Update

content/Biokemi/Kolhydrater/Anteckningar.md

@@ -0,0 +1,229 @@
+Sara Lindén (forskar i muciner)
+Kunna det som går igenom på föreläsningen och instuderingsuppgifterna
+
+SKA KUNNA: Sjukdomar som kommer upp i slides ska kunnas och det som kommer i instuderingsfrågorna
+
+Kapitel 11 sid 491-492 om galktosemi och laktosintolerans
+### Struktur
+Kolhydrator kan också kalla sockerarter/sackarider
+kedjor: polymerer och polysackarider t.ex. stärkelse
+
+Funktioner:
+- energy storage
+- komponent i livets information (DNA)
+- väggarna i celler byggs upp av
+- informationsbärare i t.ex. signalering
+	- self vs other
+	- fertilisering
+	- berättar var immunsystemet ska hitta (lymfocyter)
+	- mikrober hittar dit
+		- mikrob är ett patogen som skapar sjukdom
+- smörjmedel/skydd/fjädring (brosk?)
+
+Det är svårare att analysera kolhydrater än t.ex. DNA-studer efter som det krävs handpoläggningen finns inte automatiserade verktyg
+
+Glukos heter den bara när den är i linjeform, men vi är lite *slarviga* så vi kallar också det när det är i ringform.
+
+![[Pasted image 20251107122326.png]]
+
+Glykos är en aldos, den har en aldehyd, den biter sig själv i svansen så den skapar den här gruppen. Ungefär som när en aldehyd reagerar med en alkohol och bildar en hemiacetyl
+
+Siffror är viktiga i kolhydrater, 1-6, behöver inte kunna numreringen på kolen däremot behöver ni veta vad det innebär med 𝛼- och β- hur den här aldehydgruppen denna hydroxylgruppen (-OH) på samma sida eller motsatt sida. 
+De är ringar så när de är på samma sida
+- om de är båda neråt → beta
+- om en upp en ner → alfa
+
+Man ser ofta den här alfa och beta, man kan bli lite förvirrad även om inte vet vilket kol som är vilket, det är numreringe på kolen man veta, alfa/beta är relationen på dessa grupper båda finns i naturen
+
+Ketos finns också, t.ex. fruktos, har en ketos efter som det är en grupp $C^2$ men inte så viktigt att kunna numret. Ketos kan också bita sig i svansen och bilda.
+
+Projektioner, samma molekyl med ritat på olika sätt att rita
+- fischer
+- haworth
+	- är ganska vanlig, två olika former, ring eller skolform.
+- mills
+Behöver inte kunna rita i en viss projektion, men bra att känna igen att de finns.
+
+![[Pasted image 20251107122832.png|300]]
+vanligaste sockren, gluskos är det enda som vi behöver kunna rita.
+- ni får välja själv hur ni vill kunna rita den i kursmålet
+
+veta skillnaden mellan gluykos och glykgen.
+Glaktos:
+- blodgrupp och
+- galaktosemi
+
+sialinsyra
+- viktig för interaktion för virus och bakterier
+- $COO^-$ karboxylsyra
+- skiljer sig mycket mot andra
+
+kunna skilja:
+- **Blodsocker (glukos)** – en enkel sockerart (monosackarid) som används direkt som energikälla i kroppen.
+- **Acetylamin** – en kemisk grupp (–NHCOCH₃) som innehåller kväve och syre; den kan kopplas till socker och göra dem mer komplexa.
+- **N-acetylglukosamin** – en glukosmolekyl där en hydroxylgrupp ersatts av en acetylamin-grupp; bygger t.ex. upp kitin och delar av cellväggar och glykoproteiner.
+- **Sialinsyra** – en negativt laddad sockerderivat som ofta sitter ytterst på cellers ytskikt; viktig för celligenkänning och virusbindning.
