#### Förklara följande begrepp: replikationsbubbla och replikationsgaffel. #### Var är ett origin of replication? #### Hur skiljer sig DNA-syntes åt på leading och lagging strand? #### Vilken funktion har 3’ till 5’-exonukleas-aktiviteten som återfinns hos många DNA-polymeraser? #### Vad är processivitet? Hur kan en sliding clamp stimulera processivitet? #### Vad är ett primas? När behövs ett sådant enzym? #### Hur går “Okazaki fragment maturation” till i våra celler? #### Vilka aktiviteter är förknippade med exonukleas och endonukleas?### Förklara begreppen replikationsbubbla och replikationsgaffel ```spoiler-block: Replikationsbubbla är området där DNA öppnats kring ett origin; replikationsgaffel är varje Y-formad ände där DNA syntetiseras. ``` ### Var är ett origin of replication? ```spoiler-block: En specifik DNA-sekvens där replikation initieras och DNA öppnas. ``` ### Hur skiljer sig DNA-syntes på leading och lagging strand? ```spoiler-block: Leading strand syntetiseras kontinuerligt; lagging strand syntetiseras diskontinuerligt som Okazaki-fragment. ``` ### Vilken funktion har 3’→5’-exonukleasaktiviteten hos DNA-polymeraser? ```spoiler-block: Proofreading; avlägsnar felinkorporerade nukleotider och ökar noggrannheten. ``` ### Vad är processivitet och hur stimulerar sliding clamp detta? ```spoiler-block: Processivitet är hur många nukleotider som adderas per bindning; sliding clamp håller polymeraset kvar på DNA. ``` ### Vad är ett primas och när behövs det? ```spoiler-block: Ett RNA-polymeras som syntetiserar primers; behövs för att starta DNA-syntes. ``` ### Hur går Okazaki fragment maturation till? ```spoiler-block: RNA-primer tas bort, gap fylls med DNA och fragmenten ligeras ihop. ``` ### Vilka aktiviteter har exonukleas respektive endonukleas? ```spoiler-block: Exonukleas tar bort nukleotider från ändar; endonukleas klyver inom en nukleotidkedja. ``` ### Hur fungerar helikas? ```spoiler-block: Använder ATP för att separera DNA-strängarna genom att bryta vätebindningar. ``` ### Vilken roll spelar enkelsträngsbindande proteiner och vad heter de i våra celler? ```spoiler-block: Stabiliserar ssDNA och förhindrar återparning; i eukaryoter heter de RPA. ``` ### Varför bildas positiva supercoils och hur tas de bort? ```spoiler-block: De bildas framför replikationsgaffeln vid uppvridning; topoisomeraser avlägsnar dem genom att klyva och återligera DNA. ``` #### Hur fungerar helikas? #### Vilken roll spelar enkelsträngsbindande proteiner? Vad heter detta protein i våra celler? #### Varför bildas positiva supercoils? Vilka enzymer kan ta bort supercoils och hur?