Update gitignore

.gitattributes

@@ -1 +1,6 @@
 * text=auto eol=lf
+*.pdf filter=lfs diff=lfs merge=lfs -text
+*.docx filter=lfs diff=lfs merge=lfs -text
+*.xlsx filter=lfs diff=lfs merge=lfs -text
+*.pptx filter=lfs diff=lfs merge=lfs -text
+*.apkg filter=lfs diff=lfs merge=lfs -text

.github/workflows/deploy.yml

@@ -17,7 +17,7 @@ concurrency:
 
 jobs:
   build:
-    runs-on: ubuntu-22.04
+    runs-on: moln
     steps:
       - name: Checkout
         uses: actions/checkout@v4
@@ -35,18 +35,26 @@ jobs:
       - name: Build Quartz site
         run: npx quartz build
 
-      - name: Upload artifact
+      - name: Git LFS checkout
-        uses: actions/upload-pages-artifact@v3
+        run: |
-        with:
+          git lfs fetch
-          path: ./public
+          git lfs checkout
 
-  deploy:
+      - name: Copy
-    environment:
+        run: rsync public ~/notes
-      name: github-pages
+        
-      url: ${{ steps.deployment.outputs.page_url }}
+      # - name: Upload artifact
-    runs-on: ubuntu-22.04
+      #   uses: actions/upload-pages-artifact@v3
-    needs: build
+      #   with:
-    steps:
+      #     path: ./public
-      - name: Deploy to GitHub Pages
+     
-        id: deployment
+  # deploy:
-        uses: actions/deploy-pages@v4
+  #   environment:
+  #     name: github-pages
+  #     url: ${{ steps.deployment.outputs.page_url }}
+  #   runs-on: ubuntu-22.04
+  #   needs: build
+  #   steps:
+  #     - name: Deploy to GitHub Pages
+  #       id: deployment
+  #       uses: actions/deploy-pages@v4

.gitignore

@@ -1,3 +1,4 @@
 node_modules
 .idea/
 .obsidian/
+content/.obsidian

.idea/copilot.data.migration.agent.xml

@@ -1,6 +0,0 @@
-<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
-<project version="4">
-  <component name="AgentMigrationStateService">
-    <option name="migrationStatus" value="COMPLETED" />
-  </component>
-</project>

.idea/copilot.data.migration.ask.xml

@@ -1,6 +0,0 @@
-<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
-<project version="4">
-  <component name="AskMigrationStateService">
-    <option name="migrationStatus" value="COMPLETED" />
-  </component>
-</project>

.idea/copilot.data.migration.ask2agent.xml

@@ -1,6 +0,0 @@
-<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
-<project version="4">
-  <component name="Ask2AgentMigrationStateService">
-    <option name="migrationStatus" value="COMPLETED" />
-  </component>
-</project>

.idea/copilot.data.migration.edit.xml

@@ -1,6 +0,0 @@
-<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
-<project version="4">
-  <component name="EditMigrationStateService">
-    <option name="migrationStatus" value="COMPLETED" />
-  </component>
-</project>

.idea/dataSources.xml

@@ -1,19 +0,0 @@
-<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
-<project version="4">
-  <component name="DataSourceManagerImpl" format="xml" multifile-model="true">
-    <data-source source="LOCAL" name="collection.anki2" uuid="4eea5c4b-ac34-475e-932e-52db5d9bc3c2">
-      <driver-ref>sqlite.xerial</driver-ref>
-      <synchronize>true</synchronize>
-      <jdbc-driver>org.sqlite.JDBC</jdbc-driver>
-      <jdbc-url>jdbc:sqlite:$USER_HOME$/Library/Application Support/Anki2/User 1/collection.anki2</jdbc-url>
-      <working-dir>$ProjectFileDir$</working-dir>
-    </data-source>
-    <data-source source="LOCAL" name="collection.media.db2" uuid="38704b31-291e-4013-816b-a9d4c110da72">
-      <driver-ref>sqlite.xerial</driver-ref>
-      <synchronize>true</synchronize>
-      <jdbc-driver>org.sqlite.JDBC</jdbc-driver>
-      <jdbc-url>jdbc:sqlite:$USER_HOME$/Library/Application Support/Anki2/User 1/collection.media.db2</jdbc-url>
-      <working-dir>$ProjectFileDir$</working-dir>
-    </data-source>
-  </component>
-</project>

.idea/inspectionProfiles/Project_Default.xml

@@ -1,6 +0,0 @@
-<component name="InspectionProjectProfileManager">
-  <profile version="1.0">
-    <option name="myName" value="Project Default" />
-    <inspection_tool class="Eslint" enabled="true" level="WARNING" enabled_by_default="true" />
-  </profile>
-</component>

.idea/inspectionProfiles/profiles_settings.xml

@@ -1,6 +0,0 @@
-<component name="InspectionProjectProfileManager">
-  <settings>
-    <option name="USE_PROJECT_PROFILE" value="false" />
-    <version value="1.0" />
-  </settings>
-</component>

.idea/medical-notes.iml

@@ -1,8 +0,0 @@
-<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
-<module type="PYTHON_MODULE" version="4">
-  <component name="NewModuleRootManager">
-    <content url="file://$MODULE_DIR$" />
-    <orderEntry type="jdk" jdkName="Python 3.9" jdkType="Python SDK" />
-    <orderEntry type="sourceFolder" forTests="false" />
-  </component>
-</module>

.idea/misc.xml

@@ -1,7 +0,0 @@
-<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
-<project version="4">
-  <component name="Black">
-    <option name="sdkName" value="Python 3.9" />
-  </component>
-  <component name="ProjectRootManager" version="2" project-jdk-name="Python 3.9" project-jdk-type="Python SDK" />
-</project>

.idea/modules.xml

@@ -1,8 +0,0 @@
-<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
-<project version="4">
-  <component name="ProjectModuleManager">
-    <modules>
-      <module fileurl="file://$PROJECT_DIR$/.idea/medical-notes.iml" filepath="$PROJECT_DIR$/.idea/medical-notes.iml" />
-    </modules>
-  </component>
-</project>

.idea/vcs.xml

@@ -1,6 +0,0 @@
-<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
-<project version="4">
-  <component name="VcsDirectoryMappings">
-    <mapping directory="$PROJECT_DIR$" vcs="Git" />
-  </component>
-</project>

