vault backup: 2025-11-25 15:11:41

content/Biokemi/Cellulära processer/Transport över cellmembran/Anteckningar.md

@@ -6,3 +6,312 @@ tags:
   - transport-över-cellmembran
 date: 2025-11-25
 ---
+Diffusion är något INTE behöver hjälp
+Passiv vs Aktiv transport
+Faciliterad diffusion
+
+plasmamembransystem
+- tar in och tar
+- när det går ut, börjar det i 
+	- ER → Golgi → sekretoriska vesiklar → PM eller 
+	- ER → golgi → PM
+	- heter sekretoriska vägen
+	- 
+- när det går ut
+	- tidigt endosom → sen endosom → lysosom
+- Vad påverkar utgången?
+	- tjocklek
+	- kolesterol i membranet
+	- mättade fettsyror/acylgrupper
+	- tätare packning
+- Vad påverkar ingången?
+	- permeabilitet (hur genomsläppligt)
+
+----
+## Diffusion över membran
+
+Vad är lättast att diffunder?
+- lättast → svårast
+	- (små) hydrofoba, $O_2$ (stora kommer här också)
+	- små polära $H_2O$ (osmos)
+	- stora polära, glykos (kolhydrater) 
+	- joner, laddade har det svårast (aminosyrer, nukleotider)
+
+----
+Glukostransportörer faciliterar diffusion
+![[Pasted image 20251125132516.png]]
+Även kallade bärarproteiner 
+
+
+# Passiv transport
+med gradienten - Man behöver inte tillföra energi, använder energin som tillför gradienten 
+
+### Transportörer/Bärarproteiner
+- transport av polära moleklyer
+- $k_m$ uppnår mättnad är när alla transportörer är upptagna
+
+GLUT1-5 har olika affinitet för glukos
+Varje transportör kan ta ungefär ~1000 molekyler per sekund
+Högre i blodet och ECM, transport av glukos sker oftast inåt i cellen
+Hastigheten beror på
+- antal transportprotein
+- hur hög koncentration
+
+$\Delta G = RTln(C_2/C_1)$
+C1 = till
+C2 = från
+
+Q: Behöver vi kunna formeln. Svaret är att vi inte behöver en miniräknare på tentan.
+
+### Diffusion av $H_2O$
+Fysiologiskt salt ~150mM = isotonisk
+- Det är så mkt joner vi har i miljön runt om och i våra celler
+- Har man exakt händer ingenting
+- Har man mer eller mindre så händer osmos
+- hypertonisk, högre saltkoncentration
+	- då kommer vatten gå ut ur cellen för att xxx koncentrationsgradienten
+	- Då får vi en cell som krymper
+- hypotonisk, lägre saltkoncentration
+	- då försöker vattnet att ta sig in
+	- då sväller cellen
+	- när det kommer in för mycket vatten så går den sönder, då säger den lysering
+		- man kan använda saltlösning för att få ut innehållet i en cell
+		- sen centrifugerar man så man får ut sina mitokondrier
+- osmos = strävar mot utjämning av koncentrationsgradienten
+
+----
+### Diffusion av vatten faciliteras av aquaporiner
+
+### Aquaporiner
+- Ett ökat vattenflöde ibland, t.ex. i njurarna
+- Utsöndring av svett och tårar
+- Passiv transport
+- Epitel - njurar
+- Det här går mkt snabbare $10^6$ /s 𝛼-poriner
+- Faciliterad diffusion
+
+### Jonkanalerna
+
+- Faciliterar diffusion pendlar mellan att vara öppna eller stängda
+- Faciliterad diffusion
+- $10^6$ /s per kanal
+	- men bara öppna någon millisekund
+- Pendlar mellan öppen och stängd
+- Aktiveras betyder att den öppnas
+	- ligandbindning - kommer någonting utanför cellen, får en konformationsändring och öppnar sig
+		- i sliden nämns att det kan t.ex. vara acetylkolin
+		- elektriskt rocka, har 20k per kvmm, det gör att det kan komma upp i höga spänningar
+	- ändring av spänning
+		- membranpotential, skillnad mellan joner över ett membran
+	- mekaniskt
+----
+### Transporthastigheten genom jonkanaler styrs av skillnader i koncentrations- och elektriska gradienter
+Beroende av andra joner
+$\Delta G = RT ln(C_2/C_1) + ZF\Delta V$
+
+**R:** gaskonstanten = 8.314 J·mol⁻¹·K⁻¹
+**T:** absoluta temperaturen i Kelvin (t.ex. 310 K för 37°C)
+**C₂:** koncentration _utanför_ cellen
+**C₁:** koncentration _innanför_ cellen
+**Z:** jonens laddning (t.ex. Na⁺ = +1, Ca²⁺ = +2, Cl⁻ = –1)
+**F:** Faradays konstant (≈ 96 485 C/mol), laddning per mol elektroner
+**ΔV:** skillnaden i membranpotential (V₂ – V₁), mäts i volt
+
+----
+### Hur skulle en jonkanal vara uppbyggd?
+
+- amfipatiska hydrofila mot kanalen, hydrofoba mot insidan av cellmembranet
+- 8 helixar ovanför
+- slicad i mitten av hydrofob/fil
+
+---
+### Uppbyggnaden av katjonkanaler är konserverad
+
+![[Pasted image 20251125135429.png]]
+- central por av helix S5 och S6
+- S1-4 bildar paddel utanför por
+
+S4 positivt laddad, känner av ändring i membranpotential
+padel fälls upp vid aktivering
+
+
+----
+### $K^+$-kanalen passar $K^+$ perfekt om dehydratisering sker
+
+Selektivitetsfilter K+-kanalen
+Det känner igen storlek, konkurrerar mot Na och Ka.
+	$NA^+$ 0.95 Å 
+	$K^+$ 1.33 Å
+
+För att passa den här kanalen som är 3 Å, 
+Dehydratiseras, bort med vatten
+Binder till röda grupper som är karbonylgrupper
+Dehydratisering av $K^+$ ger lika många bindingar i filtret som till $H_2O$
+1000 gr höre selektivitet för $K^+$ än $Na^+$
+
+Kostar energi att föra igenom Na+, då blir det inte effektivt
