ord.) En morgon när du var sen blev du tvungen att springa för att hinna med spårvagnen. Efter ett tag smärtade lårmusklerna och kort därefter blev de stumma. Förklara vad som har hänt metaboliskt på molekylär nivå och varför det har inträffat. (4p) (Max 100 ord.) Det har skett då man har sprungit, en snabb explosiv aktivitet, så har lite syre blivit upptagit. Detta har lett till att glykolysen som skett i musklerna har skett i anaeroba förhållanden. Detta har lett till att pyruvat som är slutprodukten i glykolysen, har reagerat med NADH (som behöver släppa av elektronerna till syret i elektrontransportkedjan vid aeroba förhållanden) som bildats tidigare i processen, katalyserat av laktatdehydrogenas för att bilda laktat, så NAD+ kan återbildas. Laktat i sin tur har sänkt pH:t i musklerna vilket har lett till smärtan. Laktatet kommer sedan transporteras till levern för att omvandlas till glukos.
301 2024-05-15 33 heme Beskriv schematiskt hur nedbrytningen och utsöndringen av heme går till, samt ange i vilka organ/vävnader de olika stegen sker. (4p) Beskriv schematiskt hur nedbrytningen och utsöndringen av heme går till, samt ange i vilka organ/vävnader de olika stegen sker. (4p) Erytrocyter bryts ned i mjälten. Från erytrocyterna kommer hemoglobin att frisläppas. Hemoglobinet bryts ned till fria aminosyror och heme. Heme kommer att brytas ned till biliverdin som kommer att omvandlas till bilirubin. Bilirubin är okonjugerat dvs fettlöslig och ej vattenlöslig, därför kommer det transporteras till levern med hjälp av albumin. I levern kommer bilirubin att konjugera genom att bindas med gluturonsyra vilket kommer att göra den amfipatisk och vattenlöslig. Det konjugerade bilirubinet kommer sedan utsöndras från levern med gallan till tarmarna. Där det sedan kan utsöndras genom avföring.
302 2024-05-15 24 glukoneogenes Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter: fosfoenolpyruvat laktat oxalacetat succinat Vägar: citronsyracykeln Coricykeln glukoneogenes glykolysen Para ihop nedanstående metaboliter med en metabol väg där de ingår. Varje metabolit får enbart användas en gång. (2p) Metaboliter: fosfoenolpyruvat laktat oxalacetat succinat Vägar: citronsyracykeln Coricykeln glukoneogenes glykolysen fosfoenolpyruvat: glykolysen laktat: Coricykeln oxalacetat: glukoneogenes succinat: citronsyracykeln
303 2024-05-15 10 nukleotider Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en Watson–Crick helix. Vilka två påståenden är korrekta? (2p) A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning från 5´ till 3´. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är högervriden. Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en Watson–Crick helix. Vilka två påståenden är korrekta? (2p) A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning från 5´ till 3´. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är högervriden. C och D
304 2024-05-15 9 dna-replikation Initiering av eukaryot DNA-replikation är en noggrant reglerad process. A) I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin. B) I vilken fas av cellcykeln binder Cdc45 och GINS till MCM-helikaset? C) Vad heter det proteinkomplex som är bundet till replikationsorigin under hela cellcykeln? D) Vad gör CMG-helikaset när DNA-replikationen skall initieras? (4p) (Max 15 ord.) Initiering av eukaryot DNA-replikation är en noggrant reglerad process. A) I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin. B) I vilken fas av cellcykeln binder Cdc45 och GINS till MCM-helikaset? C) Vad heter det proteinkomplex som är bundet till replikationsorigin under hela cellcykeln? D) Vad gör CMG-helikaset när DNA-replikationen skall initieras? (4p) (Max 15 ord.) A) G-fasen. B) S1-fasen. C) ORC, origin recognition complex. D) Smälter DNA-strängarna, dvs separerar dem.
305 2024-05-15 34 kolesterol Vilka två av följande påståenden stämmer för kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? (2p) A: Kolesterol kan vid svält brytas ned till acetyl-CoA, som kan gå in i citronsyra-cykeln. B: En korrekt kolesterolkoncentration i cellens membran är viktig, då kolesterolkoncentrationen avgör membranets stelhet. C: Kolesterol och 7-dehydrokolesterol utgör utgångsmaterialet för syntes av steroidhormoner respektive D-vitamin. D: Kolesterol kan hos de flesta däggdjur (inklusive människa) endast syntetiseras i leverns celler (hepatocyter). Vilka två av följande påståenden stämmer för kolesterolets omsättning och funktion i kroppen? (2p) A: Kolesterol kan vid svält brytas ned till acetyl-CoA, som kan gå in i citronsyra-cykeln. B: En korrekt kolesterolkoncentration i cellens membran är viktig, då kolesterolkoncentrationen avgör membranets stelhet. C: Kolesterol och 7-dehydrokolesterol utgör utgångsmaterialet för syntes av steroidhormoner respektive D-vitamin. D: Kolesterol kan hos de flesta däggdjur (inklusive människa) endast syntetiseras i leverns celler (hepatocyter). B och C
306 2024-05-15 14 translation Vilken roll har fMet (N-formylmetionin) i initiering av translation? Beskriv kortfattat translationens initieringsprocess där fMet används. (4p) (Max 150 ord.) Vilken roll har fMet (N-formylmetionin) i initiering av translation? Beskriv kortfattat translationens initieringsprocess där fMet används. (4p) (Max 150 ord.) fMet finns enbart i prokaryoter. I eukaryota celler används istället Met. I prokaryot translation så initieras den genom att IF1 hittar en Shine-Delgarno sekvens, där binder sedan den lila ribosomala enheten in och letar tills ett AUG (startkodon) hittas. Denna startkodon kodar för aminosyran fMet som kommer bindas in då den sitter bundet till en tRNA-molekyl. tRNA:t binds in med hjälp av IF2 och sedan kommer den stora ribosomala enheten att binda in med hjälp av GTP. Alltså är fMet den första aminosyran som binder in, till startkodonet, i prokaryot translation.
307 2024-05-15 20 termodynamik Om ∆G°´ för reaktionen A → B är -40 kJ/mol under standardförhållanden så… (2p) Välj de två korrekta alternativen: A: kommer den att fortsätta i snabb takt. B: är den långt ifrån jämvikt. C: kommer den att gå från vänster till höger spontant. D: kommer den aldrig att nå jämvikt. Om ∆G°´ för reaktionen A → B är -40 kJ/mol under standardförhållanden så… (2p) Välj de två korrekta alternativen: A: kommer den att fortsätta i snabb takt. B: är den långt ifrån jämvikt. C: kommer den att gå från vänster till höger spontant. D: kommer den aldrig att nå jämvikt. B och C
308 2024-05-15 30 nukleotidnedbrytning Allopurinol är en så kallad hypoxantinanalog som inhiberar nedbrytning av purin-nukleotider till urat. Vilket enzym hämmar denna läkemedelssubstans och vid vilken sjukdom används allopurinol som läkemedel? (2p) (Max 20 ord.) Allopurinol är en så kallad hypoxantinanalog som inhiberar nedbrytning av purin-nukleotider till urat. Vilket enzym hämmar denna läkemedelssubstans och vid vilken sjukdom används allopurinol som läkemedel? (2p) (Max 20 ord.) Allopurinol hämmar enzymet xantinoxidas. Detta används vid sjukdomen gikt som beror på ökad uratnivå i kroppen.
309 2024-05-15 15 evolution Vilka är det två viktigaste principerna bakom evolutionen? Beskriv med ett valfritt exempel hur dessa två principer är viktiga för att möjliggöra uppkomsten av nya arter/fenotyper/funktioner. (4p) (Max 150 ord.) Vilka är det två viktigaste principerna bakom evolutionen? Beskriv med ett valfritt exempel hur dessa två principer är viktiga för att möjliggöra uppkomsten av nya arter/fenotyper/funktioner. (4p) (Max 150 ord.) Variation: Att det ska finnas ett brett urval av olika gener i en population. Detta stora urvalet leder till att olika individer inom samma art är olika bra anpassade. Tex om en individ från en art som i vanliga fall bara klarar varmare områden, får en gen som leder till att den klarar av kyla bättre, då kommer denna individ kunna migrera till kallare områden, eller överleva ifall kallare tider kommer. Detta gör att två individer från samma art kan utvecklas iväg från varandra, en i det varmare och en i det kallare. Naturligt urval/Survival of the fittest: Den säger att den som är best anpassad överlever. Samma exempel. Ifall en längre isperiod skulle börja så kommer de som har bäst kan anpassa sig, tex som att de kan växa extra mycket päls för att hålla inne värmen, kommer överleva medan de som ej kan anpassa sig kommer dö.
310 2024-05-15 21 enzymer Förklara vad ett kinas gör. (2p) (Max 20 ord.) Förklara vad ett kinas gör. (2p) (Max 20 ord.) Ett kinas katalyserar en reaktion där en fosfatgrupp sätts på ett substrat. Tex hexokinas som sätter på fosfat på glukos.
311 2024-05-15 31 aminosyrametabolism Till vilka aminosyror kan nedanstående två alfa-ketosyror omvandlas i ett steg via transamineringsreaktioner? Ange även det fullständiga namnet på enzymet som katalyserar bildningen av respektive aminosyra. A) pyruvat B) oxalacetat (4p) (Max 20 ord.) Till vilka aminosyror kan nedanstående två alfa-ketosyror omvandlas i ett steg via transamineringsreaktioner? Ange även det fullständiga namnet på enzymet som katalyserar bildningen av respektive aminosyra. A) pyruvat B) oxalacetat (4p) (Max 20 ord.) A) Pyruvat kan omvandlas till alanin mha enzymet alaninaminotransferas. B) Oxalacetat kan omvandlas till aspartat mha enzymet aspartataminotransferas.
312 2024-05-15 25 integrering-av-metabolismen Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. En typ av reglering av komplexet sker via fosforylering. A) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? B) Vad händer med komplexets aktivitet när det fosforyleras? C) Redogör för hur energikvoten påverkar fosforyleringen av komplexet. (4p) (Max 100 ord) Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och är därmed reglerat på flera nivåer. En typ av reglering av komplexet sker via fosforylering. A) Varför är det viktigt att komplexet är reglerat? B) Vad händer med komplexets aktivitet när det fosforyleras? C) Redogör för hur energikvoten påverkar fosforyleringen av komplexet. (4p) (Max 100 ord) A) PDH-komplexet katalyserar omvandlingen av pyruvat till Acetyl-CoA, detta är mellansteget mellan glykolys och citronsyracykeln. Det är viktigt det regleras så rätt mängd energi utvinns. Så att vi inte genererar ATP när vi ej behöver, tillexempel glukoneogenesen behövs sättas igång så vi kan omvandla pyruvat till glukos eller så att det istället lagras i kroppen. B) Komplexet kommer inhiberas vid fosforylering. C) Ifall energikvoten är hög, dvs mycket ATP finns kommer det att kunna hämma komplexet då fosforyleringen av komplexet kräver ATP. Då en fosfatgrupp kommer sättas på komplexet. Ifall hög mängd ADP finns kommer det ej att fosforylera komplexet.
313 2024-05-15 11 rna-syntes Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription samverkar flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två påståenden om denna process stämmer? (2p) A: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikasaktivitet. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TBP ingår som en subenhet i det större TFIIF-komplexet. D: TBP binder till TATA-boxen. Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription samverkar flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två påståenden om denna process stämmer? (2p) A: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikasaktivitet. B: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. C: TBP ingår som en subenhet i det större TFIIF-komplexet. D: TBP binder till TATA-boxen. A och D
314 2024-05-15 8 nukleotider Nukleotider bygger upp RNA och DNA. A) Vilken kemisk grupp finns i 2’-positionen hos ribonukleotider? B) I vilken position på sockret sitter kvävebasen? C) I vilken position på sockret sitter fosfatgruppen? D) Vad är dGDP förkortning för? (4p) Nukleotider bygger upp RNA och DNA. A) Vilken kemisk grupp finns i 2’-positionen hos ribonukleotider? B) I vilken position på sockret sitter kvävebasen? C) I vilken position på sockret sitter fosfatgruppen? D) Vad är dGDP förkortning för? (4p) A) Hydroxylgrupp (OH-grupp) B) På 1'-kolet C) På 5'-kolet D) Deoxyguanosin 5'-difosfat
315 2024-05-15 35 introduktionslaboration Du befinner dig i labsalen när det plötsligt börjar brinna i en bägare med etanol. Efter att ha uppmärksammat de övriga i labbet på branden och konstaterat att den är begränsad bestämmer du dig för att släcka den. På labbet hittar du brandsläckare för bränder av klass A–C. A) Vad avses med bränder klass A, B och C? B) Förklara vilken klass av brand som har uppstått. (4p) Max 80 ord. Du befinner dig i labsalen när det plötsligt börjar brinna i en bägare med etanol. Efter att ha uppmärksammat de övriga i labbet på branden och konstaterat att den är begränsad bestämmer du dig för att släcka den. På labbet hittar du brandsläckare för bränder av klass A–C. A) Vad avses med bränder klass A, B och C? B) Förklara vilken klass av brand som har uppstått. (4p) Max 80 ord. 3 av 4: A= brand i textilier/trä B=brand i vätskor/alkoholer C=brand i gaser Det är en typ B brand som uppstått då etanol är en alkohol.
