vault backup: 2025-12-14 22:41:11

content/Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/Instuderingsfrågor.md

@@ -0,0 +1,73 @@
+---
+tags:
+  - biokemi
+  - anteckningar
+  - rna-syntes
+föreläsare: Claes Gustavsson
+---
+#### 1. Hur ser en transkriptionsbubbla ut?
+```spoiler-block:
+Ett lokalt uppsmält DNA-område (~12–17 bp) där strängarna separeras så RNA-polymeras kan läsa templatsträngen.
+```
+
+#### 2. Vilka tre typer av RNA-polymeraser finns i kärnan och vilka gener transkriberar de?
+```spoiler-block:
+RNA-pol I: rRNA (28S, 18S, 5.8S).  
+RNA-pol II: mRNA och vissa snRNA.  
+RNA-pol III: tRNA, 5S rRNA och små RNA.
+```
+
+#### 3. Vad är alfa-amanitin?
+```spoiler-block:
+Ett toxin från flugsvamp som hämmar RNA-polymeras II (och svagt III).
+```
+
+#### 4. Vilka sekvenselement hittar man vid en eukaryot promotor?
+```spoiler-block:
+TATA-box, Inr (initiator), BRE och ibland CAAT- och GC-boxar.
+```
+
+#### 5. Hur bildas preinitieringskomplexet?
+```spoiler-block:
+Generella transkriptionsfaktorer och RNA-pol II binds stegvis till promotorn.
+```
+
+#### 6. Vilka aktiviteter hos TFIIH startar transkriptionen?
+```spoiler-block:
+Helikasaktivitet som öppnar DNA och kinasaktivitet som fosforylerar CTD.
+```
+
+#### 7. Vilken roll spelar CTD vid transkription och mRNA-processning?
+```spoiler-block:
+CTD fosforyleras och rekryterar faktorer för capping, splicing och polyadenylering.
+```
+
+#### 8. Hur processas den primära RNA-molekylen till moget mRNA?
+```spoiler-block:
+5’-capping, borttagning av introner (splicing) och poly(A)-svans.
+```
+
+#### 9. Vad är en 5’-cap och vilken funktion har den?
+```spoiler-block:
+En 7-metylguanosin-kap som skyddar mRNA, krävs för export och translation.
+```
+
+#### 10. Vad är en poly(A)-svans och vilken funktion har den?
+```spoiler-block:
+En kedja av adenosiner som sätts på posttranskriptionellt; ökar stabilitet och translation.
+```
+
+#### 11. Vad är intron och exon?
+```spoiler-block:
+Introner är icke-kodande sekvenser som tas bort; exoner är sekvenser som ingår i moget mRNA.
+```
+
+#### 12. Beskriv de grundläggande stegen vid splicing!
+```spoiler-block:
+Spliceosomen klipper vid 5’-splice site, bildar lariat, klipper 3’-splice site och ligerar exoner.
+```
+
+#### 13. Vad är alternativ splicing och dess betydelse?
+```spoiler-block:
+Olika kombinationer av exoner ger flera proteiner från samma gen och ökar proteomets komplexitet.
+```

content/Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/RNA syntes Instuderingsfrågor.md

@@ -1,23 +0,0 @@
----
-tags:
-  - biokemi
-  - anteckningar
-  - rna-syntes
-föreläsare: Claes Gustavsson
----
-
-#### Instuderingsfrågor - RNA-syntes och processning
-#### 1. Hur ser en transkriptionsbubbla ut?
-#### 2. Vilka tre typer av RNA-polymeraser finns i kärnan och vilka gener transkriberar de?
-#### 3. Vad är alfa-amanitin?
-#### 4. Vilka sekvenselement hittar man vid en eukaryot promotor?
-#### 5. Hur bildas preinitieringskomplexet?
-#### 6. Vilka aktiviteter hos TFIIH startar transkriptionen?
-#### 7. Vilken roll spelar CTD (den C-terminala domänen) vid transkription och processning
-#### av mRNA?
-#### 8. Hur processas den primära RNA-molekylen för att bilda moget mRNA?
-#### 9. Vad är en 5’-cap och vilken funktion har den?
-#### 10. Vad är en poly(A) svans, hur sätts den på och vilken funktion har den?
-#### 11. Vad är intron och exon?
-#### 12. Beskriv de grundläggande stegen vid splicing!
-#### 13. Vad är alternativ splicing? Vilken betydelse har denna process?