vault backup: 2025-12-01 12:12:33

content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Anteckningar.md

@@ -0,0 +1,236 @@
+---
+tags:
+  - biokemi
+  - glykolysen
+  - anteckningar
+föreläsare: Ingela Parmryd
+date: 2025-12-01
+---
+glykys = söt (grekiska)
+lysis = sönderdelning 
+- - **-lys / -lyse / -lytic** → anger att något bryts ned eller löses upp.
+10 steg
+3 faser
+Start: Glykos
+Slut: Pyruvat
+Kommer inte fråga om strukturformer för metaboliten
+- kan vara bra 
+- SKA KUNNA namn på metaboliter och enzymer och föreståelse för reaktioner
+
+## Energiinvesteringsfas
+2 ATP förbrukas
+2 ADP skapas 
+2 $H^+$ skapas
+
+| Steg | Input            | Output                | Enzym                   | Reaktion                                                                                          | Reversibelt | Energi                      |
+| ---- | ---------------- | --------------------- | ----------------------- | ------------------------------------------------------------------------------------------------- | ----------- | --------------------------- |
+| 1    | Glykos           | glykos-6-fosfat       | hexokinas               | fosforylering<br>gruppöverförning<br>glykosinbinding<br>konformationsändring<br>$H_2O$ stängs ute | Nej         | Kräver ATP<br>Ger ADP+$H^+$ |
+| 2    | glykos-6-fosfat  | fruktos-6-fosfat      | fosfosglykosisomeras    | Isomerering<br>aldos→ketos<br>Möjliggör klyvning                                                  | Ja          |                             |
+| 3    | fruktos-6-fosfat | fruktos-1,6-bisfosfat | fosfofrukotkinas (PK-1) | fosforylering<br>gruppöverförning<br>hindrar återisomerisering                                    | Nej         | Kräver ATP<br>Ger ADP+$H^+$ |
+
+
+## Klyvningsfas
+6 kol blir 2 st 3 col
+
+| Steg | Input                 | Output                                                | Enzym   | Reaktion             | Reversibelt | Energi |
+| ---- | --------------------- | ----------------------------------------------------- | ------- | -------------------- | ----------- | ------ |
+| 4    | fruktos-1,6-bisfosfat | dihydroxyacetonfosfat +<br>glyceraldehyd-3-fosfat<br> | aldolas | klyvning 6C→2x3C<br> | Ja          |        |
+| 5    | dihydroxyacetonfosfat | glyceraldehyd-3-fosfat                                |         | triosfosfatisomeras  | Ja          |        |
+
+
+## Energiutvinningsfas
+
+6
+- dehydrokinas plockar väten (oxidation)
+- $NAD^+$ → $NADH$ oxideras
+- GA3PDH utför två reaktioner en fördelaktig och en ofördelaktig
+- tioester är intermediär - möjliggör koppling
+- ![[Pasted image 20251201104247.png|200]]
+7
+- gruppöverföring, en molekyl till en annan
+  substratnivåfosforylering ATP bildas i en reaktion gruppöverföring
+8
+- mutas - isomeriserar genom att flytta funktioell grupp
+
+Nedanstående steg sker 2 ggr
+
+| Steg | Input                  | Output                | Rev | Enzym                               | Reaktion                                                | Energi                       |
