vault backup: 2025-12-07 00:48:31

content/Biokemi/Cellulära processer/Transport över cellmembran/Anteckningar.md

@@ -11,6 +11,7 @@ Passiv vs Aktiv transport
 Faciliterad diffusion
 
 plasmamembransystem
+
 - tar in och tar
 - när det går ut, börjar det i 
 	- ER → Golgi → sekretoriska vesiklar → PM eller 
@@ -31,6 +32,7 @@ plasmamembransystem
 ## Diffusion över membran
 
 Vad är lättast att diffunder?
+
 - lättast → svårast
 	- (små) hydrofoba, $O_2$ (stora kommer här också)
 	- små polära $H_2O$ (osmos)

wip/static.py

@@ -38,21 +38,15 @@ class ObsidianImageExtension(Extension):
 m = Markdown(
     extensions=[
         "mdx_math",
-        "mdx_truly_sane_lists",
         "nl2br",
-        "sane_lists",
         ObsidianImageExtension(),
     ],
     extension_configs={
         "mdx_math": {
             "enable_dollar_delimiter": True
-        },
-        'mdx_truly_sane_lists': {
-            'nested_indent': 2,
-            'truly_sane': True,
-        },
+        }
     },
-    #tab_length=2,
+    tab_length=2,
 )
 env.filters["markdown"] = m.convert
 

wip/templates/base.html

@@ -8,7 +8,7 @@
             --font-body: system-ui, -apple-system, "Segoe UI", Roboto, sans-serif;
             --font-mono: ui-monospace, "SF Mono", Menlo, monospace;
             --max-width: 70ch;
-            --line-height: 1.6;
+            --line-height: 1.15;
             --space: 1.25rem;
             --radius: 6px;
         }

