Introduktion till metabolismen LPG001 Biokemi 2025-11-28 Ingela Parmryd --- ## Frågeställningar • Vad säger termodynamikens lagar och vad har det för implikationer för levande organismer? • Vad skiljer katabolism från anabolism? • Vad gör energiomvandling genom katabolism effektiv? • Hur kan reaktioner med höga positiva DG drivas? • Vilka energirika molekyler är centrala i metabolismen och vad gör dem energirika? • Vilken koppling finns mellan B-vitaminer och metabolism? • Vilken typ av reaktioner är vanliga i metabolismen? --- ## En överblick av metabolismen (Biochemistry 10:e, Berg et al. Figur 15.2) *(Bild)* --- ## Termodynamikens första lag Energi kan varken skapas eller förstöras, men den kan omvandlas. --- ## Metabolism - nedbrytning och uppbyggnad av molekyler under energiomvandling (Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.2) *(Bild)* --- ## Termodynamikens andra lag I ett isolerat system kan oordningen = entropin bara öka. Konsekvens: Om entropin minskar på en plats måste den öka mer någon annanstans. --- ## Att upprätthålla ordning kräver energi (Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.4) *(Bild)* --- ## Energi från solljus är källan till nästan allt liv på jorden (Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.9) *(Bild)* --- ## Katabolismen sker i tre stadier (Biochemistry 10:e, Berg et al. Figur 15.11) *(Bild)* --- ## DG avgör om en reaktion kommer att ske spontant Reaktion: A + B ⇌ C + D ΔG = skillnad i fri energi ΔG° = skillnad i standard fri energi, 1M & pH=7 R = allmänna gaskonstanten T = absoluta temperaturen 1 kcal/mol ≈ 4,2 kJ/mol --- ## Energiinnehållet hos reaktanterna styr riktningen av en reaktion (Essential Cell Biology, Sixth Edition, Figure 3.18) X har lägre energi än Y. Reaktionen Y → X ökar entropin och är exoterm – har –DG. Sker därför oftare än reaktionen X → Y som minskar entropin och har +DG när det finns lika mycket Y och X. Vid jämvikt sker reaktionen åt båda håll lika ofta. ΔG = ΔG°’ + RT ln ([X]/[Y]) --- ## Koppling kan driva ofördelaktiga reaktioner (Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.17) *(Bild)* --- ## Sekventiell koppling kan driva en ofördelaktig reaktion (Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.21) *(Bild)* --- ## Cellens energivaluta ATP innehåller två fosfoanhydridbindningar (Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.30) *(Bild)* --- ## Fosforyltransferpotential hos metaboliter (Biochemistry 10:e, Berg et al. Figur 15.5) *(Bild)* --- ## Cellens energikvot styr metabolismen (Biochemistry 10:e, Berg et al. Figur 15.17) *(Bild)* --- ## NAD(P)H är bärare av 2e- i en hydridjon (Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.34) *(Bild)* --- ## FADH₂ är bärare av 2e- i två väten (Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 13.13b) *(Bild)* --- ## Några B-vitaminer med en roll i metabolismen (Biochemistry 10:e, Berg et al. Figur 15.16) *(Bild)* --- ## Vanliga reaktionstyper i metabolismen • Oxidation/reduktion • Ligering/klyvning • Hydrolys/kondensation • Isomerisering • Gruppöverföring --- ## Ju mer reducerat kol är, desto mer energirik molekyl (Biochemistry 10:e, Berg et al. Figur 15.8) *(Bild)* --- ## Oxidation och reduktion följs alltid åt (Biochemistry 10:e, Berg et al. sid. 465) *(Bild)* --- ## Vid ligering sammanfogas molekyler (Biochemistry 10:e, Berg et al. sid. 467) *(Bild)* --- ## Vid klyvning spjälkas en molekyl (Biochemistry 10:e, Berg et al. sid. 466) *(Bild)* --- ## Anabolism domineras av kondensation, katabolism domineras av hydrolys (Glukos → glykogen/stärkelse; Fettsyror → triacylglycerider; Aminosyror → proteiner) (Essential Cell Biology, Fifth Edition, Figure 3.39) --- ## Isomerisering innebär omarrangemang (Biochemistry 10:e, Berg et al. sid. 467) --- ## Vid gruppöverföring flyttas funktionella grupper mellan molekyler (Biochemistry 10:e, Berg et al. sid. 465) *(Bild)* --- ## Begrepp Termodynamikens första lag Termodynamikens andra lag Energiomvandling Metabolism Katabolism – tre platser Anabolism Metabolit ΔG Jämvikt Kopplade reaktioner ATP Cellens energikvot NAD(P)H FADH₂ B-vitaminer Energiinnehåll Reduktion Oxidation Ligering – Kondensation Klyvning – Hydrolys Isomerisering Gruppöverföring