1
0
Files
medical-notes/anki_import.csv

89 KiB

1#deck column:3
2Describe L1/2 in terms of receptor and ligand binding.;L₁/₂ är den ligandkoncentration som ger 50 % receptorockupation, den speglar bindningsaffiniteten mellan ligand och receptor.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Hemoglobin
3Explain the basic structure of myoglobin including the porphyrin ring and Fe.;Myoglobin är en monomerisk polypeptid med en heme-grupp, heme består av en porfyrinring med fyra pyrrolringar och en Fe²⁺-jon i centrum som binder O₂.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Hemoglobin
4What are proximal and distal histidine? How do they interact with the heme molecule?;Proximal histidin binder direkt till Fe²⁺ i heme, distal histidin stabiliserar bundet O₂ via vätebindning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Hemoglobin
5How does O₂ bind to myoglobin? Compare with carbon monoxide (CO).;O₂ binder snett till Fe²⁺ och stabiliseras av distal histidin, CO binder linjärt till Fe²⁺ med mycket högre affinitet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Hemoglobin
6Explain the basic structure of hemoglobin and its structural states.;Hemoglobin är ett tetramert protein (α₂β₂) med fyra heme-grupper, det finns i T-state (låg O₂-affinitet) och R-state (hög O₂-affinitet).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Hemoglobin
7What is cooperative binding? Describe in the context of hemoglobin.;Kooperativ bindning innebär att inbindning av en O₂-molekyl ökar affiniteten för nästa, i Hb sker detta via T→R-övergång.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Hemoglobin
8Compare the dissociation curves of myoglobin and hemoglobin. What does this mean for O₂ transport?;Myoglobin har hyperbolisk kurva (hög affinitet), hemoglobin har sigmoidal kurva vilket möjliggör effektiv O₂-upptag i lungor och frisättning i vävnad.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Hemoglobin
9Define an allosteric regulator.;En molekyl som binder till ett protein på annan plats än aktiva sätet och ändrar dess funktion eller affinitet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Hemoglobin
10How is hemoglobin affected by CO, CO₂, H⁺, and 2,3-BPG?;CO binder heme starkt → blockerar O₂-bindning, CO₂ och H⁺ binder till globindelen → stabiliserar T-state, 2,3-BPG binder mellan β-kedjor → sänker O₂-affinitet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Hemoglobin
11Define Bohr effect and explain how it influences oxygen binding.;Bohr-effekten är att ökat H⁺/CO₂ minskar Hb:s O₂-affinitet, vilket underlättar syrefrisättning i vävnader.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Hemoglobin
12How does fetal hemoglobin (HbF) differ from adult hemoglobin (HbA) and what effect does this have?;HbF har γ-kedjor istället för β-kedjor, binder 2,3-BPG svagare och har därför högre O₂-affinitet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Hemoglobin
13Explain the molecular and structural background of sickle-cell disease.;En punktmutation i β-globin (Glu→Val) ger hydrofoba interaktioner, Hb-polymerisering vid låg O₂ och sickelformade erytrocyter.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Hemoglobin
14Redogör för nomenklaturen för fettsyror.;Antal kolatomer:antal dubbelbindningar (t.ex. 18:1), dubbelbindningars position anges från karboxyländen (Δ) eller metyländen (ω).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
15Vad betyder det att en fettsyra är en omegafettsyra?;Den klassificeras efter positionen för första dubbelbindningen räknat från metyländen (ω-änden).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
16I vilken form lagras fett i adipocyter?;Som triacylglyceroler i lipiddroppar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
17Varför bildas ett tvåfas-system av olja och vatten?;På grund av hydrofoba interaktioner, opolära lipider blandar sig inte med polärt vatten.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
18a) kedjelängden?;Kortare kedjor ger högre fluiditet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
19b) antalet dubbelbindningar?;Fler dubbelbindningar ger högre fluiditet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
20c) typ av dubbelbindning?;Cis ökar fluiditet, trans ger mer packning och lägre fluiditet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
21Vilken typ av dubbelbindningar bildar människans celler?;Endast cis-dubbelbindningar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
22Rita strukturen för kolesterol.;Steroidkärna med fyra sammanfogade ringar, en OH-grupp och en kolvätesvans.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
23Rita den principiella strukturen för triacylglycerol.;Glycerolryggrad med tre fettsyror bundna via esterbindningar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
24Rita den principiella strukturen för fosfolipider.;Glycerol med två fettsyror och en fosfatgrupp med polär huvudgrupp.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
25Rita den principiella strukturen för glykolipider.;Lipidryggrad med fettsyror och en eller flera kolhydrater som huvudgrupp.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
26Ange hydrofil och hydrofob del hos amfipatiska lipider.;Kolesterol: OH = hydrofil, ringsystem/svans = hydrofob. Fosfolipider: fosfat-huvud = hydrofil, fettsyror = hydrofoba. Glykolipider: kolhydrat = hydrofil, fettsyror = hydrofoba.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
27Varför bildar fria fettsyror miceller medan fosfo- och glykolipider bildar dubbelskikt?;Fettsyror har en hydrofob svans → miceller, fosfo-/glykolipider har två svansar → stabilt dubbelskikt.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
28a) Fettsyror från födan till celler?;Kylomikroner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
29b) Kolesterol från födan till levern?;Kylomikronrester.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
30c) Fettsyror från levern till övriga celler?;VLDL.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
31d) Kolesterol till celler med rätt receptor?;LDL.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
32e) Kolesterol från celler till levern?;HDL.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Lipider
33Kolhydrater kan klassificeras som ketoser eller aldoser. Vad innebär detta?;Aldoser har en aldehydgrupp (–CHO) ytterst i kedjan, ketoser har en ketongrupp (C=O) inne i kolkedjan.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
34Vad är en Fischer-projektion?;En 2D-representation av stereokemi där kolkedjan ritas vertikalt och horisontella bindningar pekar ut ur planet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
35Vad är en Haworth-projektion?;En ringformad 2D-representation av cykliska kolhydrater som visar α- och β-anomerer.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
36En cyklisk kolhydrat är antingen i α- eller β-form. Vad innebär detta?;Det beskriver orienteringen av OH på det anomera kolet relativt CH₂OH, samma sida = β, motsatt = α.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
37Vad är en glykosidbindning?;En kovalent bindning mellan det anomera kolet i en monosackarid och en OH- eller NH-grupp.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
38Beskriv skillnader och likheter mellan glukos, N-acetylglukosamin och sialinsyra.;Alla är monosackarider, N-acetylglukosamin har en acetamidgrupp och sialinsyra är negativt laddad och mer komplex.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
39Glukos lagras hos människa i form av glykogen. Hur är glykogen uppbyggt?;En starkt förgrenad polymer av glukos med α(1→4)-bindningar och α(1→6)-förgreningar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
40Hos växter lagras glukos som stärkelse. Skillnader och likheter med glykogen?;Stärkelse består av amylose och amylopektin, mindre förgrenat än glykogen men samma bindningstyper.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
41Varför kan människor inte tillgodogöra sig glukos från cellulosa?;Cellulosa har β(1→4)-bindningar som människan saknar enzym (cellulas) för att bryta.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
42Tre skäl till att tre monosackarider kan bära mer information än en tripeptid.;Fler bindningspositioner, α/β-anomerer och möjlighet till förgrening.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
43Vad innebär laktosintolerans?;Brist på enzymet laktas → laktos spjälkas ej, fermenteras i tjocktarmen och ger GI-symtom.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
44Vad innebär galaktosemi?;Enzymdefekt i galaktosmetabolismen som leder till ansamling av galaktos/galaktos-1-fosfat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
45Vad är:;Långa, linjära polysackarider av upprepade disackarider, ofta negativt laddade.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
46b) proteoglykan?;Protein med kovalent bundna glykosaminoglykaner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
47c) glykoprotein?;Protein med korta, förgrenade kolhydratkedjor.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
48d) glykolipid?;Lipid med kovalent bunden kolhydrat, ofta i cellmembran.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
49Skillnader och likheter mellan proteoglykaner och glykoproteiner.;Båda är protein–kolhydrat-komplex, proteoglykaner domineras av kolhydrat, glykoproteiner av protein.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
50Redogör för AB0-blodgruppssystemet.;Blodgrupper baseras på kolhydratantigener (A, B) på erytrocyter, O saknar dessa.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
51Hur är barns blodgrupp kopplad till föräldrarnas?;AB0 ärvs autosomalt med A och B som kodominanta och O recessiv.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
52Antikroppar mot blodgrupper vid:;Anti-B.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
53b) blodgrupp B;Anti-A.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
54c) blodgrupp O;Anti-A och anti-B.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
55Hur påverkar blodgrupper vid transfusion av:;Plasmans antikroppar är avgörande, kompatibilitet krävs.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
56b) röda blodkroppar;Erytrocyternas antigen måste vara kompatibla med mottagarens antikroppar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
57Två vanliga bindningstyper mellan kolhydrat och protein?;N-länkad (Asn) och O-länkad (Ser/Thr) glykosylering.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
58Vad är ett lektin?;Ett protein som specifikt binder kolhydrater utan enzymatisk aktivitet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
59Vad kallas enzymer som bildar glykosidbindningar?;Glykosyltransferaser.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolhydrater
60Vad är den centrala dogmen?;Genetisk information flödar från DNA → RNA → protein.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotider
61Hur skiljer sig RNA från DNA?;RNA har ribos, uracil och är oftast enkelsträngat, DNA har deoxyribos, tymin och är dubbelsträngat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotider
62Hur numreras kolatomer i ribos/deoxyribos och var bildas fosfodiesterbindningar?;Kolatomer numreras 1′–5′, fosfodiesterbindningar bildas mellan 3′-OH och 5′-fosfat, baser sitter på 1′-kolet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotider
63Vad är skillnaden mellan en nukleosid och en nukleotid?;Nukleosid = socker + bas, nukleotid = nukleosid + fosfat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotider
64Hur skiljer sig AMP, ADP och ATP?;De skiljer sig i antal fosfatgrupper: en, två respektive tre.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotider
65Namn på nukleosider och nukleotider i RNA och DNA.;RNA: adenosin, guanosin, cytidin, uridin, DNA: deoxiadenosin, deoxiguanosin, deoxicytidin, deoxitymidin.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotider
66I vilken riktning syntetiseras DNA och RNA?;Alltid i 5′→3′-riktning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotider
67Beskriv en dubbelsträngad DNA-helix av B-typ.;Högergängad helix med ~10,5 bp per varv, strängarna är antiparallella (5′→3′ och 3′→5′) och komplementära (A–T, G–C).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotider
68Vad innebär antiparallella och komplementära strängar?;Antiparallella: motsatt riktning, komplementära: basparar specifikt via vätebindningar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotider
69Vad menas med major och minor groove?;Ojämna fåror i DNA-helixen där proteiner kan binda, major groove är bredare än minor groove.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotider
70Vilka krafter stabiliserar DNA-helixen?;Vätebindningar mellan baser, basstackning (hydrofoba/van der Waals) och joninteraktioner med ryggraden.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotider
71Hur påverkar basinnehåll DNA:s smältpunkt (Tm)?;Högre GC-innehåll ger högre Tm, A–T har 2 vätebindningar, G–C har 3.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotider
72Vad menas med att replikation är semikonservativ?;Varje dotter-DNA innehåller en gammal och en nysyntetiserad sträng.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotider
73Vilka organeller finns i eukaryota celler?;Cellkärna, mitokondrier, ER (rER och sER), Golgiapparaten, lysosomer, peroxisomer, ribosomer, cytoskelett och cellmembran.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
74Vad sker i den eukaryota cellens olika organeller?;Mitokondrier: ATP-produktion, rER: proteinsyntes, sER: lipidsyntes/avgiftning, Golgi: modifiering och sortering, lysosomer: nedbrytning, cellkärna: DNA/RNA, cytoskelett: struktur och transport, cellmembran: barriär och signalering.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
75Vad säger termodynamikens första lag?;Energi kan inte skapas eller förstöras, endast omvandlas.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
76Vad säger termodynamikens andra lag?;Den totala entropin i ett isolerat system ökar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
77Vad är entropi?;Ett mått på oordning eller antalet möjliga mikrotillstånd i ett system.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
78Varför måste en cell orsaka oordning någon annanstans för att behålla sin ordning?;Cellen är inte ett isolerat system och exporterar entropi genom energiförbrukning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
79Vilka grundämnen är vanligast i biokemiska molekyler och vad karaktäriserar dem?;Kol (4 bindningar, molekylryggrad), väte (1 bindning), syre (2 bindningar, elektronegativt), kväve (3 bindningar).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
80Vad karaktäriserar en hydrofil molekyl?;Polär eller laddad, kan bilda vätebindningar med vatten.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
81Vad karaktäriserar en hydrofob molekyl?;Opolär, kan inte bilda vätebindningar med vatten.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
82Vad karaktäriserar en kovalent bindning?;Delning av ett eller flera elektronpar mellan atomer, stark bindning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
83Vilka typer av kovalenta bindningar kan bildas mellan två kolatomer?;Enkel-, dubbel- och trippelbindning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
84Hur stark är en kovalent bindning?;Mycket stark, starkare än de flesta icke-kovalenta bindningar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
85Vad menas med resonansstabilisering?;Elektroner är delokaliserade över flera atomer, vilket stabiliserar bindningen.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
86Mellan vad bildas jonbindningar/interaktioner?;Mellan motsatt laddade joner (katjon och anjon).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
87Vad påverkar styrkan hos en jonbindning/interaktion?;Jonernas laddning, avståndet mellan dem och omgivningens dielektricitetskonstant.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
88Vad innebär det att en molekyl är polär?;Ojämn laddningsfördelning som ger en permanent dipol.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
89Vad karaktäriserar en vätebindning?;Attraktion mellan H bundet till O/N och ett fritt elektronpar på O/N.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
90Hur stark är en vätebindning?;Svagare än kovalent bindning men starkare än vanliga dipol–dipol-interaktioner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
91Vilka atomer kan vara acceptorer i vätebindningar?;Syre och kväve (ibland fluor).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
92Vad gör vatten till ett bra lösningsmedel i celler?;Poläritet och förmåga att bilda många vätebindningar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
93Vad är van der Waals-krafter?;Mycket svaga, kortdistansinteraktioner från tillfälliga dipoler.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
94På vilket avstånd förekommer van der Waals-krafter?;Vid mycket korta avstånd, cirka 1,5–2,0 Å.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
95Hur starka är van der Waals-krafter?;Mycket svaga, men betydelsefulla när många samverkar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
96Vad menas med den hydrofoba effekten?;Opolära molekyler klustrar för att minimera kontakt med vatten.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
97Vad orsakar den hydrofoba effekten?;Vattnets strävan att maximera sina vätebindningar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
98Vad karaktäriserar en svag syra?;Högt pK_a, avger protoner endast delvis i vatten.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
99Vid vilket pH fungerar en svag syra som buffert?;Vid pH ≈ pK_a ±1.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
100Hur fungerar en svag syra som buffert?;Syra och konjugerad bas kan ta upp eller avge H⁺.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
101Vilka typer av bindningar påverkas av pH-förändring?;Jonbindningar och vätebindningar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kemiska bindingar
102Nedbrytning och utsöndring av heme;Heme → biliverdin → bilirubin (makrofager). Bilirubin transporteras bundet till albumin till levern, konjugeras med glukuronsyra och utsöndras via galla till tarmen som urobilinogen/stercobilin.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Heme
103Direkt- och indirektreagerande bilirubin;Indirekt: okonjugerat, vattenolösligt bilirubin bundet till albumin. Direkt: konjugerat, vattenlösligt bilirubin i lever/galla.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Heme
104Reglering av hemesyntesen;Heme hämmar ALA-syntas (första och hastighetsbestämmande steget) via feedback.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Heme
105Orsak till porfyrisjukdomar;Ärftliga enzymdefekter i hemesyntesens steg → ansamling av porfyriner/prekursorer.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Heme
106Var i celler finns mitokondrier?;I cytoplasman, ofta lokaliserade där energibehovet är störst (t.ex. nära myofibriller i muskelceller).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
107Vad kan påverka antalet mitokondrier per cell?;Energibehov, träning, hormonell stimulering (PGC-1α), kyla ↑, inaktivitet, svält och åldrande ↓.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
108Var finns ETK?;I mitokondriens inre membran.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
109Vad menas med redoxpotential?;Ett mått på ett ämnes benägenhet att avge eller ta upp elektroner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
110Hur mäts standardredoxpotentialen?;Relativt standardväteselektroden under standardförhållanden (1 M, 1 atm, 25 °C).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
111Från vilka föreningar kommer elektronerna som går in i ETK?;Från NADH och FADH₂ bildade i glykolys, PDH, TCA-cykeln, β-oxidation samt via shuttlar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
112Vilka proteinkomplex finns i ETK?;Komplex I, II, III och IV.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
113Vad händer i komplex I i ETK?;NADH oxideras, elektroner överförs till Q och 4 H⁺ pumpas till intermembranrummet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
114Vad händer i komplex III i ETK?;QH₂ oxideras, elektroner överförs till cytokrom c och totalt 4 H⁺ flyttas till intermembranrummet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
115Vad händer i komplex IV i ETK?;Elektroner överförs till O₂ som reduceras till H₂O, protoner pumpas över membranet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
116Hur är en cytokrom uppbyggd?;Ett protein med en hemgrupp (porfyrin + Fe²⁺/Fe³⁺) som överför elektroner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
117Varför Fe-S-kluster tidigt och cytokromer sent i ETK?;Fe-S-kluster fungerar vid låg redoxpotential, cytokromer krävs vid högre potential nära syre.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
118Vad krävs för att elektrontransportkedjan ska fungera?;Syre, NADH/FADH₂, intakt inre membran och fungerande komplex.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
119Vad är en respirasom?;Ett superkomplex av komplex I, III och IV som effektiviserar elektrontransport.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
120Vilka är beståndsdelarna i den elektrokemiska gradienten?;Membranpotential (ΔΨ) och pH-gradient (ΔpH).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
121Hur kan protoner pumpas över ett membran?;Via redoxdrivna konformationsförändringar i membranproteiner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
122Vad innebär oxidativ fosforylering?;ATP-syntes driven av protongradienten från ETK.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
123Hur är ATP-syntaset uppbyggt?;F₀-del (membran, protonkanal) och F₁-del (katalytisk del i matrix).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
124Var finns L, T och O-konfigurationerna och vad sker där?;I F₁-delen, L binder ADP+Pi, T bildar ATP, O frisätter ATP.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
125Hur sker växling mellan L, T och O?;Genom rotation av γ-subenheten driven av protonflöde.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
126Hur många protoner passerar per varv ATP-syntaset roterar?;≈10 protoner per varv (beroende på c-ringens storlek).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
127Hur många protoner behövs per ATP?;≈3–4 protoner per ATP.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
128Hur transporteras protoner genom ATP-syntaset?;Via F₀-delens protonkanal som driver rotationen.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
129Vad är en shunt?;En alternativ väg som överför elektroner eller metaboliter utanför huvudvägen.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
130Hur kan NADH transporteras från cytosol till matrix?;Via malat-aspartat-shutteln eller glycerol-3-fosfat-shutteln.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
