vault backup: 2025-12-14 03:32:12

content/Biokemi/Makromolekyler/Från aminosyror till proteiner/Instuderingsfrågor.md

@@ -0,0 +1,232 @@
+---
+tags:
+  - biokemi
+  - från-aminosyror-till-proteiner
+  - instuderingsuppgifter
+föreläsare: Ingela Parmryd
+---
+
+### Vad karaktäriserar en svag bas?
+```spoiler-block
+Högt pK_b (lågt K_b); protoneras svagt och bildar buffert med sin konjugerade syra runt pK_a ±1.
+```
+
+### Hur är en aminosyra uppbyggd?
+```spoiler-block
+Ett α-kol bundet till en aminogrupp, en karboxylgrupp, ett väte och en sidokedja (R).
+```
+
+### Vad menas med ett kiralt kol?
+```spoiler-block
+Ett kol bundet till fyra olika substituenter.
+```
+
+### Hur skiljs stereoisomerer åt?
+```spoiler-block
+De har samma kemiska formel men olika 3D-orientering; beskrivs med R/S eller D/L.
+```
+
+### Vilken stereoisomer av aminosyror används för att bygga upp proteiner?
+```spoiler-block
+L-aminosyror.
+```
+
+### Vilken aminosyra har ingen stereoisomer och varför?
+```spoiler-block
+Glycin, eftersom sidokedjan är ett väte och inget kiralt centrum finns.
+```
+
+### Vilken nettoladdning har de flesta aminosyror vid neutralt pH?
+```spoiler-block
+Noll; de förekommer som zwitterjoner.
+```
+
+### Vilka aminosyror är alifatiska?
+```spoiler-block
+Glycin, alanin, valin, leucin, isoleucin, metionin och prolin.
+```
+
+### Vilka egenskaper har alifatiska aminosyror?
+```spoiler-block
+Opolära, hydrofoba och utan aromatiska ringar.
+```
+
+### Vilka aminosyror är aromatiska?
+```spoiler-block
+Fenylalanin, tyrosin och tryptofan.
+```
+
+### Vilka egenskaper har aromatiska aminosyror?
+```spoiler-block
+Ofta hydrofoba och kan absorbera UV-ljus.
+```
+
+### I vilken typ av bindningar/interaktioner deltar sidogrupperna hos hydrofoba aminosyror?
+```spoiler-block
+Van der Waals-interaktioner och hydrofoba effekter.
+```
+
+### Vilka aminosyror är polära?
+```spoiler-block
+Serin, treonin, tyrosin, cystein, asparagin, glutamin och histidin.
+```
+
+### Vilka egenskaper har polära aminosyror?
+```spoiler-block
+Hydrofila och orienterar sig ofta mot vatten.
+```
+
+### I vilken typ av bindningar deltar sidogrupperna hos polära aminosyror?
+```spoiler-block
+Vätebindningar.
+```
+
+### Vilka aminosyror är basiska?
+```spoiler-block
+Lysin, arginin och histidin.
+```
+
+### Vilka egenskaper har basiska aminosyror?
+```spoiler-block
+Positiv laddning vid fysiologiskt pH, vattenlösliga och pH-känsliga.
+```
+
+### I vilken typ av bindningar deltar sidogrupperna hos basiska aminosyror?
+```spoiler-block
+Vätebindningar och jonbindningar (saltbryggor).
+```
+
+### Vilka aminosyror är sura?
+```spoiler-block
+Aspartat och glutamat.
+```
+
+### Vilka egenskaper har sura aminosyror?
+```spoiler-block
+Negativ laddning vid fysiologiskt pH och hydrofila.
+```
+
+### I vilken typ av bindningar deltar sidogrupperna hos sura aminosyror?
+```spoiler-block
+Vätebindningar och jonbindningar (saltbryggor).
+```
+
+### Vilka aminosyror har sidogrupper som kan ändra laddning beroende på pH?