+| ---- | ---------------------- | --------------------- | --- | ----------------------------------- | ------------------------------------------------------- | ---------------------------- |
+| 6    | glyceraldehyd-3-fosfat | 1,3-bisfosfatglycerat | Ja  | glyceraldehyd-3-fosfat-dehydrokinas | oxidation (fördelaktig)<br>fosforylering (ofördelaktig) | Ger $NAD^+$ → $NADH$<br>$Pi$ |
+| 7    | 1,3-bisfosfatglycerat  | 3-fosfatglycerat      | Ja  | fosfoglyceratkinas                  | substratnivåfosforylering                               | Ger ATP                      |
+| 8    | 3-fosfatglycerat       | 2-fosfoglycerat       | Ja  | fosfoglyceratmutas                  | isomerisering                                           |                              |
+| 9    | 2-fosfoglycerat        | fosfoenolpyruvat      | Ja  | enolas                              | dehydratisering                                         | Ger $H_2O$                   |
+| 10   | fosfoenolpyruvat       | pyruvat               | Nej | pyruvatkinas                        | substratnivåfosforylering                               | Ger ATP                      |
+Vad utvinns?
+- 4 ATP
+- 2 NADH + $H^+$
+- 2 $H_2O$
+
+Varför sitter de olika enzymerna i glykolysen i ett komplex?
+- gör det snabbare om de sitter nära varandra
+- 
+
+----
+### Fosforyltransferpotential
+
+Fruktos i framförallt i levern
+- fruktos 1-fosfat
+- klyvs till deoxyacetonfosfat + glyceraldehyd
+	- deoxyacetonfosfat kan gå in i glykolysen
+	- glyceraldehyd behöver fosforylseras till glyceralaldehyd 3-fosfat
+
+Olika sockerarter utvinner olika mycket energi. Värre att äta fruktos eller glykos, fettinlagrning. Det finns inte mer energi fruktos än i glykos.
+
+Hur tar sig galaktos in i glykolysen?
+- det tar sig in i 4 steg
+- blir så småningom glykos-6-fosfat (som hittas långt upp i glykolysen)
+
+
+----
+
+### Laktosintolerans
+Enzym: laktas
+
+laktos + $H_2O$ <→ glukos + galaktos
+
+Vi har kvar 5% som vuxna av enzymet.
+Baketerier som älskar det och producerar metanol och vätgas. Vatten går även ut i floran.
+
+Fyra olika platser i världen har laktostolerans
+- varit fördelaktigt att reproducera om man kan anväanda alternativ kost när det varit brist på föda
+Avsild utveckling tll tolerans på fyra platser
+- reproduktionsfördel
+
+### Galaktitol
+
+Om galaktos ej omvandlas till galaktos till glykosintermediär
+→ ackumulering av galaktitol, lagras i linsen
+	→ vatten tas upp → grumling
+
+
+### Återbildning av NAD+ hastighetsbegränsande
+
+Om aerobt
+- ETK
+Om anaerobt
+- fermentering
+- ATP bildas med både organisk dontator och acceptor för elektroner
+	- redoxneutralt
+- Fermetering bakom alkohol, surkål, crème frache
+
+![[Pasted image 20251201112326.png|300]]
+
+
+## Glykolys vid $O_2$
+
+glykos + 2 ADP  + 2Pi + 2 $NAD^+$ → 2 pyruvat + 2$H_2O$ + 2NADH + 2$H^+$ + 2ATP
+
+### Glykolys utan $O_2$
+