316 2024-05-15 3 från-aminosyror-till-proteiner Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för proteiners sekundärstruktur? (2p) A: En dubbelhelix är en av de två vanligaste formerna. B: Identiska aminosyrasekvenser kan ha olika sekundärstruktur i olika proteiner. C: Den stabiliseras av vätebindningar mellan aminosyrornas R-grupper. D: Olika sekundärstrukturdelar hos ett protein kan bindas samman med loopar. Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för proteiners sekundärstruktur? (2p) A: En dubbelhelix är en av de två vanligaste formerna. B: Identiska aminosyrasekvenser kan ha olika sekundärstruktur i olika proteiner. C: Den stabiliseras av vätebindningar mellan aminosyrornas R-grupper. D: Olika sekundärstrukturdelar hos ett protein kan bindas samman med loopar. (svar angivet i flervalsformulär) Totalpoäng: 2
317 2024-05-15 7 kolhydrater Laktosintolerans och galaktosemi: ge ett exempel på vad som är gemensamt för dessa tillstånd och ett exempel på vad som skiljer dem åt. (4p) (Max 200 ord.) Laktosintolerans och galaktosemi: ge ett exempel på vad som är gemensamt för dessa tillstånd och ett exempel på vad som skiljer dem åt. (4p) (Max 200 ord.) Gemensamt: Båda två sjukdomar beror på brist på funktion eller brist på respektive enzym som bryter ned laktos respektive galaktos. Skillnad: Laktosintolerans är brist på enzymet laktas som bryter ned laktos till galaktos och glukos, det leder till att kroppen ej bryter ned laktos i GI-kanalen, detta leder till att laktos kommer hamna i tarmarna där det kan jäsa vilket leder till magsmärtor, diarré och gasbildning. Galaktosemi beror på bristande funktion eller brist på enzymerna (en av dem är GALT) som omvandlar galaktos till glukos. Galaktos kan ta upp av tarmcellerna tillskillnad från laktos. Detta leder till ökad nivå av galaktos i plasman, galaktos blir till galaktilol som är ett toxiskt ämne. Detta kan leda till neurologisk skador och i värsta fall död. Alltså är skillnaden vart de kommer ansamlas och påverkan på kroppen.
318 2024-05-15 6 lipider Du är läkare på en vårdcentral och en patient har frågor om de prover som du just ordinerat i en ”lipidstatus”. Du tar hjälp av en ritning du lärde dig göra när du läste biokemi under din grundutbildning för att börja svara på frågan. A) Rita den principiella strukturen för den molekyl som framför allt används för att lagra energi i kroppen. B) Vilken sorts lipoprotein skickar levern ut i blodet för att transportera energilagringsmolekylen till resten av kroppens celler? 1 ord räcker som svar. (4p) Du är läkare på en vårdcentral och en patient har frågor om de prover som du just ordinerat i en ”lipidstatus”. Du tar hjälp av en ritning du lärde dig göra när du läste biokemi under din grundutbildning för att börja svara på frågan. A) Rita den principiella strukturen för den molekyl som framför allt används för att lagra energi i kroppen. B) Vilken sorts lipoprotein skickar levern ut i blodet för att transportera energilagringsmolekylen till resten av kroppens celler? 1 ord räcker som svar. (4p) A) Triacylglycerol (TAG). B) VLDL. ![[Pasted image 20251129235437.png]] (Ritning på TAG-struktur finns på sida 11 i original-PDF.)
319 2024-05-15 2 från-aminosyror-till-proteiner På bilden visas en tripeptid. ![[Pasted image 20251129235411.png]] A) Ange vilken aminosyra som finns på C-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. B) Ange vilken aminosyra som finns på N-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. (4p) (Max 25 ord.) På bilden visas en tripeptid. ![[Pasted image 20251129235411.png]] A) Ange vilken aminosyra som finns på C-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. B) Ange vilken aminosyra som finns på N-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har. (4p) (Max 25 ord.) A) Asparginsyra, en syra. Kan binda mha elektrostatiska interaktioner då den är negativt laddad. B) Glycin, en alifatisk aminosyra. Opolär.
320 2022-12-19 28 elektrontransportkedjan I elektrontransportkedjan pumpas protoner när elektroner förflyttas mellan olika komponenter. A) Var i elektrontransportkedjan pumpas protoner? B) Vilken är drivkraften bakom protonpumpningen? Max 50 ord. I elektrontransportkedjan pumpas protoner när elektroner förflyttas mellan olika komponenter. A) Var i elektrontransportkedjan pumpas protoner? B) Vilken är drivkraften bakom protonpumpningen? Max 50 ord. A) I komplex I, III och IV B) I elektrontransportkedjans komplex flyttas elektroner från komponenter med lägre redoxpotential till komponenter med högre. Detta är en energimässigt gynnsam process och energin kan då utnyttjas för att pumpa protoner från matrix till mellanmembransutrymmet mot gradienten. Energin omvandlas då till elektrokemisk energi.
321 2022-12-19 5 utforska-proteiner Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att köra affinitetskromatografi med en 6xHis-tag. A) Beskriv kortfattat principen för affinitetskromatografi. B) Hur kan man eluera proteinet? C) Ange en metod som kan användas för analys av det eluerade proteinet. Max 200 ord. Du jobbar på labb över sommaren och har fått i uppgift att köra affinitetskromatografi med en 6xHis-tag. A) Beskriv kortfattat principen för affinitetskromatografi. B) Hur kan man eluera proteinet? C) Ange en metod som kan användas för analys av det eluerade proteinet. Max 200 ord. A) Affinitetskromatografi är en kromatografimetod som bygger på att separera proteiner baserat på en viss egeskap. Exempelvis kan glykosylerade proteiner separeras ut genom att kulorna i kolonnen har molekyler som binder till sockerenheterna. Man kan även, som i detta fall, modifiera DNA-sekvensen för proteinet man är ute efter genom att lägga till en tag av histidin vilken binder väl till nickeljoner på kulorna. B) För att få proteinet att lossna från kulorna krävs att man eluerar. Det kan ske med hjälp av en stark buffert eller saltlösning, ofta en kombination av båda. C) Gelelektrofores, SDS-PAGE, kan användas för att analysera proteinets storlek samt hur väl proteinreningen lyckats.
322 2022-12-19 18 termodynamik Diffusion är en viktig process för att fördela molekyler i gaser och vätskor. Vad beror den på och vilken termodynamisk drivkraft finns bakom den? Diffusion är en viktig process för att fördela molekyler i gaser och vätskor. Vad beror den på och vilken termodynamisk drivkraft finns bakom den? 1.5p Diffusion beror på att det finns många fler sätt för ett ämne i en vätska eller gas att vara oordnat än ordnat, alltså är sannolikheten för ett oordnat tillstånd större och molekylerna kommer då till följd av sin konstanta rörelse att hamna i ett oordnat tillstånd. Den termodynamiska drivkraften bakom diffusion är således termodynamikens andra lag, att ett system tenderar att gå mot mer oordnade tillstånd, alltså att entropin ökar. 2.0p Brownsk rörelse (stavning?) innebär att en liten molekyl har större sannolikhet att inte stöta på något (annan molekyl) på ena sidan än andra. Det leder till att molekyler rör sig mot där det är mindre molekyl-tätt, och således sprids ämnet jämt. Ämnet vill fördela sig, eftersom att ha det ordnat = låg entropi => ofördelaktigt (om molekylen är löslig i sin omgiving, om olja i vatten är det mer fördelaktigt att oljan är samlad i en stor klump)
323 2022-12-19 1 kemiska-bindingar Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. Jon Peptid van der Waals Väte Rangordna nedanstående bindningstyper från den svagaste till den starkaste. Jon Peptid van der Waals Väte 1. van der Waals 2. Väte 3. Jon 4. Peptid
324 2022-12-19 19 enzymer Vilka påståenden om övergångstillståndet för en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det har högre energi än för en icke-katalyserad reaktion. B: Det har lägre energi än reaktionens substrat. C: Det är mycket kortvarigt. D: Det har lägre energi än för en icke-katalyserad reaktion. Vilka påståenden om övergångstillståndet för en enzym-katalyserad reaktion stämmer? A: Det har högre energi än för en icke-katalyserad reaktion. B: Det har lägre energi än reaktionens substrat. C: Det är mycket kortvarigt. D: Det har lägre energi än för en icke-katalyserad reaktion. Rätt svar 1. C 2. D
325 2022-12-19 29 integrering-av-metabolismen I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzym i den processen? alfaketoglutaratdehydrogenas glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas malatdehydrogenas pyruvatdehydrogenas I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullständigt. I vilken ordning kommer följande enzym i den processen? alfaketoglutaratdehydrogenas glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas malatdehydrogenas pyruvatdehydrogenas 1. glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas 2. pyruvatdehydrogenas 3. alfaketoglutaratdehydrogenas 4. malatdehydrogenas
326 2022-12-19 4 hemoglobin Hemoglobin och myoglobin innehåller den prostetiska gruppen heme. Denna innehåller ett järn (Fe²⁺) som ansvarar för inbindningen av syremolekyler. Beskriv varför bindning till syre påverkar hemoglobinets struktur och hur det i sin tur påverkar hemoglobinets syreaffinitet. Max 70 ord. Hemoglobin och myoglobin innehåller den prostetiska gruppen heme. Denna innehåller ett järn (Fe²⁺) som ansvarar för inbindningen av syremolekyler. Beskriv varför bindning till syre påverkar hemoglobinets struktur och hur det i sin tur påverkar hemoglobinets syreaffinitet. Max 70 ord. Järnatomens storlek gör att den inte får plats i mitten av hemegruppen. När syre binder in blir järnets atommoln mindre och kan således flyttas upp 0,4 Å in i hemeplanet. Då kommer även det proximala histidinet kopplat till järnet att flyttas upp samt den alfahelix den är kopplad till. Det påverkar strukturen på hemoglobinet där subenheterna totalt kommer vridas upp 15 grader till R-state med ökad affinitet för syre.
327 2022-12-19 16 cellmembran Vilka påståenden om det eukaryota cellmembranet är korrekta? A: Fosfatidylserin finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. B: Kolesterol finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. C: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cellens utsida. D: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cytoplasman. Vilka påståenden om det eukaryota cellmembranet är korrekta? A: Fosfatidylserin finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. B: Kolesterol finns enbart i det inre skiktet av cellmembranet. C: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cellens utsida. D: Cellmembranets kolhydrater är riktade mot cytoplasman. Rätt svar 1. A 2. C
328 2022-12-19 22 enzymer Ett enzym uppvisar Michaelis–Menten-kinetik. Behöver du känna till den totala enzymkoncentrationen för att bestämma konstanterna (i) Kₘ, (ii) Vmax eller (iii) kcat? Motivera ditt svar. ![[Pasted image 20251128085625.png]] Ett enzym uppvisar Michaelis–Menten-kinetik. Behöver du känna till den totala enzymkoncentrationen för att bestämma konstanterna (i) Kₘ, (ii) Vmax eller (iii) kcat? Motivera ditt svar. ![[Pasted image 20251128085625.png]] Vmax motsvarar den maximala reaktionshastighet som är möjlig för en enzymkatalyserad reaktion och uppnås då alla enzym är bundna i enzym-substratkomplex. Vmax beror alltså av enzymkoncentratonen. Kₘ motsvarar den substratkoncentration då V = Vmax/2, alltså när hälften av enzymen har bundit substratet och är upptagna med katalys. Kₘ och Vmax kan bestämmas experimentellt för en reaktion genom att mäta den initiella reaktionshastigheten för varierande substratkoncentrationer men med samma enzymkoncentration. Värdena förs in i ett diagram där reaktionshastigheten blir en funktion av substratkoncentrationen (se nedan). När substratkoncentrationen går mot oändligheten kommer då V gå mot Vmax och man kan då matematiskt bestämma Vmax utan att känna till den exakta enzymkoncentrationen. Kₘ kan sedan bestämmas utifrån vid vilken substratkoncentration som V = Vmax/2. kcat är ett mått på hur många molekyler produkt som bildas per sekund och enzym, turnover number, och räknas således fram ur den maximala reaktionshastigheten dividerat med den totala enzymkoncentrationen. För att bestämma kcat krävs alltså att känna till den maximala enzymkoncentrationen.
329 2022-12-19 32 pentosfosfatvägen Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? A: Den huvudsakliga regleringspunkten i pentosfosfatvägen är enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas. B: Ribulos-5-fosfat kan omvandlas till glukos-6-fosfat i den reversibla oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. C: NADPH är ett mycket viktigt oxidationsmedel i celler. D: Nedsatt funktion i pentosfosfatvägen kan orsaka hemolytisk anemi. Rätt svar Vilka två av följande påståenden relaterade till pentosfosfatvägen är korrekta? A: Den huvudsakliga regleringspunkten i pentosfosfatvägen är enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas. B: Ribulos-5-fosfat kan omvandlas till glukos-6-fosfat i den reversibla oxidativa fasen av pentosfosfatvägen. C: NADPH är ett mycket viktigt oxidationsmedel i celler. D: Nedsatt funktion i pentosfosfatvägen kan orsaka hemolytisk anemi. Rätt svar A och D
330 2022-12-19 26 glykogen A) Vilka två enzymer hjälps åt att återuppbygga en delvis nedbruten glykogenpartikel genom att addera nya glukosenheter till strukturen? B) Vilken typ av bindning skapar respektive enzym? A) Vilka två enzymer hjälps åt att återuppbygga en delvis nedbruten glykogenpartikel genom att addera nya glukosenheter till strukturen? B) Vilken typ av bindning skapar respektive enzym? A) En delvis nedbruten glykogenpartikel har redan en primer i form av glykogenin, alltså behöver bara kedjorna elongeras och förgreningar bildas. Glykogensyntas kommer att förlänga kedjorna genom att addera glukosenheter medan branching enzyme kommer skapa förgreningar genom att flytta 7 glukosenheter. B) Glykogensyntas – alfa 1–4 glykosidbindning Branching enzyme – alfa 1–6 glykosidbindning
331 2022-12-19 12 rna-syntes Vilka två av följande alternativ beskriver funktioner för poly-A-svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? A: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Stimulerar translation. D: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid. Vilka två av följande alternativ beskriver funktioner för poly-A-svansen i 3'-änden på eukaryot mRNA? A: Stimulerar transport av mRNA in till cellkärnan. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Stimulerar translation. D: Reglerar mRNA-molekylens halveringstid. Rätt svar 1. C 2. D
332 2022-12-19 27 citronsyracykeln A) Vilka molekyler av betydelse för energiomvandling bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Varför är citronsyracykeln inte aktiv i frånvaro av syre? Max 50 ord. A) Vilka molekyler av betydelse för energiomvandling bildas i ett varv i citronsyracykeln? B) Varför är citronsyracykeln inte aktiv i frånvaro av syre? Max 50 ord. A) 3 NADH och 1 FADH₂ B) För att citronsyracykeln ska ske krävs att det finns mitokondriellt NAD⁺ och FAD. Utan syre avstannar elektrontransportkedjan då syre behövs i komplex IV och därmed kan inte NADH och FADH₂ oxideras vilket är det enda sättet att återbilda NAD⁺ och FAD i mitokondriens matrix.