+```spoiler-block
+Histidin, cystein, tyrosin, lysin, arginin, aspartat och glutamat.
+```
+
+### Hur bildas en peptidbindning?
+```spoiler-block
+Genom kondensationsreaktion mellan aminogrupp och karboxylgrupp med avgivning av vatten.
+```
+
+### Vad karaktäriserar en peptidbindning?
+```spoiler-block
+Delvis dubbelbindningskaraktär, plan och stel struktur.
+```
+
+### Vad är primärstruktur?
+```spoiler-block
+Den linjära aminosyrasekvensen i en polypeptidkedja.
+```
+
+### Vad menas med att en peptidkedja har en riktning?
+```spoiler-block
+Kedjan går från N-terminal till C-terminal.
+```
+
+### Vilken är skillnaden mellan cis- och transkonfiguration hos en polypeptidkedja?
+```spoiler-block
+Cis/trans avser peptidbindningen; i trans ligger α-kolen på motsatta sidor.
+```
+
+### Vad är sekundärstruktur?
+```spoiler-block
+Lokal regelbunden 3D-struktur såsom α-helix och β-flak.
+```
+
+### Vad karaktäriserar en α-helix?
+```spoiler-block
+Spiralformad struktur med 3,6 aminosyror per varv och vätebindningar i → i+4.
+```
+
+### Vilken typ av bindningar stabiliserar sekundärstrukturen α-helix?
+```spoiler-block
+Vätebindningar mellan C=O och N–H i peptidryggraden.
+```
+
+### Vilken sekundärstruktur finns ofta när en polypeptidkedja byter riktning?
+```spoiler-block
+Hårnålsböj (turn), ofta med glycin och prolin.
+```
+
+### Vad är tertiärstruktur?
+```spoiler-block
+Den fullständiga 3D-veckningen av en enskild polypeptidkedja.
+```
+
+### Vad gör att proteiner vanligtvis veckas rätt?
+```spoiler-block
+De når sitt lägsta energitillstånd.
+```
+
+### Vad innebär isoelektrisk punkt för ett protein?
+```spoiler-block
+Det pH där proteinets nettoladdning är noll.
+```
+
+### Vilka bindningar stabiliserar tertiärstrukturen hos globulära proteiner?
+```spoiler-block
+Hydrofoba interaktioner, vätebindningar, jonbindningar, van der Waals och disulfidbryggor.
+```
+
+### Vilka proteiner hjälper andra proteiner att veckas?
+```spoiler-block
+Chaperoner; de förhindrar felveckning och aggregation.
+```
+
+### Vad är kvartärstruktur?
+```spoiler-block
+När flera polypeptidkedjor bildar ett funktionellt protein.
+```
+
+### Vilken aminosyra kan stabilisera tertiär och kvartärstruktur kovalent?
+```spoiler-block
+Cystein via disulfidbryggor.
+```
+
+### Vad karaktäriserar proteiner som kan ha två olika strukturer?
+```spoiler-block
+Allosteriska proteiner som kan ändra konformation.
+```
+
+### Vad innebär det att ett protein denatureras?
+```spoiler-block
+Förlust av sekundär-, tertiär- och/eller kvartärstruktur.
+```
+
+### Vad kan få ett protein att denatureras?
+```spoiler-block
+Värme, pH-förändringar, urea, detergenter och tungmetaller.
+```
+
+### Vad är en proteindomän?
+```spoiler-block
+En självständig strukturell och funktionell enhet i ett protein.
+```
+
+### Vad är en subenhet och hur namnges de?
+```spoiler-block
+En polypeptid i ett multimeriskt protein; namnges α, β, γ osv.
+```
+
+### Hur mäts proteiners massa?
+```spoiler-block
+I dalton (Da/kDa), ofta med SDS-PAGE eller masspektrometri.
+```
+
+### Vilket är sambandet mellan proteinveckning och amyloider?
+```spoiler-block
+Felveckning leder till β-flak-rika aggregat (amyloider).
+```