.idea/workspace.xml

@@ -1,294 +0,0 @@
-<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
-<project version="4">
-  <component name="AutoImportSettings">
-    <option name="autoReloadType" value="SELECTIVE" />
-  </component>
-  <component name="ChangeListManager">
-    <list default="true" id="d89ddef3-0f6b-45b8-91d4-ca4b15835330" name="Changes" comment="Comment out all footer">
-      <change beforePath="$PROJECT_DIR$/content/.obsidian/workspace.json" beforeDir="false" afterPath="$PROJECT_DIR$/content/.obsidian/workspace.json" afterDir="false" />
-    </list>
-    <option name="SHOW_DIALOG" value="false" />
-    <option name="HIGHLIGHT_CONFLICTS" value="true" />
-    <option name="HIGHLIGHT_NON_ACTIVE_CHANGELIST" value="false" />
-    <option name="LAST_RESOLUTION" value="IGNORE" />
-  </component>
-  <component name="ChangesViewManager">
-    <option name="groupingKeys">
-      <option value="directory" />
-      <option value="repository" />
-    </option>
-  </component>
-  <component name="Git.Settings">
-    <option name="PUSH_AUTO_UPDATE" value="true" />
-    <option name="RECENT_GIT_ROOT_PATH" value="$PROJECT_DIR$" />
-    <option name="UPDATE_TYPE" value="REBASE" />
-  </component>
-  <component name="GitHubPullRequestSearchHistory">{
-  &quot;lastFilter&quot;: {
-    &quot;state&quot;: &quot;OPEN&quot;,
-    &quot;assignee&quot;: &quot;jdahlin&quot;
-  }
-}</component>
-  <component name="GithubPullRequestsUISettings">{
-  &quot;selectedUrlAndAccountId&quot;: {
-    &quot;url&quot;: &quot;git@github.com:jdahlin/medical-notes.git&quot;,
-    &quot;accountId&quot;: &quot;1e93f994-4fa7-4744-99e1-09949f7f05dc&quot;
-  }
-}</component>
-  <component name="ProjectColorInfo">{
-  &quot;associatedIndex&quot;: 8
-}</component>
-  <component name="ProjectId" id="357FfPPGmybv8emiZqIykuEuVFA" />
-  <component name="ProjectViewState">
-    <option name="hideEmptyMiddlePackages" value="true" />
-    <option name="showExcludedFiles" value="false" />
-    <option name="showLibraryContents" value="true" />
-  </component>
-  <component name="PropertiesComponent"><![CDATA[{
-  "keyToString": {
-    "RunOnceActivity.ShowReadmeOnStart": "true",
-    "RunOnceActivity.TerminalTabsStorage.copyFrom.TerminalArrangementManager.252": "true",
-    "RunOnceActivity.git.unshallow": "true",
-    "SHARE_PROJECT_CONFIGURATION_FILES": "true",
-    "git-widget-placeholder": "main",
-    "last_opened_file_path": "/Users/johandahlin/dev/medical-notes/content",
-    "node.js.detected.package.eslint": "true",
-    "node.js.detected.package.tslint": "true",
-    "node.js.selected.package.eslint": "(autodetect)",
-    "node.js.selected.package.tslint": "(autodetect)",
-    "nodejs_package_manager_path": "npm",
-    "settings.editor.selected.configurable": "preferences.pluginManager",
-    "ts.external.directory.path": "/Users/johandahlin/dev/medical-notes/node_modules/typescript/lib",
-    "vue.rearranger.settings.migration": "true"
-  },
-  "keyToStringList": {
-    "DatabaseDriversLRU": [
-      "sqlite"
-    ]
-  }
-}]]></component>
-  <component name="RecentsManager">
-    <key name="CopyFile.RECENT_KEYS">
-      <recent name="$PROJECT_DIR$/content" />
-    </key>
-  </component>
-  <component name="SharedIndexes">
-    <attachedChunks>
-      <set>
-        <option value="bundled-js-predefined-d6986cc7102b-3aa1da707db6-JavaScript-PY-252.27397.106" />
-        <option value="bundled-python-sdk-4e2b1448bda8-9a97661f3031-com.jetbrains.pycharm.pro.sharedIndexes.bundled-PY-252.27397.106" />
-      </set>
-    </attachedChunks>
-  </component>
-  <component name="TaskManager">
-    <task active="true" id="Default" summary="Default task">
-      <changelist id="d89ddef3-0f6b-45b8-91d4-ca4b15835330" name="Changes" comment="" />
-      <created>1762453305813</created>
-      <option name="number" value="Default" />
-      <option name="presentableId" value="Default" />
-      <updated>1762453305813</updated>
-      <workItem from="1762453307058" duration="710000" />
-      <workItem from="1762593327520" duration="34000" />
-      <workItem from="1762612608374" duration="65000" />
-      <workItem from="1762612692934" duration="4412000" />
-      <workItem from="1762806071935" duration="668000" />
-      <workItem from="1762847028359" duration="2090000" />
-      <workItem from="1763284536213" duration="522000" />
-      <workItem from="1763285087929" duration="5191000" />
-      <workItem from="1763368336948" duration="74000" />
-      <workItem from="1763468129001" duration="1460000" />
-      <workItem from="1763591031608" duration="2000" />
-      <workItem from="1763668772985" duration="2662000" />
-    </task>
-    <task id="LOCAL−00001" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1762453359057</created>
-      <option name="number" value="LOCAL−00001" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL−00001" />
-      <updated>1762453359057</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL−00002" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1762453362391</created>
-      <option name="number" value="LOCAL−00002" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL−00002" />
-      <updated>1762453362391</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL−00003" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1762453373454</created>
-      <option name="number" value="LOCAL−00003" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL−00003" />
-      <updated>1762453373454</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL−00004" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1762593338504</created>
-      <option name="number" value="LOCAL−00004" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL−00004" />
-      <updated>1762593338504</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL−00005" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1762806089583</created>
-      <option name="number" value="LOCAL−00005" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL−00005" />
-      <updated>1762806089583</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL−00006" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1762806734743</created>
-      <option name="number" value="LOCAL−00006" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL−00006" />
-      <updated>1762806734743</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL−00007" summary="Add biokemi link">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1762847050135</created>
-      <option name="number" value="LOCAL−00007" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL−00007" />
-      <updated>1762847050135</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL−00008" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1762857589808</created>
-      <option name="number" value="LOCAL−00008" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL−00008" />
-      <updated>1762857589808</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL−00009" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1762873221905</created>
-      <option name="number" value="LOCAL−00009" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL−00009" />
-      <updated>1762873221905</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL−00010" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1762938195312</created>
-      <option name="number" value="LOCAL−00010" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL−00010" />
-      <updated>1762938195312</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL-00011" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1763468145902</created>
-      <option name="number" value="00011" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL-00011" />
-      <option name="project" value="LOCAL" />
-      <updated>1763468145902</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL-00012" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1763468981426</created>
-      <option name="number" value="00012" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL-00012" />
-      <option name="project" value="LOCAL" />
-      <updated>1763468981426</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL-00013" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1763502902573</created>
-      <option name="number" value="00013" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL-00013" />
-      <option name="project" value="LOCAL" />
-      <updated>1763502902573</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL-00014" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1763502909657</created>
-      <option name="number" value="00014" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL-00014" />
-      <option name="project" value="LOCAL" />
-      <updated>1763502909657</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL-00015" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1763502990290</created>
-      <option name="number" value="00015" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL-00015" />
-      <option name="project" value="LOCAL" />
-      <updated>1763502990290</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL-00016" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1763668886585</created>
-      <option name="number" value="00016" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL-00016" />
-      <option name="project" value="LOCAL" />
-      <updated>1763668886585</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL-00017" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1763704155282</created>
-      <option name="number" value="00017" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL-00017" />
-      <option name="project" value="LOCAL" />
-      <updated>1763704155282</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL-00018" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1763704169794</created>
-      <option name="number" value="00018" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL-00018" />
-      <option name="project" value="LOCAL" />
-      <updated>1763704169794</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL-00019" summary="Update">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1763704336164</created>
-      <option name="number" value="00019" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL-00019" />
-      <option name="project" value="LOCAL" />
-      <updated>1763704336164</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL-00020" summary="Disable graph">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1763704389594</created>
-      <option name="number" value="00020" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL-00020" />
-      <option name="project" value="LOCAL" />
-      <updated>1763704389594</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL-00021" summary="Comment out footer">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1763704635952</created>
-      <option name="number" value="00021" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL-00021" />
-      <option name="project" value="LOCAL" />
-      <updated>1763704635952</updated>
-    </task>
-    <task id="LOCAL-00022" summary="Comment out all footer">
-      <option name="closed" value="true" />
-      <created>1763704774833</created>
-      <option name="number" value="00022" />
-      <option name="presentableId" value="LOCAL-00022" />
-      <option name="project" value="LOCAL" />
-      <updated>1763704774833</updated>
-    </task>
-    <option name="localTasksCounter" value="23" />
-    <servers />
-  </component>
-  <component name="TypeScriptGeneratedFilesManager">
-    <option name="version" value="3" />
-  </component>
-  <component name="VcsManagerConfiguration">
-    <ignored-roots>
-      <path value="$PROJECT_DIR$/content" />
-    </ignored-roots>
-    <MESSAGE value="Add biokemi link" />
-    <MESSAGE value="Update" />
-    <MESSAGE value="Disable graph" />
-    <MESSAGE value="Comment out footer" />
-    <MESSAGE value="Comment out all footer" />
-    <option name="LAST_COMMIT_MESSAGE" value="Comment out all footer" />
-  </component>
-  <component name="github-copilot-workspace">
-    <instructionFileLocations>
-      <option value=".github/instructions" />
-    </instructionFileLocations>
-    <promptFileLocations>
-      <option value=".github/prompts" />
-    </promptFileLocations>
-  </component>
-</project>

content/.obsidian/app.json

@@ -1,11 +0,0 @@
-{
-  "alwaysUpdateLinks": true,
-  "promptDelete": false,
-  "attachmentFolderPath": "attachments",
-  "pdfExportSettings": {
-    "pageSize": "Letter",
-    "landscape": false,
-    "margin": "0",
-    "downscalePercent": 100
-  }
-}

content/.obsidian/appearance.json

@@ -1,3 +0,0 @@
-{
-  "theme": "moonstone"
-}

content/.obsidian/community-plugins.json

@@ -1,4 +0,0 @@
-[
-  "folder-note-plugin",
-  "obsidian-git"
-]