+
+blodsocker är viktigt att kua reglera i kroppen
+- normal 3.3-5.6 mmol/liter
+- ökar efter måltid till 4-7 
+- vid högt blodsocker reagerar med proteiner förhårdnade cellväggar och blodkärl
+- man kan mäta hur bra diabeten är kontrollerat
+- det är viktigt med glykos i vårat blod vissa celler kan använda glykos som bränsle, t.ex. RBC och vissa celler i hjärnan
+- vi har flera olika sätt som hanterar det här, om vi tittar i blodet så får vi glygkos när vi äter också att vi har glykogen som bryts ner i kroppen för att bidra med en jämn blodscocker nivå, kroppen kan använda det från icke-kolhydratkäller t.ex från andra aminosyror, den processen heter glykoneogense
+
+behov av (ungefärliga)
+- 120 g per dygn behöver vi
+- 180 g hela kroppen
+reserver
+- 20g i krossvätskor
+- 190g i levern
+glykogen kan inte frigöras från musklerna, de töms inte ut i resten av kroppen, saknar sista steget
+
+#### Uppgifter
+##### Hur är en hexos generellt uppbyggd?
+- Är en monosackarid med 6 st kolatomer. En av dom är en karboylgrupp och 5 av dom är hydroxylgrupper. I vattenlösning bildas en ringstruktur genom en intern reaktion mellan karbonylgruppen och hydroxylgruppen längst ut
+#### Vad innebär ”acetylglukosamin” - dvs hur skiljer sig glukos från acetylglukosamin?
+- en hydroxylgrupp på glykosen har ersatts med en aminogrupp ($-NH_3$) som har en acetylgrupp ($- COCH_3$)
+	- tex glukos + amin + acetyl → **N-acetylglukosamin**
+##### På vilka sätt skiljer sig sialinsyror från glukos?
+- det är ingen saltsyra!
+- det är en N-acetylglukosamin men med en karboxylgrupp som gör den negativt laddad
+- sitter på cellens yta och deltar i igenkänning
+
+### Disackarider
+
+Det är två stycke monosackardier som sitter ihop. 
+Sucros
+- två stycken, glycopyranosyl och fruktofuranos
+Lactos
+- två stycken β-glycopyranosyl och glykopyranose
+Maltos
+- två stycken 𝛼-glycopyranosyl och glykopyranose
+
+Laktos är involverade i två stycken hälsoproblem vilket gör att vi tittar lite närmare
+#### Laktosintolerans
+Brist på enzymet laktas som sitter i tunntamsepitelet. Om det inte bryts ner i tunntarmen kommer det till kolon och bryts ner av bakterier som skapar gasbildning på av obalans, vanligt med diarre med gaser i magen. 
+ovanligt hos barn som är under 6
+över ålden minskarn produktionen, sen slutar man dricka mjölk.
+#### Galaktosemi
+Ärfligt sjukdom
+Galaktos och Glykos är väldigt lika, men det har separata funktioner, hydroxylgrupp på fel sida och det är två enzymer som gör det. Har man problem med dessa enzymer får man väldigt höga haltera av galktos i plasma, galaktos kan då omvandlas till galaktitol som är toxiskt vilket leder till neurologiska skador, t.ex intellektuel funktionsnedsättning. skador på retina
+1 av 60000 som har galaktosemi det när man föds
+En av 26 sjukdomar som testas för i PKU-provet (nog fler nu för tiden)
+![[Pasted image 20251107125523.png|200]]
+
+• Vad heter bindningen mellan två monosackarider?
+- en kovalent bindning, glykosidbindning som sitter mellan två monosackaridet, t.ex. i laktos
+• På vilka sätt skiljer sig laktosintolerans från galaktosemi?
+- laktas bryter ner glykosidbindning i laktos till monosackarider (glykos, galaktos)
+- galktosemi är när man inte har ett av två enzymer som kan konvertera galaktos till glykos genom att flytta om -OH grupp från en sida till en annan
+#### Pentasackarid
+
+Finns större kedjor av monosackarider, upp till 10000.
+När en disackarid kan binda sig via olika kol, både i 𝛼- och β- konfigurationer.