131Hur transporteras ATP ut ur mitokondrien?;Via ADP/ATP-translokas (antiport).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
132Hur transporteras fosfat till matrix?;Via fosfattranslokas som samtransport med H⁺.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
133Vad gör en frikopplare och vilka konsekvenser får det?;Kollapsar protongradienten → värmeproduktion, minskad ATP-syntes.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
134Vad gör cyanid till ett gift?;Binder komplex IV och stoppar elektronöverföring till syre.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
135Hur många ATP kan utvinnas från en glukosmolekyl aerobt?;≈30–32 ATP.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Elektrontransportkedjan
136Beskriv den generella strukturen för en α-aminosyra;Ett α-kol bundet till en aminogrupp (–NH₃⁺), en karboxylgrupp (–COO⁻), ett väte och en sidokedja (R).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
137Proteinogena vs icke-proteinogena aminosyror;Proteinogena byggs in i proteiner, icke-proteinogena gör det inte. Exempel: ornitin, citrullin.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
138Andra viktiga funktioner hos aminosyror;Kvävetransport, energikälla, prekursorer till biomolekyler, syra–bas-buffring, neurotransmittorer.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
139Hur får vi tillgång till aminosyror?;Essentiella via kosten, icke-essentiella syntetiseras från intermediärer i metabolismen.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
140Proteiners nedbrytning i mag-tarmkanalen;Pepsin i magsäcken, pankreasproteaser i tunntarmen → fria aminosyror absorberas.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
141Hur tar sig aminosyror över cellmembran?;Via specifika transportproteiner (sekundär aktiv transport), inte jonkanaler.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
142Vad är en essentiell aminosyra? Vilka är essentiella?;Kan inte syntetiseras i tillräcklig mängd. Essentiella: Phe, Val, Thr, Trp, Ile, Met, His, Leu, Lys.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
143Vad menas med konditionellt essentiella aminosyror?;Normalt syntetiserbara men krävs via kosten vid särskilda tillstånd (t.ex. arginin hos spädbarn).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
144Fem prekursorer för icke-essentiella aminosyror;Pyruvat, 3-fosfoglycerat, oxaloacetat, α-ketoglutarat, ribos-5-fosfat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
145Generell transamineringsreaktion;Aminosyra₁ + ketosyra₂ ⇌ ketosyra₁ + aminosyra₂.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
146ALT och AST – fullständiga namn och reaktioner;ALT: alaninaminotransferas (alanin ↔ pyruvat). AST: aspartataminotransferas (aspartat ↔ oxaloacetat).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
147Vanligaste aminogruppdonator/acceptor-paret;Glutamat ↔ α-ketoglutarat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
148Vad indikerar förhöjt ALT och AST i plasma?;Cellskada, främst leverpåverkan (hepatit, alkoholskada).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
149Viktig aminogruppdonator;Glutamat, bildas via transaminering. Prekursor till glutamin, prolin och arginin.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
150Fenylketonuri (PKU);Brist på fenylalaninhydroxylas → högt Phe, lågt Tyr. Behandling: Phe-reducerad kost.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
151Syftet med PKU-screening;Tidigt upptäcka behandlingsbara, allvarliga metabola sjukdomar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
152Sju metaboliter från aminosyrors kolskelett;Pyruvat, acetyl-CoA, acetoacetyl-CoA, α-ketoglutarat, succinyl-CoA, fumarat, oxaloacetat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
153Var sker aminosyranedbrytning? BCAA?;Främst i levern, grenade aminosyror bryts i hög grad ned i skelettmuskel.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
154Varför är deaminering problematisk?;Ammoniak är toxiskt, löses genom ureacykeln och transport som alanin/glutamin.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
155Oxidativ deaminering av glutamat;Enzym: glutamatdehydrogenas, plats: mitokondriematrix, produkter: α-ketoglutarat + NH₄⁺.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
156Direkt deaminering – exempel;Serin och treonin → NH₄⁺.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
157Omvandling av ammoniak till urea;Sker i ureacykeln. Energi krävs i CPS-I-steget (2 ATP). Hastighetsreglerande: CPS-I, aktiveras av N-acetylglutamat. Första stegen i mitokondrien, resten i cytosolen.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
158Funktion och defekter i ureacykeln;Avgiftning av ammoniak i levern, defekter ger hyperammonemi (t.ex. argininosuccinatlyasbrist).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
159Koppling mellan ureacykeln och citronsyracykeln;Fumarat och aspartat (aspartat–argininosuccinat-shunten).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
160Alanin–glukos-cykeln;Muskeln: pyruvat → alanin → lever. Levern: alanin → glukos → tillbaka till muskel, kväve till urea.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
161Transport av ammoniak till levern;Som glutamin i blodet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
162Roller för glutaminsyntetas och glutaminas;Glutaminsyntetas: binder NH₄⁺ till glutamat. Glutaminas: frigör NH₄⁺ i lever/njure.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
163Glukogena vs ketogena aminosyror;Glukogena ger glukoneogenesintermediärer, ketogena ger acetyl-/acetoacetyl-CoA. Ketogena: leucin, lysin.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
164Varför kan ketogena aminosyror inte bilda glukos?;Acetyl-CoA ger inget netto tillskott till glukoneogenes.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
165Aminosyror som direkt ger glykolys/TCA-intermediärer;Alanin → pyruvat, aspartat → oxaloacetat, glutamat → α-ketoglutarat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Aminosyrametabolism
166När sker glukoneogenes?;Vid fasta, svält, långvarig fysisk aktivitet och låg kolhydrattillgång.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
167Var i cellen sker glukoneogenes?;I mitokondrien, cytosolen och sista steget i ER.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
168Vilka tre steg i glykolysen är irreversibla och varför?;Hexokinas/glukokinas, PFK-1 och pyruvatkinas, de har stort negativt ΔG och regleras hårt.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
169Vilken reaktion katalyserar pyruvatkarboxylas och hur?;Pyruvat + CO₂ + ATP → oxaloacetat, sker i mitokondrien och kräver ATP.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
170Vad är biotin och dess roll i glukoneogenesen?;Ett vitamin (B7) som fungerar som CO₂-bärare i pyruvatkarboxylas.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
171I vilken form förekommer koldioxid i vattenlösning?;Som CO₂, H₂CO₃, HCO₃⁻ och CO₃²⁻ (främst bikarbonat).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
172Hur transporteras oxaloacetat ut ur mitokondrien?;Reducerar till malat eller transamineras till aspartat för transport.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
173Vilken reaktion katalyserar fosfoenolpyruvatkarboxykinas (PEPCK)?;Oxaloacetat → fosfoenolpyruvat + CO₂ med GTP-förbrukning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
174Var finns glukos-6-fosfatas och varför?;I lever (och njure), möjliggör frisättning av fritt glukos till blodet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
175Vad karaktäriserar ett bifunktionellt enzym?;Har två motsatta enzymaktiviteter i samma protein.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
176Hur kan triacylglycerider användas för glukoneogenes?;Via glycerol som omvandlas till DHAP, fettsyror kan inte ge glukos.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
177Vilka aminosyror är glukogena?;Alla utom leucin och lysin.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
178Vilka glukogena metaboliter kan bildas från aminosyror?;Pyruvat, oxaloacetat, α-ketoglutarat, succinyl-CoA och fumarat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
179När bildas laktat i glykolysen och varför?;Vid anaeroba förhållanden för att regenerera NAD⁺.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
180Hur används laktat från skelettmuskler för glukoneogenes?;Transporteras till levern via Cori-cykeln → glukos.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
181Vilka celltyper kan använda laktat som energikälla?;Hjärta, lever och njure, laktat → pyruvat → TCA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
182Vilka föreningar inhiberar respektive stimulerar glukoneogenes?;Inhibitorer: insulin, AMP, fruktos-2,6-bisfosfat. Stimulatorer: glukagon, ATP, acetyl-CoA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
183Hur undviks samtidig full aktivitet av glykolys och glukoneogenes?;Reciprok reglering via allosteriska effekter och hormoner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
184På vilken tidsskala verkar regleringsmekanismer?;Sekunder–minuter: allosterisk/kovalent, timmar: genuttryck.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glukoneogenes
185Kvävebaser i DNA och RNA; puriner vs pyrimidiner;DNA: A, G, C, T. RNA: A, G, C, U. Puriner: adenin (A), guanin (G). Pyrimidiner: cytosin (C), tymin (T), uracil (U).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotidnedbrytning
186Strukturella delar i nukleosid respektive nukleotid;Nukleosid = kvävebas + socker. Nukleotid = nukleosid + fosfatgrupp(er).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotidnedbrytning
187Skillnad mellan ribo- och deoxyribonukleotider;Ribonukleotider har OH på 2’-kolet, deoxyribonukleotider saknar den (H).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotidnedbrytning
188Andra funktioner för nukleotider;Energibärare (ATP), signalmolekyler (cAMP), koenzymer (NAD⁺/FAD), aktiverade intermediärer (UDP-glukos).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotidnedbrytning
189Nedbrytning av nukleinsyror från födan;Nukleaser → oligonukleotider → nukleotider → nukleosider/baser, absorberas i tarmen.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotidnedbrytning
190Salvage synthesis – vad och varför;Återanvändning av baser/nukleosider till nukleotider, energisnålare än de novo-syntes.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotidnedbrytning
191Nedbrytning av puriner och kväveutsöndring;Puriner → xantin → urinsyra (huvudsakligen). Aminokväve bildar NH₄⁺ som avgiftas via ureacykeln.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotidnedbrytning
192Reaktionen katalyserad av xantinoxidas;Xantin → urinsyra (oxidation).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotidnedbrytning
193Nedbrytning av pyrimidiner och utsöndring;Pyrimidiner bryts till lösliga produkter (β-alanin/β-aminoisobutyrat), kvävet utsöndras som urea/NH₄⁺.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotidnedbrytning
194Avlägsnande av kolhydratdelen vid nedbrytning;Hydrolys av N-glykosidbindningen → bas + ribos/deoxyribos, sockret går in i central metabolism.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotidnedbrytning
195Slutprodukter vid nedbrytning;Puriner: urinsyra. Pyrimidiner: CO₂, NH₄⁺ och små organiska syror.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotidnedbrytning
196Orsak till gikt och två behandlingsstrategier;Orsak: hyperurikemi → uratkristaller. Behandling: minska urinsyrabildning (xantinoxidas-hämmare) eller öka utsöndring (urikosuriska).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotidnedbrytning
197SCID kopplad till adenosinomsättning;Enzym: adenosindeaminas (ADA). Ger toxisk dATP-ansamling → lymfocytbrist. Behandling: enzymersättning, benmärgstransplantation, genterapi.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Nukleotidnedbrytning
198Hur är mitokondrier uppbyggda?;Yttre membran, intermembranrum, inre membran (cristae) och matrix.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
199Vilka centrala metabola vägar finns i mitokondrier?;Citronsyracykeln, β-oxidation, oxidativ fosforylering och delar av ureacykeln.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
200Vad gör det fördelaktigt för acyl-CoA att släppa ifrån sig sin acylgrupp?;Tioesterbindningen är energirikare än esterbindningar → driver reaktioner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
201Från vilka näringsämnen kan acetyl-CoA bildas?;Kolhydrater (via pyruvat), fettsyror (β-oxidation) och vissa aminosyror.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
202Vad gör pyruvatdehydrogenaskomplexet (PDH)?;Omvandlar pyruvat till acetyl-CoA med bildning av NADH och CO₂.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
203Var finns pyruvatdehydrogenaskomplexet?;I mitokondriens matrix.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
204Vilka prostetiska grupper finns i PDH och deras funktion?;TPP (dekarboxylering), lipoamid (acylöverföring), FAD (redox), NAD⁺ (elektronacceptor), CoA (acylbärare).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
205Hur regleras pyruvatdehydrogenaskomplexet?;Fosforylering (inaktiverar) och defosforylering (aktiverar), hämmes av ATP, NADH, acetyl-CoA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
206Vad händer med PDH vid arsenik- och kvicksilverförgiftning?;Binder lipoamid → PDH hämmas.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
207Vilka är metaboliterna i citronsyracykeln?;Citrat, isocitrat, α-ketoglutarat, succinyl-CoA, succinat, fumarat, malat, oxaloacetat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
208Vad sker i citronsyracykelns åtta reaktioner?;Kondensation, isomerisering, två oxidativa dekarboxyleringar, substratnivåfosforylering, två oxidationer, hydrering.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
209Vilka enzymer katalyserar citronsyracykeln?;Citratsyntas, akonitas, isocitratdehydrogenas, α-ketoglutaratdehydrogenas, succinyl-CoA-syntetas, succinatdehydrogenas, fumaras, malatdehydrogenas.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
210Vad innebär dekarboxylering?;Avspjälkning av CO₂.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
211Vad innebär dehydrogenering?;Avlägsnande av väte/elektroner, ofta till NAD⁺/FAD.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
212Vad är citronsyracykelns summaformel?;Acetyl-CoA + 3 NAD⁺ + FAD + GDP + Pi + 2 H₂O → 2 CO₂ + 3 NADH + FADH₂ + GTP + CoA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
213Hur många varv krävs för att oxidera en glukos?;Två varv (två acetyl-CoA per glukos).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
214Hur många varv krävs för att oxidera en fettsyra?;Ett varv per bildad acetyl-CoA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
215Hur regleras citronsyracykeln?;Via energistatus, hämmas av ATP, NADH, aktiveras av ADP, Ca²⁺.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
216Vilken funktion har HIF-1 och hur regleras den?;Transkriptionsfaktor för hypoxisvar, stabiliseras vid låg O₂.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
217När kan succinat och fumarat påverka HIF-1 och hur?;Vid ansamling hämmas prolylhydroxylaser → HIF-1 stabiliseras.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Citronsyracykeln
218Var sker glykolysen?;I cytosolen hos alla celler.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
219Vad sker i glykolysen?;Glukos bryts ner till pyruvat med samtidig bildning av ATP och NADH.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
220Vilka är glykolysens tre faser?;Investeringsfas, klyvningsfas och utvinningsfas.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
221Vilka är de tio stegen i glykolysen och vilken typ av reaktion sker?;1 Fosforylering 2 Isomerisering 3 Fosforylering 4 Klyvning 5 Isomerisering 6 Oxidation + fosforylering 7 Substratnivåfosforylering 8 Omvandling 9 Dehydrering 10 Substratnivåfosforylering;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
222Vilka enzymer katalyserar glykolysens tio steg?;Hexokinas/glukokinas, fosfoglukosisomeras, PFK-1, aldolas, triosfosfatisomeras, GAPDH, fosfoglyceratkinas, fosfoglyceratmutas, enolas, pyruvatkinas.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
223Vad innebär substratnivåfosforylering?;ATP bildas direkt genom överföring av fosfat från ett substrat till ADP.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
224Hur kan fruktos användas i glykolysen?;Omvandlas till fruktos-6-fosfat (muskel) eller till DHAP och glyceraldehyd (lever).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
225Hur kan galaktos användas i glykolysen?;Via Leloir-pathway till glukos-1-fosfat → glukos-6-fosfat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
226När sker glykolysen?;Kontinuerligt, ökar vid behov av snabb ATP-produktion.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
227Vilken är glykolysens summaformel?;Glukos + 2 ADP + 2 Pi + 2 NAD⁺ → 2 pyruvat + 2 ATP + 2 NADH + 2 H₂O + 2 H⁺.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
228Hur regleras glykolysen i skelettmuskler?;Via energistatus: ATP och citrat hämmar, ADP/AMP aktiverar PFK-1 och pyruvatkinas.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
229Hur regleras glykolysen i levern?;Hormonellt via insulin/glukagon (PFK-2/FBPase-2) samt allosteriskt.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
230Vad karaktäriserar reglerade steg i glykolysen?;Irreversibla steg med stort negativt ΔG.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
231Vad innebär feedbackreglering?;Slutprodukt hämmar ett tidigt enzym i samma väg.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
232Vad innebär feedforwardreglering?;En tidig intermediär aktiverar ett senare enzym.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
233Vad innebär allosterisk reglering?;Effektor binder till annat säte än aktiva och ändrar enzymaktivitet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
234Vad innebär kovalent reglering?;Enzymaktivitet ändras via kovalenta modifieringar, t.ex. fosforylering.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
235Hur skiljer sig glykolysen i levern från andra vävnader?;Levern har glukokinas och hormonell reglering för blodsockerkontroll.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
236Vad avgör hur glykolysens slutprodukt metaboliseras vidare?;Syretillgång, celltyp och energibehov.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
237Vad är fermentering?;Regenerering av NAD⁺ från NADH utan syre, t.ex. laktatbildning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
238Skillnad mellan anaerob och aerob glykolys?;Anaerob: pyruvat → laktat. Aerob: pyruvat → acetyl-CoA → TCA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
239Hur tas glukos upp i celler?;Via GLUT-transportörer genom faciliterad diffusion.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
240Vad reglerar glukosupptag i muskel och adipocyter?;Insulin → translokation av GLUT4 till cellmembranet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
241Vad innebär Warburgeffekten?;Cancerceller använder hög glykolys trots tillgång på syre.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykolysen
242Vilka är två huvudprinciper inom evolution?;Variation (mutationer) och naturligt urval.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Biokemi ur ett evolutionsperspektiv
243Vilka fem liknande egenskaper har alla livsformer och varför?;Cellulär uppbyggnad, DNA/RNA som arvsmassa, proteinsyntes, metabolism och reproduktion, beror på gemensamt ursprung.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Biokemi ur ett evolutionsperspektiv
244Förklara första huvudprincipens drivkrafter;Mutationer skapar genetisk variation, rekombination och genflöde bidrar ytterligare.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Biokemi ur ett evolutionsperspektiv
245Förklara andra huvudprincipen för evolutionen;Naturligt urval: egenskaper som ökar överlevnad och reproduktion selekteras.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Biokemi ur ett evolutionsperspektiv
246Förklara origin of life – RNA-världshypotesen;RNA fungerade både som arvsmolekyl och katalysator innan DNA och proteiner utvecklades.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Biokemi ur ett evolutionsperspektiv
247Förklara endosymbios och hur teorin stöds;Mitokondrier/kloroplaster härstammar från bakterier, stöds av eget DNA, dubbla membran och bakteriella ribosomer.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Biokemi ur ett evolutionsperspektiv
248Vad är fylogenetisk systematik och varför används den?;Klassificering baserad på evolutionära släktskap, används för att förstå gemensamt ursprung.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Biokemi ur ett evolutionsperspektiv
249Hur kan cancerceller studeras bättre?;Genom somatisk evolution, sekvensering och jämförelse av mutationer över tid.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Biokemi ur ett evolutionsperspektiv
250Vad är strukturbiologi och varför är den viktig?;Studerar molekylers 3D-struktur, förklarar funktion, interaktioner och läkemedelsmål.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Biokemi ur ett evolutionsperspektiv
251Hur kan Multiple Sequence Alignment utnyttjas?;Identifierar konserverade regioner, funktionella motiv och evolutionära relationer.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Biokemi ur ett evolutionsperspektiv
252Nämn två källor till kolesterol, var i cellen och vilka celler driver syntes, samt hur halter regleras;Källor: födan och de novo-syntes. Syntes sker i cytosol + slätt ER, främst i hepatocyter (även t.ex. tarm). Halter regleras via SREBP/SCAP/Insig (transkription), proteolys/ubikvitinering och hormonell fosforylering av HMGR.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolesterolsyntes
253Varför är kolesterol viktigt? Källor till acetyl-CoA, varför transport, och läkemedelsroll;Kolesterol stabiliserar membran och är prekursor till steroidhormoner, gallsyror och vitamin D. Acetyl-CoA kommer från pyruvat (PDH), β-oxidation och vissa aminosyror, exporteras som citrat till cytosolen för syntes. Statiner hämmar HMGR → ↑LDL-receptorer → ↓LDL-kolesterol i blod.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolesterolsyntes
254Beskriv kort hur acetyl-CoA omvandlas till en viktig metabolit i kolesterolsyntes;2 acetyl-CoA → acetoacetyl-CoA, + acetyl-CoA → HMG-CoA → (HMGR) mevalonat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolesterolsyntes
255Vilka steg finns i kolesterolsyntesen och vad är hastighetsbestämmande steget?;Acetyl-CoA → mevalonat → isoprenenheter (IPP/DMAPP) → squalen → lanosterol → kolesterol. Hastighetsbestämmande: HMG-CoA-reduktas (HMG-CoA → mevalonat).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolesterolsyntes
256Vilka två pathways finns och skillnad mellan kolesterol och dehydrokolesterol;Två “utgångar”: syntes av steroler (kolesterol) och syntes av icke-sterola isoprenoider (t.ex. dolikol, ubikinon, prenylgrupper). 7-dehydrokolesterol är en omättad sterol (extra dubbelbindning) som är prekursor till vitamin D3, kolesterol saknar den dubbelbindningen och är huvudsaklig membransterol/prekursor till steroider.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolesterolsyntes
257Var sker kolesterolsyntes?;I cytosolen och släta ER.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolesterolsyntes
258Förklara de fyra huvudmekanismerna för reglering av HMGR;(1) Transkription via SREBP (↓kolesterol → ↑HMGR-genuttryck). (2) Proteolytisk nedbrytning (steroler/isoprenoider → ubiquitin/proteasom). (3) Fosforylering: AMPK fosforylerar/inaktiverar, insulin gynnar defosforylering/aktivering. (4) Kompetitiv hämning av statiner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolesterolsyntes
259Vad står SM för och varför delvis oberoende av HMGR-reglering?;SM = squalenmonooxygenas (squalen epoxidas), ett post-HMGR-enzym, regleras också av sterolinducerad nedbrytning och kan därför kontrollera flödet även om HMGR är aktivt.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolesterolsyntes
260Tre mekanismer som reglerar intracellulärt kolesterol utöver HMGR;(1) LDL-receptor-medierat upptag (SREBP styr LDLR-uttryck). (2) Esterifiering via ACAT → lagring som kolesterylestrar. (3) Efflux till HDL via transportörer (ABCA1/ABCG1) och omvandling/utsöndring som gallsyror i lever.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolesterolsyntes
261Vad är enterohepatiska cykeln?;Gallsyror utsöndras i tarmen, återabsorberas (främst ileum) och återförs via portavenen till levern för återanvändning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kolesterolsyntes
262Beskriv översiktligt pentosfosfatvägen;En cytosolisk väg som oxiderar glukos-6-fosfat till ribos-5-fosfat och producerar NADPH, består av en oxidativ och en icke-oxidativ fas.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Pentosfosfatvägen
263Var i cellen är pentosfosfatvägen lokaliserad?;I cytosolen.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Pentosfosfatvägen
264Vilken är pentosfosfatvägens huvudsakliga uppgift?;Att bilda NADPH och ribos-5-fosfat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Pentosfosfatvägen
265I vilka vävnader är pentosfosfatvägen främst aktiv och varför?;Lever, fettväv, binjurebark, gonader och erytrocyter, behov av NADPH för biosyntes och antioxidativt skydd.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Pentosfosfatvägen
266Vad används NADPH till i cellen?;Reduktiv biosyntes, glutationreduktion (ROS-skydd), cytokrom P450-reaktioner och NO-syntes.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Pentosfosfatvägen
267Varför är pentosfosfatvägen viktig mot reaktiva syreföreningar?;NADPH krävs för att hålla glutation reducerat (GSH), som detoxifierar ROS.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Pentosfosfatvägen
268Viktigaste kontrollpunkten och reglering;Glukos-6-fosfatdehydrogenas (G6PD), aktiveras av NADP⁺ och hämmas av NADPH.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Pentosfosfatvägen
269Vad används ribos-5-fosfat till?;Syntes av nukleotider och nukleinsyror.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Pentosfosfatvägen
270Vanlig enzymdefekt som ger hemolytisk anemi – vilket enzym och varför?;G6PD-brist, minskat NADPH → otillräckligt GSH → oxidativ skada och hemolys.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Pentosfosfatvägen
271Två enzymer som omvandlar 5-kols-socker;Ribos-5-fosfatisomeras (R5P ⇄ ribulos-5-P) och ribulos-5-fosfatepimeras (ribulos-5-P ⇄ xylulos-5-P).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Pentosfosfatvägen
272Transketolas och transaldolas – funktion och konsekvenser;Överför C2- respektive C3-enheter mellan sockerarter, reversibla reaktioner gör att flödet anpassas efter behov av NADPH, R5P eller glykolysintermediärer (ATP-produktion).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Pentosfosfatvägen
273Samspel med glykolysen – gemensamma molekyler och styrning;Fruktos-6-fosfat och glyceraldehyd-3-fosfat, cellens behov av NADPH, R5P och energi styr flödesriktningen.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Pentosfosfatvägen
274Varför är erytrocyter extra känsliga vid nedsatt PPP-funktion?;De saknar mitokondrier och får allt NADPH från PPP, kan inte kompensera vid oxidativ stress.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Pentosfosfatvägen
275Vad säger termodynamikens lagar och vad har det för implikationer för levande organismer?;Energi bevaras (1:a lagen) och total entropi ökar (2:a lagen), organismer måste vara öppna system och exportera entropi.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Introduktion till metabolismen
276Vad skiljer katabolism från anabolism?;Katabolism bryter ner molekyler och frigör energi, anabolism bygger upp molekyler och kräver energi.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Introduktion till metabolismen
277Vad gör energiomvandling genom katabolism effektiv?;Stegvis oxidation kopplad till energibärare (ATP, NADH/FADH₂) minimerar energiförluster.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Introduktion till metabolismen
278Hur kan reaktioner med höga positiva ΔG drivas?;Genom koppling till exergona reaktioner, oftast ATP-hydrolys eller elektrokemiska gradienter.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Introduktion till metabolismen
279Vilka energirika molekyler är centrala i metabolismen och varför?;ATP, NADH, FADH₂, acetyl-CoA, de har energirika bindningar eller hög reduktionspotential.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Introduktion till metabolismen
280Vilken koppling finns mellan B-vitaminer och metabolism?;B-vitaminer är prekursorer till koenzymer (NAD⁺, FAD, CoA, TPP) som krävs i enzymreaktioner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Introduktion till metabolismen
281Vilken typ av reaktioner är vanliga i metabolismen?;Oxidation–reduktion, gruppöverföringar, isomeriseringar, hydrolyser och klyvningsreaktioner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Introduktion till metabolismen
282Varför måste kroppen även lagra glykogen?;Glykogen ger snabbt tillgängligt glukos för blodsockerreglering och anaerob ATP-produktion, vilket fett inte kan.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
283Den molekylära uppbyggnaden av glykogen;En starkt förgrenad polymer av glukos med α(1→4)-bindningar och α(1→6)-förgreningar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
284Var lagras glykogen och vilken funktion har det?;Levern: upprätthåller blodglukos. Skelettmuskler: lokal energikälla vid arbete.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
285Tre steg i glykogennedbrytningen;Fosforolys, debranching (avförgrening) och omvandling till glukos-6-fosfat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
286Enzym vid initial glykogennedbrytning och typ av klyvning;Glykogenfosforylas, fosforolys → glukos-1-fosfat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
287Varför kan inte glykogenfosforylas bryta ner hela molekylen?;Det stannar fyra glukosenheter från α(1→6)-förgreningar, enzymet är glykogenfosforylas.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
288Enzym som flyttar grenarna och dess funktion;Debranching enzyme, har transferas- och α(1→6)-glukosidasaktivitet → glukos + G1P.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
289Varför kan levern men inte muskler frisätta glukos?;Levern har glukos-6-fosfatas, muskler saknar enzymet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
290Fyra steg i glykogensyntes och enzymer;1) G6P → G1P (fosfoglukomutas) 2) Aktivering till UDP-glukos 3) Förlängning (glykogensyntas) 4) Förgrening (branching enzyme);Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
291Aktiverad form av glukos vid glykogensyntes;UDP-glukos.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
292Glykogenins funktion;Primer som initierar glykogensyntes genom att binda de första glukosenheterna.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
293Två centrala enzymer i reglering av glykogenmetabolism;Glykogenfosforylas och glykogensyntas, regleras via fosforylering och allosterisk reglering.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
294Vad är en alloster modulator och exempel i glykogenmetabolism?;En molekyl som binder ett annat säte än det aktiva. AMP aktiverar fosforylas, ATP och G6P hämmar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
295Hormoner som reglerar glykogenmetabolism;Glukagon och adrenalin stimulerar nedbrytning, insulin stimulerar syntes via defosforylering.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
296Signalväg för aktivering av glykogenfosforylas och insulineffekt;Glukagon/adrenalin → cAMP → PKA → fosforylering → aktiv fosforylas. Samma väg fosforylerar och hämmar glykogensyntas. Insulin aktiverar fosfataser som defosforylerar enzymerna.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Glykogen
297Hur kan vi veta om en kemisk reaktion kan ske?;Genom Gibbs fria energi: ΔG < 0 ⇒ reaktionen är termodynamiskt möjlig (spontan).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
298Vad är katalys, hur kan den ske och vad kallas biologiska katalysatorer?;Katalys sänker aktiveringsenergin utan att förbrukas. Biologiska katalysatorer kallas enzymer och är oftast proteiner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
299Vilka generella strategier finns för enzymkatalys?;Syra–bas-katalys, kovalent katalys, metalljonkatalys, orientering/proximitet, stabilisering av transition state.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
300Vad är ett coenzym och en co-faktor?;Cofaktor: icke-proteindel som krävs för enzymaktivitet (metalljon eller organisk). Coenzym: organisk cofaktor (ofta vitamin-derivat).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
301Vad har cellen för fördelar med biokatalysatorer?;Snabbare reaktioner, hög specificitet, milda betingelser (pH, temperatur).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
302Förklara begreppet transition state;Ett kortlivat, energirikt tillstånd mellan substrat och produkt som enzymet stabiliserar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
303Vad är ett aktivt säte?;Den del av enzymet där substratet binder och katalysen sker.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
304Vad är viktigt för optimal inbindning till ett enzym?;Komplementär form, laddning och svaga interaktioner (H-bindningar, jonbindningar, hydrofoba effekter).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
305Kopplingen mellan struktur och funktion hos enzymer;3D-strukturen bestämmer det aktiva sätets form och därmed enzymets specificitet och funktion.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
306Två sätt som enzymer underlättar substratbindning/reaktion;Orienterar substrat korrekt och stabiliserar transition state.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
307Michaelis–Menten-kurvan – axlar;y-axel: reaktionshastighet (v), x-axel: substratkoncentration [S].;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
308Vad är kcat, Km och Vmax?;kcat: omsättningstal (substrat → produkt per enzym/sek). Km: [S] vid ½ Vmax. Vmax: maximal reaktionshastighet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
309Faktorer som påverkar enzymaktivitet;Substratkoncentration, enzymkoncentration, pH, temperatur, inhibitorer, cofaktorer.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
