From e0534c4d56f9b87479cb6c18e79c2ad1d5831b3d Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Johan Dahlin Date: Sat, 6 Dec 2025 23:35:49 +0100 Subject: [PATCH] vault backup: 2025-12-06 23:35:49 --- .../Instuderingsuppgifter.md | 30 ++ .../Glukoneogenes/Instuderingsuppgifter.md | 20 ++ wip/static.py | 8 +- wip/templates/base.html | 275 +++++++++------ wip/test.html | 329 ++++++++++++------ 5 files changed, 447 insertions(+), 215 deletions(-) diff --git a/content/Biokemi/Metabolism/Elektrontransportkedjan/Instuderingsuppgifter.md b/content/Biokemi/Metabolism/Elektrontransportkedjan/Instuderingsuppgifter.md index 7673929..1f47613 100644 --- a/content/Biokemi/Metabolism/Elektrontransportkedjan/Instuderingsuppgifter.md +++ b/content/Biokemi/Metabolism/Elektrontransportkedjan/Instuderingsuppgifter.md @@ -6,3 +6,33 @@ tags: föreläsare: Ingela Parmryd date: 2025-12-05 --- +#### 1. Var i celler finns mitokondrier? +#### 2. Vad kan påverka antalet mitokondrier per cell? +#### 3. Var finns ETK? +#### 4. Vad menas med redoxpotential? +#### 5. Hur mäts standardredoxpotentialen? +#### 6. Från vilka föreningar kommer elektronerna som går in i ETK? +#### 7. Vilka proteinkomplex finns i ETK? +#### 8. Vad händer i komplex I i ETK? +#### 9. Vad händer i komplex III i ETK? +#### 10. Vad händer i komplex IV i ETK? +#### 11. Hur är en cytokrom uppbyggd? +#### 12. Tidigt i ETK används Fe-S kluster för elektrontransport, sent används cytokromer. Varför? +#### 13. Vad krävs för att elektrontransportkedjan ska fungera? +#### 14. Vad är en respirasom? +#### 15. Vilka är beståndsdelarna i den elektrokemiska gradienten? +#### 16. Hur kan protoner pumpas över ett membran? +#### 17. Vad innebär oxidativ fosforylering? +#### 18. Hur är ATP-syntaset uppbyggt? +#### 19. Var hittas L, T och O konfiguration hos ATP-syntaset och vad sker där? +#### 20. Hur sker växling mellan L, T och O form hos ATP-syntaset? +#### 21. Hur många protoner passerar mitokondriens inre membran per varv ATP-syntaset roterar? +#### 22. Hur många protoner behöver passera mitokondriens inre membran för att ATP-syntaset ska generera en ATP? +#### 23. Hur transporteras protoner genom mitokondriens inre membran med hjälp av ATP-syntaset? +#### 24. Vad är en shunt? +#### 25. Hur kan NADH transporteras från cytoplasman till mitokondriens matrix? +#### 26. Hur transporteras ATP ut från mitokondriens matrix? +#### 27. Hur transporteras fosfat till mitokondriens matrix? +#### 28. Vad gör en frikopplare och vad får det för konsekvenser? +#### 29. Vad gör cyanid till ett gift? +#### 30. Hur många ATP kan utvinnas från en glukosmolekyl vid aerob metabolism? \ No newline at end of file diff --git a/content/Biokemi/Metabolism/Glukoneogenes/Instuderingsuppgifter.md b/content/Biokemi/Metabolism/Glukoneogenes/Instuderingsuppgifter.md index 004a264..83d29b8 100644 --- a/content/Biokemi/Metabolism/Glukoneogenes/Instuderingsuppgifter.md +++ b/content/Biokemi/Metabolism/Glukoneogenes/Instuderingsuppgifter.md @@ -6,3 +6,23 @@ tags: - instuderingsuppgifter date: 2025-12-03 --- +#### 1. När sker glukoneogenes? +#### 2. Var i cellen sker glukoneogenes? +#### 3. De flesta stegen i glykolysen är reversibla, men det finns tre undantag. Vilka är de tre +#### undantagen och vad skiljer dem från de övriga stegen i glykolysen? +#### 