From 713dae01ccaf45bcfb19ec3632c86e8670cdd601 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Johan Dahlin Date: Sun, 7 Dec 2025 01:15:19 +0100 Subject: [PATCH] vault backup: 2025-12-07 01:15:19 --- .../Transport över cellmembran/Anteckningar.md | 143 +++++++++--------- 1 file changed, 71 insertions(+), 72 deletions(-) diff --git a/content/Biokemi/Cellulära processer/Transport över cellmembran/Anteckningar.md b/content/Biokemi/Cellulära processer/Transport över cellmembran/Anteckningar.md index c7131d7..276ec23 100644 --- a/content/Biokemi/Cellulära processer/Transport över cellmembran/Anteckningar.md +++ b/content/Biokemi/Cellulära processer/Transport över cellmembran/Anteckningar.md @@ -6,20 +6,19 @@ tags: - transport-över-cellmembran date: 2025-11-25 --- -Diffusion är något INTE behöver hjälp +Diffusion är något som INTE behöver hjälp Passiv vs Aktiv transport Faciliterad diffusion plasmamembransystem -- tar in och tar +- tar in och tar ut - när det går ut, börjar det i - ER → Golgi → sekretoriska vesiklar → PM eller - - ER → golgi → PM + - ER → Golgi → PM - heter sekretoriska vägen - - - när det går ut - - tidigt endosom → sen endosom → lysosom + - tidig endosom → sen endosom → lysosom - Vad påverkar utgången? - tjocklek - kolesterol i membranet @@ -31,13 +30,13 @@ plasmamembransystem ---- ## Diffusion över membran -Vad är lättast att diffunder? +Vad är lättast att diffundera? - lättast → svårast - (små) hydrofoba, $O_2$ (stora kommer här också) - små polära $H_2O$ (osmos) - - stora polära, glykos (kolhydrater) - - joner, laddade har det svårast (aminosyrer, nukleotider) + - stora polära, glukos (kolhydrater) + - joner, laddade har det svårast (aminosyror, nukleotider) ---- Glukostransportörer faciliterar diffusion @@ -46,18 +45,18 @@ Glukostransportörer faciliterar diffusion # Passiv transport -med gradienten - Man behöver inte tillföra energi, använder energin som tillför gradienten +Med gradienten – man behöver inte tillföra energi, utan använder energin som byggt upp gradienten ### Transportörer/Bärarproteiner -- transport av polära moleklyer -- $k_m$ uppnår mättnad är när alla transportörer är upptagna +- transport av polära molekyler +- $K_m$ uppnår mättnad när alla transportörer är upptagna GLUT1-5 har olika affinitet för glukos Varje transportör kan ta ungefär ~1000 molekyler per sekund Högre i blodet och ECM, transport av glukos sker oftast inåt i cellen Hastigheten beror på -- antal transportprotein -- hur hög koncentration +- antal transportproteiner +- hur hög koncentrationen är $\Delta G = RTln(C_2/C_1)$ C1 = till @@ -67,18 +66,18 @@ Q: Behöver vi kunna formeln. Svaret är att vi inte behöver en miniräknare p ### Diffusion av $H_2O$ Fysiologiskt salt ~150mM = isotonisk -- Det är så mkt joner vi har i miljön runt om och i våra celler +- Det är så mycket joner vi har i miljön runt om och i våra celler - Har man exakt händer ingenting - Har man mer eller mindre så händer osmos - hypertonisk, högre saltkoncentration - - då kommer vatten gå ut ur cellen för att xxx koncentrationsgradienten + - då kommer vatten gå ut ur cellen för att utjämna koncentrationsgradienten - Då får vi en cell som krymper - hypotonisk, lägre saltkoncentration - då försöker vattnet att ta sig in - då sväller cellen - - när det kommer in för mycket vatten så går den sönder, då säger den lysering + - när det kommer in för mycket vatten så går den sönder, då säger man lysering - man kan använda saltlösning för att få ut innehållet i en cell - - sen centrifugerar man så man får ut sina mitokondrier + - sedan centrifugerar man så man får ut sina mitokondrier - osmos = strävar mot utjämning av koncentrationsgradienten ---- @@ -89,12 +88,12 @@ Fysiologiskt salt ~150mM = isotonisk - Utsöndring av svett och tårar - Passiv transport - Epitel - njurar -- Det här går mkt snabbare $10^6$ /s 𝛼-poriner +- Det här går mycket snabbare $10^6$ /s 𝛼-poriner - Faciliterad diffusion ### Jonkanalerna -- Faciliterar diffusion pendlar mellan att vara öppna eller stängda +- Faciliterar diffusion och pendlar mellan att vara öppna eller stängda - Faciliterad diffusion - $10^6$ /s per kanal - men bara öppna någon millisekund @@ -102,7 +101,7 @@ Fysiologiskt salt ~150mM = isotonisk - Aktiveras