vault backup: 2025-11-20 16:15:04

content/.obsidian/workspace.json

@@ -13,12 +13,32 @@
             "state": {
               "type": "markdown",
               "state": {
-                "file": "PU/Tystnadsplikt AI-svar.md",
+                "file": "Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/Anteckningar.md",
                 "mode": "source",
                 "source": false
               },
               "icon": "lucide-file",
-              "title": "Tystnadsplikt AI-svar"
+              "title": "Anteckningar"
+            }
+          }
+        ]
+      },
+      {
+        "id": "656e3366de8b7874",
+        "type": "tabs",
+        "children": [
+          {
+            "id": "a08a21064c3e182b",
+            "type": "leaf",
+            "state": {
+              "type": "markdown",
+              "state": {
+                "file": "Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/Stoff.md",
+                "mode": "source",
+                "source": false
+              },
+              "icon": "lucide-file",
+              "title": "Stoff"
             }
           }
         ]
@@ -180,9 +200,11 @@
       "obsidian-git:Open Git source control": false
     }
   },
-  "active": "6b69c12590341656",
+  "active": "a08a21064c3e182b",
   "lastOpenFiles": [
     "Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/Anteckningar.md",
+    "Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/Stoff.md",
+    "PU/Tystnadsplikt AI-svar.md",
     "Biokemi/Cellulära processer/Kromatin/Anteckningar.md",
     "Biokemi/!Template/Anteckningar.md",
     "attachments/Pasted image 20251120114922.png",
@@ -225,8 +247,6 @@
     "Biokemi/Makromolekyler",
     "Biokemi/Cellulära processer/Initiering och terminering av DNA replikation/Anteckningar.md",
     "Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes",
-    "Biokemi/Cellulära processer/Initiering och terminering av DNA replikation/Instuderingsfrågor.md",
+    "Biokemi/Cellulära processer/Initiering och terminering av DNA replikation/Instuderingsfrågor.md"
-    "Biokemi/Cellulära processer/Initiering och terminering av DNA replikation/Lärandemål.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/Initiering och terminering av DNA replikation/Provfrågor.md"
   ]
 }

content/Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/Stoff.md

@@ -0,0 +1,30 @@
+Det sitter 3 fosfatgrupper i 5'-änden
+En fosfodiesterbrygga är bindningen som kopplar ihop nukleotider i DNA och RNA. Den bildas när 3’-OH på en sockergrupp binder till 5’-fosfatet på nästa nukleotid.
+För varje nukleotid som sätts på kedjan krävs en ATP, en fosfatgrupp går in i fosfodiesterbryggan, 2 fosfatgrupper spjälkas bort som energi
+RNA kopieras av mallsträngen, den får information som är identisk till den kodande strängen.
+RNA-polymeras öppnar upp DNA-strängen så RNA kan replikeras
+RNA-polymeras öppnning är ~17 baspar lång, för att ge lagom plats för mallsträng, aktivt säte och växande RNA, utan att kosta mer energi än nödvändigt.
+NTP-kanalen är en smal, laddad tunnel som leder fria nukleotider rätt in till det aktiva sätet och ökar träffsäkerheten via elektrostatiska interaktioner.
+Ribosomen är uppbyggd av ribosomalt RNA (rRNA)
+RNA-polymeras II ger upphov till ribosomalt RNA (rRNA)
+RNA-polymeras II är viktigast eftersom det gör **mRNA**, alltså utgångspunkten för alla proteiner. Det driver därmed huvuddelen av genuttrycket.
+TATA-boxen består av en sekvens av AT-nukleotider med lägre smältpunkt (2 isf 3 vätebindingar)
+Promotor är den region av DNA som RNA polymeraset binder vid för att börja transkriptionen
+RNA-polymeras behöver hjälp att hitta startpunkten, och detta sker via promotorn, särskilt TATA-boxen och de basala transkriptionsfaktorerna
+De basala transkriptionsfaktorerna är: TFIID, TFIIA, TFIIB, TFIIE, TFIIF och TFIIH.
+TATA-boxen i promotorn ligger typiskt –25 till –30 baspar uppströms om transkriptionsstart
+De viktigaste transkriptionsfaktorerna är TFIID och TFIIH
+TFIID är transkriptionsfaktorn som startar transkriptionen
+TFIIH är transkriptionsfaktorn som startar elongeringen
+Elongering är fasen där RNA-polymeras rör sig längs DNA och förlänger RNA-kedjan genom att bygga in fler nukleotider.
+Första steget vid initiering av transkription tas när det TATA-bindande proteinet (TBP) binder in till promotorns TATA-box.
+TBP binder till minor groove och inducerar en kraftig böj i DNA – 90°
+TBP ingår i ett större komplex, som kallas TFIID
+Preinitieringskomplexet börjar med TFIID binder till TATA box via TBP.
+TFIIA binder in till TFIID
+TFIIB, F, E, H binder in till TTFIID
+TFIIH öppnar DNA med sin helikasaktivitet och fosforylerar CTD med sin kinasaktivitet, vilket startar elongeringen.
+CTD är den C-terminala domänen på RNA-pol II där fosfosvansen sitter och regleras genom fosforylering.
+CTD har många fosforyleringsställen där fosfatgrupper binder för att reglera polymerasets växling mellan initiering, elongering och RNA-processing
+
+