+Transport via repulsion i fyra bindingsställning (skjutsa vidare)
+
+Na⁺ är mindre → har mycket högre laddningstäthet → binder vatten hårdare. Att ta bort vatten kostar därför mer energi för Na⁺ än för K⁺.
+
+**Varför kan K⁺ passera utan kostnad?**
+Selektivitetsfiltret är byggt exakt för K⁺-storlek: karbonylgrupperna sitter så att de ersätter _precis_ de vattenbindningar K⁺ förlorar. Energin blir nästan neutral.
+
+-----
+
+### Jonkanal stängs snabbt efter att ha öppnats
+
+Bolldomän i cytoplasman med en länk med ett bindningsställe i den aktiverade, öppna kanalen den kan binda in till
+- I öppen kanal blir *bindningen*→inaktiverad
+- States
+	- Closed hänger och slänger
+	- Open precis utanför
+	- Inactivated inne i hållet
+
+Kanalen stängs efter ms efter aktivering
+
+
+Acetylkolinreceptorn är en receptor för ormgift
+Alkaliner, cuarve, hämar transport av jonkanaler
+
+kanaler och transportförer har olika mekanismer för att öppna och stänga
+
+----
+
+### Kanalfogar
+(gap junctions)
+
+Möliggör snabb transport mellan celler
+Förbinder cytoplasman
+Uppbyggda av konnexinringar
+Fri passage för _små_ hydrofila molekyler/joner < kDa
+
+Näringsöverföring: lins & ben
+Synkronisering: 
+- finns mkt i hjärtat så allt drar åt sig samtidigt
+- livmoder för forlossning, för sammandrarning
+- stängs av $[Ca^{2+}]$ går upp eller $[H^+]$
+
+----
+
+# Aktiv transport
+mot gradient
+kräver energitillsförsel
+
+Det finns jongradienter i däggdjursceller
+- Na+ lågt i högt utanför
+- K högt inne, lågt utanför
+- Cl lågt inne, högt utanför
+#### Na+–K+ ATPaset, en jonpump 
+1/3 av all energi i alla celler används till det här
+(mer i vissa celler än andra)
+
+- Nervsignalering
+- för att få in aminosyror/andra byggstenar
+- Pendlar mellan två konformationer (öppna åt olika håll, in/ut, ut/in)
+	- de fosfyliseras, tar upp en P från ATP från Aspartat
+- 6 steg
+	- 1: 3 Na+ binder på cyt-sidan
+	- 2: Fosforylering
+	- 3: Eversion (vänder sig), frisläppning av Na+ extra cellulärt
+	- 4: 2 Ka+ binder in på ECM-sidan
+	- 5: Defosfylering
+	- 6: Eversion, K+ frisläpps i cytoplasman
+	- Alltid Na+ cytoplasma→ECM och Ka+ ECM→cytoplasma
+Finns 70 st andra kända pumpar
+
+----
+#### Kardiotona steoider hämmar Na+-K+ ATPaset
+
+Används som läkemedel för personer som har hjärtsvikt, leder till starkar kontraktioner av hjärtmuskler
+Läkemedel heter Digitoxin, Onabain som man kan plocka från växter
+
+Behöver veta vad det här proteinet gör
+
+----
+#### ABC-transportörer ändrar konformation när de binder och hydrolyserar ATP 
+
+
+ATP-bindande kasett
+Kräver två ATP per transportcykel
+Används för att transportera ut socker i eukaryota (i prokaryoter in)
+1. Substrat binder från cytoplasman
+2. Konformationsändring - ökad affinitet för ATP
+3. ATP binder - eversion (vänder)
+4. Substrat frisläpps ECM
+5. Defosfylering 2 ATP → 2 ADP, konformationsändring, eversion
+
+Ställer till besvär inom medicinen, skickar in hydrofoba föreningar. Många läkemedel är hydrofoba. Men sådana här proteiner finns det som inducerar läkemedel, multidrog-resistans, när de fått en så skickar de ut. Men de skickar ut andra läkemedel också
+
+#### MDR-multidrogresistens
+- ABC-transportör
+- Skickar ut xenobiotika=kroppsfrämmande
+- Induceras t.ex. av läkemedel
+- Blir fler om de utsätts av mkt
+CFTR-muterat cystisk firos, ABC-transportör. Segare slem i lungorna, olika mkt vatten som attraheras till det här slemmet.
+
+----
+
+### Tre grupper av membrantransportör
+Kan vara både passiva och transporta
+
+- Uniporter
+	- *passiv transport*
+	- en förening, två håll
+	- t.ex. glukostransportören
+- Symport
+	- *sekundär aktiv transport*
+		- p-typ ATP eller ABC-transportörer heter *primär aktiv transport*
+	- två föreningar, samma håll
+	- använder en gradient för att skapa en annan
+	- händer t.ex. epitelceller där det krävs mkt in
+	- Na+ hjälper glukos in mot sin gradient
+- Antiporter
+	- *sekundär aktiv transport*
+	- två föreningar, olika håll
+		- en med gradient - nästan alltid $Na^+_{(in)}$
+		- en mot gradient - tex $Ca^{2+}_{(in)}$
+
+----
+### Glukos kan tas upp mot koncentrationsgradient med sekundär aktiv transport  Glukosupptag
+
+----
+
+### Glukosupptag från tarmarna involverar transportörer av olika typer Begrepp
+
+I samma cell kan man ha olika typer av transport av samma typ av
+
+# Summary
+
+transportör med gradient
+hyperton mer joner, ut vatten
+hypoton mindre joner, in vatten
+aquaporiner släpper bara igenom vatten
+jonkanaler behöver aktiveras 3 st (ligand, potential, mekaniska dragningar)
+primärt om ATP är med i reaktionen
+sekundär om ATP hjälpt till att bygga upp gradienten
+kanalfogar binder ihop små celler, t.ex. näring i benceller
+Jongradienter Na/Kalium mkt inne/ut på av ATPaset-pump
+ABC kräver 2 ATP fosfo+defosfo
+MDR inblandat i pumpar
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+