content/.obsidian/core-plugins.json

@@ -1,33 +0,0 @@
-{
-  "file-explorer": true,
-  "global-search": true,
-  "switcher": true,
-  "graph": true,
-  "backlink": true,
-  "canvas": true,
-  "outgoing-link": true,
-  "tag-pane": true,
-  "footnotes": false,
-  "properties": false,
-  "page-preview": true,
-  "daily-notes": true,
-  "templates": true,
-  "note-composer": true,
-  "command-palette": true,
-  "slash-command": false,
-  "editor-status": true,
-  "bookmarks": true,
-  "markdown-importer": false,
-  "zk-prefixer": false,
-  "random-note": false,
-  "outline": true,
-  "word-count": true,
-  "slides": false,
-  "audio-recorder": false,
-  "workspaces": false,
-  "file-recovery": true,
-  "publish": false,
-  "sync": true,
-  "bases": true,
-  "webviewer": false
-}

content/.obsidian/graph.json

@@ -1,22 +0,0 @@
-{
-  "collapse-filter": true,
-  "search": "",
-  "showTags": false,
-  "showAttachments": false,
-  "hideUnresolved": false,
-  "showOrphans": true,
-  "collapse-color-groups": true,
-  "colorGroups": [],
-  "collapse-display": true,
-  "showArrow": false,
-  "textFadeMultiplier": 0,
-  "nodeSizeMultiplier": 1,
-  "lineSizeMultiplier": 1,
-  "collapse-forces": true,
-  "centerStrength": 0.518713248970312,
-  "repelStrength": 10,
-  "linkStrength": 1,
-  "linkDistance": 250,
-  "scale": 0.5943143512528389,
-  "close": false
-}

content/.obsidian/plugins/folder-note-plugin/data.json

@@ -1,9 +0,0 @@
-{
-  "folderNoteHide": true,
-  "folderNoteType": "index",
-  "folderNoteName": "index",
-  "folderNoteKey": "ctrl",
-  "folderNoteAutoRename": true,
-  "folderDelete2Note": false,
-  "folderNoteStrInit": "# {{FOLDER_NAME}} Overview\n {{FOLDER_BRIEF_LIVE}} \n"
-}

content/.obsidian/plugins/folder-note-plugin/manifest.json

@@ -1,10 +0,0 @@
-{
-	"id": "folder-note-plugin",
-	"name": "Folder Note",
-	"version": "0.7.3",
-	"minAppVersion": "0.9.12",
-	"description": "Click a folder node to show a note describing the folder.",
-	"author": "xpgo",
-	"authorUrl": "https://github.com/xpgo/obsidian-folder-note",
-	"isDesktopOnly": false
-}

content/.obsidian/plugins/folder-note-plugin/styles.css

@@ -1,229 +0,0 @@
-/* hide the folder note file node  */
-div.is-folder-note {
-    display: none;
-}
-
-/* indicate the folder has note  */
-div.has-folder-note {
-    color: var(--text-nav-selected);
-}
-
-/*---------------------------------------------
-            Cute card view
------------------------------------------------*/
-
-.cute-card-band {
-    width: 100%;
-    max-width: 900px;
-    margin: 0 auto;
-    margin-top: 15px;
-    margin-bottom: 5px;
-    display: grid;
-    grid-template-columns: 1fr;
-    grid-template-rows: auto;
-    grid-gap: 20px;
-}
-
-@media (min-width: 30em) {
-    .cute-card-band {
-        grid-template-columns: 1fr 1fr;
-    }
-}
-
-@media (min-width: 60em) {
-    .cute-card-band {
-        grid-template-columns: repeat(3, 1fr);
-    }
-}
-
-.cute-card-view {
-    background: var(--background-accent);
-    text-decoration: none !important;
-    color: var(--text-normal);
-    box-shadow: 0 2px 5px rgba(0, 0, 0, 0.1);
-    display: flex;
-    flex-direction: column;
-    min-height: 100%;
-    position: relative;
-    top: 0;
-    transition: all 0.1s ease-in;
-    border-radius: 10px;
-}
-
-.cute-card-view:hover {
-    top: -2px;
-    box-shadow: 0 4px 5px rgba(0, 0, 0, 0.2);
-}
-
-.cute-card-view article {
-    padding: 15px;
-    flex: 1;
-    display: flex;
-    flex-direction: column;
-    justify-content: space-between;
-}
-
-.cute-card-view h1 {
-    font-size: 1.2rem;
-    margin: 0;
-    color: var(--text-accent);
-}
-
-.cute-card-view a {
-    text-decoration: none !important;
-}
-
-.cute-card-view p {
-    flex: 1;
-    line-height: 1.0;
-}
-
-.cute-card-view span {
-    font-size: 0.8rem;
-    font-weight: bold;
-    color: var(--text-faint);
-    letter-spacing: 0.05em;
-}
-
-.cute-card-view .thumb {
-    padding-bottom: 60%;
-    background-size: cover;
-    background-position: center center;
-    border-radius: 10px 10px 0px 0px;
-}
-
-.cute-card-view .thumb-color {
-    padding-bottom: 10%;
-    background-size: cover;
-    background-position: center center;
-    border-radius: 10px 10px 0px 0px;
-    text-transform: uppercase;
-    font-size: 1.2rem;
-    font-weight: bold;
-    text-align: center;
-    color: #FFFFFF;
-    padding: 10px;
-}
-
-.cute-card-view .thumb-color-folder {
-    background-color: slateblue;
-}
-
-.cute-card-view .thumb-color-note {
-    background-color: salmon;
-}
-
-
-
-/*---------------------------------------------
-            strip card view
------------------------------------------------*/
-
-.strip-card-band {
-    width: 100%;
-}
-
-.strip-card-view {
-    width: 100%;
-    max-width: 100%;
-    margin-top: 1.0rem;
-    margin-bottom: 1.0rem;
-    display: -webkit-box;
-    display: -webkit-flex;
-    display: -ms-flexbox;
-    display: flex;
-    -webkit-box-orient: horizontal;
-    -webkit-box-direction: normal;
-    -webkit-flex-direction: row;
-    -ms-flex-direction: row;
-    flex-direction: row;
-    -webkit-box-align: stretch;
-    -webkit-align-items: stretch;
-    -ms-flex-align: stretch;
-    align-items: stretch;
-    min-height: 8rem;
-    -webkit-border-radius: 10px;
-    border-radius: 10px;
-    overflow: hidden;
-    -webkit-transition: all .3s ease;
-    -o-transition: all .3s ease;
-    transition: all .3s ease;
-    -webkit-box-shadow: 0 1px 1px 0 rgba(31, 35, 46, 0.15);
-    box-shadow: 0 1px 1px 0 rgba(31, 35, 46, 0.15);
-    /* add by xpgo */
-    background: var(--background-accent);
-    text-decoration: none !important;
-    color: var(--text-normal);
-}
-
-.strip-card-view:hover {
-    -webkit-transform: translate(0px, -2px);
-    -ms-transform: translate(0px, -2px);
-    transform: translate(0px, -2px);
-    -webkit-box-shadow: 0 15px 45px -10px rgba(10, 16, 34, 0.2);
-    box-shadow: 0 15px 45px -10px rgba(10, 16, 34, 0.2);
-}
-
-.strip-card-view .thumb {
-    width: 20%;
-    max-width: 100%;
-    min-height: 9rem;
-    -webkit-background-size: cover;
-    background-size: cover;
-    background-position: 50% 50%;
-}
-
-.strip-card-view .thumb-color {
-    width: 20%;
-    max-width: 100%;
-    min-height: 9rem;
-    -webkit-background-size: cover;
-    background-size: cover;
-    background-position: center center;
-    /* add by xpgo */
-    display: flex;
-    justify-content: center;
-    align-items: center;
-    padding: 10px;
-    text-transform: uppercase;
-    font-size: 1.2rem;
-    font-weight: bold;
-    text-align: center;
-    color: #FFFFFF;
-}
-
-.strip-card-view .thumb-color-folder {
-    background-color: slateblue;
-}
-
-.strip-card-view .thumb-color-note {
-    background-color: salmon;
-}
-
-.strip-card-view article {
-    padding: 1rem;
-    width: 80%;
-}
-
-.strip-card-view h1 {
-    font-size: 1.5rem;
-    margin: 0 0 10px;
-    color: var(--text-accent);
-}
-
-.strip-card-view a {
-    text-decoration: none !important;
-}
-
-.strip-card-view p {
-    margin-top: 0;
-    flex: 1;
-    line-height: 1.0;
-}
-
-.strip-card-view span {
-    font-size: 0.8rem;
-    font-weight: bold;
-    color: var(--text-faint);
-    letter-spacing: 0.05em;
-}