betyder att den öppnas - ligandbindning - kommer någonting utanför cellen, får en konformationsändring och öppnar sig - i sliden nämns att det kan t.ex. vara acetylkolin - - elektriskt rocka, har 20k per kvmm, det gör att det kan komma upp i höga spänningar + - elektrisk rocka, har 20k per kvmm, det gör att det kan komma upp i höga spänningar - ändring av spänning - membranpotential, skillnad mellan joner över ett membran - mekaniskt @@ -124,7 +123,7 @@ $\Delta G = RT ln(C_2/C_1) + ZF\Delta V$ - amfipatiska hydrofila mot kanalen, hydrofoba mot insidan av cellmembranet - 8 helixar ovanför -- slicad i mitten av hydrofob/fil +- delad i mitten av hydrofoba/hydrofila delar --- ### Uppbyggnaden av katjonkanaler är konserverad @@ -134,25 +133,25 @@ $\Delta G = RT ln(C_2/C_1) + ZF\Delta V$ - S1-4 bildar paddel utanför por S4 positivt laddad, känner av ändring i membranpotential -padel fälls upp vid aktivering +paddel fälls upp vid aktivering ---- ### $K^+$-kanalen passar $K^+$ perfekt om dehydratisering sker -Selektivitetsfilter K+-kanalen -Det känner igen storlek, konkurrerar mot Na och Ka. - $NA^+$ 0.95 Å - $K^+$ 1.33 Å +Selektivitetsfiltret i K+-kanalen +Det känner igen storlek, konkurrerar mot Na och K. + - $Na^+$ 0.95 Å + - $K^+$ 1.33 Å För att passa den här kanalen som är 3 Å, -Dehydratiseras, bort med vatten +Jonen dehydratiseras – bort med vatten Binder till röda grupper som är karbonylgrupper -Dehydratisering av $K^+$ ger lika många bindingar i filtret som till $H_2O$ -1000 gr höre selektivitet för $K^+$ än $Na^+$ +Dehydratisering av $K^+$ ger lika många bindningar i filtret som till $H_2O$ +1000 ggr högre selektivitet för $K^+$ än $Na^+$ Kostar energi att föra igenom Na+, då blir det inte effektivt -Transport via repulsion i fyra bindingsställning (skjutsa vidare) +Transport via repulsion i fyra bindningsställen (skjutsa vidare) Na⁺ är mindre → har mycket högre laddningstäthet → binder vatten hårdare. Att ta bort vatten kostar därför mer energi för Na⁺ än för K⁺. @@ -174,25 +173,25 @@ Kanalen stängs efter ms efter aktivering Acetylkolinreceptorn är en receptor för ormgift -Alkaliner, cuarve, hämar transport av jonkanaler +Alkaloider, curare, hämmar transport via jonkanaler -kanaler och transportförer har olika mekanismer för att öppna och stänga +kanaler och transportörer har olika mekanismer för att öppna och stänga ---- ### Kanalfogar (gap junctions) -Möliggör snabb transport mellan celler +Möjliggör snabb transport mellan celler Förbinder cytoplasman Uppbyggda av konnexinringar Fri passage för _små_ hydrofila molekyler/joner < kDa Näringsöverföring: lins & ben Synkronisering: -- finns mkt i hjärtat så allt drar åt sig samtidigt -- livmoder för forlossning, för sammandrarning -- stängs av $[Ca^{2+}]$ går upp eller $[H^+]$ +- finns mycket i hjärtat så allt drar åt sig samtidigt +- livmodern inför förlossning, för sammandragning +- stängs av när $[Ca^{2+}]$ går upp eller $[H^+]$ ---- @@ -201,9 +200,9 @@ mot gradient kräver energitillsförsel Det finns jongradienter i däggdjursceller -- Na+ lågt i högt utanför -- K högt inne, lågt utanför -- Cl lågt inne, högt utanför +- Na+ lågt inne, högt utanför +- K+ högt inne, lågt utanför +- Cl⁻ lågt inne, högt utanför #### Na+–K+ ATPaset, en jonpump 1/3 av all energi i alla celler används till det här (mer i vissa celler än andra) @@ -211,22 +210,22 @@ Det finns jongradienter i däggdjursceller - Nervsignalering - för att få in aminosyror/andra byggstenar - Pendlar mellan två konformationer (öppna åt olika håll, in/ut, ut/in) - - de fosfyliseras, tar upp en P från ATP från Aspartat + - de fosforyleras, tar upp en P från ATP från Aspartat - 6 steg - 1: 3 Na+ binder på cyt-sidan - 2: Fosforylering - - 3: Eversion (vänder sig), frisläppning av Na+ extra cellulärt - - 4: 2 Ka+ binder in på ECM-sidan - - 5: Defosfylering + - 3: Eversion (vänder sig), frisläppning av Na+ extracellulärt + - 4: 2 K+ binder in på ECM-sidan + - 5: Defosforylering - 6: Eversion, K+ frisläpps i cytoplasman - - Alltid Na+ cytoplasma→ECM och Ka+ ECM→cytoplasma + - Alltid Na+ cytoplasma→ECM och K+ ECM→cytoplasma Finns 70 st andra kända pumpar ---- -#### Kardiotona steoider hämmar Na+-K+ ATPaset +#### Kardiotona steroider hämmar Na+-K+ ATPaset -Används