+glykos + 2 ADP+ 2Pi  → 2 pyruvat + 2$H_2O$ + 2$H^+$ + 2ATP
+
+$\Delta G = -22kcal/mol$ (för hela glykolysen)
+
+-----
+
+### Reglering av enzymaktivitet
+
+inhibitorer eller stimulatorer
+konformationsändring: 
+- allosteriskt (millisekunder
+- kovalent modifiering (sekunder)
+enzymmängd
+- transkribera→translation (timmar)
+	- hormonell reglering
+separation av enzym & substrat
+- de har inte tillgång till varandra, celler som inte tar upp glykos om det inte finns 
+
+### Fosfofruktokinas
+
+Huvudsaklig regleringspunkt (3:e steget i glykolysen)
+- 1:a steget kan även bilda glykogen, 3:e är första unika steget för glykolysen
+I skelettmuskeln regleras det av energikvoten (båda allosteriska regulatorer)
+- (-) ATP: mycket ATP att göra enzymet mindre effektivt (kan spara till svårare förhållande)
+- (+) ADP: stimuleras av AMP
+- (-) om pH sjunker lägre än 6.3, så funkar inte enzymet längre
+I lever som ovan, 
+- det finns mycket energi, mycket citrat, vi behöver inte bryta ner med
+- (-) citrat
+- (+) fruktos 2,6-bisfosfat
+	- fruktos-6-fosfat
+	- feedforward
+
+### Hexokinas
+första steget i glykolysen
+muskel
+- (-) glukos-6-fosfat - feedback
+	- byggs upp mycket när fosfogruktokinas inhiberas
+lever
+- Använder glukokinas
+- 50x lägre affinitet
+
+
+### Pyruvatkinas
+10:e steget i glykolysen
+
+Muskel
+- förekommer i m-form, muskel-form
+- energikvot
+- (-) ATP (allosterisk)
+- (+) fruktos-1,6-bisfosfat (feedforward)
+Lever
+- finns i L-form
+- regleras som i muskel samt
+- (-) alanin (feedback)
+	- aminosyra men ett steg från pyruvat!
+- (-) fosforylering
+	- styrs från glykagon via PKA
+		- finns det inte glykagon finns det inte mycket blodsocker, då vill man inte köra glykolysen utan köra åt andra hållet
+
+![[Pasted image 20251201114708.png|200]]
+GLUT4 i skelettmuskel och adipocyter om det finns insulin
+- till plasmamembranet om det finns insulin $[glukos]_{blod}$ är högt
+GLUT2
+- levern & b-celler
+
+### Glykos & Cancerceller
+
+Föredrar glyklys - Warberg-effekten
+Upptäcktes för 100 år sen
+
+Man kan se det i PET-scans, som gör att man kan lokalisera tumörer.
+Kan använda det för att följa effekter av behandling.
+
+Använder glykos även när syre finns
+
+Frågor
+
+När och var förekommer glykolys under anaeroba förhållanden hos en människa?
+- alltid i erytrocyter
+- näthinnan
+- yttersta lagret av huden
+
+Varför använder cancerceller företrädesvis anaerob glykolys?
+Laktat
+- förbättrar invasion
+- hämmar immunförsvaret
+- surt är bra för cancercellen
+- behövs byggstenar
+	- glykolys intermediärer
+	- behävs även till pentosfosfatvägen som är viktig för anabolism
+
+---
+### Summering
+
+7st reversibla, 3 irreversibla (1, 3, 10)
+Oxination
+NAD+ är hastighetsbegränsande
+Anaerob och aeroba
+laktas fermenteras
+feedback, reglerar något som hänt tidigare, aktivering eller inaktiver
+feedforward tidigt steg, reglerar något senare (ofta allosteriska)
+fruktos-2,6-bisfosfat viktig regulator
+Warberg, cancerceller frodas i sur miljö och b
+
+
+