content/.obsidian/workspace.json

@@ -1,255 +0,0 @@
-{
-  "main": {
-    "id": "19179b278823b064",
-    "type": "split",
-    "children": [
-      {
-        "id": "167a802aa161f7e7",
-        "type": "tabs",
-        "dimension": 38.71975019516003,
-        "children": [
-          {
-            "id": "6be8a23612495802",
-            "type": "leaf",
-            "state": {
-              "type": "markdown",
-              "state": {
-                "file": "Biokemi/Cellulära processer/DNA replikation/Anteckningar.md",
-                "mode": "source",
-                "source": false
-              },
-              "icon": "lucide-file",
-              "title": "Anteckningar"
-            }
-          }
-        ]
-      },
-      {
-        "id": "6ce2195cbdc1aa8d",
-        "type": "tabs",
-        "dimension": 61.28024980483997,
-        "children": [
-          {
-            "id": "66d1a84367288975",
-            "type": "leaf",
-            "state": {
-              "type": "markdown",
-              "state": {
-                "file": "Biokemi/Cellulära processer/DNA replikation/Stoff.md",
-                "mode": "source",
-                "source": false
-              },
-              "icon": "lucide-file",
-              "title": "Stoff"
-            }
-          }
-        ]
-      }
-    ],
-    "direction": "vertical"
-  },
-  "left": {
-    "id": "70dc58e919eddd95",
-    "type": "split",
-    "children": [
-      {
-        "id": "47a30d427cdfb6db",
-        "type": "tabs",
-        "children": [
-          {
-            "id": "3eadd732417e81df",
-            "type": "leaf",
-            "state": {
-              "type": "file-explorer",
-              "state": {
-                "sortOrder": "alphabetical",
-                "autoReveal": false
-              },
-              "icon": "lucide-folder-closed",
-              "title": "Files"
-            }
-          },
-          {
-            "id": "2e4a8a51eb03bd6b",
-            "type": "leaf",
-            "state": {
-              "type": "search",
-              "state": {
-                "query": "",
-                "matchingCase": false,
-                "explainSearch": false,
-                "collapseAll": false,
-                "extraContext": false,
-                "sortOrder": "alphabetical"
-              },
-              "icon": "lucide-search",
-              "title": "Search"
-            }
-          },
-          {
-            "id": "591b7f92ddc7ac6e",
-            "type": "leaf",
-            "state": {
-              "type": "bookmarks",
-              "state": {},
-              "icon": "lucide-bookmark",
-              "title": "Bookmarks"
-            }
-          }
-        ]
-      }
-    ],
-    "direction": "horizontal",
-    "width": 285.5024719238281
-  },
-  "right": {
-    "id": "0948c66181b40af9",
-    "type": "split",
-    "children": [
-      {
-        "id": "8e42749b81d80f27",
-        "type": "tabs",
-        "children": [
-          {
-            "id": "e5aef8df0156336c",
-            "type": "leaf",
-            "state": {
-              "type": "backlink",
-              "state": {
-                "file": "Biokemi/Enzymer/Anteckningar.md",
-                "collapseAll": false,
-                "extraContext": false,
-                "sortOrder": "alphabetical",
-                "showSearch": false,
-                "searchQuery": "",
-                "backlinkCollapsed": false,
-                "unlinkedCollapsed": true
-              },
-              "icon": "links-coming-in",
-              "title": "Backlinks for Anteckningar"
-            }
-          },
-          {
-            "id": "131da419ce467615",
-            "type": "leaf",
-            "state": {
-              "type": "outgoing-link",
-              "state": {
-                "file": "Histologi/Demokompendium/Preparattabell.md",
-                "linksCollapsed": false,
-                "unlinkedCollapsed": true
-              },
-              "icon": "links-going-out",
-              "title": "Outgoing links from Preparattabell"
-            }
-          },
-          {
-            "id": "5c1804c056cc2e31",
-            "type": "leaf",
-            "state": {
-              "type": "tag",
-              "state": {
-                "sortOrder": "frequency",
-                "useHierarchy": true,
-                "showSearch": false,
-                "searchQuery": ""
-              },
-              "icon": "lucide-tags",
-              "title": "Tags"
-            }
-          },
-          {
-            "id": "d4a03ebd29e7b96c",
-            "type": "leaf",
-            "state": {
-              "type": "outline",
-              "state": {
-                "file": "Histologi/Demokompendium/Preparattabell.md",
-                "followCursor": false,
-                "showSearch": false,
-                "searchQuery": ""
-              },
-              "icon": "lucide-list",
-              "title": "Outline of Preparattabell"
-            }
-          },
-          {
-            "id": "10341d1503d8d1c5",
-            "type": "leaf",
-            "state": {
-              "type": "git-view",
-              "state": {},
-              "icon": "git-pull-request",
-              "title": "Source Control"
-            }
-          }
-        ],
-        "currentTab": 4
-      }
-    ],
-    "direction": "horizontal",
-    "width": 200,
-    "collapsed": true
-  },
-  "left-ribbon": {
-    "hiddenItems": {
-      "switcher:Open quick switcher": false,
-      "graph:Open graph view": false,
-      "canvas:Create new canvas": false,
-      "daily-notes:Open today's daily note": false,
-      "templates:Insert template": false,
-      "command-palette:Open command palette": false,
-      "bases:Create new base": false,
-      "obsidian-git:Open Git source control": false
-    }
-  },
-  "active": "66d1a84367288975",
-  "lastOpenFiles": [
-    "Biokemi/Cellulära processer/Initiering och terminering av DNA replikation/Lärandemål.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/Initiering och terminering av DNA replikation/Provfrågor.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/Initiering och terminering av DNA replikation/Instuderingsfrågor.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/Initiering och terminering av DNA replikation/Anteckningar.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/DNA replikation/Stoff.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/DNA replikation/Anteckningar.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/DNA replikation/Provfrågor.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/DNA replikation/Lärandemål.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/DNA replikation/Instuderingsfrågor.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/Anteckningar.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/Stoff.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/Lärandemål.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/Instuderingsfrågor.md",
-    "attachments/Pasted image 20251121114559.png",
-    "attachments/Pasted image 20251121114507.png",
-    "attachments/Pasted image 20251121114215.png",
-    "attachments/Pasted image 20251121113406.png",
-    "attachments/Pasted image 20251121113046.png",
-    "attachments/Pasted image 20251121113014.png",
-    "attachments/Pasted image 20251121112518.png",
-    "attachments/Pasted image 20251121112158.png",
-    "attachments/Pasted image 20251121111945.png",
-    "attachments/Pasted image 20251121111829.png",
-    "Biokemi/Cellulära processer/Kromatin/Instuderingsfrågor.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/Kromatin/Anteckningar.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/Provfrågor.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/Kromatin/Stoff.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/DNA replikation",
-    "Biokemi/Cellulära processer/Kromatin/Provfrågor.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/Kromatin/Lärandemål.md",
-    "PU/Tystnadsplikt AI-svar.md",
-    "Biokemi/!Template/Anteckningar.md",
-    "index.md",
-    "Biokemi/Cellulära processer/Kromatin",
-    "Biokemi/index.md",
-    "Biokemi.md",
-    "Biokemi/Proteinseminarie/Stödord.md",
-    "Anatomi.md",
-    "Anatomi & Histologi",
-    "Biokemi/Cellulära processer/Translation",
-    "Biokemi/Cellulära processer/Kromatin",
-    "Biokemi/Cellulära processer/Kontroll avgenuttryck iprokaryoter",
-    "Biokemi/Cellulära processer/DNA replikation",
-    "Biokemi/Metabolism",
-    "Biokemi/Cellulära processer",
-    "Biokemi/Makromolekyler"
-  ]
-}