333 2022-12-19 13 rna-syntes Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingår flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka två av följande påståenden är korrekta? A: TBP binder till TATA-boxen. B: TFIIF är den första faktor som binder till promotorn. C: TFIIB fosforylerar den C-terminala domänen (CTD) på RNA polymeras II. D: TFIIH kan smälta dubbelsträngat DNA med sin helikas-aktivitet. Rätt svar 1. A 2. D
334 2022-12-19 17 transport-över-cellmembran Proteinet på bilden förflyttas till plasmamembranet hos skelettmuskler som ett svar på insulinsignalering. A) Vilken är transportören? B) Vilken typ av transport sker? C) Vad händer med glukos när den kommit in i cellen och varför? Max 50 ord. ![[Pasted image 20251128085555.png]] Proteinet på bilden förflyttas till plasmamembranet hos skelettmuskler som ett svar på insulinsignalering. A) Vilken är transportören? B) Vilken typ av transport sker? C) Vad händer med glukos när den kommit in i cellen och varför? Max 50 ord. ![[Pasted image 20251128085555.png]] A) GLUT-4 B) Faciliterad diffusion C) Den kommer genom enzymet Hexokinas och förbrukning av 1 ATP bilda glukos 6-fosfat. Fosforyleringen gör att bärarproteinet inte längre känner igen glukosmolekylen och därmed kan den inte transporteras ut igen utan kommer, beroende på energikvoten, brytas ned i glykolysen eller användas för uppbyggnad av glykogen.
335 2022-12-19 23 integrering-av-metabolismen Vad har molekylerna NADH, ATP, CoA och FADH₂ gemensamt? A: De är kinetiskt stabila. B: De är kinetiskt instabila. C: De är termodynamiskt stabila. D: De är termodynamiskt instabila. Vad har molekylerna NADH, ATP, CoA och FADH₂ gemensamt? A: De är kinetiskt stabila. B: De är kinetiskt instabila. C: De är termodynamiskt stabila. D: De är termodynamiskt instabila. A och D
336 2022-12-19 33 kolesterol Vilka av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? A: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol till en fettsyra. B: Den regleras främst via tillgången på fritt extracellulärt kolesterol. C: Den regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet HMG-CoA-reduktas. D: Att bilda kolesterolestrar är i de flesta celler irreversibelt – för att återbildas till kolesterol behöver kolesterolestern först transporteras till levern via HDL. Rätt svar Vilka av följande påståenden är korrekta avseende reglering av den intracellulära kolesterolhalten? A: Cellen kan lagra kolesterol i form av kolesterol-estrar, dvs. genom att koppla kolesterol till en fettsyra. B: Den regleras främst via tillgången på fritt extracellulärt kolesterol. C: Den regleras främst via reglering av aktiviteten hos enzymet HMG-CoA-reduktas. D: Att bilda kolesterolestrar är i de flesta celler irreversibelt – för att återbildas till kolesterol behöver kolesterolestern först transporteras till levern via HDL. Rätt svar A och C
337 2022-12-19 24 glukosmetabolism Det pyruvat som bildas vid anaerob glykolys behöver metaboliseras vidare. A) Vad bildas av pyruvatet? B) Vilken är orsaken till det? C) Vilket enzym katalyserar reaktionen? Max 50 ord. Det pyruvat som bildas vid anaerob glykolys behöver metaboliseras vidare. A) Vad bildas av pyruvatet? B) Vilken är orsaken till det? C) Vilket enzym katalyserar reaktionen? Max 50 ord. A) Laktat B) Cellen behöver återbilda NAD⁺ i cytoplasman för att inte glykolysen ska avstanna då det krävs i steg 6. Vid anaerob glykolys sker detta genom fermentering där pyruvat reduceras till laktat och NADH oxideras till NAD⁺. C) Laktatdehydrogenas
338 2022-12-19 10 nukleotider Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en Watson–Crick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Helixen är högervriden. D: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'. Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en Watson–Crick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. B: Ett varv av DNA motsvarar ca. 7,4 bp. C: Helixen är högervriden. D: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'. Rätt svar 1. A 2. C
339 2022-12-19 9 dna-replikation A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Vilken form har denna faktor? A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln? B) Vilken form har denna faktor? A) PCNA, eller sliding clamp som den också kallas, har funktionen att den sitter runt en av DNA-strängarna under replikation och håller fast DNA-polymeras på strängen. Det gör att processiviteten ökar upp till 50 gånger jämfört med utan PCNA då DNA-polymeras kan syntetisera långa sträckor DNA utan att ramla av. B) Ringformad
340 2022-12-19 34 plasmid Beskriv vad som karaktäriserar plasmider med konformationen supercoiled respektive relaxerad cirkulär, hur de bildas och hur de kan skiljas åt med gelelektrofores. Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska i tabellform eller i fritext. Max 75 ord. Beskriv vad som karaktäriserar plasmider med konformationen supercoiled respektive relaxerad cirkulär, hur de bildas och hur de kan skiljas åt med gelelektrofores. Den här frågan kan besvaras på svenska eller engelska i tabellform eller i fritext. Max 75 ord. I supercoiled kommer DNAt i plasmiden vara överdrivet tvinnat, så kallat supercoiled med högre linkingnumber än normalt. Därmed kommer det bildas en linjär struktur. I relaxerad cirkulär är plasmiden istället ringformat. De två olika konformationerna kommer möta olika stort motstånd av gelen under gelelektrofores till följd av att de har olika form och de kan således separeras baserat på att de kommer färdas olika långt. ![[Pasted image 20251128085752.png]]
341 2022-12-19 14 translation Beskriv sekundärstrukturen hos molekylen som transporterar aminosyror till ribosomen och förklara vilken funktionen är för varje del av strukturen. Rita gärna. ![[Pasted image 20251128085533.png]] Beskriv sekundärstrukturen hos molekylen som transporterar aminosyror till ribosomen och förklara vilken funktionen är för varje del av strukturen. Rita gärna. ![[Pasted image 20251128085533.png]] Strukturen som transporterar aminosyror till ribosomen kallas tRNA och byggs upp av RNA. I 2D, sekundärstruktur, är tRNA klöverformad och stabiliseras av vätebindningar mellan komplementära baspar i RNA kedjan. Den nedersta loopen, Antikodon loopen, innehåller ett antikodon på tre baser som är komplementärt till kodonet på mRNA och därmed aggerar som mellanhand mellan kodon och aminosyra vilket möjliggör för den genetiska koden. De andra två looparna spelar roll för interaktioner med exempelvis aminoacyl-tRNA syntetaser som kopplar ihop rätt aminosyra med rätt tRNA. De bidrar alltså till identifiering av det specifika tRNA:t. 5'-änden av tRNA kedjan är fosforylerad och i 3'-änden sitter en CCA-sekvens, så kallad acceptor stem. Till den fria OH-gruppen på 3'-änden av adenosin i acceptor stem kopplas aminosyran av aminoacyl-tRNA syntetaser.
342 2022-12-19 20 heme Redogör för hur heme bryts ner och utsöndras. (2p) Redogör för hur heme bryts ner och utsöndras. (2p) Heme bryts ner i mjälten när röda blodkroppar bryts ner. Först bildas biliverdin som sedan omvandlas till bilirubin. Då bilirubin är en hydrofob molekyl kommer den att transporteras bunden till blodproteinet albumin via blodet till levern. I levern kommer bilirubinet konjugeras och då bli amfipatiskt för att sedan utsöndras via gallan.
343 2022-12-19 30 aminosyrametabolism Nämn två aminosyror som genom transaminering kan omvandlas till citronsyracykelintermediärer vilket gör dem till glukogena aminosyror. Ange även vilken citronsyracykelintermediär respektive aminosyra bildar. Nämn två aminosyror som genom transaminering kan omvandlas till citronsyracykelintermediärer vilket gör dem till glukogena aminosyror. Ange även vilken citronsyracykelintermediär respektive aminosyra bildar. Glutamat kan omvandlas till alfaketoglutarat Aspartat kan omvandlas till oxalacetat
344 2022-12-19 15 evolution Cancerceller utvecklas från normala celler. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till. Cancerceller utvecklas från normala celler. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till. 2.0p Evolution beror på variation och naturligt urval. Det sker mutationer "ofta", vilket ökar variationen inom en population. Många gånger är mutationen som uppstår sämre och försvinner. Ibland är en mutation bra och den blir selekterad (survival of the fittest) och lever kvar inom en population (evolution) Vid cancer så sker likaså mutationer, det kan vara mutationer som stör delningsprocessen i en cell (så att den ohämmat delar sig) eller mutationer som hämmar vårt immunsystem (vi kan ej bekämpa tumörer, p53). Cancerceller utvecklas alltså från våra egna celler (fast de är muterade och orsakar sjukdom). Cancerceller genomgår också mutationer. "Vanligt" är mutationer som stimulerar ohämmad delning och gör dem mer maligna. Cancerceller har en variation som gör dem "starka" och tar därför över i kroppen. 1.5p Evolutionen utgår från att det finns en genetisk variation och ett naturligt urval där de egenskaper som gynnar överlevnad i den aktuella miljön kommer föras vidare till nästa generation i större utsträckning. Genetisk variation uppnås bland annat genom slumpmässiga spontana mutationer i DNA. Mutationer kan då uppkomma i en cell som stänger av en tumörsupressorgen vilket då är "gynnsamt" för den individuella cellen som kan fortsätta dela sig. Andra mutationer kan då uppstå i en gen som kodar för reparation av DNA vilket möjliggör för ytterligare mutationer som aktiverar oncogener och stänger av andra tumörsupressorgener. Genom ett flertal steg där mutationer möjliggör för cellen att dela sig oftare och för fler mutationer att uppstå kan således en cancertumör utvecklas ur en normal cell.
345 2022-12-19 21 betaoxidation Vilka av följande är ketonkroppar? A: Acetoacetat B: Hydroxy-metyl-glutarat C: Aceton D: Beta-hydroxy-acetat Rätt svar Vilka av följande är ketonkroppar? A: Acetoacetat B: Hydroxy-metyl-glutarat C: Aceton D: Beta-hydroxy-acetat Rätt svar A och C
346 2022-12-19 31 nukleotidnedbrytning Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? A: Gikt är en sjukdom som kan orsakas av defekter i enzymerna som bryter ner pyrimidin-nukleotider. B: Urat är en molekyl med två ringstrukturer. C: Nukleotidaser omvandlar nukleotider till nukleosider. D: Vid nedbrytning av nukleotiden AMP kommer molekylens samtliga kväveatomer slutligen hamna i urea som utsöndras med urinen. Vilka två av följande påståenden relaterade till nukleotidnedbrytning är korrekta? A: Gikt är en sjukdom som kan orsakas av defekter i enzymerna som bryter ner pyrimidin-nukleotider. B: Urat är en molekyl med två ringstrukturer. C: Nukleotidaser omvandlar nukleotider till nukleosider. D: Vid nedbrytning av nukleotiden AMP kommer molekylens samtliga kväveatomer slutligen hamna i urea som utsöndras med urinen. Rätt svar 1. B 2. C
347 2022-12-19 25 glukosmetabolism Vilka faktorer är viktiga för regleringen av fosfofruktokinas 2/fruktos 2,6-bisfosfatas? A: Hormoner B: Cellens energikvot C: pH D: Fosforylering Vilka faktorer är viktiga för regleringen av fosfofruktokinas 2/fruktos 2,6-bisfosfatas? A: Hormoner B: Cellens energikvot C: pH D: Fosforylering Rätt svar 1. A 2. D
348 2022-12-19 11 rna-syntes A) Var återfinns alfa-amanitin i naturen? B) Vilket enzym inhiberar denna substans? A) Var återfinns alfa-amanitin i naturen? B) Vilket enzym inhiberar denna substans? A) I den lömska flugsvampen B) Substansen inhiberar RNA-polymeras II
349 2022-12-19 8 nukleotider A) Vilken kemisk grupp finns i 2’-positionen hos ribonukleotider? B) Vad är AMP förkortning för? A) Vilken kemisk grupp finns i 2’-positionen hos ribonukleotider? B) Vad är AMP förkortning för? A) Hydroxylgrupp (OH) B) Adenosinmonofosfat
350 2022-12-19 35 introduktionslaboration Du arbetar på en vårdcentral som specialistläkare. En försäljare från ett läkemedelsföretag är inbjuden för att presentera en ny medicin som påstås sänka kolesterolnivåerna i blodet med 30%. Vilka två 95%:iga konfidensintervall (CI95%) stöder detta påstående i minst utsträckning? A: 29,5% – 30,5% B: 27% – 33% C: 1% – 60% D: −10% – 70% Du arbetar på en vårdcentral som specialistläkare. En försäljare från ett läkemedelsföretag är inbjuden för att presentera en ny medicin som påstås sänka kolesterolnivåerna i blodet med 30%. Vilka två 95%:iga konfidensintervall (CI95%) stöder detta påstående i minst utsträckning? A: 29,5% – 30,5% B: 27% – 33% C: 1% – 60% D: −10% – 70% C och D
351 2022-12-19 3 från-aminosyror-till-proteiner Nyligen har det konstaterats att sjukdomen ALS (amyotrofisk lateral skleros) karaktäriseras av bildning av amyloider. Hur bildas de? Max 75 ord. Nyligen har det konstaterats att sjukdomen ALS (amyotrofisk lateral skleros) karaktäriseras av bildning av amyloider. Hur bildas de? Max 75 ord. Amyloider bildas då ett protein med alfahelixrik struktur övergår i en betaflaksrik struktur. Betaflaken kan sedan aggregeras och bilda långa fibrer, så kallade amyloider.
