diff --git a/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Anteckningar.md b/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Anteckningar.md new file mode 100644 index 0000000..84268f8 --- /dev/null +++ b/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Anteckningar.md @@ -0,0 +1,236 @@ +--- +tags: + - biokemi + - glykolysen + - anteckningar +föreläsare: Ingela Parmryd +date: 2025-12-01 +--- +glykys = söt (grekiska) +lysis = sönderdelning +- - **-lys / -lyse / -lytic** → anger att något bryts ned eller löses upp. +10 steg +3 faser +Start: Glykos +Slut: Pyruvat +Kommer inte fråga om strukturformer för metaboliten +- kan vara bra +- SKA KUNNA namn på metaboliter och enzymer och föreståelse för reaktioner + +## Energiinvesteringsfas +2 ATP förbrukas +2 ADP skapas +2 $H^+$ skapas + +| Steg | Input | Output | Enzym | Reaktion | Reversibelt | Energi | +| ---- | ---------------- | --------------------- | ----------------------- | ------------------------------------------------------------------------------------------------- | ----------- | --------------------------- | +| 1 | Glykos | glykos-6-fosfat | hexokinas | fosforylering
gruppöverförning
glykosinbinding
konformationsändring
$H_2O$ stängs ute | Nej | Kräver ATP
Ger ADP+$H^+$ | +| 2 | glykos-6-fosfat | fruktos-6-fosfat | fosfosglykosisomeras | Isomerering
aldos→ketos
Möjliggör klyvning | Ja | | +| 3 | fruktos-6-fosfat | fruktos-1,6-bisfosfat | fosfofrukotkinas (PK-1) | fosforylering
gruppöverförning
hindrar återisomerisering | Nej | Kräver ATP
Ger ADP+$H^+$ | + + +## Klyvningsfas +6 kol blir 2 st 3 col + +| Steg | Input | Output | Enzym | Reaktion | Reversibelt | Energi | +| ---- | --------------------- | ----------------------------------------------------- | ------- | -------------------- | ----------- | ------ | +| 4 | fruktos-1,6-bisfosfat | dihydroxyacetonfosfat +
glyceraldehyd-3-fosfat
| aldolas | klyvning 6C→2x3C
| Ja | | +| 5 | dihydroxyacetonfosfat | glyceraldehyd-3-fosfat | | triosfosfatisomeras | Ja | | + + +## Energiutvinningsfas + +6 +- dehydrokinas plockar väten (oxidation) +- $NAD^+$ → $NADH$ oxideras +- GA3PDH utför två reaktioner en fördelaktig och en ofördelaktig +- tioester är intermediär - möjliggör koppling +- ![[Pasted image 20251201104247.png|200]] +7 +- gruppöverföring, en molekyl till en annan + substratnivåfosforylering ATP bildas i en reaktion gruppöverföring +8 +- mutas - isomeriserar genom att flytta funktioell grupp + +Nedanstående steg sker 2 ggr + +| Steg | Input | Output | Rev | Enzym | Reaktion | Energi | +| ---- | ---------------------- | --------------------- | --- | ----------------------------------- | ------------------------------------------------------- | ---------------------------- | +| 6 | glyceraldehyd-3-fosfat | 1,3-bisfosfatglycerat | Ja | glyceraldehyd-3-fosfat-dehydrokinas | oxidation (fördelaktig)
fosforylering (ofördelaktig) | Ger $NAD^+$ → $NADH$
$Pi$ | +| 7 | 1,3-bisfosfatglycerat | 3-fosfatglycerat | Ja | fosfoglyceratkinas | substratnivåfosforylering | Ger ATP | +| 8 | 3-fosfatglycerat | 2-fosfoglycerat | Ja | fosfoglyceratmutas | isomerisering | | +| 9 | 2-fosfoglycerat | fosfoenolpyruvat | Ja | enolas | dehydratisering | Ger $H_2O$ | +| 10 | fosfoenolpyruvat | pyruvat | Nej | pyruvatkinas | substratnivåfosforylering | Ger ATP | +Vad utvinns? +- 4 ATP +- 2 NADH + $H^+$ +- 2 $H_2O$ + +Varför sitter de olika enzymerna i glykolysen i ett komplex? +- gör det snabbare om de sitter nära varandra +- + +---- +### Fosforyltransferpotential + +Fruktos i framförallt i levern +- fruktos 1-fosfat +- klyvs till deoxyacetonfosfat + glyceraldehyd + - deoxyacetonfosfat kan gå in i glykolysen + - glyceraldehyd behöver fosforylseras till glyceralaldehyd 3-fosfat + +Olika sockerarter utvinner olika mycket energi. Värre att äta fruktos eller glykos, fettinlagrning. Det finns inte mer energi fruktos än i glykos. + +Hur tar sig galaktos in i glykolysen? +- det tar sig in i 4 steg +- blir så småningom glykos-6-fosfat (som hittas långt upp i glykolysen) + + +---- + +### Laktosintolerans +Enzym: laktas + +laktos + $H_2O$ <→ glukos + galaktos + +Vi har kvar 5% som vuxna av enzymet. +Baketerier som älskar det och producerar metanol och vätgas. Vatten går även ut i floran. + +Fyra olika platser i världen har laktostolerans +- varit fördelaktigt att reproducera om man kan anväanda alternativ kost när det varit brist på föda +Avsild utveckling tll tolerans på fyra platser +- reproduktionsfördel + +### Galaktitol + +Om galaktos ej omvandlas till galaktos till glykosintermediär +→ ackumulering av galaktitol, lagras i linsen + → vatten tas upp → grumling + + +### Återbildning av NAD+ hastighetsbegränsande + +Om aerobt +- ETK +Om anaerobt +- fermentering +- ATP bildas med både organisk dontator och acceptor för elektroner + - redoxneutralt +- Fermetering bakom alkohol, surkål, crème frache + +![[Pasted image 20251201112326.png|300]] + + +## Glykolys vid $O_2$ + +glykos + 2 ADP + 2Pi + 2 $NAD^+$ → 2 pyruvat + 2$H_2O$ + 2NADH + 2$H^+$ + 2ATP + +### Glykolys utan $O_2$ + +glykos + 2 ADP+ 2Pi → 2 pyruvat + 2$H_2O$ + 2$H^+$ + 2ATP + +$\Delta G = -22kcal/mol$ (för hela glykolysen) + +----- + +### Reglering av enzymaktivitet + +inhibitorer eller stimulatorer +konformationsändring: +- allosteriskt (millisekunder +- kovalent modifiering (sekunder) +enzymmängd +- transkribera→translation (timmar) + - hormonell reglering +separation av enzym & substrat +- de har inte tillgång till varandra, celler som inte tar upp glykos om det inte finns + +### Fosfofruktokinas + +Huvudsaklig regleringspunkt (3:e steget i glykolysen) +- 1:a steget kan även bilda glykogen, 3:e är första unika steget för glykolysen +I skelettmuskeln regleras det av energikvoten (båda allosteriska regulatorer) +- (-) ATP: mycket ATP att göra enzymet mindre effektivt (kan spara till svårare förhållande) +- (+) ADP: stimuleras av AMP +- (-) om pH sjunker lägre än 6.3, så funkar inte enzymet längre +I lever som ovan, +- det finns mycket energi, mycket citrat, vi behöver inte bryta ner med +- (-) citrat +- (+) fruktos 2,6-bisfosfat + - fruktos-6-fosfat + - feedforward + +### Hexokinas +första steget i glykolysen +muskel +- (-) glukos-6-fosfat - feedback + - byggs upp mycket när fosfogruktokinas inhiberas +lever +- Använder glukokinas +- 50x lägre affinitet + + +### Pyruvatkinas +10:e steget i glykolysen + +Muskel +- förekommer i m-form, muskel-form +- energikvot +- (-) ATP (allosterisk) +- (+) fruktos-1,6-bisfosfat (feedforward) +Lever +- finns i L-form +- regleras som i muskel samt +- (-) alanin (feedback) + - aminosyra men ett steg från pyruvat! +- (-) fosforylering + - styrs från glykagon via PKA + - finns det inte glykagon finns det inte mycket blodsocker, då vill man inte köra glykolysen utan köra åt andra hållet + +![[Pasted image 20251201114708.png|200]] +GLUT4 i skelettmuskel och adipocyter om det finns insulin +- till plasmamembranet om det finns insulin $[glukos]_{blod}$ är högt +GLUT2 +- levern & b-celler + +### Glykos & Cancerceller + +Föredrar glyklys - Warberg-effekten +Upptäcktes för 100 år sen + +Man kan se det i PET-scans, som gör att man kan lokalisera tumörer. +Kan använda det för att följa effekter av behandling. + +Använder glykos även när syre finns + +Frågor + +När och var förekommer glykolys under anaeroba förhållanden hos en människa? +- alltid i erytrocyter +- näthinnan +- yttersta lagret av huden + +Varför använder cancerceller företrädesvis anaerob glykolys? +Laktat +- förbättrar invasion +- hämmar immunförsvaret +- surt är bra för cancercellen +- behövs byggstenar + - glykolys intermediärer + - behävs även till pentosfosfatvägen som är viktig för anabolism + +--- +### Summering + +7st reversibla, 3 irreversibla (1, 3, 10) +Oxination +NAD+ är hastighetsbegränsande +Anaerob och aeroba +laktas fermenteras +feedback, reglerar något som hänt tidigare, aktivering eller inaktiver +feedforward tidigt steg, reglerar något senare (ofta allosteriska) +fruktos-2,6-bisfosfat viktig regulator +Warberg, cancerceller frodas i sur miljö och b + + + diff --git a/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Instuderingsuppgifter.md b/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Instuderingsuppgifter.md new file mode 100644 index 0000000..2c5382d --- /dev/null +++ b/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Instuderingsuppgifter.md @@ -0,0 +1,8 @@ +--- +tags: + - biokemi + - glykolysen + - instuderingsuppgifter +föreläsare: Ingela Parmryd +date: 2025-12-01 +--- diff --git a/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Lärandemål.md b/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Lärandemål.md new file mode 100644 index 0000000..fed6c76 --- /dev/null +++ b/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Lärandemål.md @@ -0,0 +1,19 @@ +--- +tags: + - biokemi + - glykolysen + - lärandemål +föreläsare: Ingela Parmryd +date: 2025-12-01 +--- +Reaktioner och metaboliter i glykolysen. +Enzymer i glykolysen. +Substratnivåfosforylering. +Reglering av glykolysen. +Allosterisk, feedforward och feedback reglering. +Glykolys under anaeroba och aeroba förhållanden. +Glukostransportörer. +Warburgeffekten. + +Redogöra för glykolysens reaktioner, enzymer och reglering. + Förstå skillnaden mellan anaerob och aerob glykolys. \ No newline at end of file diff --git a/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Slides.md b/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Slides.md new file mode 100644 index 0000000..2726e83 --- /dev/null +++ b/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Slides.md @@ -0,0 +1,130 @@ +--- +tags: + - biokemi + - slides + - glykolysen +föreläsare: Ingela Parmryd +date: 2025-12-01 +--- +# Glykolysen +LPG001 +Biokemi +2025-12-01 +Ingela Parmryd + +## Frågeställningar +- Hur sker nedbrytningen av glukos? +- Vilka är de olika faserna i glykolysen? +- Vad sker i glykolysens tio steg? +- Vad händer med glykolysens slutprodukt under anaeroba och aeroba förhållanden? +- Hur regleras glykolysen? +- Hur kommer glukos in i celler? +- Vilka är kopplingarna mellan cancerceller och glykolysen? + +## Glykolysen kan delas in i tre faser +**Översiktlig reaktionsformel:** +glukos + 2 ADP + 2 Pi + 2 NAD⁺ → 2 pyruvat + 2 ATP + 2 NADH + 2 H⁺ + 2 H₂O + +## Glykolysen – vad händer i de tio stegen? + +### Steg 1 – Glukos fångas i cellen +- Hexokinas fosforylerar glukos +- Glucose → Glucose-6-phosphate (G-6P) +- ATP förbrukas + +### Steg 3 – Fruktos-1,6-bisfosfat bildas +- Ny fosforylering av glukosintermediär +- ATP förbrukas + +### Steg 4 – Molekylen klyvs +Fruktos-1,6-bisfosfat → +- Dihydroxyacetonfosfat (DHAP) +- Glyceraldehyd-3-fosfat (GAP) + +### Steg 6 – NADH bildas +- Oxidation av GAP +- NAD⁺ reduceras till NADH + +### Steg 7 & 10 – ATP bildas +- Steg 7: Substratnivåfosforylering från 1,3-bisfosfoglycerat +- Steg 10: Fosfoenolpyruvat → Pyruvat (via pyruvatkinas) + +## Fosforyltransferpotential +Relativ energi i fosfatbindningar: +- högst: fosfoenolpyruvat +- lägre: 1,3-bisfosfoglycerat +- ATP mellanläge +- lägst: glukos-6-fosfat + +## Fruktos och galaktos in i glykolysen +- Galaktos → Glucose-6-phosphate +- Fruktos → Fructose-6-phosphate eller DHAP/GAP (vävnadsberoende) + +## Laktasbrist +- Låg laktasaktivitet → laktosintolerans + +## Galaktitol och katarakt +- Ackumulering av galaktitol i linsen +- Orsakad av reducering av galaktos + +## Pyruvats öde styrs av syre +Anaerobt: +- Pyruvat → Laktat eller Etanol +- Regenererar NAD⁺ + +Aerobt: +- Pyruvat → Acetyl-CoA +- Vidare oxidation i citronsyracykeln + +## Reglering av glykolysen + +### Fosfofruktokinas (PFK) +- Allosterisk kontroll i skelettmuskler av ATP/AMP +- Hög ATP hämmar, AMP stimulerar +- Energi-status styr flödet + +### Fruktos-2,6-bisfosfat (i lever) +- Potent aktivator av PFK + +### Pyruvatkinas +- Fosforylering (inaktiv) +- Defosforylering (aktiv) +- Fruktos-1,6-bisfosfat stimulerar +- Alanin hämmar + +## Glukostransport +- Glukos tas in via faciliterad diffusion +- Olika GLUT med olika affiniteter och vävnadsfördelning + +Transportör | KM | Celltyp +---|---|--- +GLUT1 | 1 mM | Nästan alla +GLUT2 | 15–20 mM | Lever & β-celler +GLUT3 | 1 mM | Nästan alla +GLUT4 | 5 mM | Skelettmuskler & adipocyter +GLUT5 | – | Tunntarm (fruktos) + +## Warburgeffekten +- Cancerceller använder glykolys även vid god syretillgång +- Hög glykolysaktivitet kan användas för bilddiagnostik (t.ex. PET) + +## Begrepp +- Glykolysen +- Energiinvesteringsfas +- Klyvningsfas +- Energiutvinningsfas +- Irreversibla steg +- Hexokinas/Glukokinas +- Fosfofruktokinas +- Glyceraldehyd-3-fosfatdehydrogenas +- Fosfoglyceratkinas +- Pyruvatkinas +- Substratnivåfosforylering +- Glykolys under anaeroba/aeroba förhållanden +- Fermentering +- Allosterisk reglering +- Feedbackreglering +- Feedforwardreglering +- Fruktos-2,6-bisfosfat +- Glukostransportörer +- Warburgeffekten \ No newline at end of file diff --git a/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Slides.pdf.pdf b/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Slides.pdf.pdf new file mode 100644 index 0000000..66b73fc --- /dev/null +++ b/content/Biokemi/Metabolism/Glykolysen/Slides.pdf.pdf @@ -0,0 +1,3 @@ +version https://git-lfs.github.com/spec/v1 +oid sha256:5d633ebce051029514d15de24a04ceb9a4ac45c35c697c2fcb7b451c7ba3d365 +size 3263347 diff --git a/content/attachments/Pasted image 20251201104247.png b/content/attachments/Pasted image 20251201104247.png new file mode 100644 index 0000000..f83aa04 Binary files /dev/null and b/content/attachments/Pasted image 20251201104247.png differ diff --git a/content/attachments/Pasted image 20251201112326.png b/content/attachments/Pasted image 20251201112326.png new file mode 100644 index 0000000..c6354a7 Binary files /dev/null and b/content/attachments/Pasted image 20251201112326.png differ diff --git a/content/attachments/Pasted image 20251201114708.png b/content/attachments/Pasted image 20251201114708.png new file mode 100644 index 0000000..63e907c Binary files /dev/null and b/content/attachments/Pasted image 20251201114708.png differ