310Olika typer av enzyminhibitorer och kinetisk skillnad;Kompetitiv (↑Km), icke-kompetitiv (↓Vmax), unkompetitiv (↓Km och ↓Vmax).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
311Hur regleras enzymaktivitet?;Allosterisk reglering, kovalent modifiering (fosforylering), genuttryck, inhibitorer/aktivatorer.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
312Chymotrypsins katalys – generell strategi;Serinproteas, aktivt säte: Ser-His-Asp-triaden. Kovalent acylenzym-intermediär bildas → peptidbindning klyvs.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
313Andra enzymmekanismer (exempel);Oxidoreduktaser: elektronöverföring (NAD⁺/FAD). Ligaser/syntetaser: kopplar molekyler med ATP. Kinaser: överför fosfatgrupp från ATP.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Enzymer
314Hur lagras lipider i fettcellen?;Som triacylglyceroler (TAG) i lipiddroppar, tätt packade via raka fettsyror och van der Waals-interaktioner, mycket energirikare än kolhydrater.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
315Vilka hormoner stimulerar nedbrytning av lagrade lipider? Mekanism och enzym?;Glukagon, adrenalin och noradrenalin → GPCR → cAMP → PKA → fosforylering av perilipin och HSL. ATGL: TAG → DAG, HSL: DAG → MAG, MGL: MAG → glycerol + fria fettsyror.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
316Vad innebär aktivering av fettsyror före nedbrytning?;Fettsyran kopplas till CoA (acyl-CoA) med ATP-förbrukning, krävs för β-oxidation.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
317Hur transporteras aktiverade fettsyror över inre mitokondriemembranet?;Via karnitinskytteln: CPT-I → acyl-karnitin → translokas → CPT-II → acyl-CoA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
318Redogör för β-oxidationen;Cykel med fyra steg: oxidation, hydrering, oxidation, tiolys → förkortning med två kol per varv.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
319Hur många acetyl-CoA och ATP från en 16-kolatomers fettsyra?;8 acetyl-CoA, totalt ~106 ATP netto.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
320När bildas ketonkroppar och varför?;Vid svält eller insulinbrist, högt acetyl-CoA och låg oxaloacetat i levern.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
321Redogör för syntesen av ketonkroppar;I levermitokondrier: acetyl-CoA → acetoacetat → β-hydroxibutyrat och aceton.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
322Kan lipider omvandlas till glukos hos människa?;Nej, acetyl-CoA kan inte ge netto-glukos (undantag: glycerol).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
323Hur regleras acetyl-CoA-karboxylas?;Aktiveras av insulin och citrat, hämmas av glukagon, adrenalin och AMP (fosforylering).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
324Hur transporteras acetyl-CoA ut ur mitokondrien?;Via citratshutteln.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
325Redogör schematiskt för fettsyrasyntesen;Acetyl-CoA → malonyl-CoA → elongering via fettsyrasyntaskomplex → palmitat.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
326Vad karaktäriserar essentiella fettsyror?;Kan inte syntetiseras, fleromättade med dubbelbindningar bortom Δ9 (ω-3, ω-6).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
327Vilka tre hormoner påverkar lipidmetabolismen och hur?;Insulin (lagring), glukagon och adrenalin (lipolys via PKA).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
328Vad är kroppens högsta prioritet för energitillförsel?;Att försörja hjärnan med energi.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
329Varför är lipaser viktiga och varför lagras fettsyror som TAG?;Lipaser frigör energi, TAG är osmotiskt neutrala och energitäta.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
330Vilka fettsyror kan kroppen inte bryta ned?;Fettsyror med udda antal kol (slutprodukt: propionyl-CoA).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
331När bryts fettsyror ned?;Vid fasta, svält, långvarigt arbete eller låg insulin/ hög glukagon.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
332Vilka hormoner stimulerar avspjälkning av fettsyror och hur?;Glukagon och adrenalin via cAMP/PKA-aktivering av lipaser.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
333Vilka är produkterna av lipolys?;Fria fettsyror och glycerol.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
334Varför använder CNS huvudsakligen glukos?;Fettsyror passerar inte blod-hjärnbarriären, ketoner används först vid svält.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
335Vad händer med glycerol efter lipolys?;Transporteras till levern → glycerol-3-fosfat → DHAP → glykolys/glukoneogenes.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
336Vad händer med fria fettsyror efter lipolys?;Transporteras bundna till albumin → β-oxidation i vävnader.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
337Hur förbereds fettsyror för β-oxidation?;Aktivering till acyl-CoA och transport via karnitinskytteln.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
338Var sker β-oxidation och hur många steg består den av?;I mitokondriematrix, fyra återkommande steg per varv.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
339Hur mycket ATP investeras vid aktivering?;Motsvarande 2 ATP (ATP → AMP + PPi).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
340Vad händer med produkterna från β-oxidation?;NADH/FADH₂ → ETC, acetyl-CoA → TCA eller ketonkroppar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
341Varför har kroppen främst jämna fettsyror?;Fettsyrasyntes sker genom tvåkolsenheter (acetyl/malonyl-CoA).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
342Likheter mellan svält och diabetes i metabolismen?;Ökad lipolys, β-oxidation, ketogenes och glukoneogenes.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
343Hur påverkar högt blodsocker diabetiker indirekt?;Osmotisk diures, dehydrering och ketonbildning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
344Hur kan kroppen klara flera dagar vid svält?;Fettlager → fettsyror och ketonkroppar som energi.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
345Var produceras ketonkroppar?;I leverns mitokondrier.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::β-oxidation
346Berätta kort om termodynamik och förklara isolerat, stängt och öppet system;Termodynamik beskriver energiomvandlingar. Isolerat system utbyter varken energi eller materia, stängt utbyter energi men inte materia, öppet utbyter både energi och materia.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
347Vad kallas reaktioner med negativ, positiv och noll nettoenergiöverföring?;Negativ: exergona (energi frigörs). Positiv: endergona (energi krävs). Noll: i jämvikt (ΔG = 0).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
348Beskriv termodynamikens fyra lagar;0:e: Temperatur definierar termisk jämvikt. 1:a: Energi kan inte skapas eller förstöras. 2:a: Entropin ökar i isolerade system. 3:e: Entropin närmar sig noll vid 0 K.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
349Förklara entalpi och entalpiförändring;Entalpi (H) är värmeinnehåll vid konstant tryck. ΔH = H_produkter − H_reaktanter, viktigt för värmeutbyte.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
350Förklara intern energiändring;Intern energi (U) är total energi i systemet, ΔU = q − w.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
351Vad innebär att entalpi och intern energi är tillståndsfunktioner?;De beror endast på systemets tillstånd, inte på vägen dit.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
352Vad är entropi och vad händer vid spontana reaktioner?;Entropi (S) mäter oordning, vid spontana processer ökar total entropi.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
353Varför är hög entropi vanligt i naturen?;System tenderar mot flest möjliga mikrotillstånd.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
354Hur kan entropin förändras?;Genom värmeöverföring, fasövergångar och kemiska reaktioner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
355Vad är Gibbs fria energi?;G = H − TS, ΔG < 0 spontan, ΔG > 0 icke-spontan, ΔG = 0 jämvikt.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
356Vad är standardförhållanden och varför biokemisk standard?;Standard: 1 M, 1 atm, 25 °C, biokemi använder ΔG°′ (pH 7) för fysiologisk relevans.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
357Vad är unikt för kemiska jämvikter?;Fram- och bakreaktion sker lika snabbt.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
358Samband mellan Gibbs fria energi och jämviktskonstanten;ΔG° = −RT ln K_eq.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
359Varför är biokemiska processer speciella?;De kopplas till energirikare reaktioner (t.ex. ATP-hydrolys).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
360Skillnad isolerat vs öppet system – varför organismer är öppna;Organismer utbyter både energi och materia med omgivningen.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
361Vad är en endergon reaktion jämfört med exergon?;Endergon kräver energi (ΔG > 0), exergon frigör energi (ΔG < 0).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
362Termodynamikens första huvudsats och konsekvens;Energi bevaras, energi kan endast omvandlas.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
363Vilken innebörd har entalpivärden?;Anger värme som avges eller tas upp, mäts i kJ/mol.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
364Förklara entropi som drivkraft;Ökad oordning driver spontana reaktioner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
365Hur förklaras diffusion molekylärt?;Slumpmässig rörelse ökar entropin när ämnen sprids.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
366Definition och användning av Gibbs fria energi;ΔG avgör om en reaktion är spontan.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
367Vad är ΔG° och hur används det?;Gibbs energi vid standardförhållanden, jämför reaktioners energipotential.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
368Varför är koncentration viktig för reaktionsbenägenhet?;ΔG beror på aktuella koncentrationer, inte bara ΔG°.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
369Varför är många reaktioner långt från jämvikt?;De drivs kontinuerligt av metabolism och energikoppling.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
370Definiera jämviktskonstanten;Förhållandet mellan produkt- och reaktantkoncentrationer vid jämvikt.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
371Hur påverkar K < 1 reaktionens ΔG?;Ger positiv ΔG°, reaktionen är ogynnsam under standardförhållanden.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Termodynamik
372Vilka aktiviteter är förknippade med exonukleas och endonukleas?### Förklara begreppen replikationsbubbla och replikationsgaffel;Replikationsbubbla är området där DNA öppnats kring ett origin, replikationsgaffel är varje Y-formad ände där DNA syntetiseras.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::DNA replikation
373Var är ett origin of replication?;En specifik DNA-sekvens där replikation initieras och DNA öppnas.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::DNA replikation
374Hur skiljer sig DNA-syntes på leading och lagging strand?;Leading strand syntetiseras kontinuerligt, lagging strand syntetiseras diskontinuerligt som Okazaki-fragment.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::DNA replikation
375Vilken funktion har 3’→5’-exonukleasaktiviteten hos DNA-polymeraser?;Proofreading, avlägsnar felinkorporerade nukleotider och ökar noggrannheten.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::DNA replikation
