vault backup: 2025-12-14 03:32:12
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 1m41s
All checks were successful
Deploy Quartz site to GitHub Pages / build (push) Successful in 1m41s
This commit is contained in:
@@ -5,24 +5,62 @@ tags:
|
||||
- instuderingsuppgifter
|
||||
föreläsare: Abhishek Niroula
|
||||
---
|
||||
### Describe L1/2 in terms of receptor and ligand binding.
|
||||
```spoiler-block:
|
||||
L₁/₂ är den ligandkoncentration som ger 50 % receptorockupation; den speglar bindningsaffiniteten mellan ligand och receptor.
|
||||
```
|
||||
|
||||
#### Describe L1/2 in terms of receptor and ligand binding.
|
||||
### Explain the basic structure of myoglobin including the porphyrin ring and Fe.
|
||||
```spoiler-block:
|
||||
Myoglobin är en monomerisk polypeptid med en heme-grupp; heme består av en porfyrinring med fyra pyrrolringar och en Fe²⁺-jon i centrum som binder O₂.
|
||||
```
|
||||
|
||||
$L_{1/2}$ is the amount of L needed to reach 50%/balance of ligand/receptor. The value can be different depending on the binding affinity, how strong the ligand/receptor binds to each other
|
||||
#### Explain the basic structure of myoglobin including the porphyrin ring and Fe.
|
||||
Myoglobin består av en polypeptidkedja med heme som en prostetisk grupp. Heme består av en porfyrinring som är fyra pyrroleringar och en järnatom i mitten som kan binda syre.
|
||||
#### What are proximal and distal histidine? How do they interact with heme molecule?
|
||||
### What are proximal and distal histidine? How do they interact with the heme molecule?
|
||||
```spoiler-block:
|
||||
Proximal histidin binder direkt till Fe²⁺ i heme; distal histidin stabiliserar bundet O₂ via vätebindning.
|
||||
```
|
||||
|
||||
Den proximal binder direkt till
|
||||
#### How does $O^2$ bind to myoglobin? Compare with carbon monoxide ($CO$).
|
||||
### How does O₂ bind to myoglobin? Compare with carbon monoxide (CO).
|
||||
```spoiler-block:
|
||||
O₂ binder snett till Fe²⁺ och stabiliseras av distal histidin; CO binder linjärt till Fe²⁺ med mycket högre affinitet.
|
||||
```
|
||||
|
||||
Den binder till järn den distala histidinen. CO binder bara till järn
|
||||
#### Explain the basic structure of hemoglobin and its structural states.
|
||||
#### What is cooperative binding? Describe in the context of hemoglobin.
|
||||
#### Compare the dissociation curves of myoglobin and hemoglobin. What does this mean for the transport of O2 from the lungs to the tissues?
|
||||
#### Define an allosteric regulator.
|
||||
#### How is hemoglobin affected by CO, CO2, H+, and 2,3-BPG? How are these effects mediated? Where do these molecules/ions bind and what are the consequences?
|
||||
#### Define Bohr effect and explain how it influences oxygen binding.
|
||||
Bohr-effekten är hur vätejoner och 2,3-BPGs koncentrationer ändrar bindningsaffiniteten för syre i Hb, i lugnorna är det lägre där binder syre bättre än där det ska frisläppas som har högre koncentration av vätejoner/2,3-BPG.
|
||||
#### How does fetal hemoglobin (HbF) differ from adult hemoglobin (HbA) and what effect does this have?
|
||||
#### Explain the molecular and structural background of sickle-cell disease.
|
||||
### Explain the basic structure of hemoglobin and its structural states.
|
||||
```spoiler-block:
|
||||
Hemoglobin är ett tetramert protein (α₂β₂) med fyra heme-grupper; det finns i T-state (låg O₂-affinitet) och R-state (hög O₂-affinitet).
|
||||
```
|
||||
|
||||
### What is cooperative binding? Describe in the context of hemoglobin.
|
||||
```spoiler-block:
|
||||
Kooperativ bindning innebär att inbindning av en O₂-molekyl ökar affiniteten för nästa; i Hb sker detta via T→R-övergång.
|
||||
```
|
||||
|
||||
### Compare the dissociation curves of myoglobin and hemoglobin. What does this mean for O₂ transport?
|
||||
```spoiler-block:
|
||||
Myoglobin har hyperbolisk kurva (hög affinitet); hemoglobin har sigmoidal kurva vilket möjliggör effektiv O₂-upptag i lungor och frisättning i vävnad.
|
||||
```
|
||||
|
||||
### Define an allosteric regulator.
|
||||
```spoiler-block:
|
||||
En molekyl som binder till ett protein på annan plats än aktiva sätet och ändrar dess funktion eller affinitet.
|
||||
```
|
||||
|
||||
### How is hemoglobin affected by CO, CO₂, H⁺, and 2,3-BPG?
|
||||
```spoiler-block:
|
||||
CO binder heme starkt → blockerar O₂-bindning; CO₂ och H⁺ binder till globindelen → stabiliserar T-state; 2,3-BPG binder mellan β-kedjor → sänker O₂-affinitet.
|
||||
```
|
||||
|
||||
### Define Bohr effect and explain how it influences oxygen binding.
|
||||
```spoiler-block:
|
||||
Bohr-effekten är att ökat H⁺/CO₂ minskar Hb:s O₂-affinitet, vilket underlättar syrefrisättning i vävnader.
|
||||
```
|
||||
|
||||
### How does fetal hemoglobin (HbF) differ from adult hemoglobin (HbA) and what effect does this have?
|
||||
```spoiler-block:
|
||||
HbF har γ-kedjor istället för β-kedjor, binder 2,3-BPG svagare och har därför högre O₂-affinitet.
|
||||
```
|
||||
|
||||
### Explain the molecular and structural background of sickle-cell disease.
|
||||
```spoiler-block:
|
||||
En punktmutation i β-globin (Glu→Val) ger hydrofoba interaktioner, Hb-polymerisering vid låg O₂ och sickelformade erytrocyter.
|
||||
```
|
||||
Reference in New Issue
Block a user