content/Biokemi/! Målbeskrivning.md

@@ -0,0 +1,198 @@
+
+[[Biokemi/Kemisk binding och biologiska makromolekyler/index]]
+### Lipider
+•	Energi-lager: fria fettsyror och triacylglycerol.  
+•	Membranlipider; amfipatibegreppet.  
+•	Kolesterol (struktur ska kunnas).  
+•	Fosfolipider (principiell struktur ska kunnas).  
+•	Glykolipider (principiell struktur ska kunnas).  
+•	Bildning av miceller och membran.  
+•	Transportformer: översikt om lipoproteiners struktur och funktion.  
+*Beskriva lipiders struktur och biologiska funktioner.* 
+### Från aminosyror till proteiner
+•	Primära aminosyror: uppbyggnad och joniseringstillstånd.  
+•	Stereoisomerer.  
+•	De 20 aminosyrornas kemiska egenskaper och principiella struktur.  
+•	Kovalent modifiering av aminosyror.  
+•	Peptidbindningen; prolin och cystein – speciella egenskaper.  
+•	Primär-, sekundär-, tertiär- och kvartärstruktur.  
+•	a-helixar och b-flak: uppbyggnad och stabilisering.  
+•	Principer för proteinveckning; stabilisering av 3D-struktur.  
+•	Disulfidbindningar; protein-disulfidisomeras.  
+•	Chaperoner och chaperoniner.  
+•	Prioner.  
+*Redogöra för aminosyrornas egenskaper och hur de kan interagera.* 
+*Redogöra för de olika nivåerna av proteinveckning.* 
+### Kolhydrater. Struktur
+•	Kolhydraters struktur: aldos/ketos, isomeri, ringbildning, glykosidisk bindning.  
+•	Monosackarider: glukos (struktur ska kunnas), galaktos, N-acetylglukosamin, N-acetylgalatosamin, fukos, sialinsyra.  
+•	Disackarider: laktos, galaktosemi, laktosintolerans.  
+•	Glykokonjugat: glykoproteiner (N-/O-länkade), glykolipider, proteoglykaner (principiell struktur ska kunnas), mucopolysackaridos.  
+•	Diversitet - AB0-systemet.  
+*Beskriva kolhydraters struktur och biologiska roller.* 
+### Att utforska proteiner
+•	Proteom-begreppet.  
+•	Proteiners kemiska/fysikaliska egenskaper som grund för rening.  
+•	Gelfiltrering, jonbytes- och affinitetskromatografi.  
+•	Elektrofores: SDS-PAGE, isoelektrisk fokusering.  
+•	Immunologiska tekniker och ”blottning”; antikropp/antigen.  
+•	Mono- vs polyklonala antikroppar.  
+•	ELISA-princip och kliniska exempel.  
+•	Struktur-bestämning: röntgenkristallografi, NMR, cryo-EM.  
+
+### Hemoglobin
+•	Receptor-ligand-interaktion.  
+•	Myoglobin och hemoglobin: struktur (porfyrinring, Fe).  
+•	Kooperativitet; syrebindningsförmåga.  
+•	Alloster reglering: CO₂, H⁺, BPG – molekylär bakgrund.  
+•	Mättnadskurvor; syretransport till vävnad.  
+•	HbF vs HbA – konsekvenser.  
+•	Sickle-cell-anemi: molekylär bakgrund.  
+### Nukleotider
+•	Centrala dogmen: replikation, transkription, translation, genetisk kod, läsram.  
+•	Enzymer: DNA-pol, RNA-pol, ribosom.  
+•	Nukleotider/nukleosider: principiell struktur.  
+•	Komplementär basparning; stabilitet hos dsDNA/RNA.  
+•	Ribonukleotidreduktas.  
+
+### Biokemi ur ett evolutionsperspektiv
+	•	Evolution: grundkoncept, livets evolution, RNA-värld, endosymbios; tillämpningar.  
+	•	DNA-replikation: grundläggande processer; replikationsgaffel/repliosom.  
+	•	Enzymaktiviteter: endo-/exonukleas, restriktionsendonukleaser, omvänt transkriptas, DNA-ligas.  
+	•	Processivitet och proofreading.  
+	•	DNA-topologi: superhelicitet, topoisomeraser.  
+	•	Transkription: RNA-pol I/II/III; capping, polyadenylering, splicing; snRNA.  
+	•	Prokaryot transkription: särdrag; koppling transkription-translation; operon; bakteriofag; plasmid.  
+	•	Kromatin: DNA-organisation; nukleosom; kromatin-nybildning.  
+	•	Replikationsstart i eukaryoter: ARS/ori; ORC, CDC6, MCM; cellcykelkoppling; telomerer.  
+	•	Translation: tRNA-struktur/funktion; aminoacylering; ribosom; initiering/elongering/translokation/terminering; reglering.  
+	•	Termodynamikens 3 lagar; H, S, G, ΔG, E0′; exergon/endregon; aktiveringsenergi; standardtillstånd; kopplade reaktioner.  
+	•	Enzymer I: aktiveringsenergi, övergångstillstånd, katalys.  
+	•	Enzymer II: aktiva säten; hastighetskonstanter; steady-state; Michaelis-Menten (KM, Vmax, kcat); inhibitorer (kompetitiv/okompetitiv/non-kompetitiv); kofaktorer; vitaminer; kopplade reaktioner; exempel: proteaser (chymotrypsin, katalytisk triad), Ser/Thr- och Tyr-kinaser, fosfataser, syntaser, oxidoreduktaser.  
+	•	Introduktion till metabolism: energiomvandling; anabolism/katabolism; katabolismens stadier; metaboliter/vägar; ATP, NAD(P)H, FADH₂; fosforyltransferpotential; energikvot; oxidation/reduktion; hydrolys/kondensation; B-vitaminer.  
+	•	Glykolys: reaktioner/metaboliter; enzymer; substratnivåfosforylering; reglering (alloster, feedforward, feedback); anaerob/aerob; GLUT; Warburg-effekten.  
+	•	Glykogen: struktur (α-1,4/α-1,6); funktion i lever/muskel; glykogenolys; glykogenes; alloster/hormonell reglering.  
+	•	Glukoneogenes: reaktioner/enzymer/reglering; PFK-2/FBP-2; substrat; laktatdehydrogenas; Cori-cykeln; laktatets öden.  
+	•	Citronsyracykeln: PDH-komplex; prostetisk grupp; CoA/acetyl-CoA; reaktioner/enzymer; dekarboxylering; dehydrogenering; reglering; hypoxi, HIF-1.  
+	•	Betaoxidation och TAG-syntes: fettsyrefrisättning; mitokondrietransport; betaoxidation; ketonkroppar; fettsyra/TAG-syntes.  
+	•	Elektrontransportkedja/oxidativ fosforylering: mitokondriens suborganeller; redoxpotential; elektronbärare; NADH→O₂; respiration; protonpumpning; elektrokemisk gradient; ATP-syntas; frikopplare; membrantransport; inhibitorer; NADH-shuntar; ATP-utbyte.  
+	•	Aminosyrametabolism: proteinogena/icke-proteinogena aminosyror; användning; upptag; essentiella/icke-essentiella; glukogena/ketogena; biosyntes; aminotransferaser; PKU; glutamat/glutamatdehydrogenas; ureacykel; extrahepatiska vävnader; kvävetransport; påfyllnadsreaktioner.  
+	•	Nukleotidnedbrytning: puriner/pyrimidiner; pentoser; skillnader i slutprodukter; pentosfosfat till glykolysintermediär/acetyl-CoA; gikt; två behandlingsstrategier.  
+	•	Pentosfosfatvägen: NADPH och ribos-5-fosfat – uppgifter; oxidativ/icke-oxidativ fas; koppling till glykolys/glukoneogenes; behovsstyrd slussning; G6PD-brist; oxidativ stress → hemolys.  
+	•	Kolesterolsyntes: källor; position i metabolism; ATP-citratelyas; HMG-CoA-reduktas (fyra regleringsmekanismer); tre huvudmekanismer för intracellulär kolesterolkontroll; funktion; utsöndring; enterohepatiska kretsloppet.  
+	•	Heme: syntes; nedbrytning; porfyrier (översikt).  
+	•	Cellmembran: membranlipider/proteiner; barriärfunktion; membrandomäner; glykokalyx (struktur/igenkänning); cell-cell-interaktioner; adhesionsmolekyler.  
+	•	Transport över membran: diffusion; faciliterad diffusion; bärarproteiner; aquaporiner; jonkanaler/aktivering; osmos; kanalfogar; aktiv transport (primär/sekundär; P-typ; Na⁺/K⁺-ATPase; ABC-transportörer; MDR-proteiner); uniport/antiport/symport.  
+
+Mål
+	•	Beskriva hur olika bindningar bidrar till strukturen hos makromolekyler.  
+	•	Beskriva lipiders struktur och biologiska funktioner.  
+	•	Redogöra för aminosyrornas egenskaper och hur de kan interagera.  
+	•	Redogöra för de olika nivåerna av proteinveckning.  
+	•	Beskriva kolhydraters struktur och biologiska roller.  
+	•	Beskriva metoder för undersökning av proteiners struktur och funktion.  
