4.4 KiB
Introduktion till metabolismen LPG001 Biokemi 2025-11-28 Ingela Parmryd
FrÄgestÀllningar
⹠Vad sÀger termodynamikens lagar och vad har det för implikationer för levande organismer? ⹠Vad skiljer katabolism frÄn anabolism? ⹠Vad gör energiomvandling genom katabolism effektiv? ⹠Hur kan reaktioner med höga positiva DG drivas? ⹠Vilka energirika molekyler Àr centrala i metabolismen och vad gör dem energirika? ⹠Vilken koppling finns mellan B-vitaminer och metabolism? ⹠Vilken typ av reaktioner Àr vanliga i metabolismen?
En överblick av metabolismen
(Biochemistry 10:e, Berg et al. Figur 15.2)
(Bild)
Termodynamikens första lag
Energi kan varken skapas eller förstöras, men den kan omvandlas.
Metabolism - nedbrytning och uppbyggnad av molekyler under energiomvandling
(Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.2)
(Bild)
Termodynamikens andra lag
I ett isolerat system kan oordningen = entropin bara öka.
Konsekvens: Om entropin minskar pÄ en plats mÄste den öka mer nÄgon annanstans.
Att upprÀtthÄlla ordning krÀver energi
(Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.4)
(Bild)
Energi frÄn solljus Àr kÀllan till nÀstan allt liv pÄ jorden
(Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.9)
(Bild)
Katabolismen sker i tre stadier
(Biochemistry 10:e, Berg et al. Figur 15.11)
(Bild)
DG avgör om en reaktion kommer att ske spontant
Reaktion: A + B â C + D
ÎG = skillnad i fri energi
ÎG° = skillnad i standard fri energi, 1M & pH=7
R = allmÀnna gaskonstanten
T = absoluta temperaturen
1 kcal/mol â 4,2 kJ/mol
EnergiinnehÄllet hos reaktanterna styr riktningen av en reaktion
(Essential Cell Biology, Sixth Edition, Figure 3.18)
X har lÀgre energi Àn Y.
Reaktionen Y â X ökar entropin och Ă€r exoterm â har âDG.
Sker dĂ€rför oftare Ă€n reaktionen X â Y som minskar entropin och har +DG nĂ€r det finns lika mycket Y och X.
Vid jÀmvikt sker reaktionen Ät bÄda hÄll lika ofta.
ÎG = ÎG°â + RT ln ([X]/[Y])
Koppling kan driva ofördelaktiga reaktioner
(Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.17)
(Bild)
Sekventiell koppling kan driva en ofördelaktig reaktion
(Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.21)
(Bild)
Cellens energivaluta ATP innehÄller tvÄ fosfoanhydridbindningar
(Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.30)
(Bild)
Fosforyltransferpotential hos metaboliter
(Biochemistry 10:e, Berg et al. Figur 15.5)
(Bild)
Cellens energikvot styr metabolismen
(Biochemistry 10:e, Berg et al. Figur 15.17)
(Bild)
NAD(P)H Àr bÀrare av 2e- i en hydridjon
(Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.34)
(Bild)
FADHâ Ă€r bĂ€rare av 2e- i tvĂ„ vĂ€ten
(Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 13.13b)
(Bild)
NÄgra B-vitaminer med en roll i metabolismen
(Biochemistry 10:e, Berg et al. Figur 15.16)
(Bild)
Vanliga reaktionstyper i metabolismen
âą Oxidation/reduktion
âą Ligering/klyvning
âą Hydrolys/kondensation
âą Isomerisering
⹠Gruppöverföring
Ju mer reducerat kol Àr, desto mer energirik molekyl
(Biochemistry 10:e, Berg et al. Figur 15.8)
(Bild)
Oxidation och reduktion följs alltid Ät
(Biochemistry 10:e, Berg et al. sid. 465)
(Bild)
Vid ligering sammanfogas molekyler
(Biochemistry 10:e, Berg et al. sid. 467)
(Bild)
Vid klyvning spjÀlkas en molekyl
(Biochemistry 10:e, Berg et al. sid. 466)
(Bild)
Anabolism domineras av kondensation, katabolism domineras av hydrolys
(Glukos â glykogen/stĂ€rkelse; Fettsyror â triacylglycerider; Aminosyror â proteiner)
(Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.39)
Isomerisering innebÀr omarrangemang
(Biochemistry 10:e, Berg et al. sid. 467)
Vid gruppöverföring flyttas funktionella grupper mellan molekyler
(Biochemistry 10:e, Berg et al. sid. 465)
(Bild)
Begrepp
Termodynamikens första lag
Termodynamikens andra lag
Energiomvandling
Metabolism
Katabolism â tre platser
Anabolism
Metabolit
ÎG
JĂ€mvikt
Kopplade reaktioner
ATP
Cellens energikvot
NAD(P)H
FADHâ
B-vitaminer
EnergiinnehÄll
Reduktion
Oxidation
Ligering
â Kondensation
Klyvning
â Hydrolys
Isomerisering
Gruppöverföring