1
0
Files
medical-notes/content/Biokemi/Metabolism/👋 Introduktion till metabolismen/Anteckningar.md
Johan Dahlin 81790199af
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 2m4s
vault backup: 2025-12-09 15:12:34
2025-12-09 15:12:34 +01:00

7.3 KiB

förelÀsare, tags, date
förelÀsare tags date
Ingela Parmryd
biokemi
introduktion-till-metabolismen
anteckningar
2025-11-28

Viktigt att veta Delta H för att veta vilket hÄll en reaktion gÄr punkt = metabolit

  • nĂ„got som ingĂ„r i en metabol vĂ€g

Glykolysen Àr den enda som finns i alla celler.


Vi gör eller förstör ingen energi, bara omvandlar Olika typer av energi

  • kemisk bindningsenergi
  • kinetisk energi - rörelser, vibrationer EJ i kroppen
  • potentiell energi - separation av laddningar
  • elektromagnetisk energi - strĂ„lning-fotosyntes

Metabolism

Katabolism Anabolism
nedbrytning uppbyggnad
lÄg energikvot hög energikvot
$NAD^+$/NADH $NADP^+$/NADPH
oxidation (av kol) reduktion (av kol)
hydrolys kondensation

Entropi som bara kan öka

Celler upprÀtthÄller ordning

  • Makromolekyler eller mindre
  • Gradienter
  • Organisation
    • Organeller
    • Celler
    • Organ
    • Organism
  • Kostnad: oordningen mĂ„ste öka mer pĂ„ annan plats
    • genom omvandling av energi

Upp och ner 10 ggr Vad hÀnder?

  • Andas mer
  • Blir varmare
  • Piggare
  • Högre hjĂ€rtfrekvens
  • VĂ€rk i benen

Behöver mer blod till benen, pumpa mer blod, krÀver mer syre

Verkningsgrad

  • förbrĂ€nningsmotor: 10-20%
  • katabolism: 50%
    • bĂ€ttre beroende pĂ„ uppdelning i flera steg

Det vi inte klarar av att göra avges som vÀrme

Fotosyntes

Indirekt eller direkt förutsÀttning för liv !Pasted image 20251128144158.png

6H_2O (vatten) + 6CO_2 (koldioxid) → 6O_2 (syre) + C_6H_{12}O_6 (socker)


Katabolismen sker i 3 stadier

  1. munhÄla/mattarmkanal - extracelulÀrt
    1. amylas (stÀrkelse)
    2. peptidaser (protein)
    3. oligosackaridaser (kolhydrater)
    4. lipaser (lipider)
  2. Cytoplasman
    1. Glykolysen - alla celler
      1. anaerob krÀver inte O_2
    2. ~10% av kroppens ATP
  3. Mitokondrier (finns inte i röda blodkroppar)
    1. Citronsyracykeln
    2. ÎČ-oxidation (fettsyra)
    3. Elektrontransportkedjan
      1. aerob, krÀver O_2
    4. Oxidativ fosforylering
      1. aerob, krÀver O_2
    5. ~90% av kroppens ATP

!Pasted image 20251128145049.png Inneboende egenskap hos A & B, Àndras inte

  • ∆G°= skillnad i standard fri energi, 1M & pH=7
  • T = temperaturen som kan pĂ„verkas
  • koncentrationerna A, B, C, D

I isolering gÄr en reaktion mot jÀmvikt, MEN det kan ta tid

  • grafit och diamant har hög aktiveringsenergi, kan ta miljontals Ă„r

I en metabol vÀv uppnÄs ej jÀmvikt

  • konkurrens om substrat
  • produkt avlĂ€gsnas
  • substrat tillförs jĂ€mvikt = oordning => död

En reaktion med pistivt delta g kan drivas av en reaktion med större negativt delta

A <→ B \Delta G 4kcal/mol
C <→ D \Delta G -7kcal/mol
A+C <> B+D \Delta G -3kcal/mol
En fosfatgrupp Àr ungefÀr 7kcal/mol. (i provrör, i celler kan det vara Ànnu mer fördelaktigt)