+	•	Beskriva hur proteiners funktion beror på proteinstruktur, bindningspartner och enskilda aminosyrors egenskaper.  
+	•	Beskriva byggstenarna för DNA och RNA, deras syntes och konsekvenser av störd nukleotidsyntes.  
+	•	Kunna översiktligt beskriva stegen i den centrala dogmen.  
+	•	Primär- och sekundärstruktur för DNA och RNA (kunna översiktligt).  
+	•	Övergripande förståelse för utvecklingen av biologiska vägar och biomolekyler.  
+	•	Beskriva hur DNA replikeras i eukaryota celler.  
+	•	Funktionen hos enzymer som verkar på DNA.  
+	•	Beskriva hur information i cellens DNA översätts till RNA.  
+	•	Modifieringar av eukaryot mRNA (capping, poly(A), splicing).  
+	•	De typer av DNA som finns i prokaryoter.  
+	•	Överföring av genetisk information från DNA till RNA i prokaryoter.  
+	•	Beskriva den eukaryota kromosomens uppbyggnad.  
+	•	Beskriva hur replikation startar i eukaryota celler.  
+	•	Beskriva överföringen av genetisk information från mRNA till protein.  
+	•	Förstå sambandet mellan fri energi, entalpi, entropi och jämviktskonstanter.  
+	•	Förstå kopplingen mellan biokemiska reaktioner och biomolekyler med högt energi-innehåll.  
+	•	Redogöra för enzymkinetik och reglering av enzymkatalyserade reaktioner.  
+	•	Beskriva enzymers och koenzymers struktur och funktion.  
+	•	Beskriva mekanismer för reglering av proteiners aktivitet.  
+	•	Redogöra för vad som karaktäriserar anabolism och katabolism, energirika molekyler och cellens energivaluta.  
+	•	Redogöra för glykolysens reaktioner, enzymer och reglering.  
+	•	Förstå skillnaden mellan anaerob och aerob glykolys.  
+	•	Redogöra för glykogens funktion och strukturella uppbyggnad.  
+	•	Beskriva hur glykogen syntetiseras och bryts ned.  
+	•	Beskriva hur glykogenmetabolismen styrs via allostera mekanismer och hormonsignalering.  
+	•	Redogöra för glukoneogenesens reaktioner, enzymer och reglering.  
+	•	Redogöra för laktats roll i metabolismen.  
+	•	Redogöra för länken mellan glykolys och citronsyracykeln och dess reglering.  
+	•	Redogöra för citronsyracykelns reaktioner, enzymer och reglering.  
+	•	Redogöra för omsättningen av triacylglycerol.  
+	•	Redogöra för elektrontransporten och dess koppling till protonpumpning.  
+	•	Redogöra för ATP-syntes via oxidativ fosforylering.  
+	•	Beskriva hur celler får tillgång till aminosyror och vad dessa kan användas till.  
+	•	Förstå skillnaden på essentiella och icke-essentiella aminosyror.  
+	•	Översiktligt redogöra för varifrån aminosyrors α-aminogrupp och kolskelett kommer.  
+	•	Beskriva reaktionerna katalyserade av ALAT och ASAT.  
+	•	Beskriva den bakomliggande orsaken till PKU.  
+	•	Översiktligt beskriva ureacykeln, dess funktion och huvudsakliga reglering.  
+	•	Redogöra för extrahepatiska vävnaders samspel med levern i aminosyrakatabolism.  
+	•	Översiktligt beskriva purinnukleotiders nedbrytning.  
+	•	Redogöra för hur nedbrytning av puriner och pyrimidiner skiljer sig m.a.p. slutprodukter (kväven/kolskelett).  
+	•	Redogöra för pentosfosfatvägens huvudsakliga funktion.  
+	•	Ge exempel på vad NADPH och ribos-5-fosfat används till.  
+	•	Översiktligt beskriva pentosfosfatvägens två faser och interaktion med glykolys/glukoneogenes.  
+	•	Översiktligt beskriva varför G6PD-brist särskilt påverkar erytrocyter och kan ge hemolys vid oxidativ stress.  
+	•	Redogöra för kolesterolets omsättning samt huvudprinciper för kolesterolsyntes och reglering.  
+	•	Redogöra för omsättningen av heme.  
+	•	Beskriva hur det eukaryota cellmembranet är uppbyggt.  
+	•	Beskriva mekanismer för transport över cellens plasmamembran.  
+
+
+
+
+
+
+- Beskriva metoder för undersökning av proteiners struktur och funktion. 
+- Beskriva hur proteiners funktion beror på proteinstruktur, bindningspartner och enskilda aminosyrors egenskaper. 
+- Beskriva byggstenarna för DNA och RNA, deras syntes och konsekvenser av störd nukleotidsyntes. 
+- Kunna översiktligt beskriva stegen i den centrala dogmen. 
+- Primär- och sekundärstruktur för DNA och RNA (kunna översiktligt). 
+- Övergripande förståelse för utvecklingen av biologiska vägar och biomolekyler. 
+- Beskriva hur DNA replikeras i eukaryota celler. 
+- Funktionen hos enzymer som verkar på DNA. 
+- Beskriva hur information i cellens DNA översätts till RNA. 
+- Modifieringar av eukaryot mRNA (capping, poly(A), splicing). 
+- De typer av DNA som finns i prokaryoter. 
+- Överföring av genetisk information från DNA till RNA i prokaryoter. 
+- Beskriva den eukaryota kromosomens uppbyggnad. 
+- Beskriva hur replikation startar i eukaryota celler. 
+- Beskriva överföringen av genetisk information från mRNA till protein. 
+- Förstå sambandet mellan fri energi, entalpi, entropi och jämviktskonstanter. 
+- Förstå kopplingen mellan biokemiska reaktioner och biomolekyler med högt energi-innehåll. 
+- Redogöra för enzymkinetik och reglering av enzymkatalyserade reaktioner. 
+- Beskriva enzymers och koenzymers struktur och funktion. 
+- Beskriva mekanismer för reglering av proteiners aktivitet. 
+- Redogöra för vad som karaktäriserar anabolism och katabolism, energirika molekyler och cellens energivaluta. 
+- Redogöra för glykolysens reaktioner, enzymer och reglering. 
+- Förstå skillnaden mellan anaerob och aerob glykolys. 
+- Redogöra för glykogens funktion och strukturella uppbyggnad. 
+- Beskriva hur glykogen syntetiseras och bryts ned. 
+- Beskriva hur glykogenmetabolismen styrs via allostera mekanismer och hormonsignalering. 
+- Redogöra för glukoneogenesens reaktioner, enzymer och reglering. 
+- Redogöra för laktats roll i metabolismen. 
+- Redogöra för länken mellan glykolys och citronsyracykeln och dess reglering. 
+- Redogöra för citronsyracykelns reaktioner, enzymer och reglering. 
+- Redogöra för omsättningen av triacylglycerol.
+- Redogöra för elektrontransporten och dess koppling till protonpumpning. 
+- Redogöra för ATP-syntes via oxidativ fosforylering. 
+- Beskriva hur celler får tillgång till aminosyror och vad dessa kan användas till. 
+- Förstå skillnaden på essentiella och icke-essentiella aminosyror. 
+- Översiktligt redogöra för varifrån aminosyrors α-aminogrupp och kolskelett kommer. 
+- Beskriva reaktionerna katalyserade av ALAT och ASAT. 
+- Beskriva den bakomliggande orsaken till PKU. 
+- Översiktligt beskriva ureacykeln, dess funktion och huvudsakliga reglering. 
+- Redogöra för extrahepatiska vävnaders samspel med levern i aminosyrakatabolism. 
+- Översiktligt beskriva purinnukleotiders nedbrytning. 
+- Redogöra för hur nedbrytning av puriner och pyrimidiner skiljer sig m.a.p. slutprodukter (kväven/kolskelett). 
+- Redogöra för pentosfosfatvägens huvudsakliga funktion. 
+- Ge exempel på vad NADPH och ribos-5-fosfat används till. 
+- Översiktligt beskriva pentosfosfatvägens två faser och interaktion med glykolys/glukoneogenes. 
+- Översiktligt beskriva varför G6PD-brist särskilt påverkar erytrocyter och kan ge hemolys vid oxidativ stress. 
+- Redogöra för kolesterolets omsättning samt huvudprinciper för kolesterolsyntes och reglering. 
+- Redogöra för omsättningen av heme. 
+- Beskriva hur det eukaryota cellmembranet är uppbyggt. 
+- Beskriva mekanismer för transport över cellens plasmamembran.