+Tillsammans innebär att det kan bli mycket information
+
+3 nukleotider = 6 trimerer
+3 hexoser kan teoretisk producera 1056 till 27648 trisackarider
+
+Glykosyltransferases bygger glykaner för information
+- CDG olika sjukdomar, idag c:a 130 sjukdomar
+### Biomolekyler innehållande kolhydrater
+#### Glykokonjugat
+Glykosylering är när man sätter på en kolhydrat på någonting.
+Ett **glykokonjugat** är en molekyl där **ett eller flera kolhydrater är bundna till en annan biomolekyl**, som ett **protein eller lipid**.
+
+De tre huvudtyperna är 
+- glykoproteiner: 50% av proteiner har glykoser de är glykosylerade, flera olika glykoformer
+	- finns i cellmembranet, blodet
+- proteoglykaner: glukosaminosyror
+	- finns i ECM, jättemycket kolhydrater
+- glykolipider
+	- i cellmembranet, sticker ut ifrån celen
+viktigt för läkemedel, sätter man på kolhydrater på proteiner får de längre halveringstid
+#### Glykoproteiner
+Sitter fast antingen:
+- N-länk via kvävet (amin) aspargins R-grupp
+- O-länkade via syre (hydroxyl) i serin eller treonin
+
+Glykan är en sockerkedja, sockerkedja
+Glykosylering, socker sätts på proteinet
+
+Erytropoietin (EPO)
+stimulererar produktion av RBC
+40% kolhydrat
+Behandling för behandla anemi farmakologiskt
+Används vid doping
+Finns i muciner (slem) 70-90% kolhydrater.
+mucus ändras snabbt i infektioner, det är styrt via hormoner.
+- många olika kolhydratstrukturer, 800 i magen
+- c:a 100 strukturer per person
+- 2-17 socker långa
+#### Proteoglykaner
+Ofta 95% kolhydrat
+GAG-kedjor, långa repetereande kedjor av disackarider, minst en av de är negativt laddad och minst en aminosocker (dvs med kväve)
+Funktionen kommer ifrån de långa.
+33 proteiner has GAG (2015)
+Finns proteiner som ibland har kedjor ibland inte
+Kan vara 25000 disackarider långa, huvudsakligen samma disackarider som repeteras
+5 vanligaste, disackariderna (Heparin t.ex)
+huvudsaklig komponent
+i ECM-ledvätska, ben, brosk, artärväggar
+
+**Uppgifter**
+
+I panelerna B-D, identifiera vilka bilder som visar proteoglykaner, glykoproteiner, _N_-linkade och _O_-linkade glykaner.
+
+Vad definierar de olika typerna av glykokonjugat?
+- 
+
+Vilka biologiska roller kan de fylla?
+- protoglykaner - binder vatten bra, finns i ögat, ECM, stötdämpande
+- glykoproteiner - enzymer, antikroppar, igenkänning, receptorer
+
+![[Pasted image 20251107141657.png|300]]
+
+#### Glykolipider
+Sitter på cellmembran
+Används t.ex. i blodgrupper
+Glykoproteiner, vävnader
+O determinant
+- Gal |𝛼1-2, Fuc
+A determinant
+- **GalNAc𝛼3**Gal-|𝛼1-2, Fuc
+B determinant
+- **Gal𝛼3**Gal-|𝛼1-2, Fuc
+Sitter inte direkt på lipiden utan tillkommer lite extra monosackarider (som ej behöver kunnas) 
+
+#### Blodgrupper
+Viktiga vid xenotransplatation/transfusion/graviditet
+35 grupper ABO och RhD viktigaste
+Vilka man har beror på genetisak uppsätnningen av glykosyltransferas
+Finns även på epitel och muciner
+##### AB antikroppar
+Antikroppr mot icke-self
+Produceras första månaderna i livet
+Kanske försvar mot patogener
+![[Pasted image 20251107143236.png|400]]
+O har antikroppar i plasman → ge blod till alla
+- RBC innehåller kolhydratstrukturerna
+AB har antigen i RBC → ge plasma till alla
+- innehåller inga antikroppar
+
+Vilka funktioner fyller kolhydrater i kroppen - mekanism?
