vault backup: 2025-12-09 15:12:34

content/Biokemi/Makromolekyler/Nukleotider/Anteckningar.md

@@ -0,0 +1,30 @@
+---
+tags:
+  - biokemi
+  - nukleotider
+  - anteckningar
+föreläsare: Claes Gustavsson
+---
+
+Varje cell innehåller tillräckligt information för att replikera hela kroppen
+
+Dogmen: DNA till RNA till protein
+Ny forskning visar kan gå från RNA till DNA (omvänt transkriptas)
+
+- DNA → DNA: DNA polymeras (DNA replikation)
+- DNA → RNA: RNA polymeras (translation)
+- RNA → Protein: Ribosom (transkription)
+
+Prokaryoter har ingen cellkärna, allt händer på samma ställe
+Eukaryoter:
+- Kärna: DNA och primär transkription & processering
+- Cytoplasman: translation
+
+Från frågestund
+- Många blandar ihop replikation/translation/transkription
+- RNA/DNA polymeras
+- Tabell viktig, fråga ATP/GTP/CTP
+	- första fem är helt avgörande AGCTU
+
+
+Kort för vänstervriden hur dna-helixen är uppbyggd

content/Biokemi/Makromolekyler/Nukleotider/Instuderingsfrågor.md

@@ -0,0 +1,20 @@
+---
+tags:
+  - biokemi
+  - nukleotider
+  - instuderingsuppgifter
+föreläsare: Claes Gustavsson
+---
+
+#### Vad är den centrala dogmen?
+#### Hur skiljer sig RNA från DNA?    
+#### Hur numreras de olika kolatomerna i ribos och deoxyribos? Mellan vilka positioner bildas fosfodiesterbindningar? På vilken position sitter baser?    
+#### Vad är skillnaden mellan en nukleosid och en nukleotid?    
+#### Hur skiljer sig AMP, ADP och ATP från varandra?
+#### Lär dig namnen på de olika nukleosiderna och nukleotiderna i RNA och DNA.
+#### I vilken riktning syntetiseras DNA och RNA?
+#### Beskriv en dubbelsträngad DNA helix av B-typ så noga som möjligt. Antal baspar (bp) per varv, riktning på strängarna etc. Vad innebär det att strängarna är antiparallella och komplementära?
+#### Vad menas med begreppen major och minor groove?
+#### Vilka olika krafter påverkar den dubbelsträngade DNA-helixens stabilitet?
+#### Smältpunkten (melting temperature, Tm) för en DNA molekyl är den temperatur då hälften av strängarna inte längre finns föreligger i dubbelsträngad form. Hur påverkar de baser som finns i DNA-molekylen smältpunkten hos DNA? Hur många vätebindningar finns i AT resp. GC baspar?
+#### Vad menas med att replikation är semikonservativ?

content/Biokemi/Makromolekyler/Nukleotider/Lärandemål.md

@@ -0,0 +1,19 @@
+---
+tags:
+  - biokemi
+  - nukleotider
+  - lärandemål
+föreläsare: Claes Gustavsson
+---
+
+- En introduktion till den centrala dogmen.
+- Molekylärbiologiska begrepp: replikation, transkription, translation, den genetiska koden, läsram.
+- Enzymatiska aktiviteter inom molekylärbiologin: DNA polymeras, RNA polymeras, ribosomen.
+- Principiell struktur för nukleotider och nukleosider.
+- Det strukturella underlaget för komplementär basparning.
+- Fysikaliska principer för dubbelsträngade DNA/RNA molekylers stabilitet.
+- Ribonukleotidreduktas.
+  -----
+- Beskriva byggstenarna för DNA och RNA, deras syntes och konsekvenser av störd nukleotidsyntes.
+- Kunna översiktligt beskriva stegen i den centrala dogmen.
+- Primärstruktur och sekundärstruktur för DNA och RNA.

content/Biokemi/Makromolekyler/Nukleotider/Provfrågor.md

@@ -0,0 +1,59 @@
+---
+tags:
+  - biokemi
+  - nukleotider
+  - provfrågor
+föreläsare: Claes Gustavsson
+---
+
+**5** A) Vilken typ av bindning bryter nukleaser?
+B) Skriv det fullständiga namnet för dCMP.
+
+A. Hur många vätebindningar finns i AT resp. GC baspar?
+B. Hur påverkar baskompositionen DNA stabiliteten? (2p)
+
+**6** Vilket/vilka av följande påståenden om RNA är korrekta?
+A. Hur skiljer sig endonukleaser från exonukleaser?
+B. Skriv det fullständiga namnet för dADP?
+
+A) Vilken kemisk grupp finns i 2’-positionen hos ribonukleotider?
+B) Vad är AMP förkortning för?
+
+De olika kolatomerna i ribos och deoxyribos numreras som 1', 2', 3', 4' och 5' . (2p)
+A) Vad skiljer ribos från deoxyribos?
+B) Till vilken position är basen kopplad?
+
+Den vanligaste formen som DNA antar kallas B-DNA. Vilka två påståenden stämmer om denna? (2p)
+
+Det är mellan 10 - 10,4 baspar per varv av helixen.
+Den är vänstervriden.
+Avståndet mellan baspar är cirka 3,4 Å.
+De två strängarna parallella.
+
+Vilka två nedanstående påståenden är korrekta? (2p)
+
+A Uracil är en kvävebas i DNA.
+B Kolatomen i position 1' hos sockret är bunden till kvävebasen via en β-glykosid-bindning.
+C Adenosin är en nukleosid.
+D ATP innehåller två fosfatgrupper.
+
+**8**
+Nukleotider bygger upp RNA och DNA.
+
+A) Vilken kemisk grupp finns i 2’-positionen hos ribonukleotider?
+B) I vilken position på sockret sitter kvävebasen?
+C) I vilken position på sockret sitter fosfatgruppen?
+D) Vad är dGDP förkortning för?
+(4p)
+
+A) Vad är skillnaden mellan exo- och endonukleaser?
+B) Skriv det fullständiga namnet för CMP. (4p)
+
+Vilka två påståenden om nukleotider är korrekta? (2p)
+
+A En nukleotid består av en kvävebas, ett socker och tre fosfatgrupper.
+B Den innersta fosfatgruppen, närmast sockret, kallas gamma.
+C Ribonukleotider har en OH-grupp på 3'-kolatomen.
+D Deoxyribonukleotider innehåller en OH-grupp på 2'-kolatomen.
+
+Nukleotider är de byggstenar som bygger upp både DNA och RNA. Vilken kemisk grupp finns i 2' position hos ribonukleotider, och hur skiljer sig denna från deoxyribonukleotider? (4p)