content/Biokemi/Kemisk binding och biologiska makromolekyler/Kovalenta bindningar.md

@@ -0,0 +1,26 @@
+en eller flera valenselektroner delas av molekyler
+
+typer:
+* enkel
+* dubbel 1.7x starkare
+* trippel - ovanlig i kroppen
+
+enkel kan roteras, dubbel är rak
+
+elektroner kan delas av mer än 2 molekyler, kallas då resonansstabilisering
+
+### Enkelbinding
+
+Kan roteras
+
+Exempel: HCl
+$$\ce{H. + .Cl: -> H:Cl}$$
+## Dubbelbinding
+
+Rak
+
+Exempel: $O
+$$\ce{:O: + :O: -> O=O}$$
+## Resonans
+
+![[Pasted image 20251027205207.png]]

content/Biokemi/Kemisk binding och biologiska makromolekyler/Vätebindningar.md

@@ -0,0 +1 @@
+

content/Biokemi/Kemisk binding och biologiska makromolekyler/index.md

@@ -0,0 +1,11 @@
+### Kemisk binding och biologiska makromolekyler
+•	[[Kovalenta bindningar]].  
+•	[[Jonbindningar]].  
+•	[[Vätebindningar]].  
+•	[[van der Waals krafter]].  
+•	[[Hydrofob effekt]].  
+•	[[Poläritet]].  
+•	[[Syra-bas reaktioner]].  
+•	Klasser av biomolekyler: [[nukleinsyror]], [[proteiner]], [[kolhydrater]], [[lipider]]. 
+
+*Beskriva hur olika bindningar bidrar till strukturen hos makromolekyler.* 

content/Biokemi/Lipider/index.md

@@ -0,0 +1,10 @@
+
+•	Energi-lager: fria fettsyror och triacylglycerol.  
+•	Membranlipider; amfipatibegreppet.  
+•	Kolesterol (struktur ska kunnas).  
+•	Fosfolipider (principiell struktur ska kunnas).  
+•	Glykolipider (principiell struktur ska kunnas).  
+•	Bildning av miceller och membran.  
+•	Transportformer: översikt om lipoproteiners struktur och funktion.  
+
+*Beskriva lipiders struktur och biologiska funktioner.* 

content/Instuderingsfrågor/1.1 Rörelseapparaten.md

@@ -0,0 +1,35 @@
+Uppgifterna löses bäst i grupp.
+Utgå från den detaljerade måbeskrivningen och kurslitteraturen när ni svarar på frågorna.
+Skelettanatomi
+1: Gå igenom hela listan på kroppens ben och leder. Palpera och lär dig hitta dessa på dig
+själv eller på en kamrat. Fortsätt tills du kan peka ut och namnge dem utantill.
+2: Titta på bilder på de skelettdelar som du enligt målbeskrivningen skall kunna i detalj. Lär
+dig minst 5 utmärkande drag för var och en av dessa, så att du kan skilja dem åt om du ser
+dem eller får dem beskrivna för dig. Ett tips är att fokusera på stora knölar och utskott, samt
+på de delar som utgör ledytor.
+3: Lär dig beskriva ett bens uppbyggnad, och vilka skillnader som finns mellan långa ben,
+korta ben och platta ben avseende deras struktur. Lär dig att ge exempel på de olika typerna
+av ben och var de finns i kroppen (vilket du ju redan kan efter att ha gått igenom fråga 1
+ovan)
+Muskelanatomi och rörelselära
+4: Gå igenom muskeltabellen och öva på ursprung, fäste och funktion för samtliga muskler.
+Lär dig peka ut ursprung, fäste och förlopp på din egen kropp och visa rörelsen som är
+muskelns funktion.
+5: Studera de leder som tas upp i målbeskrivningen och som du skall kunna i detalj. Vilka
+ben utgör ledhuvud och ledpanna i dessa leder? Runt vilka axlar sker rörelsen i dessa leder
+och vad kallas de rörelserna på medicinskt latin? Vilka andra utmärkande drag finns för
+dessa leder?
+6: Lär dig använda begreppen ursprung, fäste och rörelseaxel för att förklara varför en
+muskel har en viss funktion över en led. Öva på minst tio olika muskler.
+Generell terminologi och medicinskt latin
+7: Lär dig termerna för att ange riktningar och lägen i kroppen. Öva på att peka ut två
+punkter på kroppen och beskriv deras läge i förhållande till varandra med korrekt anatomisk
+terminologi. Passa också på att namnge de ben, muskler och organ som finns i närheten av
+de punkter ni utgår ifrån.
+8: Öva på att beskriva kroppen utifrån olika axlar och plan. Leta efter radiologiska bilder på
+nätet eller i böcker och beskriv dessa utifrån vilka plan genom kroppen de visar. Ser du
+kroppen framifrån, nedifrån eller från sidan? Bonuspoäng om du dessutom kan identifiera de
+anatomiska strukturerna som visas.
+9: Slå upp namnen på de minst tio muskler du gått igenom i fråga 6 ovan. Lär dig vad
+musklernas namn betyder på svenska. Försök hitta andra muskler med liknande namn och
+diskutera med en kamrat varför namnen liknar varandra.

content/Instuderingsfrågor/1.2 Hjärta och cirkulation.md

@@ -0,0 +1,27 @@
+
+Dessa frågor kräver längre och mer resonerande svar. Jobba gärna ihop med en el flera
+kurskamrater!
+1. Rita en schematisk bild över vilka hjärtrum och blodkärlstyper som ingår i
+cirkulationssystemet.
+2. Hur säkerställs blodets flödesriktning genom hjärta och kärl (dvs, hur hindras backflöde)?
+3. Vilka delar av hjärtat projiceras mest ventralt respektive dorsalt?
+4. På vilka sätt skiljer sig artärer från vener?
+5. Var sitter segelklaffarna och hur är de förankrade? Varför en sådan förankring?
+6. Hur sprids den signal som får hjärtat att kontrahera?
+7. Förklara kortfattat uppdelningen i stora och lilla kretsloppet.
+8. Vilka typer av kapillärer finns? Hur hänger utseende och funktion ihop? Ge exempel på
+vävnader med olika typer av kapillärer.
+9. Under fostertiden finns en öppen förbindelse mellan de båda förmaken – denna stängs
+normalt vid födseln. Vad heter denna förbindelse? Fundera över vilka konsekvenser en
+ofullständig slutning av denna förbindelse skulle kunna få.
+10. Beskriv kort funktion och uppbyggnad av hjärtvägg och hjärtsäck.
+11. Vilka tre vener tömmer sig i atrium dextrum?
+12. Vilka delar består aorta thoracica av?
+13. Beskriv med en teckning utseendet på aorta abdominalis och avgående stora kärl.
+Namnge dessa på latin och ange vilket organ/organsystem de primärt försörjer med blod.
+14. Vad är en bifurkation? Exemplifiera!
+15. Du är ute på VFU och får i uppgift att dels mäta blodtrycket på en patient, dels göra en
+venprovtagning. Vilken ”rekvisita” behöver du? Hur går du till väga för att skapa bra
+förutsättningar för ett gott resultat? Fundera över vilka parametrar som är viktigast.
+16. Vid en hjärtauskultation placeras stetoskopet inte bara på ett ställe utan flera – vilken är
+den anatomiska orsaken till att man gör så?

content/Instuderingsfrågor/Zoom meeting.md

@@ -0,0 +1,5 @@
+foo
+
+foobar
+hej
+Hello! How can I help you today?