+Signalering, energi, komponent i DNA
+
+Några sjukdomar där kolhydrater är inblandade: vad är kolhydratens roll?
+### Övningar
+
+
+Vilka funktioner fyller kolhydrater i kroppen - mekanism?
+Några sjukdomar där kolhydrater är inblandade: vad är kolhydratens roll?
+Vad definierar de olika typerna av glykokonjugat?
+Vilka biologiska roller kan glykokonjugat fylla?
+Hur är en hexos generellt uppbyggd?
+Vad innebär ”acetylglukosamin” - dvs hur skiljer sig glukos från acetylglukosamin?
+På vilka sätt skiljer sig sialinsyror från glukos
+Vilka aminosyror binder till en N-länkad?
+Vilka aminosyror binder till en O-länkad

content/Biokemi/Kolhydrater/Instuderingsfrågor.md

@@ -0,0 +1,40 @@
+#### Kolhydrater kan klassificeras som ketoser eller aldoser. Vad innebär detta?
+En aldos har en aldehydgrupp i ändan (-CHO)
+En ketos har en ketongrupp (C=O) i mitten av kedjan.
+#### Vad är en Fischer projektion?
+Det är en 2D ritning av en molekyls 3D-struktur, används främst för socker och aminosyror. Visar kolkedjan vertikalt med de mest oxiderade kolet högst upp och horizontella linjer pekar ut från planet mot betraktaren. Väte och hydroxylgrupper placeras för att tydligt visa stereokemin kring varje asymmetriskt kol.
+#### Vad är en Hawort projektion?
+
+#### En cyklisk kolhydrat är antingen i α eller β form. Vad innebär detta?
+Det innebär att en av -OH-grupperna sitter på samma eller motsatt sida som CH2-OH-gruppen. Dessa olika varianter kallas anomerer.
+#### Vad är en glykosidbindning?
+
+#### Beskriv skillnader och likheter mellan glukos, N-acetylglukosamin och sialinsyra.
+
+#### Glukos lagras hos människa i form av glykogen. Hur är glykogen uppbyggt?
+#### Hos växter lagras glukos som stärkelse. Beskriv skillnader och likheter mellan glykogen och stärkelse.
+#### Hos växter finns glukos även i form av cellulosa. Människor kan dock inte tillgodogöra sig glukos från cellulosa. Varför?
+#### Lista och förklara tre anledningar till att tre monosackarider som sitter ihop kan bära mer information/finnas i flera varianter än en tripeptid.
+#### Vad innebär laktosintolerans?
+Att enzymet laktas inte fungerar fullt ut och laktos kan inte spjälkas ner tillräckligt mycket till monosackarider i tunntarmen vilket gör att laktos bryts ner i tjocktarmen av bakterier som fermenterar och bildar gaser och organiska syror vilket orsakar uppblåsbarhet, gas och diarre
+#### Vad innebär galaktosemi?
+#### Vad är:
+	a) glykosaminoglykan?
+	b) proteoglykan?
+	c) glykoprotein?
+	d) glykolipid?
+#### Beskriv skillnader och likheter mellan proteoglykaner och glykoproteiner.
+#### Redogör för AB0-blodgruppssystemet.
+#### På vilket sätt är biologiska barns blodgrupp kopplade till föräldrarnas
+#### blodgrupp
+#### Människor har både blodgruppsantigener och antikroppar mot blodgrupper i sitt blod. Förklara vad detta innebär – vilka blodgrupper har man antikroppar mot om man har blodgrupp:
+a) A
+b) B
+c) O
+#### Hur påverkar blodgrupper och antikroppar mot blodgrupper vid transfusion av:
+a) plasmaprodukter
+b) röda blodkroppar
+#### Kolhydrater finns förutom i fri form även bundna till lipider och proteiner. Det finns två vanliga former av bindning av kolhydrat till protein. Vilka?
+#### Vad är ett lektin?
+#### Vad kallas de enzymer som bildar glykosidbindningar
+