content/Biokemi/Cellulära processer/Transport över cellmembran/Slides.md

@@ -239,49 +239,27 @@ Biochemistry 10:e, Berg et al., Figur 13.11
   
 
 Semipermeabelt membran
-
 Passiv transport
-
 Diffusion
-
 Faciliterad diffusion
-
 Bärarproteiner
-
 Mättnad
-
 Isoton, hyperton, hypoton
-
 Osmos
-
 Aquaporiner
-
 Jonkanaler – spänning, ligand, mekaniskt
-
 Aktiv transport – primär och sekundär
-
 Hydratisering
-
 Selektivitetsfilter
-
 Kanalfogar
-
 Jongradienter
-
 P-typ transportör
-
 Na+-K+ ATPaset/pumpen
-
 ABC-transportör
-
 Multidrogresistensprotein
-
 CFTR – kloridjontransportör
-
 Uniport
-
 Symport
-
 Antiport
 
 ---

content/Biokemi/Cellulära processer/Transport över cellmembran/Stoff.md

@@ -0,0 +1,11 @@
+---
+föreläsare: Ingela Parmryd
+tags:
+  - biokemi
+  - transport-över-cellmembran
+  - stoff
+date: 2025-11-25
+---
+```
+Diffusion är när inte behöver hjälp
+```