352 2022-12-19 7 kolhydrater Kolhydrater finns förutom i fri form även bundna till lipider och proteiner. Vilka är de två vanligaste typerna av bindningar mellan kolhydrater och proteiner? (2p) Kolhydrater finns förutom i fri form även bundna till lipider och proteiner. Vilka är de två vanligaste typerna av bindningar mellan kolhydrater och proteiner? (2p) O-link: kolhydraten binder till OH-gruppen i sidokedjan på serin eller treonin i proteinet. N-link: kolhydraten binder till aminogruppen i en asparaginrests sidokedja i proteinet.
353 2022-12-19 6 lipider Namnge och rita: A) Den principiella strukturen för lipiden som lagrar energi i adipocyter. B) Strukturen för den vanligaste membranlipiden. Namnge och rita: A) Den principiella strukturen för lipiden som lagrar energi i adipocyter. B) Strukturen för den vanligaste membranlipiden. Se 2022-12-19-0097-TUX för 2/2
354 2022-12-19 2 från-aminosyror-till-proteiner I metabolismen är det vanligt att enzymer regleras av cellens energikvot. A) Nämn två aminosyror som kan interagera med olika delar hos de molekyler som då fungerar som allosteriska regulatorer. B) Förklara vad som gör dessa aminosyror lämpliga för uppdraget. Max 75 ord. I metabolismen är det vanligt att enzymer regleras av cellens energikvot. A) Nämn två aminosyror som kan interagera med olika delar hos de molekyler som då fungerar som allosteriska regulatorer. B) Förklara vad som gör dessa aminosyror lämpliga för uppdraget. Max 75 ord. A) Negativt laddad – lysin Som kan bilda vätebindningar – Asparagin B) Vid allosterisk reglering av cellens energikvot kommer ATP respektive ADP/AMP binda in till enzymet. Fosfatgrupperna är negativt laddade vilket gör att de kan interaggera med positivt laddade sidokedjor som lysin genom jonbindningar. Kvävebasen adenin som är en del av molekylerna kommer innehålla kvävegrupper som kan bilda vätebindningar med en aminosyra som har karbonyl, hydroxyl- eller aminogrupper, som asparagin med både amino- och karbonylgrupp.
355 2023-05-15 28 elektrontransportkedjan Vad menas med respirationskontroll? (1p) Max 25 ord. Vad menas med respirationskontroll? (1p) Max 25 ord. Reglering av cellandningen, dvs bildningen av ATP genom oxidativ fosforylering. Drivs av elektrontransportkedjan och den elektrokemiska gradient som uppstår, och regleras av cellens energikvot.
356 2023-05-15 5 utforska-proteiner Du har fått i uppgift att göra en proteinrening med hjälp av gelfiltrering samt att analysera resultatet av denna. (2p) Max 200 ord. A) Beskriv metoden för gelfiltrering. B) Vilken egenskap hos proteinet bygger metoden på? Du har fått i uppgift att göra en proteinrening med hjälp av gelfiltrering samt att analysera resultatet av denna. (2p) Max 200 ord. A) Beskriv metoden för gelfiltrering. B) Vilken egenskap hos proteinet bygger metoden på? A) Gelfiltrering är en separationsmetod med avseende på storlek. Man preparerar en kolonn med "beads", dvs porösa gelékulor. Detta utgör den fasta fasen. Sedan tillsätts en lösning med det protein man vill separera ut, detta kallas för den mobila fasen. När den mobila fasen hälls till kolonnen kommer den att rinna igenom och elueras under kolonnen. Stora proteiner kommer att ta vägen förbi kulorna och därmed komma ut först. De små proteinerna kommer istället att gå igenom de porösa kulorna. Detta tar längre tid och de kommer därför komma ut sist. Resultatet blir en separation med avseende på storlek där störst går först. B) Separation med avseende på storlek, där störst går först.
357 2023-05-15 18 termodynamik A) Redogör kort för vikten av jämviktskonstanten för biokemiska reaktioner. B) Hur är jämviktskonstanten definierad? (2p) A) Redogör kort för vikten av jämviktskonstanten för biokemiska reaktioner. B) Hur är jämviktskonstanten definierad? (2p) A) Jämviktskonstanten K anger förhållandet mellan substrat/reaktant och produkt. Om K = 1 betyder det att systemet är i jämvikt, mängden reaktant är lika stor som mängden produkt. Om K > 1 finns mer produkt än reaktant. Om K < 1 finns mer reaktant än produkt. Detta kan visa åt vilket håll en reaktion är förskjuten, och visar förhållandet mellan olika ämnen i ett system. I cellen är ofta flera reaktioner kopplade eller sker som en kedjereaktion. Det innebär att det som är produkt i en reaktion går vidare och utgör reaktant i en annan reaktion. Detta dynamiska samspel gör att jämviktskonstanten hela tiden kommer att förändras och gå åt olika håll. Det är bra, vi vill inte ha jämvikt (K = 1) i cellerna eftersom det då inte finns några gradienter eller någon reaktionsbenägenhet, vilket skulle innebära att alla livsviktiga processer avstannar och vi skulle dö. B) K = [produkt]/[reaktant]
358 2023-05-15 1 från-aminosyror-till-proteiner Rita aminosyran serin, R = CH₂OH, i S-konfiguration vid: A) pH 2 B) pH 7 C) pH 12 (2p) Rita aminosyran serin, R = CH₂OH, i S-konfiguration vid: A) pH 2 B) pH 7 C) pH 12 (2p) 1.5 av 2 Svar (text + ritning på separat papper) A) Vid lågt pH finns mycket fria H⁺, aminogruppen kommer att vilja motverka pH-sänkningen och ta upp en H⁺ och får således en positiv laddning. B) Vid neutralt pH kommer aminosyran vara en zwitterjon, dvs ha både en positiv och en negativ laddning men ingen nettoladdning. C) Vid högt pH kommer karboxylgruppen vilja motverka detta genom att avge H⁺, därav kommer denna att få en negativ laddning. ![[Pasted image 20251129235001.png]]
359 2023-05-15 19 enzymer Ett enzym uppvisar Michaelis–Menten-kinetik. A) Hur kan man i ett V mot [S]-diagram avläsa de två konstanterna Kₘ och Vmax? B) Förklara vad som händer med Kₘ respektive Vmax om man tillsätter en kompetitiv hämmare. (2p) Ett enzym uppvisar Michaelis–Menten-kinetik. A) Hur kan man i ett V mot [S]-diagram avläsa de två konstanterna Kₘ och Vmax? B) Förklara vad som händer med Kₘ respektive Vmax om man tillsätter en kompetitiv hämmare. (2p) A) Om ett enzym uppvisar Michaelis–Menten-kinetik kommer vi i ett sådant diagram se en hyperbol kurva där reaktionshastigheten ökar och går mot den maximala reaktionshastigheten med ökningen av substratets koncentration. Varje reaktion har ett Vmax, det vill säga den maximala hastighet en reaktion kan nå då samtliga enzym är bundna till substratet. När kurvan planar ut är V nära Vmax och kommer mycket långsamt fortsätta gå mot Vmax med en ökande substratkoncentration. Kₘ är den substratkoncentration för vilken reaktionshastigheten uppnår 1/2 Vmax. Kₘ är alltså den punkt på kurvan där V når halva Vmax. B) En kompetitiv inhibitor kommer att binda till enzymets aktiva säte och hindra det tänkta substratet från att binda in. Det uppstår alltså konkurrens om att binda in till de enzym som finns. Detta innebär att enzymets affinitet för substratet minskar och det betyder att vi vid närvaro av inhibitorn kommer att få ett lägre Kₘ-värde än utan. Om substratet hinner binda enzymet innan inhibitorn gör det finns det inget som hindrar att den tänkta produkten bildas. Vmax kommer alltså inte att förändras, det kommer bara krävas en högre substratkoncentration för att lyckas konkurrera ut inhibitorn.
360 2023-05-15 29 aminosyrametabolism Från vilka alfa-ketosyror kan aminosyrorna nedan bildas med hjälp av två kliniskt viktiga enzymer tillhörande gruppen aminotransferaser? Ange också från vilken metabol väg respektive alfa-ketosyra hämtas. (2p) A) Alanin B) Aspartat Från vilka alfa-ketosyror kan aminosyrorna nedan bildas med hjälp av två kliniskt viktiga enzymer tillhörande gruppen aminotransferaser? Ange också från vilken metabol väg respektive alfa-ketosyra hämtas. (2p) A) Alanin B) Aspartat A) Pyruvat → Alanin. Sker med hjälp av ALAT (alaninaminotransferas). Alfaketosyran är pyruvat och hämtas från glykolysen. B) Oxaloacetat → Aspartat. Sker med hjälp av ASAT (aspartataminotransferas). Alfaketosyran är oxaloacetat och hämtas från citronsyracykeln.
361 2023-05-15 4 hemoglobin Nämn de allosteriska regulatorerna för hemoglobin och ange om de höjer eller sänker hemoglobinets syreaffinitet. (2p) Max 25 ord. Nämn de allosteriska regulatorerna för hemoglobin och ange om de höjer eller sänker hemoglobinets syreaffinitet. (2p) Max 25 ord. 1.5 av 2: CO₂: bildar kolsyra & karbamatjoner, sänker pH. H⁺: interagerar med sidokedjor, uppstår jonbindningar. 2,3-BPG: binder subenheterna, förhindrar konformationsändring. Samtliga stabiliserar T-state, sänker affiniteten för syre.
362 2023-05-15 16 transport-över-cellmembran ![[Pasted image 20251129235023.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns det? C) Vilken är drivkraften för transporten? (2p) Max 30 ord. ![[Pasted image 20251129235023.png]] Proteinet på bilden utför transport. A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet? B) Var i cellen finns det? C) Vilken är drivkraften för transporten? (2p) Max 30 ord. A) En antiport. B) I mitokondriens inre membran. C) Energikvoten. Dvs fördelningen mellan ATP och ADP innanför respektive utanför mitokondriens inre membran.
363 2023-05-15 22 glykolysen Du är lite sen till bussen och behöver springa den sista biten för att inte missa den. När du slår dig ned är du varm och andas häftigt. Det gör också lite ont i lårmusklerna. A) Vilka metabola vägar aktiverades när du började springa och varför? B) Förklara med hjälp av termodynamik varför du har blivit varm. (Max 120 ord) (3p) Du är lite sen till bussen och behöver springa den sista biten för att inte missa den. När du slår dig ned är du varm och andas häftigt. Det gör också lite ont i lårmusklerna. A) Vilka metabola vägar aktiverades när du började springa och varför? B) Förklara med hjälp av termodynamik varför du har blivit varm. (Max 120 ord) (3p) 2 av 3: A) När jag började springa förbrukades energi. Glykolysen omvandlade blodglukos till pyruvat för att skapa mer ATP via citronsyracykeln, ETK och oxidativ fosforylering. Glykogen lagrat i musklerna bröts ner för att frigöra energi där. B) När ett arbete utförs kommer alltid lite av energin att gå till spillo och bli till kinetisk energi/värme. Tack vare att alla processer i kroppen är uppdelade i många men mindre steg kan vi ta tillvara på en större del av den tillgängliga energin, vi får alltså en större verkningsgrad än t.ex. en förbränningsmotor. Vår verkningsgrad är ca 50%, det innebär att hälften av den energi jag förbrukade när jag sprang frigjordes i form av värme och det var därför jag blev varm.
364 2023-05-15 32 nukleotidnedbrytning I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i nedanstående två nukleosider när dessa bryts ner? Ange en molekyl för respektive nukleosid. (1p) A) Inosin B) Cytidin I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kväveatomer som ingår i nedanstående två nukleosider när dessa bryts ner? Ange en molekyl för respektive nukleosid. (1p) A) Inosin B) Cytidin A) Urat. B) Urea.
365 2023-05-15 26 lipider Din kompis har bestämt sig för att utesluta fett ur sin diet med målet att minska sina fettförråd. Du som har studerat metabolism ser en svaghet i strategin. Redogör för den svagheten på molekylär nivå. (Max 75 ord) (2p) Din kompis har bestämt sig för att utesluta fett ur sin diet med målet att minska sina fettförråd. Du som har studerat metabolism ser en svaghet i strategin. Redogör för den svagheten på molekylär nivå. (Max 75 ord) (2p) AI: Utan fett i kosten minskar tillgången på essentiella fettsyror och framför allt på oxaloacetat, som krävs för att acetyl-CoA ska kunna gå in i citronsyracykeln. Brist på kolhydrater och fett gör att oxaloacetat används för glukoneogenes, vilket hindrar fullständig fettoxidation. Fettförbränningen bromsas alltså snarare än ökar, och ketonkroppar kan bildas.
