--- tags: - biokemi - rekombinant-dna-teknik - anteckningar föreläsare: Oliver Forsell date: 2025-11-26 --- Sätter dit en prime av intresse, restriktionssite. En insert som med hjälp av restriktionsenzym kan kapa och får en sticky ends. self-ligated vector, plasmiden binder till sig själv, isolera med blue/white. ampicillin? x-gal? iptg? lacz-alpha restriction, sitter ett repressionprotein, iptg inaktiverar en repressor AmpR: ampicillin restistans pellet? supernatant: det som hamnar ovanpå nukleasfritt vatten kilator? ko-faktor för vatten RnasaA: bryter ner RNA SDS löser upp fosfolipider och proteiner i cellmembranet eulera SYBR safe --- Dagens labb # Rena fram plasmiden # Klippar ur genen av intresse # Kör agarose gel # Tolka resultatet ---- ### What are the sites the plasmid contains that allow for this experiment? - Lacz - Β-lactamas (ampicilin resistansen) - BamH-insertion site, i vårta multiple cloning site - Origin of replication för att kunna replikera #### What are the 3 compounds in the LB plates that allow for selection of bacteria with plasmid and the distinction of plasmids with and without the inserted gene? - IPTG - X-Gal - Ampicillin ### What are the six steps in plasmid preparation and purification? 1. Pelleteringen 2. **Suspendera**, lösa upp pelleten 3. **Lysering** - så det läcker ut plasmid 4. **Neutralisera** - skyddar plasmiden på nytt 5. **Skölja bort salter** 6. Tillsätta vatten för att eulera ut vår plasmid ### What is a restriction enzyme and why was it used in this experiment? Hjälpa till att klippa ut genen och foga in vår plasmid, sticky ends ### Explain the principle of Gel Electrophoresis, what is it for? Separation av storlek eller massa på våra DNA-fragment. Elektrostatiskt repulsion, som får våra joner att separeras ### What´s the compound that allows for the visualization of the DNA in the gel? SYBR safe ### How many times does BamHI cut the plasmid without the insert? And the plasmid with the insert? Hur många gånger kommer BamHI klippa vår plasmed - utan insert: 1 - med insert: 2 på var sin sida om inserten för att få ut den ### Explain the different plasmid conformations that exist. - relaxed - supercoiled supper snabbt, de är tvinnade - linjära -