ATP adenosintrifosfat, en av nukleotiderna som anvÀnds för att bygga RNA & DNA

  • cellens energivaluta
    • Katabolismens mĂ„l Ă€r att bygga ATP-molekyler som vi kan anvĂ€nda för att tex bygga upp protein
    • tvĂ„ stycken fosfoanhydridbindning
      • 11-13kcal per mol vid klyvning, pga av jonstyrkan i cellen
      • man kan frigöra energi genom att klyva bindingarna, men det Ă€r inte bindingar i sig som innehĂ„ller energin
    • Fördelaktigt att spjĂ€lka
      • minskar repulsion
        • Alla 3 har negativ laddning, en inneboende repulsion
      • ökad oordning
        • gör tvĂ„ molekyler av en, nĂ€r man klyver
      • mer fördelaktigt interaktion med vatten
        • bĂ€ttre arrangemang med vatten nĂ€r man klyver Ă€n man har trifosfaten
      • resonansstabilisering
    • En fosfatjon kan förekomma i fyra olika former, som stĂ„r i balans med varandra

Cellens energikvot !Pasted image 20251128153544.png Koppling med ATP förskuter jÀmvikt med 10^8 per ATP

0.9-0.95 i vÀlmÄende celler.

100-250 gram beroende pÄ vikt i kroppen Àr ATP vid ett enskilt tillfÀlle

En lugn dag behöver. vi ungefÀr vÄran kroppsvikt i ATP


Fosforyltransferpotential

förmÄgan att överföra fosforyltransferpotential Hur fördelaktigt det Àr för en cell att bli av med sin fosfatgrupp

kreatinfosfat hittar vi i skellmuskler fosfoenulpyruvat PEP 1,3BPG bifosfatglycerat

fördel att bli av med fosforylgrupp - fosforylera ATP har en annan egenskap, kinetisk stabil behövs för reaktionen Termodynamiskt instabil det finns energi att utvinna, men du behöver investera för att fÄ ut det


NÀr man överför elektroner

NAD^+ / NADH nikotinamidadenindinukleotid

Den kan ocksÄ ha en fosfatjon pÄ sig ett pÄ ett stÀlle, behöver ett annat enzym för att kÀnna igen den dÄ blir det NADP+ eller NADPH.

!Pasted image 20251128154328.png

Oxiderade formen <----> reducerade formen Mer stabilt Ă©-arrangemang

Resonansstabilisering, dubbelbindningar kan sitta pÄ lite olika stÀllen (benzinringsanalogin) oxidation/reduktion

$FAD$/FADH_2

flavinadenindinukleotid oxiderande formen FAD och den reducerande FADH_2 !Pasted image 20251128154656.png VÀte kommer hamna pÄ kvÀvebindingarna Har ett mer stabilit é-arrangemang till vÀnster

oxidation/reduktion


Om \frac{[NAD^+]}{[NADH]} i cell hög → katabolism dĂ„ kommer kol att oxideras Om \frac{[NADP^+]}{[NADPH]} i cell Ă€r lĂ„g → anabolism dĂ„ kommer kol att reduceras


Vanliga reaktionstyper i metabolismen

  • reduktion tillförsel av elektroner
  • oxidation för
Reaktionstyp
reduktion tillförsel av elektroner och H^+ laddningsbalans
oxidation förlust av elektrioner
H^+ kommer att följa med
laddningsbalans
ligering sammanfogar molekyler
- subgrupp kondensation - H_2O som avges
klyvning spÀlkar en molekyl
- subgrupp hydrolys - H_2O förs till
isomerisering atomer förflyttas i molekylen, gör en isomer
gruppöverföring flyttas funktionella grupper mellan molekyler
frÄn en till en annan
Ju mer reducerat kol Àr ju mer kemisk bindningsenergi kommer att tillföras
Om vi har en enkolsförening, det mest reducerade vi kan ha Àr metan CH_4 (-IV)
det mest oxiderande Àr koldioxid CO_2 (+IV)

Vad innehÄller mest energi, glykos, mÀttad eller omÀttad fettsyra?

  • mĂ€ttad fettsyra
  • Vem har mest vĂ€ten pĂ„ sina kol?
    • glykos 4.1
    • fett fullt reducerat 9.4
    • fett oxiderat 4.3

katabolismen bryta ner (3 platser, cytoplasman, mitokondrien) anabolism senare i kursen metabolit en sak som följer med i metabolismen delta G, fördelaktig eller inte jÀmvikt uppnÄs aldrig, bra dÄ det leder till död kopplade reaktioner driver bÄde katabolism och anabolism cellens energikvot 0.9 Àr bra balans ATP vill ge bort en P-grupp, det Àr fördelaktigt ATP/NAD(P)H/FADH2 Àr kinetiskt stabila reduktion kol oxidation kol