366 2023-05-15 12 kromatin Vilka två påståenden om kromatin stämmer bäst? (1p) A: Acetylering gör histonsvansar mer positivt laddade. B: Topoisomeraser kan reglera aktiviteten i en kromatinfiber-loop. C: Histon H1 destabiliserar nukleosomen. D: Nukleosomen har en kärna av 8 histonproteiner. Vilka två påståenden om kromatin stämmer bäst? (1p) A: Acetylering gör histonsvansar mer positivt laddade. B: Topoisomeraser kan reglera aktiviteten i en kromatinfiber-loop. C: Histon H1 destabiliserar nukleosomen. D: Nukleosomen har en kärna av 8 histonproteiner. B och C
367 2023-05-15 27 elektrontransportkedjan Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (1p) Komponenter: Coenzym Q CuB Cytokrom C NADH Rangordna nedanstående komponenter i andningskedjan från lägst till högst redoxpotential. (1p) Komponenter: Coenzym Q CuB Cytokrom C NADH 1. NADH 2. Coenzym Q 3. Cytokrom C 4. CuB
368 2023-05-15 13 kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Vilken roll spelar sigma-faktorn vid prokaryot transkription? (2p) Vilken roll spelar sigma-faktorn vid prokaryot transkription? (2p) Sigmafaktorn är en av de 6 subenheter som ingår i det prokaryota polymeraset. Sigmafaktorns uppgift är att hjälpa polymeraset att snabbare hitta fram till rätt promotor. Polymeraset med sigmafaktorn åker längs med DNA till dess att rätt promotor hittas. Sigmafaktorns effekt är att polymeraset binder lösare till ospecifikt DNA, vilket gör att det kan glida längs DNA utan att fastna på fel ställe. Utan sigmafaktorn hade polymeraset bundit mycket starkare till ospecifikt DNA, vilket hade försvårat processen då det hade haft problem med att glida längs DNA utan att fastna på fel ställe. När sigmafaktorn väl hittat och bundit till rätt promotor kan transkriptionen börja. Då kommer sigmafaktorn att falla av, eftersom vi nu vill att polymeraset ska sitta fast vid DNA för att kunna utföra transkriptionen korrekt.
369 2023-05-15 17 cellmembran Var hittas ett GPI-ankare och vad har det för funktion? (2p) Var hittas ett GPI-ankare och vad har det för funktion? (2p) Ett GPI-ankare är ett perifert membranprotein. Det sitter förankrat till cellmembranet via fosfatgrupper och sockerstrukturer. GPI-ankaret kan mobiliseras väldigt snabbt genom att klippas loss med hjälp av lipaser. Vid en synaps i t.ex. en muskel kommer transmittorsubstansen acetylkolin på en impuls frisättas och leda till muskelkontraktion. För att kontraktionen ska upphöra måste acetylkolin plockas bort från muskelcellens receptorer, och det sker via acetylkolinesteras. Acetylkolinesteras sitter bundet till axonterminalen via ett GPI-ankare, vilket gör att det då snabbt kan frigöras och avsluta muskelkontraktionen.
370 2023-05-15 23 glykogen Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (1p) A: Glykogenet i skelettmuskel bryts ner hela vägen till glukos som sedan används för att generera energi i form av ATP till muskelcellen själv. B: Höga intracellulära nivåer av AMP kan stimulera glykogenolys i skelettmuskel. C: Intracellulär signalering inducerad av hormonet glukagon stimulerar glykogenolys och hämmar glykogenes i skelettmuskel. D: Utan ett funktionellt debranching enzyme kan bara en mindre del av leverns glykogenförråd utnyttjas för att höja blodets glukoskoncentration i en fastesituation. Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (1p) A: Glykogenet i skelettmuskel bryts ner hela vägen till glukos som sedan används för att generera energi i form av ATP till muskelcellen själv. B: Höga intracellulära nivåer av AMP kan stimulera glykogenolys i skelettmuskel. C: Intracellulär signalering inducerad av hormonet glukagon stimulerar glykogenolys och hämmar glykogenes i skelettmuskel. D: Utan ett funktionellt debranching enzyme kan bara en mindre del av leverns glykogenförråd utnyttjas för att höja blodets glukoskoncentration i en fastesituation. C och D
371 2023-05-15 33 heme Vilken typ av bilirubin är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? (1p) Vilken typ av bilirubin är förhöjt vid hemolytisk sjukdom? (1p) Det okonjugerade bilirubinet. Bilirubin är en hydrofob molekyl. I normala fall kommer bilirubin i levern att konjugeras med två glukuronsyra som gör att molekylen blir vattenlöslig och kan utsöndras med gallsyran. Om denna konjugering inte sker kan bilirubin inte utsöndras, och därför är det denna variant vi kommer att se förhöjda halter av vid sjukdom.
372 2023-05-15 24 citronsyracykeln Vilka två av nedanstående enzymer återfinns i citronsyracykeln? (1p) A: Succinatdehydrogenas B: Pyruvatdehydrogenas C: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas Vilka två av nedanstående enzymer återfinns i citronsyracykeln? (1p) A: Succinatdehydrogenas B: Pyruvatdehydrogenas C: Glyceraldehyd 3-fosfatdehydrogenas D: Malatdehydrogenas A och D
373 2023-05-15 10 rna-syntes Vilka två alternativ är korrekta vad gäller 5' cap hos eukaryot mRNA? (1p) A: Stimulerar syntes av polyA-svansen. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Skyddar mRNA från nedbrytning. D: Består av nukleotid bunden via en 5’–5’ bindning. Vilka två alternativ är korrekta vad gäller 5' cap hos eukaryot mRNA? (1p) A: Stimulerar syntes av polyA-svansen. B: Skyddar mot felaktig splicing. C: Skyddar mRNA från nedbrytning. D: Består av nukleotid bunden via en 5’–5’ bindning. C och D
374 2023-05-15 9 nukleotider Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en Watson–Crick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'. B: Ett varv av DNA motsvarar ca 10,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är vänstervriden. Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en Watson–Crick-helix. Vilka två påståenden stämmer? A: De två strängarna i helixen löper parallellt i samma riktning, 5' till 3'. B: Ett varv av DNA motsvarar ca 10,4 bp. C: Avståndet mellan närliggande baspar är 3,4 Å. D: Helixen är vänstervriden. B och C
375 2023-05-15 34 introduktionslaboration Du ska labba! Beskriv fyra saker som du behöver göra innan du börjar experimentera. (2p) Max 50 ord. Du ska labba! Beskriv fyra saker som du behöver göra innan du börjar experimentera. (2p) Max 50 ord. Förbereda mig genom att läsa igenom labb-handledningen så att jag vet vad jag ska göra. Lämna ytterkläder och väska och ta på mig labbrock. Tvätta av bänken med minst 75% etanol. Vid behov, ta på mig handskar.
376 2023-05-15 14 translation Beskriv strukturen och funktionen av aminoacyl-tRNA syntetas översiktligt samt förklara vad som sker i aminoacyl-tRNA syntetas om fel aminosyra binder till tRNA. (2p) Max 150 ord. Beskriv strukturen och funktionen av aminoacyl-tRNA syntetas översiktligt samt förklara vad som sker i aminoacyl-tRNA syntetas om fel aminosyra binder till tRNA. (2p) Max 150 ord. Aminoacyl-tRNA syntetas är ett enzym som katalyserar inbindning av en aminosyra till sin motsvarande tRNA-molekyl för att kunna nyttjas i translationen och kopplas ihop med andra aminosyror. Aminoacyl-tRNA syntetas har två olika delar som är avgörande för funktionen. Det finns ett active site, dit aminosyran binder för att sedan kunna länkas till en OH-grupp på tRNA-molekylens CCA-svans. Sedan finns också ett editing site. Enzymet kommer att känna av om kopplingen mellan aminosyran och tRNA blev rätt eller inte. Om det blev fel kommer editing siten direkt att spjälka loss aminosyran från tRNA för att via active site kunna sätta dit en ny. Det finns en god flexibilitet hos enzymet som gör att dessa två olika delar enkelt kan samarbeta för att snabbt åtgärda ett eventuellt fel.
377 2023-05-15 20 enzymer Vilka två av nedanstående behöver du känna till för att beräkna omsättningstalet för ett enzym? (1p) A: Enzymstrukturen. B: Enzymkoncentrationen. C: Initialhastigheten för den katalyserade reaktionen vid [S] >> Kₘ. D: Kₘ för substratet. Vilka två av nedanstående behöver du känna till för att beräkna omsättningstalet för ett enzym? (1p) A: Enzymstrukturen. B: Enzymkoncentrationen. C: Initialhastigheten för den katalyserade reaktionen vid [S] >> Kₘ. D: Kₘ för substratet. B och C
378 2023-05-15 30 pentosfosfatvägen Varför är tillgång av NADPH essentiellt för ett fungerande glutationsystem? (1p) Max 50 ord. Varför är tillgång av NADPH essentiellt för ett fungerande glutationsystem? (1p) Max 50 ord. Glutation är en antioxidant som reducerar reaktiva syreföreningar, ex väteperoxid till vatten. För att reaktionen ska kunna ske igen måste glutation reduceras tillbaka till sin ursprungsform. Det är NADPH som fungerar som reduktionsmedel och oxideras till NADP⁺. Utan NADPH förblir glutation oxiderat och kan inte reducera fler farliga syreradikaler.
379 2023-05-15 15 evolution Coronavirus ändrades mycket under pandemin, från en ganska dödlig variant som var lagom smittsam till en variant som är relativt ofarlig men mycket smittsam. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till. (2p) Coronavirus ändrades mycket under pandemin, från en ganska dödlig variant som var lagom smittsam till en variant som är relativt ofarlig men mycket smittsam. Beskriv hur man kan använda koncept från evolutionen för att förstå hur detta går till. (2p) 1 av 2: Med tiden har celler, organismer och hela populationer förändrats efter rådande omständigheter. Miljön påverkar och leder till att egenskaper som är gynnsamma för en organisms överlevnad i den aktuella miljön kommer att bevaras medan egenskaper som inte är gynnsamma kommer att selekteras bort hos kommande generationer. Coronaviruset genomgick en sådan förändring. Till en början var viruset mindre smittsamt men hade en högre dödlighet hos de smittade. Människor kom fram med sätt att skydda sig mot viruset och metoder för att bli frisk om man blivit smittad. Viruset mötte motstånd som hotade dess fortsatta utveckling och överlevnad. Omgivningen fick alltså viruset att utveckla nya egenskaper som var mer gynnsamma för att kunna fortsätta utvecklas och leva vidare. Det var i detta fall att bli mindre dödligt men desto mer smittsamt. Omgivningens selektionstryck kommer alltså leda till en förändring hos organismen där de mest fördelaktiga egenskaperna för dess överlevnad kommer att bevaras och utvecklas vidare.
380 2023-05-15 21 introduktion-till-metabolismen Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) A: ATP stimulerar katabolism. B: ATP innehåller en energirik fosfoanhydridbindning för varje fosfatgrupp. C: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan negativa laddningar. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i CTP. Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (1p) A: ATP stimulerar katabolism. B: ATP innehåller en energirik fosfoanhydridbindning för varje fosfatgrupp. C: När en fosfatgrupp frigörs minskar repulsionen mellan negativa laddningar. D: Motsvarande energirika bindningar hittas i CTP. C och D
381 2023-05-15 31 kolesterol Beskriv översiktligt kolesterolets omsättning i kroppen: var det kommer ifrån, två viktiga funktioner och hur det kan utsöndras. (2p) Beskriv översiktligt kolesterolets omsättning i kroppen: var det kommer ifrån, två viktiga funktioner och hur det kan utsöndras. (2p) Kolesterol kan antingen bildas i kroppen eller intas via födan. För en person som väger ca 70 kg och har en västerländsk diet får man i sig ca 500–700 mikrogram kolesterol via födan varje dygn och ca 50% av detta tas upp i kroppen. Syntes av kolesterol kommer att ske ändå, men i vilken utsträckning varierar beroende på kostsammansättningen. Kolesterol är en viktig komponent i våra cellmembran där det påverkar membranets fluiditet och skyddar membranet från att fluiditeten ska bli för hög eller låg vid temperaturförändringar i kroppen. Kolesterol utgör också grundstrukturen i syntesen av katekolaminer i binjuren, exempelvis testosteron, testosteron och progesteron. När kolesterol bryts ner kommer det att utsöndras gallan.
382 2023-05-15 25 betaoxidation Vilka två av nedanstående påståenden om ketonkroppar är korrekta? (1p) A: De syntetiseras i njuren. B: De kan betraktas som vattenlösliga transportformer av oxaloacetat i blodbanan. C: Höga halter av ketonkroppar ger metabol acidos. D: De används som energikälla i hjärtmuskel och njurcortex. Vilka två av nedanstående påståenden om ketonkroppar är korrekta? (1p) A: De syntetiseras i njuren. B: De kan betraktas som vattenlösliga transportformer av oxaloacetat i blodbanan. C: Höga halter av ketonkroppar ger metabol acidos. D: De används som energikälla i hjärtmuskel och njurcortex. C och D
383 2023-05-15 11 dna-replikation Enzymet flap endonuclease 1 (FEN1) är viktigt vid eukaryot DNA-replikation. Vad gör detta enzym? (2p) Enzymet flap endonuclease 1 (FEN1) är viktigt vid eukaryot DNA-replikation. Vad gör detta enzym? (2p) FEN1 är verksamt vid lagging strand under Okazaki fragment maturation. Eftersom lagging strand syntetiseras i flera sekvenser finns det flera primers med RNA inne i den nysyntetiserade strängen. I färdigt DNA vill vi inte ha något RNA kvar, detta måste på något sätt plockas bort. När polymeraset syntetiserar ett fragment kommer det slutligen krocka in i RNA-primern som utgjorde starten för det föregående fragmentet. När polymeraset och primern krockar kommer primern puttas bort och hänga som en liten svans från DNA-strängen. Då är det FEN1 som med sin endonukleasaktivitet klipper bort primern så att enbart DNA återstår i den nya strängen.
384 2023-05-15 8 nukleotider De olika kolatomerna i ribos och deoxyribos numreras som 1', 2', 3', 4' och 5'. (2p) A) Vad skiljer ribos från deoxyribos? B) Till vilken position är basen kopplad? De olika kolatomerna i ribos och deoxyribos numreras som 1', 2', 3', 4' och 5'. (2p) A) Vad skiljer ribos från deoxyribos? B) Till vilken position är basen kopplad? A) Ribos har en OH-grupp kopplad till både 2´ och 3´ position. Deoxyribos har också en OH-grupp vid 3´ position, men enbart ett väte i 2´ position. B) Kvävebasen är kopplad till pentosens 1´ position.