som läkemedel för personer som har hjärtsvikt, leder till starkar kontraktioner av hjärtmuskler -Läkemedel heter Digitoxin, Onabain som man kan plocka från växter +Används som läkemedel för personer som har hjärtsvikt, leder till starkare kontraktioner av hjärtmuskler +Läkemedel heter Digitoxin, Ouabain som man kan plocka från växter Behöver veta vad det här proteinet gör @@ -234,28 +233,28 @@ Behöver veta vad det här proteinet gör #### ABC-transportörer ändrar konformation när de binder och hydrolyserar ATP -ATP-bindande kasett +ATP-bindande kassett Kräver två ATP per transportcykel Används för att transportera ut socker i eukaryota (i prokaryoter in) 1. Substrat binder från cytoplasman 2. Konformationsändring - ökad affinitet för ATP 3. ATP binder - eversion (vänder) -4. Substrat frisläpps ECM -5. Defosfylering 2 ATP → 2 ADP, konformationsändring, eversion +4. Substrat frisläpps till ECM +5. Defosforylering 2 ATP → 2 ADP, konformationsändring, eversion -Ställer till besvär inom medicinen, skickar in hydrofoba föreningar. Många läkemedel är hydrofoba. Men sådana här proteiner finns det som inducerar läkemedel, multidrog-resistans, när de fått en så skickar de ut. Men de skickar ut andra läkemedel också +Ställer till besvär inom medicinen, skickar in hydrofoba föreningar. Många läkemedel är hydrofoba. Men sådana här proteiner finns det som inducerar läkemedel, multidrogresistens, när de fått en skickar de ut den. Men de skickar ut andra läkemedel också #### MDR-multidrogresistens - ABC-transportör - Skickar ut xenobiotika=kroppsfrämmande - Induceras t.ex. av läkemedel -- Blir fler om de utsätts av mkt -CFTR-muterat cystisk firos, ABC-transportör. Segare slem i lungorna, olika mkt vatten som attraheras till det här slemmet. +- Blir fler om de utsätts av mycket +CFTR-muterad cystisk fibros, ABC-transportör. Segare slem i lungorna, olika mycket vatten som attraheras till det här slemmet. ---- -### Tre grupper av membrantransportör -Kan vara både passiva och transporta +### Tre grupper av membrantransportörer +Kan vara både passiva och aktiva - Uniporter - *passiv transport* @@ -265,34 +264,34 @@ Kan vara både passiva och transporta - *sekundär aktiv transport* - p-typ ATP eller ABC-transportörer heter *primär aktiv transport* - två föreningar, samma håll - - använder en gradient för att skapa en annan - - händer t.ex. epitelceller där det krävs mkt in + - använder en gradient för att skapa en annan + - händer t.ex. epitelceller där det krävs mycket in - Na+ hjälper glukos in mot sin gradient - Antiporter - *sekundär aktiv transport* - två föreningar, olika håll - en med gradient - nästan alltid $Na^+_{(in)}$ - - en mot gradient - tex $Ca^{2+}_{(in)}$ + - en mot gradient - t.ex. $Ca^{2+}_{(in)}$ ---- -### Glukos kan tas upp mot koncentrationsgradient med sekundär aktiv transport Glukosupptag +### Glukos kan tas upp mot koncentrationsgradient med sekundär aktiv transport ---- -### Glukosupptag från tarmarna involverar transportörer av olika typer Begrepp +### Glukosupptag från tarmarna involverar transportörer av olika typer -I samma cell kan man ha olika typer av transport av samma typ av +I samma cell kan man ha olika typer av transport av samma typ av molekyl # Summary -transportör med gradient -hyperton mer joner, ut vatten -hypoton mindre joner, in vatten -aquaporiner släpper bara igenom vatten -jonkanaler behöver aktiveras 3 st (ligand, potential, mekaniska dragningar) -primärt om ATP är med i reaktionen -sekundär om ATP hjälpt till att bygga upp gradienten -kanalfogar binder ihop små celler, t.ex. näring i benceller -Jongradienter Na/Kalium mkt inne/ut på av ATPaset-pump -ABC kräver 2 ATP fosfo+defosfo -MDR inblandat i pumpar \ No newline at end of file +Transportör med gradient +Hyperton = mer joner, ut vatten +Hypoton = mindre joner, in vatten +Aquaporiner släpper bara igenom vatten +Jonkanaler behöver aktiveras på tre sätt (ligand, potential, mekanisk påverkan) +Primärt om ATP är med i reaktionen +Sekundär om ATP hjälpt till att bygga upp gradienten +Kanalfogar binder ihop celler, t.ex. näring i benceller +Jongradienter: Na/Kalium mycket inne/ut på grund av ATPaset-pumpen +ABC kräver 2 ATP (fosforylering + defosforylering) +MDR inblandat i pumpar