content/Instuderingsfrågor/index.md

@@ -0,0 +1,6 @@
+
+
+```dataview
+LIST
+WHERE file.name != "index" and contains(file.folder, this.file.folder)
+```

content/Målbeskrivning/Alla mål.md

@@ -0,0 +1,124 @@
+
+## 1. Rörelseapparaten
+- Förstå hur muskler, leder och skelett samverkar för rörelse.
+- Redogöra för hur muskelns läge och kraftöverföring ger upphov till rörelse.
+- Förklara skillnaden mellan koncentrisk, excentrisk och isometrisk kontraktion.
+- Förklara hur agonist, synergist och antagonist samverkar.
+- Förstå skillnaden mellan tvärstrimmig, hjärt- och glatt muskel (struktur, innervering, funktion).
+- Förklara muskelns mikroskopiska uppbyggnad och kontraktionsmekanism (aktin–myosin).
+- Förklara principen för muskelspole och motorisk enhet (motor unit).
+- Beskriva skelettets uppbyggnad: kompakt/spongiöst ben, periost, endost, benmärg.
+- Redogöra för benbildning:
+  - Intramembranös (direkt)
+  - Endokondral (indirekt, via broskmodell)
+  - Zonindelning i epifysplattan
+- Förklara benremodellering och skillnad mellan omoget (filtben) och lammelärt ben.
+- Förstå broskets typer (hyalint, elastiskt, fibrillärt) och dess funktion.
+- Beskriva leder (synovialledens uppbyggnad, broskfogar, bindvävsfogar, bursor, senskidor).
+
+---
+
+## 2. Cirkulation och hjärta
+- Förklara hjärtats pumpcykel (systole/diastole).
+- Förstå hur hjärtklaffar och retledningssystem samverkar.
+- Beskriva blodflödet genom hjärtat och de stora kärlen.
+- Förklara funktionen hos SA-knutan, AV-knutan, His’ bunt och Purkinjefibrer.
+- Förklara hjärtats vägglager (endokard, myokard, epikard) och perikardiets roll.
+- Beskriva kärlväggens lager (tunica intima, media, adventitia).
+- Förstå skillnader mellan artärer, vener, arterioler, venoler och kapillärer.
+- Förklara hur blodtrycksreglering och muskelpump fungerar.
+- Beskriva blodets sammansättning och cellernas funktion.
+- Förklara blodbildning (hematopoes) och utvecklingslinjer:
+  - Myeloid och erytroid linje
+  - Granulocytutveckling
+  - Trombocytbildning från megakaryocyt
+- Förklara neutrofilens vandring från blod till vävnad (diapedes).
+
+---
+
+## 3. Hud
+- Förklara hudens lager och keratiniseringsprocessen (stratum basale → corneum).
+- Beskriva melaninsyntes och överföring till keratinocyter.
+- Förklara funktionen hos Langerhans-, Merkel- och melanocyter.
+- Redogöra för svettkörtlars sekretionstyper (merokrin, apokrin).
+- Förklara talgkörtelns holokrina sekretion.
+- Förstå hårsäckens struktur, tillväxt och stamceller.
+- Beskriva bröstkörtelns uppbyggnad och skillnaden mellan lakterande och icke-lakterande tillstånd.
+
+---
+
+## 4. Lymfatiska och immunologiska processer
+- Förstå lymfcirkulationen (från vävnad till venvinkel).
+- Förklara funktionen för lymfnod, mjälte och thymus.
+- Redogöra för lymfknutans filtrering och aktivering av immunsvar.
+- Förstå T-cellsselektion i thymus (positiv/negativ).
+- Förklara mjältens blodflöde, funktion i blodfiltrering och immunövervakning.
+
+---
+
+## 5. Nervsystemet
+- Förstå signalöverföring i neuron (aktionspotential, synapsöverföring).
+- Beskriva gliacellernas funktioner (astrocyter, oligodendrocyter, Schwannceller, mikroglia).
+- Förstå uppbyggnaden av CNS (grå/vit substans, bark, banor, kärnor).
+- Förklara hjärnhinnornas funktion (pia, arachnoidea, dura).
+- Förstå cerebrospinalvätskans produktion och cirkulation.
+- Förklara skillnaden mellan CNS och PNS: neuronens väg, ganglier och nervers lager (endo-/peri-/epineurium).
+- Förstå skillnaden mellan sympaticus och parasympaticus (ursprung, koppling, effekt).
+- Förklara reflexbågens princip.
+
+---
+
+## 6. Respiration
+- Förstå luftvägarnas struktur och gradvisa förändring från trakea till alveol.
+- Förklara gasutbytet i alveoler (diffusionsbarriär, typ I- och II-pneumocyter).
+- Förstå surfaktantens roll och produktion.
+- Förklara lungans elastiska egenskaper och pleurans funktion.
+- Förstå skillnaden mellan respiratoriskt och olfaktoriskt epitel.
+
+---
+
+## 7. Digestionssystemet
+- Förklara slemhinnans generella uppbyggnad (mucosa, submucosa, muscularis, serosa/adventitia).
+- Beskriva epitelvariationer längs GI-kanalen (esofagus → rektum).
+- Förklara magens körtelceller (parietal-, huvud-, mukösa och endokrina celler).
+- Förstå tunntarmens absorptionsmekanismer (villi, mikrovilli, kryptor).
+- Förklara tjocktarmens sekretion och resorption.
+- Förstå leverns lobulusstruktur och blodflöde (vena porta → centralven).
+- Förklara gallbildning och gallflöde.
+- Beskriva pankreas exokrina och endokrina delar (acinus, Langerhansöar).
+- Förklara hormonell reglering (insulin, glukagon) och diabetesprinciper.
+
+---
+
+## 8. Urogenitalorgan
+- Förstå njurens filtrationsprocess (glomerulus, Bowmans kapsel).
+- Beskriva tubulära funktioner: reabsorption, sekretion, koncentration.
+- Förklara miktionens nervreglering och sfinktrars roll.
+- Förstå spermatogenes (meios I–II, spermiogenes).
+- Förklara sertolicellers och leydigcellers funktion.
+- Förstå oogenes, follikelutveckling och ovulation.
+- Förklara endometriets cykliska förändringar (menstruation, proliferation, sekretion).
+- Förstå corpus luteums bildning och regression.
+- Beskriva placentans struktur, barriär och näringsutbyte.
+- Förklara uppbyggnad och funktion av navelsträngen.
+
+---
+
+## 9. Endokrina systemet
+- Förstå hormonell reglering via feedback (negativ återkoppling).
+- Förklara hypofysens uppbyggnad (adeno-/neurohypofys) och hormoner.
+- Beskriva sköldkörtelns hormonproduktion (tyroxin, T3, calcitonin).
+- Förklara paratyroideans PTH-effekt på kalciumreglering.
+- Förstå binjurens zoner och hormonproduktion (aldosteron, kortisol, androgener, adrenalin/noradrenalin).
+- Förklara pankreas endokrina funktion (insulin/glukagon).
+- Beskriva epifysens (corpus pineale) roll i melatoninsekretion.
+
+---
+
+## 10. Allmän cell- och vävnadsnivå
+- Förstå cell–cell och cell–matrix-förbindelser (tight junctions, desmosomer, hemidesmosomer, gap junctions).
+- Förklara basalmembranets uppbyggnad och funktion.
+- Beskriva epitelens polaritet och förnyelse.
+- Förstå ECM:s komponenter (fibrer, grundsubstans, proteoglykaner, GAG).
+- Förklara skillnaden mellan olika bindvävstyper (lucker, stram, elastisk, retikulär, mesenkymal).
+- Förstå principen för vävnadsregeneration och stamcellers roll.

content/Målbeskrivning/Plan.md

@@ -0,0 +1,24 @@
+
+Fredag:
+- Gör klart Epitel/Bindväv/Ben 30min
+- Blod 2h
+- Muskler 2h
+- Nerv 2h
+- Hud 2h
+- Anki 300
+
+Lördag
+* Lymfatiska 2h
+* Endokrina 2h
+* GI 2h
+* Respiratoriska 2h
+* Anki 300
+
+Söndag
+* Njure 1h
+* MUG 3h
+* KUG 3h
+* Anki 300
+
+Måndag
+* Anki 1000

content/Studieteknik/Minnespalats.md

@@ -0,0 +1,41 @@
+
+### Alfabet
+Arnold
+Bamse
+Chaplin
+Darth Vader
+Einstein
+Forrest Gump
+Greta
+Håkan
+Ingmar Bergman
+Jesus
+Kungen
+Lenin
+Mario
+Napoleon
+Ozzy
+Pippi
+Quentin
+Rick Ashley
+Stephen Hawkins
+Tarzan
+Ulf Kristersen
+Volvo
+Walter White
+X11
+Yoda
+Zlatan
+Åsna
+Älg
+Ödla
+1 sol
+2 glasögon
+3 tre vise men
+4 beatles
+5 pentagon
+6 tärning
+7 seven-up
+8 råtta
+9 kub
+0 Zorro