385 2023-05-15 35 plasmid Vilka två av nedanstående används som substrat för beta-galaktosidas vid blåvit screening? (1p) A: IPTG B: X-gal C: Beta-laktamas D: 5-Bromo-4-Chloro-3-Indolyl beta-D-Galctopyranoside Vilka två av nedanstående används som substrat för beta-galaktosidas vid blåvit screening? (1p) A: IPTG B: X-gal C: Beta-laktamas D: 5-Bromo-4-Chloro-3-Indolyl beta-D-Galctopyranoside B och D
386 2023-05-15 3 från-aminosyror-till-proteiner Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp vardera som deras R-grupper kan delta i när pH = 7. (1p) Aminosyror: Cystein Glutamat Treonin Tryptofan Bindningstyper: Jonbindning Kovalent bindning van der Waals interaktion Vätebindning Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp vardera som deras R-grupper kan delta i när pH = 7. (1p) Aminosyror: Cystein Glutamat Treonin Tryptofan Bindningstyper: Jonbindning Kovalent bindning van der Waals interaktion Vätebindning Cystein: Kovalent bindning Glutamat: Jonbindning Treonin: Vätebindning Tryptofan: van der Waals interaktion
387 2023-05-15 7 cellmembran Membranlipider är amfipatiska. Vad betyder amfipati och varför är det en nödvändig egenskap för membranlipider? (2p) Max 75 ord. Membranlipider är amfipatiska. Vad betyder amfipati och varför är det en nödvändig egenskap för membranlipider? (2p) Max 75 ord. En molekyl som är amfipatisk har både en hydrofob och en hydrofil del. Både fosfolipiderna och kolesterol är amfipatiska molekyler. Egenskapen gör att membranlipiderna kan orientera sig så att det bildas ett dubbellager med samtliga molekylers hydrofoba delar riktade in mot varandra och membranets mitt medan dess hydrofila delar riktas mot cytoplasman respektive extracellulärmatrix. Amfipati är alltså en nödvändig egenskap för att kunna bilda ett cellmembran som kan interagera med omgivningen och utgöra en barriärfunktion.
388 2023-05-15 6 kolhydrater A) Vad kallas den kovalenta bindningen som binder ihop två monosackarider (till exempel i en di- eller trisackarid)? B) Ange två skäl till varför tre hexoser kan resultera i många fler olika trisackarider än antalet olika tripeptider tre aminosyror kan resultera i. (2p) Max 100 ord. A) Vad kallas den kovalenta bindningen som binder ihop två monosackarider (till exempel i en di- eller trisackarid)? B) Ange två skäl till varför tre hexoser kan resultera i många fler olika trisackarider än antalet olika tripeptider tre aminosyror kan resultera i. (2p) Max 100 ord. 1 av 2: A) Glykosidbindning. B) Det finns 20 proteinogena aminosyror. Dessa kan förekomma i L- och D-form efter hur de bryter ljus. I kroppen finns bara aminosyror av L-form, det innebär att det i kroppen endast finns 20 olika aminosyror att välja mellan i skapandet av en tripeptid. Antalet möjliga kombinationer är begränsat. Det finns många olika monosackarider. Dessa kan likt aminosyrorna också förekomma i olika former, så kallade stereoisomerer. Skillnaden är att det finns väldigt många fler monosackarider och fler isomerer av dessa som kan förekomma i kroppen. Det gör att det finns en större möjlig variation vid bildandet av en trisackarid.
389 2023-05-15 2 från-aminosyror-till-proteiner I pyruvatdehydrogenaskomplexet överförs en av reaktionsintermediärerna från en subenhet till en annan och till det används sidogruppen av en aminosyra kopplad med en kovalent bindning till en prostetisk grupp. (2p) Max 30 ord. A) Vilken aminosyra är lämplig för uppdraget och varför? B) Förklara kortfattat syftet med överföringen. I pyruvatdehydrogenaskomplexet överförs en av reaktionsintermediärerna från en subenhet till en annan och till det används sidogruppen av en aminosyra kopplad med en kovalent bindning till en prostetisk grupp. (2p) Max 30 ord. A) Vilken aminosyra är lämplig för uppdraget och varför? B) Förklara kortfattat syftet med överföringen. A) Serin. Är en alkohol, har OH-grupp som kan bilda vätebindning till kväveatomer hos lipoamidarmen. B) Acetylgrupp överförs av lipoamidarmen från E1 till E2 där den blir acetyl-CoA.
390 2024-12-20 28 elektrontransportkedjan Vid reduktion av syre bildas små mängder reaktiva syreföreningar. Ange två enzymer som oskadliggör dessa. (2p) Max 10 ord. Vid reduktion av syre bildas små mängder reaktiva syreföreningar. Ange två enzymer som oskadliggör dessa. (2p) Max 10 ord. 1. Glutation perioxidas 2. Superoxid dismutas
391 2024-12-20 5 cellmembran Redogör för hur bakterier/anpassning av cellmembranets fluiditet kan ske via fettsyrornas egenskaper. (4p) Redogör för hur bakterier/anpassning av cellmembranets fluiditet kan ske via fettsyrornas egenskaper. (4p) Fettsyror i cellmembran är amfipatiska, och har alltså en polär del (huvud) och en opolär del (svans). Den opolära delen består av acylgrupper, som binder till varandra via VdW-krafter, vilket inte är så starka bindningar och börjar därför lossna vid värmetillförsel (även om det inte är så hög temperatur). Fluiditeten i cellmembran ökar när temperaturen ökar, eftersom fettsyrorna börjar att röra på sig av värmeenergin. För att cellmembranet inte ska bli alltför genomsläppligt så fungerar kolesterol som en buffert som minskar på rörelsen hos fettsyrorna. Och tvärtom gäller det att när temperaturen sjunker så minskar fettsyrornas rörelseenergi, och de börjar att binda hårdare till varandra. För att cellmembranet inte ska klumpa ihop sig, och bli helt ogenomsläppligt så fungerar kolesterolet även här som en buffert som sitter mellan fettsyrorna och sänker möjligheten för ihopklumpning av fettsyrorna.
392 2024-12-20 18 enzymer Chymotrypsin är ett enzym som använder kovalent katalys, vilken lämnar en kovalent bunden polypeptid till ett serin i enzymet efter att peptidbindningen har spjälkats. Redogör för den kemiska mekanism med vilken enzymet regenereras. (4p) Chymotrypsin är ett enzym som använder kovalent katalys, vilken lämnar en kovalent bunden polypeptid till ett serin i enzymet efter att peptidbindningen har spjälkats. Redogör för den kemiska mekanism med vilken enzymet regenereras. (4p) Brevid serinet finns histidin, som en del av den katalytiska triaden (med bredvid menas endast i den katalytiska triaden, eftersom i primärstrukturen ligger serin och histidin inte brevid varandra). När en vattenmolekyl kommer in i den katalytiska klyftan så kommer histidinet att ta upp ett väte från vattenmolekylen, vilket aktiverar syremolekylen i vattnet. Syremolekylen utför en nukleofil attack på bindningen mellan serin och polypeptiden, och syret från vattnet binder till polypeptiden istället för serin. Detta gör att peptiden och OH-gruppen från vattnet lämnar den katalytiska klyftan, och att histidin donerar sitt väte som den tog från vattnet till serinet så att serin återgår till att ha en OH-grupp i sin sidokedja så att enzymet regenereras till sin ursprungsform.
393 2024-12-20 1 kemiska-bindingar Förklara vad som menas med att en molekyl är resonansstabiliserad och vad det innebär för molekylen. Illustrera med ett valfritt exempel. (4p) Max 30 ord. Illustrationen görs på ett separat papper. Förklara vad som menas med att en molekyl är resonansstabiliserad och vad det innebär för molekylen. Illustrera med ett valfritt exempel. (4p) Max 30 ord. Illustrationen görs på ett separat papper. "Mellanläge" mellan enkelbindning och dubbelbindning, så styrkan på en resonansstabiliserad bindning är mellan enkelbindning och dubbelbindning. Atomer delar på elektronerna, så molekylen kan stabiliseras och finnas i flera konfigurationer. Ritning: ATP med streckade bindningar mellan P–O som visar resonans (sid 8). ![[Pasted image 20251129235730.png]]
394 2024-12-20 19 enzymer Ett enzym uppvisar Michaelis-Menten kinetik, vilket gör det möjligt att bestämma dess Km-värde. Km kan man använda för att förstå: (2p) A: Hur snabbt det går för bundet substrat att bli omsatt till frisatt produkt. B: Hur sannolikt det är att substrat binder till enzymet. C: Hur bra ett enzym kan skilja mellan olika möjliga substrat. D: Hur sannolikt det är att substrat lossnar från enzymet när det har bundit. Ett enzym uppvisar Michaelis-Menten kinetik, vilket gör det möjligt att bestämma dess Km-värde. Km kan man använda för att förstå: (2p) A: Hur snabbt det går för bundet substrat att bli omsatt till frisatt produkt. B: Hur sannolikt det är att substrat binder till enzymet. C: Hur bra ett enzym kan skilja mellan olika möjliga substrat. D: Hur sannolikt det är att substrat lossnar från enzymet när det har bundit. C och D
395 2024-12-20 29 lipider Beskriv hur triacylglycerol i fettceller bryts ner till fria fettsyror. (4p) Beskriv hur triacylglycerol i fettceller bryts ner till fria fettsyror. (4p) Adrenalin eller glukagon inducerar intracellulära reaktioner via 7TM, vilket omvandlar ATP till cAMP. cAMP aktiverar proteinkinas A, som i sin tur aktiverar perilipin. Perilipin omarrangerar TAG så att ATGL kan klyva den första fettsyran (TAG blir DAG). Proteinkinas A aktiverar HS lipas som spjälkar den andra fettsyran (DAG till MAG). MAG lipas spjälkar den tredje fettsyran, så att det bara blir kvar glycerol.
396 2024-12-20 4 utforska-proteiner Du ska rena ett protein med gelfiltrering. Proteinet innehåller också en his-tagg. (4p) Max 200 ord. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med gelfiltrering. B) Beskriv vad en his-tag är och hur den kan användas för rening och detektion. Du ska rena ett protein med gelfiltrering. Proteinet innehåller också en his-tagg. (4p) Max 200 ord. A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med gelfiltrering. B) Beskriv vad en his-tag är och hur den kan användas för rening och detektion. A) Gelfiltrening består av en fast fas med porösa kulor i en kolonn, och en mobil fas med en buffert och proteinet som ska renas. Små molekyler kommer att fastna i håligheterna i kulorna, medan stora proteiner kommer att komma ut först. Reningsmetoden är alltså baserad på proteiners storlek. B) His-tagg är en sekvens av 6 histidin-aminosyror efter varandra. His-tagg binder starkt till nickel-joner och man kan därför använda den egenskapen vid rening av proteinet. Man använder då affinitetskromatografi, och renar proteinet baserat på selektivitet alltså en specifik egenskap. Proteinet kan sedan elueras med Imidazol, som konkurrerar ut His-taggen.
397 2024-12-20 16 transport-över-cellmembran Para ihop respektive molekyl med en typ av transport den kan genomgå. Varje alternativ får enbart användas en gång. (2p) A: Glukos B: O₂ C: K⁺ D: Vatten Transporttyper: A: Sekundär aktiv transport B: Primär aktiv transport C: Passiv transport D: Fri diffusion Para ihop respektive molekyl med en typ av transport den kan genomgå. Varje alternativ får enbart användas en gång. (2p) A: Glukos B: O₂ C: K⁺ D: Vatten Transporttyper: A: Sekundär aktiv transport B: Primär aktiv transport C: Passiv transport D: Fri diffusion Glukos → Sekundär aktiv transport O₂ → Fri diffusion K⁺ → Primär aktiv transport Vatten → Passiv transport (kanal/aquaporin)
398 2024-12-20 22 glukoneogenes Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker när hormonet insulin utsöndras. B: Aminosyrorna alanin och lysin är glukogena. C: Glukoneogenes sker under nattens fasta. D: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat. Vilka två av nedanstående påståenden stämmer för glukoneogenes? (2p) A: Glukoneogenes sker när hormonet insulin utsöndras. B: Aminosyrorna alanin och lysin är glukogena. C: Glukoneogenes sker under nattens fasta. D: Glukoneogenes regleras av fruktos 2,6-bisfosfat. C och D
399 2024-12-20 32 nukleotidnedbrytning Nämn en vanlig sjukdom som är relaterad till nedbrytning av nukleotider, samt ange vilken av de två huvudtyperna av nukleotider som har en koppling till denna sjukdom. (2p) Max 10 ord. Nämn en vanlig sjukdom som är relaterad till nedbrytning av nukleotider, samt ange vilken av de två huvudtyperna av nukleotider som har en koppling till denna sjukdom. (2p) Max 10 ord. Gikt, och puriner har en koppling till sjukdomen.
400 2024-12-20 26 integrering-av-metabolismen Redogör för två sätt som metabolismen ändras vid träning och hur ändringarna leder till förbättrad prestation. (4p) Max 120 ord. Redogör för två sätt som metabolismen ändras vid träning och hur ändringarna leder till förbättrad prestation. (4p) Max 120 ord. Laktat i muskeltyp IIb tas upp av hjärtat och av muskeltyp I, vilket gör att mängden laktat minskar i muskeltyp IIb så att anaerob metabolism kan fortgå längre. Hjärtats konkurrens om glukos minskar även då. Laktat tas även upp av levern, och omvandlas till pyruvat, och sedan till glukos som går ut till blodet och tas upp av muskeltyp IIb och används i glykolysen. Detta kallas för Coricykeln. Båda dessa metabola vägar leder till förbättrad prestation, eftersom kroppen orkar hålla på under längre tid.