wip/test.html

@@ -8,7 +8,7 @@
             --font-body: system-ui, -apple-system, "Segoe UI", Roboto, sans-serif;
             --font-mono: ui-monospace, "SF Mono", Menlo, monospace;
             --max-width: 70ch;
-            --line-height: 1.6;
+            --line-height: 1.15;
             --space: 1.25rem;
             --radius: 6px;
         }
@@ -204,30 +204,44 @@
 <p>Diffusion är något INTE behöver hjälp<br />
 Passiv vs Aktiv transport<br />
 Faciliterad diffusion</p>
-<p>plasmamembransystem<br />
-- tar in och tar<br />
-- när det går ut, börjar det i <br />
-    - ER → Golgi → sekretoriska vesiklar → PM eller <br />
-    - ER → golgi → PM<br />
-    - heter sekretoriska vägen<br />
-    - <br />
-- när det går ut<br />
-    - tidigt endosom → sen endosom → lysosom<br />
-- Vad påverkar utgången?<br />
-    - tjocklek<br />
-    - kolesterol i membranet<br />
-    - mättade fettsyror/acylgrupper<br />
-    - tätare packning<br />
-- Vad påverkar ingången?<br />
-    - permeabilitet (hur genomsläppligt)</p>
+<p>plasmamembransystem</p>
+<ul>
+<li>tar in och tar</li>
+<li>när det går ut, börjar det i <ul>
+<li>ER → Golgi → sekretoriska vesiklar → PM eller </li>
+<li>ER → golgi → PM</li>
+<li>heter sekretoriska vägen</li>
+<li></li>
+</ul>
+</li>
+<li>när det går ut<ul>
+<li>tidigt endosom → sen endosom → lysosom</li>
+</ul>
+</li>
+<li>Vad påverkar utgången?<ul>
+<li>tjocklek</li>
+<li>kolesterol i membranet</li>
+<li>mättade fettsyror/acylgrupper</li>
+<li>tätare packning</li>
+</ul>
+</li>
+<li>Vad påverkar ingången?<ul>
+<li>permeabilitet (hur genomsläppligt)</li>
+</ul>
+</li>
+</ul>
 <hr />
 <h2>Diffusion över membran</h2>
-<p>Vad är lättast att diffunder?<br />
-- lättast → svårast<br />
-    - (små) hydrofoba, <script type="math/tex">O_2</script> (stora kommer här också)<br />
-    - små polära <script type="math/tex">H_2O</script> (osmos)<br />
-    - stora polära, glykos (kolhydrater) <br />
-    - joner, laddade har det svårast (aminosyrer, nukleotider)</p>
+<p>Vad är lättast att diffunder?</p>
+<ul>
+<li>lättast → svårast<ul>
+<li>(små) hydrofoba, <script type="math/tex">O_2</script> (stora kommer här också)</li>
+<li>små polära <script type="math/tex">H_2O</script> (osmos)</li>
+<li>stora polära, glykos (kolhydrater) </li>
+<li>joner, laddade har det svårast (aminosyrer, nukleotider)</li>
+</ul>
+</li>
+</ul>
 <hr />
 <p>Glukostransportörer faciliterar diffusion<br />
 <img src='../content/attachments/Pasted image 20251125132516.png'/><br />
@@ -259,14 +273,14 @@ C2 = från</p>
 - Har man exakt händer ingenting<br />
 - Har man mer eller mindre så händer osmos<br />
 - hypertonisk, högre saltkoncentration<br />
-    - då kommer vatten gå ut ur cellen för att xxx koncentrationsgradienten<br />
-    - Då får vi en cell som krymper<br />
+  - då kommer vatten gå ut ur cellen för att xxx koncentrationsgradienten<br />
+  - Då får vi en cell som krymper<br />
 - hypotonisk, lägre saltkoncentration<br />
-    - då försöker vattnet att ta sig in<br />
-    - då sväller cellen<br />
-    - när det kommer in för mycket vatten så går den sönder, då säger den lysering<br />
-        - man kan använda saltlösning för att få ut innehållet i en cell<br />
-        - sen centrifugerar man så man får ut sina mitokondrier<br />
+  - då försöker vattnet att ta sig in<br />
+  - då sväller cellen<br />
+  - när det kommer in för mycket vatten så går den sönder, då säger den lysering<br />
+    - man kan använda saltlösning för att få ut innehållet i en cell<br />
+    - sen centrifugerar man så man får ut sina mitokondrier<br />
 - osmos = strävar mot utjämning av koncentrationsgradienten</p>
 <hr />
 <h3>Diffusion av vatten faciliteras av aquaporiner</h3>
@@ -290,12 +304,14 @@ C2 = från</p>
 </li>
 <li>Pendlar mellan öppen och stängd</li>
 <li>Aktiveras betyder att den öppnas<ul>
-<li>ligandbindning - kommer någonting utanför cellen, får en konformationsändring och öppnar sig<pre><code>- i sliden nämns att det kan t.ex. vara acetylkolin
-- elektriskt rocka, har 20k per kvmm, det gör att det kan komma upp i höga spänningar
-</code></pre>
+<li>ligandbindning - kommer någonting utanför cellen, får en konformationsändring och öppnar sig<ul>
+<li>i sliden nämns att det kan t.ex. vara acetylkolin</li>
+<li>elektriskt rocka, har 20k per kvmm, det gör att det kan komma upp i höga spänningar</li>
+</ul>
 </li>
-<li>ändring av spänning<pre><code>- membranpotential, skillnad mellan joner över ett membran
-</code></pre>
+<li>ändring av spänning<ul>
+<li>membranpotential, skillnad mellan joner över ett membran</li>
+</ul>
 </li>
 <li>mekaniskt</li>
 </ul>
@@ -351,9 +367,9 @@ Selektivitetsfiltret är byggt exakt för K⁺-storlek: karbonylgrupperna sitter
 <p>Bolldomän i cytoplasman med en länk med ett bindningsställe i den aktiverade, öppna kanalen den kan binda in till<br />
 - I öppen kanal blir <em>bindningen</em>→inaktiverad<br />
 - States<br />
-    - Closed hänger och slänger<br />
-    - Open precis utanför<br />
-    - Inactivated inne i hållet</p>
+  - Closed hänger och slänger<br />
+  - Open precis utanför<br />
+  - Inactivated inne i hållet</p>
 <p>Kanalen stängs efter ms efter aktivering</p>
 <p>Acetylkolinreceptorn är en receptor för ormgift<br />
 Alkaliner, cuarve, hämar transport av jonkanaler</p>
@@ -436,8 +452,9 @@ CFTR-muterat cystisk firos, ABC-transportör. Segare slem i lungorna, olika mkt
 </ul>
 </li>
 <li>Symport<ul>
-<li><em>sekundär aktiv transport</em><pre><code>- p-typ ATP eller ABC-transportörer heter *primär aktiv transport*
-</code></pre>
+<li><em>sekundär aktiv transport</em><ul>
+<li>p-typ ATP eller ABC-transportörer heter <em>primär aktiv transport</em></li>
+</ul>
 </li>
 <li>två föreningar, samma håll</li>
 <li>använder en gradient för att skapa en annan</li>
@@ -447,9 +464,12 @@ CFTR-muterat cystisk firos, ABC-transportör. Segare slem i lungorna, olika mkt
 </li>
 <li>Antiporter<ul>
 <li><em>sekundär aktiv transport</em></li>
-<li>två föreningar, olika håll<pre><code>- en med gradient - nästan alltid $Na^+_{(in)}$
-- en mot gradient - tex $Ca^{2+}_{(in)}$
-</code></pre>
+<li>två föreningar, olika håll<ul>
+<li>en med gradient - nästan alltid <script type="math/tex">Na^+_{(in)}</script>
+</li>
+<li>en mot gradient - tex <script type="math/tex">Ca^{2+}_{(in)}</script>
+</li>
+</ul>
 </li>
 </ul>
 </li>