376Vad är processivitet och hur stimulerar sliding clamp detta?;Processivitet är hur många nukleotider som adderas per bindning, sliding clamp håller polymeraset kvar på DNA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::DNA replikation
377Vad är ett primas och när behövs det?;Ett RNA-polymeras som syntetiserar primers, behövs för att starta DNA-syntes.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::DNA replikation
378Hur går Okazaki fragment maturation till?;RNA-primer tas bort, gap fylls med DNA och fragmenten ligeras ihop.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::DNA replikation
379Vilka aktiviteter har exonukleas respektive endonukleas?;Exonukleas tar bort nukleotider från ändar, endonukleas klyver inom en nukleotidkedja.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::DNA replikation
380Hur fungerar helikas?;Använder ATP för att separera DNA-strängarna genom att bryta vätebindningar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::DNA replikation
381Vilken roll spelar enkelsträngsbindande proteiner och vad heter de i våra celler?;Stabiliserar ssDNA och förhindrar återparning, i eukaryoter heter de RPA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::DNA replikation
382Varför bildas positiva supercoils och hur tas de bort?;De bildas framför replikationsgaffeln vid uppvridning, topoisomeraser avlägsnar dem genom att klyva och återligera DNA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::DNA replikation
383Describe the main features of the genetic code.;Triplet code (codons of three nucleotides), non-overlapping, read continuously, nearly universal, and unambiguous (each codon specifies one amino acid or stop).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
384What is degeneracy of the genetic code and its biological significance?;Multiple codons encode the same amino acid, this reduces the impact of point mutations and translation errors.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
385What is translation?;The process by which ribosomes synthesize proteins using mRNA as a template.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
386What is a tRNA and what is its function in protein synthesis?;A transfer RNA that carries a specific amino acid to the ribosome and matches it to the mRNA codon.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
387What are the general characteristics of a tRNA?;Small (~75 nt), cloverleaf secondary structure, L-shaped 3D structure, anticodon loop, and 3′-CCA end.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
388Why is the 3′ CCA region called the acceptor arm?;It is the site where the amino acid is covalently attached to the tRNA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
389What is the wobble effect and which base determines it?;Flexible base pairing at the third codon position, determined by the first base (5′ end) of the anticodon.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
390Why are aminoacyl-tRNA synthetases the ‘true readers’ of the genetic code?;They ensure correct amino acid is attached to the correct tRNA, enforcing codon–amino acid fidelity.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
391How do aminoacyl-tRNA synthetases work?;Two-step reaction: amino acid activation with ATP, then transfer to tRNA, editing site removes mischarged amino acids.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
392What is a ribosome and what are its components?;A ribonucleoprotein complex of rRNA and proteins, composed of large and small subunits.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
393Which ribosomal components are critical for structure and function?;rRNA forms the structural core and catalyzes peptide bond formation.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
394Describe the A, P, and E sites.;A-site binds aminoacyl-tRNA, P-site holds peptidyl-tRNA, E-site releases empty tRNA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
395Differences between bacterial and eukaryotic ribosomes?;Bacterial: 70S (30S+50S), eukaryotic: 80S (40S+60S).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
396How can ribosomes be targets for antibiotics?;Antibiotics selectively bind bacterial ribosomes, inhibiting translation without affecting eukaryotic ribosomes.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
397What are the steps of protein translation?;Initiation, elongation, and termination.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
398Characteristics of the bacterial initiation region?;Shine–Dalgarno sequence upstream of start codon aligns mRNA with ribosome.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
399Why is the reading frame established during initiation?;Start codon positioning defines triplet grouping for the entire mRNA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
400How does protein initiation start and what is the role of initiation factors?;Initiation factors assemble ribosomal subunits at the start codon and recruit initiator tRNA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
401Role of elongation and translocation factors?;Deliver aa-tRNAs (EF-Tu/eEF1A) and move ribosome along mRNA (EF-G/eEF2).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
402Role of release factors?;Recognize stop codons and trigger peptide release.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
403What is a polysome and its significance?;Multiple ribosomes translating one mRNA simultaneously, increasing efficiency.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
404Differences between bacterial and eukaryotic protein biosynthesis?;Different ribosomes, initiation mechanisms, factors, and cellular localization.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
405How does streptomycin inhibit protein biosynthesis?;Binds 30S subunit, causes misreading of mRNA, and blocks initiation.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Translation
406Vad är definitionen av ”genom”?;Allt genetiskt material (DNA) i en organism eller cell.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
407Vad menas med ”proteom”?;Samtliga proteiner som uttrycks i en cell, vävnad eller organism vid ett givet tillfälle.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
408Vad menas med ett homogenisat?;En cell- eller vävnadssuspension där celler har brutits sönder.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
409Egenskaper hos proteiner som kan användas för rening;Storlek, laddning, hydrofobicitet och specifik bindningsförmåga.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
410I vilken ordning elueras proteiner vid gelfiltrering?;Stora proteiner först, små sist.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
411Vilken laddning har proteiner som binder en katjonbytare?;Positiv laddning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
412Vilken laddning har proteiner som inte binder till katjonbytare?;Negativ eller neutral laddning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
413Vilken laddning har proteiner som binder en anjonbytare?;Negativ laddning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
414Vilken laddning har proteiner som inte binder till anjonbytare?;Positiv eller neutral laddning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
415Hur eluerar man protein från en katjonbytare?;Genom ökad salthalt eller ändrat pH.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
416Vad menas med affinitetskromatografi?;Rening baserad på specifik bindning mellan protein och ligand.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
417Hur elueras 6xHis-protein från Ni²⁺-kolonn?;Med imidazol.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
418Vad kallas det automatiserade systemet för proteinrening?;ÄKTA-system.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
419Vilken parameter följs oftast?;Absorbans vid 280 nm.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
420Vilken gel används i SDS-PAGE?;Polyakrylamidgel.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
421Vad är SDS?;Ett anjoniskt detergent (natriumdodecylsulfat).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
422Vilken laddning har SDS?;Negativ.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
423Vad hamnar högst upp respektive längst ner i SDS-PAGE?;Stora proteiner överst, små längst ner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
424Hur visualiseras SDS-PAGE?;Coomassie-färgning eller silverfärgning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
425Vad menas med proteinreferens?;Molekylviktsmarkör (protein ladder).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
426Vad är isoelektrisk fokusering?;Separation av proteiner efter deras isoelektriska punkt (pI).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
427Vad är tvådimensionell gelelektrofores?;Kombination av isoelektrisk fokusering och SDS-PAGE.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
428Hur används SDS-PAGE för att följa proteinrening?;Genom att analysera renhet och bandintensitet över reningssteg.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
429Vad är en antikropp?;Ett protein som specifikt binder ett antigen.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
430Vad är ett antigen?;En molekyl som känns igen av antikroppar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
431Vad är en epitop?;Den del av antigenet som antikroppen binder.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
432Vad kännetecknar en monoklonal antikropp?;Binder en enda specifik epitop.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
433Vad kännetecknar polyklonala antikroppar?;Binder flera epitoper på samma antigen.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
434Hur tillverkas monoklonala antikroppar?;Via hybridomteknik (B-cell + myelomcell).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
435Beskriv ELISA;En enzymbaserad metod för att detektera antigen eller antikroppar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
436Beskriv indirekt ELISA;Antigen på platta → primärantikropp → enzymkopplad sekundärantikropp.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
437Beskriv Sandwich ELISA;Antigen fångas mellan två antikroppar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
438Vilken ELISA-metod är mest specifik?;Sandwich ELISA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
439Kliniska applikationer för ELISA;Indirekt: antikroppsdetektion (infektioner). Sandwich: antigen-/hormondetektion.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
440Vad är Western blot?;Proteiner separeras med SDS-PAGE, överförs till membran och detekteras med antikroppar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
441Skillnad mellan SDS-PAGE och Western blot?;SDS-PAGE separerar proteiner, Western blot identifierar specifika proteiner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
442Vad kan masspektrometri detektera?;Proteiner, peptider, metaboliter och lipider.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
443Användningsområden för masspektrometri;Proteomik, identifiering av proteiner, posttranslationella modifieringar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
444Varför behövs kristaller för röntgenkristallografi?;För att ge regelbundet diffraktionsmönster.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
445Varför är hög upplösning viktig?;För att kunna se atomära detaljer i strukturen.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
