vault backup: 2025-12-06 00:40:26

2025-12-06 00:40:26 +01:00
parent 038cb1c2dd
commit b6e8a73fff
4 changed files with 44 additions and 34 deletions
--- a/wip/static.py
+++ b/wip/static.py
@@ -1,7 +1,12 @@
 import pathlib
-from obsidian_parser import Vault
-import markdown
+import re
+
 import jinja2
+from markdown.core import Markdown
+from markdown.extensions import Extension
+from markdown.preprocessors import Preprocessor
+from obsidian_parser import Vault
+

 root_dir = pathlib.Path(__file__).parent
 vault = Vault(root_dir / ".." / "content")
@@ -9,38 +14,37 @@ note = vault.get_note("Biokemi/Cellulära processer/Transport över cellmembran/
 loader = jinja2.FileSystemLoader(root_dir / "templates")
 env = jinja2.Environment(loader=loader)

-from markdown.preprocessors import Preprocessor
-import re

-class NoRender(Preprocessor):
-    """ Skip any line with words 'NO RENDER' in it. """
+class ObsidianImage(Preprocessor):
    def run(self, lines):
        new_lines = []
        for line in lines:
-            print(repr(line))
            m = re.search(r"!\[\[(.*)\]\]", line)
            if m:
-                print(m.groups())
+                if "|" in m.group(1):
+                    img, width = m.group(1).split("|")
+                    new_lines.append("<img src='../content/attachments/" + img + "' style='width:" + width + ";'/>")
+                else:
+                    new_lines.append("<img src='../content/attachments/" + m.group(1) + "'/>")
+            else:
+                new_lines.append(line)
        return new_lines

-from markdown.extensions import Extension

 class MyExtension(Extension):
    def extendMarkdown(self, md):
-        md.preprocessors.register(NoRender(md), 'mypattern', 175)
+        md.preprocessors.register(ObsidianImage(md), 'mypattern', 175)

-m = markdown.Markdown(extensions=[])
-print(m.registeredExtensions)
+m = Markdown(extensions=[MyExtension()])
 env.filters["markdown"] = m.convert

 output = root_dir / "test.html"
 template = env.get_template("base.html")

 with output.open("w", encoding="utf-8") as f:
-    print(note.reading_view)
-    output = template.render(note=note, vault=vault)
-    f.write(output)
+    data = template.render(note=note, vault=vault)
+    f.write(data)

-#import webbrowser
-#webbrowser.open(output.as_uri())
-#print(f"Written to {output}")
+import webbrowser
+webbrowser.open(output.as_uri())
+print(f"Written to {output}")
--- a/wip/templates/base.html
+++ b/wip/templates/base.html
@@ -10,6 +10,6 @@
 </head>
 <body>
 <h1>{{note.title}}</h1>
-{{note.reading_view | markdown}}
+{{note.content | markdown}}
 </body>
 </html>
--- a/wip/test.html
+++ b/wip/test.html
@@ -10,16 +10,24 @@
 </head>
 <body>
 <h1>Anteckningar</h1>
+<hr />
+<p>föreläsare: Ingela Parmryd
+tags:
+  - biokemi
+  - anteckningar
+  - transport-över-cellmembran
+date: 2025-11-25</p>
+<hr />
 <p>Diffusion är något INTE behöver hjälp
 Passiv vs Aktiv transport
 Faciliterad diffusion</p>
 <p>plasmamembransystem
 - tar in och tar
- när det går ut, börjar det i
-    - ER → Golgi → sekretoriska vesiklar → PM eller
+- när det går ut, börjar det i 
+    - ER → Golgi → sekretoriska vesiklar → PM eller 
    - ER → golgi → PM
    - heter sekretoriska vägen
-    -
+    - 
 - när det går ut
    - tidigt endosom → sen endosom → lysosom
 - Vad påverkar utgången?
@@ -35,14 +43,14 @@ Faciliterad diffusion</p>
 - lättast → svårast
    - (små) hydrofoba, $O_2$ (stora kommer här också)
    - små polära $H_2O$ (osmos)
-    - stora polära, glykos (kolhydrater)
+    - stora polära, glykos (kolhydrater) 
    - joner, laddade har det svårast (aminosyrer, nukleotider)</p>
 <hr />
 <p>Glukostransportörer faciliterar diffusion
-!Pasted image 20251125132516.png
-Även kallade bärarproteiner</p>
+<img src='../content/attachments/Pasted image 20251125132516.png'/>
+Även kallade bärarproteiner </p>
 <h1>Passiv transport</h1>
-<p>med gradienten - Man behöver inte tillföra energi, använder energin som tillför gradienten</p>
+<p>med gradienten - Man behöver inte tillföra energi, använder energin som tillför gradienten </p>
 <h3>Transportörer/Bärarproteiner</h3>
 <ul>
 <li>transport av polära moleklyer</li>
@@ -127,7 +135,7 @@ $\Delta G = RT ln(C_2/C_1) + ZF\Delta V$</p>
 </ul>
 <hr />
 <h3>Uppbyggnaden av katjonkanaler är konserverad</h3>
-<p>!Pasted image 20251125135429.png
+<p><img src='../content/attachments/Pasted image 20251125135429.png'/>
 - central por av helix S5 och S6
 - S1-4 bildar paddel utanför por</p>
 <p>S4 positivt laddad, känner av ändring i membranpotential
@@ -136,9 +144,9 @@ padel fälls upp vid aktivering</p>
 <h3>$K^+$-kanalen passar $K^+$ perfekt om dehydratisering sker</h3>
 <p>Selektivitetsfilter K+-kanalen
 Det känner igen storlek, konkurrerar mot Na och Ka.
-    $NA^+$ 0.95 Å
+    $NA^+$ 0.95 Å 
    $K^+$ 1.33 Å</p>
-<p>För att passa den här kanalen som är 3 Å,
+<p>För att passa den här kanalen som är 3 Å, 
 Dehydratiseras, bort med vatten
 Binder till röda grupper som är karbonylgrupper
 Dehydratisering av $K^+$ ger lika många bindingar i filtret som till $H_2O$
@@ -168,7 +176,7 @@ Förbinder cytoplasman
 Uppbyggda av konnexinringar
 Fri passage för <em>små</em> hydrofila molekyler/joner &lt; kDa</p>
 <p>Näringsöverföring: lins &amp; ben
-Synkronisering:
+Synkronisering: 
 - finns mkt i hjärtat så allt drar åt sig samtidigt
 - livmoder för forlossning, för sammandrarning
 - stängs av $[Ca^{2+}]$ går upp eller $[H^+]$</p>
@@ -274,6 +282,6 @@ kanalfogar binder ihop små celler, t.ex. näring i benceller
 Jongradienter Na/Kalium mkt inne/ut på av ATPaset-pump
 ABC kräver 2 ATP fosfo+defosfo
 MDR inblandat i pumpar</p>
-<p>!Pasted image 20251125132516.png</p>
+<p><img src='../content/attachments/Pasted image 20251125132516.png' style='width:100;'/></p>
 </body>
 </html>