4. Vilken reaktion katalyseras av enzymet pyruvatkarboxylas och hur sker reaktionen? +#### 5. Vad är biotin och vad har det för roll i glukoneogenesen? +#### 6. I vilken form kan koldioxid förekomma i vattenlösning? +#### 7. Hur transporteras oxalacetat ut ur mitokondrier? +#### 8. Vilken reaktion katalyseras av enzymet fosfoenolpyruvatkarboxykinas? +#### 9. I vilken vävnad finns glukos 6-fosfatas, varför finns det där och vilken reaktion katalyserar enzymet? +#### 10. Vad karaktäriserar ett bifunktionellt enzym? +#### 11. På vilket sätt kan triacylglycerider användas för glukoneogenes? +#### 12. Vilka aminosyror är glukogena? +#### 13. Vilka glukogena metaboliter kan bildas från aminosyror? +#### 14. När bildas laktat som slutprodukt i glykolysen och varför? +#### 15. Hur kan laktat som bildas i skelettmuskler användas för glukoneogenes? +#### 16. Vilka celltyper kan använda laktat som energikälla och hur gör de det? +#### 17. Vilka föreningar inhiberar respektive stimulerar glukoneogenes? +#### 18. Hur säkerställs det att glykolys och glukoneogenes inte är fullt aktiva på samma gång? +#### 19. På vilken tidsskala verkar olika regleringsmekanismer? \ No newline at end of file diff --git a/wip/static.py b/wip/static.py index 4d95812..909d054 100644 --- a/wip/static.py +++ b/wip/static.py @@ -35,7 +35,13 @@ class MyExtension(Extension): def extendMarkdown(self, md): md.preprocessors.register(ObsidianImage(md), 'mypattern', 175) -m = Markdown(extensions=[MyExtension()]) +m = Markdown( + extensions=[MyExtension(), "mdx_math"], + extension_configs={ + "mdx_math": { + "enable_dollar_delimiter": True + } + }) env.filters["markdown"] = m.convert output = root_dir / "test.html" diff --git a/wip/templates/base.html b/wip/templates/base.html index a919395..31e8c12 100644 --- a/wip/templates/base.html +++ b/wip/templates/base.html @@ -1,120 +1,191 @@ - - - {{note.title}} + p, ul, ol, blockquote, pre, table { + margin: var(--space) 0; + } + + /* Headings: predictable rhythm, not oversized */ + h1, h2, h3, h4, h5, h6 { + line-height: 1.25; + margin: calc(var(--space) * 1.6) 0 var(--space); + font-weight: 600; + } + + h1 { + font-size: 1.8rem; + } + + h2 { + font-size: 1.45rem; + } + + h3 { + font-size: 1.25rem; + } + + h4 { + font-size: 1.1rem; + } + + h5, h6 { + font-size: 1rem; + } + + /* Lists */ + ul, ol { + padding-inline-start: 1.4rem; + margin-block-start: var(--space); + } + + li { + margin: 0.3rem 0; + } + + /* Code */ + code, pre { + font-family: var(--font-mono); + font-size: 0.9rem; + border-radius: var(--radius); + } + + pre { + padding: 0.75rem 1rem; + overflow-x: auto; + } + + /* Tables */ + table { + width: 100%; + border-collapse: collapse; + font-size: 0.95rem; + } + + th, td { + padding: 0.5rem 0.75rem; + border: 1px solid currentcolor; + border-opacity: 0.2; + } + + th { + font-weight: 600; + } + + /* Blockquotes */ + blockquote { + padding: 0.75rem 1rem; + border-inline-start: 4px solid currentcolor; + border-opacity: 0.4; + opacity: 0.9; + } + + /* Images & media */ + img, video { + max-width: 100%; + height: auto; + display: block; + border-radius: var(--radius); + margin: var(--space) 0; + } + + /* Horizontal rule */ + hr { + margin: calc(var(--space) * 2) 0; + border: none; + border-bottom: 1px solid; + opacity: 0.2; + } + + {{note.title}} + +