401 2024-12-20 12 nukleotider Vilka två påståenden om B-DNA (Watson–Crick helix) är korrekta? (2p) A: Avståndet mellan baspar i helixen är 5,0 Å. B: Helixen är vänstervriden. C: De två strängarna i helixen löper i motsatta riktningar. D: Ett varv av DNA består av ungefär 10 baspar. Vilka två påståenden om B-DNA (Watson–Crick helix) är korrekta? (2p) A: Avståndet mellan baspar i helixen är 5,0 Å. B: Helixen är vänstervriden. C: De två strängarna i helixen löper i motsatta riktningar. D: Ett varv av DNA består av ungefär 10 baspar. C och D
402 2024-12-20 36 plasmid Vilka två påståenden om plasmidkloning är korrekta? (2p) A: När en miniprep görs centrifugeras lösningen direkt efter alkalisk lysering för att separera plasmider från bakterierester. B: IPTG används för att bryta ned X-gal vilket gör att kolonier som tagit upp plasmiden blir blå. C: LacZ-genen används för blåvit screening där vita kolonier indikerar rekombinant DNA och blå kolonier indikerar icke-rekombinant DNA. D: BamHI är ett restriktionsenzym som klyver DNA vid en specifik sekvens. Vilka två påståenden om plasmidkloning är korrekta? (2p) A: När en miniprep görs centrifugeras lösningen direkt efter alkalisk lysering för att separera plasmider från bakterierester. B: IPTG används för att bryta ned X-gal vilket gör att kolonier som tagit upp plasmiden blir blå. C: LacZ-genen används för blåvit screening där vita kolonier indikerar rekombinant DNA och blå kolonier indikerar icke-rekombinant DNA. D: BamHI är ett restriktionsenzym som klyver DNA vid en specifik sekvens. C och D
403 2024-12-20 27 elektrontransportkedjan I elektrontransportkedjan förekommer steg där elektrondonatorn och elektronacceptorn inte är bärare av lika många elektroner. Redogör för vad som händer vid ett sådant steg. (4p) Max 100 ord. I elektrontransportkedjan förekommer steg där elektrondonatorn och elektronacceptorn inte är bärare av lika många elektroner. Redogör för vad som händer vid ett sådant steg. (4p) Max 100 ord. Detta händer i komplex III i elektrontransportkedjan när coenzym Q ska donera 2 elektroner till cytokrom C som endast kan ta upp en elektron. Q-cykeln: QH₂ kommer till Q Cytokrom C oxidoreduktas (komplex III): 1 elektron tas upp av cytokrom C och ges till cytokrom C (elektronen transporteras till komplex IV) 1 elektron tas upp av Q som blir Q⁻ En annan QH₂ kommer in till komplex III 1 elektron tas upp av cytokrom C1 och ges till cytokrom C 1 elektron tas upp av Q⁻ blir till QH₂ (2 H⁺ tas upp från matrix)
404 2024-12-20 13 translation Describe the main features of the genetic code and explain their biological significance. (4p) Answer in English. Describe the main features of the genetic code and explain their biological significance. (4p) Answer in English. The genetic code is in humans stored in DNA (23 chromosome pairs). It stems from our mother and father. The DNA contains 4 different base-pairs. Adenin, Tymin, Cytosin och Guanin. The genetic code is not read one base-pair at a time, but rather in groups of three (i.e codons). For example AUG, ATT. The genetic code is also degenarative, leading to different codons being able to code for the same aminoacid. This leads to a protective function against mutations, since a mutation in a codon can lead to the same amino acid still being coded for example. The gentic code codes for all the proteins in an organism. The DNA can be transcribed into mRNA which can be translated into proteins
405 2024-12-20 17 termodynamik Gibbs fria energi möjliggör att man kan förutsäga om en kemisk reaktion kan ske spontant. Ange vilka termer som ingår i formeln som beskriver förändringar i Gibbs fria energi. Förklara även hur ökad respektive minskad temperatur påverkar förändringen av Gibbs fria energi. (4p) Gibbs fria energi möjliggör att man kan förutsäga om en kemisk reaktion kan ske spontant. Ange vilka termer som ingår i formeln som beskriver förändringar i Gibbs fria energi. Förklara även hur ökad respektive minskad temperatur påverkar förändringen av Gibbs fria energi. (4p) Gibbs fria energi = deltaG Entalpi = deltaH Temperatur = T Entropi = deltaS En ökad temperatur kommer ha inverkan på entropin, vilket kommer leda till att deltaG kommer bli mer negativ/gå mot ett lägre värde. Den kemiska reaktionen i fråga kommer då förkjutas mot ett läge där den kan ske spontant (kan ske spontant om delta G är <0) En minskad temperatur kommer också ha en inverkan på entropin, fast i detta fall kommer deltaG istälett gå mot ett högre värde. Den kemiska reaktionen i fråga kommer då kräva mer energi för att äga rum. Temperaturen påverkar entropin eftersom detta är ett diret mått på molekylers/atomernas rörelseenergi.
406 2024-12-20 23 glykogen Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet adrenalin induceras glykogenes i cellen. B: Glykogen upplagrat i skelettmuskel används främst för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider. C: Glukos-6-fosfat är slutprodukten vid glykogenolys i skelettmuskler. D: Glykogenin är ett enzym som är kovalent bundet till glykogen. Vilka två av följande påståenden relaterade till glykogenmetabolism är korrekta? (2p) A: Stimuleras en skelettmuskelcell med hormonet adrenalin induceras glykogenes i cellen. B: Glykogen upplagrat i skelettmuskel används främst för att upprätthålla blodglukoskoncentrationen mellan måltider. C: Glukos-6-fosfat är slutprodukten vid glykogenolys i skelettmuskler. D: Glykogenin är ett enzym som är kovalent bundet till glykogen. C och D
407 2024-12-20 33 pentosfosfatvägen Var i cellen sker pentosfosfatvägen, och vilken biomolekyl, som kan användas vid reduktiv biosyntes, kan bildas i denna väg? (2p) Max 10 ord. Var i cellen sker pentosfosfatvägen, och vilken biomolekyl, som kan användas vid reduktiv biosyntes, kan bildas i denna väg? (2p) Max 10 ord. Pentosfosfatvägen sker i cytosolen, och bildar NADPH.
408 2024-12-20 24 glykogen Vilka av följande faktorer stimulerar glykogenolys i en skelettmuskelcell? (2p) A: Intracellulär signalering inducerad av hormonet adrenalin. B: Aktivering av proteinfosfatas 1 i cellen. C: En låg energistatus i cellen, vilket reflekteras av en förhöjd intracellulär koncentration av AMP. D: En förhöjd koncentration av ATP i cellen. Vilka av följande faktorer stimulerar glykogenolys i en skelettmuskelcell? (2p) A: Intracellulär signalering inducerad av hormonet adrenalin. B: Aktivering av proteinfosfatas 1 i cellen. C: En låg energistatus i cellen, vilket reflekteras av en förhöjd intracellulär koncentration av AMP. D: En förhöjd koncentration av ATP i cellen. A och C
409 2024-12-20 10 rna-syntes Vilken är den biologiska betydelsen av den 5’-cap som återfinns på mRNA i eukaryota celler? (4p) Vilken är den biologiska betydelsen av den 5’-cap som återfinns på mRNA i eukaryota celler? (4p) Så fort mRNA:et börjar komma ut från RNA polymeras II, så sätts det på en guaninmolekyl på 5'-ändan via en 5'-5' bindning. Detta gör att mRNA-sekvensen inte bryts ner och att transkriptionen kan fortgå. När transkriptionen är färdig och mRNA-sekvensen har fått sin poly(A)-svans på sin 3´-ända och ska translateras så krävs det att både 5´cap och poly(A) finns på mRNA:et för att det ska kännas igen av ribosomen och translateras. 5´-capen hämmar alltså nedbrytning av mRNA, och möjliggör intiering av translation (tillsammas med poly(A)-svansen).
410 2024-12-20 9 kromatin Histonmodifieringar spelar en viktig roll i kromatinets funktion. Vilken effekt har acetylering av histoner på kromatinstrukturen, och varför är detta viktigt för genuttryck? (4p) Histonmodifieringar spelar en viktig roll i kromatinets funktion. Vilken effekt har acetylering av histoner på kromatinstrukturen, och varför är detta viktigt för genuttryck? (4p) I nukleosomen finns bland annat dubbla uppsättningar av H3 och H4, och dessa 4 histoner har svansar av positivt laddade aminosyror (t.ex lysin och arginin) vid sin N-terminal. Dessa aminosyror binder till fosfatgrupperna på DNA:et ryggrad, eftersom fosfatgrupperna är negativt laddade. När svansarna blir acetylerade så neutraliseras de positiva laddningarna, och svansarna binder inte lika hårt till fosfatgrupperna. Detta möjliggör för enzymer att komma åt DNA:et, eftersom den inte är så hårt bunden till histonerna och möjliggör reglering av genuttryck (antingen mer eller mindre transkription beroende på gen och vilket enzym det handlar om).
411 2024-12-20 34 kolesterol På vilka två sätt regleras kolesterolsyntesens hastighet? (2p) A: Via mängden aktivt 24-dehydrokolesterolreduktas, som styr aktiviteten i Kandutsch-Russel vägen för kolesterolsyntes. B: Via mängden aktivt HMG-CoA reduktas, som katalyserar bildningen av mevalonat. C: Via mängden aktivt squalenmonooxygenas, som katalyserar första steget i cykliseringen av squalen till lanosterol. D: Via mängden aktivt SLC25A1, ett transportprotein som transporterar citrat ut ur mitokondrien. På vilka två sätt regleras kolesterolsyntesens hastighet? (2p) A: Via mängden aktivt 24-dehydrokolesterolreduktas, som styr aktiviteten i Kandutsch-Russel vägen för kolesterolsyntes. B: Via mängden aktivt HMG-CoA reduktas, som katalyserar bildningen av mevalonat. C: Via mängden aktivt squalenmonooxygenas, som katalyserar första steget i cykliseringen av squalen till lanosterol. D: Via mängden aktivt SLC25A1, ett transportprotein som transporterar citrat ut ur mitokondrien. B och C
412 2024-12-20 14 från-aminosyror-till-proteiner Hur kan man identifiera viktiga aminosyror i ett protein när man bara har sekvensinformation från många olika organismer att tillgå? (4p) Hur kan man identifiera viktiga aminosyror i ett protein när man bara har sekvensinformation från många olika organismer att tillgå? (4p) Sekvensanalys innebär att man kan identifiera viktiga aminosyror genom att jämföra sekvenser från flera olika organismer och hitta likheter mellan organismerna. Viktiga aminosyror, t.ex den katalytiska triaden i t.ex chymotrypsin tenderar att bevaras i organismer därför att det naturliga urvalet bevarar sekvenser som är gynnsamma för artens anpassning och överlevnad.
413 2024-12-20 20 introduktion-till-metabolismen Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs från ATP ökar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från glukos 6-fosfat. C: Det frigörs lika mycket energi när ATP och GTP hydrolyseras. D: ATP har högre fosforyltransferpotential än fosfoenolpyruvat. Vilka två av följande påståenden stämmer för ATP? (2p) A: När en fosfatgrupp frigörs från ATP ökar entropin. B: ATP kan bildas via substratnivåfosforylering från glukos 6-fosfat. C: Det frigörs lika mycket energi när ATP och GTP hydrolyseras. D: ATP har högre fosforyltransferpotential än fosfoenolpyruvat. A och C
414 2024-12-20 30 heme Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur hemesyntesen regleras. (4p) Syntes av heme beror på kroppens järninnehåll. Beskriv hur hemesyntesen regleras. (4p) I första steget av hemesyntesen används enzymet ALA-syntas, och det är translationen av detta enzym som regleras. Det finns ett järn-bindande protein som binder till mRNA:et som kodar för ALA-syntas vid frånvaro av järn. När det finns järn så binder järnet till järn-bindande proteinet, och får det att lossna från mRNA:et. Då kan mRNA:et translateras och ALA-syntas bildas. Järn sätts in i heme som sista steg vid syntesen, så det hade varit onödigt om alla syntes-steg skedde trots att det inte finns något järn.
415 2024-12-20 15 transport-över-cellmembran Vilka två påståenden om jonkanaler är korrekta? (2p) A: Transport sker alltid med en gradient. B: Na⁺-kanalen är mer selektiv än K⁺-kanalen. C: ATP driver transporten. D: De kan aktiveras genom ligandbindning. Vilka två påståenden om jonkanaler är korrekta? (2p) A: Transport sker alltid med en gradient. B: Na⁺-kanalen är mer selektiv än K⁺-kanalen. C: ATP driver transporten. D: De kan aktiveras genom ligandbindning. A och D
416 2024-12-20 21 glykolysen A) Förklara vad som menas med allosterisk reglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras allosteriskt och redogör för hur enzymets aktivitet ändras av regleringen. (4p) Max 50 ord. A) Förklara vad som menas med allosterisk reglering. B) Ge ett exempel på ett enzym i glykolysen som regleras allosteriskt och redogör för hur enzymets aktivitet ändras av regleringen. (4p) Max 50 ord. A) När en molekyl binder till ett annat ställe på enzymet än på det aktiva sätet och ändrar enzymets form, vilket ändrar dess aktivitet. B) Fosfofruktokinas I stimuleras vid allosterisk reglering av AMP och fruktos-2,6-bisfofat. Den hämmas vid allosterisk reglering av ATP och citrat.
