jdahlin/medical-notes
1
0
Fork 0
Code Actions Activity

vault backup: 2025-12-06 00:40:26
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 1m18s
Details

Browse Source
This commit is contained in:
Johan Dahlin
2025-12-06 00:40:26 +01:00
parent 038cb1c2dd
commit b6e8a73fff
4 changed files with 44 additions and 34 deletions
Download Patch File Download Diff File Expand all files Collapse all files

2
content/Biokemi/Cellulära processer/Transport över cellmembran/Anteckningar.md
View File

@@ -294,5 +294,3 @@ kanalfogar binder ihop små celler, t.ex. näring i benceller
Jongradienter Na/Kalium mkt inne/ut på av ATPaset-pump Jongradienter Na/Kalium mkt inne/ut på av ATPaset-pump
ABC kräver 2 ATP fosfo+defosfo ABC kräver 2 ATP fosfo+defosfo
MDR inblandat i pumpar MDR inblandat i pumpar
![[Pasted image 20251125132516.png]]

40
wip/static.py
View File

@@ -1,7 +1,12 @@
import pathlib import pathlib
from obsidian_parser import Vault import re
import markdown
import jinja2 import jinja2
from markdown.core import Markdown
from markdown.extensions import Extension
from markdown.preprocessors import Preprocessor
from obsidian_parser import Vault
root_dir = pathlib.Path(__file__).parent root_dir = pathlib.Path(__file__).parent
vault = Vault(root_dir / ".." / "content") vault = Vault(root_dir / ".." / "content")
@@ -9,38 +14,37 @@ note = vault.get_note("Biokemi/Cellulära processer/Transport över cellmembran/
loader = jinja2.FileSystemLoader(root_dir / "templates") loader = jinja2.FileSystemLoader(root_dir / "templates")
env = jinja2.Environment(loader=loader) env = jinja2.Environment(loader=loader)
from markdown.preprocessors import Preprocessor
import re
class NoRender(Preprocessor): class ObsidianImage(Preprocessor):
""" Skip any line with words 'NO RENDER' in it. """
def run(self, lines): def run(self, lines):
new_lines = [] new_lines = []
for line in lines: for line in lines:
print(repr(line))
m = re.search(r"!\[\[(.*)\]\]", line) m = re.search(r"!\[\[(.*)\]\]", line)
if m: if m:
print(m.groups()) if "|" in m.group(1):
img, width = m.group(1).split("|")
new_lines.append("<img src='../content/attachments/" + img + "' style='width:" + width + ";'/>")
else:
new_lines.append("<img src='../content/attachments/" + m.group(1) + "'/>")
else:
new_lines.append(line)
return new_lines return new_lines
from markdown.extensions import Extension
class MyExtension(Extension): class MyExtension(Extension):
def extendMarkdown(self, md): def extendMarkdown(self, md):
md.preprocessors.register(NoRender(md), 'mypattern', 175) md.preprocessors.register(ObsidianImage(md), 'mypattern', 175)
m = markdown.Markdown(extensions=[]) m = Markdown(extensions=[MyExtension()])
print(m.registeredExtensions)
env.filters["markdown"] = m.convert env.filters["markdown"] = m.convert
output = root_dir / "test.html" output = root_dir / "test.html"
template = env.get_template("base.html") template = env.get_template("base.html")
with output.open("w", encoding="utf-8") as f: with output.open("w", encoding="utf-8") as f:
print(note.reading_view) data = template.render(note=note, vault=vault)
output = template.render(note=note, vault=vault) f.write(data)
f.write(output)
#import webbrowser import webbrowser
#webbrowser.open(output.as_uri()) webbrowser.open(output.as_uri())
#print(f"Written to {output}") print(f"Written to {output}")

2
wip/templates/base.html
View File

@@ -10,6 +10,6 @@
</head> </head>
<body> <body>
<h1>{{note.title}}</h1> <h1>{{note.title}}</h1>
{{note.reading_view | markdown}} {{note.content | markdown}}
</body> </body>
</html> </html>

18
wip/test.html
View File

@@ -10,6 +10,14 @@
</head> </head>
<body> <body>
<h1>Anteckningar</h1> <h1>Anteckningar</h1>
<hr />
<p>föreläsare: Ingela Parmryd
tags:
- biokemi
- anteckningar
- transport-över-cellmembran
date: 2025-11-25</p>
<hr />
<p>Diffusion är något INTE behöver hjälp <p>Diffusion är något INTE behöver hjälp
Passiv vs Aktiv transport Passiv vs Aktiv transport
Faciliterad diffusion</p> Faciliterad diffusion</p>
@@ -39,10 +47,10 @@ Faciliterad diffusion</p>
- joner, laddade har det svårast (aminosyrer, nukleotider)</p> - joner, laddade har det svårast (aminosyrer, nukleotider)</p>
<hr /> <hr />
<p>Glukostransportörer faciliterar diffusion <p>Glukostransportörer faciliterar diffusion
!Pasted image 20251125132516.png <img src='../content/attachments/Pasted image 20251125132516.png'/>
Även kallade bärarproteiner</p> Även kallade bärarproteiner </p>
<h1>Passiv transport</h1> <h1>Passiv transport</h1>
<p>med gradienten - Man behöver inte tillföra energi, använder energin som tillför gradienten</p> <p>med gradienten - Man behöver inte tillföra energi, använder energin som tillför gradienten </p>
<h3>Transportörer/Bärarproteiner</h3> <h3>Transportörer/Bärarproteiner</h3>
<ul> <ul>
<li>transport av polära moleklyer</li> <li>transport av polära moleklyer</li>
@@ -127,7 +135,7 @@ $\Delta G = RT ln(C_2/C_1) + ZF\Delta V$</p>
</ul> </ul>
<hr /> <hr />
<h3>Uppbyggnaden av katjonkanaler är konserverad</h3> <h3>Uppbyggnaden av katjonkanaler är konserverad</h3>
<p>!Pasted image 20251125135429.png <p><img src='../content/attachments/Pasted image 20251125135429.png'/>
- central por av helix S5 och S6 - central por av helix S5 och S6
- S1-4 bildar paddel utanför por</p> - S1-4 bildar paddel utanför por</p>
<p>S4 positivt laddad, känner av ändring i membranpotential <p>S4 positivt laddad, känner av ändring i membranpotential
@@ -274,6 +282,6 @@ kanalfogar binder ihop små celler, t.ex. näring i benceller
Jongradienter Na/Kalium mkt inne/ut på av ATPaset-pump Jongradienter Na/Kalium mkt inne/ut på av ATPaset-pump
ABC kräver 2 ATP fosfo+defosfo ABC kräver 2 ATP fosfo+defosfo
MDR inblandat i pumpar</p> MDR inblandat i pumpar</p>
<p>!Pasted image 20251125132516.png</p> <p><img src='../content/attachments/Pasted image 20251125132516.png' style='width:100;'/></p>
</body> </body>
</html> </html>