446Vanligaste atomen i NMR?;¹H (väte).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
447Fördel med kryo-EM jämfört med röntgenkristallografi?;Kräver inga kristaller och kan studera stora komplex i nära nativt tillstånd.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Utforska proteiner
448Definiera begreppen kromosom respektive kromatin;Kromatin är DNA bundet till histoner, kromosom är den starkt kondenserade formen av kromatin vid celldelning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kromatin
449Beskriv nukleosomens uppbyggnad;~147 bp DNA lindat runt en histonoktamer (2×H2A, H2B, H3, H4).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kromatin
450Vilken roll spelar histon H1?;Binder linker-DNA och stabiliserar högre ordningens kromatinstruktur.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kromatin
451Vilken roll spelar histonsvansar?;Reglerar kromatinstruktur via kovalenta modifieringar som påverkar genuttryck.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kromatin
452Vad händer med nukleosomer under DNA-replikation?;Histoner återfördelas till dottersträngar och kompletteras med nybildade histoner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kromatin
453Hur packas DNA till en kromosom? Vilken roll spelar protein scaffold?;DNA bildar loopar fästa till ett protein scaffold som organiserar och kondenserar kromatinet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kromatin
454Hur kan aktiviteten i kromatin-loopar regleras?;Via histonmodifieringar, kromatinremodellering och bindning av regulatoriska proteiner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kromatin
455Vad är en gen?;En DNA-sekvens som innehåller information för att syntetisera ett funktionellt RNA eller protein.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kontroll av genuttryck i prokaryoter
456Vilken sträng i DNA skrivs av till RNA – vad styr detta?;Templatsträngen skrivs av, promotorns orientering avgör vilken sträng som används.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kontroll av genuttryck i prokaryoter
457Vad är ett operon?;En grupp gener med gemensam promotor som transkriberas tillsammans till ett polycistroniskt mRNA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kontroll av genuttryck i prokaryoter
458Vad är en Shine–Dalgarno-sekvens?;En ribosombindningssekvens i bakteriellt mRNA som basparar med 16S rRNA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kontroll av genuttryck i prokaryoter
459Hur är RNA-polymeras uppbyggt i E. coli?;Kärnenzym: α₂ββ′ω (katalytiskt aktivt). Holoenzym: kärnenzym + σ-faktor (kan initiera transkription).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kontroll av genuttryck i prokaryoter
460Vilken roll spelar sigma-faktorn?;Känner igen promotorn och positionerar RNA-polymeraset korrekt för initiering.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kontroll av genuttryck i prokaryoter
461Hur hittar RNA-polymeraset till promotorn i E. coli?;Via sigma-faktorns specifika bindning till promotorelement (-10 och -35).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kontroll av genuttryck i prokaryoter
462Vad menas med att gener i ett operon regleras gemensamt?;Alla gener påverkas samtidigt av samma regulatoriska element.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kontroll av genuttryck i prokaryoter
463Vad är en repressor? Hur regleras Trp-operonet?;En repressor är ett protein som blockerar transkription, i Trp-operonet aktiveras repressorn av tryptofan och stänger operonet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kontroll av genuttryck i prokaryoter
464CAP är en aktivator – hur fungerar den?;CAP binder cAMP och fäster vid DNA för att öka RNA-polymerasets inbindning.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kontroll av genuttryck i prokaryoter
465Förklara hur lac-operonet fungerar.;Inducerbart operon, laktos inaktiverar repressorn och låg glukos → cAMP–CAP aktiverar transkription.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kontroll av genuttryck i prokaryoter
466Vad är en bakteriofag och hur har den bidragit till vaccinproduktion?;Ett virus som infekterar bakterier, används som vektor för antigenproduktion.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kontroll av genuttryck i prokaryoter
467Hur fungerar Rifampicin respektive Actinomycin?;Rifampicin hämmar bakteriellt RNA-polymeras, Actinomycin binder DNA och blockerar transkription.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Kontroll av genuttryck i prokaryoter
468Initiering och terminering av eukaryot DNA-replikation;Initiering sker vid origins med ORC och licensiering, terminering när replikationsgafflar möts och kromatinet återställs.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Initiering och terminering av DNA replikation
469Vad är PCNA?;En ringformad sliding clamp som ökar DNA-polymerasets processivitet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Initiering och terminering av DNA replikation
470ORC, Cdc6, Cdt1 och MCM-helikasets roller vid initiering;ORC binder origins, Cdc6 och Cdt1 laddar MCM-helikaset som licensierar replikation.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Initiering och terminering av DNA replikation
471När och hur aktiveras MCM-helikaset?;Aktiveras i S-fas via fosforylering av CDK och DDK.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Initiering och terminering av DNA replikation
472Vilka DNA-polymeraser verkar vid replikationsgaffeln och deras aktiviteter?;Pol α (primase/initiator), Pol δ (lagging strand), Pol ε (leading strand).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Initiering och terminering av DNA replikation
473Beskriv den eukaryota replikationsgaffeln;Innehåller MCM-helikas, primase/Pol α, Pol δ/ε, PCNA, RFC, RPA och topoisomeras.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Initiering och terminering av DNA replikation
474Hur fungerar telomeras och säkerställer korrekt replikation av kromosomändar?;Ett RNA-beroende DNA-polymeras som förlänger telomerer med repetitiva sekvenser.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Initiering och terminering av DNA replikation
475Hur ser en transkriptionsbubbla ut?;Ett lokalt uppsmält DNA-område (~12–17 bp) där strängarna separeras så RNA-polymeras kan läsa templatsträngen.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::RNA syntes
476Vilka tre typer av RNA-polymeraser finns i kärnan och vilka gener transkriberar de?;RNA-pol I: rRNA (28S, 18S, 5.8S). RNA-pol II: mRNA och vissa snRNA. RNA-pol III: tRNA, 5S rRNA och små RNA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::RNA syntes
477Vad är alfa-amanitin?;Ett toxin från flugsvamp som hämmar RNA-polymeras II (och svagt III).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::RNA syntes
478Vilka sekvenselement hittar man vid en eukaryot promotor?;TATA-box, Inr (initiator), BRE och ibland CAAT- och GC-boxar.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::RNA syntes
479Hur bildas preinitieringskomplexet?;Generella transkriptionsfaktorer och RNA-pol II binds stegvis till promotorn.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::RNA syntes
480Vilka aktiviteter hos TFIIH startar transkriptionen?;Helikasaktivitet som öppnar DNA och kinasaktivitet som fosforylerar CTD.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::RNA syntes
481Vilken roll spelar CTD vid transkription och mRNA-processning?;CTD fosforyleras och rekryterar faktorer för capping, splicing och polyadenylering.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::RNA syntes
482Hur processas den primära RNA-molekylen till moget mRNA?;5’-capping, borttagning av introner (splicing) och poly(A)-svans.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::RNA syntes
483Vad är en 5’-cap och vilken funktion har den?;En 7-metylguanosin-kap som skyddar mRNA, krävs för export och translation.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::RNA syntes
484Vad är en poly(A)-svans och vilken funktion har den?;En kedja av adenosiner som sätts på posttranskriptionellt, ökar stabilitet och translation.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::RNA syntes
485Vad är intron och exon?;Introner är icke-kodande sekvenser som tas bort, exoner är sekvenser som ingår i moget mRNA.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::RNA syntes
486Beskriv de grundläggande stegen vid splicing!;Spliceosomen klipper vid 5’-splice site, bildar lariat, klipper 3’-splice site och ligerar exoner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::RNA syntes
487Vad är alternativ splicing och dess betydelse?;Olika kombinationer av exoner ger flera proteiner från samma gen och ökar proteomets komplexitet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::RNA syntes
488Vilka lipider ingår i det eukaryota cellmembranet?;Fosfolipider, glykolipider och kolesterol.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Transport över cellmembran
489Vilken roll har kolesterolet?;Reglerar membranets fluiditet och stabilitet, minskar permeabilitet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Transport över cellmembran
490Cellmembranet sägs vara asymmetriskt – vad innebär detta?;Olika lipider och proteiner är ojämnt fördelade mellan inre och yttre membranbladet.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Transport över cellmembran
491Vilka molekyler kan spontant diffundera över cellmembranet?;Små opolära molekyler och små oladdade polära molekyler (t.ex. O₂, CO₂).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Transport över cellmembran
492Vilka molekyler kan inte spontant diffundera över cellmembranet?;Laddade joner och stora polära molekyler (t.ex. Na⁺, glukos).;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Transport över cellmembran
493Vilka typer av rörlighet finns i cellmembranet vid 37°?;Lateral diffusion, rotation och flexion av lipidkedjor.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Transport över cellmembran
494Hur är lipid rafts uppbyggda?;Kolesterol- och sfingolipidrika, mer ordnade membrandomäner med specifika proteiner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Transport över cellmembran
495Vilka typer av integrala membranproteiner finns?;Single-pass, multi-pass (α-helixar) och β-tunnor.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Transport över cellmembran
496Vad är en hydropatiplot?;Ett diagram som visar hydrofoba och hydrofila regioner i ett protein.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Transport över cellmembran
497Vad ger en hydropatiplot information om?;Förekomst och position av transmembrana segment.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Transport över cellmembran
498Hur är perifera membranproteiner associerade till cellmembranet?;Via icke-kovalenta interaktioner med lipider eller integrala membranproteiner.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Transport över cellmembran
499Vilka typer av celladhesionsproteiner finns?;Cadheriner, integriner, selektiner och Ig-superfamiljen.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Transport över cellmembran
500Vad binder celladhesionsproteiner till?;Andra celler eller extracellulär matrix.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Transport över cellmembran
501Vilken är deras huvudsakliga funktion?;Mediar cell–cell- och cell–matrix-adhesion samt signalering.;Biokemi::Johan D - Instuderingsfrågor::Transport över cellmembran