417 2024-12-20 31 aminosyrametabolism Nämn en så kallad alfa-ketosyra, som via transaminering kan omvandlas till en aminosyra. Ange även vilken aminosyra som bildas från alfa-ketosyran, vad enzymet som katalyserar reaktionen heter, samt från vilken metabol väg alfa-ketosyran kan hämtas. (4p) Max 25 ord. Nämn en så kallad alfa-ketosyra, som via transaminering kan omvandlas till en aminosyra. Ange även vilken aminosyra som bildas från alfa-ketosyran, vad enzymet som katalyserar reaktionen heter, samt från vilken metabol väg alfa-ketosyran kan hämtas. (4p) Max 25 ord. Oxaloacetat (alfaketosyra) transamineras vid deaminering av glutamat (aminosyra), och bilda aspartat (aminosyra som bildas) och alfa-ketoglutarat (alfa-ketosyran som bildas) Enzym: aspartataminotransferas (AST) Alfa-ketosyran från citronsyracykeln
418 2024-12-20 25 integrering-av-metabolismen I vilken ordning kommer glukos att stöta på nedanstående enzymer under sin väg i katabolismen? (2p) A: succinyl-CoA syntetas B: glyceraldehyd 3-dehydrogenas C: malatdehydrogenas D: fosfoglyceratkinas I vilken ordning kommer glukos att stöta på nedanstående enzymer under sin väg i katabolismen? (2p) A: succinyl-CoA syntetas B: glyceraldehyd 3-dehydrogenas C: malatdehydrogenas D: fosfoglyceratkinas 1. glyceraldehyd 3-dehydrogenas 2. fosfoglyceratkinas 3. succinyl-CoA syntetas 4. malatdehydrogenas
419 2024-12-20 11 kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Lac-repressorn kan binda till operatorn också när det finns mycket glukos. B: Lac-operonet uttrycks alltid, oavsett närvaro av laktos. C: I närvaro av laktos binder allolaktos till repressorn och förhindrar dess bindning till DNA. D: CAP-proteinet förhindrar transkription av lac-operonet när glukos är frånvarande. Vilka två påståenden om lac-operonet stämmer? (2p) A: Lac-repressorn kan binda till operatorn också när det finns mycket glukos. B: Lac-operonet uttrycks alltid, oavsett närvaro av laktos. C: I närvaro av laktos binder allolaktos till repressorn och förhindrar dess bindning till DNA. D: CAP-proteinet förhindrar transkription av lac-operonet när glukos är frånvarande. A och C
420 2024-12-20 8 dna-replikation DNA-replikation är en noggrant reglerad process. I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin, och vilken funktion har detta komplex under replikationen? (4p) DNA-replikation är en noggrant reglerad process. I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin, och vilken funktion har detta komplex under replikationen? (4p) MCM-helikaset binder till replikationsorigin under G1-fasen när den lockas dit av ORC, och laddas av Cdc6 och Cdt1. Detta är möjligt under G1-fasen eftersom CDK-nivåerna är låga. Under S-fasen höjs CDK-nivåerna vilket lockar dit Gins och Cdc45, som binder till det laddade MCM-helikaset och skapar ett komplett CMG-helikas som kan börja öppna upp dubbelsträngen. Replikationen sker under S-fasen, och det möjliggörs alltså av de höga nivåerna av CDK, vilket säkerställer att replikationen endast sker en gång under cellcykeln. Helikaset är ett motorprotein som glider längs med DNA-ryggraden av fosfatgrupper och bryter vätebindningarna mellan kvävebaserna genom hydrolys av ATP.
421 2024-12-20 35 introduktionslaboration Du jämför ny kolesterolsänkande tablett mot standardbehandling. Efter tre månader görs t-test: p = 0,02, 95% KI för skillnaden 0,5–1,7 mmol/L. A) Formulera nollhypotes och alternativhypotes. B) Vilka slutsatser kan dras baserat på p-värdet och konfidensintervallet? (4p) Du jämför ny kolesterolsänkande tablett mot standardbehandling. Efter tre månader görs t-test: p = 0,02, 95% KI för skillnaden 0,5–1,7 mmol/L. A) Formulera nollhypotes och alternativhypotes. B) Vilka slutsatser kan dras baserat på p-värdet och konfidensintervallet? (4p) A) Nollhypotes: Det finns ingen skilland mellan blodtryckssänkningen om standradbehandling eller den nya tabletten används Alternativ hypotes: Det finns en skilland mellan blodtryckssänkningen om standradbehandling eller den nya tabletten används B) Testet visar statistisk signifikans, eftersom p-värdet är lägre än 0,05 och konfidensintervallet inte innehåller siffran noll. Nollhypotesen kan därför förkastas.
422 2024-12-20 3 hemoglobin A) Define cooperativity in the context of hemoglobin and myoglobin. B) Give an example where cooperativity is beneficial and explain how it is beneficial. (4p) Max 100 words. Answer in English. A) Define cooperativity in the context of hemoglobin and myoglobin. B) Give an example where cooperativity is beneficial and explain how it is beneficial. (4p) Max 100 words. Answer in English. A) Coopertivity means that once one hemegroup in hemoglobin binds to one oxygen molecule, it makes it easier to other oxygen molecules to bind in to the other hemegroups in the same hemoglobin molecule. Even when one oxygen molecule gets released from heme, it fascilitates for other oxygen molecules to get released. B) In hemoglobin there are 4 hememolecules, and each one of them can bind to one oxygen. In the lungs, the partial pressure of oxygen is high, which encourage hemoglobin to bind to oxygen. Coopevtivity here is benificial because it makes the oxygen transport in the body effective.
423 2024-12-20 7 nukleotider Vilka två påståenden om nukleotider är korrekta? (2p) A: En nukleotid består av en kvävebas, ett socker och tre fosfatgrupper. B: Den innersta fosfatgruppen, närmast sockret, kallas gamma. C: Ribonukleotider har en OH-grupp på 3'-kolatomen. D: Deoxyribonukleotider innehåller en OH-grupp på 2'-kolatomen. Vilka två påståenden om nukleotider är korrekta? (2p) A: En nukleotid består av en kvävebas, ett socker och tre fosfatgrupper. B: Den innersta fosfatgruppen, närmast sockret, kallas gamma. C: Ribonukleotider har en OH-grupp på 3'-kolatomen. D: Deoxyribonukleotider innehåller en OH-grupp på 2'-kolatomen. A och C
424 2024-12-20 6 kolhydrater Förklara kortfattat likheter och skillnader mellan glukos, glukopyranos och N-acetylglukosamin på strukturell/molekylär nivå. (4p) Förklara kortfattat likheter och skillnader mellan glukos, glukopyranos och N-acetylglukosamin på strukturell/molekylär nivå. (4p) 3 av 4 poäng: Linjär glukos blir cirkulär genom att aldehydgruppen på kol 1 binder till kol 5. Glukopyranos bildas genom att en aldehydgrupp på en molekyl binder till en hydroxylgrupp på en annan molekyl. Likheten är alltså att båda är cirkulära, men att antalet molekyler är olika. N-acetylglukosamin är en glukosmolekyl, som är bunden till en acetylamingrupp. Acetylamingruppen är bunden till glukoset via sitt kväve. Likheten är alltså att glukos och N-acetylglukosamin båda innehåller glukos, men att N-acetylglukosamin även innehåller en acetylamingrupp.
425 2024-12-20 2 från-aminosyror-till-proteiner En aminosyra har en sidogrupp bestående av en aminogrupp och en kedja med fyra CH₂-grupper. A) Vilken är aminosyran? B) Ange två egenskaper aminosyran har. C) Rita upp aminosyran vid pH = 2. (4p) Max 30 ord. Uppgift C på separat papper. En aminosyra har en sidogrupp bestående av en aminogrupp och en kedja med fyra CH₂-grupper. A) Vilken är aminosyran? B) Ange två egenskaper aminosyran har. C) Rita upp aminosyran vid pH = 2. (4p) Max 30 ord. Uppgift C på separat papper. A) Lysin B) Basisk, kan ta upp en H⁺ vid lågt pH. Fungerar i vissa enzymkomplex som en arm som flyttar prostetisk grupp mellan enzymer, t.ex lipoamiden i pyruvatdehydrogenaskomplexet. Ritning: Lysin vid pH 2, fullständigt protonerad (sid 12). ![[Pasted image 20251129235808.png]]

View File

@@ -20,7 +20,7 @@ def find_date(path: Path):
def parse_frontmatter(text: str): def parse_frontmatter(text: str):
m = FRONTMATTER_RE.match(text) m = FRONTMATTER_RE.match(text)
if not m: if not m:
return {"tags": [], "date": ""}, text return {"tags": [], "date": "", "maxpoints": ""}, text
fm_raw = m.group(1) fm_raw = m.group(1)
rest = text[m.end():] rest = text[m.end():]
tags = [] tags = []
@@ -53,7 +53,12 @@ def parse_frontmatter(text: str):
mdate = re.search(r"^date\s*:\s*(.+)$", fm_raw, re.M) mdate = re.search(r"^date\s*:\s*(.+)$", fm_raw, re.M)
if mdate: if mdate:
date_val = mdate.group(1).strip().strip('"\'') date_val = mdate.group(1).strip().strip('"\'')
return {"tags": tags, "date": date_val}, rest # parse maxpoints (accept either maxpoints or max_points)
maxpoints_val = ""
mmax = re.search(r"^(?:max_points|maxpoints)\s*:\s*(.+)$", fm_raw, re.M)
if mmax:
maxpoints_val = mmax.group(1).strip().strip('"\'')
return {"tags": tags, "date": date_val, "maxpoints": maxpoints_val}, rest
def extract_question_answer(body: str): def extract_question_answer(body: str):
# find first fenced block (prefer spoiler) # find first fenced block (prefer spoiler)
@@ -75,7 +80,24 @@ def extract_question_answer(body: str):
question = body.strip() question = body.strip()
return question, answer return question, answer
def main(root: Path, out: Path):
def _plain_text_from_md(md_text: str) -> str:
"""Simple cleanup to produce plain text from markdown for CSV/Excel export.
Removes fenced code blocks, basic markdown punctuation, list markers, and collapses whitespace.
This is intentionally lightweight (not a full markdown->text renderer) but good enough for spreadsheet import.
"""
# remove fenced code blocks
txt = re.sub(r"```.*?```", "", md_text, flags=re.S)
# remove inline code markers and emphasis/headers
txt = re.sub(r"[#*_`]+", "", txt)
# remove list markers at start of lines
txt = re.sub(r"^\s*-\s+", "", txt, flags=re.M)
# collapse whitespace to single spaces
txt = re.sub(r"\s+", " ", txt)
return txt.strip()
def main(root: Path, out: Path, mode: str = "anki"):
rows = [] rows = []
for md in root.rglob("*.md"): for md in root.rglob("*.md"):
# process each markdown file # process each markdown file
@@ -86,6 +108,7 @@ def main(root: Path, out: Path):
date = fm.get("date") or find_date(md.parent) date = fm.get("date") or find_date(md.parent)
qnum = md.stem qnum = md.stem
tags = fm.get("tags", []) tags = fm.get("tags", [])
maxpoints = fm.get("maxpoints", "")
# choose first tag that's not biokemi or provfråga # choose first tag that's not biokemi or provfråga
category = "" category = ""
for t in tags: for t in tags:
@@ -101,6 +124,17 @@ def main(root: Path, out: Path):
question_md = question_md.replace("**Rätt svar**", "") question_md = question_md.replace("**Rätt svar**", "")
question_md = question_md.replace("**Svar**", "") question_md = question_md.replace("**Svar**", "")
question_md = question_md.replace("**Answer**", "") question_md = question_md.replace("**Answer**", "")
if mode == "excel":
# produce plain-text (no HTML) rows: date;question_number;question;category;maxpoints;question;answer
date_val = date or ""
q_plain = _plain_text_from_md(question_md)
a_plain = _plain_text_from_md(answer_md)
# columns: date;question_number;question;category;maxpoints;question;answer
# move category to be the third column as requested: date;question_number;category;question;maxpoints;question;answer
rows.append((date_val, qnum, category, q_plain, maxpoints, q_plain, a_plain))
continue
# Render question and answer markdown to HTML. Enable common extensions. # Render question and answer markdown to HTML. Enable common extensions.
question_html = markdown(question_md, extensions=["fenced_code", "tables"]) question_html = markdown(question_md, extensions=["fenced_code", "tables"])
answer_html = markdown(answer_md, extensions=["fenced_code", "tables"]) answer_html = markdown(answer_md, extensions=["fenced_code", "tables"])
@@ -116,13 +150,18 @@ def main(root: Path, out: Path):
out.parent.mkdir(parents=True, exist_ok=True) out.parent.mkdir(parents=True, exist_ok=True)
with out.open("w", encoding="utf-8", newline="") as f: with out.open("w", encoding="utf-8", newline="") as f:
writer = csv.writer(f, delimiter=";", quoting=csv.QUOTE_ALL) writer = csv.writer(f, delimiter=";", quoting=csv.QUOTE_ALL)
# If exporting for Excel, add a header row matching the columns
if mode == "excel":
writer.writerow(["date", "question_number", "category", "question", "maxpoints", "question", "answer"])
#writer.writerow(["fråga", "svar", "kategori"]) #writer.writerow(["fråga", "svar", "kategori"])
for r in rows: for r in rows:
writer.writerow(r) writer.writerow(r)
if __name__ == "__main__": if __name__ == "__main__":
ap = argparse.ArgumentParser(description="Extract questions+answers to CSV") ap = argparse.ArgumentParser(description="Extract questions+answers to CSV")
ap.add_argument("root", nargs="?", default="content", help="root content folder (default: content)") ap.add_argument("root", nargs="?", default="content", help="root content folder (default: content)")
ap.add_argument("-o", "--out", default="output.csv", help="output CSV file (default: output.csv)") ap.add_argument("-o", "--out", default="output.csv", help="output CSV file (default: output.csv)")
ap.add_argument("--mode", choices=["anki", "excel"], default="anki", help="output mode: 'anki' (default) or 'excel' (date;question_number;question;category;maxpoints;question;answer)")
args = ap.parse_args() args = ap.parse_args()
main(Path(args.root), Path(args.out)) main(Path(args.root), Path(args.out), args.mode)