{{note.title}}

-{{note.frontmatter}} + {{note.our_content | markdown}} \ No newline at end of file diff --git a/wip/test.html b/wip/test.html index c702fb0..6a956e3 100644 --- a/wip/test.html +++ b/wip/test.html @@ -1,114 +1,209 @@ - - - Anteckningar + p, ul, ol, blockquote, pre, table { + margin: var(--space) 0; + } + + /* Headings: predictable rhythm, not oversized */ + h1, h2, h3, h4, h5, h6 { + line-height: 1.25; + margin: calc(var(--space) * 1.6) 0 var(--space); + font-weight: 600; + } + + h1 { + font-size: 1.8rem; + } + + h2 { + font-size: 1.45rem; + } + + h3 { + font-size: 1.25rem; + } + + h4 { + font-size: 1.1rem; + } + + h5, h6 { + font-size: 1rem; + } + + /* Lists */ + ul, ol { + padding-inline-start: 1.4rem; + margin-block-start: var(--space); + } + + li { + margin: 0.3rem 0; + } + + /* Code */ + code, pre { + font-family: var(--font-mono); + font-size: 0.9rem; + border-radius: var(--radius); + } + + pre { + padding: 0.75rem 1rem; + overflow-x: auto; + } + + /* Tables */ + table { + width: 100%; + border-collapse: collapse; + font-size: 0.95rem; + } + + th, td { + padding: 0.5rem 0.75rem; + border: 1px solid currentcolor; + border-opacity: 0.2; + } + + th { + font-weight: 600; + } + + /* Blockquotes */ + blockquote { + padding: 0.75rem 1rem; + border-inline-start: 4px solid currentcolor; + border-opacity: 0.4; + opacity: 0.9; + } + + /* Images & media */ + img, video { + max-width: 100%; + height: auto; + display: block; + border-radius: var(--radius); + margin: var(--space) 0; + } + + /* Horizontal rule */ + hr { + margin: calc(var(--space) * 2) 0; + border: none; + border-bottom: 1px solid; + opacity: 0.2; + } + + Anteckningar + +

Anteckningar

-{'föreläsare': 'Ingela Parmryd', 'tags': ['biokemi', 'anteckningar', 'transport-över-cellmembran'], 'date': datetime.date(2025, 11, 25)} +

Diffusion är något INTE behöver hjälp Passiv vs Aktiv transport Faciliterad diffusion

@@ -132,8 +227,8 @@ Faciliterad diffusion

Diffusion över membran

Vad är lättast att diffunder? - lättast → svårast - - (små) hydrofoba, $O_2$ (stora kommer här också) - - små polära $H_2O$ (osmos) + - (små) hydrofoba, (stora kommer här också) + - små polära (osmos) - stora polära, glykos (kolhydrater) - joner, laddade har det svårast (aminosyrer, nukleotider)

@@ -145,7 +240,8 @@ Faciliterad diffusion

Transportörer/Bärarproteiner

GLUT1-5 har olika affinitet för glukos Varje transportör kan ta ungefär ~1000 molekyler per sekund @@ -153,11 +249,13 @@ Högre i blodet och ECM, transport av glukos sker oftast inåt i cellen Hastigheten beror på - antal transportprotein - hur hög koncentration

-

$\Delta G = RTln(C_2/C_1)$ +

+ C1 = till C2 = från

Q: Behöver vi kunna formeln. Svaret är att vi inte behöver en miniräknare på tentan.

-

Diffusion av $H_2O$

+

Diffusion av +

Fysiologiskt salt ~150mM = isotonisk - Det är så mkt joner vi har i miljön runt om och i våra celler - Har man exakt händer ingenting @@ -180,14 +278,15 @@ C2 = från

  • Utsöndring av svett och tårar
  • Passiv transport
  • Epitel - njurar
    • -
  • Det här går mkt snabbare $10^6$ /s 𝛼-poriner
    • +
  • Det här går mkt snabbare /s 𝛼-poriner
  • Faciliterad diffusion

    • Jonkanalerna