content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Instuderingsuppgifter.md

@@ -0,0 +1,8 @@
+---
+tags:
+  - biokemi
+  - glykolysen
+  - instuderingsuppgifter
+föreläsare: Ingela Parmryd
+date: 2025-12-01
+---

content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Lärandemål.md

@@ -0,0 +1,19 @@
+---
+tags:
+  - biokemi
+  - glykolysen
+  - lärandemål
+föreläsare: Ingela Parmryd
+date: 2025-12-01
+---
+Reaktioner och metaboliter i glykolysen.  
+Enzymer i glykolysen.  
+Substratnivåfosforylering.  
+Reglering av glykolysen.  
+Allosterisk, feedforward och feedback reglering.  
+Glykolys under anaeroba och aeroba förhållanden.  
+Glukostransportörer.  
+Warburgeffekten.
+
+Redogöra för glykolysens reaktioner, enzymer och reglering.  
+	Förstå skillnaden mellan anaerob och aerob glykolys.

content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Slides.md

@@ -0,0 +1,130 @@
+---
+tags:
+  - biokemi
+  - slides
+  - glykolysen
+föreläsare: Ingela Parmryd
+date: 2025-12-01
+---
+# Glykolysen
+LPG001  
+Biokemi  
+2025-12-01  
+Ingela Parmryd
+
+## Frågeställningar
+- Hur sker nedbrytningen av glukos?
+- Vilka är de olika faserna i glykolysen?
+- Vad sker i glykolysens tio steg?
+- Vad händer med glykolysens slutprodukt under anaeroba och aeroba förhållanden?
+- Hur regleras glykolysen?
+- Hur kommer glukos in i celler?
+- Vilka är kopplingarna mellan cancerceller och glykolysen?
+
+## Glykolysen kan delas in i tre faser
+**Översiktlig reaktionsformel:**  
+glukos + 2 ADP + 2 Pi + 2 NAD⁺ → 2 pyruvat + 2 ATP + 2 NADH + 2 H⁺ + 2 H₂O
+
+## Glykolysen – vad händer i de tio stegen?
+
+### Steg 1 – Glukos fångas i cellen
+- Hexokinas fosforylerar glukos
+- Glucose → Glucose-6-phosphate (G-6P)
+- ATP förbrukas
+
+### Steg 3 – Fruktos-1,6-bisfosfat bildas
+- Ny fosforylering av glukosintermediär
+- ATP förbrukas
+
+### Steg 4 – Molekylen klyvs
+Fruktos-1,6-bisfosfat →  
+- Dihydroxyacetonfosfat (DHAP)  
+- Glyceraldehyd-3-fosfat (GAP)
+
+### Steg 6 – NADH bildas
+- Oxidation av GAP
+- NAD⁺ reduceras till NADH
+
+### Steg 7 & 10 – ATP bildas
+- Steg 7: Substratnivåfosforylering från 1,3-bisfosfoglycerat
+- Steg 10: Fosfoenolpyruvat → Pyruvat (via pyruvatkinas)
+
+## Fosforyltransferpotential
+Relativ energi i fosfatbindningar:
+- högst: fosfoenolpyruvat
+- lägre: 1,3-bisfosfoglycerat
+- ATP mellanläge
+- lägst: glukos-6-fosfat
+
+## Fruktos och galaktos in i glykolysen
+- Galaktos → Glucose-6-phosphate
+- Fruktos → Fructose-6-phosphate eller DHAP/GAP (vävnadsberoende)
+
+## Laktasbrist
+- Låg laktasaktivitet → laktosintolerans
+
+## Galaktitol och katarakt
+- Ackumulering av galaktitol i linsen
+- Orsakad av reducering av galaktos
+
+## Pyruvats öde styrs av syre
+Anaerobt:
+- Pyruvat → Laktat eller Etanol
+- Regenererar NAD⁺
+
+Aerobt:
+- Pyruvat → Acetyl-CoA
+- Vidare oxidation i citronsyracykeln
+
+## Reglering av glykolysen
+
+### Fosfofruktokinas (PFK)
+- Allosterisk kontroll i skelettmuskler av ATP/AMP
+- Hög ATP hämmar, AMP stimulerar
+- Energi-status styr flödet
+
+### Fruktos-2,6-bisfosfat (i lever)
+- Potent aktivator av PFK
+
+### Pyruvatkinas
+- Fosforylering (inaktiv)
+- Defosforylering (aktiv)
+- Fruktos-1,6-bisfosfat stimulerar
+- Alanin hämmar
+
+## Glukostransport
+- Glukos tas in via faciliterad diffusion
+- Olika GLUT med olika affiniteter och vävnadsfördelning
+
+Transportör | KM | Celltyp
+---|---|---
+GLUT1 | 1 mM | Nästan alla
+GLUT2 | 15–20 mM | Lever & β-celler
+GLUT3 | 1 mM | Nästan alla
+GLUT4 | 5 mM | Skelettmuskler & adipocyter
+GLUT5 | – | Tunntarm (fruktos)
+
+## Warburgeffekten
+- Cancerceller använder glykolys även vid god syretillgång
+- Hög glykolysaktivitet kan användas för bilddiagnostik (t.ex. PET)
+
+## Begrepp
+- Glykolysen  
+- Energiinvesteringsfas  
+- Klyvningsfas  
+- Energiutvinningsfas  
+- Irreversibla steg  
+- Hexokinas/Glukokinas  
+- Fosfofruktokinas  
+- Glyceraldehyd-3-fosfatdehydrogenas  
+- Fosfoglyceratkinas  
+- Pyruvatkinas  
+- Substratnivåfosforylering  
+- Glykolys under anaeroba/aeroba förhållanden  
+- Fermentering  
+- Allosterisk reglering  
+- Feedbackreglering  
+- Feedforwardreglering  
+- Fruktos-2,6-bisfosfat  
+- Glukostransportörer  
+- Warburgeffekten